Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pbq_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 2.A N LYS 35.A O THR 2.A H 2.903 2.047 ILE 4.A N GLU 37.A O ILE 4.A H.B 2.808 1.952 LYS 5.A N GLU 62.A OE1 LYS 5.A H 2.948 2.104 LYS 5.A NZ THR 60.A O LYS 5.A HZ1 2.932 2.076 LYS 5.A NZ GLU 62.A OE1 LYS 5.A HZ3 2.969 2.128 LYS 5.A NZ GLU 62.A OE2 LYS 5.A HZ3 3.280 2.681 LEU 6.A N ARG 39.A O LEU 6.A H 2.823 2.011 GLY 7.A N ALA 63.A O GLY 7.A H 3.117 2.332 HIS 8.A N TYR 41.A O HIS 8.A H 3.025 2.213 ASN 10.A ND2 ASN 119.A OD1 ASN 10.A HD22 3.151 2.561 ILE 13.A N SER 11.A OG ILE 13.A H 3.030 2.172 HIS 14.A N SER 11.A O HIS 14.A H 3.080 2.249 HIS 14.A ND1 SER 16.A OG HIS 14.A HD1 2.793 2.073 HIS 17.A N HIS 14.A O HIS 17.A H 2.887 2.249 ILE 18.A N HIS 14.A O ILE 18.A H 3.097 2.260 ALA 19.A N PRO 15.A O ALA 19.A H 2.869 2.018 LEU 20.A N SER 16.A O LEU 20.A H 2.889 2.075 GLN 21.A N HIS 17.A O GLN 21.A H 2.911 2.091 GLU 22.A N ILE 18.A O GLU 22.A H 3.012 2.230 TYR 23.A N ALA 19.A O TYR 23.A H 2.929 2.142 PHE 24.A N ALA 19.A O PHE 24.A H 3.351 2.579 LYS 25.A N LEU 20.A O LYS 25.A H 2.769 1.910 LYS 25.A NZ GLU 29.A OE2 LYS 25.A HZ2 2.720 1.864 LYS 25.A NZ ILE 38.A O LYS 25.A HZ3 2.865 2.267 LYS 26.A NZ GLU 22.A OE1 LYS 26.A HZ2 2.889 2.055 THR 27.A N TYR 23.A O THR 27.A H 3.325 2.532 THR 27.A OG1 TYR 23.A O THR 27.A HG1 2.577 2.040 ILE 28.A N PHE 24.A O ILE 28.A H 3.140 2.283 GLU 29.A N LYS 25.A O GLU 29.A H 2.933 2.080 ASN 30.A N LYS 26.A O ASN 30.A H 2.972 2.120 GLU 31.A N THR 27.A O GLU 31.A H 2.915 2.071 THR 32.A N ILE 28.A O THR 32.A H 3.058 2.365 THR 32.A OG1 ILE 28.A O THR 32.A HG1 2.797 2.044 ASN 33.A N ASN 30.A O ASN 33.A H 3.359 2.550 HIS 34.A N GLU 29.A O HIS 34.A H 2.876 2.161 LYS 35.A N THR 32.A O LYS 35.A H 2.977 2.179 LYS 35.A NZ ASP 222.A OD2 LYS 35.A HZ3 3.126 2.290 GLU 37.A N THR 2.A O GLU 37.A H 2.863 2.051 ILE 38.A N GLU 29.A OE2 ILE 38.A H 2.904 2.115 ARG 39.A N ILE 4.A O ARG 39.A H 2.842 2.057 TYR 41.A N LEU 6.A O TYR 41.A H 2.751 1.999 ASN 43.A N ASN 10.A O ASN 43.A H 2.798 2.037 ASN 44.A N HIS 8.A O ASN 44.A H 3.027 2.172 GLN 45.A N PRO 42.A O GLN 45.A H 3.068 2.230 GLY 47.A N ASN 44.A O GLY 47.A H 2.891 2.083 GLN 51.A NE2 LEU 46.A O GLN 51.A HE21 2.735 1.916 ILE 52.A N GLY 48.A O ILE 52.A H 3.019 2.237 VAL 53.A N GLU 49.A O VAL 53.A H 3.067 2.232 ASN 54.A N ASP 50.A O ASN 54.A H 3.096 2.262 GLY 55.A N GLN 51.A O GLY 55.A H 2.876 2.068 LEU 56.A N ILE 52.A O LEU 56.A H 2.907 2.084 ARG 57.A N VAL 53.A O ARG 57.A H 3.074 2.285 ARG 57.A NE TYR 110.A O ARG 57.A HE 2.878 2.074 ASN 58.A N ASN 54.A O ASN 58.A H 2.986 2.198 THR 60.A N ASN 58.A OD1 THR 60.A H 2.892 2.040 THR 60.A OG1 ASN 58.A OD1 THR 60.A HG1 2.655 1.864 ILE 61.A N GLY 55.A O ILE 61.A H 3.095 2.238 ALA 63.A N LYS 5.A O ALA 63.A H 2.829 2.076 GLY 64.A N GLN 209.A O GLY 64.A H 2.978 2.201 ILE 65.A N GLY 7.A O ILE 65.A H 2.984 2.230 THR 66.A N LEU 207.A O THR 66.A H 3.251 2.492 THR 66.A OG1 GLY 67.A O THR 66.A HG1 2.856 2.066 GLY 67.A N GLU 49.A OE2 GLY 67.A H 2.649 1.855 GLN 71.A N LEU 68.A O GLN 71.A H 2.900 2.050 ASN 72.A N LEU 69.A O ASN 72.A H 3.020 2.161 VAL 73.A N LEU 70.A O VAL 73.A H 2.846 2.013 ASP 74.A N LEU 70.A O ASP 74.A H 3.193 2.383 ILE 76.A N ASP 74.A OD1 ILE 76.A H 3.227 2.373 PHE 77.A N ASP 74.A O PHE 77.A H 3.264 2.436 GLY 78.A N PRO 75.A O GLY 78.A H 3.020 2.189 VAL 79.A N ILE 76.A O VAL 79.A H 3.269 2.421 GLU 81.A N GLY 78.A O GLU 81.A H 3.136 2.321 TRP 82.A N VAL 79.A O TRP 82.A H 3.029 2.173 TYR 84.A N HIS 201.A O TYR 84.A H 3.100 2.390 LYS 87.A N GLU 91.A OE2 LYS 87.A H 2.845 2.037 ASN 89.A ND2 GLU 245.A OE1 ASN 89.A HD22 3.104 2.271 GLU 91.A N ASP 88.A OD1 GLU 91.A H 2.900 2.082 ALA 92.A N ASP 88.A O ALA 92.A H 3.061 2.228 LYS 93.A N ASN 89.A O LYS 93.A H 2.969 2.177 LYS 93.A NZ GLU 97.A OE1 LYS 93.A HZ3 3.156 2.298 LYS 94.A N GLN 90.A O LYS 94.A H 2.981 2.170 LYS 94.A NZ LYS 298.A OXT LYS 94.A HZ3 2.850 1.971 VAL 95.A N GLU 91.A O VAL 95.A H 2.974 2.131 LEU 96.A N ALA 92.A O LEU 96.A H 2.952 2.132 GLU 97.A N LYS 93.A O GLU 97.A H 2.954 2.336 GLU 97.A N LYS 94.A O GLU 97.A H 3.275 2.558 SER 98.A N VAL 95.A O SER 98.A H 2.974 2.145 ASN 102.A N.A SER 98.A O ASN 102.A H.A 3.183 2.369 ASN 102.A N.B SER 98.A O ASN 102.A H.B 3.200 2.399 ASN 102.A N.B PRO 99.A O ASN 102.A H.B 3.088 2.595 ASN 102.A ND2.A GLN 106.A OE1 ASN 102.A HD22.A 2.642 1.984 LYS 103.A N PRO 99.A O LYS 103.A H.A 2.836 2.025 ILE 104.A N ILE 100.A O ILE 104.A H 2.995 2.161 GLY 105.A N ALA 101.A O GLY 105.A H 2.927 2.104 GLN 106.A N ASN 102.A O.A GLN 106.A H 2.928 2.138 GLN 106.A N ASN 102.A O.B GLN 106.A H 3.009 2.221 LYS 107.A N ILE 104.A O LYS 107.A H 3.035 2.329 GLU 108.A N GLN 106.A O GLU 108.A H 3.172 2.333 LYS 109.A N LYS 107.A O LYS 109.A H 3.284 2.529 TYR 110.A OH ASP 74.A OD2 TYR 110.A HH 2.905 2.209 GLY 111.A N GLU 108.A O GLY 111.A H 3.097 2.249 LYS 113.A N ILE 210.A O LYS 113.A H 2.876 2.037 LEU 115.A N LEU 208.A O LEU 115.A H 2.803 1.964 ALA 116.A N LEU 208.A O ALA 116.A H 3.235 2.483 TYR 117.A OH ALA 101.A O TYR 117.A HH 2.765 2.203 GLY 118.A N GLY 206.A O GLY 118.A H 2.826 2.003 ASN 119.A N SER 204.A O ASN 119.A H 3.005 2.217 GLY 120.A N SER 204.A O GLY 120.A H 2.995 2.172 ARG 122.A N ILE 202.A O ARG 122.A H 2.754 1.943 ARG 122.A NE GLU 179.A OE1 ARG 122.A HE 2.685 1.849 ARG 122.A NH1 SER 204.A OG ARG 122.A HH11 2.849 2.056 ARG 122.A NH2 GLU 179.A OE2 ARG 122.A HH21 3.022 2.196 VAL 123.A N ASN 180.A O VAL 123.A H 2.886 2.028 ILE 124.A N ILE 197.A O ILE 124.A H 3.045 2.229 SER 125.A N GLN 178.A O SER 125.A H 2.915 2.152 SER 126.A N TYR 195.A O SER 126.A H 2.872 2.189 ASN 127.A N ASP 176.A O ASN 127.A H 2.890 2.073 LYS 128.A N SER 126.A OG LYS 128.A H 2.883 2.069 LYS 128.A NZ ASP 176.A OD2 LYS 128.A HZ2 2.906 2.087 GLU 131.A N ASP 135.A OD2 GLU 131.A H 2.893 2.037 LYS 132.A N ASP 135.A OD2 LYS 132.A H 3.281 2.624 LYS 132.A NZ ASP 135.A OD1 LYS 132.A HZ3 2.772 2.090 ASP 135.A N LYS 132.A O ASP 135.A H 2.885 2.056 PHE 136.A N PHE 133.A O PHE 136.A H 3.120 2.289 LYS 137.A N ASP 134.A O LYS 137.A H 3.277 2.459 LEU 139.A N PHE 136.A O LEU 139.A H 2.867 2.034 ARG 140.A N ASP 176.A OD2 ARG 140.A H 2.874 2.042 ARG 140.A NE ASP 176.A OD2 ARG 140.A HE 3.258 2.410 ARG 140.A NH1 LYS 173.A O ARG 140.A HH12 2.810 2.075 ARG 140.A NH2 LYS 173.A O ARG 140.A HH22 3.226 2.613 ARG 140.A NH2 ASP 176.A OD1 ARG 140.A HH21 2.929 2.078 LEU 141.A N ASN 158.A O LEU 141.A H 2.999 2.194 ARG 142.A N GLY 177.A O ARG 142.A H 2.901 2.108 VAL 143.A N GLN 160.A O VAL 143.A H 3.081 2.277 LEU 148.A N ASN 146.A OD1 LEU 148.A H 2.907 2.096 PHE 149.A N ASN 146.A O PHE 149.A H 3.008 2.220 ASP 151.A N SER 147.A O ASP 151.A H 2.829 1.978 TRP 152.A N LEU 148.A O TRP 152.A H 2.842 2.015 ALA 153.A N PHE 149.A O ALA 153.A H 2.963 2.140 LYS 154.A N VAL 150.A O LYS 154.A H 3.053 2.230 ALA 155.A N ASP 151.A O ALA 155.A H 2.926 2.135 ASN 156.A N LYS 154.A O ASN 156.A H 3.050 2.223 ILE 157.A N ALA 153.A O ILE 157.A H 2.924 2.128 ASN 158.A N LEU 139.A O ASN 158.A H 2.858 2.027 GLN 160.A N LEU 141.A O GLN 160.A H 2.964 2.189 GLU 165.A N PRO 162.A O GLU 165.A H 2.935 2.087 VAL 166.A N LEU 163.A O VAL 166.A H 3.222 2.362 ALA 169.A N GLU 165.A O ALA 169.A H 2.993 2.160 LEU 170.A N VAL 166.A O LEU 170.A H 2.949 2.120 GLU 171.A N PHE 167.A O GLU 171.A H 2.926 2.101 GLN 172.A N THR 168.A O GLN 172.A H 2.899 2.119 GLN 172.A NE2 THR 168.A O GLN 172.A HE21 3.283 2.614 GLN 172.A NE2 THR 168.A OG1 GLN 172.A HE21 2.923 2.193 LYS 173.A N LEU 170.A O LYS 173.A H 2.914 2.079 VAL 174.A N ALA 169.A O VAL 174.A H 2.888 2.062 ASP 176.A N ARG 140.A O ASP 176.A H 2.714 1.862 GLN 178.A N SER 125.A O GLN 178.A H 3.111 2.373 GLN 178.A NE2 SER 125.A OG GLN 178.A HE21 2.838 1.986 ASN 180.A N VAL 123.A O ASN 180.A H 3.009 2.230 ASN 180.A ND2 GLN 178.A OE1 ASN 180.A HD21 2.897 2.058 ILE 184.A N PRO 181.A O ILE 184.A H 3.168 2.334 LYS 185.A N TYR 182.A O LYS 185.A H 3.091 2.312 SER 187.A N LEU 183.A O SER 187.A H 2.887 2.047 GLY 188.A N LYS 185.A O GLY 188.A H 2.999 2.180 LEU 189.A N SER 187.A OG LEU 189.A H 3.027 2.184 TYR 190.A N ILE 184.A O TYR 190.A H 3.191 2.443 GLU 191.A N GLY 188.A O GLU 191.A H 3.043 2.208 VAL 192.A N LEU 189.A O VAL 192.A H 3.026 2.197 GLN 193.A NE2 ASN 127.A OD1 GLN 193.A HE21 3.064 2.529 GLN 193.A NE2 ASP 176.A O GLN 193.A HE22 3.296 2.449 GLN 193.A NE2 VAL 192.A O GLN 193.A HE21 3.150 2.347 LYS 194.A NZ TYR 195.A OH LYS 194.A HZ2 3.197 2.467 TYR 195.A N SER 126.A O TYR 195.A H 2.955 2.121 ILE 196.A N GLU 258.A O ILE 196.A H 2.928 2.083 ILE 197.A N ILE 124.A O ILE 197.A H 2.722 1.874 GLN 198.A N ILE 260.A O GLN 198.A H 2.822 1.968 GLN 198.A NE2 TYR 182.A OH GLN 198.A HE21 2.791 1.940 SER 199.A N ILE 197.A O SER 199.A H 2.764 2.040 HIS 201.A ND1 SER 199.A OG HIS 201.A HD1 2.776 1.988 HIS 201.A NE2 GLU 179.A OE1 HIS 201.A HE2 2.837 1.995 SER 204.A N GLY 120.A O SER 204.A H 2.881 2.026 GLY 206.A N GLY 118.A O GLY 206.A H 2.873 2.080 LEU 207.A N THR 66.A O LEU 207.A H 2.787 1.944 LEU 208.A N ALA 116.A O LEU 208.A H 2.890 2.073 GLN 209.A N GLY 64.A O GLN 209.A H 2.851 2.040 GLN 209.A NE2 THR 66.A OG1 GLN 209.A HE22 2.928 2.098 GLN 209.A NE2 LEU 207.A O GLN 209.A HE21 3.027 2.225 ILE 210.A N LYS 113.A O ILE 210.A H 2.874 2.043 SER 211.A N GLU 62.A O SER 211.A H 2.796 1.981 LEU 212.A N GLY 111.A O LEU 212.A H 2.914 2.057 TRP 215.A N SER 211.A O TRP 215.A H 2.835 2.000 ASN 216.A N LEU 212.A O ASN 216.A H 2.862 2.064 LYS 217.A N THR 214.A O LYS 217.A H 3.045 2.210 ILE 218.A N TRP 215.A O ILE 218.A H 3.008 2.165 ASP 222.A N PRO 219.A O ASP 222.A H 2.906 2.265 GLN 223.A N PRO 219.A O GLN 223.A H 2.915 2.106 GLN 223.A NE2 TRP 215.A O GLN 223.A HE21 3.055 2.323 ILE 224.A N LYS 220.A O ILE 224.A H 2.987 2.182 ILE 225.A N ASP 222.A O ILE 225.A H 2.999 2.408 PHE 226.A N ASP 222.A O PHE 226.A H 3.088 2.280 GLU 227.A N GLN 223.A O GLU 227.A H 2.797 2.000 LYS 228.A N ILE 224.A O LYS 228.A H 2.898 2.079 LYS 228.A NZ GLU 31.A OE1 LYS 228.A HZ3 3.022 2.159 ALA 229.A N ILE 225.A O ALA 229.A H 2.978 2.155 ALA 230.A N PHE 226.A O ALA 230.A H 2.902 2.140 LYS 231.A N GLU 227.A O LYS 231.A H 2.917 2.095 LEU 232.A N LYS 228.A O LEU 232.A H 3.040 2.185 TYR 233.A N ALA 229.A O TYR 233.A H 2.817 1.966 GLN 234.A N ALA 230.A O GLN 234.A H 2.848 2.074 GLN 234.A NE2 GLU 97.A OE2 GLN 234.A HE21 2.970 2.175 GLU 235.A N LYS 231.A O GLU 235.A H 3.033 2.193 LYS 236.A N LEU 232.A O LYS 236.A H 2.970 2.120 GLU 237.A N TYR 233.A O GLU 237.A H 2.729 1.925 TRP 238.A N GLN 234.A O TRP 238.A H 3.077 2.218 TRP 238.A NE1 TYR 117.A O TRP 238.A HE1 2.876 2.038 GLU 239.A N GLU 235.A O GLU 239.A H 3.264 2.408 LEU 240.A N LYS 236.A O LEU 240.A H 2.877 2.037 ALA 241.A N GLU 237.A O ALA 241.A H 2.762 1.947 ILE 242.A N TRP 238.A O ILE 242.A H 2.944 2.095 LYS 243.A N GLU 239.A O LYS 243.A H 3.112 2.262 THR 244.A N LEU 240.A O THR 244.A H 2.788 1.976 THR 244.A OG1 LEU 240.A O THR 244.A HG1 2.745 2.050 GLU 245.A N ALA 241.A O GLU 245.A H 2.895 2.082 LEU 246.A N ILE 242.A O LEU 246.A H 3.421 2.597 GLU 247.A N LYS 243.A O GLU 247.A H 3.337 2.538 VAL 248.A N THR 244.A O VAL 248.A H 2.878 2.096 LYS 249.A N GLU 245.A O LYS 249.A H 2.915 2.098 ASP 250.A N LEU 246.A O ASP 250.A H 3.232 2.403 TYR 251.A N GLU 247.A O TYR 251.A H 2.916 2.077 LEU 252.A N VAL 248.A O LEU 252.A H 2.893 2.056 ALA 253.A N LYS 249.A O ALA 253.A H 3.106 2.314 LYS 254.A N TYR 251.A O LYS 254.A H 2.913 2.106 LYS 254.A NZ ASP 250.A OD1 LYS 254.A HZ2 3.089 2.450 LYS 254.A NZ ASP 250.A OD2 LYS 254.A HZ2 2.952 2.078 HIS 255.A ND1 TYR 251.A O HIS 255.A HD1 2.720 1.902 ASN 257.A ND2 TYR 190.A O ASN 257.A HD22 2.945 2.102 ASN 257.A ND2 GLN 193.A O ASN 257.A HD21 2.643 2.145 ASN 257.A ND2 LYS 194.A O ASN 257.A HD21 3.573 2.799 GLU 258.A N LYS 194.A O GLU 258.A H 2.885 2.061 ILE 260.A N ILE 196.A O ILE 260.A H 2.748 1.920 PHE 266.A N SER 263.A OG PHE 266.A H 3.055 2.215 LYS 267.A N SER 263.A O LYS 267.A H 2.895 2.036 ASN 268.A N GLU 264.A O ASN 268.A H 2.875 2.047 ASN 268.A ND2 GLU 264.A OE2 ASN 268.A HD22 3.420 2.676 ASP 269.A N ALA 265.A O ASP 269.A H 2.892 2.063 VAL 270.A N LYS 267.A O VAL 270.A H 2.983 2.146 ASN 271.A N ASN 268.A O ASN 271.A H 2.849 1.997 ALA 272.A N ASP 269.A O ALA 272.A H 2.974 2.167 SER 273.A N VAL 270.A O SER 273.A H 3.105 2.413 SER 273.A OG VAL 270.A O SER 273.A HG 2.712 2.223 LYS 274.A N ASN 271.A O LYS 274.A H 3.197 2.359 LYS 274.A NZ ASP 278.A OD1 LYS 274.A HZ3 3.021 2.272 LEU 276.A N SER 273.A O LEU 276.A H 2.952 2.162 ASP 278.A N LYS 274.A O ASP 278.A H 2.928 2.097 SER 279.A N VAL 275.A O SER 279.A H 3.188 2.380 PHE 280.A N LEU 276.A O PHE 280.A H 2.961 2.182 TYR 281.A N TYR 277.A O TYR 281.A H 2.996 2.160 LYS 282.A N ASP 278.A O LYS 282.A H 3.313 2.612 LYS 282.A N SER 279.A O LYS 282.A H 3.039 2.398 LYS 283.A N SER 279.A O LYS 283.A H 3.058 2.391 LYS 283.A N PHE 280.A O LYS 283.A H 3.300 2.575 TYR 284.A N PHE 280.A O TYR 284.A H 2.910 2.110 ALA 287.A N TYR 284.A O ALA 287.A H 3.361 2.504 VAL 290.A N TRP 286.A O VAL 290.A H 2.944 2.124 VAL 291.A N ALA 287.A O VAL 291.A H 2.958 2.099 GLN 292.A N LYS 288.A O GLN 292.A H 3.068 2.246 GLN 292.A NE2 GLU 296.A OE2 GLN 292.A HE21 2.956 2.109 LYS 293.A N ASP 289.A O LYS 293.A H 2.980 2.184 ILE 294.A N VAL 290.A O ILE 294.A H 2.864 2.054 ASN 295.A N VAL 291.A O ASN 295.A H 2.906 2.062 GLU 296.A N GLN 292.A O GLU 296.A H 2.913 2.101 ALA 297.A N LYS 293.A O ALA 297.A H 3.062 2.386 ALA 297.A N ILE 294.A O ALA 297.A H 3.145 2.473 LYS 298.A N ASN 295.A O LYS 298.A H 3.192 2.399 LYS 298.A NZ LEU 85.A O LYS 298.A HZ1 2.662 1.996 LYS 298.A NZ ASN 295.A OD1 LYS 298.A HZ2 2.887 2.155