Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pcd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 3.A N ARG 35.A O GLU 3.A H 2.810 2.029 LEU 5.A N ALA 37.A O LEU 5.A H 2.787 1.958 LYS 6.A N ASP 61.A OD2 LYS 6.A H 3.155 2.337 LEU 7.A N GLU 39.A O LEU 7.A H 2.938 2.093 HIS 9.A N PHE 41.A O HIS 9.A H 3.027 2.209 ASN 12.A N SER 185.A OG ASN 12.A H 2.823 2.033 GLU 13.A N GLU 13.A OE1 GLU 13.A H 2.782 2.102 GLN 14.A N ASN 12.A OD1 GLN 14.A H 3.014 2.246 ASN 15.A N ASN 12.A O ASN 15.A H 3.223 2.380 TRP 17.A N ASN 15.A OD1 TRP 17.A H 2.885 2.068 HIS 18.A N ASN 15.A O HIS 18.A H 2.930 2.282 LEU 19.A N ASN 15.A O LEU 19.A H 3.241 2.415 ALA 20.A N ALA 16.A O ALA 20.A H 2.896 2.083 ALA 21.A N TRP 17.A O ALA 21.A H 2.894 2.111 VAL 22.A N HIS 18.A O VAL 22.A H 2.919 2.079 LYS 23.A N LEU 19.A O LYS 23.A H 2.917 2.112 PHE 24.A N ALA 20.A O PHE 24.A H 2.825 1.983 GLY 25.A N ALA 21.A O GLY 25.A H 3.033 2.204 GLU 26.A N VAL 22.A O GLU 26.A H 2.882 2.063 GLU 27.A N LYS 23.A O GLU 27.A H 2.929 2.095 LEU 28.A N PHE 24.A O LEU 28.A H 2.919 2.093 SER 29.A N GLY 25.A O SER 29.A H 2.981 2.141 THR 30.A N GLU 26.A O THR 30.A H 3.051 2.198 LEU 31.A N GLU 27.A O LEU 31.A H 2.864 2.021 THR 32.A N LEU 28.A O THR 32.A H 3.011 2.363 THR 32.A N SER 29.A O THR 32.A H 3.186 2.468 THR 32.A OG1 LEU 28.A O THR 32.A HG1 2.816 2.034 THR 32.A OG1 SER 29.A O THR 32.A HG1 3.458 2.960 ASP 33.A N THR 30.A O ASP 33.A H 3.202 2.350 GLY 34.A N SER 29.A O GLY 34.A H 2.771 1.959 ARG 35.A N THR 32.A O ARG 35.A H 2.955 2.106 ARG 35.A NH1 GLU 3.A OE1 ARG 35.A HH11 3.080 2.287 ARG 35.A NH1 ASP 221.A OD1 ARG 35.A HH12 3.538 2.889 ARG 35.A NH1 ASP 221.A OD2 ARG 35.A HH12 2.935 2.075 ARG 35.A NH2 ASP 221.A OD1 ARG 35.A HH22 2.869 2.015 ILE 36.A N THR 32.A OG1 ILE 36.A H 3.061 2.248 GLU 39.A N LEU 5.A O GLU 39.A H 2.845 2.014 PHE 41.A N LEU 7.A O PHE 41.A H 2.800 1.994 ASN 43.A N ALA 11.A O ASN 43.A H 2.873 2.066 ASN 43.A ND2 GLU 13.A OE1 ASN 43.A HD22 3.344 2.503 GLU 44.A N HIS 9.A O GLU 44.A H 2.952 2.106 SER 45.A N PRO 42.A O SER 45.A H 2.882 2.073 GLY 47.A N GLU 44.A O GLY 47.A H 3.158 2.502 LYS 48.A NZ GLU 163.A OE2 LYS 48.A HZ2 2.528 1.725 GLU 49.A N GLU 44.A OE2 GLU 49.A H 3.036 2.327 LEU 52.A N LYS 48.A O LEU 52.A H 2.895 2.099 ILE 53.A N GLU 49.A O ILE 53.A H 3.001 2.212 ASN 54.A N ILE 50.A O ASN 54.A H 3.062 2.215 GLY 55.A N ASP 51.A O GLY 55.A H 2.838 2.051 GLN 56.A N ILE 53.A O GLN 56.A H 3.130 2.350 GLN 56.A NE2 ALA 108.A O GLN 56.A HE21 2.927 2.121 LEU 57.A N ASN 54.A O LEU 57.A H 2.935 2.198 GLY 58.A N GLY 55.A O GLY 58.A H 2.871 2.165 THR 59.A N GLY 55.A O THR 59.A H 2.859 2.077 VAL 60.A N GLY 55.A O VAL 60.A H 3.321 2.577 THR 62.A N THR 208.A O THR 62.A H 3.169 2.430 THR 62.A OG1 GLY 8.A O THR 62.A HG1 2.815 2.086 THR 64.A N TYR 206.A O THR 64.A H 2.948 2.161 THR 64.A OG1 GLU 49.A OE2 THR 64.A HG1 2.646 1.827 GLU 66.A N GLU 66.A OE1 GLU 66.A H 2.701 1.884 LEU 68.A N GLY 65.A O LEU 68.A H 2.858 2.014 GLN 69.A N GLU 66.A O GLN 69.A H 2.939 2.087 GLN 69.A NE2 GLU 66.A O GLN 69.A HE21 2.956 2.248 ASN 70.A N SER 67.A O ASN 70.A H 3.339 2.488 ASN 70.A ND2 SER 67.A O ASN 70.A HD21 2.891 2.150 ASN 70.A ND2 ASN 142.A O ASN 70.A HD22 2.875 2.085 TRP 71.A N LEU 68.A O TRP 71.A H 2.890 2.039 ALA 72.A N LEU 68.A O ALA 72.A H 2.871 2.018 ALA 74.A N ALA 72.A O ALA 74.A H 2.880 2.060 ALA 75.A N PRO 73.A O ALA 75.A H 3.091 2.238 LEU 77.A N ALA 74.A O LEU 77.A H 3.165 2.318 ALA 78.A N ALA 75.A O ALA 78.A H 3.138 2.282 TYR 81.A N HIS 200.A O TYR 81.A H 3.017 2.384 TYR 81.A OH THR 198.A O TYR 81.A HH 3.208 2.495 ALA 82.A N VAL 79.A O ALA 82.A H 3.159 2.341 HIS 88.A N SER 85.A OG HIS 88.A H 3.011 2.182 ASP 89.A N LEU 86.A O ASP 89.A H 2.861 2.040 GLU 90.A N GLU 87.A O GLU 90.A H 3.083 2.298 VAL 91.A N HIS 88.A O VAL 91.A H 3.164 2.369 SER 93.A N ASP 89.A O SER 93.A H 3.001 2.253 GLY 94.A N VAL 91.A O GLY 94.A H 3.216 2.391 GLY 97.A N VAL 91.A O GLY 97.A H 3.119 2.500 GLU 98.A N GLY 94.A O GLU 98.A H 2.931 2.156 GLN 99.A N GLU 95.A O GLN 99.A H 3.038 2.228 GLN 99.A NE2 GLU 95.A OE2 GLN 99.A HE21 2.707 1.936 ILE 100.A N ILE 96.A O.A ILE 100.A H 3.051 2.225 ILE 100.A N ILE 96.A O.B ILE 100.A H 3.045 2.219 LYS 101.A N GLY 97.A O LYS 101.A H 2.927 2.076 GLN 102.A N GLU 98.A O GLN 102.A H 2.958 2.124 GLN 102.A NE2 GLU 98.A OE2 GLN 102.A HE21 2.927 2.135 GLN 103.A N GLN 99.A O GLN 103.A H 3.013 2.223 GLN 103.A NE2 GLU 279.A OE2 GLN 103.A HE22 2.683 1.954 ILE 104.A N ILE 100.A O ILE 104.A H 2.958 2.137 ILE 105.A N LYS 101.A O ILE 105.A H 3.027 2.187 GLU 106.A N GLN 102.A O GLU 106.A H 3.002 2.203 LYS 107.A N GLN 103.A O LYS 107.A H 2.819 1.993 ALA 108.A N ILE 104.A O ALA 108.A H 2.881 2.078 GLN 109.A N ILE 105.A O GLN 109.A H 3.171 2.511 ARG 111.A N ILE 209.A O ARG 111.A H 2.796 1.954 ARG 111.A NE GLU 211.A OE1 ARG 111.A HE 2.873 2.042 ARG 111.A NH2 GLU 211.A OE1 ARG 111.A HH21 3.520 2.883 ARG 111.A NH2 GLU 211.A OE2 ARG 111.A HH21 3.001 2.142 ILE 113.A N LEU 207.A O ILE 113.A H 2.817 1.967 PHE 115.A N GLN 232.A OE1 PHE 115.A H 2.928 2.133 PHE 116.A N ILE 205.A O PHE 116.A H 2.826 1.994 ARG 118.A N SER 203.A O ARG 118.A H 2.889 2.145 ARG 121.A N VAL 201.A O ARG 121.A H 2.798 1.974 ARG 121.A NE GLU 177.A OE2 ARG 121.A HE 2.649 1.824 ARG 121.A NH2 GLU 177.A O ARG 121.A HH21 2.969 2.431 ARG 121.A NH2 GLU 177.A OE1 ARG 121.A HH21 3.005 2.199 ASN 122.A N ASN 178.A O ASN 122.A H 2.917 2.062 LEU 123.A N THR 198.A OG1 LEU 123.A H 3.219 2.491 THR 124.A N GLN 176.A O THR 124.A H 2.899 2.074 THR 124.A OG1 GLN 176.A O THR 124.A HG1 3.541 2.800 SER 125.A N TYR 194.A O SER 125.A H 3.100 2.376 SER 125.A OG ARG 127.A O SER 125.A HG 2.533 2.071 GLN 126.A NE2 VAL 191.A O GLN 126.A HE22 2.795 2.083 ARG 127.A NH1 ASP 134.A O ARG 127.A HH12 2.838 2.031 ARG 127.A NH2 ASP 134.A O ARG 127.A HH22 3.108 2.393 ARG 127.A NH2 LEU 135.A O ARG 127.A HH22 2.950 2.330 ILE 129.A N ASN 196.A OD1 ILE 129.A H 2.823 1.965 THR 130.A N ASP 134.A OD2 THR 130.A H 2.759 1.905 THR 130.A OG1 ASP 134.A OD2 THR 130.A HG1 2.763 2.005 ASP 134.A N SER 131.A O ASP 134.A H 2.919 2.131 LEU 135.A N PRO 132.A O LEU 135.A H 2.924 2.079 GLY 137.A N GLY 154.A O GLY 137.A H 2.786 1.998 ARG 139.A N GLY 175.A O ARG 139.A H 2.988 2.170 VAL 140.A N THR 158.A O VAL 140.A H 3.085 2.269 VAL 143.A N PRO 141.A O VAL 143.A H 2.777 2.103 LEU 145.A N GLN 69.A OE1 LEU 145.A H 3.218 2.410 PHE 146.A N VAL 143.A O PHE 146.A H 2.953 2.297 VAL 147.A N VAL 143.A O VAL 147.A H 3.228 2.424 ASP 148.A N PRO 144.A O ASP 148.A H 3.004 2.166 VAL 149.A N LEU 145.A O VAL 149.A H 2.926 2.122 TRP 150.A N PHE 146.A O TRP 150.A H 3.001 2.143 SER 151.A N.A VAL 147.A O SER 151.A H.A 3.035 2.203 SER 151.A N.B VAL 147.A O SER 151.A H.B 3.047 2.221 ALA 152.A N ASP 148.A O ALA 152.A H 3.056 2.226 LEU 153.A N VAL 149.A O LEU 153.A H 2.926 2.167 GLY 154.A N SER 151.A O.A GLY 154.A H 3.022 2.257 GLY 154.A N SER 151.A O.B GLY 154.A H 3.123 2.366 ALA 155.A N TRP 150.A O ALA 155.A H 2.997 2.197 SER 162.A N GLU 44.A OE1 SER 162.A H 3.058 2.249 GLU 163.A N ALA 160.A O GLU 163.A H 3.095 2.271 VAL 164.A N PHE 161.A O VAL 164.A H 3.114 2.258 SER 167.A N GLU 163.A O SER 167.A H 3.304 2.511 LEU 168.A N VAL 164.A O LEU 168.A H 2.904 2.064 GLN 169.A N PHE 165.A O GLN 169.A H 2.951 2.114 ASN 170.A N THR 166.A O ASN 170.A H 2.904 2.158 GLY 171.A N LEU 168.A O GLY 171.A H 3.126 2.329 VAL 172.A N SER 167.A O VAL 172.A H 3.028 2.337 ASP 174.A N LYS 138.A O ASP 174.A H 2.821 1.971 GLN 176.A N THR 124.A O GLN 176.A H 3.334 2.605 GLN 176.A NE2 THR 124.A OG1 GLN 176.A HE21 2.954 2.104 ASN 178.A N ASN 122.A O ASN 178.A H 3.026 2.238 ASN 178.A ND2 GLN 176.A OE1 ASN 178.A HD21 2.915 2.084 LEU 182.A N PRO 179.A O LEU 182.A H 3.090 2.417 ILE 183.A N PRO 179.A O ILE 183.A H 3.139 2.309 ARG 184.A N LEU 180.A O ARG 184.A H 2.952 2.110 ARG 184.A NH1 ASP 246.A OD1 ARG 184.A HH11 2.907 2.142 SER 185.A N ALA 181.A O SER 185.A H 2.958 2.175 ALA 186.A N LEU 182.A O ALA 186.A H 2.991 2.165 ASN 187.A N ARG 184.A O ASN 187.A H 3.113 2.289 PHE 188.A N ILE 183.A O PHE 188.A H 3.065 2.269 GLU 190.A N ASN 187.A O GLU 190.A H 2.980 2.125 VAL 191.A N PHE 188.A O VAL 191.A H 2.947 2.112 GLN 192.A NE2 ASP 174.A O GLN 192.A HE22 2.974 2.119 GLN 192.A NE2 VAL 191.A O GLN 192.A HE21 2.989 2.170 GLY 193.A N SER 125.A O GLY 193.A H 3.058 2.394 TYR 194.A N SER 125.A O TYR 194.A H 2.984 2.223 VAL 195.A N THR 255.A O VAL 195.A H 2.881 2.076 ASN 196.A N LEU 123.A O ASN 196.A H 2.738 1.909 ASN 196.A ND2 LEU 123.A O ASN 196.A HD21 3.016 2.312 ASN 196.A ND2 SER 125.A OG ASN 196.A HD22 2.895 2.047 GLN 197.A N VAL 257.A O GLN 197.A H 2.897 2.041 THR 198.A N ASN 196.A O THR 198.A H 2.753 2.019 GLU 199.A N ASN 122.A OD1 GLU 199.A H 2.908 2.099 HIS 200.A N ARG 121.A O HIS 200.A H 3.103 2.422 HIS 200.A NE2 GLU 177.A OE2 HIS 200.A HE2 2.853 1.996 ARG 202.A NH1.B GLU 199.A OE1 ARG 202.A HH12.B 3.360 2.564 ARG 202.A NH2.A GLU 199.A OE1 ARG 202.A HH21.A 3.480 2.902 ILE 205.A N PHE 116.A O ILE 205.A H 2.963 2.198 TYR 206.A N THR 64.A O TYR 206.A H 2.907 2.078 LEU 207.A N ALA 114.A O LEU 207.A H 2.945 2.196 THR 208.A N THR 62.A O THR 208.A H 2.845 2.038 THR 208.A OG1 THR 62.A O THR 208.A HG1 3.059 2.277 ILE 209.A N ARG 111.A O ILE 209.A H 2.964 2.152 ALA 210.A N ASP 61.A O ALA 210.A H 2.751 1.940 GLU 211.A N GLN 109.A O GLU 211.A H 3.034 2.183 THR 213.A OG1 ASP 61.A OD1 THR 213.A HG1 2.775 2.187 TRP 214.A N ALA 210.A O TRP 214.A H 2.920 2.086 ALA 215.A N GLU 211.A O ALA 215.A H 2.949 2.166 LYS 216.A N THR 213.A O LYS 216.A H 3.078 2.326 LEU 217.A N TRP 214.A O LEU 217.A H 3.126 2.314 ASP 221.A N SER 218.A OG ASP 221.A H 3.025 2.185 GLN 222.A N SER 218.A O GLN 222.A H 2.837 2.005 GLN 222.A NE2 TRP 214.A O GLN 222.A HE21 2.927 2.097 ASN 223.A N GLU 219.A O ASN 223.A H 2.946 2.111 ALA 224.A N ASP 220.A O ALA 224.A H 2.972 2.219 VAL 225.A N ASP 221.A O VAL 225.A H 2.905 2.068 GLN 226.A N ASN 223.A O GLN 226.A H 2.906 2.086 ALA 227.A N ALA 224.A O ALA 227.A H 2.856 2.010 ALA 228.A N VAL 225.A O ALA 228.A H 2.904 2.102 THR 230.A N GLN 226.A O THR 230.A H 3.042 2.221 ALA 231.A N ALA 227.A O ALA 231.A H 2.905 2.072 GLN 232.A N ALA 228.A O GLN 232.A H 2.864 2.078 GLU 233.A N ALA 229.A O GLU 233.A H 3.095 2.263 TYR 234.A N THR 230.A O TYR 234.A H 3.092 2.254 GLU 235.A N ALA 231.A O GLU 235.A H 2.842 2.039 ARG 236.A N GLN 232.A O ARG 236.A H 3.049 2.268 ARG 236.A NH1 ASP 89.A OD2 ARG 236.A HH12 2.998 2.170 ARG 236.A NH2 ASP 89.A OD1 ARG 236.A HH22 2.749 1.906 ARG 236.A NH2 ASP 89.A OD2 ARG 236.A HH22 3.417 2.720 LEU 238.A N TYR 234.A O LEU 238.A H 3.293 2.519 LEU 239.A N GLU 235.A O LEU 239.A H 2.878 2.057 LEU 240.A N ARG 236.A O LEU 240.A H 3.023 2.203 GLU 241.A N GLY 237.A O GLU 241.A H 2.984 2.160 SER 242.A N LEU 238.A O SER 242.A H 2.946 2.178 SER 242.A OG LEU 239.A O SER 242.A HG 2.670 2.121 LEU 243.A N LEU 239.A O LEU 243.A H 2.999 2.277 LEU 243.A N LEU 240.A O LEU 243.A H 3.164 2.555 ALA 244.A N GLU 241.A O ALA 244.A H 3.071 2.359 GLU 245.A N SER 242.A O GLU 245.A H 3.152 2.369 ASP 246.A N SER 242.A O ASP 246.A H 2.953 2.154 ARG 247.A NE GLU 251.A OE2 ARG 247.A HE 3.068 2.305 ARG 247.A NH2 GLU 251.A OE2 ARG 247.A HH21 3.089 2.345 TYR 249.A N GLU 245.A O TYR 249.A H 3.084 2.285 LEU 250.A N ASP 246.A O LEU 250.A H 2.951 2.108 GLU 251.A N ARG 247.A O GLU 251.A H 2.908 2.085 SER 252.A N GLY 248.A O SER 252.A H 2.921 2.141 SER 252.A OG TYR 249.A O SER 252.A HG 2.636 2.168 LYS 253.A N TYR 249.A O LYS 253.A H 3.100 2.466 LYS 253.A N LEU 250.A O LYS 253.A H 3.123 2.436 GLY 254.A N GLU 251.A O GLY 254.A H 2.940 2.099 THR 255.A N GLY 193.A O THR 255.A H 3.068 2.220 VAL 257.A N VAL 195.A O VAL 257.A H 2.840 2.022 ASP 260.A N THR 130.A O ASP 260.A H 2.715 1.859 ALA 263.A N ASP 260.A OD1 ALA 263.A H 3.093 2.264 PHE 264.A N ASP 260.A O PHE 264.A H 3.140 2.297 GLN 265.A N GLY 261.A O GLN 265.A H 2.813 1.991 ALA 266.A N ALA 262.A O ALA 266.A H 2.944 2.096 ALA 267.A N ALA 263.A O ALA 267.A H 3.131 2.287 ALA 268.A N PHE 264.A O ALA 268.A H 2.913 2.086 LYS 269.A N GLN 265.A O LYS 269.A H 2.901 2.056 ASP 270.A N ALA 266.A O ASP 270.A H 3.147 2.294 ALA 271.A N ALA 267.A O ALA 271.A H 3.071 2.257 VAL 272.A N ALA 268.A O VAL 272.A H 2.801 1.983 LEU 273.A N LYS 269.A O LEU 273.A H 2.951 2.112 ALA 274.A N ASP 270.A O ALA 274.A H 3.016 2.236 ASN 275.A N VAL 272.A O ASN 275.A H 3.013 2.228 ASN 275.A ND2 ALA 271.A O ASN 275.A HD21 2.807 1.962 VAL 276.A N VAL 272.A O VAL 276.A H 2.751 2.061 ILE 280.A N SER 277.A O ILE 280.A H 3.153 2.419 ARG 281.A N GLU 278.A O ARG 281.A H 3.355 2.598 ARG 281.A NE GLU 278.A OE1 ARG 281.A HE 3.286 2.548 ARG 281.A NE GLU 278.A OE2 ARG 281.A HE 3.392 2.627 ARG 281.A NH1 LEU 273.A O ARG 281.A HH12 2.934 2.266 ARG 281.A NH2 LEU 273.A O ARG 281.A HH22 2.874 2.187 ARG 281.A NH2 GLU 278.A OE2 ARG 281.A HH21 3.481 2.753 ILE 283.A N ILE 280.A O ILE 283.A H 2.953 2.281 VAL 284.A N ILE 280.A O VAL 284.A H 3.137 2.317 GLU 285.A N ARG 281.A O GLU 285.A H 2.841 1.994 SER 286.A N PRO 282.A O SER 286.A H 3.144 2.356 LEU 287.A N ILE 283.A O LEU 287.A H 2.939 2.111 PHE 288.A N VAL 284.A O PHE 288.A H 2.857 2.094 SER 289.A N SER 286.A O SER 289.A H 3.104 2.302