Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pdd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 1.A N ARG 33.A O no hydrogen 2.750 N/A LEU 3.A N LYS 35.A O LEU 3.A H 2.832 2.001 LYS 4.A N ASP 60.A OD2 LYS 4.A H 2.824 1.990 ILE 5.A N GLN 37.A O ILE 5.A H 2.994 2.156 GLY 6.A N LEU 61.A O GLY 6.A H 3.094 2.279 TYR 7.A N PHE 39.A O TYR 7.A H 3.209 2.426 HIS 14.A NE2 ASN 120.A OD1 HIS 14.A HE2 2.870 2.015 GLY 16.A N SER 13.A OG GLY 16.A H 2.925 2.111 VAL 17.A N SER 13.A O VAL 17.A H 2.827 1.994 GLY 18.A N HIS 14.A O GLY 18.A H 2.970 2.130 ALA 19.A N TYR 15.A O ALA 19.A H 2.834 1.986 THR 20.A N GLY 16.A O THR 20.A H 2.879 2.072 THR 20.A OG1 GLY 16.A O THR 20.A HG1 3.243 2.569 THR 20.A OG1 VAL 17.A O THR 20.A HG1 3.045 2.407 THR 21.A N VAL 17.A O THR 21.A H 2.962 2.112 THR 21.A OG1 VAL 17.A O THR 21.A HG1 3.053 2.332 PHE 22.A N GLY 18.A O PHE 22.A H 2.934 2.075 CYS 23.A N ALA 19.A O CYS 23.A H 2.873 2.024 CYS 23.A SG ALA 19.A O no hydrogen 3.080 N/A ASP 24.A N THR 20.A O ASP 24.A H 2.813 1.959 GLU 25.A N THR 21.A O GLU 25.A H 3.111 2.279 VAL 26.A N PHE 22.A O VAL 26.A H 2.995 2.201 GLU 27.A N CYS 23.A O GLU 27.A H 2.997 2.164 LYS 28.A N ASP 24.A O LYS 28.A H 3.148 2.312 GLY 29.A N GLU 25.A O GLY 29.A H 2.825 1.996 THR 30.A N VAL 26.A O THR 30.A H 2.818 2.057 THR 30.A OG1 VAL 26.A O THR 30.A HG1 2.751 1.972 GLN 31.A N LYS 28.A O GLN 31.A H 3.112 2.266 GLU 32.A N GLU 27.A O GLU 32.A H 2.975 2.142 ARG 33.A N THR 30.A O ARG 33.A H 2.933 2.089 ARG 33.A NE ASP 227.A OD2 ARG 33.A HE 2.909 2.124 ARG 33.A NH1 GLN 31.A OE1 ARG 33.A HH12 3.057 2.221 ARG 33.A NH2 ASP 227.A OD1 ARG 33.A HH21 2.863 2.008 TYR 34.A N THR 30.A OG1 TYR 34.A H 3.281 2.528 LYS 35.A N THR 1.A O LYS 35.A H 3.063 2.280 GLN 37.A N LEU 3.A O GLN 37.A H 2.831 2.010 HIS 38.A ND1 TYR 7.A OH HIS 38.A HD1 2.811 2.012 PHE 39.A N ILE 5.A O PHE 39.A H 2.760 1.956 SER 41.A N PRO 9.A O SER 41.A H 2.984 2.157 SER 42.A N TYR 7.A O SER 42.A H 3.084 2.225 ALA 43.A N PRO 40.A O ALA 43.A H 3.226 2.404 GLY 45.A N SER 42.A O GLY 45.A H 2.815 1.991 ARG 48.A NE GLU 147.A OE2 ARG 48.A HE 3.433 2.645 MET 50.A N GLY 46.A O MET 50.A H 2.910 2.079 ILE 51.A N GLU 47.A O ILE 51.A H 2.942 2.099 GLU 52.A N ARG 48.A O GLU 52.A H 3.072 2.243 SER 53.A N GLU 49.A O SER 53.A H 2.961 2.174 VAL 54.A N MET 50.A O VAL 54.A H 2.888 2.074 GLN 55.A N ILE 51.A O GLN 55.A H 2.935 2.097 GLN 55.A NE2 LYS 110.A O GLN 55.A HE21 2.828 1.974 LEU 56.A N GLU 52.A O LEU 56.A H 3.029 2.270 GLY 57.A N SER 53.A O GLY 57.A H 2.826 2.225 GLY 57.A N VAL 54.A O GLY 57.A H 3.118 2.430 THR 58.A N SER 53.A O THR 58.A H 2.862 2.264 GLN 59.A N SER 53.A O GLN 59.A H 3.188 2.386 GLN 59.A NE2 LEU 61.A O GLN 59.A HE21 2.836 1.977 LEU 61.A N LYS 4.A O LEU 61.A H 2.880 2.152 VAL 62.A N ILE 214.A O VAL 62.A H 2.973 2.188 ASN 63.A N GLY 6.A O ASN 63.A H 3.143 2.344 ASN 63.A ND2 TYR 15.A O ASN 63.A HD21 3.235 2.514 ASN 63.A ND2 GLN 242.A OE1 ASN 63.A HD22 2.961 2.106 THR 64.A N VAL 212.A O THR 64.A H 3.058 2.232 THR 64.A OG1 SER 65.A O THR 64.A HG1 2.902 2.107 SER 65.A N GLU 47.A OE2 SER 65.A H 2.928 2.100 THR 66.A N PRO 210.A O THR 66.A H 3.261 2.579 GLY 67.A N SER 65.A OG GLY 67.A H 2.924 2.091 LEU 69.A N THR 66.A O LEU 69.A H 3.105 2.459 ASN 71.A N PRO 68.A O ASN 71.A H 3.094 2.329 PHE 72.A N LEU 69.A O PHE 72.A H 2.908 2.086 VAL 73.A N LEU 69.A O VAL 73.A H 2.975 2.211 GLU 75.A N GLU 75.A OE1 GLU 75.A H 2.923 2.116 THR 76.A N VAL 73.A O THR 76.A H 3.047 2.214 THR 76.A OG1 VAL 73.A O THR 76.A HG1 3.132 2.342 ARG 77.A N PRO 74.A O ARG 77.A H 3.160 2.313 ARG 77.A NH2 ASN 71.A OD1 ARG 77.A HH21 3.036 2.238 ILE 78.A N GLU 75.A O ILE 78.A H 3.331 2.474 VAL 79.A N THR 76.A O VAL 79.A H 3.227 2.402 ASP 80.A N ARG 77.A O ASP 80.A H 2.969 2.147 PHE 83.A N HIS 206.A O PHE 83.A H 2.885 2.159 LEU 84.A N ILE 81.A O LEU 84.A H 3.437 2.623 ARG 86.A NH1 VAL 299.A O ARG 86.A HH12 2.799 1.956 ARG 86.A NH2 GLN 297.A O ARG 86.A HH22 2.803 2.191 ARG 86.A NH2 VAL 299.A O ARG 86.A HH22 3.459 2.814 TYR 88.A OH GLU 250.A OE2 TYR 88.A HH 2.556 1.928 HIS 90.A N ASP 87.A OD1 HIS 90.A H 2.866 2.021 HIS 90.A NE2 ILE 296.A O HIS 90.A HE2 2.724 1.875 ALA 91.A N ASP 87.A O ALA 91.A H 3.032 2.183 ARG 92.A N TYR 88.A O ARG 92.A H 2.829 1.975 ARG 92.A NE GLU 119.A OE2 ARG 92.A HE 2.886 2.033 ARG 92.A NH1 ASN 247.A OD1 ARG 92.A HH12 3.457 2.780 ARG 92.A NH2 GLU 119.A OE1 ARG 92.A HH21 2.754 1.898 ARG 92.A NH2 ASN 247.A OD1 ARG 92.A HH22 2.951 2.117 LYS 93.A N GLU 89.A O LYS 93.A H 3.082 2.258 VAL 94.A N HIS 90.A O VAL 94.A H 3.108 2.281 MET 95.A N ALA 91.A O MET 95.A H 3.053 2.218 ASP 96.A N ARG 92.A O ASP 96.A H 2.938 2.143 GLY 97.A N LYS 93.A O GLY 97.A H 2.920 2.270 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.249 2.564 GLY 100.A N VAL 94.A O GLY 100.A H 3.084 2.303 GLN 101.A N GLY 97.A O GLN 101.A H 2.956 2.130 GLN 101.A NE2 ASP 96.A O GLN 101.A HE21 3.040 2.188 ASP 102.A N ALA 98.A O ASP 102.A H 2.946 2.134 LEU 103.A N ILE 99.A O LEU 103.A H 3.231 2.454 LEU 104.A N GLY 100.A O LEU 104.A H 3.162 2.355 LYS 105.A N GLN 101.A O LYS 105.A H 3.230 2.444 LYS 106.A N ASP 102.A O LYS 106.A H 2.943 2.150 LYS 106.A NZ ASP 102.A OD2 LYS 106.A HZ3 3.022 2.221 MET 107.A N LEU 103.A O MET 107.A H 2.956 2.131 GLN 108.A N LEU 104.A O GLN 108.A H 2.883 2.073 ALA 109.A N LYS 105.A O ALA 109.A H 3.043 2.256 LYS 110.A N MET 107.A O LYS 110.A H 2.938 2.150 LYS 110.A NZ PHE 72.A O LYS 110.A HZ1 3.079 2.368 GLY 111.A N GLN 108.A O GLY 111.A H 3.033 2.183 LEU 112.A N MET 107.A O LEU 112.A H 3.174 2.358 ILE 113.A N LEU 215.A O ILE 113.A H 3.008 2.264 LEU 115.A N LEU 213.A O LEU 115.A H 2.889 2.031 TRP 117.A NE1 GLY 100.A O TRP 117.A HE1 2.910 2.071 THR 118.A N ALA 211.A O THR 118.A H 2.586 1.881 THR 118.A OG1 ASN 63.A OD1 THR 118.A HG1 2.991 2.243 ASN 120.A N SER 209.A O ASN 120.A H 2.960 2.189 ASN 120.A ND2 SER 209.A OG ASN 120.A HD21 3.038 2.245 GLY 121.A N SER 209.A O GLY 121.A H 2.905 2.086 PHE 122.A N TYR 88.A OH PHE 122.A H 3.025 2.220 ARG 123.A N VAL 207.A O ARG 123.A H 2.950 2.120 ARG 123.A NE GLU 183.A OE1 ARG 123.A HE 3.386 2.622 ARG 123.A NE GLU 183.A OE2 ARG 123.A HE 2.851 2.083 ARG 123.A NH1 SER 209.A OG ARG 123.A HH11 3.229 2.487 ARG 123.A NH2 GLU 183.A O ARG 123.A HH21 2.805 2.190 ARG 123.A NH2 GLU 183.A OE1 ARG 123.A HH21 3.399 2.660 HIS 124.A N ASN 184.A O HIS 124.A H 2.982 2.147 MET 125.A N.A THR 204.A OG1 MET 125.A H.A 3.229 2.504 MET 125.A N.B THR 204.A OG1 MET 125.A H.B 3.225 2.499 THR 126.A N GLN 182.A O THR 126.A H 2.905 2.059 THR 126.A OG1 GLN 198.A OE1 THR 126.A HG1 2.644 1.894 ASN 127.A N HIS 200.A O ASN 127.A H 3.019 2.282 ASN 127.A ND2 ARG 130.A O ASN 127.A HD22 2.766 1.942 SER 128.A N ASP 180.A O SER 128.A H 2.945 2.285 SER 128.A OG ASP 180.A O SER 128.A HG 3.120 2.661 LYS 129.A N ASN 127.A OD1 LYS 129.A H 2.834 2.015 ARG 130.A N ASN 127.A OD1 ARG 130.A H 2.916 2.092 ARG 130.A NE ASP 137.A O ARG 130.A HE 2.809 1.998 ARG 130.A NH2 ASP 137.A O ARG 130.A HH21 3.155 2.467 LEU 133.A N ASP 137.A OD2 LEU 133.A H 2.883 2.056 GLN 134.A N ASP 137.A OD2 GLN 134.A H 3.154 2.431 ALA 135.A N SER 272.A OG ALA 135.A H 2.971 2.150 ASP 137.A N GLN 134.A O ASP 137.A H 2.920 2.144 ALA 138.A N ALA 135.A O ALA 138.A H 2.954 2.183 ALA 139.A N SER 136.A O ALA 139.A H 3.325 2.563 GLY 140.A N GLY 159.A O GLY 140.A H 3.021 2.187 LEU 141.A N ALA 138.A O LEU 141.A H 3.056 2.203 LYS 142.A N ASP 180.A OD2 LYS 142.A H 2.943 2.098 VAL 143.A N LEU 161.A O VAL 143.A H 2.940 2.119 ARG 144.A N GLY 181.A O ARG 144.A H 2.873 2.108 ARG 144.A NE MET 165.A O ARG 144.A HE 2.962 2.222 ARG 144.A NH1 MET 165.A O ARG 144.A HH11 2.833 2.083 THR 145.A N THR 163.A O THR 145.A H 2.953 2.133 THR 145.A OG1 MET 146.A O THR 145.A HG1 2.944 2.177 ASN 148.A N MET 146.A O ASN 148.A H 2.827 2.181 ASN 148.A ND2 GLY 67.A O ASN 148.A HD21 2.826 2.034 ASN 148.A ND2 ASP 80.A OD2 ASN 148.A HD22 2.903 2.142 LYS 149.A NZ GLU 287.A OE1 LYS 149.A HZ1 3.027 2.198 VAL 150.A N ASN 148.A OD1 VAL 150.A H 2.824 2.211 HIS 151.A N ASN 148.A OD1 HIS 151.A H 2.969 2.160 MET 152.A N ASN 148.A O MET 152.A H 3.023 2.183 ASP 153.A N LYS 149.A O ASP 153.A H 2.919 2.063 GLY 154.A N VAL 150.A O GLY 154.A H 2.830 2.018 TYR 155.A N HIS 151.A O TYR 155.A H 2.800 1.952 TYR 155.A OH GLU 183.A OE2 TYR 155.A HH 2.697 1.954 LYS 156.A N MET 152.A O LYS 156.A H 3.116 2.350 THR 157.A N GLY 154.A O THR 157.A H 3.175 2.398 THR 157.A OG1 GLY 154.A O THR 157.A HG1 2.732 1.939 PHE 158.A N TYR 155.A O PHE 158.A H 2.921 2.120 GLY 159.A N LYS 156.A O GLY 159.A H 2.936 2.103 LEU 161.A N LEU 141.A O LEU 161.A H 2.822 1.970 THR 163.A N VAL 143.A O THR 163.A H 3.155 2.383 MET 165.A N THR 145.A O MET 165.A H 3.021 2.229 GLU 169.A N ALA 166.A O GLU 169.A H 3.074 2.248 LEU 170.A N PHE 167.A O LEU 170.A H 2.938 2.084 ALA 173.A N GLU 169.A O ALA 173.A H 3.187 2.361 LEU 174.A N LEU 170.A O LEU 174.A H 2.882 2.054 GLN 175.A N PHE 171.A O GLN 175.A H 2.900 2.087 GLN 176.A N THR 172.A O GLN 176.A H 2.916 2.086 GLY 177.A N LEU 174.A O GLY 177.A H 3.257 2.511 THR 178.A N ALA 173.A O THR 178.A H 3.021 2.415 ASP 180.A N LYS 142.A O ASP 180.A H 2.713 2.006 GLY 181.A N LYS 142.A O GLY 181.A H 3.112 2.408 GLN 182.A N THR 126.A O GLN 182.A H 3.077 2.317 GLN 182.A NE2 THR 126.A OG1 GLN 182.A HE21 2.852 1.999 ASN 184.A N HIS 124.A O ASN 184.A H 3.052 2.282 ASN 184.A ND2 GLN 182.A OE1 ASN 184.A HD21 2.900 2.057 VAL 188.A N PRO 185.A O VAL 188.A H 2.987 2.266 ILE 189.A N PRO 185.A O ILE 189.A H 3.035 2.205 LEU 190.A N ILE 186.A O LEU 190.A H 2.832 1.981 SER 191.A N PRO 187.A O SER 191.A H 3.292 2.480 SER 192.A N VAL 188.A O SER 192.A H 2.955 2.269 LYS 193.A N LEU 190.A O LYS 193.A H 3.269 2.431 SER 195.A OG ASP 260.A OD2 SER 195.A HG 3.423 2.630 GLN 196.A N LYS 193.A O GLN 196.A H 3.343 2.496 VAL 197.A N PHE 194.A O VAL 197.A H 3.078 2.270 GLN 198.A NE2 ASP 180.A O GLN 198.A HE22 3.247 2.413 GLN 198.A NE2 VAL 197.A O GLN 198.A HE21 2.947 2.098 HIS 200.A N ASN 127.A O HIS 200.A H 2.906 2.151 LEU 201.A N GLN 263.A O LEU 201.A H 2.989 2.144 SER 202.A N MET 125.A O.A SER 202.A H 2.910 2.071 SER 202.A N MET 125.A O.B SER 202.A H 2.911 2.073 SER 202.A OG ILE 132.A O SER 202.A HG 2.531 1.927 LEU 203.A N VAL 265.A O LEU 203.A H 2.922 2.091 HIS 206.A N ARG 123.A O HIS 206.A H 3.119 2.459 HIS 206.A NE2 GLU 183.A OE2 HIS 206.A HE2 2.859 2.014 SER 209.A N GLY 121.A O SER 209.A H 2.913 2.138 VAL 212.A N THR 64.A O VAL 212.A H 2.809 2.125 LEU 213.A N ALA 116.A O LEU 213.A H 3.219 2.417 ILE 214.A N VAL 62.A O ILE 214.A H 2.865 2.030 LEU 215.A N ILE 113.A O LEU 215.A H 2.952 2.111 SER 216.A N ASP 60.A O SER 216.A H 2.897 2.166 VAL 219.A N SER 216.A OG VAL 219.A H 3.195 2.374 TRP 220.A N SER 216.A O TRP 220.A H 3.046 2.192 ASP 221.A N SER 217.A O ASP 221.A H 2.968 2.129 LYS 222.A N VAL 219.A O LYS 222.A H 2.976 2.239 LEU 223.A N TRP 220.A O LEU 223.A H 3.049 2.218 ASP 227.A N SER 224.A OG ASP 227.A H 2.957 2.143 LYS 228.A N SER 224.A O LYS 228.A H 2.990 2.154 LYS 228.A NZ GLU 225.A OE2 LYS 228.A HZ2 3.025 2.160 LYS 229.A N GLU 225.A O LYS 229.A H 3.309 2.506 VAL 230.A N ALA 226.A O VAL 230.A H 3.182 2.416 PHE 231.A N ASP 227.A O PHE 231.A H 2.922 2.110 VAL 232.A N LYS 228.A O VAL 232.A H 3.177 2.341 ALA 233.A N LYS 229.A O ALA 233.A H 2.957 2.100 ALA 234.A N VAL 230.A O ALA 234.A H 2.808 1.978 ALA 235.A N PHE 231.A O ALA 235.A H 2.988 2.199 GLN 236.A N VAL 232.A O GLN 236.A H 2.968 2.184 LYS 237.A N ALA 233.A O LYS 237.A H 3.020 2.225 ALA 238.A N ALA 234.A O ALA 238.A H 3.070 2.287 THR 239.A N ALA 235.A O THR 239.A H 3.003 2.234 THR 239.A OG1 TRP 117.A O THR 239.A HG1 2.689 2.086 VAL 240.A N LYS 237.A O VAL 240.A H 3.166 2.570 ALA 241.A N LYS 237.A O ALA 241.A H 3.232 2.403 GLN 242.A N ALA 238.A O GLN 242.A H 2.795 1.975 GLN 242.A NE2 GLU 119.A O GLN 242.A HE21 2.724 1.891 ARG 243.A N THR 239.A O ARG 243.A H 2.963 2.108 ARG 243.A NH1 ASP 96.A OD1 ARG 243.A HH12 3.450 2.869 ARG 243.A NH1 ASP 96.A OD2 ARG 243.A HH12 2.805 1.947 ARG 243.A NH2 ASP 96.A OD1 ARG 243.A HH22 2.758 1.981 LYS 244.A N VAL 240.A O LYS 244.A H 2.971 2.153 ARG 245.A N ALA 241.A O ARG 245.A H 3.092 2.328 ARG 245.A NE ASP 249.A OD1 ARG 245.A HE 2.941 2.133 ARG 245.A NH1 ASP 12.A OD1 ARG 245.A HH12 3.540 2.878 ARG 245.A NH2 ASP 12.A OD1 ARG 245.A HH22 2.959 2.123 VAL 246.A N GLN 242.A O VAL 246.A H 2.925 2.095 ASN 247.A N ARG 243.A O ASN 247.A H 2.846 2.002 ASP 248.A N LYS 244.A O ASP 248.A H 2.922 2.121 ASP 249.A N ARG 245.A O ASP 249.A H 2.801 1.958 GLU 250.A N VAL 246.A O GLU 250.A H 3.069 2.296 ALA 251.A N ASN 247.A O ALA 251.A H 3.084 2.274 ASN 252.A N ASP 248.A O ASN 252.A H 3.235 2.505 GLY 253.A N ASP 249.A O GLY 253.A H 2.706 2.078 GLN 256.A N ASN 252.A O GLN 256.A H 3.402 2.579 GLN 256.A NE2 ASP 260.A OD1 GLN 256.A HE21 3.048 2.358 LEU 257.A N GLY 253.A O LEU 257.A H 2.823 1.992 LYS 258.A N ILE 254.A O LYS 258.A H 2.935 2.130 LYS 259.A N THR 255.A O LYS 259.A H 3.006 2.182 ASP 260.A N GLN 256.A O ASP 260.A H 2.928 2.194 GLY 261.A N LYS 258.A O GLY 261.A H 2.942 2.143 MET 262.A N LEU 257.A O MET 262.A H 2.990 2.167 GLN 263.A N LYS 199.A O GLN 263.A H 2.729 1.891 VAL 265.A N LEU 201.A O VAL 265.A H 2.778 1.938 ASP 269.A N LEU 133.A O ASP 269.A H 2.826 1.973 SER 272.A N ASP 269.A O SER 272.A H 3.198 2.565 SER 272.A N ASP 269.A OD1 SER 272.A H 3.033 2.248 SER 272.A OG ASP 269.A O SER 272.A HG 2.628 2.154 PHE 273.A N GLY 270.A O PHE 273.A H 3.124 2.531 ARG 274.A N GLY 270.A O ARG 274.A H 3.039 2.225 ARG 274.A NH1 GLY 270.A O ARG 274.A HH11 3.052 2.267 LYS 275.A N GLU 271.A O LYS 275.A H 2.862 2.029 ALA 276.A N SER 272.A O ALA 276.A H 3.220 2.477 VAL 277.A N PHE 273.A O VAL 277.A H 3.185 2.469 ALA 278.A N ARG 274.A O ALA 278.A H 3.243 2.607 ALA 280.A N VAL 277.A O ALA 280.A H 2.881 2.179 TYR 281.A N ALA 278.A O TYR 281.A H 2.977 2.144 ALA 282.A N PRO 279.A O ALA 282.A H 3.284 2.451 PHE 284.A N ALA 280.A O PHE 284.A H 3.007 2.180 ALA 285.A N TYR 281.A O ALA 285.A H 2.885 2.033 LYS 286.A N ALA 282.A O LYS 286.A H 3.022 2.209 GLU 287.A N GLY 283.A O GLU 287.A H 3.075 2.274 PHE 288.A N PHE 284.A O PHE 288.A H 2.872 2.031 GLY 289.A N ALA 285.A O GLY 289.A H 2.776 1.994 GLU 291.A N GLU 291.A OE1 GLU 291.A H 2.616 1.828 ARG 292.A N GLY 289.A O ARG 292.A H 3.006 2.331 ILE 293.A N GLY 289.A O ILE 293.A H 3.159 2.337 ALA 294.A N ALA 290.A O ALA 294.A H 2.907 2.088 ALA 295.A N GLU 291.A O ALA 295.A H 2.962 2.215 ILE 296.A N ARG 292.A O ILE 296.A H 3.187 2.361 GLN 297.A N ILE 293.A O GLN 297.A H 2.999 2.191 ALA 298.A N ALA 294.A O ALA 298.A H 2.925 2.193 VAL 299.A N ILE 296.A O VAL 299.A H 3.283 2.524 ALA 301.A N ALA 298.A O ALA 301.A H 3.196 2.354