Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pet_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 4.A N ARG 34.A O TYR 4.A H 2.707 1.849 TRP 6.A N THR 36.A O TRP 6.A H 2.739 1.889 LYS 7.A N GLN 61.A OE1 LYS 7.A H 2.847 2.012 LEU 8.A N ARG 38.A O LEU 8.A H 2.641 1.826 GLU 10.A N ASP 40.A O GLU 10.A H 2.925 2.084 THR 11.A N HIS 63.A O THR 11.A H 3.053 2.250 THR 11.A OG1 ALA 48.A O THR 11.A HG1 2.899 2.107 ILE 18.A N ASP 21.A OD2 ILE 18.A H 2.846 1.992 PHE 19.A N PRO 17.A O PHE 19.A H 2.694 1.983 GLY 20.A N PHE 16.A O GLY 20.A H 2.953 2.308 ALA 22.A N ILE 18.A O ALA 22.A H 3.062 2.303 THR 23.A OG1 GLU 10.A OE1 THR 23.A HG1 2.693 1.939 LYS 24.A N GLY 20.A O LYS 24.A H 3.295 2.450 ASN 25.A N ASP 21.A O ASN 25.A H 2.734 1.879 ALA 26.A N THR 23.A O ALA 26.A H 2.856 2.000 LYS 27.A N LYS 24.A O LYS 27.A H 2.847 2.032 LYS 29.A N ALA 26.A O LYS 29.A H 3.046 2.203 GLU 30.A N LYS 27.A O GLU 30.A H 2.929 2.083 SER 31.A N VAL 28.A O SER 31.A H 2.854 2.053 SER 31.A OG LYS 29.A O SER 31.A HG 3.286 2.516 ASN 32.A N GLU 30.A O ASN 32.A H 3.172 2.329 GLY 33.A N LYS 29.A O GLY 33.A H 2.926 2.118 ARG 34.A N SER 31.A O ARG 34.A H 3.044 2.198 ARG 34.A NE SER 31.A O ARG 34.A HE 3.009 2.225 ARG 34.A NH1 ASP 218.A OD2 ARG 34.A HH12 2.930 2.072 LEU 35.A N SER 31.A OG LEU 35.A H 2.983 2.125 THR 36.A N TYR 4.A O THR 36.A H 3.055 2.223 ARG 38.A N TRP 6.A O ARG 38.A H 2.902 2.103 ARG 38.A NH1 ASP 40.A OD1 ARG 38.A HH11 3.172 2.320 ARG 38.A NH1 ASP 40.A OD2 ARG 38.A HH11 2.950 2.301 ASP 40.A N LEU 8.A O ASP 40.A H 2.725 1.869 SER 42.A N TRP 12.A O SER 42.A H 2.907 2.063 LYS 44.A N SER 41.A O LYS 44.A H 2.888 2.107 HIS 45.A N SER 41.A O HIS 45.A H 3.261 2.450 HIS 45.A NE2 GLU 10.A O HIS 45.A HE2 2.701 1.870 LYS 46.A N SER 42.A O LYS 46.A H 2.993 2.225 LYS 46.A NZ ASN 43.A O LYS 46.A HZ2 3.055 2.285 LYS 46.A NZ LYS 44.A O LYS 46.A HZ2 3.496 2.911 GLY 50.A N SER 47.A O GLY 50.A H 2.800 1.965 PHE 54.A N GLY 50.A O PHE 54.A H 2.986 2.198 VAL 55.A N ILE 51.A O VAL 55.A H 3.064 2.240 LYS 56.A N PHE 52.A O LYS 56.A H 2.970 2.110 SER 57.A N ASP 53.A O SER 57.A H 3.108 2.279 GLY 58.A N VAL 55.A O GLY 58.A H 3.085 2.376 GLN 59.A N SER 57.A OG GLN 59.A H 3.047 2.190 TYR 60.A N PHE 54.A O TYR 60.A H 3.085 2.230 GLN 61.A N GLN 61.A OE1 GLN 61.A H 3.011 2.305 HIS 63.A N ALA 9.A O HIS 63.A H 3.039 2.293 HIS 63.A NE2 GLY 113.A O HIS 63.A HE2 2.820 1.963 SER 64.A N GLN 205.A O SER 64.A H 2.864 2.049 TYR 67.A N THR 79.A OG1 TYR 67.A H 2.847 2.171 TYR 67.A OH GLU 199.A OE1 TYR 67.A HH 2.750 2.175 TYR 68.A N ALA 65.A O TYR 68.A H 3.039 2.192 TRP 69.A N SER 66.A O TRP 69.A H 3.099 2.241 TRP 69.A NE1 GLN 205.A OE1 TRP 69.A HE1 2.906 2.081 LYS 70.A NZ GLY 141.A O LYS 70.A HZ3 2.950 2.177 LYS 70.A NZ GLU 145.A OE2 LYS 70.A HZ2 2.952 2.106 LYS 72.A N TRP 69.A O LYS 72.A H 2.756 1.979 LYS 72.A NZ ASP 53.A OD1 LYS 72.A HZ2 3.434 2.807 ASN 73.A N TRP 69.A O ASN 73.A H 3.042 2.305 ASN 73.A ND2 TYR 107.A OH ASN 73.A HD21 2.987 2.153 ASN 75.A N ASN 73.A OD1 ASN 75.A H 2.798 1.999 ASN 75.A ND2 ASP 279.A OD2 ASN 75.A HD22 3.154 2.330 THR 76.A N ASN 73.A O THR 76.A H 3.023 2.189 THR 76.A OG1 ASN 73.A O THR 76.A HG1 2.723 1.917 PHE 83.A N TRP 197.A O PHE 83.A H 2.888 2.060 GLY 84.A N VAL 81.A O GLY 84.A H 2.851 2.101 ILE 85.A N GLU 88.A OE2 ILE 85.A H 3.053 2.274 GLN 89.A N ILE 85.A O GLN 89.A H 2.930 2.127 GLN 89.A NE2 THR 79.A O GLN 89.A HE22 2.959 2.108 HIS 90.A N ALA 86.A O HIS 90.A H 2.986 2.190 HIS 90.A NE2 GLU 203.A OE1 HIS 90.A HE2 2.883 2.149 ALA 91.A N SER 87.A O ALA 91.A H 3.440 2.610 TRP 92.A N GLU 88.A O TRP 92.A H 2.919 2.115 TRP 92.A NE1 SER 287.A OG TRP 92.A HE1 3.077 2.223 PHE 93.A N GLN 89.A O PHE 93.A H 2.786 1.960 TYR 94.A N HIS 90.A O TYR 94.A H 3.008 2.150 TYR 95.A N ALA 91.A O TYR 95.A H 2.892 2.131 GLY 96.A N TRP 92.A O GLY 96.A H 2.899 2.185 GLY 98.A N TRP 92.A O GLY 98.A H 2.993 2.185 LEU 100.A N GLY 97.A O LEU 100.A H 3.180 2.362 LYS 101.A NZ ASP 105.A OD2 LYS 101.A HZ3 2.725 1.899 LYS 102.A N GLU 99.A O LYS 102.A H 3.099 2.312 LYS 102.A NZ GLU 283.A OE2 LYS 102.A HZ1 3.445 2.607 VAL 103.A N LEU 100.A O VAL 103.A H 3.137 2.384 ASP 105.A N LYS 101.A O ASP 105.A H 2.843 2.045 GLN 106.A NE2 VAL 103.A O GLN 106.A HE21 2.741 1.960 TYR 107.A N TYR 104.A O TYR 107.A H 2.891 2.063 GLY 108.A N ASP 105.A O GLY 108.A H 3.009 2.157 ILE 109.A N TYR 104.A O ILE 109.A H 3.421 2.587 PHE 111.A N PHE 206.A O PHE 111.A H 2.906 2.080 GLY 113.A N LEU 204.A O GLY 113.A H 2.752 1.985 GLY 114.A N GLU 203.A OE2 GLY 114.A H 2.770 1.969 ASN 115.A ND2 GLN 89.A OE1 ASN 115.A HD22 3.050 2.467 ASN 115.A ND2 GLY 201.A O ASN 115.A HD22 3.200 2.434 ASN 115.A ND2 GLU 203.A OE1 ASN 115.A HD21 2.930 2.079 THR 116.A N THR 202.A O THR 116.A H 2.940 2.158 THR 116.A OG1 GLY 117.A O THR 116.A HG1 2.957 2.169 GLY 117.A N ASN 115.A OD1 GLY 117.A H 2.810 2.000 GLN 119.A N GLU 199.A O GLN 119.A H 2.877 2.096 GLN 119.A NE2 THR 116.A OG1 GLN 119.A HE21 2.886 2.051 GLY 120.A N TYR 194.A O GLY 120.A H 2.637 1.944 TRP 122.A N LEU 174.A O TRP 122.A H 2.728 1.897 TRP 122.A NE1 ASP 182.A OD2 TRP 122.A HE1 2.841 2.040 PHE 123.A N TYR 192.A O PHE 123.A H 2.903 2.145 LYS 124.A NZ ILE 189.A O LYS 124.A HZ3 3.378 2.504 ILE 127.A N TYR 194.A OH ILE 127.A H 2.763 1.958 ASN 128.A N ASP 132.A OD2 ASN 128.A H 2.700 1.894 SER 129.A N ASP 132.A OD2 SER 129.A H 3.018 2.316 ASP 132.A N SER 129.A O ASP 132.A H 3.105 2.427 LEU 133.A N VAL 130.A O LEU 133.A H 2.994 2.186 LYS 134.A N GLU 131.A O LYS 134.A H 3.043 2.238 GLY 135.A N GLY 151.A O GLY 135.A H 2.912 2.053 LEU 136.A N LEU 133.A O LEU 136.A H 3.062 2.228 LYS 137.A N ASP 172.A OD2 LYS 137.A H 2.941 2.104 ARG 138.A N ALA 173.A O ARG 138.A H 3.105 2.365 ARG 138.A NE ILE 157.A O ARG 138.A HE 2.993 2.247 ARG 138.A NH1 GLU 175.A O ARG 138.A HH11 2.937 2.158 ARG 138.A NH2 ASN 156.A OD1 ARG 138.A HH21 3.342 2.663 ILE 139.A N THR 155.A O ILE 139.A H 3.094 2.345 GLY 144.A N PRO 140.A O GLY 144.A H 3.395 2.626 GLY 144.A N GLY 141.A O GLY 144.A H 3.086 2.433 VAL 146.A N PHE 142.A O VAL 146.A H 2.963 2.156 LEU 147.A N ALA 143.A O LEU 147.A H 2.886 2.041 ALA 148.A N GLY 144.A O ALA 148.A H 3.022 2.205 LYS 149.A N GLU 145.A O LYS 149.A H 3.127 2.400 LYS 149.A N VAL 146.A O LYS 149.A H 3.015 2.398 LYS 149.A NZ GLU 270.A OE1 LYS 149.A HZ2 2.978 2.164 LEU 150.A N LEU 147.A O LEU 150.A H 2.974 2.318 GLY 151.A N ALA 148.A O GLY 151.A H 2.887 2.041 ALA 152.A N LEU 147.A O ALA 152.A H 2.965 2.169 LYS 153.A N LEU 136.A O LYS 153.A H 2.755 1.898 GLU 161.A N PRO 158.A O GLU 161.A H 2.927 2.095 LEU 162.A N SER 159.A O LEU 162.A H 3.317 2.459 ALA 165.A N GLU 161.A O ALA 165.A H 3.141 2.307 LEU 166.A N LEU 162.A O LEU 166.A H 3.057 2.239 GLU 167.A N TYR 163.A O GLU 167.A H 2.817 1.968 ARG 168.A N THR 164.A O ARG 168.A H 2.979 2.256 ASN 169.A N LEU 166.A O ASN 169.A H 3.127 2.305 THR 170.A N ALA 165.A O THR 170.A H 2.896 2.237 ILE 171.A N ALA 165.A O ILE 171.A H 3.272 2.457 ASP 172.A N LYS 137.A O ASP 172.A H 2.637 1.808 ALA 173.A N LYS 137.A O ALA 173.A H 3.295 2.605 LEU 174.A N TRP 122.A O LEU 174.A H 3.091 2.313 GLU 175.A N ARG 138.A O GLU 175.A H 2.964 2.162 VAL 177.A N ASP 182.A OD1 VAL 177.A H 3.067 2.219 GLY 178.A N ASP 182.A OD1 GLY 178.A H 2.995 2.198 LEU 181.A N GLY 178.A O LEU 181.A H 3.120 2.277 ASP 182.A N GLY 178.A O ASP 182.A H 2.740 1.929 GLY 185.A N LEU 183.A O GLY 185.A H 3.034 2.250 LYS 188.A N GLY 185.A O LYS 188.A H 2.891 2.067 ILE 189.A N PHE 186.A O ILE 189.A H 3.071 2.232 ALA 190.A N PHE 186.A O ALA 190.A H 2.920 2.157 TYR 192.A N PHE 123.A O TYR 192.A H 3.126 2.292 TYR 193.A N GLN 254.A O TYR 193.A H 2.984 2.156 TYR 193.A OH ASP 182.A OD2 TYR 193.A HH 2.945 2.213 TYR 194.A N GLY 121.A O TYR 194.A H 2.819 1.980 THR 195.A N ARG 255.A O THR 195.A H 2.950 2.186 THR 202.A OG1 GLU 199.A OE1 THR 202.A HG1 2.619 2.046 GLU 203.A N THR 79.A O GLU 203.A H 3.014 2.161 LEU 204.A N GLY 114.A O no hydrogen 2.616 N/A GLN 205.A N SER 64.A O GLN 205.A H 2.818 2.036 GLN 205.A NE2 TYR 104.A OH GLN 205.A HE22 2.959 2.162 GLN 205.A NE2 SER 110.A OG GLN 205.A HE21 2.966 2.108 PHE 206.A N PHE 111.A O PHE 206.A H 2.869 2.084 ASN 208.A N GLN 61.A O ASN 208.A H 2.865 2.024 ASN 208.A ND2 VAL 55.A O ASN 208.A HD21 2.844 2.025 GLN 209.A N GLY 108.A O GLN 209.A H 3.062 2.203 GLN 209.A NE2 ASN 213.A OD1 GLN 209.A HE21 2.942 2.107 ALA 211.A N ASN 208.A OD1 ALA 211.A H 2.884 2.108 TYR 212.A N ASN 208.A O TYR 212.A H 2.904 2.065 ASN 213.A N GLN 209.A O ASN 213.A H 2.776 1.949 SER 214.A N LYS 210.A O SER 214.A H 3.196 2.554 SER 214.A N ALA 211.A O SER 214.A H 3.046 2.326 SER 214.A OG ALA 211.A O SER 214.A HG 2.643 2.218 LEU 215.A N TYR 212.A O LEU 215.A H 2.968 2.149 GLN 220.A N PRO 216.A O GLN 220.A H 2.947 2.134 GLN 220.A NE2 TYR 212.A O GLN 220.A HE21 3.170 2.450 GLN 220.A NE2 LEU 215.A O GLN 220.A HE21 3.114 2.644 LYS 221.A N LYS 217.A O LYS 221.A H 3.090 2.286 ILE 222.A N ASP 218.A O ILE 222.A H 3.001 2.190 LEU 223.A N LEU 219.A O LEU 223.A H 2.966 2.127 THR 224.A N GLN 220.A O THR 224.A H 3.040 2.205 VAL 225.A N LYS 221.A O VAL 225.A H 2.844 1.991 ALA 226.A N ILE 222.A O ALA 226.A H 2.838 2.007 LYS 227.A N THR 224.A O LYS 227.A H 3.078 2.247 ALA 228.A N VAL 225.A O ALA 228.A H 2.944 2.089 ALA 229.A N ALA 226.A O ALA 229.A H 2.890 2.048 TYR 231.A N LYS 227.A O TYR 231.A H 2.943 2.094 ASP 232.A N ALA 228.A O ASP 232.A H 2.981 2.120 TYR 233.A N TYR 231.A O TYR 233.A H 3.064 2.359 GLN 235.A N ASP 232.A O GLN 235.A H 2.848 2.030 GLN 235.A NE2 ASP 21.A OD2 GLN 235.A HE22 2.974 2.152 HIS 237.A N SER 234.A O HIS 237.A H 2.906 2.083 ALA 238.A N GLN 235.A O ALA 238.A H 2.743 1.896 SER 239.A N SER 236.A O SER 239.A H 3.020 2.216 VAL 241.A N HIS 237.A O VAL 241.A H 3.032 2.214 ASN 242.A N ALA 238.A O ASN 242.A H 2.856 2.047 ASN 242.A ND2 PRO 179.A O ASN 242.A HD21 2.885 2.107 ASN 242.A ND2 SER 180.A O ASN 242.A HD21 3.140 2.676 LEU 243.A N SER 239.A O LEU 243.A H 2.808 1.994 ALA 244.A N GLY 240.A O ALA 244.A H 3.136 2.339 LEU 246.A N ASN 242.A O no hydrogen 2.896 N/A LYS 247.A N LEU 243.A O LYS 247.A H 2.955 2.189 LYS 248.A N SER 245.A O no hydrogen 2.936 N/A LYS 248.A NZ ASP 249.A OD1 LYS 248.A HZ2 3.376 2.743 ASP 249.A N SER 245.A O no hydrogen 2.675 N/A VAL 253.A N TYR 250.A O VAL 253.A H 3.072 2.235 GLN 254.A N PRO 191.A O GLN 254.A H 2.807 1.951 ARG 255.A N TYR 193.A O ARG 255.A H 2.749 1.946 ARG 255.A NE GLU 126.A OE2 ARG 255.A HE 2.784 1.933 ARG 255.A NH2 GLN 254.A OE1 ARG 255.A HH22 2.847 2.117 SER 256.A OG THR 195.A OG1 SER 256.A HG 3.302 2.717 GLU 262.A N LYS 259.A O GLU 262.A H 2.782 1.983 ALA 263.A N PRO 260.A O ALA 263.A H 3.106 2.264 ILE 264.A N VAL 261.A O ILE 264.A H 3.010 2.212 GLN 266.A N GLU 262.A O GLN 266.A H 3.095 2.271 ALA 267.A N ALA 263.A O ALA 267.A H 2.948 2.155 ASN 268.A N ILE 264.A O ASN 268.A H 2.901 2.047 ASP 269.A N VAL 265.A O ASP 269.A H 2.935 2.085 GLU 270.A N GLN 266.A O GLU 270.A H 2.824 1.995 LEU 271.A N ALA 267.A O LEU 271.A H 2.889 2.093 LEU 272.A N ASN 268.A O LEU 272.A H 2.896 2.087 GLU 273.A N ASP 269.A O GLU 273.A H 3.171 2.336 GLU 274.A N GLU 270.A O GLU 274.A H 3.153 2.401 PHE 275.A N LEU 271.A O PHE 275.A H 2.850 2.008 ALA 276.A N LEU 272.A O ALA 276.A H 2.927 2.081 ALA 277.A N GLU 273.A O ALA 277.A H 3.331 2.626 LYS 278.A N PHE 275.A O LYS 278.A H 3.240 2.473 THR 281.A N ASP 279.A OD2 THR 281.A H 3.132 2.382 THR 281.A OG1 ASN 75.A OD1 THR 281.A HG1 2.570 1.762 ALA 282.A N ASP 279.A O ALA 282.A H 2.976 2.198 GLU 283.A N PRO 280.A O GLU 283.A H 2.960 2.175 LEU 285.A N THR 281.A O LEU 285.A H 2.916 2.057 LYS 286.A N ALA 282.A O LYS 286.A H 2.856 2.039 SER 287.A N GLU 283.A O SER 287.A H 3.046 2.213 LEU 288.A N ILE 284.A O LEU 288.A H 2.995 2.167 ASN 289.A N LEU 285.A O ASN 289.A H 2.881 2.088 ASP 290.A N LYS 286.A O ASP 290.A H 2.910 2.052 TYR 291.A N SER 287.A O TYR 291.A H 2.912 2.089 LYS 292.A N LEU 288.A O LYS 292.A H 2.884 2.036 LYS 292.A NZ PHE 83.A O LYS 292.A HZ3 3.324 2.510 HIS 293.A N ASN 289.A O HIS 293.A H 2.985 2.155 GLN 294.A N ASP 290.A O GLN 294.A H 3.138 2.378 ILE 295.A N TYR 291.A O ILE 295.A H 2.896 2.046 ARG 296.A N LYS 292.A O ARG 296.A H 2.857 2.019 ARG 296.A NE GLU 88.A OE1 ARG 296.A HE 3.121 2.264 ARG 296.A NH2 GLY 84.A O ARG 296.A HH22 3.163 2.420 ARG 296.A NH2 GLU 88.A OE2 ARG 296.A HH21 3.013 2.154 TRP 298.A N ILE 295.A O TRP 298.A H 2.898 2.279 THR 299.A N ILE 295.A O THR 299.A H 3.000 2.167 THR 299.A OG1 GLU 88.A OE1 THR 299.A HG1 2.560 1.841 ASN 300.A N ARG 296.A O ASN 300.A H 2.832 1.999 LEU 301.A N ALA 297.A O LEU 301.A H 3.007 2.242 SER 302.A N TRP 298.A O SER 302.A H 2.920 2.306 ARG 304.A N THR 299.A O ARG 304.A H 2.935 2.076 ALA 305.A N ASN 300.A O ALA 305.A H 3.320 2.606 TYR 306.A N SER 302.A O TYR 306.A H 3.210 2.390 LEU 307.A N ASP 303.A O LEU 307.A H 2.783 1.944 ASP 308.A N ARG 304.A O ASP 308.A H 2.772 1.922 ASN 309.A N ALA 305.A O ASN 309.A H 2.990 2.310 ASN 309.A N TYR 306.A O ASN 309.A H 3.241 2.587 ASN 309.A ND2 ALA 305.A O ASN 309.A HD21 2.600 1.808 PHE 310.A N TYR 306.A O PHE 310.A H 2.987 2.230