Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pf6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A NZ ALA 29.A O LYS 2.A HZ3 2.750 1.880 ILE 3.A N PHE 31.A O ILE 3.A H 3.034 2.212 LEU 5.A N THR 33.A O LEU 5.A H 2.793 1.941 ARG 6.A N GLU 58.A OE1 ARG 6.A H 2.767 1.922 ARG 6.A NE GLU 58.A OE1 ARG 6.A HE 2.906 2.052 ARG 6.A NH2 GLY 55.A O ARG 6.A HH22 2.990 2.353 ARG 6.A NH2 GLU 58.A OE2 ARG 6.A HH21 2.853 2.001 THR 8.A N HIS 37.A O THR 8.A H 3.079 2.276 ALA 10.A N THR 8.A OG1 ALA 10.A H 2.999 2.151 SER 11.A OG ASP 189.A OD2 SER 11.A HG 2.670 1.965 GLU 12.A N GLU 12.A OE1 GLU 12.A H 2.711 1.866 THR 13.A N SER 11.A OG THR 13.A H 3.252 2.584 THR 13.A OG1 ASP 189.A OD1 THR 13.A HG1 2.663 1.991 ASP 14.A N SER 11.A OG ASP 14.A H 3.058 2.420 ARG 16.A N ASP 14.A OD1 ARG 16.A H 2.880 2.075 ARG 16.A NE ASP 14.A OD1 ARG 16.A HE 2.898 2.107 ARG 16.A NH1 ASN 209.A OD1 ARG 16.A HH11 2.850 2.124 ARG 16.A NH2 ASP 14.A OD1 ARG 16.A HH21 3.398 2.746 ARG 16.A NH2 ASP 14.A OD2 ARG 16.A HH21 2.838 1.982 SER 17.A OG SER 11.A O SER 17.A HG 2.840 2.097 VAL 18.A N ASP 14.A O VAL 18.A H 2.880 2.040 ALA 19.A N GLN 15.A O ALA 19.A H 2.943 2.121 LEU 20.A N ARG 16.A O LEU 20.A H 3.110 2.284 ALA 21.A N SER 17.A O ALA 21.A H 2.965 2.154 GLU 22.A N VAL 18.A O GLU 22.A H 2.772 2.009 VAL 23.A N ALA 19.A O VAL 23.A H 2.865 2.100 PHE 24.A N ALA 19.A O PHE 24.A H 3.283 2.498 ALA 25.A N LEU 20.A O ALA 25.A H 2.861 2.067 ALA 29.A N PRO 26.A O ALA 29.A H 3.404 2.557 PHE 31.A N VAL 28.A O PHE 31.A H 3.035 2.186 ALA 32.A N VAL 28.A O ALA 32.A H 2.892 2.173 THR 33.A N ILE 3.A O THR 33.A H 2.763 1.962 GLN 35.A N LEU 5.A O GLN 35.A H 2.812 2.000 HIS 37.A NE2 GLN 35.A OE1 HIS 37.A HE2 2.760 1.932 ASN 39.A N ALA 10.A O ASN 39.A H 2.939 2.104 ASN 39.A ND2 GLU 12.A OE2 ASN 39.A HD22 3.089 2.358 ALA 40.A N THR 8.A O ALA 40.A H 2.909 2.062 SER 41.A N TYR 38.A O SER 41.A H 3.173 2.337 ILE 43.A N SER 7.A OG ILE 43.A H 3.257 2.513 ASN 46.A N GLU 48.A OE1 ASN 46.A H 2.873 2.243 SER 47.A N ALA 44.A O SER 47.A H 2.960 2.132 GLU 48.A N GLU 48.A OE1 GLU 48.A H 2.825 2.031 ALA 51.A N SER 47.A O ALA 51.A H 3.136 2.390 ILE 52.A N GLU 48.A O ILE 52.A H 2.959 2.188 ALA 53.A N LEU 49.A O ALA 53.A H 2.977 2.131 SER 54.A N.A GLU 50.A O SER 54.A H.A 2.899 2.173 SER 54.A N.B GLU 50.A O SER 54.A H.B 2.905 2.182 SER 54.A OG.B ALA 51.A O SER 54.A HG.B 3.328 2.579 GLY 55.A N ILE 52.A O GLY 55.A H.B 3.077 2.245 ASP 56.A N ALA 51.A O ASP 56.A H 2.805 2.025 GLU 58.A N ARG 6.A O GLU 58.A H 2.958 2.150 SER 59.A N ALA 212.A O SER 59.A H 3.133 2.367 ALA 61.A N TYR 210.A O ALA 61.A H 2.860 2.075 GLN 64.A N GLN 64.A OE1 GLN 64.A H 2.792 1.997 GLU 65.A N SER 62.A OG GLU 65.A H 2.903 2.065 LEU 66.A N SER 62.A O LEU 66.A H 3.079 2.244 ALA 67.A N ALA 63.A O ALA 67.A H 2.774 2.031 GLN 68.A N GLU 65.A O GLN 68.A H 3.181 2.410 GLN 68.A NE2 ASN 46.A O GLN 68.A HE22 3.560 2.712 GLN 68.A NE2 GLU 65.A O GLN 68.A HE21 2.936 2.114 PHE 69.A N LEU 66.A O PHE 69.A H 2.943 2.137 PHE 70.A N LEU 66.A O PHE 70.A H 2.868 2.033 GLU 72.A N GLU 72.A OE1 GLU 72.A H 2.745 1.914 PHE 73.A N PHE 70.A O PHE 73.A H 2.939 2.089 SER 74.A N PRO 71.A O SER 74.A H 2.939 2.087 ILE 75.A N GLU 72.A O ILE 75.A H 3.192 2.334 PHE 76.A N PHE 73.A O PHE 76.A H 3.077 2.289 ALA 77.A N SER 74.A O ALA 77.A H 2.921 2.091 GLY 79.A N TYR 277.A OH GLY 79.A H 3.095 2.244 TYR 80.A N HIS 204.A O TYR 80.A H 2.977 2.253 TYR 80.A OH THR 202.A O TYR 80.A HH 2.744 2.079 VAL 81.A N THR 78.A O VAL 81.A H 3.333 2.530 HIS 87.A N SER 84.A OG HIS 87.A H 3.042 2.212 HIS 87.A NE2 ILE 294.A O HIS 87.A HE2 2.767 1.954 GLN 88.A N SER 84.A O GLN 88.A H 3.134 2.335 GLN 88.A NE2 VAL 206.A O GLN 88.A HE21 2.792 2.142 GLN 88.A NE2 ASP 207.A O GLN 88.A HE22 3.013 2.203 VAL 89.A N ALA 85.A O VAL 89.A H 3.284 2.490 ALA 90.A N GLU 86.A O ALA 90.A H 3.010 2.174 VAL 91.A N HIS 87.A O VAL 91.A H 2.951 2.116 PHE 92.A N GLN 88.A O PHE 92.A H 3.021 2.208 ASN 93.A N VAL 89.A O ASN 93.A H 3.043 2.284 ASN 93.A ND2 VAL 89.A O ASN 93.A HD21 3.040 2.270 ASP 94.A N VAL 91.A O ASP 94.A H 3.279 2.496 LEU 96.A N ASP 94.A OD1 LEU 96.A H 2.883 2.036 ASP 97.A N PRO 95.A O ASP 97.A H 2.973 2.124 LYS 100.A NZ PHE 92.A O LYS 100.A HZ1 3.053 2.496 LYS 101.A N ASP 97.A O LYS 101.A H 2.928 2.110 LYS 101.A NZ ASP 105.A OD2 LYS 101.A HZ3 3.042 2.252 THR 102.A N PRO 98.A O THR 102.A H 2.967 2.153 VAL 103.A N PHE 99.A O VAL 103.A H 3.287 2.492 GLU 104.A N LYS 100.A O GLU 104.A H 3.100 2.264 ASP 105.A N LYS 101.A O ASP 105.A H 2.872 2.030 GLU 106.A N THR 102.A O GLU 106.A H 2.903 2.110 LEU 107.A N VAL 103.A O LEU 107.A H 2.907 2.111 GLY 108.A N GLU 104.A O GLY 108.A H 2.998 2.297 ILE 109.A N VAL 103.A O ILE 109.A H 3.421 2.568 LYS 110.A N PHE 213.A O LYS 110.A H 2.795 1.943 LEU 112.A N ILE 211.A O LEU 112.A H 2.870 2.059 LEU 116.A N ASP 207.A O LEU 116.A H 2.981 2.174 GLY 117.A N ASP 207.A O GLY 117.A H 3.136 2.306 GLN 118.A N GLU 248.A OE2 GLN 118.A H 2.848 2.030 ARG 119.A N LEU 205.A O ARG 119.A H 2.833 1.981 ARG 119.A NE ASP 181.A OD1 ARG 119.A HE 3.206 2.498 ARG 119.A NE ASP 181.A OD2 ARG 119.A HE 2.978 2.148 ARG 119.A NH1 ASP 181.A OD1 ARG 119.A HH11 2.791 1.971 ARG 119.A NH2 ASP 207.A OD2 ARG 119.A HH21 2.922 2.242 HIS 120.A N ASP 181.A O HIS 120.A H 3.288 2.602 VAL 121.A N ALA 200.A O VAL 121.A H 3.168 2.526 ASN 122.A N GLN 180.A O ASN 122.A H 2.896 2.053 ASN 122.A ND2 THR 196.A OG1 ASN 122.A HD22 2.935 2.094 ASN 122.A ND2 GLN 198.A O ASN 122.A HD21 2.996 2.169 LEU 123.A N GLN 198.A O LEU 123.A H 2.956 2.198 ARG 124.A N ASP 178.A O ARG 124.A H 2.919 2.102 GLN 125.A N.B GLN 125.A OE1.B GLN 125.A H.B 2.837 2.045 THR 126.A N GLU 129.A OE1 THR 126.A H.B 2.975 2.163 LYS 127.A N GLU 260.A OE1.A LYS 127.A H 2.857 2.043 GLU 129.A N THR 126.A OG1 GLU 129.A H 3.047 2.225 LEU 130.A N THR 126.A O LEU 130.A H 2.906 2.108 THR 131.A OG1 LYS 127.A O THR 131.A HG1 2.654 2.254 VAL 132.A N TYR 262.A OH VAL 132.A H 2.859 2.003 THR 133.A N ASP 137.A OD2 THR 133.A H 2.824 1.991 THR 134.A N ASP 137.A OD2 THR 134.A H 2.940 2.104 ASP 137.A N THR 134.A O ASP 137.A H 2.917 2.129 LEU 138.A N PRO 135.A O LEU 138.A H 3.000 2.168 ALA 139.A N ALA 136.A O ALA 139.A H 3.147 2.301 VAL 141.A N LEU 138.A O VAL 141.A H 2.935 2.087 ASN 142.A N ASP 178.A OD2 ASN 142.A H 2.862 2.004 LEU 143.A N ASN 160.A O LEU 143.A H 3.209 2.445 ARG 144.A N GLY 179.A O ARG 144.A H 2.960 2.155 THR 147.A N PRO 145.A O THR 147.A H 3.040 2.355 GLN 151.A N THR 147.A O GLN 151.A H 2.947 2.100 GLN 151.A NE2 PRO 145.A O GLN 151.A HE21 2.955 2.129 PHE 152.A N ASP 148.A O PHE 152.A H 2.894 2.071 LEU 153.A N ALA 149.A O LEU 153.A H 3.238 2.443 GLY 154.A N TRP 150.A O GLY 154.A H 3.236 2.416 LYS 155.A N GLN 151.A O LYS 155.A H 2.969 2.139 ALA 156.A N PHE 152.A O ALA 156.A H 2.767 1.985 LEU 157.A N LEU 153.A O LEU 157.A H 3.145 2.452 LEU 157.A N GLY 154.A O LEU 157.A H 3.283 2.600 GLY 158.A N LYS 155.A O GLY 158.A H 3.000 2.205 ASN 160.A N VAL 141.A O ASN 160.A H 2.818 1.967 THR 162.A N.A LEU 143.A O THR 162.A H.A 3.048 2.276 THR 162.A N.B LEU 143.A O THR 162.A H.B 3.073 2.320 PHE 165.A N GLN 45.A OE1 PHE 165.A H 2.900 2.054 GLU 167.A N ALA 164.A O GLU 167.A H 2.969 2.128 ILE 168.A N PHE 165.A O ILE 168.A H 3.208 2.350 TYR 169.A OH GLU 194.A OE1 TYR 169.A HH 2.735 2.080 ALA 171.A N GLU 167.A O ALA 171.A H 3.184 2.360 LEU 172.A N ILE 168.A O LEU 172.A H 2.878 2.061 GLN 173.A N TYR 169.A O GLN 173.A H 2.883 2.057 THR 174.A N THR 170.A O THR 174.A H 2.942 2.152 THR 174.A OG1 THR 170.A O THR 174.A HG1 2.942 2.181 THR 174.A OG1 ALA 171.A O THR 174.A HG1 3.431 2.923 GLY 175.A N LEU 172.A O GLY 175.A H 3.185 2.414 SER 176.A N ALA 171.A O SER 176.A H 2.899 2.229 ASP 178.A N ASN 142.A O ASP 178.A H 2.757 1.934 GLN 180.A N ASN 122.A O GLN 180.A H 2.964 2.194 GLN 180.A NE2 ASN 122.A OD1 GLN 180.A HE21 2.816 1.982 ASN 182.A N GLN 180.A OE1 ASN 182.A H 2.859 2.007 ASN 182.A ND2 GLN 180.A OE1 ASN 182.A HD21 2.779 1.939 THR 186.A N PRO 183.A O THR 186.A H 2.918 2.262 VAL 187.A N PRO 183.A O VAL 187.A H 2.989 2.177 VAL 188.A N LEU 184.A O VAL 188.A H 3.003 2.190 ASP 189.A N PRO 185.A O ASP 189.A H 2.869 2.028 ALA 190.A N THR 186.A O ALA 190.A H 2.870 2.016 LYS 191.A N VAL 188.A O LYS 191.A H 3.018 2.239 PHE 192.A N VAL 187.A O PHE 192.A H 2.895 2.260 GLU 194.A N LYS 191.A O GLU 194.A H 3.021 2.175 VAL 195.A N PHE 192.A O VAL 195.A H 3.102 2.257 THR 196.A OG1 PHE 192.A O THR 196.A HG1 2.885 2.098 ASN 197.A N LEU 123.A O ASN 197.A H 2.913 2.076 ASN 197.A ND2 ARG 124.A O ASN 197.A HD21 2.667 1.809 GLN 198.A N LEU 123.A O GLN 198.A H 3.221 2.418 GLN 198.A NE2 GLN 125.A O.A GLN 198.A HE21 2.900 2.065 GLN 198.A NE2 GLN 125.A O.B GLN 198.A HE21 2.980 2.151 GLN 198.A NE2 LEU 130.A O GLN 198.A HE22 2.862 2.003 VAL 199.A N GLU 260.A O.A VAL 199.A H 2.926 2.129 VAL 199.A N GLU 260.A O.B VAL 199.A H 2.897 2.095 ALA 200.A N VAL 121.A O ALA 200.A H 2.787 1.981 LEU 201.A N TYR 262.A O LEU 201.A H 2.756 1.923 THR 202.A N ALA 200.A O THR 202.A H 2.745 2.008 HIS 204.A N ARG 119.A O HIS 204.A H 3.121 2.497 HIS 204.A NE2 ASP 181.A OD2 HIS 204.A HE2 2.804 1.953 ASP 207.A N GLY 117.A O ASP 207.A H 2.807 1.949 LEU 208.A N ASP 207.A OD1 LEU 208.A H 2.803 2.089 ASN 209.A ND2 ALA 61.A O ASN 209.A HD21 3.010 2.216 TYR 210.A N ALA 61.A O TYR 210.A H 2.850 2.069 ILE 211.A N SER 113.A O ILE 211.A H 2.963 2.169 ALA 212.A N SER 59.A O ALA 212.A H 2.980 2.130 PHE 213.A N LYS 110.A O PHE 213.A H 2.891 2.151 SER 214.A N GLU 58.A O SER 214.A H 2.860 2.074 LYS 215.A N GLY 108.A O LYS 215.A H 2.894 2.039 LYS 215.A NZ ASP 219.A OD1 LYS 215.A HZ2 3.433 2.636 VAL 217.A N SER 214.A OG VAL 217.A H 3.137 2.295 TRP 218.A N SER 214.A O TRP 218.A H 3.007 2.156 ASP 219.A N LYS 215.A O ASP 219.A H 2.797 1.961 GLY 220.A N VAL 217.A O GLY 220.A H 3.016 2.287 LEU 221.A N TRP 218.A O LEU 221.A H 3.033 2.204 SER 222.A N GLN 225.A OE1 SER 222.A H 2.962 2.128 GLN 225.A N SER 222.A OG GLN 225.A H 3.089 2.256 GLN 226.A N SER 222.A O GLN 226.A H 2.828 1.990 GLN 226.A NE2 TRP 218.A O GLN 226.A HE21 2.913 2.078 GLU 227.A N PRO 223.A O GLU 227.A H 3.019 2.185 ILE 228.A N GLU 224.A O ILE 228.A H 3.111 2.296 VAL 229.A N GLN 225.A O VAL 229.A H 2.896 2.050 GLN 230.A N GLN 226.A O GLN 230.A H 2.929 2.079 GLN 230.A NE2 LEU 112.A O GLN 230.A HE22 2.894 2.049 GLN 230.A NE2 GLN 230.A O GLN 230.A HE21 3.467 2.937 GLN 230.A NE2 ASP 234.A OD1 GLN 230.A HE21 3.395 2.792 GLN 230.A NE2 ASP 234.A OD2 GLN 230.A HE21 3.028 2.222 THR 231.A N GLU 227.A O THR 231.A H 2.899 2.056 THR 231.A OG1 GLU 227.A O THR 231.A HG1 2.777 2.031 ALA 232.A N ILE 228.A O ALA 232.A H 2.779 1.939 ALA 233.A N VAL 229.A O ALA 233.A H 2.925 2.105 ASP 234.A N GLN 230.A O ASP 234.A H 2.968 2.113 ALA 235.A N THR 231.A O ALA 235.A H 2.798 1.967 ALA 236.A N ALA 232.A O ALA 236.A H 2.932 2.113 ALA 237.A N ALA 233.A O ALA 237.A H 2.891 2.047 GLN 238.A N ASP 234.A O GLN 238.A H 2.894 2.072 SER 239.A N ALA 235.A O SER 239.A H 2.917 2.094 GLY 240.A N ALA 236.A O GLY 240.A H 2.893 2.035 ARG 241.A N ALA 237.A O ARG 241.A H 2.836 2.045 ARG 241.A NH2 VAL 114.A O ARG 241.A HH22 2.908 2.239 GLU 242.A N GLN 238.A O GLU 242.A H 3.171 2.336 LYS 243.A N SER 239.A O LYS 243.A H 3.051 2.230 GLN 244.A N GLY 240.A O GLN 244.A H 2.863 2.058 GLN 244.A NE2 LEU 116.A O GLN 244.A HE21 2.843 1.988 LEU 245.A N ARG 241.A O LEU 245.A H 2.951 2.109 ALA 246.A N GLU 242.A O ALA 246.A H 3.098 2.286 LYS 247.A N LYS 243.A O LYS 247.A H 3.048 2.231 GLU 248.A N GLN 244.A O GLU 248.A H 2.917 2.102 GLN 249.A N LEU 245.A O GLN 249.A H 3.080 2.289 GLU 250.A N ALA 246.A O GLU 250.A H 3.019 2.217 LEU 251.A N LYS 247.A O LEU 251.A H 2.983 2.284 SER 253.A OG GLU 250.A O SER 253.A HG 3.135 2.602 LEU 255.A N LEU 251.A O LEU 255.A H 2.869 2.016 GLU 256.A N VAL 252.A O GLU 256.A H 2.957 2.126 GLU 257.A N SER 253.A O GLU 257.A H 2.883 2.076 GLN 258.A N PHE 254.A O GLN 258.A H 3.082 2.421 GLN 258.A N LEU 255.A O GLN 258.A H 2.953 2.297 GLY 259.A N GLU 256.A O GLY 259.A H 2.862 2.043 GLU 260.A N.A ASN 197.A O GLU 260.A H.A 3.049 2.212 GLU 260.A N.B ASN 197.A O GLU 260.A H.B 3.074 2.245 TYR 262.A N VAL 199.A O TYR 262.A H 3.110 2.309 TYR 262.A OH GLN 198.A OE1 TYR 262.A HH 2.593 1.943 ASP 265.A N THR 133.A O ASP 265.A H 2.859 2.025 ALA 268.A N ASP 265.A OD1 ALA 268.A H 3.142 2.307 PHE 269.A N ASP 265.A O PHE 269.A H 3.069 2.236 ARG 270.A N LEU 266.A O ARG 270.A H 2.858 2.010 THR 271.A N ASP 267.A O THR 271.A H 2.967 2.125 THR 271.A OG1 ASP 267.A O THR 271.A HG1 3.070 2.425 HIS 272.A N ALA 268.A O HIS 272.A H 3.078 2.239 VAL 273.A N PHE 269.A O VAL 273.A H 2.890 2.052 GLN 274.A N ARG 270.A O GLN 274.A H 2.970 2.128 GLU 275.A N THR 271.A O GLU 275.A H 3.151 2.328 GLN 276.A N HIS 272.A O GLN 276.A H 2.959 2.205 TYR 277.A N VAL 273.A O TYR 277.A H 3.201 2.464 TYR 277.A N GLN 274.A O TYR 277.A H 3.105 2.477 VAL 278.A N GLN 274.A O VAL 278.A H 3.270 2.498 SER 280.A N TYR 277.A O SER 280.A H 2.985 2.156 ALA 284.A N SER 280.A O ALA 284.A H 3.285 2.501 SER 285.A N PHE 282.A O SER 285.A H 3.003 2.240 SER 285.A OG PHE 282.A O SER 285.A HG 2.665 2.192 TRP 286.A N ALA 283.A O TRP 286.A H 3.316 2.463 TRP 286.A NE1 SER 74.A OG TRP 286.A HE1 2.991 2.290 VAL 290.A N PRO 287.A O VAL 290.A H 3.271 2.416 LYS 293.A N GLY 289.A O LYS 293.A H 3.133 2.329 ILE 294.A N VAL 290.A O ILE 294.A H 2.864 2.033 ASN 295.A N LEU 291.A O ASN 295.A H 2.874 2.038 ALA 296.A N ASP 292.A O ALA 296.A H 2.991 2.185 LEU 297.A N LYS 293.A O LEU 297.A H 3.206 2.516 LEU 297.A N ILE 294.A O LEU 297.A H 3.110 2.417 GLY 298.A N ASN 295.A O GLY 298.A H 3.052 2.230