Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pgn_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 2.A N LYS 34.A O VAL 2.A H 2.848 2.057 LEU 4.A N ASP 36.A O LEU 4.A H 2.894 2.051 ASN 5.A N ASP 61.A OD2 ASN 5.A H 2.858 2.015 TYR 6.A N LEU 38.A O TYR 6.A H 2.811 1.965 ALA 7.A N ILE 62.A O ALA 7.A H 2.794 1.975 ASN 8.A N TYR 40.A O ASN 8.A H 3.177 2.385 ASN 8.A ND2 PRO 16.A O ASN 8.A HD22 3.010 2.381 PHE 9.A N ASN 8.A OD1 PHE 9.A H 2.973 2.286 SER 13.A OG ASP 187.A O SER 13.A HG 2.960 2.448 THR 14.A N PRO 11.A O THR 14.A H 3.001 2.150 THR 14.A OG1 PRO 11.A O THR 14.A HG1 2.798 1.979 CYS 17.A N THR 14.A O CYS 17.A H 2.936 2.256 CYS 17.A SG PRO 10.A O CYS 17.A HG 3.228 2.410 ILE 18.A N THR 14.A O ILE 18.A H 3.002 2.174 GLN 19.A N PHE 15.A O GLN 19.A H 3.007 2.162 GLN 19.A NE2 TYR 6.A OH GLN 19.A HE22 3.167 2.336 GLN 19.A NE2 PRO 16.A O GLN 19.A HE21 2.857 2.149 GLU 21.A N CYS 17.A O GLU 21.A H 3.087 2.273 GLN 22.A N ILE 18.A O GLN 22.A H 3.176 2.359 TRP 23.A N GLN 19.A O TRP 23.A H 2.926 2.070 ALA 24.A N MET 20.A O ALA 24.A H 2.889 2.054 HIS 25.A N GLU 21.A O HIS 25.A H 2.986 2.176 GLU 26.A N GLN 22.A O GLU 26.A H 3.025 2.207 VAL 27.A N TRP 23.A O VAL 27.A H 2.937 2.103 ARG 28.A N ALA 24.A O ARG 28.A H 3.029 2.181 ARG 28.A NE ASP 36.A OD1 ARG 28.A HE 2.932 2.104 ARG 28.A NH2 VAL 37.A O ARG 28.A HH21 2.986 2.166 THR 29.A N HIS 25.A O THR 29.A H 3.023 2.189 THR 29.A OG1 HIS 25.A O THR 29.A HG1 2.849 2.111 ARG 30.A N GLU 26.A O ARG 30.A H 2.735 1.877 ARG 30.A NE GLU 26.A OE1 ARG 30.A HE 2.873 2.134 ARG 30.A NH1 GLU 233.A OE1 ARG 30.A HH12 3.043 2.202 ARG 30.A NH2 GLU 26.A OE1 ARG 30.A HH21 3.420 2.836 ARG 30.A NH2 GLU 233.A OE1 ARG 30.A HH22 3.496 2.793 ARG 30.A NH2 GLU 233.A OE2 ARG 30.A HH22 2.872 2.025 THR 31.A N VAL 27.A O THR 31.A H 3.002 2.184 THR 31.A OG1 VAL 27.A O THR 31.A HG1 2.828 2.045 ARG 32.A N THR 29.A O ARG 32.A H 3.027 2.205 GLY 33.A N ARG 28.A O GLY 33.A H 2.941 2.148 LYS 34.A N THR 31.A O LYS 34.A H 2.960 2.119 VAL 35.A N THR 31.A OG1 VAL 35.A H 2.957 2.139 ASP 36.A N VAL 2.A O ASP 36.A H 2.780 1.938 VAL 37.A N ASP 36.A OD1 VAL 37.A H 2.856 2.167 LEU 38.A N LEU 4.A O LEU 38.A H 2.860 2.047 THR 39.A OG1 GLU 21.A OE2 THR 39.A HG1 2.783 1.977 TYR 40.A N TYR 6.A O TYR 40.A H 2.855 2.122 GLY 42.A N PRO 10.A O GLY 42.A H 2.882 2.182 GLY 43.A N ASN 8.A O GLY 43.A H 2.971 2.217 GLY 47.A N ASN 50.A OD1 GLY 47.A H 2.869 2.167 ARG 49.A NH1 GLU 165.A OE2 ARG 49.A HH12 2.993 2.184 ARG 49.A NH2 GLU 165.A OE1 ARG 49.A HH22 3.108 2.255 ARG 49.A NH2 GLU 165.A OE2 ARG 49.A HH22 3.511 2.849 GLY 54.A N ASN 50.A O GLY 54.A H 2.820 2.075 VAL 55.A N MET 51.A O VAL 55.A H 2.954 2.145 MET 56.A N LEU 52.A O MET 56.A H 3.075 2.260 SER 57.A N ARG 53.A O SER 57.A H 2.931 2.186 SER 57.A OG GLY 54.A O SER 57.A HG 3.290 2.617 GLY 58.A N VAL 55.A O GLY 58.A H 3.068 2.331 GLN 59.A N GLY 54.A O GLN 59.A H 2.783 2.133 ALA 60.A N GLY 54.A O ALA 60.A H 3.335 2.570 ASP 61.A N ASN 5.A O ASP 61.A H 3.009 2.372 ILE 62.A N ASN 5.A O ILE 62.A H 2.958 2.135 GLY 63.A N ILE 210.A O GLY 63.A H 2.897 2.100 ILE 65.A N ALA 208.A O ILE 65.A H 2.894 2.056 LEU 67.A N PRO 206.A O LEU 67.A H 2.943 2.122 TYR 69.A N SER 66.A O TYR 69.A H 2.956 2.111 HIS 70.A N LEU 67.A O HIS 70.A H 3.095 2.257 VAL 73.A N HIS 70.A O VAL 73.A H 3.183 2.345 VAL 76.A N GLU 107.A OE2 VAL 76.A H 2.778 1.924 MET 77.A N GLU 107.A OE1 MET 77.A H 2.792 1.935 SER 78.A N PHE 74.A O SER 78.A H 3.034 2.235 VAL 79.A N VAL 76.A O VAL 79.A H 3.076 2.220 PHE 80.A N MET 77.A O PHE 80.A H 3.104 2.251 GLU 81.A N SER 78.A O GLU 81.A H 2.992 2.139 LEU 82.A N VAL 79.A O LEU 82.A H 3.129 2.287 ALA 89.A N ASP 243.A OD1 ALA 89.A H 2.795 1.977 GLU 90.A N ASP 243.A OD2 GLU 90.A H 2.941 2.120 ALA 91.A N SER 88.A OG ALA 91.A H 3.197 2.341 ALA 92.A N SER 88.A O ALA 92.A H 3.209 2.356 SER 93.A N ALA 89.A O SER 93.A H 2.850 2.017 SER 94.A N GLU 90.A O SER 94.A H 3.146 2.319 VAL 95.A N ALA 91.A O VAL 95.A H 2.952 2.102 LEU 96.A N ALA 92.A O LEU 96.A H 2.868 2.038 TRP 97.A N SER 93.A O TRP 97.A H 3.043 2.215 GLU 98.A N SER 94.A O GLU 98.A H 3.046 2.227 LEU 99.A N VAL 95.A O LEU 99.A H 2.882 2.096 TYR 100.A N LEU 96.A O TYR 100.A H 2.991 2.141 SER 101.A N TRP 97.A O SER 101.A H 2.861 2.052 GLY 102.A N GLU 98.A O GLY 102.A H 2.961 2.236 LEU 103.A N LEU 99.A O LEU 103.A H 3.032 2.329 LEU 103.A N TYR 100.A O LEU 103.A H 3.268 2.584 ARG 104.A N TYR 100.A O ARG 104.A H 2.748 1.916 ARG 104.A NH1 SER 101.A O ARG 104.A HH11 3.125 2.433 LEU 108.A N PRO 105.A O LEU 108.A H 3.147 2.287 GLU 109.A N ALA 106.A O GLU 109.A H 3.116 2.258 VAL 111.A N LEU 108.A O VAL 111.A H 3.281 2.439 LYS 112.A N MET 211.A O LYS 112.A H 2.927 2.090 LYS 112.A NZ ASP 228.A OD1 LYS 112.A HZ1 2.815 1.967 LEU 114.A N VAL 209.A O LEU 114.A H 2.769 1.959 THR 115.A OG1 ALA 231.A O THR 115.A HG1 2.849 2.352 PHE 117.A N PHE 207.A O PHE 117.A H 3.259 2.461 THR 118.A OG1 SER 119.A O THR 118.A HG1 2.752 2.017 SER 119.A N TYR 205.A O SER 119.A H 2.911 2.106 SER 122.A N GLN 202.A O SER 122.A H 3.252 2.491 SER 122.A N ALA 203.A O SER 122.A H 3.184 2.513 HIS 123.A N THR 180.A O HIS 123.A H 2.922 2.082 PHE 124.A N THR 198.A O PHE 124.A H 2.940 2.104 MET 125.A N LEU 178.A O MET 125.A H 2.919 2.063 THR 126.A N HIS 196.A O THR 126.A H 2.809 1.977 VAL 127.A N LYS 176.A O VAL 127.A H 2.902 2.125 ARG 131.A N ASP 135.A OD2 ARG 131.A H 2.913 2.073 LEU 133.A N ASP 268.A OD2 LEU 133.A H 2.831 2.014 ASP 135.A N SER 132.A O ASP 135.A H 3.043 2.382 LEU 136.A N LEU 133.A O LEU 136.A H 3.005 2.200 GLN 137.A N ARG 134.A O GLN 137.A H 3.251 2.403 GLN 137.A NE2 LEU 133.A O GLN 137.A HE21 2.915 2.067 GLN 137.A NE2 LEU 154.A O GLN 137.A HE22 2.867 2.040 GLY 138.A N GLY 155.A O GLY 138.A H 2.943 2.095 MET 139.A N LEU 136.A O MET 139.A H 2.902 2.049 ILE 141.A N THR 157.A O ILE 141.A H 2.975 2.188 ARG 142.A N GLY 177.A O ARG 142.A H 2.914 2.068 ARG 142.A NE MET 161.A O ARG 142.A HE 3.059 2.286 ARG 142.A NH2 MET 161.A O ARG 142.A HH21 2.927 2.130 GLY 143.A N VAL 159.A O GLY 143.A H 3.310 2.537 THR 146.A N GLU 81.A OE1 THR 146.A H 2.969 2.111 SER 148.A N ALA 144.A O SER 148.A H 3.368 2.609 SER 148.A N GLY 145.A O SER 148.A H 3.080 2.473 SER 148.A OG SER 160.A OG SER 148.A HG 2.736 1.925 ALA 149.A N GLY 145.A O ALA 149.A H 3.329 2.556 ILE 150.A N THR 146.A O ILE 150.A H 2.855 2.069 LEU 151.A N LEU 147.A O LEU 151.A H 3.131 2.310 GLU 152.A N SER 148.A O GLU 152.A H 2.984 2.173 LYS 153.A N ALA 149.A O LYS 153.A H 2.975 2.156 LEU 154.A N ILE 150.A O LEU 154.A H 3.060 2.299 GLY 155.A N GLU 152.A O GLY 155.A H 3.048 2.268 ALA 156.A N LEU 151.A O ALA 156.A H 2.949 2.229 THR 157.A N MET 139.A O THR 157.A H 2.877 2.057 VAL 159.A N ILE 141.A O VAL 159.A H 3.035 2.238 MET 161.A N GLY 143.A O MET 161.A H 3.312 2.550 MET 163.A N TYR 69.A OH MET 163.A H 2.934 2.115 GLU 165.A N PRO 162.A O GLU 165.A H 3.031 2.232 VAL 166.A N MET 163.A O VAL 166.A H 3.023 2.174 ALA 169.A N GLU 165.A O ALA 169.A H 3.401 2.580 VAL 170.A N VAL 166.A O VAL 170.A H 3.036 2.209 GLN 171.A N PRO 167.A O GLN 171.A H 2.839 1.984 LYS 172.A N GLU 168.A O LYS 172.A H 2.838 2.078 GLY 173.A N VAL 170.A O GLY 173.A H 3.109 2.310 ILE 174.A N ALA 169.A O ILE 174.A H 2.832 2.233 ILE 175.A N ALA 169.A O ILE 175.A H 3.251 2.460 LYS 176.A N GLU 140.A O LYS 176.A H 2.800 1.943 LEU 178.A N MET 125.A O LEU 178.A H 2.806 2.031 PHE 179.A N ARG 142.A O PHE 179.A H 2.943 2.255 THR 180.A N HIS 123.A O THR 180.A H 3.222 2.517 MET 185.A N LEU 182.A O MET 185.A H 3.019 2.202 LYS 186.A N SER 249.A OG LYS 186.A H 3.119 2.439 ASP 187.A N ASP 183.A O ASP 187.A H 2.980 2.124 MET 188.A N VAL 184.A O MET 188.A H 3.075 2.276 ASN 189.A N LYS 186.A O ASN 189.A H 3.035 2.253 ASN 189.A ND2 GLU 192.A OE1 ASN 189.A HD22 2.607 1.829 PHE 190.A N VAL 184.A O PHE 190.A H 3.196 2.338 ALA 191.A N MET 185.A O ALA 191.A H 2.946 2.103 GLU 192.A N ASN 189.A O GLU 192.A H 3.149 2.316 MET 193.A N PHE 190.A O MET 193.A H 2.889 2.046 THR 194.A N PHE 190.A O THR 194.A H 2.698 1.846 HIS 196.A N THR 126.A O HIS 196.A H 3.206 2.511 VAL 197.A N GLN 260.A O VAL 197.A H 2.826 2.001 THR 198.A N PHE 124.A O THR 198.A H 2.885 2.084 ARG 199.A N HIS 262.A O ARG 199.A H 3.066 2.259 GLN 202.A N SER 122.A O GLN 202.A H 2.988 2.140 ALA 203.A N GLN 202.A OE1 ALA 203.A H 2.919 2.148 TYR 205.A N SER 119.A OG TYR 205.A H 2.912 2.052 TYR 205.A OH PHE 179.A O TYR 205.A HH 2.738 2.177 PHE 207.A N PHE 117.A O PHE 207.A H 2.772 1.984 ALA 208.A N ILE 65.A O ALA 208.A H 2.964 2.193 VAL 209.A N THR 115.A O VAL 209.A H 2.930 2.072 ILE 210.A N GLY 63.A O ILE 210.A H 2.885 2.070 MET 211.A N LYS 112.A O MET 211.A H 2.732 1.951 ASN 212.A N ASP 61.A O ASN 212.A H 2.824 2.000 ASN 212.A ND2 VAL 55.A O ASN 212.A HD21 2.935 2.118 ASN 212.A ND2 GLU 214.A OE1 ASN 212.A HD22 3.306 2.705 ALA 215.A N ASN 212.A OD1 ALA 215.A H 2.876 2.130 TRP 216.A N ASN 212.A O TRP 216.A H 3.030 2.237 GLU 217.A N ARG 213.A O GLU 217.A H 2.940 2.143 ARG 218.A N GLU 214.A O ARG 218.A H 3.071 2.410 LEU 219.A N TRP 216.A O LEU 219.A H 2.984 2.154 VAL 223.A N SER 220.A OG VAL 223.A H 3.350 2.498 GLN 224.A N SER 220.A O GLN 224.A H 2.983 2.141 GLN 224.A NE2 TRP 216.A O GLN 224.A HE21 3.057 2.245 GLN 225.A N PRO 221.A O GLN 225.A H 3.051 2.241 VAL 226.A N ASP 222.A O VAL 226.A H 3.270 2.526 LEU 227.A N VAL 223.A O LEU 227.A H 3.134 2.315 ASP 228.A N GLN 224.A O ASP 228.A H 2.862 2.012 GLY 229.A N GLN 225.A O GLY 229.A H 2.904 2.169 LEU 230.A N LEU 227.A O LEU 230.A H 3.206 2.380 ALA 231.A N ASP 228.A O ALA 231.A H 3.269 2.418 HIS 234.A N LEU 230.A O HIS 234.A H 2.933 2.131 HIS 234.A NE2 GLN 19.A OE1 HIS 234.A HE2 2.764 1.958 ALA 235.A N ALA 231.A O ALA 235.A H 3.076 2.248 ALA 236.A N ALA 232.A O ALA 236.A H 3.307 2.463 TRP 237.A N GLU 233.A O TRP 237.A H 2.966 2.120 THR 238.A N HIS 234.A O THR 238.A H 2.868 2.055 THR 238.A OG1 HIS 234.A O THR 238.A HG1 2.888 2.116 GLY 239.A N ALA 235.A O GLY 239.A H 3.174 2.327 ARG 240.A N ALA 236.A O ARG 240.A H 2.855 2.019 ARG 240.A NE GLU 90.A OE2 ARG 240.A HE 3.059 2.240 ARG 240.A NH2 GLU 90.A OE2 ARG 240.A HH21 3.275 2.531 TYR 241.A N TRP 237.A O TYR 241.A H 2.886 2.037 LEU 242.A N THR 238.A O LEU 242.A H 3.035 2.222 ASP 243.A N GLY 239.A O ASP 243.A H 2.895 2.055 ALA 244.A N ARG 240.A O ALA 244.A H 3.300 2.455 HIS 245.A N TYR 241.A O HIS 245.A H 2.909 2.097 HIS 245.A NE2 ASP 187.A OD1 HIS 245.A HE2 2.652 1.799 VAL 246.A N LEU 242.A O VAL 246.A H 2.763 1.966 ASP 248.A N ALA 244.A O ASP 248.A H 3.160 2.323 SER 249.A N HIS 245.A O SER 249.A H 2.818 1.988 SER 249.A OG LEU 182.A O SER 249.A HG 2.909 2.319 SER 249.A OG ASP 183.A O SER 249.A HG 3.411 2.740 MET 250.A N VAL 246.A O MET 250.A H 3.047 2.215 ARG 251.A N GLN 247.A O ARG 251.A H 3.051 2.225 TRP 252.A N ASP 248.A O TRP 252.A H 3.030 2.180 ALA 253.A N SER 249.A O ALA 253.A H 2.919 2.114 GLU 254.A N MET 250.A O GLU 254.A H 2.914 2.082 GLU 255.A N ARG 251.A O GLU 255.A H 2.971 2.141 LYS 256.A N TRP 252.A O LYS 256.A H 2.876 2.049 HIS 257.A N ALA 253.A O HIS 257.A H 2.987 2.240 VAL 259.A N ALA 253.A O VAL 259.A H 3.387 2.529 GLN 260.A N GLY 195.A O GLN 260.A H 2.888 2.043 GLN 260.A NE2 GLY 258.A O GLN 260.A HE21 3.101 2.266 HIS 262.A N VAL 197.A O HIS 262.A H 2.700 1.913 GLU 267.A N GLU 267.A OE1 GLU 267.A H 2.798 1.992 ASP 268.A N PRO 265.A O ASP 268.A H 3.003 2.371 ILE 269.A N PRO 265.A O ILE 269.A H 3.095 2.309 ALA 270.A N GLU 266.A O ALA 270.A H 3.071 2.285 ALA 271.A N GLU 267.A O ALA 271.A H 3.008 2.175 MET 272.A N ASP 268.A O MET 272.A H 2.804 1.986 ARG 273.A N ILE 269.A O ARG 273.A H 3.125 2.310 ARG 274.A N ALA 270.A O ARG 274.A H 3.138 2.353 SER 275.A N ALA 271.A O SER 275.A H 2.939 2.149 SER 275.A OG MET 272.A O SER 275.A HG 3.085 2.464 VAL 276.A N MET 272.A O VAL 276.A H 3.284 2.574 GLN 277.A N ARG 274.A O GLN 277.A H 3.263 2.483 LEU 279.A N VAL 276.A O LEU 279.A H 2.988 2.191 PHE 280.A N GLN 277.A O PHE 280.A H 3.071 2.250 ALA 282.A N PRO 278.A O ALA 282.A H 3.077 2.280 TRP 283.A N LEU 279.A O TRP 283.A H 2.898 2.064 TRP 283.A NE1 PRO 75.A O TRP 283.A HE1 2.845 2.233 ALA 284.A N PHE 280.A O ALA 284.A H 3.005 2.176 GLN 285.A N ASP 281.A O GLN 285.A H 2.967 2.152 GLN 285.A NE2 GLN 285.A O GLN 285.A HE21 3.015 2.408 GLN 285.A NE2 ASP 289.A OD1 GLN 285.A HE21 2.660 2.000 ARG 286.A N ALA 282.A O ARG 286.A H 3.061 2.214 ALA 287.A N TRP 283.A O ALA 287.A H 2.934 2.143 ALA 288.A N ALA 284.A O ALA 288.A H 2.892 2.046 ASP 289.A N GLN 285.A O ASP 289.A H 2.855 2.033 LYS 290.A N ARG 286.A O LYS 290.A H 3.100 2.415 LYS 290.A N ALA 287.A O LYS 290.A H 3.054 2.376 LYS 290.A NZ GLY 72.A O LYS 290.A HZ3 3.294 2.735 GLY 291.A N ALA 288.A O GLY 291.A H 2.902 2.055 ALA 292.A N ALA 287.A O ALA 292.A H 2.971 2.155 ALA 296.A N ASP 293.A OD1 ALA 296.A H 3.197 2.369 VAL 297.A N ASP 293.A O VAL 297.A H 3.077 2.260 MET 298.A N PRO 294.A O MET 298.A H 2.922 2.079 ARG 299.A N ASP 295.A O ARG 299.A H 2.890 2.049 THR 300.A N ALA 296.A O THR 300.A H 2.986 2.186 THR 300.A OG1 ALA 296.A O THR 300.A HG1 2.928 2.135 VAL 301.A N VAL 297.A O VAL 301.A H 2.879 2.042 ASP 302.A N MET 298.A O ASP 302.A H 2.953 2.125 ALA 303.A N ARG 299.A O ALA 303.A H 3.054 2.220 LEU 304.A N THR 300.A O LEU 304.A H 2.897 2.065 LYS 305.A N VAL 301.A O LYS 305.A H 2.981 2.125 LYS 305.A NZ LEU 84.A O LYS 305.A HZ3 2.986 2.371 ALA 306.A N ASP 302.A O ALA 306.A H 3.076 2.319 GLN 307.A N ALA 303.A O GLN 307.A H 2.984 2.158 TYR 308.A N LEU 304.A O TYR 308.A H 3.140 2.469