Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pgp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 2.A N LYS 34.A O VAL 2.A H 3.293 2.464 LEU 4.A N ASP 36.A O LEU 4.A H 2.815 1.985 ASN 5.A N ASP 61.A OD2 ASN 5.A H 2.855 2.084 TYR 6.A N LEU 38.A O TYR 6.A H 2.879 2.051 ALA 7.A N ILE 62.A O ALA 7.A H 2.729 1.953 ASN 8.A N TYR 40.A O ASN 8.A H 3.046 2.215 ASN 8.A ND2 PRO 16.A O ASN 8.A HD22 3.056 2.448 PHE 9.A N ASN 8.A OD1 PHE 9.A H 2.977 2.277 SER 13.A OG ASP 187.A O SER 13.A HG 3.115 2.720 THR 14.A N PRO 11.A O THR 14.A H 3.144 2.305 THR 14.A OG1 PRO 11.A O THR 14.A HG1 2.801 1.999 CYS 17.A N THR 14.A O CYS 17.A H 3.121 2.427 CYS 17.A SG PRO 10.A O CYS 17.A HG 3.171 2.340 CYS 17.A SG PRO 11.A O CYS 17.A HG 3.487 2.795 ILE 18.A N THR 14.A O ILE 18.A H 3.029 2.227 GLN 19.A N PHE 15.A O GLN 19.A H 2.914 2.066 GLN 19.A NE2 TYR 6.A OH GLN 19.A HE22 3.355 2.524 GLN 19.A NE2 PRO 16.A O GLN 19.A HE21 2.896 2.186 MET 20.A N PRO 16.A O MET 20.A H 3.402 2.614 GLU 21.A N CYS 17.A O GLU 21.A H 3.097 2.304 GLN 22.A N ILE 18.A O GLN 22.A H 3.131 2.357 TRP 23.A N GLN 19.A O TRP 23.A H 2.884 2.051 ALA 24.A N MET 20.A O ALA 24.A H 2.867 2.016 HIS 25.A N GLU 21.A O HIS 25.A H 2.999 2.180 GLU 26.A N GLN 22.A O GLU 26.A H 3.127 2.378 VAL 27.A N TRP 23.A O VAL 27.A H 3.008 2.155 ARG 28.A N ALA 24.A O ARG 28.A H 3.089 2.235 ARG 28.A NE ASP 36.A OD1 ARG 28.A HE 2.953 2.145 ARG 28.A NH2 VAL 37.A O ARG 28.A HH21 2.683 1.939 THR 29.A N HIS 25.A O THR 29.A H 3.155 2.400 THR 29.A OG1 HIS 25.A O THR 29.A HG1 2.896 2.128 ARG 30.A N GLU 26.A O ARG 30.A H 2.801 1.944 ARG 30.A NE GLU 26.A OE1 ARG 30.A HE 3.025 2.225 ARG 30.A NH1 GLU 233.A OE1 ARG 30.A HH12 3.518 2.714 ARG 30.A NH2 GLU 26.A OE1 ARG 30.A HH21 3.538 2.884 ARG 30.A NH2 GLU 233.A OE2 ARG 30.A HH22 2.894 2.089 THR 31.A N VAL 27.A O THR 31.A H 3.000 2.180 THR 31.A OG1 VAL 27.A O THR 31.A HG1 2.755 1.980 ARG 32.A N THR 29.A O ARG 32.A H 3.114 2.304 GLY 33.A N ARG 28.A O GLY 33.A H 3.087 2.289 LYS 34.A N THR 31.A O LYS 34.A H 2.780 1.956 VAL 35.A N THR 31.A OG1 VAL 35.A H 2.924 2.110 ASP 36.A N VAL 2.A O ASP 36.A H 2.984 2.140 VAL 37.A N ASP 36.A OD1 VAL 37.A H 2.773 2.143 LEU 38.A N LEU 4.A O LEU 38.A H 2.996 2.295 THR 39.A OG1 GLU 21.A OE2 THR 39.A HG1 2.750 1.941 TYR 40.A N TYR 6.A O TYR 40.A H 2.935 2.093 GLY 42.A N PRO 10.A O GLY 42.A H 3.066 2.360 GLY 43.A N ASN 8.A O GLY 43.A H 2.964 2.250 GLY 47.A N ASN 50.A OD1 GLY 47.A H 2.742 2.006 ARG 49.A NE GLU 165.A OE2 ARG 49.A HE 2.895 2.187 ARG 49.A NH2 GLU 165.A OE1 ARG 49.A HH21 3.134 2.373 ARG 49.A NH2 GLU 165.A OE2 ARG 49.A HH21 2.837 2.135 GLY 54.A N ASN 50.A O GLY 54.A H 3.184 2.570 GLY 54.A N MET 51.A O GLY 54.A H 3.240 2.508 VAL 55.A N MET 51.A O VAL 55.A H 3.056 2.296 VAL 55.A N LEU 52.A O VAL 55.A H 3.204 2.587 MET 56.A N LEU 52.A O MET 56.A H 3.276 2.448 SER 57.A N ARG 53.A O SER 57.A H 3.177 2.514 GLY 58.A N VAL 55.A O GLY 58.A H 3.202 2.478 ILE 62.A N ASN 5.A O ILE 62.A H 3.030 2.229 GLY 63.A N ILE 210.A O GLY 63.A H 2.989 2.175 ILE 65.A N ALA 208.A O ILE 65.A H 2.995 2.153 LEU 67.A N PRO 206.A O LEU 67.A H 2.826 2.020 TYR 69.A N SER 66.A O TYR 69.A H 2.947 2.119 HIS 70.A N LEU 67.A O HIS 70.A H 2.926 2.081 VAL 73.A N HIS 70.A O VAL 73.A H 3.199 2.370 VAL 76.A N GLU 107.A OE2 VAL 76.A H 2.730 1.878 MET 77.A N GLU 107.A OE1 MET 77.A H 2.931 2.076 SER 78.A N PHE 74.A O SER 78.A H 2.988 2.243 VAL 79.A N VAL 76.A O VAL 79.A H 2.924 2.067 PHE 80.A N MET 77.A O PHE 80.A H 3.024 2.182 GLU 81.A N SER 78.A O GLU 81.A H 2.897 2.052 LEU 82.A N VAL 79.A O LEU 82.A H 3.071 2.233 ALA 89.A N ASP 243.A OD1 ALA 89.A H 2.840 2.006 GLU 90.A N ASP 243.A OD2 GLU 90.A H 3.060 2.203 ALA 91.A N SER 88.A OG ALA 91.A H 3.012 2.174 ALA 92.A N SER 88.A O ALA 92.A H 3.194 2.377 SER 93.A N ALA 89.A O SER 93.A H 2.785 2.002 SER 94.A N GLU 90.A O SER 94.A H 3.078 2.230 VAL 95.A N ALA 91.A O VAL 95.A H 3.084 2.261 LEU 96.A N ALA 92.A O LEU 96.A H 2.940 2.097 TRP 97.A N SER 93.A O TRP 97.A H 3.105 2.265 GLU 98.A N SER 94.A O GLU 98.A H 3.104 2.250 LEU 99.A N VAL 95.A O LEU 99.A H 2.918 2.116 TYR 100.A N LEU 96.A O TYR 100.A H 3.076 2.296 SER 101.A N TRP 97.A O SER 101.A H 2.765 1.957 GLY 102.A N GLU 98.A O GLY 102.A H 3.036 2.242 LEU 103.A N TYR 100.A O LEU 103.A H 3.399 2.549 ARG 104.A N TYR 100.A O ARG 104.A H 3.033 2.180 ARG 104.A NH2 SER 101.A O ARG 104.A HH21 3.073 2.256 LEU 108.A N PRO 105.A O LEU 108.A H 3.187 2.333 GLU 109.A N ALA 106.A O GLU 109.A H 3.109 2.249 LYS 112.A N MET 211.A O LYS 112.A H 2.895 2.036 LYS 112.A NZ VAL 113.A O LYS 112.A HZ2 3.500 2.805 LYS 112.A NZ ASP 228.A OD1 LYS 112.A HZ1 3.134 2.259 LEU 114.A N VAL 209.A O LEU 114.A H 2.872 2.039 THR 115.A OG1 ALA 231.A O THR 115.A HG1 3.047 2.471 PHE 117.A N PHE 207.A O PHE 117.A H 3.251 2.432 THR 118.A OG1 SER 119.A O THR 118.A HG1 2.843 2.126 SER 119.A N TYR 205.A O SER 119.A H 2.940 2.124 SER 122.A N GLN 202.A O SER 122.A H 3.336 2.597 HIS 123.A N THR 180.A O HIS 123.A H 2.839 2.004 PHE 124.A N THR 198.A O PHE 124.A H 2.928 2.101 MET 125.A N LEU 178.A O MET 125.A H 2.940 2.116 THR 126.A N HIS 196.A O THR 126.A H 2.877 2.061 THR 126.A OG1 THR 128.A O THR 126.A HG1 2.683 2.152 VAL 127.A N LYS 176.A O VAL 127.A H 2.946 2.126 ARG 131.A N ASP 135.A OD2 ARG 131.A H 2.764 1.958 SER 132.A N ASP 135.A OD2 SER 132.A H 3.036 2.328 LEU 133.A N ASP 268.A OD2 LEU 133.A H 2.635 1.779 ARG 134.A N SER 132.A OG ARG 134.A H 2.749 2.140 ASP 135.A N SER 132.A O ASP 135.A H 3.218 2.596 LEU 136.A N LEU 133.A O LEU 136.A H 3.030 2.425 GLN 137.A N ARG 134.A O GLN 137.A H 3.118 2.318 GLN 137.A NE2 LEU 133.A O GLN 137.A HE21 3.063 2.203 GLN 137.A NE2 LEU 154.A O GLN 137.A HE22 2.999 2.179 GLY 138.A N GLY 155.A O GLY 138.A H 3.121 2.277 MET 139.A N LEU 136.A O MET 139.A H 3.041 2.189 GLU 140.A N GLU 140.A OE1 GLU 140.A H 3.165 2.387 ILE 141.A N THR 157.A O ILE 141.A H 2.970 2.186 ARG 142.A N GLY 177.A O ARG 142.A H 2.974 2.156 ARG 142.A NE MET 161.A O ARG 142.A HE 2.971 2.206 ARG 142.A NH2 MET 161.A O ARG 142.A HH21 2.903 2.147 GLY 143.A N VAL 159.A O GLY 143.A H 3.271 2.572 THR 146.A N GLU 81.A OE1 THR 146.A H 3.135 2.295 LEU 147.A N ALA 144.A O LEU 147.A H 3.060 2.346 SER 148.A N GLY 145.A O SER 148.A H 3.118 2.475 SER 148.A OG SER 160.A OG SER 148.A HG 2.599 1.780 ALA 149.A N GLY 145.A O ALA 149.A H 3.292 2.553 ILE 150.A N THR 146.A O ILE 150.A H 2.824 2.040 LEU 151.A N LEU 147.A O LEU 151.A H 3.151 2.392 GLU 152.A N SER 148.A O GLU 152.A H 3.080 2.302 LYS 153.A N ALA 149.A O LYS 153.A H 3.078 2.251 LEU 154.A N ILE 150.A O LEU 154.A H 3.109 2.355 LEU 154.A N LEU 151.A O LEU 154.A H 3.200 2.589 GLY 155.A N GLU 152.A O GLY 155.A H 3.002 2.168 ALA 156.A N LEU 151.A O ALA 156.A H 3.103 2.382 THR 157.A N MET 139.A O THR 157.A H 3.088 2.250 VAL 159.A N ILE 141.A O VAL 159.A H 3.035 2.241 SER 160.A OG SER 148.A OG SER 160.A HG 2.599 2.029 MET 161.A N GLY 143.A O MET 161.A H 3.322 2.556 MET 163.A N TYR 69.A OH MET 163.A H 3.205 2.398 GLU 165.A N PRO 162.A O GLU 165.A H 3.179 2.443 VAL 166.A N MET 163.A O VAL 166.A H 3.052 2.205 ALA 169.A N GLU 165.A O ALA 169.A H 3.289 2.534 VAL 170.A N VAL 166.A O VAL 170.A H 3.015 2.202 GLN 171.A N PRO 167.A O GLN 171.A H 3.038 2.179 LYS 172.A N GLU 168.A O LYS 172.A H 3.152 2.321 GLY 173.A N VAL 170.A O GLY 173.A H 2.799 1.994 ILE 174.A N ALA 169.A O ILE 174.A H 2.933 2.249 ILE 175.A N ALA 169.A O ILE 175.A H 3.418 2.609 LYS 176.A N GLU 140.A O LYS 176.A H 2.889 2.030 LYS 176.A NZ GLU 140.A OE1 LYS 176.A HZ2 3.020 2.178 LEU 178.A N MET 125.A O LEU 178.A H 2.818 2.032 PHE 179.A N ARG 142.A O PHE 179.A H 2.863 2.106 THR 180.A N HIS 123.A O THR 180.A H 3.265 2.513 MET 185.A N LEU 182.A O MET 185.A H 3.101 2.273 LYS 186.A N ASP 183.A O LYS 186.A H 3.212 2.488 LYS 186.A N SER 249.A OG LYS 186.A H 3.158 2.453 ASP 187.A N ASP 183.A O ASP 187.A H 3.086 2.233 MET 188.A N VAL 184.A O MET 188.A H 3.094 2.309 ASN 189.A N LYS 186.A O ASN 189.A H 3.050 2.335 PHE 190.A N VAL 184.A O PHE 190.A H 3.292 2.433 ALA 191.A N MET 185.A O ALA 191.A H 3.088 2.298 GLU 192.A N ASN 189.A O GLU 192.A H 3.302 2.474 MET 193.A N PHE 190.A O MET 193.A H 2.943 2.100 THR 194.A N PHE 190.A O THR 194.A H 2.787 1.941 HIS 196.A N THR 126.A O HIS 196.A H 3.139 2.370 VAL 197.A N GLN 260.A O VAL 197.A H 2.756 1.944 THR 198.A N PHE 124.A O THR 198.A H 2.898 2.133 THR 198.A OG1 VAL 130.A O THR 198.A HG1 2.692 2.092 ARG 199.A N HIS 262.A O ARG 199.A H 3.074 2.254 GLN 202.A N SER 122.A O GLN 202.A H 2.988 2.134 ALA 203.A N GLN 202.A OE1 ALA 203.A H 2.741 1.962 TYR 205.A N SER 119.A OG TYR 205.A H 3.094 2.237 TYR 205.A OH PHE 179.A O TYR 205.A HH 2.668 2.080 PHE 207.A N PHE 117.A O PHE 207.A H 2.687 1.846 ALA 208.A N ILE 65.A O ALA 208.A H 2.984 2.200 VAL 209.A N THR 115.A O VAL 209.A H 2.923 2.080 ILE 210.A N GLY 63.A O ILE 210.A H 2.864 2.084 MET 211.A N LYS 112.A O MET 211.A H 2.657 1.965 ASN 212.A N ASP 61.A O ASN 212.A H 2.857 2.081 ASN 212.A ND2 VAL 55.A O ASN 212.A HD21 3.239 2.525 ASN 212.A ND2 MET 56.A O ASN 212.A HD21 3.497 3.045 ASN 212.A ND2 GLU 214.A OE1 ASN 212.A HD22 3.410 2.621 ARG 213.A NH1 GLU 109.A O ARG 213.A HH11 3.422 2.686 ALA 215.A N ASN 212.A OD1 ALA 215.A H 2.651 1.863 TRP 216.A N ASN 212.A O TRP 216.A H 2.990 2.209 GLU 217.A N ARG 213.A O GLU 217.A H 2.895 2.150 ARG 218.A N ALA 215.A O ARG 218.A H 3.263 2.500 LEU 219.A N TRP 216.A O LEU 219.A H 3.164 2.326 GLN 224.A N SER 220.A O GLN 224.A H 3.134 2.359 GLN 224.A NE2 TRP 216.A O GLN 224.A HE21 2.987 2.190 GLN 225.A N PRO 221.A O GLN 225.A H 3.083 2.306 VAL 226.A N ASP 222.A O VAL 226.A H 3.304 2.578 LEU 227.A N VAL 223.A O LEU 227.A H 3.276 2.469 ASP 228.A N GLN 224.A O ASP 228.A H 2.927 2.069 GLY 229.A N GLN 225.A O GLY 229.A H 2.850 2.133 LEU 230.A N LEU 227.A O LEU 230.A H 3.164 2.347 HIS 234.A N LEU 230.A O HIS 234.A H 2.987 2.194 HIS 234.A NE2 GLN 19.A OE1 HIS 234.A HE2 2.600 1.762 ALA 235.A N ALA 231.A O ALA 235.A H 3.011 2.194 ALA 236.A N ALA 232.A O ALA 236.A H 3.307 2.486 TRP 237.A N GLU 233.A O TRP 237.A H 2.850 1.996 THR 238.A N HIS 234.A O THR 238.A H 2.931 2.139 THR 238.A OG1 HIS 234.A O THR 238.A HG1 2.792 2.027 GLY 239.A N ALA 235.A O GLY 239.A H 3.078 2.230 ARG 240.A N ALA 236.A O ARG 240.A H 2.823 2.004 ARG 240.A NE GLU 90.A OE2 ARG 240.A HE 2.966 2.113 TYR 241.A N TRP 237.A O TYR 241.A H 2.968 2.142 LEU 242.A N THR 238.A O LEU 242.A H 3.208 2.388 ASP 243.A N GLY 239.A O ASP 243.A H 3.204 2.386 ALA 244.A N ARG 240.A O ALA 244.A H 3.345 2.494 HIS 245.A N TYR 241.A O HIS 245.A H 2.858 2.033 HIS 245.A NE2 ASP 187.A OD1 HIS 245.A HE2 2.745 1.902 VAL 246.A N LEU 242.A O VAL 246.A H 2.761 1.923 ASP 248.A N ALA 244.A O ASP 248.A H 3.343 2.518 SER 249.A N HIS 245.A O SER 249.A H 2.857 2.007 SER 249.A OG LEU 182.A O SER 249.A HG 2.952 2.424 SER 249.A OG ASP 183.A O SER 249.A HG 3.015 2.400 MET 250.A N VAL 246.A O MET 250.A H 3.043 2.208 ARG 251.A N GLN 247.A O ARG 251.A H 2.860 2.034 ARG 251.A NH2 ASP 248.A OD1 ARG 251.A HH21 3.286 2.442 TRP 252.A N ASP 248.A O TRP 252.A H 2.938 2.145 ALA 253.A N SER 249.A O ALA 253.A H 3.138 2.451 GLU 254.A N MET 250.A O GLU 254.A H 3.171 2.339 GLU 255.A N ARG 251.A O GLU 255.A H 3.238 2.380 LYS 256.A N TRP 252.A O LYS 256.A H 2.964 2.247 HIS 257.A N ALA 253.A O HIS 257.A H 3.028 2.348 GLY 258.A N GLU 254.A O GLY 258.A H 3.076 2.451 VAL 259.A N ALA 253.A O VAL 259.A H 3.294 2.465 GLN 260.A N GLY 195.A O GLN 260.A H 2.867 2.020 GLN 260.A NE2 GLY 258.A O GLN 260.A HE21 3.584 2.847 GLN 260.A NE2 VAL 259.A O GLN 260.A HE21 3.368 2.677 HIS 262.A N VAL 197.A O HIS 262.A H 2.761 1.956 GLU 267.A N GLU 267.A OE1 GLU 267.A H 2.655 1.877 ASP 268.A N PRO 265.A O ASP 268.A H 3.263 2.628 ILE 269.A N PRO 265.A O ILE 269.A H 3.089 2.256 ALA 270.A N GLU 266.A O ALA 270.A H 2.936 2.106 ALA 271.A N GLU 267.A O ALA 271.A H 3.291 2.524 MET 272.A N ASP 268.A O MET 272.A H 2.963 2.296 MET 272.A N ILE 269.A O MET 272.A H 3.215 2.549 ARG 273.A N ILE 269.A O ARG 273.A H 3.163 2.328 ARG 274.A N ALA 270.A O ARG 274.A H 3.091 2.278 SER 275.A N ALA 271.A O SER 275.A H 3.048 2.378 SER 275.A N MET 272.A O SER 275.A H 2.880 2.271 VAL 276.A N MET 272.A O VAL 276.A H 3.087 2.369 LEU 279.A N VAL 276.A O LEU 279.A H 3.028 2.249 PHE 280.A N GLN 277.A O PHE 280.A H 3.154 2.383 ASP 281.A N PRO 278.A O ASP 281.A H 3.156 2.494 ALA 282.A N PRO 278.A O ALA 282.A H 3.210 2.378 TRP 283.A N LEU 279.A O TRP 283.A H 2.870 2.030 TRP 283.A NE1 PRO 75.A O TRP 283.A HE1 2.918 2.307 ALA 284.A N PHE 280.A O ALA 284.A H 3.035 2.298 GLN 285.A N ASP 281.A O GLN 285.A H 2.808 2.094 ARG 286.A N ALA 282.A O ARG 286.A H 3.092 2.301 ALA 287.A N TRP 283.A O ALA 287.A H 3.138 2.322 ALA 288.A N ALA 284.A O ALA 288.A H 3.176 2.388 ASP 289.A N GLN 285.A O ASP 289.A H 3.151 2.293 LYS 290.A N ALA 287.A O LYS 290.A H 3.049 2.281 GLY 291.A N ALA 288.A O GLY 291.A H 2.867 2.021 ALA 292.A N ALA 287.A O ALA 292.A H 2.979 2.144 ALA 296.A N ASP 293.A OD1 ALA 296.A H 3.313 2.497 VAL 297.A N ASP 293.A O VAL 297.A H 3.043 2.269 MET 298.A N PRO 294.A O MET 298.A H 2.872 2.044 ARG 299.A N ASP 295.A O ARG 299.A H 3.049 2.210 THR 300.A N ALA 296.A O THR 300.A H 2.921 2.104 THR 300.A OG1 ALA 296.A O THR 300.A HG1 3.091 2.315 VAL 301.A N VAL 297.A O VAL 301.A H 2.779 1.947 ASP 302.A N MET 298.A O ASP 302.A H 2.898 2.042 ALA 303.A N ARG 299.A O ALA 303.A H 3.088 2.304 LEU 304.A N THR 300.A O LEU 304.A H 2.946 2.111 LYS 305.A N VAL 301.A O LYS 305.A H 2.933 2.102 LYS 305.A NZ LEU 84.A O LYS 305.A HZ3 3.311 2.683 ALA 306.A N ASP 302.A O ALA 306.A H 3.116 2.341 GLN 307.A N LEU 304.A O GLN 307.A H 2.943 2.125 TYR 308.A N LEU 304.A O TYR 308.A H 2.982 2.148