Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pk1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 3.A N ILE 67.A O GLN 3.A H 2.958 2.165 GLN 4.A NE2 GLU 240.A OE1 GLN 4.A HE22 3.143 2.319 ASN 6.A N VAL 69.A O ASN 6.A H 2.756 1.959 ASN 6.A ND2 GLU 263.A OE2 ASN 6.A HD21 3.309 2.653 VAL 8.A N VAL 71.A O VAL 8.A H 3.030 2.211 HIS 11.A N GLU 75.A OE1 HIS 11.A H 2.755 1.925 ALA 12.A N GLU 75.A OE1 ALA 12.A H 2.864 2.140 ALA 12.A N GLU 75.A OE2 ALA 12.A H 3.147 2.334 GLU 17.A N THR 14.A O GLU 17.A H 3.383 2.534 ILE 19.A N THR 15.A O ILE 19.A H 3.354 2.494 SER 20.A N GLU 17.A O SER 20.A H 3.159 2.551 SER 20.A OG GLU 17.A O SER 20.A HG 2.738 1.942 PHE 22.A N ILE 19.A O PHE 22.A H 2.385 1.539 GLN 23.A N ASP 35.A OD2 GLN 23.A H 2.553 1.848 ARG 25.A NH1 GLN 3.A O ARG 25.A HH12 3.228 2.488 GLN 28.A NE2 ASP 26.A O GLN 28.A HE21 3.179 2.649 LYS 31.A N GLN 28.A O LYS 31.A H 3.353 2.623 LYS 31.A NZ GLN 23.A OE1 LYS 31.A HZ1 2.427 1.721 ASP 35.A N LYS 31.A O ASP 35.A H 2.943 2.257 ASP 35.A N LEU 32.A O ASP 35.A H 3.066 2.437 LEU 36.A N LEU 32.A O LEU 36.A H 2.749 1.987 GLU 37.A N ALA 33.A O GLU 37.A H 3.240 2.464 THR 38.A N GLY 34.A O THR 38.A H 3.268 2.557 LEU 39.A N ASP 35.A O LEU 39.A H 2.917 2.101 ARG 40.A N LEU 36.A O ARG 40.A H 3.018 2.200 ARG 40.A NH1 GLU 37.A OE2 ARG 40.A HH11 3.441 2.870 SER 41.A N GLU 37.A O SER 41.A H 2.791 1.935 TYR 42.A N THR 38.A O TYR 42.A H 2.924 2.087 TYR 43.A N LEU 39.A O TYR 43.A H 3.319 2.573 TYR 43.A OH GLU 75.A OE2 TYR 43.A HH 2.615 1.843 LEU 44.A N ARG 40.A O LEU 44.A H 2.848 2.002 ASP 45.A N SER 41.A O ASP 45.A H 2.805 2.185 ARG 46.A N TYR 43.A O ARG 46.A H 2.840 2.003 ARG 46.A NH1 TYR 42.A O ARG 46.A HH11 3.282 2.439 GLY 47.A N TYR 102.A O GLY 47.A H 2.862 2.257 TYR 48.A N TYR 43.A O TYR 48.A H 3.088 2.271 ASP 54.A N ASN 72.A O ASP 54.A H 2.871 2.249 SER 55.A N ASN 72.A O SER 55.A H 3.260 2.430 GLN 57.A N THR 70.A O GLN 57.A H 2.939 2.141 SER 59.A N TYR 68.A O SER 59.A H 2.728 1.870 THR 61.A OG1 ASP 63.A OD1 THR 61.A HG1 2.857 2.186 LYS 64.A N THR 61.A O LYS 64.A H 3.363 2.531 LYS 65.A N ASP 63.A OD2 LYS 65.A H 3.046 2.195 ILE 67.A N GLU 1.A O ILE 67.A H 3.050 2.312 TYR 68.A N SER 59.A O TYR 68.A H 2.604 1.763 VAL 69.A N GLN 4.A O VAL 69.A H 3.115 2.324 THR 70.A N GLN 57.A O THR 70.A H 3.081 2.291 VAL 71.A N ASN 6.A O VAL 71.A H 2.858 2.038 ASN 72.A N SER 55.A O ASN 72.A H 2.893 2.137 ASN 72.A ND2 SER 55.A OG ASN 72.A HD22 3.072 2.462 ILE 73.A N VAL 8.A O ILE 73.A H 2.914 2.175 THR 74.A N ASN 52.A O THR 74.A H 2.890 2.068 THR 74.A OG1 ASP 54.A OD2 THR 74.A HG1 2.456 1.778 GLN 78.A NE2 ARG 46.A O GLN 78.A HE21 3.566 2.910 TYR 79.A N GLY 47.A O TYR 79.A H 2.826 2.096 TYR 79.A OH ASP 136.A OD1 TYR 79.A HH 3.296 2.588 LEU 81.A N GLU 100.A O LEU 81.A H 2.766 1.917 SER 82.A N VAL 141.A O SER 82.A H 2.792 1.955 GLU 85.A N LEU 143.A O GLU 85.A H 3.019 2.197 SER 87.A N VAL 145.A O SER 87.A H 3.005 2.165 GLU 96.A N HIS 93.A O GLU 96.A H 2.868 2.252 ILE 97.A N HIS 93.A O ILE 97.A H 3.071 2.295 GLY 104.A N LEU 44.A O GLY 104.A H 2.537 1.715 THR 105.A N ASP 45.A OD1 THR 105.A H 3.036 2.322 THR 105.A OG1 ASP 45.A OD1 THR 105.A HG1 3.486 2.829 THR 105.A OG1 ASN 103.A OD1 THR 105.A HG1 3.404 2.816 VAL 107.A N ASN 103.A O VAL 107.A H 2.953 2.122 THR 108.A N GLY 104.A O THR 108.A H 3.126 2.266 THR 108.A OG1 GLY 104.A O THR 108.A HG1 2.942 2.164 LYS 109.A N THR 105.A O LYS 109.A H 2.452 1.636 MET 110.A N LYS 106.A O MET 110.A H 2.582 1.793 GLU 111.A N VAL 107.A O GLU 111.A H 2.727 1.898 ASP 112.A N THR 108.A O ASP 112.A H 3.079 2.276 ASP 113.A N LYS 109.A O ASP 113.A H 3.283 2.494 ILE 114.A N MET 110.A O ILE 114.A H 2.968 2.145 LYS 115.A N GLU 111.A O LYS 115.A H 2.643 1.818 LYS 116.A N ASP 112.A O LYS 116.A H 2.582 1.926 LEU 117.A N ASP 113.A O LEU 117.A H 2.670 1.866 ARG 120.A N LYS 116.A O ARG 120.A H 3.160 2.523 ARG 120.A N LEU 117.A O ARG 120.A H 3.112 2.386 TYR 121.A N LEU 118.A O TYR 121.A H 2.816 2.152 GLY 122.A N GLY 119.A O GLY 122.A H 3.260 2.422 TYR 123.A N LEU 118.A O TYR 123.A H 3.100 2.383 ARG 127.A N ASP 148.A OD1 ARG 127.A H 2.959 2.126 ARG 127.A NH1 TYR 125.A O ARG 127.A HH11 3.551 2.916 GLU 133.A N LYS 142.A O GLU 133.A H 2.584 1.780 ASN 135.A N THR 140.A O ASN 135.A H 3.288 2.439 ALA 137.A N ASN 135.A OD1 ALA 137.A H 2.919 2.080 THR 140.A OG1 ASP 138.A OD1 THR 140.A HG1 3.125 2.324 VAL 141.A N LYS 80.A O VAL 141.A H 2.692 1.847 LYS 142.A N GLU 133.A O LYS 142.A H 2.656 1.870 LEU 143.A N GLY 83.A O LEU 143.A H 3.415 2.564 ARG 144.A N MET 131.A O ARG 144.A H 3.224 2.372 VAL 145.A N GLU 85.A O VAL 145.A H 2.927 2.235 ASP 148.A N ARG 127.A O ASP 148.A H 3.445 2.588 ASN 151.A ND2 ASN 151.A O ASN 151.A HD22 2.735 2.045 SER 154.A N LEU 425.A O SER 154.A H 3.199 2.349 ASN 161.A N ASN 161.A OD1 ASN 161.A H 2.596 1.970 THR 166.A N THR 493.A O THR 166.A H 2.811 2.166 ALA 168.A N SER 491.A O ALA 168.A H 2.710 1.890 TRP 169.A NE1 ALA 207.A O TRP 169.A HE1 2.804 2.013 THR 171.A N VAL 489.A O THR 171.A H 3.199 2.402 THR 171.A OG1 GLY 210.A O THR 171.A HG1 2.309 1.600 GLY 178.A N LYS 485.A O GLY 178.A H 2.990 2.174 SER 182.A N GLN 470.A OE1 SER 182.A H 3.325 2.571 ASN 183.A N SER 225.A O ASN 183.A H 2.732 1.948 HIS 185.A ND1 PRO 186.A O HIS 185.A HD1 2.834 1.983 VAL 192.A N ALA 189.A O VAL 192.A H 3.437 2.629 VAL 193.A N LEU 205.A O VAL 193.A H 2.550 1.735 TYR 194.A N ALA 187.A O TYR 194.A H 2.827 2.017 ALA 195.A N LYS 203.A O ALA 195.A H 3.093 2.352 ASP 197.A N LEU 201.A O ASP 197.A H 2.751 1.937 ARG 198.A NE GLU 240.A OE2 ARG 198.A HE 3.171 2.461 ARG 198.A NH2 GLN 4.A OE1 ARG 198.A HH22 2.386 1.559 ARG 198.A NH2 GLU 240.A OE2 ARG 198.A HH21 2.776 1.951 ALA 199.A N ASP 197.A OD1 ALA 199.A H 3.166 2.346 GLY 200.A N ASP 197.A O GLY 200.A H 3.050 2.430 VAL 202.A N VAL 216.A O VAL 202.A H 2.682 1.905 LYS 203.A N ALA 195.A O LYS 203.A H 2.875 2.031 LYS 203.A NZ SER 172.A O LYS 203.A HZ3 3.557 2.843 LYS 203.A NZ GLU 212.A OE1 LYS 203.A HZ1 2.253 1.365 ALA 204.A N TRP 214.A O ALA 204.A H 3.053 2.229 LEU 205.A N VAL 193.A O LEU 205.A H 2.640 1.846 ASN 206.A N LYS 211.A O ASN 206.A H 3.154 2.309 ALA 207.A N ASN 191.A O ALA 207.A H 3.161 2.310 ASP 208.A N ASN 206.A OD1 ASP 208.A H 3.140 2.453 ASP 209.A N ASN 206.A O ASP 209.A H 3.215 2.422 GLY 210.A N ASN 206.A O GLY 210.A H 2.332 1.569 ILE 213.A N ALA 204.A O ILE 213.A H 2.967 2.257 TRP 214.A NE1 THR 249.A O TRP 214.A HE1 2.710 1.995 VAL 216.A N VAL 202.A O VAL 216.A H 2.917 2.169 ALA 222.A N ALA 199.A O ALA 222.A H 2.505 1.690 LEU 224.A N ARG 198.A O LEU 224.A H 3.169 2.480 SER 225.A N GLY 238.A O SER 225.A H 3.006 2.148 GLY 226.A N GLY 238.A O GLY 226.A H 2.861 2.004 VAL 228.A N HIS 185.A O VAL 228.A H 3.030 2.261 THR 229.A N TYR 236.A O THR 229.A H 3.174 2.335 THR 229.A OG1 PRO 268.A O THR 229.A HG1 2.338 1.523 SER 231.A N HIS 234.A O SER 231.A H 3.193 2.413 HIS 234.A N SER 231.A O HIS 234.A H 2.973 2.253 HIS 234.A ND1 GLY 233.A O HIS 234.A HD1 2.855 2.027 VAL 235.A N LEU 247.A O VAL 235.A H 2.974 2.309 TYR 236.A N THR 229.A O TYR 236.A H 3.100 2.407 ILE 237.A N TYR 245.A O ILE 237.A H 3.131 2.315 GLY 238.A N GLY 226.A O GLY 238.A H 2.607 1.767 SER 239.A N GLN 243.A O SER 239.A H 2.914 2.181 SER 239.A OG GLN 243.A O SER 239.A HG 2.944 2.104 GLU 240.A N LEU 223.A O GLU 240.A H 2.682 1.839 LYS 241.A NZ PRO 221.A O LYS 241.A HZ1 2.924 2.196 VAL 244.A N THR 258.A O VAL 244.A H 3.043 2.232 TYR 245.A N ILE 237.A O TYR 245.A H 2.840 2.001 ALA 246.A N TRP 256.A O ALA 246.A H 2.955 2.143 LEU 247.A N VAL 235.A O LEU 247.A H 3.313 2.564 ASN 248.A N THR 253.A O ASN 248.A H 3.016 2.179 ASN 248.A ND2 THR 253.A O ASN 248.A HD21 2.319 1.685 THR 249.A N GLY 233.A O THR 249.A H 3.439 2.628 ASP 251.A N ASP 251.A OD1 ASP 251.A H 2.489 1.878 GLY 252.A N ASN 248.A O GLY 252.A H 2.879 2.207 ALA 255.A N ALA 246.A O ALA 255.A H 2.527 1.787 TRP 256.A N ALA 246.A O TRP 256.A H 3.257 2.483 TRP 256.A NE1 GLU 289.A O TRP 256.A HE1 2.614 1.866 THR 258.A N VAL 244.A O THR 258.A H 2.939 2.157 VAL 260.A N ALA 242.A O VAL 260.A H 3.120 2.271 ALA 264.A N SER 239.A O ALA 264.A H 3.004 2.232 VAL 269.A N LEU 276.A O VAL 269.A H 3.378 2.548 SER 271.A OG THR 315.A OG1 SER 271.A HG 3.381 2.715 LEU 276.A N VAL 269.A O LEU 276.A H 2.996 2.184 ILE 277.A N GLN 285.A O ILE 277.A H 2.815 2.034 HIS 278.A ND1 SER 311.A O HIS 278.A HD1 2.839 2.071 THR 279.A N GLN 283.A O THR 279.A H 2.890 2.077 SER 280.A N GLU 263.A O SER 280.A H 3.161 2.489 SER 280.A OG GLU 263.A O SER 280.A HG 3.308 2.482 ASN 281.A N ASN 281.A OD1 ASN 281.A H 2.387 1.665 GLY 282.A N THR 279.A O GLY 282.A H 3.042 2.337 GLN 283.A N THR 279.A OG1 GLN 283.A H 3.270 2.554 LEU 284.A N VAL 298.A O LEU 284.A H 2.745 1.914 GLN 285.A N ILE 277.A O GLN 285.A H 3.000 2.379 ALA 286.A N TRP 296.A O ALA 286.A H 3.239 2.406 ASN 288.A N ALA 293.A O ASN 288.A H 3.146 2.366 ALA 290.A N ASN 288.A OD1 ALA 290.A H 2.793 1.934 GLY 292.A N ASN 288.A O GLY 292.A H 2.979 2.284 ALA 293.A N ASP 291.A OD1 ALA 293.A H 2.592 1.899 LYS 295.A N ALA 286.A O LYS 295.A H 2.848 2.004 LYS 295.A NZ GLU 335.A OE2 LYS 295.A HZ2 2.234 1.500 VAL 298.A N LEU 284.A O VAL 298.A H 2.789 1.942 LEU 300.A N GLY 282.A O LEU 300.A H 2.602 1.813 ARG 308.A NH1 GLU 240.A OE1 ARG 308.A HH12 3.027 2.334 ARG 308.A NH2 GLU 263.A OE1 ARG 308.A HH22 2.697 1.967 THR 314.A N VAL 321.A O THR 314.A H 3.031 2.270 ALA 316.A N ALA 319.A O ALA 316.A H 3.118 2.325 ALA 320.A N VAL 332.A O ALA 320.A H 2.824 1.997 VAL 321.A N THR 314.A O VAL 321.A H 3.152 2.392 VAL 322.A N SER 330.A O VAL 322.A H 2.975 2.121 GLY 323.A N SER 311.A OG GLY 323.A H 2.726 1.911 VAL 329.A N GLN 343.A O VAL 329.A H 2.916 2.307 SER 330.A N VAL 322.A O SER 330.A H 2.629 1.769 ALA 331.A N TRP 341.A O ALA 331.A H 3.250 2.408 VAL 332.A N ALA 320.A O VAL 332.A H 2.845 2.033 LEU 333.A N GLN 338.A O LEU 333.A H 3.320 2.589 GLY 337.A N LEU 333.A O GLY 337.A H 2.811 2.128 ILE 340.A N ALA 331.A O ILE 340.A H 3.231 2.397 TRP 341.A NE1 LEU 374.A O TRP 341.A HE1 2.465 1.713 GLN 342.A NE2 SER 330.A OG GLN 342.A HE21 2.696 1.939 GLN 343.A N VAL 329.A O GLN 343.A H 3.061 2.331 GLN 343.A NE2 GLY 377.A O GLN 343.A HE21 2.279 1.516 SER 346.A OG GLY 327.A O SER 346.A HG 2.796 2.027 THR 351.A N LEU 363.A O THR 351.A H 3.069 2.420 THR 352.A OG1 ALA 312.A O THR 352.A HG1 3.302 2.619 VAL 354.A N PHE 361.A O VAL 354.A H 3.077 2.310 VAL 356.A N VAL 359.A O VAL 356.A H 3.181 2.509 VAL 360.A N LEU 372.A O VAL 360.A H 2.794 1.981 PHE 361.A N VAL 354.A O PHE 361.A H 2.778 1.968 ALA 362.A N THR 370.A O ALA 362.A H 3.123 2.319 TYR 365.A N VAL 349.A O TYR 365.A H 2.900 2.168 ASN 366.A N GLN 403.A OE1 ASN 366.A H 2.260 1.461 ASN 368.A ND2 ILE 345.A O ASN 368.A HD22 2.991 2.280 THR 370.A N ALA 362.A O THR 370.A H 2.960 2.140 ALA 371.A N TRP 381.A O ALA 371.A H 3.008 2.180 LEU 372.A N VAL 360.A O LEU 372.A H 2.609 1.881 ASP 373.A N GLN 378.A O ASP 373.A H 3.025 2.196 LEU 374.A N GLY 358.A O LEU 374.A H 3.122 2.286 GLY 377.A N ASP 373.A O GLY 377.A H 2.747 1.979 MET 380.A N ALA 371.A O MET 380.A H 2.866 2.080 ARG 383.A NH2 THR 417.A OG1 ARG 383.A HH22 3.420 2.736 ILE 392.A N TYR 399.A O ILE 392.A H 3.187 2.441 ARG 397.A N ASP 394.A O ARG 397.A H 3.230 2.424 ARG 397.A NH1 VAL 453.A O ARG 397.A HH12 2.743 2.113 ILE 398.A N LEU 410.A O ILE 398.A H 2.643 2.032 TYR 399.A N ILE 392.A O TYR 399.A H 2.987 2.231 LEU 400.A N MET 408.A O LEU 400.A H 3.280 2.515 ASP 402.A N ARG 406.A O ASP 402.A H 3.030 2.218 ASN 404.A N ASP 402.A OD2 ASN 404.A H 2.952 2.124 ASP 405.A N ASP 402.A O ASP 405.A H 3.060 2.303 VAL 407.A N GLN 421.A O VAL 407.A H 3.032 2.351 ALA 409.A N TRP 419.A O ALA 409.A H 3.273 2.501 LEU 410.A N ILE 398.A O LEU 410.A H 3.065 2.242 THR 411.A N VAL 416.A O THR 411.A H 3.347 2.544 THR 411.A OG1 ASP 413.A OD1 THR 411.A HG1 2.225 1.600 ILE 412.A N ASN 396.A O ILE 412.A H 2.949 2.266 GLY 414.A N THR 411.A OG1 GLY 414.A H 2.944 2.128 GLY 415.A N THR 411.A OG1 GLY 415.A H 3.228 2.607 LEU 418.A N ALA 409.A O LEU 418.A H 2.775 1.945 TRP 419.A NE1 VAL 453.A O TRP 419.A HE1 2.922 2.115 GLN 421.A N VAL 407.A O GLN 421.A H 2.869 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N LYS 479.A O ALA 476.A H 2.747 1.900 LYS 479.A N ALA 476.A O LYS 479.A H 2.590 1.764 LYS 479.A NZ ALA 207.A O LYS 479.A HZ3 2.664 1.957 LEU 481.A N VAL 474.A O LEU 481.A H 2.573 1.794 ILE 482.A N TYR 490.A O ILE 482.A H 3.223 2.450 GLN 483.A NE2 ALA 196.A O GLN 483.A HE22 3.411 2.559 ALA 484.A N THR 488.A O ALA 484.A H 3.004 2.178 LYS 485.A N GLY 468.A O LYS 485.A H 3.166 2.404 THR 488.A N ASP 486.A OD1 THR 488.A H 2.557 1.714 VAL 489.A N THR 171.A O VAL 489.A H 3.143 2.298 TYR 490.A N ILE 482.A O TYR 490.A H 2.882 2.037 TYR 490.A OH ASP 465.A OD1 TYR 490.A HH 2.402 1.612 SER 491.A N TRP 169.A O SER 491.A H 3.327 2.511 THR 493.A N THR 166.A O THR 493.A H 2.688 1.884