Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pki_G.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 5.A NE2 ASP 26.A OD1 no hydrogen 2.861 N/A GLU 7.A N HIS 5.A ND1 GLU 7.A H 3.089 2.281 LEU 9.A N HIS 5.A O LEU 9.A H 3.175 2.352 LYS 10.A N GLU 7.A O LYS 10.A H 2.970 2.280 LYS 10.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 10.A HZ1 2.683 1.991 ALA 11.A N PHE 8.A O ALA 11.A H 2.941 2.104 GLY 12.A N GLN 18.A OE1 GLY 12.A H 2.857 2.048 LYS 13.A NZ ALA 11.A O LYS 13.A HZ2 3.083 2.241 GLY 16.A N THR 49.A O GLY 16.A H 2.808 2.004 GLN 18.A N LEU 47.A O GLN 18.A H 3.129 2.357 GLN 18.A NE2 LYS 10.A O GLN 18.A HE22 2.974 2.170 ILE 19.A N TYR 35.A OH ILE 19.A H 3.097 2.321 TRP 20.A N VAL 45.A O TRP 20.A H 2.814 1.958 TRP 20.A NE1 GLU 7.A OE1 TRP 20.A HE1 2.743 1.893 ARG 21.A N VAL 28.A O ARG 21.A H 2.727 1.918 ARG 21.A NE GLU 23.A OE1 ARG 21.A HE 2.754 2.016 ARG 21.A NH1 ASP 42.A OD2 ARG 21.A HH11 2.852 2.224 ARG 21.A NH2 GLU 23.A OE1 ARG 21.A HH21 2.652 1.895 VAL 22.A N ALA 43.A O VAL 22.A H 3.059 2.206 GLU 23.A N ASP 26.A O GLU 23.A H 2.988 2.164 LYS 24.A NZ ALA 122.A O LYS 24.A HZ2 3.569 2.980 ASP 26.A N GLU 23.A O ASP 26.A H 3.012 2.221 LEU 27.A N ASP 26.A OD1 LEU 27.A H 2.819 2.129 VAL 28.A N ARG 21.A O VAL 28.A H 2.889 2.031 VAL 30.A N ILE 19.A O VAL 30.A H 2.986 2.142 LEU 34.A N PRO 31.A O LEU 34.A H 2.707 1.872 TYR 35.A N THR 32.A O TYR 35.A H 3.378 2.531 ASP 37.A N LEU 34.A O ASP 37.A H 3.094 2.254 PHE 38.A N LYS 115.A O PHE 38.A H 2.976 2.125 PHE 39.A N TYR 44.A OH PHE 39.A H 2.935 2.095 THR 40.A N LYS 117.A O THR 40.A H 2.881 2.090 THR 40.A OG1 GLU 68.A OE2 THR 40.A HG1 2.638 1.932 GLY 41.A N GLY 119.A O GLY 41.A H 2.790 2.087 ASP 42.A N PHE 39.A O ASP 42.A H 3.034 2.220 TYR 44.A N TRP 64.A O TYR 44.A H 2.885 2.074 VAL 45.A N TRP 20.A O VAL 45.A H 2.790 1.952 ILE 46.A N HIS 62.A O ILE 46.A H 2.701 1.854 LEU 47.A N GLN 18.A O LEU 47.A H 2.954 2.130 LYS 48.A N ASP 60.A O LYS 48.A H 2.920 2.094 THR 49.A N GLY 16.A O THR 49.A H 2.891 2.057 VAL 50.A N GLN 58.A O VAL 50.A H 2.824 2.005 GLN 51.A NE2 GLY 55.A O GLN 51.A HE21 3.518 3.046 LEU 52.A N ASN 56.A O LEU 52.A H 3.144 2.327 ASN 54.A ND2 LEU 52.A O ASN 54.A HD22 3.181 2.574 GLY 55.A N LEU 52.A O GLY 55.A H 2.740 1.905 GLN 58.A N VAL 50.A O GLN 58.A H 2.631 1.776 TYR 59.A OH GLY 12.A O TYR 59.A HH 2.843 2.027 ASP 60.A N LYS 48.A O ASP 60.A H 2.979 2.175 LEU 61.A N VAL 93.A O LEU 61.A H 2.731 1.914 HIS 62.A N ILE 46.A O HIS 62.A H 2.793 1.961 HIS 62.A ND1 GLU 97.A OE2 no hydrogen 2.738 N/A TYR 63.A N HIS 95.A O TYR 63.A H 2.899 2.120 TRP 64.A N TYR 44.A O TRP 64.A H 2.905 2.122 TRP 64.A NE1 GLU 102.A OE2 TRP 64.A HE1 2.927 2.072 LEU 65.A N GLU 97.A O LEU 65.A H 2.857 2.056 GLY 66.A N ASP 42.A O GLY 66.A H 3.033 2.259 ASN 67.A N GLN 99.A OE1 ASN 67.A H 2.777 1.934 ASN 67.A ND2 GLU 68.A OE1 ASN 67.A HD22 2.938 2.088 GLU 68.A N THR 40.A O GLU 68.A H 2.883 2.031 CYS 69.A N GLY 66.A O CYS 69.A H 3.255 2.400 CYS 69.A SG GLY 66.A O CYS 69.A HG 3.322 2.378 SER 70.A N GLU 73.A OE1 SER 70.A H 3.012 2.241 GLU 73.A N SER 70.A O GLU 73.A H 2.718 2.015 SER 74.A N SER 70.A O SER 74.A H 3.162 2.374 GLY 75.A N GLN 71.A O GLY 75.A H 2.939 2.110 ALA 76.A N ASP 72.A O ALA 76.A H 2.994 2.170 ALA 77.A N GLU 73.A O ALA 77.A H 2.899 2.064 ALA 78.A N SER 74.A O ALA 78.A H 3.120 2.297 ILE 79.A N GLY 75.A O ILE 79.A H 2.991 2.148 PHE 80.A N ALA 76.A O PHE 80.A H 2.750 1.891 THR 81.A N ALA 77.A O THR 81.A H 2.970 2.134 THR 81.A OG1 ALA 77.A O THR 81.A HG1 2.944 2.209 VAL 82.A N ALA 78.A O VAL 82.A H 3.073 2.253 GLN 83.A N ILE 79.A O GLN 83.A H 2.865 2.078 LEU 84.A N PHE 80.A O LEU 84.A H 2.785 1.952 ASP 85.A N THR 81.A O ASP 85.A H 3.017 2.165 ASP 86.A N VAL 82.A O ASP 86.A H 3.046 2.194 TYR 87.A N GLN 83.A O TYR 87.A H 2.964 2.197 LEU 88.A N LEU 84.A O LEU 88.A H 3.011 2.258 ASN 89.A N ASP 86.A O ASN 89.A H 2.983 2.227 GLY 90.A N ASP 85.A O GLY 90.A H 2.759 1.934 ARG 91.A N LEU 88.A O ARG 91.A H 3.084 2.235 ARG 91.A NH2 LEU 57.A O ARG 91.A HH22 2.851 2.239 ALA 92.A N ASP 85.A OD1 ALA 92.A H 2.993 2.364 VAL 93.A N TYR 59.A O VAL 93.A H 3.066 2.253 GLN 94.A NE2 ASP 85.A OD2 GLN 94.A HE21 2.718 1.858 HIS 95.A N LEU 61.A O HIS 95.A H 2.602 1.854 HIS 95.A NE2 ASP 60.A OD1 no hydrogen 3.032 N/A GLU 97.A N TYR 63.A O GLU 97.A H 2.914 2.058 GLN 99.A N LEU 65.A O GLN 99.A H 3.082 2.225 GLY 100.A N GLU 102.A OE1 GLY 100.A H 3.187 2.555 GLY 100.A N TYR 116.A OH GLY 100.A H 2.998 2.245 PHE 101.A N VAL 98.A O PHE 101.A H 2.951 2.182 GLU 102.A N GLU 102.A OE1 GLU 102.A H 2.638 1.844 SER 103.A N GLU 97.A OE1 SER 103.A H 2.670 1.828 SER 103.A OG GLU 97.A OE1 SER 103.A HG 3.353 2.693 PHE 106.A N SER 103.A OG PHE 106.A H 3.327 2.481 LEU 107.A N SER 103.A O LEU 107.A H 2.909 2.052 GLY 108.A N ALA 104.A O GLY 108.A H 2.872 2.145 TYR 109.A N PHE 106.A O TYR 109.A H 3.061 2.213 TYR 109.A OH HIS 62.A NE2 TYR 109.A HH 2.807 2.053 PHE 110.A N LEU 107.A O PHE 110.A H 3.257 2.409 GLY 113.A N PHE 110.A O GLY 113.A H 2.918 2.102 LYS 115.A N GLY 36.A O LYS 115.A H 2.774 1.933 LYS 115.A NZ GLY 113.A O LYS 115.A HZ2 3.078 2.250 TYR 116.A OH GLU 102.A OE2 TYR 116.A HH 2.449 1.627 LYS 117.A N PHE 38.A O LYS 117.A H 2.916 2.097 VAL 121.A N ASP 42.A OD2 VAL 121.A H 2.998 2.219 SER 123.A OG ASP 72.A OD1 SER 123.A HG 2.863 2.075 SER 123.A OG ASP 72.A OD2 SER 123.A HG 3.357 2.606 GLY 124.A N ASP 72.A OD2 GLY 124.A H 2.724 1.885 PHE 125.A N SER 123.A OG PHE 125.A H 2.975 2.138 ASN 136.A ND2 ASN 158.A O ASN 136.A HD21 2.816 1.963 ASN 136.A ND2 ASN 160.A O ASN 136.A HD22 3.003 2.162 THR 138.A N ASN 136.A OD1 THR 138.A H 2.910 2.071 THR 138.A OG1 ASN 136.A OD1 THR 138.A HG1 2.714 2.044 GLU 142.A N ASP 139.A OD1 GLU 142.A H 2.959 2.103 THR 143.A N ASP 139.A O THR 143.A H 2.873 2.050 THR 143.A OG1 ASP 139.A O THR 143.A HG1 2.616 1.837 LEU 144.A N VAL 140.A O LEU 144.A H 3.021 2.201 GLU 145.A N GLU 141.A O GLU 145.A H 3.125 2.327 ARG 146.A N GLU 142.A O ARG 146.A H 2.937 2.136 ARG 146.A NH1 ASP 151.A OD2 ARG 146.A HH11 2.990 2.157 ILE 147.A N THR 143.A O ILE 147.A H 3.012 2.194 LYS 148.A N LEU 144.A O LYS 148.A H 3.061 2.227 ASN 149.A N GLU 145.A O ASN 149.A H 2.843 2.030 ASN 150.A N ILE 147.A O ASN 150.A H 3.158 2.360 ASN 150.A ND2 SER 181.A OG ASN 150.A HD21 3.338 2.567 ASP 151.A N ARG 146.A O ASP 151.A H 2.906 2.117 LYS 153.A N ASP 151.A OD1 LYS 153.A H 3.066 2.230 LYS 153.A NZ ASP 151.A OD1 LYS 153.A HZ1 3.252 2.563 LEU 154.A N ASP 151.A O LEU 154.A H 3.126 2.284 VAL 157.A N LYS 185.A O VAL 157.A H 2.974 2.137 LEU 159.A N SER 187.A O LEU 159.A H 2.814 1.955 ASN 160.A N ASN 158.A OD1 ASN 160.A H 2.851 2.052 ASN 161.A N VAL 189.A O ASN 161.A H 2.842 2.009 THR 169.A N PRO 166.A O THR 169.A H 2.947 2.333 LEU 170.A N PRO 166.A O LEU 170.A H 3.097 2.295 LYS 171.A N ILE 167.A O LYS 171.A H 2.953 2.119 ALA 172.A N PRO 168.A O ALA 172.A H 2.989 2.191 TYR 173.A N THR 169.A O TYR 173.A H 2.951 2.162 TYR 173.A OH VAL 140.A O TYR 173.A HH 2.511 1.916 ALA 174.A N LEU 170.A O ALA 174.A H 3.193 2.443 GLU 175.A N LYS 171.A O GLU 175.A H 3.058 2.299 ALA 176.A N ALA 172.A O ALA 176.A H 2.901 2.078 LEU 177.A N TYR 173.A O LEU 177.A H 3.069 2.345 LYS 178.A N GLU 175.A O LYS 178.A H 3.246 2.471 LYS 178.A NZ GLU 175.A OE1.B LYS 178.A HZ3 3.009 2.156 LYS 178.A NZ GLU 175.A OE2.A LYS 178.A HZ3 3.016 2.157 LYS 178.A NZ GLU 203.A OE1 LYS 178.A HZ2 3.367 2.507 ASN 180.A ND2 ILE 147.A O ASN 180.A HD22 3.375 2.521 SER 181.A N ASN 150.A OD1 SER 181.A H 2.766 1.932 TYR 182.A N ASN 180.A OD1 TYR 182.A H 2.711 1.858 VAL 183.A N ASN 180.A OD1 VAL 183.A H 2.664 1.846 LYS 184.A N GLU 155.A O LYS 184.A H 2.779 1.977 LYS 185.A N GLU 155.A O LYS 185.A H 3.193 2.366 LYS 185.A NZ THR 213.A OG1 LYS 185.A HZ1 3.401 2.684 PHE 186.A N THR 213.A O PHE 186.A H 2.931 2.162 SER 187.A N VAL 157.A O SER 187.A H 2.950 2.173 ILE 188.A N ASN 215.A O ILE 188.A H 2.832 1.996 VAL 189.A N ASN 160.A OD1 VAL 189.A H 2.942 2.154 GLY 190.A N GLU 217.A O GLY 190.A H 3.287 2.550 THR 191.A N ASN 219.A OD1 THR 191.A H 2.920 2.202 THR 191.A OG1 ILE 188.A O THR 191.A HG1 2.958 2.215 SER 193.A N ASN 219.A OD1 SER 193.A H 3.358 2.552 SER 193.A OG THR 191.A OG1 SER 193.A HG 2.969 2.226 ALA 198.A N ASN 194.A O ALA 198.A H 3.199 2.397 TYR 199.A N ASP 195.A O TYR 199.A H 2.678 1.841 ALA 200.A N PRO 196.A O ALA 200.A H 3.101 2.251 LEU 201.A N VAL 197.A O LEU 201.A H 2.871 2.022 ALA 202.A N ALA 198.A O ALA 202.A H 2.824 2.010 GLU 203.A N TYR 199.A O GLU 203.A H 3.098 2.265 MET 204.A N ALA 200.A O MET 204.A H 2.993 2.188 LEU 205.A N LEU 201.A O LEU 205.A H 2.998 2.283 LEU 205.A N ALA 202.A O LEU 205.A H 3.078 2.445 LYS 206.A N GLU 203.A O LYS 206.A H 3.147 2.461 GLU 207.A N MET 204.A O GLU 207.A H 2.908 2.074 ASN 208.A N MET 204.A O ASN 208.A H 2.764 1.907 ASN 208.A ND2 LEU 177.A O ASN 208.A HD22 2.838 1.983 VAL 210.A N ASN 208.A OD1 VAL 210.A H 2.852 2.043 LEU 211.A N ASN 208.A OD1 LEU 211.A H 2.595 1.738 LYS 212.A N LYS 184.A O LYS 212.A H 2.718 1.890 THR 213.A N LYS 184.A O THR 213.A H 2.926 2.165 LEU 214.A N GLU 241.A O LEU 214.A H 3.015 2.216 ASN 215.A N PHE 186.A O ASN 215.A H 2.950 2.165 VAL 216.A N LYS 243.A O VAL 216.A H 2.952 2.128 GLU 217.A N ASN 215.A OD1 GLU 217.A H 2.856 1.999 SER 218.A N ASP 245.A O SER 218.A H 3.109 2.361 ASN 219.A ND2 ILE 188.A O ASN 219.A HD21 2.843 1.992 ASN 219.A ND2 VAL 216.A O ASN 219.A HD22 3.066 2.382 PHE 220.A N SER 193.A O PHE 220.A H 2.872 2.049 ILE 221.A N GLN 247.A OE1 ILE 221.A H 2.888 2.037 SER 222.A N ASP 195.A OD1 SER 222.A H 2.856 2.045 SER 222.A OG ASP 195.A OD1 SER 222.A HG 3.371 2.594 ALA 224.A N SER 222.A OG ALA 224.A H 2.967 2.307 ILE 226.A N SER 222.A O ILE 226.A H 2.873 2.052 LEU 227.A N GLY 223.A O LEU 227.A H 2.789 1.959 ARG 228.A N ALA 224.A O ARG 228.A H 3.048 2.239 LEU 229.A N GLY 225.A O LEU 229.A H 3.208 2.357 VAL 230.A N ILE 226.A O VAL 230.A H 3.129 2.356 GLU 231.A N LEU 227.A O GLU 231.A H 2.805 1.989 ALA 232.A N LEU 229.A O ALA 232.A H 3.051 2.235 LEU 233.A N VAL 230.A O LEU 233.A H 2.902 2.089 TYR 235.A N ALA 232.A O TYR 235.A H 2.827 2.033 ASN 236.A N LEU 233.A O ASN 236.A H 2.927 2.129 ASN 236.A ND2 LEU 205.A O ASN 236.A HD22 2.875 2.015 SER 238.A N ASN 236.A OD1 SER 238.A H 2.967 2.135 LEU 239.A N ASN 236.A OD1 LEU 239.A H 2.612 1.760 VAL 240.A N LYS 212.A O VAL 240.A H 2.761 1.916 GLU 241.A N LYS 212.A O GLU 241.A H 3.049 2.238 MET 242.A N LYS 271.A O MET 242.A H 3.101 2.266 LYS 243.A N LEU 214.A O LYS 243.A H 2.993 2.167 ILE 244.A N GLY 273.A O ILE 244.A H 2.786 1.936 ASN 246.A ND2 SER 218.A OG ASN 246.A HD22 2.669 1.819 GLN 247.A NE2 VAL 216.A O GLN 247.A HE22 2.839 2.024 GLN 247.A NE2 ILE 244.A O GLN 247.A HE21 3.048 2.216 SER 248.A N ASN 219.A O SER 248.A H 2.972 2.332 GLU 256.A N GLY 252.A O GLU 256.A H 3.088 2.262 MET 257.A N ASN 253.A O MET 257.A H 3.316 2.580 MET 257.A N LYS 254.A O MET 257.A H 3.034 2.371 GLU 258.A N LYS 254.A O GLU 258.A H 3.177 2.382 ILE 259.A N VAL 255.A O ILE 259.A H 2.894 2.153 VAL 260.A N GLU 256.A O VAL 260.A H 3.209 2.409 SER 261.A N MET 257.A O SER 261.A H 3.133 2.284 SER 261.A OG GLU 258.A O SER 261.A HG 2.568 1.753 MET 262.A N GLU 258.A O MET 262.A H 3.254 2.471 LEU 263.A N ILE 259.A O LEU 263.A H 2.931 2.113 GLU 264.A N VAL 260.A O GLU 264.A H 2.978 2.169 LYS 265.A N MET 262.A O LYS 265.A H 2.895 2.077 ASN 266.A N LEU 263.A O ASN 266.A H 3.369 2.550 ASN 266.A ND2 LEU 233.A O ASN 266.A HD22 2.949 2.138 THR 268.A N ASN 266.A OD1 THR 268.A H 2.735 1.963 LEU 269.A N ASN 266.A OD1 LEU 269.A H 2.546 1.697 LEU 270.A N VAL 240.A O LEU 270.A H 2.773 1.948 LYS 271.A N VAL 240.A O LYS 271.A H 2.967 2.186 LYS 271.A NZ GLU 241.A OE1 LYS 271.A HZ2 3.216 2.380 GLY 273.A N MET 242.A O GLY 273.A H 2.734 1.897 TYR 274.A OH GLU 256.A OE1 TYR 274.A HH 2.741 2.078 HIS 275.A N ASP 245.A OD1 HIS 275.A H 3.280 2.439 THR 277.A N GLU 256.A OE1 THR 277.A H 2.707 1.850 GLN 278.A N GLU 256.A OE2 GLN 278.A H 3.073 2.215 GLN 278.A NE2 ASN 253.A O GLN 278.A HE22 2.813 2.061 GLN 278.A NE2 GLU 256.A OE2 GLN 278.A HE21 3.387 2.538 ARG 282.A N GLN 278.A O ARG 282.A H 3.012 2.182 LEU 283.A N GLN 279.A O LEU 283.A H 3.050 2.208 ARG 284.A N GLY 280.A O ARG 284.A H 3.136 2.285 ARG 284.A NE GLU 264.A OE2 ARG 284.A HE 3.128 2.290 ARG 284.A NH2 GLU 264.A OE1 ARG 284.A HH21 2.922 2.075 ALA 285.A N PRO 281.A O ALA 285.A H 2.723 1.916 SER 286.A N ARG 282.A O SER 286.A H 3.127 2.306 ASN 287.A N LEU 283.A O ASN 287.A H 2.881 2.037 ALA 288.A N ARG 284.A O ALA 288.A H 2.841 2.037 MET 289.A N ALA 285.A O MET 289.A H 2.950 2.120 MET 290.A N SER 286.A O MET 290.A H 3.050 2.229 ASN 291.A N ASN 287.A O ASN 291.A H.A 2.764 1.938 ASN 291.A ND2.A ASN 292.A OD1 ASN 291.A HD22.A 3.107 2.294 ASN 292.A N ALA 288.A O ASN 292.A H 2.891 2.046 ASN 292.A ND2 ASN 266.A O ASN 292.A HD21 2.778 1.949 ASN 292.A ND2 LEU 269.A O ASN 292.A HD22 2.822 1.998 ASN 293.A N MET 289.A O ASN 293.A H 2.815 1.984 ASN 293.A ND2 LEU 270.A O ASN 293.A HD21 2.947 2.398 ASN 293.A ND2 MET 289.A O ASN 293.A HD22 3.207 2.428 ASP 294.A N MET 290.A O ASP 294.A H 3.029 2.328 ASP 294.A N ASN 291.A O ASP 294.A H 3.101 2.439 LEU 295.A N ASN 291.A O LEU 295.A H 3.233 2.448 ARG 297.A N ASN 293.A O ARG 297.A H 3.400 2.591 ARG 297.A NH1 ASP 294.A OD1 ARG 297.A HH11 3.027 2.172 LYS 298.A N ASP 294.A O LYS 298.A H 2.901 2.062 ARG 299.A N LEU 295.A O ARG 299.A H 3.020 2.202 ARG 300.A N VAL 296.A O ARG 300.A H 2.861 2.054 LEU 301.A N ARG 297.A O LEU 301.A H 2.930 2.247 ALA 302.A N LYS 298.A O ALA 302.A H 2.970 2.204 ASP 303.A N ARG 299.A O ASP 303.A H 2.986 2.130 LEU 304.A N LEU 301.A O LEU 304.A H 3.408 2.613