Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4pu4_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 3.A N LEU 15.A O LEU 3.A H 2.666 1.866 GLU 4.A N VAL 100.A O GLU 4.A H 2.899 2.162 MET 5.A N GLY 13.A O MET 5.A H 2.829 1.985 HIS 6.A N ALA 98.A O HIS 6.A H 2.893 2.070 LEU 7.A N LEU 10.A O LEU 7.A H 2.548 1.863 ASP 9.A N ASP 9.A OD1 ASP 9.A H 2.618 1.957 LEU 10.A N LEU 7.A O LEU 10.A H 2.904 2.088 ILE 12.A N MET 5.A O ILE 12.A H 2.884 2.176 GLU 14.A N HIS 27.A O GLU 14.A H 2.993 2.142 LEU 15.A N LEU 3.A O LEU 15.A H 2.688 1.848 SER 16.A N ALA 25.A O SER 16.A H 2.637 1.811 PHE 17.A N LEU 1.A O PHE 17.A H 2.538 1.684 ASP 18.A N THR 23.A O ASP 18.A H 2.873 2.123 ALA 21.A N ASP 18.A OD2 ALA 21.A H 3.390 2.550 ASP 22.A N ALA 19.A O ASP 22.A H 3.241 2.452 THR 23.A N ASP 18.A O THR 23.A H 3.187 2.360 THR 23.A OG1 SER 51.A OG THR 23.A HG1 2.567 1.852 PHE 24.A N SER 51.A OG PHE 24.A H 2.544 1.741 ALA 25.A N SER 16.A O ALA 25.A H 2.613 1.810 HIS 27.A N GLU 14.A O HIS 27.A H 3.173 2.393 TYR 28.A OH ILE 43.A O TYR 28.A HH 3.126 2.416 THR 29.A OG1 ILE 12.A O THR 29.A HG1 3.330 2.513 TRP 32.A NE1 PHE 37.A O TRP 32.A HE1 2.979 2.321 GLN 33.A N THR 29.A O GLN 33.A H 2.916 2.139 GLN 34.A N LYS 30.A O GLN 34.A H 3.403 2.576 GLN 34.A NE2 GLN 33.A OE1 GLN 34.A HE21 3.054 2.530 SER 35.A N ASP 31.A O SER 35.A H 3.042 2.223 SER 35.A OG ASP 31.A O SER 35.A HG 2.511 1.706 GLY 36.A N TRP 32.A O GLY 36.A H 2.643 1.939 LEU 39.A N TYR 28.A OH LEU 39.A H 3.016 2.185 ILE 43.A N SER 40.A O ILE 43.A H 3.143 2.291 GLY 47.A N PRO 44.A O GLY 47.A H 3.321 2.492 THR 48.A N ASP 46.A OD1 THR 48.A H 2.816 2.055 GLN 53.A NE2 GLY 232.A O GLN 53.A HE22 3.220 2.439 ILE 54.A N THR 50.A O ILE 54.A H 3.158 2.346 SER 55.A N SER 51.A O SER 55.A H 3.058 2.240 MET 56.A N ASN 52.A O MET 56.A H 3.121 2.285 PHE 57.A N GLN 53.A O PHE 57.A H 3.105 2.322 LEU 58.A N ILE 54.A O LEU 58.A H 3.140 2.329 VAL 59.A N SER 55.A O VAL 59.A H 2.973 2.127 ASN 60.A N MET 56.A O ASN 60.A H 2.947 2.230 ASN 60.A ND2 PHE 233.A O ASN 60.A HD21 3.319 2.527 LEU 61.A N LEU 58.A O LEU 61.A H 2.941 2.103 LEU 62.A N VAL 59.A O LEU 62.A H 3.228 2.378 LEU 68.A N ASN 65.A O LEU 68.A H 2.673 1.897 TYR 70.A N LYS 66.A O TYR 70.A H 2.723 1.953 LEU 71.A N GLY 67.A O LEU 71.A H 2.900 2.185 LEU 71.A N LEU 68.A O LEU 71.A H 3.120 2.535 ILE 72.A N LEU 68.A O ILE 72.A H 2.972 2.141 GLU 73.A N ASP 69.A O GLU 73.A H 3.260 2.505 SER 74.A N TYR 70.A O SER 74.A H 3.044 2.267 LEU 75.A N LEU 71.A O LEU 75.A H 2.986 2.146 GLY 76.A N ILE 72.A O GLY 76.A H 2.484 1.854 VAL 77.A N ILE 72.A O VAL 77.A H 3.034 2.408 ASN 81.A N SER 78.A O ASN 81.A H 3.448 2.613 ALA 84.A N ASN 81.A OD1 ALA 84.A H 3.214 2.381 ILE 86.A N THR 82.A O ILE 86.A H 2.762 1.929 ARG 87.A N PHE 83.A O ARG 87.A H 2.953 2.121 ALA 88.A N ALA 84.A O ALA 88.A H 3.112 2.423 ILE 89.A N LEU 85.A O ILE 89.A H 3.277 2.462 ASP 92.A N ILE 89.A O ASP 92.A H 3.065 2.415 GLY 95.A N ASP 209.A OD2 GLY 95.A H 3.237 2.387 ALA 98.A N HIS 6.A O ALA 98.A H 2.717 1.902 PHE 99.A N GLY 90.A O PHE 99.A H 2.593 1.914 VAL 100.A N GLU 4.A O VAL 100.A H 2.790 1.978 ALA 104.A N PRO 101.A O ALA 104.A H 3.300 2.625 ILE 114.A N PHE 150.A O ILE 114.A H 3.067 2.339 LYS 115.A N GLU 118.A OE2 LYS 115.A H 3.074 2.254 GLU 118.A N LYS 115.A O GLU 118.A H 3.300 2.554 VAL 119.A N ALA 116.A O VAL 119.A H 3.242 2.563 ILE 120.A N ALA 116.A O ILE 120.A H 3.105 2.307 GLN 121.A N GLU 117.A O GLN 121.A H 3.287 2.473 GLN 121.A NE2 GLU 118.A O GLN 121.A HE21 3.579 2.964 ARG 122.A N VAL 119.A O ARG 122.A H 2.992 2.344 ILE 123.A N VAL 119.A O ILE 123.A H 2.902 2.312 ILE 123.A N ILE 120.A O ILE 123.A H 3.024 2.364 GLU 124.A N ILE 120.A O GLU 124.A H 2.760 2.003 MET 128.A N ASP 125.A OD1 MET 128.A H 2.852 2.001 TRP 129.A N ASP 125.A O TRP 129.A H 2.619 1.802 ARG 132.A NH1 VAL 137.A O ARG 132.A HH12 3.476 2.778 LEU 141.A N VAL 163.A O LEU 141.A H 2.849 2.005 LEU 143.A N HIS 161.A O LEU 143.A H 2.996 2.137 PHE 144.A N ALA 151.A O PHE 144.A H 2.957 2.150 TYR 145.A N THR 160.A OG1 TYR 145.A H 3.036 2.260 LYS 148.A N ASN 146.A OD1 LYS 148.A H 2.914 2.066 PHE 150.A N GLU 149.A OE2 PHE 150.A H 2.932 2.269 PHE 152.A N ARG 112.A O PHE 152.A H 3.136 2.331 HIS 161.A N LEU 143.A O HIS 161.A H 3.009 2.221 ILE 162.A N VAL 205.A O ILE 162.A H 2.798 1.979 VAL 163.A N LEU 141.A O VAL 163.A H 2.927 2.181 LYS 164.A N LEU 203.A O LYS 164.A H 2.982 2.190 LYS 164.A NZ GLU 175.A OE1 LYS 164.A HZ3 2.931 2.290 LYS 164.A NZ GLU 175.A OE2 LYS 164.A HZ3 2.866 2.029 PHE 165.A N PRO 139.A O PHE 165.A H 2.967 2.141 LYS 167.A NZ GLN 138.A OE1 LYS 167.A HZ1 3.312 2.671 HIS 170.A N GLU 166.A OE2 HIS 170.A H 2.383 1.672 ASN 174.A N HIS 170.A O ASN 174.A H 3.076 2.286 ASN 174.A ND2 SER 317.A O ASN 174.A HD22 2.627 1.797 GLU 175.A N LEU 171.A O GLU 175.A H 3.000 2.161 PHE 176.A N VAL 172.A O PHE 176.A H 3.079 2.240 ILE 177.A N ILE 173.A O ILE 177.A H 3.099 2.249 THR 178.A N ASN 174.A O THR 178.A H 3.047 2.209 THR 178.A OG1 ASN 174.A O THR 178.A HG1 2.864 2.048 MET 179.A N GLU 175.A O MET 179.A H 2.723 1.871 ARG 180.A N PHE 176.A O ARG 180.A H 2.943 2.113 ARG 180.A NE VAL 192.A O ARG 180.A HE 2.786 2.064 ARG 180.A NH2 VAL 192.A O ARG 180.A HH21 2.599 1.829 ARG 180.A NH2 ASP 193.A OD1 ARG 180.A HH21 3.160 2.504 LEU 181.A N ILE 177.A O LEU 181.A H 2.655 1.849 ALA 182.A N THR 178.A O ALA 182.A H 3.083 2.254 LYS 183.A N MET 179.A O LYS 183.A H 3.329 2.519 VAL 184.A N ARG 180.A O VAL 184.A H 2.840 1.995 LEU 185.A N LEU 181.A O LEU 185.A H 2.987 2.208 GLY 186.A N LYS 183.A O GLY 186.A H 2.785 2.003 MET 187.A N ALA 182.A O MET 187.A H 2.972 2.202 ALA 190.A N TRP 312.A O ALA 190.A H 2.947 2.103 ASN 191.A ND2 GLU 206.A OE1 ASN 191.A HD21 3.415 2.621 ASP 193.A N CYS 204.A O ASP 193.A H 2.747 1.896 VAL 195.A N ALA 202.A O VAL 195.A H 2.770 1.918 PHE 197.A N TYR 200.A O PHE 197.A H 2.606 1.779 TYR 200.A N PHE 197.A O TYR 200.A H 2.656 1.925 LYS 201.A NZ GLU 389.A OE2 LYS 201.A HZ3 2.828 1.978 ALA 202.A N VAL 195.A O ALA 202.A H 2.715 1.880 LEU 203.A N LYS 164.A O LEU 203.A H 3.068 2.287 CYS 204.A N ASP 193.A O CYS 204.A H 2.581 1.793 VAL 205.A N ILE 162.A O VAL 205.A H 2.876 2.022 GLU 206.A N ASN 191.A O GLU 206.A H 2.875 2.039 ARG 207.A N THR 160.A O ARG 207.A H 3.044 2.196 ASP 209.A N ASP 209.A OD1 ASP 209.A H 2.742 2.141 ARG 210.A NE GLY 95.A O ARG 210.A HE 3.467 2.757 ARG 210.A NH1 ASP 92.A OD1 ARG 210.A HH12 2.954 2.194 ARG 210.A NH2 ASP 92.A OD1 ARG 210.A HH22 2.993 2.245 ARG 210.A NH2 GLY 95.A O ARG 210.A HH21 2.975 2.131 ARG 211.A N LEU 220.A O ARG 211.A H 2.805 2.032 ASN 212.A ND2 TYR 145.A O ASN 212.A HD21 3.649 2.892 LEU 220.A N ARG 211.A O LEU 220.A H 3.052 2.346 ARG 221.A NH1 LEU 91.A O ARG 221.A HH12 2.944 2.209 ARG 221.A NH2 LEU 91.A O ARG 221.A HH22 2.946 2.212 ARG 222.A N ASP 209.A O ARG 222.A H 3.023 2.207 ARG 222.A NH2 PHE 208.A O ARG 222.A HH21 3.519 2.675 HIS 223.A NE2 LEU 39.A O HIS 223.A HE2 2.940 2.176 VAL 225.A N PHE 300.A O VAL 225.A H 2.995 2.171 ASP 226.A N GLN 229.A OE1 ASP 226.A H 2.732 1.895 SER 227.A N GLY 295.A O SER 227.A H 3.175 2.396 SER 227.A OG GLY 295.A O SER 227.A HG 2.572 1.773 GLN 229.A NE2 PHE 57.A O GLN 229.A HE21 3.129 2.290 ALA 230.A N ASP 226.A O ALA 230.A H 3.118 2.397 LEU 231.A N SER 227.A O LEU 231.A H 2.897 2.079 PHE 233.A N CYS 228.A O PHE 233.A H 2.864 2.012 LYS 237.A N SER 234.A O LYS 237.A H 2.882 2.050 LYS 237.A NZ GLU 254.A O LYS 237.A HZ2 2.428 1.776 LYS 238.A N VAL 235.A O LYS 238.A H 3.348 2.507 GLU 240.A N ALA 329.A O GLU 240.A H 3.090 2.257 ASN 242.A ND2 GLU 254.A OE1 ASN 242.A HD21 3.293 2.720 ILE 252.A N VAL 249.A O ILE 252.A H 3.067 2.232 ARG 253.A NE GLU 240.A OE2 ARG 253.A HE 2.726 1.976 ARG 253.A NH1 ASP 334.A OD1 ARG 253.A HH12 3.157 2.417 ARG 253.A NH2 GLU 240.A OE2 ARG 253.A HH21 2.722 1.981 ARG 253.A NH2 ASP 334.A OD1 ARG 253.A HH22 3.303 2.604 GLY 255.A N GLU 240.A O GLY 255.A H 2.756 1.972 VAL 256.A N LYS 237.A O VAL 256.A H 3.193 2.427 LEU 261.A N SER 257.A O LEU 261.A H 2.842 2.117 PHE 262.A N PHE 258.A O PHE 262.A H 2.820 1.988 SER 263.A N ASN 259.A O SER 263.A H 3.248 2.573 SER 263.A OG ARG 260.A O SER 263.A HG 2.626 1.824 LEU 264.A N LEU 261.A O LEU 264.A H 3.118 2.278 ALA 265.A N PHE 262.A O ALA 265.A H 3.025 2.173 LYS 267.A N LEU 264.A O LYS 267.A H 2.972 2.304 CYS 268.A N ALA 265.A O CYS 268.A H 2.913 2.180 CYS 268.A SG LEU 264.A O CYS 268.A HG 3.604 2.475 ARG 269.A N MET 307.A O ARG 269.A H 2.557 1.794 ALA 273.A N ASN 270.A OD1 ALA 273.A H 3.454 2.608 ALA 274.A N ASN 270.A O ALA 274.A H 2.877 2.080 LYS 275.A N PRO 271.A O LYS 275.A H 2.920 2.074 GLN 276.A N VAL 272.A O GLN 276.A H 3.217 2.439 ASP 277.A N ALA 273.A O ASP 277.A H 3.336 2.528 MET 278.A N ALA 274.A O MET 278.A H 2.924 2.105 LEU 279.A N LYS 275.A O LEU 279.A H 2.997 2.180 GLN 280.A N GLN 276.A O GLN 280.A H 2.992 2.148 GLN 280.A NE2 ASN 363.A OD1 GLN 280.A HE21 2.915 2.082 TRP 281.A N ASP 277.A O TRP 281.A H 2.963 2.195 ALA 282.A N MET 278.A O ALA 282.A H 2.943 2.139 LEU 283.A N LEU 279.A O LEU 283.A H 2.794 1.941 PHE 284.A N GLN 280.A O PHE 284.A H 2.601 1.780 ASN 285.A N TRP 281.A O ASN 285.A H 3.018 2.188 LEU 286.A N ALA 282.A O LEU 286.A H 2.910 2.165 LEU 287.A N LEU 283.A O LEU 287.A H 3.102 2.279 THR 288.A N PHE 284.A O THR 288.A H 2.852 2.078 GLY 289.A N LEU 286.A O GLY 289.A H 3.367 2.611 ASN 290.A N ASN 285.A O ASN 290.A H 2.730 1.901 ASN 290.A ND2 ASN 285.A OD1 ASN 290.A HD22 3.053 2.238 ASP 292.A N ASN 290.A OD1 ASP 292.A H 3.192 2.420 GLY 295.A N LYS 238.A O GLY 295.A H 2.963 2.116 LYS 296.A NZ ASN 60.A O LYS 296.A HZ1 2.830 1.955 LYS 296.A NZ ASN 60.A OD1 LYS 296.A HZ3 3.209 2.419 ASN 297.A N HIS 294.A O ASN 297.A H 3.045 2.233 TYR 298.A OH ASP 277.A OD2 TYR 298.A HH 2.958 2.283 PHE 300.A N VAL 225.A O PHE 300.A H 2.830 2.021 PHE 301.A N GLU 308.A O PHE 301.A H 2.831 2.068 MET 302.A N HIS 223.A O MET 302.A H 3.278 2.451 GLY 306.A N THR 303.A O GLY 306.A H 3.145 2.431 MET 307.A N LYS 267.A O MET 307.A H 3.281 2.460 GLU 308.A N PHE 301.A O GLU 308.A H 3.364 2.597 THR 310.A N SER 299.A O THR 310.A H 3.198 2.354 THR 310.A OG1 PRO 311.A O THR 310.A HG1 3.242 2.467 TRP 312.A N ASN 188.A O TRP 312.A H 2.648 1.816 TRP 312.A NE1 ASP 277.A OD2 TRP 312.A HE1 2.613 1.766 TYR 313.A OH LYS 296.A O TYR 313.A HH 2.946 2.249 SER 317.A N ASN 174.A OD1 SER 317.A H 3.182 2.340 SER 317.A OG THR 288.A O SER 317.A HG 2.390 1.821 SER 317.A OG GLY 289.A O SER 317.A HG 3.300 2.699 VAL 318.A N GLY 289.A O VAL 318.A H 2.822 2.209 ASP 319.A N GLY 289.A O ASP 319.A H 3.112 2.300 TYR 321.A N VAL 318.A O TYR 321.A H 2.890 2.149 GLN 326.A NE2 TYR 321.A O GLN 326.A HE21 2.454 1.892 LEU 328.A N PHE 336.A O LEU 328.A H 2.709 1.923 ALA 329.A N ALA 291.A O ALA 329.A H 3.201 2.502 ALA 331.A N GLU 240.A OE1 ALA 331.A H 2.767 1.935 ILE 332.A N GLU 335.A O ILE 332.A H 3.237 2.389 GLU 335.A N ILE 332.A O GLU 335.A H 3.123 2.390 ASP 337.A N GLU 335.A OE2 ASP 337.A H 3.354 2.533 ASN 339.A N ASP 337.A OD1 ASN 339.A H 2.816 2.189 SER 340.A N ASP 337.A O SER 340.A H 3.074 2.275 TYR 342.A N GLN 345.A OE1 TYR 342.A H 3.082 2.312 GLN 345.A N GLN 345.A OE1 GLN 345.A H 2.638 1.895 LEU 346.A N TYR 342.A O LEU 346.A H 3.252 2.419 ALA 347.A N ALA 343.A O ALA 347.A H 3.043 2.245 ALA 348.A N TYR 344.A O ALA 348.A H 2.928 2.075 PHE 349.A N GLN 345.A O PHE 349.A H 2.948 2.252 MET 350.A N LEU 346.A O MET 350.A H 2.986 2.142 ASP 351.A N ALA 347.A O ASP 351.A H 2.929 2.085 GLY 352.A N ALA 348.A O GLY 352.A H 2.781 2.084 LEU 353.A N PHE 349.A O LEU 353.A H 2.876 2.147 GLY 354.A N ASP 351.A O GLY 354.A H 3.032 2.261 LEU 355.A N MET 350.A O LEU 355.A H 2.901 2.045 ARG 357.A NE ASP 351.A OD1 ARG 357.A HE 2.936 2.077 ARG 357.A NH1 VAL 414.A O ARG 357.A HH11 3.348 2.708 ARG 357.A NH1 VAL 417.A O ARG 357.A HH12 2.660 1.825 ARG 357.A NH2 ASP 351.A OD2 ARG 357.A HH21 2.701 1.851 ARG 357.A NH2 VAL 417.A O ARG 357.A HH22 3.494 2.907 LEU 359.A N PRO 356.A O LEU 359.A H 3.253 2.433 LEU 360.A N ARG 357.A O LEU 360.A H 2.865 2.232 ILE 361.A N ARG 357.A O ILE 361.A H 3.298 2.482 ASN 363.A N LEU 359.A O ASN 363.A H 3.400 2.545 ASN 363.A ND2 GLN 276.A OE1 ASN 363.A HD21 2.567 1.888 ASN 363.A ND2 LEU 359.A O ASN 363.A HD22 3.435 2.605 LEU 364.A N LEU 360.A O LEU 364.A H 2.721 1.878 THR 365.A N ILE 361.A O THR 365.A H 2.672 1.830 THR 365.A OG1 ILE 361.A O THR 365.A HG1 2.575 1.851 ARG 366.A N SER 362.A O ARG 366.A H 3.039 2.205 ARG 366.A NH2 ASN 363.A OD1 ARG 366.A HH21 3.188 2.390 ILE 367.A N ASN 363.A O ILE 367.A H 3.135 2.299 ALA 368.A N LEU 364.A O ALA 368.A H 3.221 2.379 ARG 369.A N THR 365.A O ARG 369.A H 3.286 2.498 ARG 370.A N ARG 366.A O ARG 370.A H 3.108 2.333 ALA 374.A N ARG 370.A O ALA 374.A H 3.128 2.489 ALA 374.A N ILE 371.A O ALA 374.A H 2.578 1.977 ILE 375.A N ILE 371.A O ILE 375.A H 2.704 1.951 VAL 378.A N ALA 374.A O VAL 378.A H 3.320 2.519 ILE 379.A N ILE 375.A O ILE 379.A H 3.167 2.344 LEU 380.A N GLU 377.A O LEU 380.A H 3.366 2.606 MET 381.A N VAL 378.A O MET 381.A H 2.905 2.120 LEU 382.A N ILE 379.A O LEU 382.A H 3.449 2.612 GLU 387.A N GLU 387.A OE1 GLU 387.A H 2.766 2.001 GLU 389.A N ASP 386.A OD2 GLU 389.A H 2.892 2.075 ALA 390.A N ASP 386.A O ALA 390.A H 3.148 2.325 SER 391.A N GLU 387.A O SER 391.A H 3.016 2.220 PHE 392.A N ASP 388.A O PHE 392.A H 2.726 1.964 VAL 393.A N GLU 389.A O VAL 393.A H 2.838 1.989 ALA 394.A N ALA 390.A O ALA 394.A H 2.763 2.016 HIS 395.A N SER 391.A O HIS 395.A H 2.848 2.033 TYR 396.A N PHE 392.A O TYR 396.A H 2.637 1.821 LYS 397.A N VAL 393.A O LYS 397.A H 2.728 1.881 THR 398.A N ALA 394.A O THR 398.A H 3.188 2.340 GLN 399.A N HIS 395.A O GLN 399.A H 3.322 2.467 LEU 400.A N TYR 396.A O LEU 400.A H 3.071 2.316 LEU 401.A N LYS 397.A O LEU 401.A H 3.068 2.248 ALA 402.A N THR 398.A O ALA 402.A H 3.046 2.354 ARG 403.A N GLN 399.A O ARG 403.A H 2.887 2.125 ARG 403.A N LEU 400.A O ARG 403.A H 3.129 2.536 ARG 403.A NE ASP 319.A OD2 ARG 403.A HE 3.269 2.442 ARG 403.A NH1 LEU 287.A O ARG 403.A HH11 2.864 2.152 CYS 404.A N LEU 400.A O CYS 404.A H 3.173 2.334 CYS 404.A SG LEU 400.A O CYS 404.A HG 3.599 2.606 GLU 405.A N LEU 401.A O GLU 405.A H 2.757 1.901 ARG 406.A N ALA 402.A O ARG 406.A H 2.804 2.064 ARG 406.A NH1 ILE 341.A O ARG 406.A HH12 3.444 2.683 ARG 406.A NH2 ILE 341.A O ARG 406.A HH22 3.378 2.597 TYR 407.A N ARG 403.A O TYR 407.A H 2.897 2.047 LEU 408.A N CYS 404.A O LEU 408.A H 2.746 1.911 GLY 409.A N ARG 406.A O GLY 409.A H 3.267 2.468 GLU 413.A N PHE 410.A O GLU 413.A H 3.108 2.323 VAL 414.A N VAL 411.A O VAL 414.A H 3.071 2.259 ASP 416.A N GLU 413.A O ASP 416.A H 3.024 2.293