Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4puv_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 8.A N LEU 38.A O TYR 8.A H 3.110 2.332 TYR 8.A OH VAL 55.A O TYR 8.A HH 2.613 1.802 LYS 10.A N VAL 36.A O LYS 10.A H 3.029 2.296 LYS 10.A NZ THR 57.A OG1 LYS 10.A HZ2 3.041 2.154 ASN 12.A N ASP 11.A OD1 ASN 12.A H 2.801 2.146 VAL 13.A N VAL 34.A O VAL 13.A H 2.975 2.142 ARG 14.A NH2 GLU 31.A OE2 ARG 14.A HH22 2.950 2.136 VAL 15.A N MET 32.A O VAL 15.A H 2.920 2.073 LYS 17.A N TYR 30.A O LYS 17.A H 2.829 1.986 LYS 17.A NZ ALA 68.A O LYS 17.A HZ3 2.749 1.912 HIS 19.A N THR 28.A O HIS 19.A H 2.886 2.028 ASP 21.A N VAL 26.A O ASP 21.A H 2.888 2.045 LYS 23.A N ASP 21.A OD2 LYS 23.A H 2.832 2.117 THR 24.A N ASP 21.A OD2 THR 24.A H 2.988 2.204 GLY 25.A N ASP 21.A O GLY 25.A H 2.680 1.944 GLN 27.A N PRO 117.A O GLN 27.A H 2.747 1.902 THR 28.A N HIS 19.A O THR 28.A H 2.846 2.037 TYR 30.A N LYS 17.A O TYR 30.A H 2.843 2.050 MET 32.A N VAL 15.A O no hydrogen 2.845 N/A THR 33.A N VAL 102.A O THR 33.A H 2.874 2.056 THR 33.A OG1 HIS 104.A NE2 THR 33.A HG1 2.714 1.987 VAL 34.A N VAL 13.A O VAL 34.A H 2.810 1.998 CYS 35.A N ASN 100.A O no hydrogen 2.882 N/A CYS 35.A SG LYS 10.A O no hydrogen 3.715 N/A VAL 36.A N LYS 10.A O VAL 36.A H 2.989 2.170 LEU 37.A N HIS 98.A O LEU 37.A H 2.920 2.068 LEU 38.A N TYR 8.A O LEU 38.A H 2.750 1.893 GLU 39.A N ALA 96.A O GLU 39.A H 2.965 2.112 GLU 41.A N HIS 93.A O GLU 41.A H 2.789 1.947 ILE 42.A N GLY 40.A O ILE 42.A H 2.834 2.122 SER 45.A N ILE 42.A O SER 45.A H 2.886 2.102 SER 45.A OG ILE 42.A O SER 45.A HG 2.736 1.917 TYR 46.A N GLU 43.A O TYR 46.A H 2.942 2.237 THR 47.A N GLU 43.A O THR 47.A H 3.098 2.315 LYS 48.A N THR 44.A O LYS 48.A H 2.905 2.149 ASP 50.A N THR 44.A O ASP 50.A H 3.198 2.365 SER 52.A N ASP 50.A OD1 SER 52.A H 3.114 2.423 SER 52.A OG ASP 50.A OD1 SER 52.A HG 2.566 1.799 ILE 54.A N ASN 51.A O ILE 54.A H 2.929 2.099 ILE 60.A N ALA 56.A O ILE 60.A H 2.985 2.169 LYS 61.A N THR 57.A O LYS 61.A H 2.995 2.168 ASN 62.A N ASP 58.A O ASN 62.A H 3.054 2.227 THR 63.A N SER 59.A O THR 63.A H 2.872 2.058 THR 63.A OG1 SER 59.A O THR 63.A HG1 2.786 2.012 ILE 64.A N ILE 60.A O ILE 64.A H 2.979 2.176 TYR 65.A N LYS 61.A O TYR 65.A H 3.232 2.392 TYR 65.A OH ARG 14.A O TYR 65.A HH 2.911 2.111 ILE 66.A N ASN 62.A O ILE 66.A H 2.934 2.088 THR 67.A N THR 63.A O THR 67.A H 2.920 2.102 THR 67.A OG1 THR 63.A O THR 67.A HG1 2.730 1.993 ALA 68.A N ILE 64.A O ALA 68.A H 3.027 2.198 LYS 69.A N TYR 65.A O LYS 69.A H 2.963 2.218 GLN 70.A N ILE 66.A O GLN 70.A H 3.083 2.366 ASN 71.A ND2 THR 67.A O ASN 71.A HD21 2.981 2.150 GLU 77.A N GLU 77.A OE1 GLU 77.A H 2.800 2.019 LEU 78.A N PRO 75.A O LEU 78.A H 2.993 2.329 PHE 79.A N PRO 75.A O PHE 79.A H 3.183 2.330 GLY 80.A N PRO 76.A O GLY 80.A H 2.847 2.000 SER 81.A N GLU 77.A O SER 81.A H 3.170 2.406 SER 81.A OG GLU 77.A O SER 81.A HG 2.868 2.151 ILE 82.A N LEU 78.A O ILE 82.A H 2.852 2.005 LEU 83.A N PHE 79.A O LEU 83.A H 2.909 2.062 GLY 84.A N GLY 80.A O GLY 84.A H 2.895 2.062 THR 85.A N SER 81.A O THR 85.A H 2.900 2.082 HIS 86.A N ILE 82.A O HIS 86.A H 2.997 2.197 ILE 88.A N GLY 84.A O ILE 88.A H 3.351 2.515 GLU 89.A N THR 85.A O GLU 89.A H 2.975 2.155 LYS 90.A N HIS 86.A O LYS 90.A H 2.847 2.038 TYR 91.A N PHE 87.A O TYR 91.A H 3.246 2.448 HIS 93.A NE2 VAL 53.A O no hydrogen 2.659 N/A ILE 94.A N TYR 91.A O ILE 94.A H 3.173 2.365 HIS 95.A N GLU 39.A O HIS 95.A H 2.891 2.089 HIS 95.A NE2 GLU 41.A OE2 no hydrogen 2.611 N/A ALA 96.A N GLU 39.A O ALA 96.A H 3.186 2.376 ALA 97.A N VAL 134.A O ALA 97.A H 2.789 1.957 HIS 98.A N LEU 37.A O HIS 98.A H 2.753 1.925 HIS 98.A ND1 ASP 133.A OD1 HIS 98.A HD1 2.646 1.799 HIS 98.A NE2 GLU 39.A OE2 no hydrogen 2.597 N/A VAL 99.A N VAL 132.A O VAL 99.A H 2.814 1.963 ASN 100.A N CYS 35.A O ASN 100.A H 2.851 2.014 ASN 100.A ND2 GLN 131.A OE1 ASN 100.A HD21 2.868 2.075 ILE 101.A N VAL 130.A O ILE 101.A H 2.933 2.084 VAL 102.A N THR 33.A O VAL 102.A H 2.943 2.087 CYS 103.A N ARG 128.A O no hydrogen 2.755 N/A HIS 104.A N GLU 31.A O HIS 104.A H 2.901 2.050 ARG 105.A NE ASP 123.A O ARG 105.A HE 3.108 2.494 ARG 105.A NE ASP 123.A OD1 ARG 105.A HE 3.078 2.277 ARG 105.A NH2 ASP 123.A OD1 ARG 105.A HH22 3.551 2.885 ARG 105.A NH2 ASP 123.A OD2 ARG 105.A HH22 2.864 2.006 TRP 106.A NE1 GLU 31.A OE1 TRP 106.A HE1 2.857 2.023 THR 107.A N ILE 121.A O THR 107.A H 2.906 2.073 ARG 108.A NH1 GLN 27.A O ARG 108.A HH12 3.044 2.317 ARG 108.A NH1 HIS 116.A O ARG 108.A HH11 2.847 1.997 ARG 108.A NH2 GLN 27.A O ARG 108.A HH21 2.817 2.014 MET 109.A N SER 119.A O no hydrogen 2.941 N/A ILE 111.A N LYS 114.A O ILE 111.A H 2.893 2.051 LYS 114.A N ILE 111.A O LYS 114.A H 3.084 2.268 HIS 116.A N MET 109.A O HIS 116.A H 2.827 1.977 ILE 121.A N THR 107.A O ILE 121.A H 2.816 1.981 ARG 122.A NE ARG 105.A O ARG 122.A HE 2.835 2.002 ARG 122.A NH1 ARG 105.A O ARG 122.A HH12 3.463 2.801 GLU 126.A N SER 124.A OG GLU 126.A H 3.243 2.421 LYS 127.A N SER 147.A O LYS 127.A H 2.840 1.988 LYS 127.A NZ GLU 125.A OE2 LYS 127.A HZ1 2.848 2.044 ARG 128.A N CYS 103.A O ARG 128.A H 3.381 2.539 ARG 128.A NH1 ASP 205.A OD1 ARG 128.A HH11 2.839 2.063 ARG 128.A NH2 GLU 77.A OE1 ARG 128.A HH21 2.967 2.259 ARG 128.A NH2 ASP 205.A OD1 ARG 128.A HH22 3.070 2.376 ASN 129.A N SER 145.A O ASN 129.A H 2.877 2.022 ASN 129.A ND2 SER 145.A OG ASN 129.A HD21 3.067 2.242 ASN 129.A ND2 SER 147.A OG ASN 129.A HD22 2.975 2.143 VAL 130.A N ILE 101.A O VAL 130.A H 2.960 2.132 GLN 131.A N LYS 143.A O GLN 131.A H 2.835 1.983 GLN 131.A NE2 ASP 133.A OD1 GLN 131.A HE21 3.242 2.397 VAL 132.A N VAL 99.A O VAL 132.A H 2.808 1.955 ASP 133.A N ASP 141.A O ASP 133.A H 2.807 1.949 VAL 134.A N ALA 97.A O VAL 134.A H 2.844 1.993 VAL 135.A N GLY 139.A O VAL 135.A H 3.024 2.166 GLU 136.A N HIS 95.A O GLU 136.A H 2.774 1.920 LYS 138.A N VAL 135.A O LYS 138.A H 2.789 1.989 ILE 140.A N PHE 191.A O ILE 140.A H 2.838 2.019 ASP 141.A N ASP 133.A O ASP 141.A H 2.873 2.017 LYS 143.A N GLN 131.A O LYS 143.A H 2.897 2.040 LYS 143.A NZ GLU 249.A OE2 LYS 143.A HZ1 2.747 1.932 SER 144.A N TRP 186.A O SER 144.A H 2.953 2.103 SER 145.A N ASN 129.A O SER 145.A H 2.935 2.128 LEU 146.A N ALA 184.A O LEU 146.A H 2.937 2.132 SER 147.A N LYS 127.A O SER 147.A H 3.078 2.255 VAL 151.A N THR 180.A O VAL 151.A H 2.956 2.103 LYS 153.A N LEU 178.A O LYS 153.A H 2.847 1.998 LYS 153.A NZ ASN 156.A O LYS 153.A HZ2 3.065 2.329 LYS 153.A NZ PHE 219.A O LYS 153.A HZ3 2.969 2.115 THR 155.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 155.A HG1 2.616 1.803 THR 155.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 155.A HG1 3.456 2.821 GLN 158.A N SER 224.A O GLN 158.A H 2.831 2.038 GLN 158.A NE2 ASN 223.A OD1 GLN 158.A HE21 3.024 2.190 PHE 159.A N THR 173.A O PHE 159.A H 2.880 2.032 TRP 160.A NE1 GLN 158.A OE1 TRP 160.A HE1 2.901 2.085 GLY 161.A N GLU 172.A OE2 GLY 161.A H 2.808 1.980 ARG 164.A NH1 LEU 170.A O ARG 164.A HH11 3.017 2.296 ARG 164.A NH2 LEU 170.A O ARG 164.A HH22 2.985 2.248 GLU 166.A N GLU 166.A OE1 GLU 166.A H 2.708 1.908 TYR 167.A N ASP 165.A OD1 TYR 167.A H 2.915 2.093 THR 168.A N ASP 165.A O THR 168.A H 3.094 2.276 THR 168.A OG1 ASP 165.A O THR 168.A HG1 3.463 2.915 THR 168.A OG1 ASP 165.A OD1 THR 168.A HG1 3.331 2.571 THR 173.A N PHE 159.A O THR 173.A H 3.020 2.165 ASP 175.A N THR 173.A OG1 ASP 175.A H 3.110 2.257 ARG 176.A N SER 157.A O ARG 176.A H 2.902 2.145 ARG 176.A NE SER 157.A OG ARG 176.A HE 2.982 2.142 LEU 178.A N LYS 153.A O LEU 178.A H 3.048 2.219 SER 179.A OG VAL 151.A O SER 179.A HG 2.776 2.032 THR 180.A N VAL 151.A O THR 180.A H 3.090 2.289 THR 180.A OG1 PRO 253.A O THR 180.A HG1 2.637 1.938 VAL 182.A N LEU 149.A O VAL 182.A H 2.737 1.887 ALA 184.A N LEU 146.A O ALA 184.A H 2.958 2.115 THR 185.A N GLU 249.A O THR 185.A H 2.881 2.044 TRP 186.A N SER 144.A O TRP 186.A H 2.810 1.981 GLN 187.A N THR 247.A O GLN 187.A H 2.923 2.064 TRP 188.A N ILE 142.A O TRP 188.A H 3.059 2.225 LYS 189.A N LEU 244.A O LYS 189.A H 2.855 1.996 LYS 189.A NZ ASN 190.A O LYS 189.A HZ3 2.989 2.121 LYS 189.A NZ GLU 196.A OE2 LYS 189.A HZ1 2.650 1.765 ASN 190.A ND2 LYS 138.A O ASN 190.A HD22 2.994 2.206 ASN 190.A ND2 ASP 141.A OD1 ASN 190.A HD21 3.026 2.175 ASN 190.A ND2 ASP 141.A OD2 ASN 190.A HD21 3.548 2.852 PHE 191.A N ILE 140.A O PHE 191.A H 3.068 2.218 SER 192.A N GLU 196.A OE1 SER 192.A H 2.586 1.768 VAL 197.A N GLY 193.A O VAL 197.A H 3.152 2.318 ARG 198.A N LEU 194.A O ARG 198.A H 2.864 2.011 SER 199.A N GLN 195.A O SER 199.A H 2.948 2.208 SER 199.A OG GLU 196.A O SER 199.A HG 2.694 1.890 HIS 200.A N VAL 197.A O HIS 200.A H 3.030 2.235 VAL 201.A N ARG 198.A O VAL 201.A H 3.270 2.419 LYS 203.A N HIS 200.A O LYS 203.A H 2.820 2.090 PHE 204.A N VAL 201.A O PHE 204.A H 3.106 2.300 ALA 206.A N PRO 202.A O ALA 206.A H 3.368 2.545 THR 207.A N LYS 203.A O THR 207.A H 2.921 2.143 THR 207.A OG1 LYS 203.A O THR 207.A HG1 2.724 2.029 TRP 208.A N PHE 204.A O TRP 208.A H 3.092 2.256 ALA 209.A N ASP 205.A O ALA 209.A H 3.007 2.161 THR 210.A N ALA 206.A O THR 210.A H 2.914 2.117 THR 210.A OG1 ALA 206.A O THR 210.A HG1 3.091 2.333 ALA 211.A N THR 207.A O ALA 211.A H 2.919 2.074 ARG 212.A N TRP 208.A O ARG 212.A H 2.998 2.150 ARG 212.A NE GLU 126.A OE1 ARG 212.A HE 3.263 2.578 ARG 212.A NE GLU 126.A OE2 ARG 212.A HE 2.836 1.998 ARG 212.A NH2 GLU 126.A OE1 ARG 212.A HH21 2.757 1.932 GLU 213.A N ALA 209.A O GLU 213.A H 2.873 2.032 VAL 214.A N THR 210.A O VAL 214.A H 2.803 1.963 THR 215.A N ALA 211.A O THR 215.A H 2.881 2.057 THR 215.A OG1 ALA 211.A O THR 215.A HG1 2.728 1.991 LEU 216.A N ARG 212.A O LEU 216.A H 3.033 2.207 LYS 217.A N GLU 213.A O LYS 217.A H 2.945 2.107 LYS 217.A NZ GLU 221.A OE2 LYS 217.A HZ3 2.493 1.690 THR 218.A N VAL 214.A O THR 218.A H 2.952 2.117 THR 218.A OG1 VAL 214.A O THR 218.A HG1 2.799 2.113 PHE 219.A N THR 215.A O PHE 219.A H 2.969 2.144 ALA 220.A N LEU 216.A O ALA 220.A H 2.949 2.131 GLU 221.A N LYS 217.A O GLU 221.A H 2.915 2.195 ASP 222.A N THR 218.A O ASP 222.A H 2.935 2.117 SER 224.A N ASN 156.A O SER 224.A H 3.115 2.291 SER 224.A OG SER 226.A O SER 224.A HG 2.962 2.398 SER 224.A OG THR 230.A OG1 SER 224.A HG 2.930 2.289 GLN 228.A N GLN 228.A OE1 GLN 228.A H 2.792 1.998 THR 230.A N SER 226.A O THR 230.A H 3.185 2.360 THR 230.A OG1 SER 226.A O THR 230.A HG1 3.215 2.544 MET 231.A N VAL 227.A O no hydrogen 2.917 N/A TYR 232.A N GLN 228.A O TYR 232.A H 3.227 2.422 LYS 233.A N ALA 229.A O LYS 233.A H 3.328 2.511 LYS 233.A NZ ASP 222.A OD1 LYS 233.A HZ3 2.765 1.893 MET 234.A N THR 230.A O no hydrogen 3.201 N/A ALA 235.A N MET 231.A O ALA 235.A H 3.045 2.200 GLU 236.A N TYR 232.A O GLU 236.A H 2.844 2.003 GLN 237.A N LYS 233.A O GLN 237.A H 3.255 2.448 GLN 237.A NE2 THR 218.A OG1 GLN 237.A HE22 2.833 2.041 GLN 237.A NE2 LYS 233.A O GLN 237.A HE21 2.917 2.139 ILE 238.A N MET 234.A O ILE 238.A H 3.111 2.280 LEU 239.A N ALA 235.A O LEU 239.A H 3.102 2.248 ALA 240.A N GLU 236.A O ALA 240.A H 3.035 2.284 ARG 241.A N GLN 237.A O ARG 241.A H 3.070 2.412 ARG 241.A N ILE 238.A O ARG 241.A H 3.163 2.460 ARG 241.A NH1 GLU 213.A OE1 ARG 241.A HH11 2.889 2.278 GLN 242.A N ILE 238.A O GLN 242.A H 3.211 2.535 GLN 242.A NE2 THR 207.A OG1 GLN 242.A HE21 3.291 2.544 LEU 244.A N GLN 242.A OE1 LEU 244.A H 3.060 2.215 ILE 245.A N GLN 242.A O ILE 245.A H 3.234 2.415 GLU 246.A N GLN 187.A O GLU 246.A H 2.824 2.008 VAL 248.A N VAL 292.A O VAL 248.A H 2.930 2.093 GLU 249.A N THR 185.A O GLU 249.A H 2.771 1.922 TYR 250.A N CYS 290.A O TYR 250.A H 2.966 2.160 TYR 250.A OH THR 215.A OG1 TYR 250.A HH 2.771 2.005 SER 251.A N ASP 183.A O SER 251.A H 2.924 2.085 LEU 252.A N ILE 288.A O LEU 252.A H 2.839 2.012 ASN 254.A N GLY 286.A O ASN 254.A H 2.748 1.924 LYS 255.A N SER 179.A O LYS 255.A H 3.006 2.164 LYS 255.A NZ ASP 181.A OD1 LYS 255.A HZ3 2.860 2.019 LYS 255.A NZ ASP 181.A OD2 LYS 255.A HZ3 3.384 2.629 PHE 258.A N ALA 279.A O PHE 258.A H 2.948 2.100 SER 263.A N ASP 261.A OD1 SER 263.A H 2.869 2.041 SER 263.A OG ASP 261.A OD1 SER 263.A HG 2.759 1.983 HIS 265.A N LEU 262.A O HIS 265.A H 2.917 2.091 LEU 268.A N HIS 265.A O LEU 268.A H 2.925 2.123 GLN 269.A NE2 GLY 267.A O GLN 269.A HE21 3.248 2.553 ASN 270.A ND2 ILE 260.A O ASN 270.A HD21 2.849 2.056 ASN 270.A ND2 VAL 277.A O ASN 270.A HD22 2.902 2.095 GLY 272.A N GLU 259.A OE1 GLY 272.A H 2.985 2.146 ASN 274.A N THR 271.A O ASN 274.A H 2.898 2.143 ALA 275.A N GLY 272.A O ALA 275.A H 2.965 2.132 GLU 276.A N ASN 270.A OD1 GLU 276.A H 2.941 2.103 VAL 277.A N ASN 270.A OD1 VAL 277.A H 3.064 2.208 ALA 279.A N PHE 258.A O ALA 279.A H 2.871 2.019 GLN 281.A N HIS 256.A O GLN 281.A H 2.862 2.017 GLN 281.A NE2 ALA 279.A O GLN 281.A HE21 2.863 2.010 ASN 285.A ND2 GLY 286.A O ASN 285.A HD21 2.998 2.191 GLY 286.A N HIS 256.A NE2 GLY 286.A H 3.314 2.560 ILE 288.A N LEU 252.A O ILE 288.A H 2.953 2.138 LYS 289.A NZ SER 251.A OG LYS 289.A HZ2 3.092 2.210 CYS 290.A N TYR 250.A O no hydrogen 3.117 N/A VAL 292.A N VAL 248.A O VAL 292.A H 2.837 1.981 ARG 294.A NE ILE 245.A O ARG 294.A HE 2.954 2.259 ARG 294.A NH1 LEU 239.A O ARG 294.A HH11 3.276 2.571 ARG 294.A NH2 LEU 239.A O ARG 294.A HH21 2.933 2.123 ARG 294.A NH2 ILE 245.A O ARG 294.A HH22 2.832 2.097 SER 295.A OG SER 295.A O no hydrogen 2.598 N/A