Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4qpm_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 4.A N ASN 2.A OD1 TRP 4.A H 3.379 2.527 TRP 4.A NE1 GLN 196.A O TRP 4.A HE1 3.069 2.272 ASP 5.A N ASN 2.A O ASP 5.A H 2.912 2.061 LYS 7.A N ASP 5.A OD1 LYS 7.A H 3.352 2.565 LEU 8.A N ASP 5.A OD2 LEU 8.A H 3.084 2.316 ILE 9.A N ASP 5.A O ILE 9.A H 2.929 2.079 PHE 10.A N ASP 6.A O PHE 10.A H 2.873 2.080 LYS 11.A N LYS 7.A O LYS 11.A H 2.786 1.980 LEU 12.A N LEU 8.A O LEU 12.A H 2.780 1.969 LEU 13.A N ILE 9.A O LEU 13.A H 2.951 2.094 SER 14.A N PHE 10.A O SER 14.A H 2.929 2.205 SER 14.A OG PHE 10.A O SER 14.A HG 2.639 1.905 GLY 15.A N LYS 11.A O GLY 15.A H 3.137 2.455 GLY 15.A N LEU 12.A O GLY 15.A H 3.221 2.525 SER 22.A N PRO 19.A O SER 22.A H 2.781 1.944 SER 22.A OG PRO 19.A O SER 22.A HG 2.610 1.779 TYR 23.A N VAL 20.A O TYR 23.A H 3.086 2.263 ASN 25.A ND2 TYR 107.A O ASN 25.A HD22 3.084 2.243 THR 26.A N TYR 23.A O THR 26.A H 3.310 2.462 THR 26.A OG1 VAL 20.A O THR 26.A HG1 2.663 1.909 PHE 27.A N ALA 109.A O PHE 27.A H 2.872 2.101 TRP 29.A N LEU 111.A O TRP 29.A H 2.883 2.046 TRP 29.A NE1 HIS 110.A ND1 TRP 29.A HE1 3.172 2.341 LEU 33.A N ASN 114.A OD1 LEU 33.A H 2.553 1.819 LYS 39.A N VAL 51.A O LYS 39.A H 2.684 2.080 LYS 39.A N HIS 52.A O LYS 39.A H 2.806 2.125 THR 40.A N VAL 51.A O THR 40.A H 3.268 2.598 THR 40.A OG1 LYS 37.A O THR 40.A HG1 2.546 1.857 PHE 42.A N VAL 49.A O PHE 42.A H 2.965 2.157 GLN 43.A NE2 GLY 45.A O GLN 43.A HE21 2.909 2.105 LEU 44.A N LYS 47.A O LEU 44.A H 2.940 2.096 VAL 49.A N PHE 42.A O VAL 49.A H 3.138 2.280 TYR 50.A N THR 67.A O TYR 50.A H 3.018 2.178 VAL 51.A N THR 40.A O VAL 51.A H 3.002 2.146 HIS 52.A N GLU 65.A O HIS 52.A H 2.847 2.048 LEU 55.A N VAL 63.A O LEU 55.A H 2.852 2.040 GLY 56.A N VAL 63.A O GLY 56.A H 3.398 2.613 GLY 58.A N ALA 61.A O GLY 58.A H 2.971 2.152 GLN 62.A N VAL 76.A O GLN 62.A H 2.938 2.160 GLN 62.A NE2 GLU 57.A OE1 GLN 62.A HE21 3.030 2.185 VAL 63.A N GLY 56.A O VAL 63.A H 3.089 2.254 TYR 64.A N LEU 74.A O TYR 64.A H 3.033 2.208 GLU 65.A N HIS 53.A O GLU 65.A H 3.083 2.257 ALA 66.A N PHE 72.A O ALA 66.A H 2.763 1.984 THR 67.A N TYR 50.A O THR 67.A H 3.135 2.348 THR 67.A OG1 HIS 52.A NE2 THR 67.A HG1 3.008 2.468 PHE 72.A N ALA 66.A O PHE 72.A H 2.879 2.038 VAL 73.A N GLY 120.A O VAL 73.A H 3.057 2.205 LEU 74.A N TYR 64.A O LEU 74.A H 2.869 2.065 LYS 75.A N LEU 118.A O LYS 75.A H 2.880 2.048 LYS 75.A NZ GLU 84.A OE1 LYS 75.A HZ3 2.914 2.053 LYS 75.A NZ GLU 84.A OE2 LYS 75.A HZ3 2.915 2.214 VAL 76.A N GLN 62.A O VAL 76.A H 2.756 1.900 GLN 77.A N SER 116.A O GLN 77.A H 3.267 2.506 ASN 81.A N SER 116.A OG ASN 81.A H 2.975 2.175 ASN 81.A ND2 GLN 77.A OE1 ASN 81.A HD22 3.334 2.617 TRP 83.A NE1 SER 197.A O TRP 83.A HE1 2.883 2.068 TYR 86.A N PRO 82.A O TYR 86.A H 2.841 2.051 TYR 86.A OH ASP 199.A OD2 TYR 86.A HH 2.449 1.791 ILE 87.A N TRP 83.A O ILE 87.A H 2.924 2.080 GLY 88.A N GLU 84.A O GLY 88.A H 2.949 2.095 THR 89.A N PHE 85.A O THR 89.A H 2.954 2.174 THR 89.A OG1 PHE 85.A O THR 89.A HG1 2.585 1.789 GLN 90.A N TYR 86.A O GLN 90.A H 2.869 2.041 LEU 91.A N ILE 87.A O LEU 91.A H 2.751 1.923 MET 92.A N GLY 88.A O MET 92.A H 3.234 2.389 GLU 93.A N THR 89.A O GLU 93.A H 3.119 2.402 GLU 93.A N GLN 90.A O GLU 93.A H 3.127 2.541 ARG 94.A N GLN 90.A O ARG 94.A H 2.875 2.119 ARG 94.A NH1 GLN 90.A OE1 ARG 94.A HH11 3.522 2.815 ARG 94.A NH1 ASP 199.A OD1 ARG 94.A HH12 3.246 2.583 ARG 94.A NH1 ASP 199.A OD2 ARG 94.A HH12 2.886 2.084 ARG 94.A NH2 CYS 165.A O ARG 94.A HH21 2.910 2.119 ARG 94.A NH2 ASP 199.A OD1 ARG 94.A HH22 2.706 1.863 LEU 95.A N LEU 91.A O LEU 95.A H 2.864 2.088 MET 99.A N LYS 96.A O MET 99.A H 2.800 1.946 MET 102.A N MET 99.A O MET 102.A H 3.262 2.414 PHE 103.A N GLN 100.A O PHE 103.A H 3.124 2.308 LYS 105.A NZ GLN 100.A OE1 LYS 105.A HZ1 2.746 2.188 TYR 107.A N VAL 119.A O TYR 107.A H 2.602 1.928 SER 108.A N VAL 119.A O SER 108.A H 3.287 2.474 ALA 109.A N ASN 25.A O ALA 109.A H 3.059 2.253 HIS 110.A N VAL 117.A O HIS 110.A H 2.782 1.925 LEU 111.A N PHE 27.A O LEU 111.A H 2.772 1.967 PHE 112.A N GLY 115.A O PHE 112.A H 2.728 1.906 GLN 113.A N CYS 31.A O GLN 113.A H 3.201 2.348 SER 116.A N GLN 77.A O SER 116.A H 3.087 2.328 VAL 117.A N HIS 110.A O VAL 117.A H 2.777 1.966 LEU 118.A N LYS 75.A O LEU 118.A H 2.999 2.179 VAL 119.A N SER 108.A O VAL 119.A H 2.848 2.034 GLY 120.A N VAL 73.A O GLY 120.A H 3.054 2.243 GLU 121.A N LYS 105.A O GLU 121.A H 3.002 2.262 TYR 123.A OH PHE 103.A O TYR 123.A HH 2.974 2.283 TYR 125.A N LEU 179.A O TYR 125.A H 2.838 2.053 LEU 128.A N PHE 177.A O LEU 128.A H 3.013 2.282 ASN 130.A N THR 127.A OG1 ASN 130.A H 2.922 2.101 ALA 131.A N THR 127.A O ALA 131.A H 3.163 2.363 ILE 132.A N LEU 128.A O ILE 132.A H 2.879 2.062 ASN 133.A N LEU 129.A O ASN 133.A H 2.943 2.164 LEU 134.A N ASN 130.A O LEU 134.A H 2.819 2.064 TYR 135.A N ALA 131.A O TYR 135.A H 3.313 2.592 TYR 135.A N ILE 132.A O TYR 135.A H 3.206 2.557 LYS 136.A N ILE 132.A O LYS 136.A H 3.336 2.579 LYS 136.A NZ GLY 247.A O LYS 136.A HZ1 2.831 1.943 THR 138.A N TYR 135.A O THR 138.A H 3.007 2.200 THR 138.A OG1 TYR 135.A O THR 138.A HG1 2.652 1.876 LYS 141.A N THR 138.A O LYS 141.A H 3.019 2.283 LYS 141.A NZ LYS 136.A O LYS 141.A HZ2 2.792 1.918 VAL 142.A N GLU 140.A O VAL 142.A H 2.484 1.706 LEU 147.A N PRO 144.A O LEU 147.A H 3.027 2.365 VAL 148.A N PRO 144.A O VAL 148.A H 3.110 2.273 ILE 149.A N GLN 145.A O ILE 149.A H 2.909 2.050 SER 150.A N GLY 146.A O SER 150.A H 3.256 2.480 PHE 151.A N LEU 147.A O PHE 151.A H 2.759 1.911 ALA 152.A N VAL 148.A O ALA 152.A H 2.863 2.059 MET 153.A N ILE 149.A O MET 153.A H 2.898 2.073 ARG 154.A N SER 150.A O ARG 154.A H 3.215 2.388 ARG 154.A NE SER 186.A O ARG 154.A HE 2.962 2.396 ARG 154.A NE SER 186.A OG ARG 154.A HE 3.284 2.467 MET 155.A N PHE 151.A O MET 155.A H 2.889 2.093 LEU 156.A N ALA 152.A O LEU 156.A H 3.027 2.195 TYR 157.A N MET 153.A O TYR 157.A H 3.010 2.188 MET 158.A N ARG 154.A O MET 158.A H 2.761 1.998 ILE 159.A N MET 155.A O ILE 159.A H 3.090 2.260 GLU 160.A N LEU 156.A O GLU 160.A H 3.197 2.460 GLN 161.A N TYR 157.A O GLN 161.A H 3.300 2.544 GLN 161.A N MET 158.A O GLN 161.A H 3.034 2.424 GLN 161.A NE2 TYR 157.A O GLN 161.A HE21 3.669 3.002 VAL 162.A N MET 158.A O VAL 162.A H 3.078 2.256 HIS 163.A N ILE 159.A O HIS 163.A H 2.807 1.962 HIS 163.A NE2 ASP 233.A OD2 no hydrogen 2.736 N/A ASP 164.A N GLU 160.A O ASP 164.A H 2.997 2.263 CYS 165.A N GLN 161.A O CYS 165.A H 3.144 2.482 CYS 165.A N VAL 162.A O CYS 165.A H 2.918 2.233 CYS 165.A SG GLN 161.A O CYS 165.A HG 3.453 2.361 GLU 166.A N HIS 163.A O GLU 166.A H 2.866 2.065 ILE 167.A N VAL 162.A O ILE 167.A H 3.196 2.377 ILE 168.A N ILE 198.A O ILE 168.A H 2.771 1.941 HIS 169.A N ASP 233.A OD2 HIS 169.A H 3.013 2.234 HIS 169.A NE2 ILE 192.A O no hydrogen 2.812 N/A GLY 170.A N ASP 233.A OD1 GLY 170.A H 2.979 2.122 ASP 171.A N HIS 169.A ND1 ASP 171.A H 3.098 2.333 ASP 175.A N ASP 175.A OD1 ASP 175.A H 2.535 1.801 ASN 176.A N LYS 173.A O ASN 176.A H 2.877 2.043 ASN 176.A ND2 ASP 171.A O ASN 176.A HD22 2.675 1.860 ASN 176.A ND2 ASP 171.A OD2 ASN 176.A HD21 2.828 2.110 PHE 177.A N PRO 174.A O PHE 177.A H 3.194 2.344 ILE 178.A N ALA 190.A O ILE 178.A H 2.851 2.015 LEU 179.A N GLY 126.A O LEU 179.A H 2.895 2.049 GLY 180.A N GLY 188.A O GLY 180.A H 2.947 2.158 PHE 183.A N GLY 180.A O PHE 183.A H 2.956 2.121 LEU 184.A N ASN 181.A O LEU 184.A H 2.977 2.243 GLU 185.A N GLY 182.A O GLU 185.A H 3.064 2.249 ALA 190.A N ILE 178.A O ALA 190.A H 2.925 2.146 LEU 191.A N MET 102.A O LEU 191.A H 3.062 2.239 ILE 192.A N ASN 176.A O ILE 192.A H 2.930 2.076 LEU 194.A N GLU 84.A OE1 LEU 194.A H 3.130 2.347 GLY 195.A N ASP 193.A OD1 GLY 195.A H 3.372 2.523 SER 197.A N LEU 194.A O SER 197.A H 3.262 2.424 SER 197.A OG HIS 169.A O SER 197.A HG 3.055 2.421 ILE 198.A N ILE 168.A O ILE 198.A H 2.763 1.967 MET 200.A N GLU 166.A O MET 200.A H 3.036 2.245 LYS 201.A N ASP 199.A OD1 LYS 201.A H 3.210 2.391 LEU 202.A N ASP 199.A O LEU 202.A H 3.158 2.308 PHE 203.A N MET 200.A O PHE 203.A H 3.256 2.412 THR 207.A N PRO 204.A O THR 207.A H 3.264 2.500 THR 207.A OG1 PRO 204.A O THR 207.A HG1 2.581 1.806 PHE 209.A N TRP 228.A O PHE 209.A H 2.822 2.001 LYS 212.A NZ ASN 225.A OD1 LYS 212.A HZ3 3.337 2.488 GLU 214.A N GLU 214.A OE1 GLU 214.A H 2.569 1.748 GLN 218.A NE2 CYS 213.A O GLN 218.A HE21 2.865 2.118 GLU 221.A N GLU 221.A OE1 GLU 221.A H 2.555 1.789 LEU 223.A N CYS 219.A O LEU 223.A H 3.129 2.328 SER 224.A N GLU 221.A O SER 224.A H 3.392 2.590 SER 224.A OG VAL 220.A O SER 224.A HG 3.274 2.466 SER 224.A OG GLU 221.A O SER 224.A HG 3.470 3.054 ASN 225.A N MET 222.A O ASN 225.A H 3.063 2.210 LYS 226.A N GLU 221.A O LYS 226.A H 2.624 1.982 TRP 228.A N PHE 209.A O TRP 228.A H 2.816 2.118 TRP 228.A NE1 ALA 211.A O TRP 228.A HE1 2.906 2.230 ASN 229.A N GLN 231.A OE1 ASN 229.A H 2.840 1.992 ASN 229.A ND2 THR 207.A O ASN 229.A HD22 3.267 2.428 TYR 230.A N ASN 229.A OD1 TYR 230.A H 2.640 1.886 GLN 231.A N GLN 231.A OE1 GLN 231.A H 2.993 2.194 ASP 233.A N TYR 230.A O ASP 233.A H 3.114 2.347 TYR 234.A OH PRO 291.A O TYR 234.A HH 3.016 2.275 PHE 235.A N GLN 231.A O PHE 235.A H 3.091 2.252 GLY 236.A N ILE 232.A O GLY 236.A H 3.111 2.351 VAL 237.A N ASP 233.A O VAL 237.A H 2.912 2.102 ALA 238.A N TYR 234.A O ALA 238.A H 2.980 2.139 ALA 239.A N PHE 235.A O ALA 239.A H 2.808 1.994 THR 240.A N GLY 236.A O THR 240.A H 2.936 2.154 THR 240.A OG1 GLY 236.A O THR 240.A HG1 2.803 2.004 VAL 241.A N VAL 237.A O VAL 241.A H 2.967 2.127 TYR 242.A N ALA 238.A O TYR 242.A H 2.989 2.202 CYS 243.A N ALA 239.A O CYS 243.A H 3.089 2.357 CYS 243.A N THR 240.A O CYS 243.A H 3.137 2.544 MET 244.A N THR 240.A O MET 244.A H 3.137 2.359 LEU 245.A N VAL 241.A O LEU 245.A H 3.058 2.341 PHE 246.A N TYR 242.A O PHE 246.A H 2.947 2.158 GLY 247.A N CYS 243.A O GLY 247.A H 2.745 1.991 LYS 253.A N LYS 260.A O LYS 253.A H 2.869 2.017 LYS 253.A NZ GLU 255.A OE2 LYS 253.A HZ2 2.761 2.015 GLU 255.A N GLU 258.A O GLU 255.A H 2.814 1.975 GLU 258.A N GLU 255.A O GLU 258.A H 3.085 2.269 CYS 259.A N ASN 283.A OD1 CYS 259.A H 2.813 1.978 LYS 260.A N LYS 253.A O LYS 260.A H 2.997 2.173 GLU 262.A N LYS 251.A O GLU 262.A H 2.797 1.958 HIS 270.A NE2 TYR 308.A OH no hydrogen 2.474 N/A TRP 274.A N HIS 270.A O TRP 274.A H 3.095 2.283 TRP 274.A NE1 GLN 145.A OE1 TRP 274.A HE1 3.114 2.297 ASN 275.A N LEU 271.A O ASN 275.A H 2.930 2.092 GLU 276.A N ASP 272.A O GLU 276.A H 3.154 2.322 PHE 277.A N MET 273.A O PHE 277.A H 2.946 2.158 PHE 278.A N TRP 274.A O PHE 278.A H 2.808 1.962 HIS 279.A N ASN 275.A O HIS 279.A H 2.898 2.139 HIS 279.A ND1 GLU 258.A OE2 no hydrogen 2.722 N/A VAL 280.A N GLU 276.A O VAL 280.A H 3.166 2.322 MET 281.A N PHE 277.A O MET 281.A H 3.205 2.386 LEU 282.A N PHE 278.A O LEU 282.A H 3.083 2.377 ASN 283.A ND2 CYS 259.A O ASN 283.A HD21 2.982 2.184 ASN 283.A ND2 HIS 279.A O ASN 283.A HD22 2.662 1.823 CYS 287.A SG GLN 231.A OE1 CYS 287.A HG 3.687 2.507 HIS 288.A N ASP 286.A OD1 HIS 288.A H 2.941 2.280 HIS 289.A N ASP 286.A O HIS 289.A H 3.109 2.288 HIS 289.A ND1 ASP 286.A OD1 no hydrogen 2.444 N/A HIS 289.A ND1 ASP 286.A OD2 no hydrogen 3.017 N/A LEU 295.A N SER 292.A OG LEU 295.A H 3.345 2.492 LEU 296.A N SER 292.A O LEU 296.A H 3.029 2.196 ARG 297.A N LEU 293.A O ARG 297.A H 3.231 2.471 GLN 298.A N ASP 294.A O GLN 298.A H 2.928 2.187 LYS 299.A N LEU 295.A O LYS 299.A H 3.186 2.383 LYS 299.A NZ GLU 276.A OE1 LYS 299.A HZ3 2.652 1.818 LYS 301.A N ARG 297.A O LYS 301.A H 2.832 2.022 LYS 302.A N GLN 298.A O LYS 302.A H 2.893 2.188 PHE 304.A N LEU 300.A O PHE 304.A H 3.003 2.184 GLN 305.A N LYS 301.A O GLN 305.A H 2.989 2.145 GLN 306.A N LYS 302.A O GLN 306.A H 3.173 2.499 GLN 306.A N VAL 303.A O GLN 306.A H 3.173 2.565 HIS 307.A N PHE 304.A O HIS 307.A H 3.286 2.453 HIS 307.A ND1 VAL 303.A O no hydrogen 3.105 N/A TYR 308.A N PHE 304.A O TYR 308.A H 2.833 1.986 LYS 311.A N TYR 308.A O LYS 311.A H 3.357 2.625 ILE 312.A N TYR 308.A O ILE 312.A H 2.958 2.274 LEU 315.A N LYS 311.A O LEU 315.A H 3.159 2.345 ARG 316.A N ILE 312.A O ARG 316.A H 3.060 2.254 ASN 317.A N ARG 313.A O ASN 317.A H 3.185 2.348 ARG 318.A N ALA 314.A O ARG 318.A H 2.953 2.138 ARG 318.A NE GLU 140.A OE2 ARG 318.A HE 3.224 2.401 LEU 319.A N LEU 315.A O LEU 319.A H 3.188 2.404 ILE 320.A N ARG 316.A O ILE 320.A H 2.801 1.969 VAL 321.A N ASN 317.A O VAL 321.A H 3.129 2.329 LEU 322.A N ARG 318.A O LEU 322.A H 3.382 2.597 LEU 323.A N LEU 319.A O LEU 323.A H 2.788 1.989 LEU 324.A N ILE 320.A O LEU 324.A H 2.846 2.003 GLU 325.A N VAL 321.A O GLU 325.A H 3.016 2.191 CYS 326.A N LEU 322.A O CYS 326.A H 3.047 2.304 LYS 327.A N LEU 323.A O LYS 327.A H 2.859 2.104 LYS 327.A NZ SER 124.A O LYS 327.A HZ3 3.509 2.642 ARG 328.A N LEU 324.A O ARG 328.A H 2.917 2.108 ARG 328.A NH2 GLU 325.A OE1 ARG 328.A HH21 2.553 1.860 SER 329.A N CYS 326.A O SER 329.A H 3.278 2.576