Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4r8q_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 3.A N ILE 210.A O VAL 3.A H 3.154 2.393 TRP 7.A N ASN 5.A OD1 TRP 7.A H 2.934 2.095 TRP 7.A NE1 GLN 198.A O TRP 7.A HE1 2.695 1.943 ASP 8.A N ASN 5.A O ASP 8.A H 3.256 2.402 LEU 11.A N ASP 8.A OD2 LEU 11.A H 2.854 2.136 ILE 12.A N ASP 8.A O ILE 12.A H 3.087 2.280 PHE 13.A N ASP 9.A O PHE 13.A H 3.019 2.203 LYS 14.A N LYS 10.A O LYS 14.A H 3.196 2.450 LYS 14.A N LEU 11.A O LYS 14.A H 3.210 2.611 LEU 15.A N LEU 11.A O LEU 15.A H 2.904 2.084 LEU 16.A N ILE 12.A O LEU 16.A H 2.985 2.141 SER 17.A N PHE 13.A O SER 17.A H 2.903 2.133 SER 17.A OG PHE 13.A O SER 17.A HG 2.505 1.766 GLY 18.A N LYS 14.A O GLY 18.A H 3.166 2.485 LEU 19.A N LEU 16.A O LEU 19.A H 3.200 2.343 SER 25.A N PRO 22.A O SER 25.A H 2.752 1.906 SER 25.A OG PRO 22.A O SER 25.A HG 2.629 1.792 TYR 26.A N VAL 23.A O TYR 26.A H 3.157 2.301 ASN 28.A N ASN 28.A OD1 ASN 28.A H 2.662 2.008 ASN 28.A ND2 TYR 109.A O ASN 28.A HD22 3.144 2.322 THR 29.A N TYR 26.A O THR 29.A H 3.334 2.491 THR 29.A OG1 VAL 23.A O THR 29.A HG1 2.706 1.947 PHE 30.A N ALA 111.A O PHE 30.A H 2.811 2.102 TRP 32.A N LEU 113.A O TRP 32.A H 2.813 2.078 TRP 32.A NE1 HIS 112.A ND1 TRP 32.A HE1 3.249 2.397 CYS 34.A SG LYS 35.A O CYS 34.A HG 3.654 2.543 LEU 36.A N ASN 116.A OD1 LEU 36.A H 2.710 1.936 LYS 42.A N HIS 55.A O LYS 42.A H 2.524 1.722 THR 43.A N VAL 54.A O THR 43.A H 3.087 2.397 THR 43.A OG1 PRO 41.A O THR 43.A HG1 2.908 2.098 PHE 45.A N VAL 52.A O PHE 45.A H 3.172 2.427 GLN 46.A NE2 GLY 48.A O GLN 46.A HE21 2.909 2.119 GLN 46.A NE2 SER 49.A O GLN 46.A HE22 3.086 2.610 LEU 47.A N LYS 50.A O LEU 47.A H 3.096 2.267 LYS 50.A NZ GLN 71.A OE1 LYS 50.A HZ3 3.264 2.506 VAL 52.A N PHE 45.A O VAL 52.A H 3.141 2.326 TYR 53.A N THR 70.A O TYR 53.A H 2.868 2.093 VAL 54.A N THR 43.A O VAL 54.A H 3.005 2.158 HIS 55.A N GLU 68.A O HIS 55.A H 2.920 2.095 LEU 58.A N VAL 66.A O LEU 58.A H 2.782 1.973 GLY 59.A N VAL 66.A O GLY 59.A H 3.304 2.535 GLY 61.A N ALA 64.A O GLY 61.A H 3.132 2.285 GLN 65.A N VAL 78.A O GLN 65.A H 2.898 2.072 GLN 65.A NE2 GLU 60.A OE1 GLN 65.A HE21 3.184 2.369 VAL 66.A N GLY 59.A O VAL 66.A H 3.079 2.239 TYR 67.A N LEU 76.A O TYR 67.A H 3.102 2.285 GLU 68.A N HIS 56.A O GLU 68.A H 3.136 2.278 ALA 69.A N PHE 74.A O ALA 69.A H 2.875 2.259 THR 70.A N TYR 53.A O THR 70.A H 2.918 2.096 THR 70.A OG1 HIS 55.A NE2 THR 70.A HG1 3.243 2.607 GLN 72.A NE2 LYS 73.A O GLN 72.A HE21 3.262 2.417 PHE 74.A N ALA 69.A O PHE 74.A H 2.982 2.154 VAL 75.A N GLY 122.A O VAL 75.A H 2.970 2.118 LEU 76.A N TYR 67.A O LEU 76.A H 2.961 2.156 LYS 77.A N LEU 120.A O LYS 77.A H 2.810 1.977 LYS 77.A NZ GLU 86.A OE1 LYS 77.A HZ3 2.993 2.116 LYS 77.A NZ GLU 86.A OE2 LYS 77.A HZ3 2.874 2.217 VAL 78.A N GLN 65.A O VAL 78.A H 2.740 1.885 GLN 79.A N SER 118.A O GLN 79.A H 3.127 2.332 ASN 83.A ND2 GLN 79.A OE1 ASN 83.A HD22 3.201 2.363 TRP 85.A NE1 SER 199.A O TRP 85.A HE1 2.795 2.036 GLU 86.A N ASN 83.A OD1 GLU 86.A H 2.956 2.141 TYR 88.A N PRO 84.A O TYR 88.A H 2.897 2.099 TYR 88.A OH ASP 201.A OD2 TYR 88.A HH 2.563 1.865 ILE 89.A N TRP 85.A O ILE 89.A H 2.893 2.050 GLY 90.A N GLU 86.A O GLY 90.A H 2.995 2.142 THR 91.A N PHE 87.A O THR 91.A H 2.999 2.176 THR 91.A OG1 PHE 87.A O THR 91.A HG1 2.668 1.855 GLN 92.A N TYR 88.A O GLN 92.A H 2.982 2.140 GLN 92.A NE2 GLU 95.A OE2 GLN 92.A HE22 3.436 2.842 LEU 93.A N ILE 89.A O LEU 93.A H 2.835 1.998 MET 94.A N GLY 90.A O MET 94.A H 3.174 2.357 GLU 95.A N THR 91.A O GLU 95.A H 3.104 2.330 ARG 96.A N GLN 92.A O ARG 96.A H 3.000 2.241 ARG 96.A NH1 ASP 201.A OD1 ARG 96.A HH12 3.527 2.880 ARG 96.A NH1 ASP 201.A OD2 ARG 96.A HH12 3.030 2.200 ARG 96.A NH2 CYS 167.A O ARG 96.A HH21 2.983 2.189 ARG 96.A NH2 ASP 201.A OD1 ARG 96.A HH22 2.848 1.992 LEU 97.A N LEU 93.A O LEU 97.A H 3.001 2.272 MET 101.A N LYS 98.A O MET 101.A H 2.668 1.817 HIS 103.A ND1 SER 100.A O no hydrogen 3.043 N/A MET 104.A N MET 101.A O MET 104.A H 3.005 2.147 PHE 105.A N GLN 102.A O PHE 105.A H 3.136 2.304 TYR 109.A N VAL 121.A O TYR 109.A H 2.580 1.835 SER 110.A N VAL 121.A O SER 110.A H 3.317 2.504 ALA 111.A N ASN 28.A O ALA 111.A H 2.948 2.178 HIS 112.A N VAL 119.A O HIS 112.A H 2.704 1.861 LEU 113.A N PHE 30.A O LEU 113.A H 2.727 1.931 PHE 114.A N GLY 117.A O PHE 114.A H 2.696 1.884 GLN 115.A N CYS 34.A O GLN 115.A H 3.058 2.199 SER 118.A N GLN 79.A O SER 118.A H 2.949 2.175 VAL 119.A N HIS 112.A O VAL 119.A H 2.783 1.953 LEU 120.A N LYS 77.A O LEU 120.A H 2.905 2.055 VAL 121.A N SER 110.A O VAL 121.A H 2.849 2.012 GLY 122.A N VAL 75.A O GLY 122.A H 3.017 2.191 GLU 123.A N LYS 107.A O GLU 123.A H 2.851 2.104 TYR 125.A OH PHE 105.A O TYR 125.A HH 2.638 2.037 TYR 127.A N LEU 181.A O TYR 127.A H 2.809 2.032 LEU 130.A N PHE 179.A O LEU 130.A H 2.885 2.137 LEU 131.A N PRO 176.A O LEU 131.A H 3.248 2.547 ASN 132.A N THR 129.A OG1 ASN 132.A H 2.804 1.968 ALA 133.A N THR 129.A O ALA 133.A H 3.024 2.212 ILE 134.A N LEU 130.A O ILE 134.A H 2.876 2.058 ASN 135.A N LEU 131.A O ASN 135.A H 2.974 2.178 LEU 136.A N ASN 132.A O LEU 136.A H 2.823 2.061 TYR 137.A N ALA 133.A O TYR 137.A H 3.219 2.480 TYR 137.A N ILE 134.A O TYR 137.A H 3.225 2.591 LYS 138.A N ILE 134.A O LYS 138.A H 3.227 2.453 THR 140.A N TYR 137.A O THR 140.A H 3.028 2.278 THR 140.A OG1 TYR 137.A O THR 140.A HG1 2.569 1.799 LYS 143.A N THR 140.A O LYS 143.A H 3.130 2.425 LYS 143.A NZ LYS 138.A O LYS 143.A HZ2 3.445 2.686 VAL 144.A N GLU 142.A O VAL 144.A H 2.510 1.740 VAL 150.A N PRO 146.A O VAL 150.A H 3.059 2.244 ILE 151.A N GLN 147.A O ILE 151.A H 2.797 1.939 SER 152.A N GLY 148.A O SER 152.A H 3.033 2.241 PHE 153.A N LEU 149.A O PHE 153.A H 2.799 1.944 ALA 154.A N VAL 150.A O ALA 154.A H 2.867 2.049 MET 155.A N ILE 151.A O MET 155.A H 3.029 2.220 ARG 156.A N SER 152.A O ARG 156.A H 3.170 2.340 ARG 156.A NE SER 188.A OG ARG 156.A HE 3.193 2.417 MET 157.A N PHE 153.A O MET 157.A H 2.980 2.198 LEU 158.A N ALA 154.A O LEU 158.A H 3.064 2.218 TYR 159.A N MET 155.A O TYR 159.A H 2.934 2.135 MET 160.A N ARG 156.A O MET 160.A H 2.700 1.951 ILE 161.A N MET 157.A O ILE 161.A H 3.069 2.234 GLU 162.A N LEU 158.A O GLU 162.A H 3.234 2.480 GLN 163.A N TYR 159.A O GLN 163.A H 3.199 2.424 VAL 164.A N MET 160.A O VAL 164.A H 2.994 2.194 HIS 165.A N ILE 161.A O HIS 165.A H 2.720 1.871 HIS 165.A NE2 ASP 236.A OD2 no hydrogen 2.763 N/A ASP 166.A N GLU 162.A O ASP 166.A H 3.095 2.361 CYS 167.A N VAL 164.A O CYS 167.A H 2.974 2.247 GLU 168.A N HIS 165.A O GLU 168.A H 2.778 1.985 ILE 169.A N VAL 164.A O ILE 169.A H 3.281 2.455 ILE 170.A N ILE 200.A O ILE 170.A H 2.794 1.966 HIS 171.A N ASP 236.A OD2 HIS 171.A H 2.948 2.155 HIS 171.A NE2 ILE 194.A O no hydrogen 2.773 N/A GLY 172.A N ASP 236.A OD1 GLY 172.A H 2.917 2.058 ASP 173.A N HIS 171.A ND1 ASP 173.A H 3.173 2.395 ASN 178.A N LYS 175.A O ASN 178.A H 2.855 2.008 ASN 178.A ND2 ASP 173.A O ASN 178.A HD22 2.654 1.857 ASN 178.A ND2 ASP 173.A OD2 ASN 178.A HD21 2.971 2.238 PHE 179.A N PRO 176.A O PHE 179.A H 3.339 2.493 ILE 180.A N ALA 192.A O ILE 180.A H 2.830 1.994 LEU 181.A N GLY 128.A O LEU 181.A H 2.881 2.031 GLY 182.A N GLY 190.A O GLY 182.A H 2.968 2.156 PHE 185.A N GLY 182.A O PHE 185.A H 3.042 2.204 LEU 186.A N ASN 183.A O LEU 186.A H 2.996 2.281 LEU 191.A N SER 188.A O LEU 191.A H 3.064 2.215 ALA 192.A N ILE 180.A O ALA 192.A H 2.861 2.049 LEU 193.A N MET 104.A O LEU 193.A H 3.087 2.268 ILE 194.A N ASN 178.A O ILE 194.A H 2.921 2.062 LEU 196.A N GLU 86.A OE1 LEU 196.A H 3.103 2.280 GLY 197.A N ASP 195.A OD1 GLY 197.A H 3.357 2.522 SER 199.A N LEU 196.A O SER 199.A H 3.089 2.249 SER 199.A OG HIS 171.A O SER 199.A HG 3.024 2.363 ILE 200.A N ILE 170.A O ILE 200.A H 2.763 1.959 MET 202.A N GLU 168.A O MET 202.A H 3.086 2.295 LYS 203.A N ASP 201.A OD1 LYS 203.A H 3.156 2.350 LEU 204.A N ASP 201.A O LEU 204.A H 3.161 2.335 PHE 205.A N MET 202.A O PHE 205.A H 3.096 2.278 THR 209.A N PRO 206.A O THR 209.A H 3.239 2.520 THR 209.A OG1 PRO 206.A O THR 209.A HG1 2.594 1.797 ILE 210.A N PHE 1.A O ILE 210.A H 3.243 2.497 PHE 211.A N TRP 231.A O PHE 211.A H 2.851 2.072 CYS 215.A SG GLU 216.A O CYS 215.A HG 3.596 2.569 GLU 216.A N PHE 220.A O GLU 216.A H 2.859 2.029 GLY 219.A N GLU 216.A O GLY 219.A H 3.281 2.420 GLN 221.A NE2 LYS 214.A O GLN 221.A HE21 2.335 1.829 GLU 224.A N GLU 224.A OE1 GLU 224.A H 2.637 1.874 LEU 226.A N CYS 222.A O LEU 226.A H 3.123 2.381 LEU 226.A N VAL 223.A O LEU 226.A H 3.119 2.514 SER 227.A N GLU 224.A O SER 227.A H 3.202 2.423 ASN 228.A N MET 225.A O ASN 228.A H 3.213 2.366 LYS 229.A N GLU 224.A O LYS 229.A H 2.727 1.960 TRP 231.A N PHE 211.A O TRP 231.A H 2.960 2.227 TRP 231.A NE1 ALA 213.A O TRP 231.A HE1 3.025 2.226 ASN 232.A N GLN 234.A OE1 ASN 232.A H 2.854 2.029 ASN 232.A ND2 THR 209.A O ASN 232.A HD22 3.239 2.401 TYR 233.A N ASN 232.A OD1 TYR 233.A H 2.644 1.891 GLN 234.A N GLN 234.A OE1 GLN 234.A H 3.001 2.210 ASP 236.A N TYR 233.A O ASP 236.A H 3.164 2.423 TYR 237.A OH PRO 294.A O TYR 237.A HH 2.949 2.208 PHE 238.A N GLN 234.A O PHE 238.A H 2.973 2.159 GLY 239.A N ILE 235.A O GLY 239.A H 3.086 2.289 VAL 240.A N ASP 236.A O VAL 240.A H 3.034 2.201 ALA 241.A N TYR 237.A O ALA 241.A H 3.143 2.315 ALA 242.A N PHE 238.A O ALA 242.A H 2.783 1.947 THR 243.A N GLY 239.A O THR 243.A H 2.899 2.108 THR 243.A OG1 GLY 239.A O THR 243.A HG1 2.779 1.981 VAL 244.A N VAL 240.A O VAL 244.A H 2.946 2.115 TYR 245.A N ALA 241.A O TYR 245.A H 2.926 2.137 TYR 245.A OH GLU 265.A O TYR 245.A HH 3.058 2.266 CYS 246.A N ALA 242.A O CYS 246.A H 3.005 2.251 MET 247.A N THR 243.A O MET 247.A H 3.047 2.268 LEU 248.A N VAL 244.A O LEU 248.A H 3.044 2.368 LEU 248.A N TYR 245.A O LEU 248.A H 3.097 2.442 PHE 249.A N TYR 245.A O PHE 249.A H 2.922 2.197 GLY 250.A N CYS 246.A O GLY 250.A H 2.828 2.085 LYS 256.A N LYS 263.A O LYS 256.A H 2.826 1.980 LYS 256.A NZ GLU 258.A OE2 LYS 256.A HZ2 3.284 2.667 GLU 258.A N GLU 261.A O GLU 258.A H 2.997 2.175 CYS 262.A N ASN 286.A OD1 CYS 262.A H 2.741 1.945 LYS 263.A N LYS 256.A O LYS 263.A H 2.988 2.183 GLU 265.A N LYS 254.A O GLU 265.A H 2.813 1.972 HIS 273.A NE2 TYR 311.A OH no hydrogen 2.614 N/A TRP 277.A N HIS 273.A O TRP 277.A H 2.994 2.172 TRP 277.A NE1 GLN 147.A OE1 TRP 277.A HE1 3.021 2.186 ASN 278.A N LEU 274.A O ASN 278.A H 3.038 2.228 GLU 279.A N ASP 275.A O GLU 279.A H 3.125 2.300 PHE 280.A N MET 276.A O PHE 280.A H 2.940 2.132 PHE 281.A N TRP 277.A O PHE 281.A H 2.846 2.005 HIS 282.A N ASN 278.A O HIS 282.A H 2.892 2.097 HIS 282.A ND1 GLU 261.A OE2 no hydrogen 2.611 N/A VAL 283.A N GLU 279.A O VAL 283.A H 3.086 2.240 MET 284.A N PHE 280.A O MET 284.A H 3.081 2.292 LEU 285.A N PHE 281.A O LEU 285.A H 2.932 2.213 ASN 286.A N HIS 282.A O ASN 286.A H 2.988 2.300 ASN 286.A ND2 CYS 262.A O ASN 286.A HD21 2.802 1.961 ASN 286.A ND2 HIS 282.A O ASN 286.A HD22 2.906 2.090 HIS 292.A N ASP 289.A O HIS 292.A H 3.159 2.369 HIS 292.A ND1 ASP 289.A OD1 no hydrogen 2.645 N/A LEU 298.A N SER 295.A OG LEU 298.A H 3.229 2.391 LEU 299.A N SER 295.A O LEU 299.A H 3.161 2.332 ARG 300.A N LEU 296.A O ARG 300.A H 3.216 2.430 GLN 301.A N ASP 297.A O GLN 301.A H 3.064 2.299 LYS 302.A N LEU 298.A O LYS 302.A H 3.208 2.402 LYS 302.A NZ GLU 279.A OE1 LYS 302.A HZ2 2.724 1.962 LEU 303.A N LEU 299.A O LEU 303.A H 3.324 2.534 LYS 304.A N ARG 300.A O LYS 304.A H 2.849 2.115 LYS 305.A N GLN 301.A O LYS 305.A H 2.918 2.110 PHE 307.A N LEU 303.A O PHE 307.A H 2.890 2.066 GLN 308.A N LYS 304.A O GLN 308.A H 2.685 1.864 GLN 309.A N LYS 305.A O GLN 309.A H 2.958 2.303 GLN 309.A N VAL 306.A O GLN 309.A H 3.074 2.423 HIS 310.A N PHE 307.A O HIS 310.A H 3.345 2.507 HIS 310.A ND1 VAL 306.A O no hydrogen 3.191 N/A TYR 311.A N PHE 307.A O TYR 311.A H 2.818 2.029 LYS 314.A N TYR 311.A O LYS 314.A H 3.239 2.525 ILE 315.A N TYR 311.A O ILE 315.A H 3.233 2.624 LEU 318.A N LYS 314.A O LEU 318.A H 3.100 2.318 ARG 319.A N ILE 315.A O ARG 319.A H 2.952 2.118 ARG 319.A NH1 GLU 187.A O ARG 319.A HH12 3.346 2.720 ASN 320.A N ARG 316.A O ASN 320.A H 3.271 2.440 ARG 321.A N ALA 317.A O ARG 321.A H 3.231 2.395 ARG 321.A NE GLU 142.A OE2 ARG 321.A HE 2.816 1.965 ARG 321.A NH2 GLU 142.A OE2 ARG 321.A HH21 3.342 2.669 LEU 322.A N LEU 318.A O LEU 322.A H 3.196 2.437 ILE 323.A N ARG 319.A O ILE 323.A H 2.857 2.022 VAL 324.A N ASN 320.A O VAL 324.A H 3.101 2.262 LEU 325.A N ARG 321.A O LEU 325.A H 3.400 2.615 LEU 326.A N LEU 322.A O LEU 326.A H 2.750 1.984 LEU 327.A N ILE 323.A O LEU 327.A H 2.835 1.989 GLU 328.A N VAL 324.A O GLU 328.A H 3.237 2.431 CYS 329.A N LEU 325.A O CYS 329.A H 3.325 2.558 LYS 330.A N LEU 326.A O LYS 330.A H 2.984 2.197 LYS 330.A NZ SER 126.A O LYS 330.A HZ3 3.179 2.358 ARG 331.A N LEU 327.A O ARG 331.A H 3.016 2.157 ARG 331.A NH2 GLU 328.A OE2 ARG 331.A HH21 3.164 2.315