Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4rpb_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ GLU 234.A O LYS 1.A HZ2 2.885 2.077 THR 9.A N GLU 12.A OE1 THR 9.A H 3.010 2.192 GLU 12.A N THR 9.A O GLU 12.A H 2.838 2.007 LEU 13.A N LEU 10.A O LEU 13.A H 3.134 2.301 SER 14.A N GLU 226.A OE1 SER 14.A H 2.770 1.955 SER 14.A OG GLU 226.A OE1 SER 14.A HG 3.470 2.888 SER 14.A OG GLU 226.A OE2 SER 14.A HG 2.401 1.814 ASN 15.A N VAL 20.A O ASN 15.A H 2.898 2.061 ASN 15.A ND2 SER 206.A OG ASN 15.A HD22 2.999 2.199 ASN 15.A ND2 ILE 219.A O ASN 15.A HD21 3.202 2.474 ARG 17.A N ASN 15.A OD1 ARG 17.A H 2.828 1.987 ARG 17.A NE ASP 99.A OD1 ARG 17.A HE 3.219 2.496 ARG 17.A NE ASP 99.A OD2 ARG 17.A HE 3.043 2.261 ARG 17.A NH1 GLN 172.A OE1 ARG 17.A HH12 2.978 2.306 ARG 17.A NH1 ASP 220.A O ARG 17.A HH11 2.704 1.874 ARG 17.A NH2 ASP 99.A OD1 ARG 17.A HH21 2.861 2.046 ARG 17.A NH2 GLN 172.A O ARG 17.A HH22 2.823 2.064 VAL 20.A N PHE 18.A O VAL 20.A H 2.733 2.022 ILE 22.A N LEU 13.A O ILE 22.A H 2.972 2.113 ASP 23.A N ARG 205.A O ASP 23.A H 2.778 1.939 GLN 24.A N ARG 205.A O GLN 24.A H 3.135 2.310 TYR 26.A N PHE 203.A O TYR 26.A H 2.923 2.148 THR 27.A N ALA 275.A O THR 27.A H 3.185 2.356 THR 27.A OG1 THR 273.A O THR 27.A HG1 2.753 2.162 SER 28.A N LEU 201.A O SER 28.A H 2.920 2.142 SER 28.A OG LEU 201.A O SER 28.A HG 3.474 2.774 VAL 32.A N PRO 29.A O VAL 32.A H 2.997 2.196 VAL 35.A N VAL 192.A O VAL 35.A H 3.101 2.284 GLN 36.A NE2 ALA 189.A O GLN 36.A HE21 3.019 2.189 GLN 38.A N ASP 99.A OD2 GLN 38.A H 2.883 2.096 GLN 38.A NE2 GLN 36.A O GLN 38.A HE21 2.920 2.095 GLN 38.A NE2 ALA 189.A O GLN 38.A HE22 3.113 2.267 ASN 39.A N ASP 99.A OD2 ASN 39.A H 2.981 2.123 ASN 39.A ND2 VAL 97.A O ASN 39.A HD21 2.977 2.202 ARG 41.A N THR 52.A OG1 ARG 41.A H 2.864 2.008 ARG 41.A NH1 CYS 37.A O ARG 41.A HH11 2.924 2.130 ARG 41.A NH1 PRO 190.A O ARG 41.A HH12 2.926 2.174 ARG 41.A NH2 PRO 190.A O ARG 41.A HH22 2.869 2.094 CYS 42.A SG THR 43.A O CYS 42.A HG 3.393 2.217 THR 43.A N GLU 47.A O THR 43.A H 3.012 2.207 LEU 44.A N ARG 263.A O LEU 44.A H 2.990 2.192 GLY 46.A N THR 43.A O GLY 46.A H 2.897 2.055 GLU 47.A N THR 43.A OG1 no hydrogen 3.001 N/A GLN 49.A N ARG 41.A O GLN 49.A H 2.939 2.123 THR 51.A N GLN 38.A O THR 51.A H 3.003 2.258 THR 51.A OG1 ASN 39.A OD1 THR 51.A HG1 2.790 2.000 THR 52.A N GLN 49.A O THR 52.A H 3.028 2.195 THR 52.A OG1 GLN 38.A O THR 52.A HG1 2.954 2.262 THR 52.A OG1 GLN 49.A O THR 52.A HG1 2.993 2.452 GLN 53.A NE2 GLN 55.A O GLN 53.A HE22 2.874 2.052 GLN 55.A N GLN 53.A OE1 GLN 55.A H 3.028 2.261 SER 57.A OG GLN 55.A OE1 SER 57.A HG 3.408 2.843 GLY 58.A N GLN 55.A O GLY 58.A H 2.967 2.140 ILE 59.A N VAL 56.A O ILE 59.A H 3.102 2.263 CYS 60.A N GLY 96.A O CYS 60.A H 2.685 1.919 CYS 60.A SG ARG 17.A O CYS 60.A HG 3.413 2.615 ALA 61.A N GLY 58.A O ALA 61.A H 3.198 2.349 LYS 63.A NZ LEU 80.A O LYS 63.A HZ2 3.007 2.203 GLY 64.A N VAL 157.A O GLY 64.A H 3.167 2.397 GLU 65.A N THR 76.A O GLU 65.A H 2.789 1.993 VAL 66.A N GLN 155.A O VAL 66.A H 3.376 2.548 THR 67.A N ASN 74.A O THR 67.A H 2.854 2.017 LEU 70.A N LEU 72.A O LEU 70.A H 2.967 2.119 TYR 73.A N ILE 147.A O TYR 73.A H 2.913 2.090 ASN 74.A N ALA 68.A O ASN 74.A H 3.023 2.275 ILE 75.A N VAL 145.A O ILE 75.A H 2.804 1.952 THR 76.A N GLU 65.A O THR 76.A H 2.790 2.011 ILE 77.A N GLY 143.A O ILE 77.A H 2.908 2.150 THR 78.A N LYS 63.A O THR 78.A H 2.888 2.050 ASN 79.A N SER 83.A O ASN 79.A H 2.882 2.066 ASN 79.A ND2 SER 83.A OG ASN 79.A HD22 2.983 2.129 GLY 82.A N ASN 79.A O GLY 82.A H 2.899 2.066 SER 83.A N ASN 81.A OD1 SER 83.A H 2.811 1.961 SER 88.A N ASP 86.A OD1 SER 88.A H 3.028 2.190 SER 88.A OG ASP 86.A OD1 SER 88.A HG 3.241 2.621 SER 88.A OG ASP 86.A OD2 SER 88.A HG 2.817 2.069 GLU 89.A N ASP 86.A O GLU 89.A H 2.856 2.003 ILE 91.A N GLU 89.A O ILE 91.A H 2.796 2.060 GLY 96.A N THR 51.A O GLY 96.A H 2.828 2.071 VAL 97.A N PRO 94.A O VAL 97.A H 3.369 2.512 GLN 101.A N VAL 174.A O GLN 101.A H 3.179 2.595 GLY 102.A N THR 133.A OG1 GLY 102.A H 2.833 2.181 ARG 103.A NE ASP 166.A OD2 ARG 103.A HE 3.297 2.484 ARG 103.A NH1 TYR 134.A OH ARG 103.A HH11 3.446 2.651 VAL 104.A N VAL 131.A O VAL 104.A H 2.981 2.173 PHE 105.A N GLY 163.A O PHE 105.A H 2.763 1.926 GLY 106.A N ALA 129.A O GLY 106.A H 2.998 2.175 VAL 107.A N THR 160.A O VAL 107.A H 2.931 2.143 ILE 108.A N HIS 127.A O ILE 108.A H 2.895 2.093 THR 109.A N LYS 158.A O THR 109.A H 2.929 2.109 GLN 110.A N ARG 125.A O GLN 110.A H 2.800 2.066 GLN 110.A NE2 LYS 152.A O GLN 110.A HE22 2.899 2.139 GLN 110.A NE2 GLN 155.A O GLN 110.A HE21 3.147 2.424 ARG 111.A NE ASN 124.A OD1 ARG 111.A HE 2.688 1.845 ARG 111.A NH2 ASN 124.A OD1 ARG 111.A HH21 3.215 2.553 ASP 112.A N ALA 123.A O ASP 112.A H 3.089 2.244 LYS 113.A N GLN 155.A OE1 LYS 113.A H 2.820 2.026 LYS 113.A NZ ASN 154.A O LYS 113.A HZ1 3.101 2.464 GLN 119.A N ALA 116.A O GLN 119.A H 3.036 2.231 ARG 125.A N GLN 110.A O ARG 125.A H 3.086 2.295 ARG 125.A NH1 GLN 110.A OE1 ARG 125.A HH11 2.809 2.005 ARG 125.A NH1 ASP 112.A OD1 ARG 125.A HH12 2.724 1.868 ARG 125.A NH2 ASP 112.A OD1 ARG 125.A HH22 3.482 2.859 ARG 125.A NH2 ASP 112.A OD2 ARG 125.A HH22 2.925 2.069 HIS 127.A N ILE 108.A O HIS 127.A H 2.872 2.092 ALA 129.A N GLY 106.A O ALA 129.A H 2.781 1.948 VAL 130.A N GLY 148.A O VAL 130.A H 2.880 2.072 VAL 131.A N VAL 104.A O VAL 131.A H 2.764 1.936 THR 133.A N GLY 102.A O THR 133.A H 2.976 2.183 THR 133.A OG1 PHE 100.A O THR 133.A HG1 2.569 1.842 GLN 137.A N THR 135.A OG1 GLN 137.A H 3.281 2.508 TYR 138.A N THR 135.A O TYR 138.A H 3.151 2.318 TYR 138.A OH PRO 98.A O TYR 138.A HH 2.940 2.308 THR 139.A N GLN 144.A O THR 139.A H 3.003 2.255 LYS 141.A N TYR 178.A O LYS 141.A H 2.860 2.048 LYS 141.A NZ PRO 87.A O LYS 141.A HZ2 2.768 2.064 LYS 141.A NZ ILE 91.A O LYS 141.A HZ3 2.819 1.947 LEU 142.A N THR 139.A O LEU 142.A H 2.950 2.265 GLY 143.A N PRO 140.A O GLY 143.A H 2.938 2.189 GLN 144.A N THR 139.A O GLN 144.A H 3.175 2.330 VAL 145.A N ILE 75.A O VAL 145.A H 3.013 2.232 GLN 146.A NE2 ASN 74.A OD1 GLN 146.A HE21 3.143 2.306 ILE 147.A N TYR 73.A O ILE 147.A H 2.919 2.092 GLY 148.A N VAL 130.A O GLY 148.A H 3.010 2.197 THR 149.A N THR 71.A O THR 149.A H 2.836 2.023 LEU 151.A N TYR 73.A OH LEU 151.A H 3.198 2.493 LYS 152.A N GLN 110.A OE1 LYS 152.A H 2.809 1.952 LYS 152.A NZ ASP 112.A OD2 LYS 152.A HZ2 3.116 2.226 ASN 154.A N VAL 66.A O ASN 154.A H 2.639 1.784 VAL 157.A N GLY 64.A O VAL 157.A H 2.781 1.955 LYS 158.A N THR 109.A O LYS 158.A H 2.905 2.097 PHE 159.A N PHE 62.A O PHE 159.A H 2.867 2.010 THR 160.A N VAL 107.A O THR 160.A H 2.890 2.038 VAL 162.A N PHE 105.A O VAL 162.A H 2.827 1.984 GLY 163.A N PHE 105.A O GLY 163.A H 3.001 2.159 LEU 164.A N PRO 209.A O LEU 164.A H 2.939 2.121 ASN 165.A N ARG 103.A O ASN 165.A H 2.788 1.958 GLU 168.A N ASP 166.A OD1 GLU 168.A H 2.988 2.256 PHE 170.A N THR 167.A O PHE 170.A H 3.121 2.289 ASN 171.A N GLN 101.A O ASN 171.A H 2.920 2.143 ASN 171.A ND2 GLN 101.A OE1 ASN 171.A HD22 3.020 2.217 GLN 172.A NE2 ASP 220.A OD2 GLN 172.A HE22 2.901 2.108 VAL 174.A N ASN 171.A O VAL 174.A H 3.138 2.283 ARG 177.A NH2.A ASN 183.A O no hydrogen 2.377 N/A ARG 177.A NH2.B VAL 175.A O no hydrogen 2.931 N/A TYR 178.A N ASN 185.A OD1 TYR 178.A H 2.999 2.266 GLY 180.A N ARG 177.A O GLY 180.A H 2.925 2.072 ASN 183.A N GLY 180.A O ASN 183.A H 3.249 2.410 ASN 183.A ND2 ALA 179.A O ASN 183.A HD22 3.007 2.158 ASN 185.A ND2 PRO 176.A O ASN 185.A HD21 2.860 2.017 THR 186.A OG1 ASN 187.A OD1 THR 186.A HG1 3.328 2.758 ALA 189.A N GLN 38.A OE1 ALA 189.A H 2.809 2.012 VAL 192.A N VAL 35.A O VAL 192.A H 2.863 2.045 GLU 199.A N PHE 196.A O GLU 199.A H 3.020 2.177 ARG 200.A N VAL 269.A O ARG 200.A H 2.929 2.137 ARG 200.A NE SER 271.A O ARG 200.A HE 2.804 1.978 ARG 200.A NH1 SER 28.A O ARG 200.A HH11 2.812 1.989 ARG 200.A NH1 ASN 30.A OD1 ARG 200.A HH12 2.827 2.008 ARG 200.A NH2 ASN 30.A OD1 ARG 200.A HH22 3.128 2.411 LEU 202.A N MET 267.A O LEU 202.A H 2.984 2.142 PHE 203.A N TYR 26.A O PHE 203.A H 2.757 1.903 PHE 204.A N CYS 221.A O PHE 204.A H 2.986 2.137 ARG 205.A N GLN 24.A O ARG 205.A H 2.744 1.889 ARG 205.A NE ASP 220.A OD1 ARG 205.A HE 2.739 1.884 ARG 205.A NH1 TYR 207.A OH ARG 205.A HH11 3.379 2.525 ARG 205.A NH2 ASP 220.A OD2 ARG 205.A HH21 2.940 2.115 SER 206.A N ILE 219.A O SER 206.A H 3.038 2.191 SER 206.A OG SER 21.A O SER 206.A HG 2.702 2.107 TYR 207.A N ASP 23.A OD2 TYR 207.A H 2.823 1.987 TYR 207.A OH GLN 24.A OE1 TYR 207.A HH 2.831 2.031 LEU 208.A N PRO 217.A O LEU 208.A H 2.928 2.195 LYS 211.A N LEU 164.A O LYS 211.A H 2.984 2.193 GLY 212.A N ASN 165.A O GLY 212.A H 3.232 2.591 ILE 219.A N SER 206.A O ILE 219.A H 2.931 2.117 ASP 220.A N GLN 172.A OE1 ASP 220.A H 2.828 1.971 CYS 221.A N PHE 204.A O CYS 221.A H 2.886 2.035 CYS 221.A SG PHE 204.A O CYS 221.A HG 3.563 2.500 GLN 225.A N SER 14.A O GLN 225.A H 2.893 2.078 GLN 225.A NE2 GLN 53.A O GLN 225.A HE22 3.008 2.209 GLN 225.A NE2 LEU 54.A O GLN 225.A HE21 2.955 2.166 GLU 226.A N GLU 226.A OE1 GLU 226.A H 2.773 2.016 TRP 227.A N PRO 224.A O TRP 227.A H 2.974 2.326 VAL 228.A N PRO 224.A O VAL 228.A H 3.249 2.427 GLN 229.A N GLN 225.A O GLN 229.A H 2.954 2.138 GLN 229.A NE2 LEU 54.A O GLN 229.A HE21 2.806 2.023 HIS 230.A N GLU 226.A O HIS 230.A H 2.926 2.113 HIS 230.A NE2 THR 4.A OG1 HIS 230.A HE2 2.896 2.051 PHE 231.A N TRP 227.A O PHE 231.A H 2.834 1.991 TYR 232.A N VAL 228.A O TYR 232.A H 3.060 2.215 GLN 233.A N GLN 229.A O GLN 233.A H 3.042 2.223 GLU 234.A N HIS 230.A O GLU 234.A H 2.932 2.111 ALA 235.A N PHE 231.A O ALA 235.A H 2.930 2.084 SER 240.A OG VAL 291.A O SER 240.A HG 2.567 1.871 VAL 242.A N SER 240.A OG VAL 242.A H 3.053 2.231 ALA 243.A N LEU 261.A O ALA 243.A H 2.780 1.923 LEU 244.A N SER 289.A O LEU 244.A H 2.692 1.876 VAL 245.A N ALA 259.A O VAL 245.A H 3.006 2.148 ARG 246.A N ARG 286.A O ARG 246.A H 2.989 2.165 TYR 247.A N PHE 257.A O TYR 247.A H 2.899 2.069 ILE 248.A N TYR 284.A O ILE 248.A H 2.779 1.921 ASN 249.A N ARG 254.A O ASN 249.A H 2.940 2.109 ASP 251.A N ASN 249.A OD1 ASP 251.A H 3.355 2.625 GLY 253.A N ASN 249.A O GLY 253.A H 2.577 1.772 ARG 254.A N THR 252.A OG1 ARG 254.A H 3.151 2.296 LEU 256.A N TYR 247.A O LEU 256.A H 2.786 1.937 ALA 259.A N VAL 245.A O ALA 259.A H 2.890 2.073 LYS 260.A N THR 268.A O LYS 260.A H 2.907 2.092 LYS 260.A NZ GLU 199.A OE2 LYS 260.A HZ2 2.818 1.949 LYS 260.A NZ TYR 295.A O LYS 260.A HZ1 2.719 1.997 LEU 261.A N ALA 243.A O LEU 261.A H 2.741 1.883 HIS 262.A N PHE 266.A O HIS 262.A H 2.788 1.940 HIS 262.A NE2 THR 268.A OG1 HIS 262.A HE2 2.849 1.992 ARG 263.A N GLU 241.A O ARG 263.A H 2.887 2.098 ARG 263.A NH1 SER 238.A O ARG 263.A HH12 3.454 2.931 GLY 265.A N HIS 262.A O GLY 265.A H 2.825 2.023 THR 268.A N LYS 260.A O THR 268.A H 2.985 2.209 VAL 269.A N ARG 200.A O VAL 269.A H 2.961 2.151 SER 271.A N GLY 198.A O SER 271.A H 3.303 2.566 SER 271.A OG THR 273.A O SER 271.A HG 3.113 2.642 SER 274.A OG THR 27.A O SER 274.A HG 2.866 2.034 ALA 275.A N THR 27.A OG1 ALA 275.A H 2.989 2.205 VAL 277.A N MET 25.A O VAL 277.A H 2.862 2.016 ASN 282.A ND2 ASN 249.A OD1 ASN 282.A HD21 3.370 2.644 ASN 282.A ND2 ASP 251.A OD2 ASN 282.A HD21 2.915 2.294 GLY 283.A N PRO 280.A O GLY 283.A H 3.165 2.311 TYR 284.A N ILE 248.A O TYR 284.A H 3.181 2.409 ARG 286.A N ARG 246.A O ARG 286.A H 2.826 2.050 ASP 288.A N LEU 244.A O ASP 288.A H 2.858 2.016 SER 289.A N LEU 244.A O SER 289.A H 3.389 2.602 SER 289.A OG ASP 288.A OD2 SER 289.A HG 3.235 2.497 VAL 291.A N VAL 242.A O VAL 291.A H 2.890 2.073 PHE 294.A N ASN 292.A OD1 PHE 294.A H 2.561 1.787 TYR 295.A N ASN 292.A O TYR 295.A H 3.084 2.259 TYR 295.A OH GLU 258.A OE1 TYR 295.A HH 3.335 2.601 ALA 298.A N GLU 258.A OE2 ALA 298.A H 2.793 1.951 MET 300.A N SER 270.A O MET 300.A H 3.107 2.326