Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4s1q_G.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 2.A NE1 GLU 48.A OE2 TRP 2.A HE1 2.654 1.944 LYS 3.A N GLN 342.A O LYS 3.A H 3.178 2.405 ALA 5.A N VAL 340.A O ALA 5.A H 3.136 2.290 LEU 9.A N GLN 60.A OE1 LEU 9.A H 3.035 2.220 PHE 10.A N CYS 102.A O PHE 10.A H 2.954 2.164 ALA 12.A N HIS 100.A O ALA 12.A H 2.783 2.015 SER 13.A N VAL 32.A O SER 13.A H 3.168 2.394 ALA 15.A N SER 13.A OG ALA 15.A H 3.344 2.578 LYS 16.A N ASN 24.A OD1 LYS 16.A H 2.853 2.004 GLU 19.A N LYS 16.A O GLU 19.A H 3.012 2.218 GLU 21.A N GLU 19.A OE1 GLU 21.A H 3.254 2.433 VAL 22.A N SER 93.A O VAL 22.A H 2.987 2.145 HIS 23.A N GLU 21.A OE2 HIS 23.A H 3.218 2.362 HIS 23.A ND1 GLU 21.A OE2 HIS 23.A HD1 2.774 1.929 ASN 24.A N GLU 21.A OE1 ASN 24.A H 2.838 2.048 ASN 24.A ND2 GLU 21.A OE1 ASN 24.A HD22 3.101 2.330 VAL 25.A N GLU 21.A O VAL 25.A H 2.991 2.172 TRP 26.A N VAL 22.A O TRP 26.A H 3.004 2.162 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 2.836 1.997 THR 28.A N ASN 24.A O THR 28.A H 2.865 2.095 THR 28.A OG1 ASN 24.A O THR 28.A HG1 2.618 1.799 ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 2.893 2.095 CYS 31.A N ALA 27.A O CYS 31.A H 2.812 2.000 VAL 32.A N CYS 11.A O VAL 32.A H 3.135 2.316 ASN 37.A N ASP 35.A OD1 ASN 37.A H 2.849 2.200 ILE 41.A N SER 128.A O ILE 41.A H 3.037 2.181 LEU 43.A N VAL 126.A O LEU 43.A H 3.021 2.162 GLU 48.A N CYS 123.A O GLU 48.A H 3.105 2.285 PHE 50.A N GLY 121.A O PHE 50.A H 2.936 2.092 MET 52.A N GLY 119.A O MET 52.A H 3.025 2.243 TRP 53.A N ASN 51.A OD1 TRP 53.A H 3.049 2.303 LYS 54.A N ASN 51.A O LYS 54.A H 3.081 2.313 ASN 55.A ND2 LEU 335.A O ASN 55.A HD22 3.361 2.898 MET 57.A N ASN 55.A OD1 MET 57.A H 3.201 2.369 VAL 58.A N ASN 55.A O VAL 58.A H 3.205 2.422 GLU 59.A N ASN 56.A O GLU 59.A H 2.912 2.305 GLN 60.A N ASN 56.A O no hydrogen 3.225 N/A MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 3.149 2.315 GLN 62.A N VAL 58.A O GLN 62.A H 3.034 2.176 GLU 63.A N GLU 59.A O GLU 63.A H 3.169 2.388 ASP 64.A N GLN 60.A O ASP 64.A H 3.016 2.250 VAL 65.A N MET 61.A O VAL 65.A H 2.909 2.076 ILE 66.A N GLN 62.A O ILE 66.A H 2.936 2.116 SER 67.A N GLU 63.A O SER 67.A H 2.909 2.068 LEU 68.A N ASP 64.A O LEU 68.A H 2.852 2.059 TRP 69.A N VAL 65.A O TRP 69.A H 3.010 2.163 ASP 70.A N ILE 66.A O ASP 70.A H 2.900 2.107 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 3.156 2.495 GLN 71.A N LEU 68.A O GLN 71.A H 3.161 2.428 SER 72.A N LEU 68.A O SER 72.A H 3.227 2.554 LEU 73.A N TRP 69.A O LEU 73.A H 2.859 2.041 GLN 74.A NE2 ASP 70.A O GLN 74.A HE21 2.778 1.960 CYS 76.A N MET 286.A O CYS 76.A H 2.691 2.042 VAL 77.A N MET 286.A O VAL 77.A H 3.218 2.431 LYS 78.A N ILE 85.A O LYS 78.A H 3.321 2.583 LYS 78.A NZ GLN 74.A OE1 LYS 78.A HZ3 3.090 2.533 THR 80.A N SER 83.A O THR 80.A H 2.957 2.107 SER 83.A N THR 80.A O SER 83.A H 3.333 2.508 ILE 85.A N LYS 78.A O ILE 85.A H 2.885 2.066 GLN 87.A N CYS 76.A O GLN 87.A H 2.980 2.151 GLN 87.A NE2 GLN 74.A OE1 GLN 87.A HE22 2.855 1.997 GLN 87.A NE2 PRO 75.A O GLN 87.A HE21 3.597 3.125 CYS 89.A SG GLN 87.A O no hydrogen 4.023 N/A LYS 91.A NZ GLU 241.A OE2 LYS 91.A HZ2 3.014 2.157 LYS 91.A NZ ALA 288.A O LYS 91.A HZ1 3.110 2.405 LYS 91.A NZ PRO 289.A O LYS 91.A HZ1 2.815 2.144 ASP 95.A N GLU 21.A OE2 ASP 95.A H 2.563 1.786 ILE 99.A N ILE 135.A O ILE 99.A H 2.806 1.958 HIS 100.A N ALA 12.A O HIS 100.A H 2.721 1.877 HIS 100.A ND1 THR 132.A O HIS 100.A HD1 3.132 2.384 TYR 101.A N THR 132.A OG1 TYR 101.A H 3.049 2.200 TYR 101.A OH ASP 64.A OD2 TYR 101.A HH 3.033 2.358 CYS 102.A N PHE 10.A O CYS 102.A H 2.697 1.914 THR 103.A N GLN 130.A O THR 103.A H 3.266 2.468 THR 103.A OG1 GLN 130.A OE1 THR 103.A HG1 2.805 2.287 TYR 107.A N PRO 104.A O TYR 107.A H 3.407 2.571 VAL 108.A N VAL 341.A O VAL 108.A H 3.027 2.262 ILE 109.A N VAL 129.A O ILE 109.A H 3.056 2.256 LEU 110.A N LYS 339.A O LEU 110.A H 2.930 2.115 LYS 111.A N SER 127.A O LYS 111.A H 2.803 2.027 CYS 112.A N LYS 337.A O CYS 112.A H 2.944 2.157 ASN 113.A N ASN 125.A O ASN 113.A H 2.811 2.069 ASN 113.A ND2 ASN 125.A O ASN 113.A HD22 3.613 3.048 ASN 113.A ND2 SER 127.A OG ASN 113.A HD21 2.966 2.200 ASN 116.A ND2 GLU 152.A OE1 ASN 116.A HD21 2.942 2.131 PHE 117.A N ASP 114.A O PHE 117.A H 3.053 2.203 THR 120.A N ASN 118.A OD1 THR 120.A H 2.987 2.133 GLY 121.A N PHE 50.A O GLY 121.A H 3.053 2.275 CYS 123.A N GLU 48.A O CYS 123.A H 2.663 1.954 CYS 123.A SG ASP 114.A OD1 no hydrogen 3.107 N/A CYS 123.A SG ASN 125.A O no hydrogen 3.763 N/A ASN 125.A N ASP 114.A OD1 ASN 125.A H 3.111 2.350 VAL 126.A N LYS 124.A O VAL 126.A H 2.920 2.311 SER 127.A N LYS 111.A O SER 127.A H 3.064 2.236 SER 127.A OG GLU 40.A OE2 SER 127.A HG 2.930 2.120 SER 128.A N ILE 41.A O SER 128.A H 2.549 1.724 VAL 129.A N ILE 109.A O VAL 129.A H 2.915 2.076 THR 132.A N TYR 101.A O THR 132.A H 2.935 2.119 HIS 133.A NE2 GLU 334.A OE1 HIS 133.A HE2 2.916 2.160 ILE 135.A N ILE 99.A O ILE 135.A H 2.962 2.118 VAL 138.A N LYS 136.A O VAL 138.A H 2.881 2.164 THR 141.A N HIS 235.A O THR 141.A H 2.972 2.226 THR 141.A OG1 GLU 230.A O THR 141.A HG1 2.831 2.037 GLN 142.A NE2 ILE 231.A O GLN 142.A HE21 2.501 1.681 LEU 143.A N THR 141.A O LEU 143.A H 2.597 1.912 LEU 144.A N GLY 303.A O LEU 144.A H 3.018 2.162 ASN 146.A N ASN 300.A O ASN 146.A H 2.881 2.116 SER 148.A N GLU 334.A OE2 SER 148.A H 2.828 2.002 SER 148.A OG GLU 334.A OE1 SER 148.A HG 3.098 2.510 ALA 150.A N LEU 172.A O ALA 150.A H 2.863 2.032 GLU 153.A N ASN 116.A OD1 GLU 153.A H 3.250 2.429 ILE 155.A N HIS 171.A O ILE 155.A H 3.127 2.302 ARG 157.A N ILE 169.A O ARG 157.A H 2.801 1.965 ARG 157.A NH1 PHE 117.A O ARG 157.A HH12 3.539 2.914 ARG 157.A NH1 HIS 171.A ND1 ARG 157.A HH11 3.160 2.321 ARG 157.A NH2 PHE 117.A O ARG 157.A HH22 2.803 1.959 ASN 160.A N SER 158.A OG ASN 160.A H 3.318 2.597 ASN 163.A N ASN 160.A O ASN 163.A H 2.914 2.203 ALA 165.A N ASN 163.A OD1 ALA 165.A H 2.842 2.016 LYS 166.A N ASN 163.A O LYS 166.A H 3.121 2.285 THR 167.A OG1 GLY 324.A O THR 167.A HG1 2.510 1.986 ILE 168.A N LEU 306.A O ILE 168.A H 2.818 1.959 ILE 169.A N ARG 157.A O ILE 169.A H 2.878 2.060 VAL 170.A N ILE 304.A O VAL 170.A H 2.859 2.000 HIS 171.A N ILE 155.A O HIS 171.A H 2.814 1.960 HIS 171.A NE2 SER 148.A O HIS 171.A HE2 2.542 1.750 LEU 172.A N THR 302.A O LEU 172.A H 3.059 2.240 ASN 173.A ND2 GLU 152.A O ASN 173.A HD21 2.763 1.925 VAL 176.A N ILE 301.A O VAL 176.A H 3.334 2.545 ILE 178.A N SER 299.A O ILE 178.A H 2.763 1.929 ASN 179.A N GLU 193.A O ASN 179.A H 2.888 2.085 CYS 180.A N CYS 297.A O CYS 180.A H 3.395 2.559 THR 181.A N TYR 191.A O THR 181.A H 2.789 1.987 ARG 182.A N ILE 295.A O ARG 182.A H 2.691 1.850 ARG 182.A NE ARG 182.A O ARG 182.A HE 3.234 2.568 ARG 182.A NE GLY 293.A O ARG 182.A HE 3.421 2.759 ARG 182.A NH1 ILE 187.A O ARG 182.A HH11 2.706 1.892 ARG 182.A NH2 ILE 291.A O ARG 182.A HH22 2.611 1.904 ARG 182.A NH2 GLY 293.A O ARG 182.A HH21 2.794 1.961 ARG 188.A N ASP 186.A OD1 ARG 188.A H 2.940 2.088 ARG 188.A NE GLN 274.A OE1 ARG 188.A HE 3.353 2.726 ARG 188.A NH2 GLN 274.A OE1 ARG 188.A HH21 2.915 2.187 LYS 189.A N ASP 186.A O LYS 189.A H 3.403 2.625 ALA 190.A N CYS 270.A O ALA 190.A H 3.217 2.394 TYR 191.A N THR 181.A O TYR 191.A H 3.055 2.279 CYS 192.A N LEU 268.A O CYS 192.A H 3.112 2.313 GLU 193.A N ASN 179.A O GLU 193.A H 2.630 1.800 ILE 194.A N ILE 266.A O ILE 194.A H 2.851 2.069 GLY 196.A N GLY 264.A O GLY 196.A H 2.978 2.296 THR 197.A OG1 ASN 263.A O THR 197.A HG1 2.501 1.939 TRP 199.A N ASN 195.A O TRP 199.A H 2.899 2.050 TRP 199.A NE1 LEU 250.A O TRP 199.A HE1 2.398 1.641 ASN 200.A N GLY 196.A O ASN 200.A H 2.912 2.059 LYS 201.A N THR 197.A O LYS 201.A H 3.216 2.423 VAL 202.A N LYS 198.A O VAL 202.A H 3.111 2.296 LEU 203.A N TRP 199.A O LEU 203.A H 2.757 1.924 LYS 204.A N ASN 200.A O LYS 204.A H 3.122 2.369 LYS 204.A NZ ILE 256.A O LYS 204.A HZ3 3.566 2.869 LYS 204.A NZ GLY 257.A O LYS 204.A HZ3 3.289 2.522 LYS 204.A NZ ASN 258.A OD1 LYS 204.A HZ1 3.084 2.492 GLN 205.A N LYS 201.A O GLN 205.A H 3.288 2.484 VAL 206.A N VAL 202.A O VAL 206.A H 3.090 2.311 THR 207.A N LEU 203.A O THR 207.A H 3.211 2.418 THR 207.A OG1 LYS 204.A O THR 207.A HG1 2.460 1.832 GLU 208.A N LYS 204.A O GLU 208.A H 3.233 2.396 LYS 209.A N GLN 205.A O LYS 209.A H 3.038 2.245 LYS 209.A NZ ILE 154.A O LYS 209.A HZ3 2.865 2.289 LEU 210.A N VAL 206.A O LEU 210.A H 2.869 2.143 LYS 211.A N THR 207.A O LYS 211.A H 2.774 2.046 LYS 211.A NZ GLU 208.A OE1 LYS 211.A HZ2 2.944 2.260 GLU 212.A N GLU 208.A O no hydrogen 3.403 N/A HIS 213.A N LEU 210.A O HIS 213.A H 3.132 2.408 HIS 213.A ND1 LYS 209.A O HIS 213.A HD1 3.228 2.381 PHE 214.A N LEU 210.A O PHE 214.A H 2.982 2.318 PHE 214.A N LYS 211.A O PHE 214.A H 3.282 2.627 ASN 216.A N LYS 211.A O ASN 216.A H 2.779 1.922 LYS 217.A N PHE 214.A O LYS 217.A H 3.364 2.542 ILE 220.A N GLU 318.A O no hydrogen 3.001 N/A PHE 221.A N ASN 253.A OD1 PHE 221.A H 3.044 2.202 GLN 222.A N PHE 320.A O GLN 222.A H 2.978 2.219 GLN 222.A NE2 PHE 221.A O GLN 222.A HE21 2.735 1.992 GLU 230.A N GLU 230.A OE1 GLU 230.A H 2.666 1.925 ILE 231.A N ASP 228.A O ILE 231.A H 2.985 2.133 THR 232.A N ASP 228.A O THR 232.A H 3.153 2.308 MET 233.A N LEU 229.A O MET 233.A H 3.121 2.497 HIS 234.A N CYS 245.A O HIS 234.A H 2.848 2.030 HIS 234.A ND1 THR 141.A O HIS 234.A HD1 3.076 2.310 HIS 235.A N THR 141.A OG1 HIS 235.A H 2.984 2.173 HIS 235.A ND1 PHE 243.A O HIS 235.A HD1 3.185 2.440 PHE 236.A N PHE 243.A O PHE 236.A H 3.320 2.518 CYS 238.A N GLU 241.A O CYS 238.A H 2.815 1.976 ARG 239.A NE ASN 296.A O ARG 239.A HE 3.380 2.659 ARG 239.A NH2 ASP 95.A OD2 ARG 239.A HH22 2.827 2.175 GLY 240.A N ASN 237.A OD1 GLY 240.A H 3.128 2.517 GLU 241.A N CYS 238.A O GLU 241.A H 2.998 2.154 PHE 243.A N PHE 236.A O PHE 243.A H 2.803 1.964 TYR 244.A N LYS 271.A O TYR 244.A H 2.938 2.272 TYR 244.A OH GLU 230.A OE2 TYR 244.A HH 2.542 1.826 CYS 245.A N HIS 234.A O CYS 245.A H 2.951 2.111 ASN 246.A N PRO 269.A O ASN 246.A H 2.888 2.085 THR 247.A OG1 GLN 142.A OE1 THR 247.A HG1 2.767 2.067 THR 248.A N ASN 246.A OD1 THR 248.A H 2.736 1.929 THR 248.A OG1 ASN 246.A OD1 THR 248.A HG1 2.491 1.728 GLN 249.A NE2 THR 267.A O GLN 249.A HE22 2.504 1.699 LEU 250.A N THR 247.A O LEU 250.A H 3.076 2.326 ASN 253.A ND2 PHE 221.A O ASN 253.A HD21 2.615 1.814 CYS 255.A SG THR 254.A OG1 no hydrogen 3.700 N/A ILE 256.A N ASN 253.A O ILE 256.A H 3.095 2.240 CYS 262.A SG LYS 260.A O no hydrogen 3.818 N/A ILE 266.A N ILE 194.A O ILE 266.A H 2.705 1.850 LEU 268.A N CYS 192.A O LEU 268.A H 2.826 1.993 CYS 270.A N ALA 190.A O CYS 270.A H 3.086 2.313 CYS 270.A SG LEU 268.A O no hydrogen 3.391 N/A LYS 271.A N TYR 244.A O LYS 271.A H 2.963 2.284 ILE 272.A N ARG 188.A O ILE 272.A H 2.942 2.114 LYS 273.A N PHE 242.A O LYS 273.A H 3.173 2.379 ILE 276.A N ALA 285.A O ILE 276.A H 2.953 2.130 ASN 277.A N GLU 230.A OE2 ASN 277.A H 3.091 2.256 ASN 277.A ND2 GLU 230.A OE1 ASN 277.A HD22 3.247 2.425 MET 278.A N GLY 283.A O MET 278.A H 3.002 2.157 GLN 280.A N GLN 280.A OE1 GLN 280.A H 2.601 1.886 GLY 281.A N MET 278.A O GLY 281.A H 3.198 2.358 GLN 284.A NE2 ASN 277.A OD1 GLN 284.A HE21 3.614 2.909 ALA 285.A N ILE 276.A O ALA 285.A H 2.825 1.991 MET 286.A N VAL 77.A O MET 286.A H 2.894 2.119 TYR 287.A N GLN 274.A O TYR 287.A H 2.835 2.019 TYR 287.A OH LEU 73.A O TYR 287.A HH 2.793 1.999 ILE 295.A N ARG 182.A O ILE 295.A H 3.164 2.423 ASN 296.A ND2 ASN 179.A OD1 ASN 296.A HD21 3.070 2.345 ASN 296.A ND2 THR 181.A OG1 ASN 296.A HD22 2.774 2.031 CYS 297.A N CYS 180.A O CYS 297.A H 3.234 2.433 SER 299.A N ILE 178.A O SER 299.A H 2.949 2.106 ASN 300.A N ASN 146.A OD1 ASN 300.A H 3.345 2.510 ILE 301.A N VAL 176.A O ILE 301.A H 2.940 2.090 THR 302.A N LEU 144.A O THR 302.A H 2.871 2.041 ILE 304.A N VAL 170.A O ILE 304.A H 3.019 2.246 LEU 305.A N GLN 142.A O LEU 305.A H 2.883 2.024 LEU 306.A N ILE 168.A O LEU 306.A H 2.817 2.022 THR 307.A N ARG 321.A O THR 307.A H 2.987 2.171 THR 307.A OG1 GLY 323.A O THR 307.A HG1 3.254 2.447 ARG 308.A NH1 GLU 318.A OE1 ARG 308.A HH11 3.460 2.619 ARG 308.A NH2 LEU 161.A O ARG 308.A HH21 3.124 2.436 ASP 309.A N THR 319.A O ASP 309.A H 2.967 2.141 THR 315.A N ASN 313.A OD1 THR 315.A H 3.008 2.164 THR 315.A OG1 ASN 313.A OD1 THR 315.A HG1 2.750 1.998 GLU 318.A N THR 218.A O GLU 318.A H 2.884 2.136 PHE 320.A N ILE 220.A O PHE 320.A H 2.849 2.040 ARG 321.A N THR 307.A O ARG 321.A H 2.967 2.147 ARG 321.A NE ASP 309.A OD1 ARG 321.A HE 3.012 2.232 ARG 321.A NE ASP 309.A OD2 ARG 321.A HE 3.114 2.334 ARG 321.A NH1 PRO 223.A O ARG 321.A HH11 2.716 1.972 ARG 321.A NH2 ASP 309.A OD2 ARG 321.A HH21 3.040 2.253 GLY 323.A N LEU 305.A O GLY 323.A H 3.077 2.383 LYS 328.A NZ GLU 59.A OE1 LYS 328.A HZ3 2.793 2.046 ASP 329.A N ASN 326.A O ASP 329.A H 3.101 2.301 ASN 330.A N ILE 327.A O ASN 330.A H 2.885 2.145 ASN 330.A ND2 VAL 138.A O ASN 330.A HD22 3.606 2.752 ASN 330.A ND2 SER 140.A O ASN 330.A HD21 2.973 2.148 TRP 331.A N LYS 328.A O TRP 331.A H 3.021 2.395 TRP 331.A NE1 GLN 62.A OE1 TRP 331.A HE1 2.745 1.961 ARG 332.A N LYS 328.A O ARG 332.A H 2.920 2.119 ARG 332.A NH1 ASP 329.A OD1 ARG 332.A HH11 2.860 2.185 SER 333.A N ASP 329.A O SER 333.A H 3.063 2.359 GLU 334.A N TRP 331.A O GLU 334.A H 3.149 2.316 LEU 335.A N TRP 331.A O LEU 335.A H 3.009 2.216 TYR 338.A N LEU 335.A O TYR 338.A H 3.035 2.180 LYS 339.A N LEU 110.A O LYS 339.A H 3.193 2.461 LYS 339.A NZ ASP 4.A OD2 LYS 339.A HZ2 3.399 2.552 LYS 339.A NZ GLU 48.A OE1 LYS 339.A HZ1 2.890 2.105 LYS 339.A NZ ASN 49.A O LYS 339.A HZ3 2.878 2.098 VAL 341.A N VAL 108.A O VAL 341.A H 2.971 2.125 GLN 342.A N LYS 3.A O GLN 342.A H 2.863 2.037 ILE 343.A N GLY 106.A O ILE 343.A H 2.906 2.048 GLU 344.A N VAL 1.A O GLU 344.A H 3.367 2.551