Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4u0j_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 3.A N GLN 31.A OE1 LEU 3.A H 2.878 2.026 LEU 4.A N GLN 31.A O LEU 4.A H 2.851 2.053 ASP 5.A N GLY 2.A O no hydrogen 3.254 N/A LYS 7.A N LEU 4.A O LYS 7.A H 2.997 2.155 LYS 7.A NZ ASP 247.A OD1 LYS 7.A HZ1 2.901 2.087 ARG 8.A N ASP 88.A OD2 ARG 8.A H 2.952 2.119 ILE 9.A N GLN 34.A O ILE 9.A H 2.931 2.122 LEU 10.A N GLY 89.A O LEU 10.A H 2.885 2.064 VAL 11.A N VAL 36.A O VAL 11.A H 2.838 2.038 SER 12.A N VAL 91.A O SER 12.A H 3.035 2.183 SER 12.A OG VAL 91.A O SER 12.A HG 2.781 1.947 ILE 15.A N SER 19.A OG ILE 15.A H 2.973 2.125 THR 16.A N SER 19.A OG THR 16.A H 2.995 2.140 SER 18.A N THR 16.A OG1 SER 18.A H 2.918 2.093 SER 18.A OG THR 16.A OG1 SER 18.A HG 2.847 2.069 SER 19.A N THR 16.A O SER 19.A H 3.194 2.358 PHE 22.A N SER 19.A O PHE 22.A H 2.939 2.252 ILE 24.A N ILE 20.A O ILE 24.A H 2.930 2.099 ALA 25.A N ALA 21.A O ALA 25.A H 2.929 2.087 ARG 26.A N PHE 22.A O ARG 26.A H 2.909 2.085 ARG 26.A NH1 GLU 30.A OE2 ARG 26.A HH11 3.006 2.209 ARG 26.A NH2 HIS 23.A ND1 ARG 26.A HH21 3.144 2.285 ARG 26.A NH2 THR 235.A OG1 ARG 26.A HH22 3.088 2.385 VAL 27.A N HIS 23.A O VAL 27.A H 2.990 2.134 ALA 28.A N ILE 24.A O ALA 28.A H 2.893 2.052 GLN 29.A N ALA 25.A O GLN 29.A H 2.972 2.137 GLN 29.A NE2 ALA 55.A O GLN 29.A HE22 3.028 2.263 GLU 30.A N ARG 26.A O GLU 30.A H 2.902 2.077 GLN 31.A N VAL 27.A O GLN 31.A H 2.987 2.278 GLN 31.A N ALA 28.A O GLN 31.A H 3.152 2.518 GLY 32.A N GLN 29.A O GLY 32.A H 3.012 2.159 ALA 33.A N ALA 28.A O ALA 33.A H 2.959 2.117 GLN 34.A N LYS 7.A O GLN 34.A H 2.852 2.005 VAL 36.A N ILE 9.A O VAL 36.A H 3.014 2.202 LEU 37.A N PRO 58.A O LEU 37.A H 2.835 1.979 THR 38.A N VAL 11.A O THR 38.A H 3.023 2.228 GLY 39.A N LEU 60.A O GLY 39.A H 2.880 2.107 ARG 42.A N PHE 40.A O ARG 42.A H 2.747 2.018 ILE 46.A N ARG 42.A O ILE 46.A H 2.977 2.152 GLN 47.A N LEU 43.A O GLN 47.A H 2.893 2.061 GLN 47.A NE2 GLN 47.A O GLN 47.A HE21 3.320 2.767 GLN 47.A NE2 ASP 51.A OD2 GLN 47.A HE21 3.095 2.283 ARG 48.A N ARG 44.A O ARG 48.A H 3.072 2.252 ILE 49.A N LEU 45.A O ILE 49.A H 2.933 2.106 THR 50.A N ILE 46.A O THR 50.A H 2.850 2.024 THR 50.A OG1 ILE 46.A O THR 50.A HG1 2.907 2.117 THR 50.A OG1 GLN 47.A O THR 50.A HG1 3.253 2.777 ASP 51.A N GLN 47.A O ASP 51.A H 2.903 2.226 ARG 52.A N ILE 49.A O ARG 52.A H 3.123 2.278 ARG 52.A NH1 ARG 48.A O ARG 52.A HH11 2.989 2.206 LEU 53.A N THR 50.A O LEU 53.A H 3.029 2.199 ALA 55.A N GLN 29.A OE1 ALA 55.A H 2.923 2.123 LEU 60.A N LEU 37.A O LEU 60.A H 2.793 1.955 LEU 62.A N GLY 39.A O LEU 62.A H 2.863 2.017 ASP 63.A N HIS 69.A ND1 ASP 63.A H 3.055 2.203 GLN 65.A N ASP 63.A OD1 GLN 65.A H 2.959 2.124 GLN 65.A NE2 HIS 120.A ND1 GLN 65.A HE21 3.095 2.236 ASN 66.A N ASP 63.A O ASN 66.A H 2.853 2.013 GLU 68.A N ASN 66.A OD1 GLU 68.A H 2.802 2.203 HIS 69.A N ASN 66.A OD1 HIS 69.A H 3.086 2.294 LEU 70.A N ASN 66.A O LEU 70.A H 3.151 2.335 ALA 71.A N GLU 67.A O ALA 71.A H 2.943 2.152 SER 72.A N GLU 68.A O SER 72.A H 3.085 2.334 SER 72.A OG GLU 68.A O SER 72.A HG 3.265 2.551 SER 72.A OG HIS 69.A O SER 72.A HG 3.289 2.646 LEU 73.A N LEU 70.A O LEU 73.A H 3.317 2.505 ARG 76.A N SER 72.A O ARG 76.A H 3.073 2.253 ARG 76.A NE SER 72.A OG ARG 76.A HE 2.838 2.110 ARG 76.A NH1 GLU 61.A O ARG 76.A HH12 2.735 1.934 ARG 76.A NH2 GLU 61.A O ARG 76.A HH22 3.026 2.327 ARG 76.A NH2 HIS 69.A O ARG 76.A HH21 2.960 2.193 ARG 76.A NH2 SER 72.A OG ARG 76.A HH21 3.415 2.840 VAL 77.A N LEU 73.A O VAL 77.A H 2.854 2.031 THR 78.A N ALA 74.A O THR 78.A H 2.925 2.092 THR 78.A OG1 ALA 74.A O THR 78.A HG1 3.020 2.266 GLU 79.A N GLY 75.A O GLU 79.A H 2.993 2.146 ALA 80.A N ARG 76.A O ALA 80.A H 3.105 2.347 ILE 81.A N VAL 77.A O ILE 81.A H 2.869 2.106 GLY 82.A N THR 78.A O GLY 82.A H 2.612 1.935 ASN 85.A N GLY 82.A O ASN 85.A H 3.018 2.196 ASN 85.A ND2 ILE 81.A O ASN 85.A HD22 2.809 2.020 ASN 85.A ND2 GLY 82.A O ASN 85.A HD22 3.386 2.855 LYS 86.A NZ PRO 135.A O LYS 86.A HZ3 3.263 2.700 LEU 87.A N ILE 136.A O LEU 87.A H 2.861 2.048 ASP 88.A N ARG 8.A O ASP 88.A H 2.684 1.868 GLY 89.A N ARG 8.A O GLY 89.A H 3.126 2.449 VAL 90.A N SER 142.A O VAL 90.A H 2.927 2.142 VAL 91.A N LEU 10.A O VAL 91.A H 2.780 1.964 HIS 92.A N VAL 144.A O HIS 92.A H 2.743 1.908 HIS 92.A NE2 SER 125.A OG HIS 92.A HE2 2.893 2.034 SER 93.A N SER 12.A OG SER 93.A H 3.159 2.370 PHE 96.A N SER 122.A OG PHE 96.A H 2.992 2.145 THR 100.A OG1 ASP 114.A OD2 THR 100.A HG1 2.570 1.893 GLY 101.A N PRO 98.A O GLY 101.A H 2.863 2.018 MET 102.A N GLN 99.A O MET 102.A H 3.245 2.390 GLY 103.A N ALA 156.A O GLY 103.A H 2.795 2.013 ILE 104.A N LEU 206.A O ILE 104.A H 3.107 2.289 ASN 105.A ND2.A THR 100.A O ASN 105.A HD22.A 2.556 1.829 ASN 105.A ND2.B GLN 99.A O ASN 105.A HD22.B 2.811 2.113 ASP 109.A N PRO 106.A O ASP 109.A H 2.913 2.110 ASP 114.A N PRO 111.A O ASP 114.A H 3.012 2.364 VAL 115.A N PRO 111.A O VAL 115.A H 3.232 2.402 SER 116.A N TYR 112.A O SER 116.A H 2.728 1.874 LYS 117.A N ALA 113.A O LYS 117.A H 3.119 2.316 GLY 118.A N ASP 114.A O GLY 118.A H 3.066 2.233 ILE 119.A N VAL 115.A O ILE 119.A H 2.854 2.037 HIS 120.A N SER 116.A O HIS 120.A H 2.866 2.065 ILE 121.A N LYS 117.A O ILE 121.A H 3.069 2.231 SER 122.A N GLY 118.A O SER 122.A H 2.873 2.085 SER 122.A OG GLY 118.A O SER 122.A HG 2.894 2.282 ALA 123.A N ILE 119.A O ALA 123.A H 2.894 2.102 TYR 124.A N ILE 119.A O TYR 124.A H 3.009 2.192 SER 125.A N HIS 120.A O SER 125.A H 3.020 2.343 TYR 126.A N ALA 123.A O TYR 126.A H 3.029 2.224 TYR 126.A OH SER 185.A OG TYR 126.A HH 2.838 2.023 SER 128.A N TYR 124.A O SER 128.A H 3.050 2.253 MET 129.A N SER 125.A O MET 129.A H 2.896 2.084 ALA 130.A N TYR 126.A O ALA 130.A H 3.192 2.363 LYS 131.A N ALA 127.A O LYS 131.A H 2.841 2.008 ALA 132.A N SER 128.A O ALA 132.A H 3.046 2.228 LEU 133.A N MET 129.A O LEU 133.A H 2.936 2.249 LEU 133.A N ALA 130.A O LEU 133.A H 3.268 2.614 LEU 134.A N ALA 130.A O LEU 134.A H 2.900 2.052 ILE 136.A N LEU 133.A O ILE 136.A H 2.842 2.037 MET 137.A N LEU 134.A O MET 137.A H 3.015 2.190 ASN 138.A N LEU 87.A O ASN 138.A H 2.853 2.031 ASN 138.A ND2 ASP 88.A OD1 ASN 138.A HD21 3.059 2.215 GLY 140.A N GLY 182.A O GLY 140.A H 2.763 1.956 GLY 141.A N ASN 138.A O GLY 141.A H 3.011 2.318 SER 142.A N ASP 88.A O SER 142.A H 2.981 2.300 SER 142.A OG LEU 244.A O SER 142.A HG 2.697 1.904 ILE 143.A N ARG 184.A O ILE 143.A H 2.796 1.956 VAL 144.A N VAL 90.A O VAL 144.A H 2.840 2.018 GLY 145.A N ASN 186.A O GLY 145.A H 3.005 2.210 MET 146.A N HIS 92.A O MET 146.A H 3.157 2.547 ASP 147.A N VAL 188.A O ASP 147.A H 2.788 1.959 SER 151.A N ASP 149.A OD1 SER 151.A H 3.049 2.203 SER 151.A OG ASP 149.A OD1 SER 151.A HG 2.767 2.111 TYR 157.A N PRO 155.A O TYR 157.A H 2.799 2.092 ASN 158.A ND2 GLY 103.A O ASN 158.A HD21 3.406 2.880 TRP 159.A N GLY 101.A O TRP 159.A H 2.912 2.104 TRP 159.A NE1 PHE 107.A O TRP 159.A HE1 2.837 1.983 MET 160.A N TYR 157.A O MET 160.A H 2.860 2.205 THR 161.A N ASN 158.A O THR 161.A H 3.074 2.439 THR 161.A OG1 ASN 158.A O THR 161.A HG1 2.809 2.101 ALA 163.A N TRP 159.A O ALA 163.A H 2.945 2.128 LYS 164.A N MET 160.A O LYS 164.A H 2.879 2.086 LYS 164.A NZ MET 146.A O LYS 164.A HZ2 2.800 1.968 SER 165.A N THR 161.A O SER 165.A H 2.895 2.074 ALA 166.A N VAL 162.A O ALA 166.A H 2.941 2.111 LEU 167.A N ALA 163.A O LEU 167.A H 2.866 2.060 GLU 168.A N LYS 164.A O GLU 168.A H 2.971 2.164 SER 169.A N SER 165.A O SER 169.A H 3.295 2.501 VAL 170.A N ALA 166.A O VAL 170.A H 2.845 2.004 ASN 171.A N LEU 167.A O ASN 171.A H 2.830 2.001 ASN 171.A ND2 ASP 255.A O ASN 171.A HD21 3.116 2.506 ARG 172.A N GLU 168.A O no hydrogen 3.346 N/A PHE 173.A N SER 169.A O no hydrogen 3.367 N/A VAL 174.A N VAL 170.A O VAL 174.A H 2.799 1.979 ALA 175.A N ASN 171.A O ALA 175.A H 2.946 2.145 GLU 177.A N PHE 173.A O GLU 177.A H 3.304 2.500 ALA 178.A N VAL 174.A O ALA 178.A H 2.779 1.931 GLY 179.A N ALA 175.A O GLY 179.A H 2.968 2.172 LYS 180.A N GLU 177.A O LYS 180.A H 3.106 2.360 LYS 180.A NZ GLU 177.A OE1 LYS 180.A HZ2 2.886 2.019 TYR 181.A N ALA 178.A O TYR 181.A H 2.873 2.100 GLY 182.A N GLY 179.A O GLY 182.A H 3.032 2.182 VAL 183.A N ALA 178.A O VAL 183.A H 2.980 2.151 ARG 184.A N GLY 141.A O ARG 184.A H 2.980 2.141 ARG 184.A NE LEU 249.A O ARG 184.A HE 3.124 2.553 ARG 184.A NH1 GLY 140.A O ARG 184.A HH11 3.392 2.724 ARG 184.A NH1 SER 246.A O ARG 184.A HH12 3.281 2.590 ARG 184.A NH2 SER 246.A O ARG 184.A HH22 3.313 2.620 ARG 184.A NH2 LEU 249.A O ARG 184.A HH21 3.118 2.579 SER 185.A N THR 253.A OG1 SER 185.A H 2.899 2.058 SER 185.A OG ASN 171.A OD1 SER 185.A HG 2.740 1.941 ASN 186.A N ILE 143.A O ASN 186.A H 2.934 2.137 ASN 186.A ND2 THR 252.A O ASN 186.A HD21 2.878 2.028 LEU 187.A N ASP 255.A O LEU 187.A H 2.889 2.061 VAL 188.A N GLY 145.A O VAL 188.A H 2.840 2.039 ALA 189.A N ILE 257.A O ALA 189.A H 2.857 2.063 ALA 190.A N ASP 147.A O ALA 190.A H 3.056 2.275 GLY 191.A N ALA 259.A O GLY 191.A H 3.081 2.309 ARG 194.A N MET 231.A O ARG 194.A H 2.823 1.978 ARG 194.A NE GLU 218.A OE2 ARG 194.A HE 2.753 1.902 ARG 194.A NH2 GLU 218.A OE1 ARG 194.A HH21 2.897 2.047 THR 195.A N ILE 193.A O no hydrogen 2.859 N/A LEU 196.A N SER 18.A OG LEU 196.A H 3.045 2.400 MET 198.A N THR 195.A OG1 MET 198.A H 3.410 2.578 SER 199.A N THR 195.A O SER 199.A H 3.081 2.262 SER 199.A OG THR 195.A O SER 199.A HG 3.444 2.676 ALA 200.A N LEU 196.A O ALA 200.A H 2.915 2.163 ILE 201.A N ALA 197.A O ILE 201.A H 2.708 1.923 VAL 202.A N MET 198.A O VAL 202.A H 2.787 1.931 GLY 203.A N SER 199.A O GLY 203.A H 2.851 2.116 GLY 204.A N ILE 201.A O GLY 204.A H 2.811 1.990 ALA 205.A N ALA 200.A O ALA 205.A H 2.916 2.078 GLY 207.A N GLY 204.A O GLY 207.A H 2.936 2.133 GLU 209.A N GLU 209.A OE1 no hydrogen 2.525 N/A GLY 211.A N GLY 207.A O GLY 211.A H 3.122 2.304 ALA 212.A N GLU 208.A O ALA 212.A H 2.919 2.077 GLN 213.A N GLU 209.A O GLN 213.A H.A 2.888 2.081 ILE 214.A N ALA 210.A O ILE 214.A H 2.965 2.155 GLN 215.A N GLY 211.A O GLN 215.A H 3.040 2.209 LEU 216.A N ALA 212.A O LEU 216.A H 3.067 2.250 LEU 217.A N GLN 213.A O no hydrogen 2.904 N/A GLU 218.A N ILE 214.A O GLU 218.A H 2.868 2.036 GLU 219.A N GLN 215.A O GLU 219.A H 3.005 2.195 GLY 220.A N LEU 216.A O GLY 220.A H 2.955 2.127 TRP 221.A N LEU 217.A O TRP 221.A H 2.887 2.121 TRP 221.A NE1 ASP 260.A O TRP 221.A HE1 2.879 2.138 ASP 222.A N GLU 218.A O ASP 222.A H 3.299 2.464 GLN 223.A N GLU 219.A O GLN 223.A H 3.181 2.383 ARG 224.A N GLY 220.A O ARG 224.A H 2.884 2.048 ARG 224.A NE ALA 263.A O ARG 224.A HE 3.324 2.628 ALA 225.A N TRP 221.A O ALA 225.A H 2.928 2.131 GLY 228.A N ALA 225.A O GLY 228.A H 2.960 2.119 TRP 229.A N ASP 222.A OD1 TRP 229.A H 2.916 2.083 TRP 229.A NE1 PRO 192.A O TRP 229.A HE1 2.761 1.924 LYS 232.A N ASN 230.A OD1 LYS 232.A H 2.978 2.163 ASP 233.A N ASN 230.A O ASP 233.A H 3.053 2.205 THR 235.A N ASP 233.A OD1 THR 235.A H 3.072 2.247 THR 235.A OG1 ASP 233.A OD1 THR 235.A HG1 3.269 2.708 VAL 237.A N ALA 234.A O VAL 237.A H 2.986 2.397 ALA 238.A N ALA 234.A O ALA 238.A H 2.971 2.145 LYS 239.A N THR 235.A O LYS 239.A H 2.816 1.987 THR 240.A N PRO 236.A O THR 240.A H 3.228 2.428 THR 240.A OG1 PRO 236.A O THR 240.A HG1 2.855 2.050 VAL 241.A N VAL 237.A O VAL 241.A H 3.022 2.198 CYS 242.A N ALA 238.A O CYS 242.A H 2.985 2.151 CYS 242.A SG ALA 238.A O CYS 242.A HG 3.480 2.589 ALA 243.A N LYS 239.A O ALA 243.A H 2.851 2.074 LEU 244.A N THR 240.A O LEU 244.A H 3.148 2.347 LEU 245.A N VAL 241.A O LEU 245.A H 2.953 2.194 SER 246.A N ALA 243.A O SER 246.A H 3.232 2.474 SER 246.A OG ALA 243.A O SER 246.A HG 2.703 1.872 TRP 248.A N SER 246.A OG TRP 248.A H 2.971 2.139 GLY 254.A N SER 185.A O GLY 254.A H 2.698 1.948 ASP 255.A N ASN 186.A OD1 ASP 255.A H 2.969 2.206 ILE 256.A N ASP 255.A OD1 ILE 256.A H 2.843 2.083 ILE 257.A N LEU 187.A O ILE 257.A H 2.887 2.053 ALA 259.A N ALA 189.A O ALA 259.A H 2.842 2.138 GLY 262.A N ASP 260.A OD1 GLY 262.A H 2.832 2.107 ALA 263.A N ASP 260.A O ALA 263.A H 3.269 2.415 HIS 264.A N ASP 260.A OD2 HIS 264.A H 2.947 2.163 THR 265.A N GLY 262.A O THR 265.A H 3.004 2.169 THR 265.A OG1 GLY 262.A O THR 265.A HG1 2.760 1.921 GLN 266.A N ALA 263.A O GLN 266.A H 3.232 2.391 GLN 266.A NE2 THR 265.A OG1 GLN 266.A HE21 2.938 2.140