Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4u0k_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 2.A N GLN 30.A OE1 LEU 2.A H 2.833 1.984 LEU 3.A N GLN 30.A O LEU 3.A H 2.881 2.077 ASP 4.A N GLY 1.A O ASP 4.A H 3.269 2.448 LYS 6.A N LEU 3.A O LYS 6.A H 3.006 2.172 LYS 6.A NZ ASP 246.A OD1 LYS 6.A HZ2 2.843 2.107 ARG 7.A N ASP 87.A OD2 ARG 7.A H 2.969 2.123 ILE 8.A N GLN 33.A O ILE 8.A H 2.986 2.170 LEU 9.A N GLY 88.A O LEU 9.A H 2.835 2.012 VAL 10.A N VAL 35.A O VAL 10.A H 2.878 2.063 SER 11.A N VAL 90.A O SER 11.A H 3.036 2.189 SER 11.A OG VAL 90.A O SER 11.A HG 2.866 2.035 ILE 14.A N SER 18.A OG ILE 14.A H 2.997 2.148 THR 15.A N SER 18.A OG THR 15.A H 3.079 2.227 SER 17.A N THR 15.A OG1 SER 17.A H 3.008 2.207 SER 17.A OG THR 15.A OG1 SER 17.A HG 2.882 2.082 SER 18.A N THR 15.A O SER 18.A H 3.146 2.309 PHE 21.A N SER 18.A O PHE 21.A H 2.944 2.235 ILE 23.A N ILE 19.A O ILE 23.A H 2.925 2.084 ALA 24.A N ALA 20.A O ALA 24.A H 2.861 2.012 ARG 25.A N PHE 21.A O ARG 25.A H 2.964 2.164 ARG 25.A NH1 GLU 29.A OE2 ARG 25.A HH11 3.183 2.368 ARG 25.A NH2 HIS 22.A ND1 ARG 25.A HH21 3.061 2.202 ARG 25.A NH2 THR 234.A OG1 ARG 25.A HH22 3.205 2.445 VAL 26.A N HIS 22.A O VAL 26.A H 2.949 2.091 ALA 27.A N ILE 23.A O ALA 27.A H 2.914 2.061 GLN 28.A N ALA 24.A O GLN 28.A H 2.953 2.121 GLN 28.A NE2 ALA 54.A O GLN 28.A HE22 2.908 2.136 GLU 29.A N ARG 25.A O GLU 29.A H 2.913 2.075 GLN 30.A N VAL 26.A O GLN 30.A H 3.000 2.312 GLN 30.A N ALA 27.A O GLN 30.A H 3.176 2.524 GLY 31.A N GLN 28.A O GLY 31.A H 3.005 2.154 ALA 32.A N ALA 27.A O ALA 32.A H 2.989 2.147 GLN 33.A N LYS 6.A O GLN 33.A H 2.830 1.994 VAL 35.A N ILE 8.A O VAL 35.A H 2.981 2.169 LEU 36.A N PRO 57.A O LEU 36.A H 2.770 1.914 THR 37.A N VAL 10.A O THR 37.A H 3.019 2.215 GLY 38.A N LEU 59.A O GLY 38.A H 2.960 2.177 ARG 41.A N PHE 39.A O ARG 41.A H 2.796 2.060 ILE 45.A N ARG 41.A O ILE 45.A H 3.029 2.211 GLN 46.A N LEU 42.A O GLN 46.A H 2.854 2.023 ARG 47.A N ARG 43.A O ARG 47.A H 3.104 2.307 ILE 48.A N LEU 44.A O ILE 48.A H 2.940 2.105 THR 49.A N ILE 45.A O THR 49.A H 2.870 2.048 THR 49.A OG1 ILE 45.A O THR 49.A HG1 3.054 2.276 THR 49.A OG1 GLN 46.A O THR 49.A HG1 3.336 2.822 ASP 50.A N GLN 46.A O ASP 50.A H 2.943 2.263 ARG 51.A N ILE 48.A O ARG 51.A H 3.140 2.291 ARG 51.A NH2 ARG 47.A O ARG 51.A HH21 2.847 2.182 LEU 52.A N THR 49.A O LEU 52.A H 3.042 2.199 ALA 54.A N GLN 28.A OE1 ALA 54.A H 2.934 2.174 LEU 59.A N LEU 36.A O LEU 59.A H 2.770 1.927 LEU 61.A N GLY 38.A O LEU 61.A H 2.922 2.079 ASP 62.A N HIS 68.A ND1 ASP 62.A H 3.038 2.182 GLN 64.A N ASP 62.A OD1 GLN 64.A H 2.891 2.053 GLN 64.A NE2 HIS 119.A ND1 GLN 64.A HE21 3.127 2.268 ASN 65.A N ASP 62.A O ASN 65.A H 2.958 2.115 HIS 68.A N ASN 65.A OD1 HIS 68.A H 3.058 2.258 LEU 69.A N ASN 65.A O LEU 69.A H 3.181 2.368 ALA 70.A N GLU 66.A O ALA 70.A H 2.920 2.138 SER 71.A N GLU 67.A O SER 71.A H 3.028 2.277 SER 71.A OG GLU 67.A O SER 71.A HG 3.284 2.610 SER 71.A OG HIS 68.A O SER 71.A HG 3.253 2.575 LEU 72.A N LEU 69.A O LEU 72.A H 3.375 2.532 ARG 75.A N SER 71.A O ARG 75.A H 3.131 2.313 ARG 75.A NE SER 71.A OG ARG 75.A HE 2.818 2.100 ARG 75.A NH1 GLU 60.A O ARG 75.A HH12 2.746 1.940 ARG 75.A NH2 GLU 60.A O ARG 75.A HH22 3.054 2.357 ARG 75.A NH2 HIS 68.A O ARG 75.A HH21 2.961 2.203 ARG 75.A NH2 SER 71.A OG ARG 75.A HH21 3.340 2.761 VAL 76.A N LEU 72.A O VAL 76.A H 2.861 2.024 THR 77.A N ALA 73.A O THR 77.A H 2.850 2.024 THR 77.A OG1 ALA 73.A O THR 77.A HG1 2.911 2.125 GLU 78.A N GLY 74.A O GLU 78.A H 2.935 2.114 ALA 79.A N ARG 75.A O ALA 79.A H 3.054 2.282 ILE 80.A N VAL 76.A O ILE 80.A H 2.916 2.177 GLY 81.A N THR 77.A O GLY 81.A H 2.713 2.017 ASN 84.A N GLY 81.A O ASN 84.A H 2.988 2.158 ASN 84.A ND2 ILE 80.A O ASN 84.A HD22 2.884 2.033 LEU 86.A N ILE 135.A O LEU 86.A H 2.838 2.028 ASP 87.A N ARG 7.A O ASP 87.A H 2.700 1.902 GLY 88.A N ARG 7.A O GLY 88.A H 3.159 2.437 VAL 89.A N SER 141.A O VAL 89.A H 2.919 2.117 VAL 90.A N LEU 9.A O VAL 90.A H 2.771 1.966 HIS 91.A N VAL 143.A O HIS 91.A H 2.772 1.927 HIS 91.A NE2 SER 124.A OG HIS 91.A HE2 2.881 2.025 SER 92.A N SER 11.A OG SER 92.A H 3.219 2.420 PHE 95.A N SER 121.A OG PHE 95.A H 2.980 2.136 THR 99.A OG1 ASP 113.A OD2 THR 99.A HG1 2.634 1.959 GLY 100.A N PRO 97.A O GLY 100.A H 2.861 2.024 MET 101.A N GLN 98.A O MET 101.A H 3.258 2.401 GLY 102.A N ALA 155.A O GLY 102.A H 2.848 2.056 ILE 103.A N LEU 205.A O ILE 103.A H 3.081 2.264 ASN 104.A ND2 MET 101.A O ASN 104.A HD22 2.808 1.966 ASP 108.A N PRO 105.A O ASP 108.A H 2.891 2.059 ASP 113.A N PRO 110.A O ASP 113.A H 2.974 2.328 VAL 114.A N PRO 110.A O VAL 114.A H 3.190 2.359 SER 115.A N TYR 111.A O SER 115.A H 2.690 1.833 LYS 116.A N ALA 112.A O LYS 116.A H 3.116 2.313 GLY 117.A N ASP 113.A O GLY 117.A H 3.075 2.268 ILE 118.A N VAL 114.A O ILE 118.A H 2.861 2.076 HIS 119.A N SER 115.A O HIS 119.A H 2.851 2.054 ILE 120.A N LYS 116.A O ILE 120.A H 3.151 2.311 SER 121.A N GLY 117.A O SER 121.A H 2.859 2.065 SER 121.A OG GLY 117.A O SER 121.A HG 2.857 2.216 ALA 122.A N ILE 118.A O ALA 122.A H 2.879 2.100 TYR 123.A N ILE 118.A O TYR 123.A H 3.026 2.207 SER 124.A N HIS 119.A O SER 124.A H 2.994 2.307 TYR 125.A N ALA 122.A O TYR 125.A H 3.144 2.368 TYR 125.A OH SER 184.A OG TYR 125.A HH 2.787 1.966 ALA 126.A N TYR 123.A O ALA 126.A H 2.907 2.314 SER 127.A N TYR 123.A O SER 127.A H 3.017 2.211 SER 127.A OG TYR 123.A O SER 127.A HG 3.529 2.727 MET 128.A N SER 124.A O MET 128.A H 2.886 2.069 ALA 129.A N TYR 125.A O ALA 129.A H 3.188 2.362 LYS 130.A N ALA 126.A O LYS 130.A H 2.878 2.038 ALA 131.A N SER 127.A O ALA 131.A H 3.067 2.262 LEU 132.A N MET 128.A O LEU 132.A H 2.915 2.204 LEU 133.A N ALA 129.A O LEU 133.A H 2.847 2.004 ILE 135.A N LEU 132.A O ILE 135.A H 2.791 1.964 MET 136.A N LEU 133.A O MET 136.A H 3.057 2.243 ASN 137.A N LEU 86.A O ASN 137.A H 2.866 2.041 ASN 137.A ND2 ASP 87.A OD1 ASN 137.A HD21 3.160 2.331 GLY 139.A N GLY 181.A O GLY 139.A H 2.728 1.916 GLY 140.A N ASN 137.A O GLY 140.A H 3.007 2.266 SER 141.A N ASP 87.A O SER 141.A H 3.011 2.336 SER 141.A OG LEU 243.A O SER 141.A HG 2.707 1.910 ILE 142.A N ARG 183.A O ILE 142.A H 2.797 1.946 VAL 143.A N VAL 89.A O VAL 143.A H 2.855 2.036 GLY 144.A N ASN 185.A O GLY 144.A H 2.966 2.169 MET 145.A N HIS 91.A O MET 145.A H 3.178 2.531 ASP 146.A N VAL 187.A O ASP 146.A H 2.833 2.025 SER 150.A N ASP 148.A OD1 SER 150.A H 3.095 2.262 SER 150.A OG ASP 148.A OD1 SER 150.A HG 3.066 2.367 TYR 156.A N PRO 154.A O TYR 156.A H 2.762 2.038 ASN 157.A ND2 GLY 102.A O ASN 157.A HD21 3.321 2.786 TRP 158.A N GLY 100.A O TRP 158.A H 2.933 2.119 TRP 158.A NE1 PHE 106.A O TRP 158.A HE1 2.934 2.086 MET 159.A N TYR 156.A O MET 159.A H 2.888 2.206 THR 160.A N ASN 157.A O THR 160.A H 3.111 2.488 THR 160.A OG1 ASN 157.A O THR 160.A HG1 3.144 2.558 ALA 162.A N TRP 158.A O ALA 162.A H 2.902 2.074 LYS 163.A N MET 159.A O LYS 163.A H 2.880 2.089 LYS 163.A NZ MET 145.A O LYS 163.A HZ2 2.863 2.028 SER 164.A N THR 160.A O SER 164.A H 2.924 2.119 ALA 165.A N VAL 161.A O ALA 165.A H 2.962 2.153 LEU 166.A N ALA 162.A O LEU 166.A H 2.873 2.074 GLU 167.A N LYS 163.A O GLU 167.A H 2.955 2.146 SER 168.A N SER 164.A O SER 168.A H 3.339 2.531 VAL 169.A N ALA 165.A O VAL 169.A H 2.857 2.030 ASN 170.A N LEU 166.A O ASN 170.A H 2.856 2.041 ASN 170.A ND2 ASP 254.A O ASN 170.A HD21 3.186 2.578 ARG 171.A N SER 168.A O ARG 171.A H 3.154 2.556 PHE 172.A N SER 168.A O PHE 172.A H 3.345 2.548 VAL 173.A N VAL 169.A O VAL 173.A H 2.765 1.936 ALA 174.A N ASN 170.A O ALA 174.A H 2.973 2.201 ARG 175.A N PHE 172.A O ARG 175.A H 3.033 2.432 GLU 176.A N PHE 172.A O GLU 176.A H 3.321 2.520 ALA 177.A N VAL 173.A O ALA 177.A H 2.761 1.926 GLY 178.A N ALA 174.A O GLY 178.A H 2.928 2.134 LYS 179.A N GLU 176.A O LYS 179.A H 3.202 2.462 TYR 180.A N ALA 177.A O TYR 180.A H 2.878 2.090 GLY 181.A N GLY 178.A O GLY 181.A H 2.989 2.142 VAL 182.A N ALA 177.A O VAL 182.A H 2.997 2.167 ARG 183.A N GLY 140.A O ARG 183.A H 2.919 2.081 ARG 183.A NH1 LEU 243.A O ARG 183.A HH12 2.940 2.170 ARG 183.A NH2 GLY 139.A O ARG 183.A HH21 3.469 2.631 ARG 183.A NH2 LEU 243.A O ARG 183.A HH22 3.528 2.921 ARG 183.A NH2 SER 245.A O ARG 183.A HH22 3.055 2.429 SER 184.A N THR 252.A OG1 SER 184.A H 2.927 2.091 SER 184.A OG ASN 170.A OD1 SER 184.A HG 2.761 1.964 ASN 185.A N ILE 142.A O ASN 185.A H 2.949 2.162 ASN 185.A ND2 THR 251.A O ASN 185.A HD21 2.906 2.059 LEU 186.A N ASP 254.A O LEU 186.A H 2.877 2.042 VAL 187.A N GLY 144.A O VAL 187.A H 2.818 2.011 ALA 188.A N ILE 256.A O ALA 188.A H 2.876 2.106 ALA 189.A N ASP 146.A O ALA 189.A H 3.090 2.299 GLY 190.A N ALA 258.A O GLY 190.A H 3.118 2.348 ARG 193.A N MET 230.A O ARG 193.A H 2.837 1.993 ARG 193.A NE GLU 217.A OE1 ARG 193.A HE 3.451 2.738 ARG 193.A NE GLU 217.A OE2 ARG 193.A HE 2.793 2.008 ARG 193.A NH2 GLU 217.A OE1 ARG 193.A HH21 3.004 2.176 THR 194.A N ILE 192.A O THR 194.A H 2.824 2.100 LEU 195.A N SER 17.A OG LEU 195.A H 3.089 2.335 MET 197.A N THR 194.A OG1 MET 197.A H 3.248 2.407 SER 198.A N THR 194.A O SER 198.A H 2.936 2.107 ALA 199.A N LEU 195.A O ALA 199.A H 2.958 2.157 ILE 200.A N ALA 196.A O ILE 200.A H 2.928 2.135 VAL 201.A N MET 197.A O VAL 201.A H 2.982 2.134 GLY 202.A N SER 198.A O GLY 202.A H 2.929 2.155 GLY 203.A N ILE 200.A O GLY 203.A H 2.813 1.996 ALA 204.A N ALA 199.A O ALA 204.A H 2.977 2.125 GLY 206.A N GLY 203.A O GLY 206.A H 3.015 2.205 GLY 210.A N GLY 206.A O GLY 210.A H 3.115 2.307 ALA 211.A N GLU 207.A O ALA 211.A H 2.951 2.137 GLN 212.A N GLU 208.A O GLN 212.A H.A 2.954 2.151 ILE 213.A N ALA 209.A O ILE 213.A H 3.057 2.221 GLN 214.A N GLY 210.A O GLN 214.A H 3.030 2.239 LEU 215.A N ALA 211.A O LEU 215.A H 3.012 2.229 LEU 216.A N GLN 212.A O LEU 216.A H 2.869 2.035 GLU 217.A N ILE 213.A O GLU 217.A H 2.930 2.087 GLU 218.A N GLN 214.A O GLU 218.A H 3.129 2.302 GLY 219.A N LEU 215.A O GLY 219.A H 2.975 2.154 TRP 220.A N LEU 216.A O TRP 220.A H 3.017 2.296 TRP 220.A N GLU 217.A O TRP 220.A H 3.210 2.611 TRP 220.A NE1 ASP 259.A O TRP 220.A HE1 2.897 2.150 ASP 221.A N GLU 217.A O ASP 221.A H 3.318 2.495 GLN 222.A N GLU 218.A O GLN 222.A H 3.144 2.349 ARG 223.A N GLY 219.A O ARG 223.A H 2.850 2.031 ARG 223.A NE ALA 262.A O ARG 223.A HE 3.460 2.731 ALA 224.A N TRP 220.A O ALA 224.A H 2.923 2.157 GLY 227.A N ALA 224.A O GLY 227.A H 2.910 2.065 TRP 228.A N ASP 221.A OD1 TRP 228.A H 2.903 2.080 TRP 228.A NE1 PRO 191.A O TRP 228.A HE1 2.701 1.861 LYS 231.A N ASN 229.A OD1 LYS 231.A H 2.946 2.120 ASP 232.A N ASN 229.A O ASP 232.A H 3.060 2.220 THR 234.A N ASP 232.A OD1 THR 234.A H 3.054 2.241 ALA 237.A N ALA 233.A O ALA 237.A H 2.917 2.082 LYS 238.A N THR 234.A O LYS 238.A H 2.826 1.998 THR 239.A N PRO 235.A O THR 239.A H 3.206 2.404 THR 239.A OG1 PRO 235.A O THR 239.A HG1 2.894 2.098 VAL 240.A N VAL 236.A O VAL 240.A H 3.068 2.244 CYS 241.A N ALA 237.A O CYS 241.A H 2.980 2.136 CYS 241.A SG ALA 237.A O CYS 241.A HG 3.474 2.579 ALA 242.A N LYS 238.A O ALA 242.A H 2.853 2.072 LEU 243.A N THR 239.A O LEU 243.A H 3.093 2.316 LEU 244.A N VAL 240.A O LEU 244.A H 2.983 2.282 LEU 244.A N CYS 241.A O LEU 244.A H 3.093 2.489 SER 245.A N ALA 242.A O SER 245.A H 3.245 2.487 SER 245.A OG ALA 242.A O SER 245.A HG 2.726 1.892 TRP 247.A N SER 245.A OG TRP 247.A H 3.056 2.227 GLY 253.A N SER 184.A O GLY 253.A H 2.702 1.969 ASP 254.A N ASN 185.A OD1 ASP 254.A H 3.008 2.233 ILE 255.A N ASP 254.A OD1 ILE 255.A H 2.858 2.097 ILE 256.A N LEU 186.A O ILE 256.A H 2.840 2.007 ALA 258.A N ALA 188.A O ALA 258.A H 2.754 1.976 GLY 261.A N ASP 259.A OD1 GLY 261.A H 2.861 2.139 ALA 262.A N ASP 259.A O ALA 262.A H 3.284 2.430 HIS 263.A N ASP 259.A OD2 HIS 263.A H 2.967 2.172 THR 264.A N GLY 261.A O THR 264.A H 3.037 2.193 THR 264.A OG1 GLY 261.A O THR 264.A HG1 2.708 1.869 GLN 265.A N ALA 262.A O GLN 265.A H 3.213 2.388 GLN 265.A NE2 THR 264.A OG1 GLN 265.A HE21 2.988 2.187