Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4u9b_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N TYR 42.A O MET 1.A H3 2.901 2.196 LYS 2.A NZ ALA 39.A O LYS 2.A HZ3 2.946 2.107 LYS 2.A NZ SER 41.A OG LYS 2.A HZ1 2.684 1.924 LYS 2.A NZ HIS 111.A O LYS 2.A HZ2 2.761 1.943 GLY 3.A N LYS 40.A O GLY 3.A H 2.880 2.183 ILE 4.A N SER 38.A O ILE 4.A H 3.195 2.526 ILE 5.A N LYS 2.A O ILE 5.A H 3.064 2.331 ASN 7.A N GLY 3.A O ASN 7.A H 2.730 1.950 VAL 8.A N ILE 4.A O VAL 8.A H 2.977 2.167 LEU 9.A N ILE 5.A O LEU 9.A H 3.006 2.194 GLU 10.A N PHE 6.A O GLU 10.A H 2.803 2.004 ASP 11.A N ASN 7.A O ASP 11.A H 3.075 2.256 MET 12.A N VAL 8.A O MET 12.A H 3.066 2.300 VAL 13.A N LEU 9.A O VAL 13.A H 2.858 2.007 VAL 14.A N GLU 10.A O VAL 14.A H 2.782 1.940 ALA 15.A N ASP 11.A O ALA 15.A H 3.119 2.319 GLN 16.A N MET 12.A O GLN 16.A H 3.026 2.394 GLN 16.A N VAL 13.A O GLN 16.A H 3.043 2.350 CYS 17.A N VAL 13.A O CYS 17.A H 2.599 1.901 GLY 18.A N VAL 14.A O GLY 18.A H 2.832 2.095 TRP 22.A N GLY 18.A O TRP 22.A H 3.319 2.498 ASN 23.A N MET 19.A O ASN 23.A H 2.803 1.970 GLU 24.A N SER 20.A O GLU 24.A H 2.809 2.004 LEU 25.A N VAL 21.A O LEU 25.A H 2.931 2.097 LEU 26.A N TRP 22.A O LEU 26.A H 3.002 2.226 GLU 27.A N ASN 23.A O GLU 27.A H 2.898 2.079 LYS 28.A N GLU 24.A O LYS 28.A H 2.955 2.159 LYS 28.A NZ ASP 53.A OD2 LYS 28.A HZ2 2.830 1.955 HIS 29.A N LEU 25.A O HIS 29.A H 2.982 2.295 HIS 29.A NE2 ASP 53.A OD2 HIS 29.A HE2 2.678 1.826 ALA 30.A N LEU 26.A O ALA 30.A H 2.871 2.070 ARG 34.A NE GLU 46.A OE1 ARG 34.A HE 3.025 2.165 ARG 34.A NH2 GLU 46.A OE2 ARG 34.A HH21 2.789 1.930 TYR 36.A OH GLU 46.A OE1 TYR 36.A HH 2.506 1.783 VAL 37.A N TYR 42.A OH VAL 37.A H 2.773 1.917 LYS 40.A N VAL 37.A O LYS 40.A H.B 2.970 2.159 TYR 42.A N MET 1.A O TYR 42.A H 2.733 1.924 GLU 46.A N ALA 43.A O GLU 46.A H 2.967 2.186 PHE 48.A N GLU 44.A O PHE 48.A H 3.009 2.165 SER 49.A N SER 45.A O SER 49.A H 2.807 1.979 SER 49.A OG SER 45.A O SER 49.A HG 2.931 2.273 ILE 50.A N GLU 46.A O ILE 50.A H 3.065 2.230 VAL 51.A N LEU 47.A O VAL 51.A H 2.963 2.119 GLN 52.A N PHE 48.A O GLN 52.A H 2.715 1.903 ASP 53.A N SER 49.A O ASP 53.A H 3.031 2.234 VAL 54.A N ILE 50.A O VAL 54.A H 3.089 2.250 ALA 55.A N VAL 51.A O ALA 55.A H 2.943 2.108 GLN 56.A N GLN 52.A O GLN 56.A H 2.989 2.164 ARG 57.A N ASP 53.A O ARG 57.A H 2.930 2.133 ARG 57.A NE ASP 53.A OD1 ARG 57.A HE 2.622 1.812 ARG 57.A NH1 GLU 24.A OE1 ARG 57.A HH12 3.403 2.605 ARG 57.A NH2 GLU 24.A OE2 ARG 57.A HH22 3.313 2.667 ARG 57.A NH2 ASP 53.A OD2 ARG 57.A HH21 3.411 2.652 LEU 58.A N VAL 54.A O LEU 58.A H 3.062 2.282 ASN 59.A N GLN 56.A O ASN 59.A H 3.150 2.386 MET 60.A N ALA 55.A O MET 60.A H 2.921 2.097 ASP 64.A N PRO 61.A O ASP 64.A H 3.289 2.590 VAL 66.A N ILE 62.A O VAL 66.A H 2.937 2.130 LYS 67.A N GLN 63.A O LYS 67.A H 2.950 2.178 LYS 67.A NZ GLU 143.A OE2 LYS 67.A HZ3 2.521 1.845 ALA 68.A N ASP 64.A O ALA 68.A H 3.056 2.245 PHE 69.A N VAL 65.A O PHE 69.A H 2.894 2.058 GLY 70.A N VAL 66.A O GLY 70.A H 2.890 2.087 GLN 71.A N LYS 67.A O GLN 71.A H 3.110 2.324 PHE 72.A N ALA 68.A O PHE 72.A H 3.096 2.256 LEU 73.A N PHE 69.A O LEU 73.A H 2.681 1.977 LEU 77.A N LEU 73.A O LEU 77.A H 2.886 2.091 ALA 78.A N PHE 74.A O ALA 78.A H 2.758 1.921 SER 79.A N ASN 75.A O SER 79.A H 2.811 2.005 SER 79.A OG ASN 75.A O SER 79.A HG 3.006 2.373 ARG 80.A NH1 GLY 76.A O ARG 80.A HH11 2.981 2.162 ARG 80.A NH2 ASP 11.A OD2 ARG 80.A HH22 2.995 2.173 HIS 81.A N LEU 77.A O HIS 81.A H 2.851 2.143 HIS 81.A NE2 TYR 110.A OH HIS 81.A HE2 2.580 1.769 VAL 84.A N HIS 81.A O VAL 84.A H 3.100 2.412 VAL 85.A N HIS 81.A O VAL 85.A H 3.436 2.615 ASP 86.A N THR 82.A O ASP 86.A H 2.856 2.032 LYS 87.A N VAL 84.A O LYS 87.A H 3.199 2.373 PHE 88.A N VAL 85.A O PHE 88.A H 3.094 2.254 SER 93.A N ASP 90.A OD1 SER 93.A H 2.808 1.986 LEU 94.A N ASP 90.A O LEU 94.A H 3.214 2.405 VAL 95.A N PHE 91.A O VAL 95.A H 3.090 2.243 MET 96.A N THR 92.A O MET 96.A H 2.984 2.131 GLY 97.A N LEU 94.A O GLY 97.A H 2.911 2.179 ILE 98.A N VAL 95.A O ILE 98.A H 3.256 2.399 HIS 99.A ND1 ASP 100.A OD1 no hydrogen 3.226 N/A VAL 101.A N GLY 97.A O VAL 101.A H 2.812 2.172 ILE 102.A N GLY 97.A O ILE 102.A H 2.937 2.119 HIS 103.A N ILE 98.A O HIS 103.A H 3.104 2.328 LEU 104.A N ASP 100.A O LEU 104.A H 3.307 2.500 GLU 105.A N VAL 101.A O GLU 105.A H 2.979 2.135 VAL 106.A N ILE 102.A O VAL 106.A H 2.908 2.078 ASN 107.A N HIS 103.A O ASN 107.A H 3.110 2.305 ASN 107.A ND2 HIS 103.A O ASN 107.A HD21 2.903 2.065 LYS 108.A N LEU 104.A O LYS 108.A H 2.947 2.241 LYS 108.A NZ GLU 105.A OE1 LYS 108.A HZ2 2.845 2.079 LYS 108.A NZ GLU 105.A OE2 LYS 108.A HZ2 3.255 2.413 LEU 109.A N GLU 105.A O LEU 109.A H 3.067 2.390 LEU 109.A N VAL 106.A O LEU 109.A H 3.195 2.550 TYR 110.A N VAL 106.A O TYR 110.A H 2.848 2.184 HIS 117.A N SER 133.A O HIS 117.A H 2.758 1.962 ASN 119.A N ARG 131.A O ASN 119.A H 3.078 2.273 GLN 121.A N ALA 129.A O GLN 121.A H 2.879 2.064 LEU 123.A N GLN 127.A O LEU 123.A H 2.835 1.979 ASN 126.A N LEU 123.A O ASN 126.A H 2.718 1.942 GLN 127.A N ASN 125.A OD1 GLN 127.A H 3.109 2.262 GLN 127.A NE2 GLU 177.A OE1 GLN 127.A HE21 2.904 2.136 ILE 128.A N ILE 176.A O ILE 128.A H 2.833 2.006 ALA 129.A N GLN 121.A O ALA 129.A H 2.811 1.989 LEU 130.A N LEU 174.A O LEU 130.A H 2.869 2.028 ARG 131.A N ASN 119.A O ARG 131.A H 2.772 1.962 TYR 132.A N CYS 172.A O TYR 132.A H 2.858 2.018 SER 133.A N HIS 117.A O SER 133.A H 2.879 2.106 ARG 136.A N SER 134.A OG ARG 136.A H 3.092 2.275 ARG 137.A N SER 134.A O ARG 137.A H.B 3.076 2.277 LEU 138.A N TYR 132.A OH LEU 138.A H 2.824 2.070 CYS 141.A N LEU 138.A O CYS 141.A H 2.953 2.338 ALA 142.A N LEU 138.A O ALA 142.A H 3.033 2.244 GLU 143.A N CYS 139.A O GLU 143.A H 2.874 2.082 GLY 144.A N PHE 140.A O GLY 144.A H 2.986 2.159 LEU 145.A N CYS 141.A O LEU 145.A H 2.833 2.005 LEU 146.A N ALA 142.A O LEU 146.A H 2.970 2.184 PHE 147.A N GLU 143.A O PHE 147.A H 3.136 2.323 GLY 148.A N GLY 144.A O GLY 148.A H 2.877 2.081 ALA 149.A N LEU 145.A O ALA 149.A H 2.804 1.997 ALA 150.A N LEU 146.A O ALA 150.A H 2.870 2.093 GLN 151.A N PHE 147.A O GLN 151.A H 2.952 2.115 HIS 152.A N GLY 148.A O HIS 152.A H 3.055 2.222 PHE 153.A N ALA 149.A O PHE 153.A H 3.208 2.445 PHE 153.A N ALA 150.A O PHE 153.A H 3.142 2.552 GLN 154.A N GLN 151.A O GLN 154.A H 2.972 2.137 GLN 155.A N ALA 150.A O GLN 155.A H 2.848 2.005 GLN 155.A NE2 LYS 156.A O GLN 155.A HE21 3.085 2.280 GLN 155.A NE2 GLN 179.A O GLN 155.A HE22 2.860 2.374 LYS 156.A NZ GLN 179.A OE1 LYS 156.A HZ1 2.855 2.005 GLN 158.A N GLU 177.A O GLN 158.A H 2.942 2.152 SER 160.A N ILE 175.A O SER 160.A H 2.851 2.021 HIS 161.A ND1 GLU 143.A OE1 HIS 161.A HD1 3.013 2.167 CYS 164.A SG HIS 161.A NE2 no hydrogen 3.482 N/A THR 167.A N CYS 164.A O THR 167.A H 3.196 2.347 THR 167.A OG1 CYS 164.A O THR 167.A HG1 3.061 2.236 GLY 168.A N MET 165.A O GLY 168.A H 3.002 2.182 HIS 171.A ND1 ASP 170.A OD1 HIS 171.A HD1 2.591 1.733 CYS 172.A N TYR 132.A O CYS 172.A H 2.736 1.892 CYS 172.A SG HIS 161.A NE2 no hydrogen 3.573 N/A MET 173.A N THR 163.A O MET 173.A H 3.031 2.229 LEU 174.A N LEU 130.A O LEU 174.A H 2.855 1.997 ILE 175.A N SER 160.A O ILE 175.A H 2.729 1.919 ILE 176.A N ILE 128.A O ILE 176.A H 2.771 1.922 GLU 177.A N GLN 158.A O GLU 177.A H 2.900 2.060 GLN 179.A N LYS 156.A O GLN 179.A H 2.999 2.144 GLN 179.A NE2 GLN 158.A OE1 GLN 179.A HE22 2.860 2.248 GLN 179.A NE2 GLU 177.A OE2 GLN 179.A HE21 2.872 2.031