Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4u9k_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N TYR 42.A O MET 1.A H3 2.712 1.830 LYS 2.A NZ ALA 39.A O LYS 2.A HZ3 3.120 2.259 LYS 2.A NZ SER 41.A OG LYS 2.A HZ1 2.823 1.992 LYS 2.A NZ HIS 111.A O LYS 2.A HZ2 2.870 2.000 GLY 3.A N LYS 40.A O GLY 3.A H 2.845 2.130 ILE 4.A N SER 38.A O.A ILE 4.A H 2.995 2.305 ILE 4.A N SER 38.A O.B ILE 4.A H 2.980 2.299 ILE 5.A N LYS 2.A O ILE 5.A H 2.908 2.129 ASN 7.A N GLY 3.A O ASN 7.A H 2.738 1.954 ASN 7.A ND2 TYR 36.A O ASN 7.A HD22 3.065 2.208 VAL 8.A N ILE 4.A O VAL 8.A H 3.045 2.212 LEU 9.A N ILE 5.A O LEU 9.A H 3.057 2.230 GLU 10.A N PHE 6.A O GLU 10.A H 2.912 2.123 ASP 11.A N ASN 7.A O ASP 11.A H 3.149 2.318 MET 12.A N VAL 8.A O MET 12.A H 3.043 2.245 VAL 13.A N LEU 9.A O VAL 13.A H 2.837 2.023 VAL 14.A N GLU 10.A O VAL 14.A H 2.687 1.854 ALA 15.A N ASP 11.A O ALA 15.A H 3.086 2.313 GLN 16.A N MET 12.A O GLN 16.A H 3.199 2.373 CYS 17.A N VAL 13.A O CYS 17.A H 3.001 2.183 GLY 18.A N VAL 13.A O GLY 18.A H 3.169 2.496 GLY 18.A N VAL 14.A O GLY 18.A H 3.128 2.493 VAL 21.A N GLY 18.A O VAL 21.A H 3.146 2.495 TRP 22.A N GLY 18.A O TRP 22.A H 3.368 2.583 ASN 23.A N MET 19.A O ASN 23.A H 3.147 2.378 GLU 24.A N SER 20.A O GLU 24.A H 3.218 2.449 LEU 25.A N VAL 21.A O LEU 25.A H 2.937 2.096 LEU 26.A N TRP 22.A O LEU 26.A H 2.915 2.118 GLU 27.A N ASN 23.A O GLU 27.A H 2.993 2.156 LYS 28.A N GLU 24.A O LYS 28.A H 3.060 2.304 HIS 29.A N LEU 25.A O HIS 29.A H 2.890 2.097 HIS 29.A NE2 ASP 53.A OD2 HIS 29.A HE2 2.688 1.850 ALA 30.A N LEU 26.A O ALA 30.A H 3.038 2.449 ARG 34.A N PRO 31.A O ARG 34.A H 3.205 2.589 ARG 34.A NE GLU 46.A OE1 ARG 34.A HE 3.170 2.335 ARG 34.A NH2 GLU 46.A OE1 ARG 34.A HH21 3.426 2.679 ARG 34.A NH2 GLU 46.A OE2 ARG 34.A HH21 2.675 1.866 TYR 36.A OH GLU 46.A OE1 TYR 36.A HH 2.707 1.900 VAL 37.A N TYR 42.A OH VAL 37.A H 2.761 1.914 SER 38.A OG.A ASN 7.A OD1 SER 38.A HG.A 2.595 1.756 LYS 40.A N VAL 37.A O LYS 40.A H 2.982 2.203 TYR 42.A N MET 1.A O TYR 42.A H 2.766 1.938 GLU 46.A N ALA 43.A O GLU 46.A H 2.945 2.176 PHE 48.A N GLU 44.A O PHE 48.A H 3.112 2.282 SER 49.A N SER 45.A O SER 49.A H 2.992 2.139 ILE 50.A N GLU 46.A O ILE 50.A H 3.124 2.333 VAL 51.A N LEU 47.A O VAL 51.A H 2.896 2.061 GLN 52.A N PHE 48.A O GLN 52.A H 2.728 1.902 ASP 53.A N SER 49.A O ASP 53.A H 3.114 2.327 VAL 54.A N ILE 50.A O VAL 54.A H 3.145 2.367 ALA 55.A N VAL 51.A O ALA 55.A H 3.120 2.262 GLN 56.A N GLN 52.A O GLN 56.A H 3.253 2.488 ARG 57.A N ASP 53.A O ARG 57.A H 3.050 2.252 ARG 57.A NE ASP 53.A OD1 ARG 57.A HE 3.005 2.237 ARG 57.A NH2 GLU 24.A OE1 ARG 57.A HH22 3.079 2.227 LEU 58.A N VAL 54.A O LEU 58.A H 2.946 2.152 ASN 59.A N GLN 56.A O ASN 59.A H 3.237 2.403 MET 60.A N ALA 55.A O MET 60.A H 2.809 1.956 GLN 63.A N GLN 63.A OE1 GLN 63.A H 2.767 1.974 ASP 64.A N PRO 61.A O ASP 64.A H 2.856 2.181 VAL 65.A N PRO 61.A O VAL 65.A H 3.290 2.561 VAL 65.A N ILE 62.A O VAL 65.A H 3.215 2.560 VAL 66.A N ILE 62.A O VAL 66.A H 3.067 2.249 LYS 67.A N GLN 63.A O LYS 67.A H 2.970 2.151 LYS 67.A NZ GLU 143.A OE2 LYS 67.A HZ1 3.554 2.815 ALA 68.A N ASP 64.A O ALA 68.A H 3.216 2.533 ALA 68.A N VAL 65.A O ALA 68.A H 3.229 2.625 PHE 69.A N VAL 65.A O PHE 69.A H 2.972 2.131 GLY 70.A N VAL 66.A O GLY 70.A H 2.921 2.078 GLN 71.A N LYS 67.A O GLN 71.A H 3.168 2.418 GLN 71.A NE2 GLN 151.A OE1 GLN 71.A HE21 3.208 2.350 PHE 72.A N ALA 68.A O PHE 72.A H 3.100 2.277 LEU 73.A N PHE 69.A O LEU 73.A H 2.596 1.791 PHE 74.A N GLY 70.A O PHE 74.A H 3.123 2.388 GLY 76.A N PHE 72.A O GLY 76.A H 3.169 2.431 LEU 77.A N LEU 73.A O LEU 77.A H 2.776 1.943 ALA 78.A N PHE 74.A O ALA 78.A H 2.857 2.007 SER 79.A N ASN 75.A O SER 79.A H 2.976 2.209 ARG 80.A N.A LEU 77.A O ARG 80.A H.A 2.992 2.317 ARG 80.A N.B GLY 76.A O ARG 80.A H.B 3.280 2.586 ARG 80.A N.B LEU 77.A O ARG 80.A H.B 2.988 2.403 ARG 80.A NH1.A GLY 76.A O ARG 80.A HH11.A 3.021 2.211 ARG 80.A NH1.B ARG 80.A O.B ARG 80.A HH11.B 2.879 2.282 ARG 80.A NH2.A ASP 11.A OD2 ARG 80.A HH22.A 2.813 1.986 HIS 81.A N LEU 77.A O HIS 81.A H 2.743 1.941 HIS 81.A NE2 TYR 110.A OH HIS 81.A HE2 2.602 1.824 THR 82.A OG1 ALA 78.A O THR 82.A HG1 3.026 2.413 VAL 84.A N HIS 81.A O VAL 84.A H 2.918 2.237 VAL 85.A N HIS 81.A O VAL 85.A H 3.383 2.572 ASP 86.A N THR 82.A O ASP 86.A H 2.895 2.081 LYS 87.A N VAL 84.A O LYS 87.A H 3.304 2.496 PHE 88.A N VAL 85.A O PHE 88.A H 3.159 2.310 SER 93.A N ASP 90.A OD1 SER 93.A H 2.827 2.017 SER 93.A OG ASP 90.A OD1 SER 93.A HG 3.018 2.250 LEU 94.A N ASP 90.A O LEU 94.A H 3.185 2.360 VAL 95.A N PHE 91.A O VAL 95.A H 3.037 2.200 MET 96.A N THR 92.A O MET 96.A H 3.052 2.217 GLY 97.A N LEU 94.A O GLY 97.A H 2.978 2.169 ILE 98.A N VAL 95.A O ILE 98.A H 3.260 2.402 VAL 101.A N GLY 97.A O VAL 101.A H 3.033 2.254 ILE 102.A N GLY 97.A O ILE 102.A H 2.976 2.140 HIS 103.A N ILE 98.A O HIS 103.A H 2.887 2.028 GLU 105.A N VAL 101.A O GLU 105.A H 2.960 2.124 VAL 106.A N ILE 102.A O VAL 106.A H 2.986 2.190 ASN 107.A N HIS 103.A O ASN 107.A H 3.163 2.406 ASN 107.A N LEU 104.A O ASN 107.A H 3.083 2.464 ASN 107.A ND2 HIS 103.A O ASN 107.A HD22 2.814 2.185 LYS 108.A N GLU 105.A O LYS 108.A H 2.825 2.108 LYS 108.A NZ GLU 105.A OE2 LYS 108.A HZ2 3.408 2.639 LEU 109.A N GLU 105.A O LEU 109.A H 2.833 2.105 TYR 110.A N VAL 106.A O TYR 110.A H 2.998 2.217 HIS 117.A N SER 133.A O HIS 117.A H 2.771 1.929 ASN 119.A N ARG 131.A O ASN 119.A H 3.060 2.267 GLN 121.A N ALA 129.A O GLN 121.A H 2.837 2.071 GLN 121.A NE2 ASN 119.A OD1 GLN 121.A HE21 2.818 1.977 LEU 123.A N GLN 127.A O LEU 123.A H 2.817 1.986 ILE 128.A N ILE 176.A O ILE 128.A H 2.877 2.080 ALA 129.A N GLN 121.A O ALA 129.A H 2.881 2.059 LEU 130.A N LEU 174.A O LEU 130.A H 2.893 2.034 ARG 131.A N ASN 119.A O ARG 131.A H 2.869 2.076 TYR 132.A N CYS 172.A O TYR 132.A H 2.886 2.061 SER 133.A OG ASP 170.A O SER 133.A HG 3.263 2.566 ARG 136.A N SER 134.A OG ARG 136.A H 2.725 1.937 ARG 136.A NH2 LEU 115.A O ARG 136.A HH21 3.320 2.742 ARG 137.A N SER 134.A O ARG 137.A H 3.096 2.323 ARG 137.A NH1 MET 165.A O ARG 137.A HH11 3.232 2.634 LEU 138.A N TYR 132.A OH LEU 138.A H 2.729 1.951 ALA 142.A N LEU 138.A O ALA 142.A H 3.020 2.255 GLU 143.A N CYS 139.A O GLU 143.A H 3.018 2.241 GLY 144.A N PHE 140.A O GLY 144.A H 3.159 2.306 LEU 145.A N CYS 141.A O LEU 145.A H 2.961 2.138 LEU 146.A N ALA 142.A O LEU 146.A H 3.011 2.255 PHE 147.A N GLU 143.A O PHE 147.A H 2.974 2.185 GLY 148.A N GLY 144.A O GLY 148.A H 2.838 2.083 ALA 149.A N LEU 145.A O ALA 149.A H 2.845 2.007 ALA 150.A N LEU 146.A O ALA 150.A H 2.925 2.084 GLN 151.A N PHE 147.A O GLN 151.A H 3.056 2.238 HIS 152.A N GLY 148.A O HIS 152.A H 2.882 2.102 PHE 153.A N ALA 149.A O PHE 153.A H 3.240 2.463 ALA 154.A N GLN 151.A O ALA 154.A H 3.071 2.231 ALA 155.A N ALA 150.A O ALA 155.A H 2.776 1.943 ALA 156.A N ASN 180.A O ALA 156.A H 2.727 1.905 GLN 158.A N GLU 177.A O GLN 158.A H 3.148 2.364 GLN 158.A NE2 GLN 179.A OE1 GLN 158.A HE22 3.422 2.787 SER 160.A N ILE 175.A O SER 160.A H 2.998 2.185 HIS 161.A ND1 GLU 143.A OE1 HIS 161.A HD1 2.820 1.993 CYS 164.A SG HIS 161.A NE2 no hydrogen 3.382 N/A HIS 166.A NE2 ARG 137.A O HIS 166.A HE2 3.122 2.354 THR 167.A N CYS 164.A O THR 167.A H 3.080 2.258 THR 167.A OG1 CYS 164.A O THR 167.A HG1 3.223 2.668 GLY 168.A N MET 165.A O GLY 168.A H 3.202 2.369 ALA 169.A N CYS 164.A O ALA 169.A H 3.115 2.282 HIS 171.A ND1 ASP 170.A OD1 HIS 171.A HD1 2.691 1.835 CYS 172.A N TYR 132.A O CYS 172.A H 2.819 1.999 CYS 172.A SG HIS 161.A NE2 no hydrogen 3.591 N/A MET 173.A N.A THR 163.A O MET 173.A H.A 3.075 2.314 MET 173.A N.B THR 163.A O MET 173.A H.B 3.064 2.295 LEU 174.A N LEU 130.A O LEU 174.A H 2.918 2.059 ILE 175.A N SER 160.A O ILE 175.A H 2.819 2.005 ILE 176.A N ILE 128.A O ILE 176.A H 2.721 1.875 GLU 177.A N GLN 158.A O GLU 177.A H 2.761 1.911 LEU 178.A N ASN 126.A O LEU 178.A H 2.930 2.077 GLN 179.A N ALA 156.A O GLN 179.A H 2.781 2.007 ASN 180.A N ALA 156.A O ASN 180.A H 3.377 2.576 ASN 183.A N ASP 181.A OD1 ASN 183.A H 2.957 2.156 LEU 184.A N ASP 181.A O LEU 184.A H 2.929 2.093