Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ud9_H.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 1.A N ASN 143.A O no hydrogen 2.874 N/A ILE 1.A N ASP 200.A OD2 no hydrogen 2.666 N/A VAL 2.A N ASP 195.A O VAL 2.A H 2.819 1.989 SER 5.A N VAL 158.A O SER 5.A H 2.917 2.127 ALA 7.A N LEU 156.A O ALA 7.A H 2.794 1.940 MET 11.A N GLU 8.A O MET 11.A H 3.105 2.299 SER 12.A OG GLN 15.A OE1.A SER 12.A HG 2.801 2.192 GLN 15.A N SER 12.A O GLN 15.A H.A 2.890 2.038 GLN 15.A NE2.A THR 139.A O GLN 15.A HE22.A 3.132 2.417 GLN 15.A NE2.B VAL 16.A O GLN 15.A HE21.B 3.364 2.716 VAL 16.A N ALA 30.A O VAL 16.A H 2.906 2.112 MET 17.A N ARG 62.A O MET 17.A H 2.890 2.036 LEU 18.A N CYS 28.A O LEU 18.A H 2.866 2.031 PHE 19.A N LEU 60.A O PHE 19.A H 2.890 2.056 ARG 20.A N GLU 25.A O ARG 20.A H.B 2.854 2.025 ARG 20.A NE.A GLU 25.A OE2 ARG 20.A HE.A 2.478 1.713 ARG 20.A NH1.B GLU 25.A OE2 ARG 20.A HH11.B 3.139 2.296 LYS 21.A N ASP 58.A O LYS 21.A H 3.068 2.213 LYS 21.A NZ ASN 57.A O LYS 21.A HZ3 2.990 2.267 LEU 27.A N LEU 18.A O LEU 27.A H 2.863 2.006 CYS 28.A SG LEU 27.A O no hydrogen 2.953 N/A CYS 28.A SG SER 201.A OG.A no hydrogen 3.616 N/A GLY 29.A N SER 201.A O.A GLY 29.A H 2.890 2.191 GLY 29.A N SER 201.A O.B GLY 29.A H 2.707 1.976 SER 31.A N LEU 39.A O SER 31.A H 2.866 2.114 SER 31.A OG GLN 217.A OE1 SER 31.A HG 2.642 1.817 LEU 32.A N TRP 14.A O LEU 32.A H 2.820 2.048 ILE 33.A N TRP 37.A O ILE 33.A H 3.040 2.187 ARG 36.A N SER 34.A OG ARG 36.A H 3.235 2.381 ARG 36.A NE LEU 105.A O ARG 36.A HE 2.837 2.150 ARG 36.A NH2 LEU 105.A O ARG 36.A HH21 3.052 2.434 VAL 38.A N MET 103.A O VAL 38.A H 2.926 2.108 LEU 39.A N SER 31.A O LEU 39.A H 2.825 2.011 THR 40.A N ALA 101.A O THR 40.A H 2.964 2.124 THR 40.A OG1 GLY 29.A O THR 40.A HG1 2.875 2.205 HIS 43.A N ASP 99.A OD1 HIS 43.A H 2.836 2.042 HIS 43.A ND1 ASP 99.A OD2 no hydrogen 2.637 N/A CYS 44.A N ALA 41.A O CYS 44.A H 3.065 2.280 CYS 44.A SG HIS 43.A NE2 no hydrogen 4.026 N/A CYS 44.A SG SER 201.A O.A no hydrogen 3.429 N/A LEU 45.A N ALA 42.A O LEU 45.A H 2.893 2.064 LEU 46.A N ALA 42.A O LEU 46.A H 2.892 2.123 GLU 56.A N GLU 56.A OE1 GLU 56.A H 2.697 1.884 ASP 58.A N THR 55I.A O ASP 58.A H 3.000 2.179 LEU 59.A N GLU 56.A O LEU 59.A H 3.228 2.389 LEU 60.A N PHE 19.A O LEU 60.A H 2.864 2.026 VAL 61.A N SER 79.A O VAL 61.A H 3.032 2.188 ARG 62.A N MET 17.A O ARG 62.A H 2.885 2.074 ARG 62.A NE GLU 76.A OE1 ARG 62.A HE 2.770 1.925 ARG 62.A NH2 GLU 76.A OE1 ARG 62.A HH21 3.270 2.596 ARG 62.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 62.A HH21 2.883 2.068 ILE 63.A N LYS 77.A O ILE 63.A H 2.815 1.994 LYS 65.A NZ ARG 70.A O.B LYS 65.A HZ2 2.790 2.230 LYS 65.A NZ GLU 72.A OE1 LYS 65.A HZ3 2.829 1.992 LYS 65.A NZ GLU 76.A OE2 LYS 65.A HZ1 2.828 2.031 HIS 66.A N GLU 72.A OE1 HIS 66.A H 2.830 2.005 HIS 66.A N GLU 72.A OE2 HIS 66.A H 3.348 2.620 SER 67.A N GLU 72.A OE2 SER 67.A H 2.859 2.033 ARG 68.A N SER 154.A O ARG 68.A H 2.907 2.064 ARG 68.A NE PRO 153.A O ARG 68.A HE 2.739 1.905 GLU 72.A N GLU 76.A OE2 GLU 72.A H 2.846 1.994 ILE 75.A N GLU 72.A O ILE 75.A H 2.993 2.201 GLU 76.A N GLU 72.A O GLU 76.A H 2.947 2.150 LYS 77.A N ILE 63.A O LYS 77.A H 2.816 2.002 SER 79.A N VAL 61.A O SER 79.A H 2.888 2.054 GLU 82.A N LYS 104.A O GLU 82.A H 2.742 1.957 LYS 83.A N LYS 104.A O LYS 83.A H 3.373 2.582 ILE 84.A N GLU 56.A OE2 ILE 84.A H 2.872 2.043 TYR 85.A N LEU 102.A O TYR 85.A H 2.827 1.983 HIS 87.A N ILE 100.A O HIS 87.A H 3.221 2.373 ARG 89.A N HIS 87.A ND1 ARG 89.A H 2.930 2.079 TYR 90.A N HIS 87.A O TYR 90.A H 3.059 2.202 TYR 90.A OH LEU 46.A O TYR 90.A HH 2.761 1.960 ASN 91.A N ASP 97.A O ASN 91.A H 2.861 2.026 ASN 95.A ND2 ARG 176.A O ASN 95.A HD21 2.865 2.056 LEU 96.A N ASN 91.A O LEU 96.A H 2.838 2.178 ASP 97.A N ASN 95.A OD1 ASP 97.A H 3.115 2.338 ARG 98.A NH1 ARG 89.A O ARG 98.A HH11 2.780 2.058 ALA 101.A N THR 40.A O ALA 101.A H 2.940 2.162 LEU 102.A N TYR 85.A O LEU 102.A H 2.839 2.017 MET 103.A N VAL 38.A O MET 103.A H 2.793 1.983 LYS 104.A N LYS 83.A O LYS 104.A H 2.886 2.048 LEU 105.A N ARG 36.A O LEU 105.A H 2.803 1.970 LYS 106.A N MET 80.A O LYS 106.A H 2.974 2.139 VAL 109.A N ASP 35.A O VAL 109.A H 2.906 2.103 SER 112.A N ILE 115.A O SER 112.A H 2.975 2.148 TYR 114.A N SER 112.A OG TYR 114.A H 2.994 2.171 ILE 115.A N SER 112.A O ILE 115.A H 3.311 2.479 HIS 116.A N PRO 13.A O HIS 116.A H 3.048 2.253 VAL 118.A N LEU 32.A O VAL 118.A H 3.028 2.225 CYS 119.A N TRP 215.A O CYS 119.A H 3.128 2.299 THR 125.A N ASP 122.A OD2 THR 125.A H 2.750 1.938 THR 125.A OG1 ASP 122.A OD2 THR 125.A HG1 3.316 2.534 ALA 126.A N ASP 122.A O ALA 126.A H 3.035 2.181 LEU 130.A N ALA 126.A O LEU 130.A H.A 2.948 2.120 GLN 131.A N LEU 129C.A O GLN 131.A H 2.903 2.245 GLN 131.A NE2 SER 128B.A O GLN 131.A HE21 2.771 1.912 GLY 133.A N ILE 163.A O GLY 133.A H 2.789 1.937 TYR 134.A N GLN 131.A O TYR 134.A H 3.009 2.190 GLY 136.A N LEU 161.A O GLY 136.A H 2.933 2.149 ARG 137.A N VAL 206.A O ARG 137.A H 2.808 2.070 ARG 137.A NE ASN 160.A OD1 ARG 137.A HE 3.068 2.246 VAL 138.A N VAL 159.A O VAL 138.A H 2.836 1.988 THR 139.A OG1 GLN 15.A OE1.B THR 139.A HG1 2.733 2.118 GLY 140.A N GLN 157.A O GLY 140.A H 3.034 2.262 TRP 141.A NE1 HIS 66.A O TRP 141.A HE1 2.914 2.053 GLY 142.A N ASP 200.A OD1 GLY 142.A H 2.767 1.948 ASN 143.A N GLU 198.A O ASN 143.A H 2.794 1.996 LEU 144.A N GLY 151.A O LEU 144.A H 2.758 1.905 GLN 152.A NE2 ASN 143.A OD1 GLN 152.A HE21 3.099 2.257 LEU 156.A N HIS 66.A O LEU 156.A H 2.871 2.101 GLN 157.A N GLY 140.A O GLN 157.A H 3.012 2.162 GLN 157.A NE2 ASP 6.A OD1 GLN 157.A HE22 2.857 2.028 GLN 157.A NE2 VAL 155.A O GLN 157.A HE21 3.021 2.166 VAL 158.A N SER 5.A O VAL 158.A H.A 2.852 2.103 VAL 159.A N VAL 138.A O VAL 159.A H 2.939 2.134 LEU 161.A N GLY 136.A O LEU 161.A H 2.814 2.008 ILE 163.A N TYR 134.A O ILE 163.A H 2.848 1.996 VAL 164.A N CYS 183.A O VAL 164.A H 2.970 2.143 GLU 165.A N GLU 165.A OE1 GLU 165.A H 2.755 1.913 ARG 166.A NH1 MET 181.A O ARG 166.A HH12 2.805 2.004 ARG 166.A NH2 THR 178.A O ARG 166.A HH22 2.855 2.275 ARG 166.A NH2 MET 181.A O ARG 166.A HH22 3.019 2.295 CYS 169.A N GLU 165.A O CYS 169.A H 3.027 2.197 CYS 169.A SG VAL 164.A O no hydrogen 3.616 N/A CYS 169.A SG GLU 165.A O no hydrogen 3.505 N/A LYS 170.A N ARG 166.A O LYS 170.A H 2.921 2.083 ASP 171.A N PRO 167.A O ASP 171.A H 2.903 2.126 SER 172.A N CYS 169.A O SER 172.A H 3.222 2.392 SER 172.A OG CYS 169.A O SER 172.A HG 2.722 1.888 THR 173.A OG1 GLU 225.A OE1 THR 173.A HG1 2.839 2.169 ILE 175.A N THR 173.A OG1 ILE 175.A H 3.075 2.230 ARG 176.A NE GLU 94A.A OE2 ARG 176.A HE 2.962 2.123 ARG 176.A NH2 GLU 94A.A OE1 ARG 176.A HH21 2.690 1.845 THR 178.A OG1 ASP 97.A OD1 THR 178.A HG1 2.701 1.863 ASN 180.A N THR 178.A OG1 ASN 180.A H 3.063 2.290 ASN 180.A ND2 ASP 97.A OD1 ASN 180.A HD21 2.923 2.081 MET 181.A N THR 178.A O MET 181.A H 3.051 2.271 PHE 182.A N TYR 236.A O PHE 182.A H 2.951 2.154 ALA 184.A N GLY 234.A O ALA 184.A H 2.973 2.205 GLY 185.A N PRO 162.A O GLY 185.A H 2.893 2.078 LYS 187.A N GLU 190B.A OE1 LYS 187.A H 2.756 1.913 LYS 187.A NZ GLU 165.A OE1 LYS 187.A HZ2 2.958 2.140 LYS 187.A NZ GLU 165.A OE2 LYS 187.A HZ2 3.504 2.804 ARG 193.A NE ASP 228.A OD2 ARG 193.A HE 2.830 2.021 ARG 193.A NH1 ASP 230.A OD1 ARG 193.A HH12 2.894 2.176 ARG 193.A NH2 ASP 228.A O ARG 193.A HH21 2.749 2.024 ARG 193.A NH2 ASP 228.A OD2 ARG 193.A HH21 3.516 2.871 ARG 193.A NH2 ASP 230.A OD1 ARG 193.A HH22 2.906 2.191 GLY 194.A N ASP 228.A OD1 GLY 194.A H 2.856 2.021 ASP 195.A N VAL 2.A O ASP 195.A H 3.205 2.449 CYS 197.A N ASP 200.A OD2 CYS 197.A H 2.844 2.076 ASP 200.A N CYS 197.A O ASP 200.A H 2.956 2.108 SER 201.A OG.B HIS 43.A NE2 SER 201.A HG.B 2.866 2.292 GLY 202.A N VAL 221.A O GLY 202.A H 2.844 1.990 GLY 203.A N ASP 200.A O GLY 203.A H 3.102 2.261 PHE 205.A N GLY 219.A O PHE 205.A H 2.955 2.099 VAL 206.A N ARG 137.A O VAL 206.A H 2.879 2.064 MET 207.A N TYR 216.A O MET 207.A H 2.881 2.079 SER 209.A N ARG 214.A O SER 209.A H 2.824 2.007 ASN 213.A N SER 209.A O ASN 213.A H 2.881 2.177 ARG 214.A N ASN 212B.A OD1 ARG 214.A H 3.175 2.371 TYR 216.A N MET 207.A O TYR 216.A H 2.859 2.008 GLN 217.A N CYS 119.A O GLN 217.A H 2.853 2.029 GLN 217.A NE2 GLY 219.A O GLN 217.A HE21 2.980 2.155 MET 218.A N PHE 205.A O MET 218.A H 2.928 2.267 GLY 219.A N PHE 205.A O GLY 219.A H 3.087 2.261 ILE 220.A N THR 237.A O ILE 220.A H 3.200 2.493 VAL 221.A N GLY 203.A O VAL 221.A H 2.846 2.015 SER 222.A N PHE 235.A O SER 222.A H 2.959 2.167 SER 222.A OG ASP 99.A OD2 SER 222.A HG 2.705 1.871 TRP 223.A N PHE 235.A O TRP 223.A H 3.095 2.292 CYS 227.A N GLU 146.A OE1 CYS 227.A H 3.014 2.205 ASP 228.A N ASP 195.A OD2 ASP 228.A H 2.805 1.949 LYS 232.A N ARG 229A.A O no hydrogen 3.117 N/A LYS 232.A NZ.A SER 172.A O no hydrogen 3.017 N/A LYS 232.A NZ.A GLU 225.A OE1 no hydrogen 3.414 N/A LYS 232.A NZ.B SER 172.A O no hydrogen 2.728 N/A LYS 232.A NZ.B GLU 225.A OE1 no hydrogen 2.787 N/A GLY 234.A N ALA 184.A O GLY 234.A H 3.128 2.376 PHE 235.A N TRP 223.A O PHE 235.A H 2.826 1.988 TYR 236.A N PHE 182.A O TYR 236.A H 2.832 2.031 THR 237.A N ILE 220.A O THR 237.A H 2.877 2.108 THR 237.A OG1 ASP 99.A O THR 237.A HG1 2.819 2.009 HIS 238.A N ASN 180.A O HIS 238.A H 2.880 2.043 VAL 239.A N MET 218.A O VAL 239.A H 3.091 2.254 ARG 241.A N HIS 238.A ND1 ARG 241.A H 3.361 2.546 ARG 241.A NE ASN 180.A OD1 ARG 241.A HE 3.001 2.172 ARG 241.A NH2 ASN 180.A OD1 ARG 241.A HH21 3.233 2.492 LEU 242.A N VAL 239.A O LEU 242.A H 2.995 2.252 LYS 243.A N PHE 240.A O LYS 243.A H 3.056 2.208 LYS 243.A NZ PRO 121.A O LYS 243.A HZ3 2.966 2.249 TRP 245.A N LEU 242.A O TRP 245.A H 3.120 2.520 ILE 246.A N LEU 242.A O ILE 246.A H 3.247 2.427 GLN 247.A N.A LYS 243.A O GLN 247.A H.A 2.866 2.036 GLN 247.A N.B LYS 243.A O GLN 247.A H.B 2.855 2.016 LYS 248.A N LYS 244.A O LYS 248.A H 2.958 2.151 VAL 249.A N TRP 245.A O VAL 249.A H 2.976 2.157 ILE 250.A N ILE 246.A O ILE 250.A H 2.992 2.143 ASP 251.A N GLN 247.A O.A ASP 251.A H 2.769 1.929 ASP 251.A N GLN 247.A O.B ASP 251.A H 2.802 1.965 GLN 252.A N LYS 248.A O GLN 252.A H 3.042 2.282 PHE 253.A N VAL 249.A O PHE 253.A H 2.836 2.035 GLY 254.A N ILE 250.A O GLY 254.A H 2.753 2.047 TYR 47A.A N LYS 52F.A O TYR 47A.A H 2.753 1.917 ARG 73A.A N TYR 71.A O ARG 73A.A H 2.964 2.339 GLU 94A.A N ASN 91.A OD1 GLU 94A.A H 2.946 2.237 ALA 127A.A N ARG 123.A O ALA 127A.A H 2.884 2.060 PHE 211A.A N SER 209.A OG PHE 211A.A H 3.062 2.275 ARG 229A.A NE GLU 146.A OE1 ARG 229A.A HE 2.958 2.184 ARG 229A.A NH2 GLU 146.A OE2 ARG 229A.A HH21 2.787 1.930 SER 128B.A N GLU 124.A O SER 128B.A H.A 2.938 2.120 SER 128B.A OG.B GLU 124.A O SER 128B.A HG.B 2.952 2.253 GLU 190B.A N LYS 187.A O GLU 190B.A H 2.987 2.144 ASN 212B.A ND2 TYR 216.A OH ASN 212B.A HD22 2.884 2.051 LEU 129C.A N THR 125.A O LEU 129C.A H 2.946 2.184 TRP 50D.A N TYR 47A.A O TRP 50D.A H 2.987 2.189 ASP 51E.A N PRO 48B.A O ASP 51E.A H 2.909 2.058 LYS 52F.A N TYR 47A.A O LYS 52F.A H 3.141 2.294 PHE 54H.A N LEU 45.A O PHE 54H.A H 2.929 2.133 THR 55I.A N ASP 58.A OD2 THR 55I.A H 2.859 2.014