Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4up1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 3.A NE2 ARG 249.A O HIS 3.A HE2 3.005 2.306 GLU 5.A N HIS 3.A ND1 GLU 5.A H 3.040 2.240 LEU 6.A N HIS 3.A O LEU 6.A H 3.371 2.567 GLN 7.A N GLY 4.A O GLN 7.A H 3.023 2.280 TYR 8.A OH MET 194.A O TYR 8.A HH 2.473 1.652 LEU 9.A N GLU 5.A O LEU 9.A H 2.987 2.151 GLY 10.A N LEU 6.A O GLY 10.A H 2.664 1.889 GLN 11.A N GLN 7.A O GLN 11.A H 3.210 2.507 GLN 11.A N TYR 8.A O GLN 11.A H 3.069 2.424 ILE 12.A N TYR 8.A O ILE 12.A H 3.235 2.451 GLN 13.A N LEU 9.A O GLN 13.A H 3.087 2.269 HIS 14.A N GLY 10.A O HIS 14.A H 3.026 2.254 ILE 15.A N GLN 11.A O ILE 15.A H 3.101 2.304 LEU 16.A N ILE 12.A O LEU 16.A H 3.150 2.375 ARG 17.A N GLN 13.A O ARG 17.A H 3.126 2.273 CYS 18.A N HIS 14.A O CYS 18.A H 2.819 1.989 GLY 19.A N ILE 15.A O GLY 19.A H 2.815 2.131 VAL 20.A N SER 32.A O VAL 20.A H 3.075 2.243 ARG 21.A NH2 ASP 23.A OD1 ARG 21.A HH21 3.501 2.781 LYS 22.A N THR 30.A O LYS 22.A H 2.707 1.877 LYS 22.A NZ ASP 229.A OD2 LYS 22.A HZ3 3.495 2.720 ASP 24.A N THR 28.A O ASP 24.A H 3.020 2.202 THR 26.A N ASP 24.A OD1 THR 26.A H 3.232 2.624 GLY 27.A N ASP 24.A O GLY 27.A H 3.136 2.312 THR 28.A N ASP 24.A OD1 THR 28.A H 2.668 2.036 THR 28.A OG1 THR 26.A OG1 THR 28.A HG1 2.951 2.255 THR 30.A N LYS 22.A O THR 30.A H 2.804 2.107 THR 30.A OG1 LYS 22.A O THR 30.A HG1 2.759 1.929 LEU 31.A N ILE 232.A O LEU 31.A H 2.935 2.094 SER 32.A N VAL 20.A O SER 32.A H 2.788 1.939 VAL 33.A N ALA 230.A O VAL 33.A H 2.792 1.950 GLY 35.A N GLY 228.A O GLY 35.A H 2.878 2.189 GLN 37.A NE2 THR 226.A OG1 GLN 37.A HE21 3.401 2.544 ALA 38.A N HIS 225.A O ALA 38.A H 3.020 2.307 TYR 40.A N PHE 223.A O TYR 40.A H 2.784 1.952 LEU 42.A N GLY 221.A O LEU 42.A H 2.894 2.087 ARG 43.A N SER 41.A OG ARG 43.A H 3.263 2.419 ARG 43.A NE GLU 182.A OE1 ARG 43.A HE 3.296 2.618 ARG 43.A NE GLU 182.A OE2 ARG 43.A HE 3.119 2.313 ARG 43.A NH1 SER 41.A OG ARG 43.A HH11 3.000 2.240 ARG 43.A NH1 ASP 222.A OD1 ARG 43.A HH12 2.594 1.736 ARG 43.A NH2 GLU 182.A OE1 ARG 43.A HH21 2.940 2.165 ARG 43.A NH2 ASP 222.A OD2 ARG 43.A HH22 3.100 2.267 PHE 46.A N PRO 252.A O PHE 46.A H 2.998 2.166 LEU 48.A N PHE 46.A O LEU 48.A H 2.600 1.948 THR 50.A N GLU 5.A OE1 THR 50.A H 2.850 2.008 THR 50.A OG1 GLU 5.A OE1 THR 50.A HG1 2.950 2.160 THR 51.A N GLU 5.A OE2 THR 51.A H 2.998 2.195 THR 51.A OG1 GLU 5.A OE2 THR 51.A HG1 2.604 1.811 VAL 54.A N TYR 276.A OH VAL 54.A H 3.085 2.286 VAL 59.A N PHE 55.A O VAL 59.A H 3.281 2.478 LEU 60.A N TRP 56.A O LEU 60.A H 2.825 1.975 GLU 61.A N LYS 57.A O GLU 61.A H 3.050 2.225 GLU 62.A N GLY 58.A O GLU 62.A H 2.941 2.152 LEU 63.A N VAL 59.A O LEU 63.A H 3.037 2.244 LEU 64.A N LEU 60.A O LEU 64.A H 3.113 2.257 TRP 65.A N GLU 61.A O TRP 65.A H 3.070 2.346 TRP 65.A NE1 ASN 72.A O TRP 65.A HE1 3.004 2.328 PHE 66.A N GLU 62.A O PHE 66.A H 2.850 2.146 ILE 67.A N LEU 63.A O ILE 67.A H 2.984 2.175 LYS 68.A N LEU 64.A O LYS 68.A H 3.107 2.338 LYS 68.A NZ GLU 75.A OE2 LYS 68.A HZ3 2.755 2.045 GLY 69.A N PHE 66.A O GLY 69.A H 2.802 2.010 THR 71.A OG1 TYR 121.A OH THR 71.A HG1 2.988 2.226 ASN 72.A N SER 70.A OG ASN 72.A H 3.200 2.398 ALA 73.A N GLY 104.A O ALA 73.A H 2.826 1.983 LYS 74.A N ASN 72.A OD1 LYS 74.A H 3.068 2.278 LYS 74.A NZ GLU 103.A OE1 LYS 74.A HZ2 2.855 2.031 LEU 76.A N ALA 73.A O LEU 76.A H 3.176 2.563 SER 77.A N ALA 73.A O SER 77.A H 2.845 2.045 SER 78.A N LYS 74.A O SER 78.A H 2.931 2.151 SER 78.A OG LYS 74.A O SER 78.A HG 3.426 2.754 SER 78.A OG GLU 75.A O SER 78.A HG 2.899 2.294 LYS 79.A N LEU 76.A O LYS 79.A H 3.035 2.222 GLY 80.A N SER 77.A O GLY 80.A H 2.965 2.121 LYS 82.A NZ SER 77.A O LYS 82.A HZ3 2.790 1.951 TRP 84.A NE1 GLU 62.A OE2 TRP 84.A HE1 3.021 2.179 ASP 85.A N LYS 82.A O ASP 85.A H 3.042 2.192 GLY 88.A N ASP 85.A O GLY 88.A H 3.019 2.244 SER 89.A OG ALA 86.A O SER 89.A HG 2.978 2.269 ARG 90.A N GLU 103.A OE2 ARG 90.A H 3.313 2.544 PHE 92.A N SER 89.A OG PHE 92.A H 3.268 2.449 LEU 93.A N SER 89.A O LEU 93.A H 3.065 2.232 ASP 94.A N ARG 90.A O ASP 94.A H 3.357 2.554 SER 95.A N ASP 91.A O SER 95.A H 3.260 2.494 SER 95.A OG PHE 92.A O SER 95.A HG 2.497 1.798 LEU 96.A N LEU 93.A O LEU 96.A H 3.037 2.269 GLY 97.A N ASP 94.A O GLY 97.A H 3.119 2.282 PHE 98.A N LEU 93.A O PHE 98.A H 3.086 2.257 ARG 101.A N PHE 98.A O ARG 101.A H 2.643 1.829 ARG 101.A NH1 LEU 164.A O ARG 101.A HH12 3.025 2.343 ARG 101.A NH2 LEU 164.A O ARG 101.A HH22 2.667 1.858 GLY 104.A N GLY 88.A O GLY 104.A H 2.780 2.025 ASP 105.A N GLU 102.A O ASP 105.A H 3.376 2.562 LEU 106.A N THR 71.A O LEU 106.A H 3.301 2.500 GLY 107.A N ASP 105.A OD1 GLY 107.A H 3.098 2.255 VAL 109.A N GLY 107.A O VAL 109.A H 2.810 2.130 GLN 113.A N VAL 109.A O GLN 113.A H 3.065 2.232 GLN 113.A NE2 PRO 108.A O GLN 113.A HE21 3.045 2.213 GLN 113.A NE2 ASP 161.A OD2 GLN 113.A HE22 3.134 2.301 TRP 114.A N TYR 110.A O TRP 114.A H 2.800 2.006 ARG 115.A NE ASP 134.A OD1 ARG 115.A HE 2.980 2.177 ARG 115.A NE ASP 134.A OD2 ARG 115.A HE 3.328 2.604 ARG 115.A NH1 ILE 67.A O ARG 115.A HH11 2.830 2.142 ARG 115.A NH1 ASP 264.A OD2 ARG 115.A HH12 2.597 1.781 ARG 115.A NH2 ASP 134.A OD2 ARG 115.A HH21 3.038 2.245 ARG 115.A NH2 ASP 264.A OD2 ARG 115.A HH22 3.240 2.627 HIS 116.A N PHE 112.A O HIS 116.A H 2.841 2.070 ALA 119.A N HIS 116.A O ALA 119.A H 3.007 2.174 TYR 121.A OH ASP 105.A OD1 TYR 121.A HH 2.589 1.873 ARG 122.A N TYR 128.A OH ARG 122.A H 2.906 2.047 MET 124.A N ASP 105.A OD2 MET 124.A H 3.173 2.465 GLU 125.A N ASP 123.A OD1 GLU 125.A H 3.108 2.383 SER 126.A N ASP 123.A O SER 126.A H 3.139 2.286 TYR 128.A OH ASP 123.A O TYR 128.A HH 2.968 2.223 SER 129.A N ASP 127.A OD1 SER 129.A H 3.298 2.597 GLN 131.A N TYR 128.A O GLN 131.A H 2.827 2.003 VAL 133.A N PHE 117.A O VAL 133.A H 2.598 1.779 GLN 135.A N TRP 114.A O GLN 135.A H 2.888 2.043 GLN 135.A NE2 GLN 113.A O GLN 135.A HE21 2.858 2.084 GLN 135.A NE2 CYS 155.A O GLN 135.A HE22 2.929 2.078 GLN 137.A N ASP 134.A OD1 GLN 137.A H 3.115 2.280 GLN 137.A NE2 ASP 141.A OD1 GLN 137.A HE21 3.072 2.242 ARG 138.A N ASP 134.A O ARG 138.A H 3.280 2.476 VAL 139.A N GLN 135.A O VAL 139.A H 2.861 2.066 ILE 140.A N LEU 136.A O ILE 140.A H 3.293 2.474 ASP 141.A N GLN 137.A O ASP 141.A H 2.752 1.934 THR 142.A N ARG 138.A O THR 142.A H 2.856 2.031 THR 142.A OG1 ARG 138.A O THR 142.A HG1 2.651 1.871 ILE 143.A N VAL 139.A O ILE 143.A H 2.996 2.184 LYS 144.A N ILE 140.A O LYS 144.A H 3.281 2.515 LYS 144.A N ASP 141.A O LYS 144.A H 3.198 2.609 THR 145.A N ASP 141.A O THR 145.A H 2.967 2.126 THR 145.A OG1 ASN 146.A OD1 THR 145.A HG1 3.097 2.459 ASN 146.A N THR 142.A O ASN 146.A H 2.704 1.893 ASP 149.A N ASN 146.A O ASP 149.A H 2.972 2.136 ARG 151.A N ASP 149.A OD2 ARG 151.A H 2.857 2.189 MET 154.A N CYS 174.A O MET 154.A H 2.978 2.145 CYS 155.A N GLN 135.A OE1 CYS 155.A H 2.960 2.103 ALA 156.A N ALA 172.A O ALA 156.A H 2.897 2.120 ASN 158.A ND2 GLN 113.A OE1 ASN 158.A HD21 3.657 2.833 ARG 160.A N ASN 158.A OD1 ARG 160.A H 3.325 2.576 ARG 160.A NH1 GLY 118.A O ARG 160.A HH12 3.530 3.015 ASP 161.A N ASN 158.A O ASP 161.A H 2.741 2.072 LEU 164.A N ASP 161.A O LEU 164.A H 3.158 2.412 MET 165.A N LEU 162.A O MET 165.A H 3.248 2.389 ALA 166.A N LEU 106.A O ALA 166.A H 3.146 2.358 CYS 170.A N TYR 110.A OH CYS 170.A H 2.541 1.835 HIS 171.A N TYR 110.A OH HIS 171.A H 3.229 2.425 HIS 171.A NE2 ASN 201.A OD1 HIS 171.A HE2 2.621 1.843 ALA 172.A N TYR 188.A O ALA 172.A H 2.957 2.157 CYS 174.A N MET 154.A O CYS 174.A H 3.030 2.240 GLN 175.A N GLN 186.A O GLN 175.A H 2.877 2.071 GLN 175.A NE2 ARG 150.A O GLN 175.A HE21 2.935 2.445 PHE 176.A N ILE 152.A O PHE 176.A H 3.348 2.550 TYR 177.A N SER 184.A O TYR 177.A H 2.913 2.178 VAL 179.A N GLU 182.A O VAL 179.A H 3.290 2.510 GLU 182.A N VAL 179.A O GLU 182.A H 2.878 2.084 LEU 183.A N LYS 219.A O LEU 183.A H 2.933 2.128 SER 184.A N TYR 177.A O SER 184.A H 2.812 1.961 CYS 185.A N ASP 222.A O CYS 185.A H 3.304 2.544 GLN 186.A N GLN 175.A O GLN 186.A H 2.913 2.103 GLN 186.A NE2 THR 226.A OG1 GLN 186.A HE21 2.577 1.848 LEU 187.A N ILE 224.A O LEU 187.A H 2.944 2.136 TYR 188.A N LEU 173.A O TYR 188.A H 2.910 2.053 GLN 189.A N THR 226.A O GLN 189.A H 2.814 1.963 GLN 189.A NE2 SER 191.A O GLN 189.A HE21 3.020 2.192 ARG 190.A N CYS 170.A O ARG 190.A H 3.145 2.441 ARG 190.A NE PRO 169.A O ARG 190.A HE 2.806 2.032 ARG 190.A NH2 PRO 168.A O ARG 190.A HH21 3.499 2.641 GLY 192.A N ASP 229.A O GLY 192.A H 3.018 2.204 MET 194.A N HIS 231.A O MET 194.A H 3.154 2.316 GLY 195.A N ASP 193.A OD1 GLY 195.A H 2.928 2.171 LEU 196.A N ASP 193.A O LEU 196.A H 3.281 2.541 LEU 196.A N ASP 193.A OD1 LEU 196.A H 3.193 2.541 VAL 198.A N ASP 193.A O VAL 198.A H 2.884 2.065 ASN 201.A N GLY 197.A O ASN 201.A H 3.072 2.306 ILE 202.A N VAL 198.A O ILE 202.A H 2.955 2.125 ALA 203.A N PRO 199.A O ALA 203.A H 3.213 2.405 SER 204.A N PHE 200.A O SER 204.A H 3.093 2.325 TYR 205.A N ASN 201.A O TYR 205.A H 3.224 2.387 ALA 206.A N ILE 202.A O ALA 206.A H 3.070 2.325 LEU 207.A N ALA 203.A O LEU 207.A H 2.976 2.158 LEU 208.A N SER 204.A O LEU 208.A H 2.803 2.005 THR 209.A N TYR 205.A O THR 209.A H 3.205 2.407 THR 209.A OG1 TYR 205.A O THR 209.A HG1 2.681 1.897 TYR 210.A N ALA 206.A O TYR 210.A H 2.982 2.205 TYR 210.A OH GLU 45.A O TYR 210.A HH 2.849 2.120 MET 211.A N LEU 207.A O MET 211.A H 2.840 2.033 ILE 212.A N LEU 208.A O ILE 212.A H 2.931 2.075 ALA 213.A N THR 209.A O ALA 213.A H 2.914 2.132 HIS 214.A N TYR 210.A O HIS 214.A H 3.019 2.281 HIS 214.A N MET 211.A O HIS 214.A H 3.130 2.527 ILE 215.A N MET 211.A O ILE 215.A H 3.160 2.338 THR 216.A N ILE 212.A O THR 216.A H 3.050 2.246 THR 216.A OG1 ILE 212.A O THR 216.A HG1 2.782 1.980 THR 216.A OG1 ALA 213.A O THR 216.A HG1 3.495 3.092 GLY 217.A N HIS 214.A O GLY 217.A H 3.289 2.468 LEU 218.A N ALA 213.A O LEU 218.A H 2.699 1.842 LYS 219.A N SER 181.A O LYS 219.A H 3.259 2.407 GLY 221.A N LEU 183.A O GLY 221.A H 2.821 1.985 PHE 223.A N TYR 40.A O PHE 223.A H 2.681 1.829 ILE 224.A N CYS 185.A O ILE 224.A H 2.880 2.071 HIS 225.A N ALA 38.A O HIS 225.A H 2.712 1.868 HIS 225.A NE2 GLN 189.A OE1 HIS 225.A HE2 2.862 2.006 THR 226.A N LEU 187.A O THR 226.A H 2.894 2.076 LEU 227.A N MET 36.A O LEU 227.A H 3.276 2.449 GLY 228.A N GLN 189.A O GLY 228.A H 2.572 1.724 ASP 229.A N ARG 190.A O ASP 229.A H 2.676 2.021 ALA 230.A N VAL 33.A O ALA 230.A H 2.923 2.099 HIS 231.A N GLY 192.A O HIS 231.A H 3.449 2.630 HIS 231.A NE2 SER 191.A OG no hydrogen 3.253 N/A ILE 232.A N LEU 31.A O ILE 232.A H 3.211 2.408 HIS 236.A N TYR 233.A O HIS 236.A H 2.721 1.882 LEU 240.A N HIS 236.A O LEU 240.A H 2.994 2.218 LYS 241.A N ILE 237.A O LYS 241.A H 2.944 2.181 LYS 241.A NZ GLU 238.A OE2 LYS 241.A HZ3 3.276 2.466 ILE 242.A N GLU 238.A O ILE 242.A H 3.085 2.349 GLN 243.A N PRO 239.A O GLN 243.A H 3.194 2.412 GLN 243.A NE2 THR 51.A OG1 GLN 243.A HE21 2.752 1.950 LEU 244.A N LEU 240.A O LEU 244.A H 2.884 2.128 GLN 245.A N ILE 242.A O GLN 245.A H 3.031 2.349 GLN 245.A NE2 LYS 241.A O GLN 245.A HE21 3.618 2.835 ARG 246.A N GLN 243.A O ARG 246.A H 3.164 2.483 ARG 246.A NH1 THR 51.A O ARG 246.A HH11 2.806 2.042 ARG 249.A N THR 50.A OG1 ARG 249.A H 2.848 2.162 ARG 249.A NH1 ASN 277.A O ARG 249.A HH11 3.299 2.442 LYS 253.A N GLU 274.A O LYS 253.A H 2.968 2.148 LYS 253.A NZ ASP 44.A O LYS 253.A HZ3 2.754 1.925 ARG 255.A N GLN 272.A O ARG 255.A H 2.986 2.177 LEU 257.A N ASP 270.A O LEU 257.A H 2.838 2.001 ARG 258.A NE ASP 270.A OD1 ARG 258.A HE 2.828 2.067 ARG 258.A NE ASP 270.A OD2 ARG 258.A HE 3.229 2.582 ARG 258.A NH1 ASP 265.A OD2 ARG 258.A HH12 3.394 2.569 ARG 258.A NH2 ASP 265.A O ARG 258.A HH22 2.913 2.368 ARG 258.A NH2 ASP 270.A OD2 ARG 258.A HH21 3.197 2.557 VAL 260.A N HIS 214.A NE2 VAL 260.A H 3.234 2.404 ASP 265.A N LYS 262.A O ASP 265.A H 3.046 2.260 LYS 267.A N ASP 270.A OD2 LYS 267.A H 2.848 2.059 LYS 267.A NZ ASP 265.A O LYS 267.A HZ1 3.429 2.584 LYS 267.A NZ PHE 266.A O LYS 267.A HZ3 3.408 2.820 ASP 270.A N LYS 267.A O ASP 270.A H 2.919 2.087 PHE 271.A N ALA 268.A O PHE 271.A H 3.459 2.610 GLN 272.A N ARG 255.A O GLN 272.A H 3.095 2.357 GLN 272.A NE2 GLU 274.A OE1 GLN 272.A HE21 3.129 2.422 GLU 274.A N LYS 253.A O GLU 274.A H 3.082 2.238 TYR 276.A OH LEU 49.A O TYR 276.A HH 2.972 2.148 HIS 279.A N THR 50.A O HIS 279.A H 2.848 2.052 HIS 279.A NE2 GLU 247.A O HIS 279.A HE2 2.718 1.887