Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4uup_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 3.A N.A LYS 32.A O ILE 3.A H.A 2.954 2.158 ILE 3.A N.B LYS 32.A O ILE 3.A H.B 2.967 2.171 HIS 4.A N ASP 79.A OD2 HIS 4.A H 2.994 2.143 HIS 4.A ND1 HIS 36.A NE2 HIS 4.A HD1 3.077 2.221 VAL 5.A N VAL 34.A O VAL 5.A H 2.950 2.112 LEU 6.A N VAL 80.A O LEU 6.A H 2.800 1.954 ILE 7.A N HIS 36.A O ILE 7.A H 2.808 1.986 THR 8.A N PHE 82.A O THR 8.A H 3.097 2.254 ALA 10.A N LEU 38.A O ALA 10.A H 3.443 2.626 ALA 11.A N GLU 39.A OE2 ALA 11.A H 2.891 2.083 GLY 12.A N GLY 9.A O GLY 12.A H 2.996 2.167 TYR 16.A N GLY 12.A O TYR 16.A H 2.864 2.028 TYR 16.A OH GLU 53.A OE2 TYR 16.A HH 2.604 1.774 ALA 17.A N GLN 13.A O ALA 17.A H 3.232 2.411 LEU 18.A N ILE 14.A O LEU 18.A H 2.868 2.064 ALA 19.A N GLY 15.A O ALA 19.A H 2.940 2.200 ARG 21.A NE ASP 26.A OD2 ARG 21.A HE 2.848 2.001 ARG 21.A NH1 ASN 244.A OD1 ARG 21.A HH12 2.797 1.939 ARG 21.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 21.A HH21 3.416 2.781 ILE 22.A N LEU 18.A O ILE 22.A H 3.075 2.234 ALA 23.A N ALA 19.A O ALA 23.A H 2.876 2.041 LYS 24.A N PHE 20.A O LYS 24.A H 3.012 2.330 GLY 25.A N ILE 22.A O GLY 25.A H.A 3.205 2.433 ASP 26.A N ARG 21.A O ASP 26.A H 3.034 2.213 GLY 29.A N GLY 25.A O GLY 29.A H 2.937 2.274 ARG 31.A N PHE 28.A O ARG 31.A H 3.204 2.376 ARG 31.A NE GLU 1.A O ARG 31.A HE 3.137 2.420 ARG 31.A NH2 GLU 1.A O ARG 31.A HH21 3.081 2.364 LYS 32.A NZ PRO 60.A O LYS 32.A HZ3 3.075 2.445 VAL 33.A N.A THR 61.A O VAL 33.A H.A 2.888 2.076 VAL 33.A N.B THR 61.A O VAL 33.A H.B 2.886 2.074 VAL 34.A N ILE 3.A O.A VAL 34.A H 2.744 1.900 VAL 34.A N ILE 3.A O.B VAL 34.A H 2.915 2.095 LEU 35.A N GLY 64.A O LEU 35.A H 2.941 2.158 HIS 36.A N VAL 5.A O HIS 36.A H 2.683 1.842 HIS 36.A ND1 ALA 74.A O HIS 36.A HD1 2.805 2.000 LEU 37.A N VAL 66.A O LEU 37.A H 2.725 1.879 LEU 38.A N ILE 7.A O LEU 38.A H 3.103 2.276 GLU 39.A N THR 68.A O GLU 39.A H 3.051 2.244 ILE 40.A N GLU 39.A OE1 ILE 40.A H 3.099 2.357 ALA 43.A N ILE 40.A O ALA 43.A H 2.926 2.089 MET 44.A N PRO 41.A O MET 44.A H 3.175 2.321 LEU 47.A N ALA 43.A O LEU 47.A H 2.925 2.130 GLU 48.A N.A MET 44.A O GLU 48.A H.A 2.916 2.113 GLU 48.A N.B MET 44.A O GLU 48.A H.B 2.936 2.150 GLY 49.A N LYS 45.A O GLY 49.A H 3.392 2.621 VAL 50.A N ALA 46.A O VAL 50.A H 2.995 2.239 CYS 51.A N LEU 47.A O CYS 51.A H 2.939 2.146 CYS 51.A SG LEU 47.A O CYS 51.A HG 3.411 2.414 MET 52.A N GLU 48.A O.A MET 52.A H 2.953 2.168 MET 52.A N GLU 48.A O.B MET 52.A H 2.946 2.158 GLU 53.A N GLY 49.A O GLU 53.A H 3.045 2.218 LEU 54.A N VAL 50.A O LEU 54.A H 2.890 2.092 GLN 55.A N CYS 51.A O GLN 55.A H 3.104 2.270 ASP 56.A N MET 52.A O ASP 56.A H 2.923 2.166 CYS 57.A N LEU 54.A O CYS 57.A H 3.124 2.294 CYS 57.A SG GLU 53.A O CYS 57.A HG 3.473 2.391 ALA 58.A N GLN 55.A O ALA 58.A H 3.120 2.319 THR 61.A OG1 ALA 23.A O THR 61.A HG1 2.662 1.901 LEU 62.A N PHE 59.A O LEU 62.A H 3.218 2.379 ALA 63.A N VAL 33.A O.A ALA 63.A H 2.810 1.974 ALA 63.A N VAL 33.A O.B ALA 63.A H 2.781 1.945 VAL 66.A N LEU 35.A O VAL 66.A H 2.764 1.921 THR 68.A N LEU 37.A O THR 68.A H 2.943 2.135 THR 68.A OG1 GLU 73.A OE1 THR 68.A HG1 3.093 2.497 ASP 70.A N THR 68.A OG1 ASP 70.A H 2.917 2.070 GLU 72.A N ASP 70.A OD1 GLU 72.A H 3.245 2.467 ALA 74.A N ASP 70.A O ALA 74.A H 2.929 2.119 PHE 75.A N PRO 71.A O PHE 75.A H 2.872 2.059 ASP 77.A N TYR 116.A O ASP 77.A H 2.862 2.013 VAL 78.A N PHE 75.A O VAL 78.A H 3.252 2.418 ASP 79.A N HIS 4.A O ASP 79.A H 2.845 1.997 VAL 80.A N HIS 4.A O VAL 80.A H 3.335 2.571 ALA 81.A N LYS 122.A O ALA 81.A H 2.862 2.028 PHE 82.A N LEU 6.A O PHE 82.A H 2.865 2.015 LEU 83.A N LEU 124.A O LEU 83.A H 2.893 2.076 GLY 85.A N THR 8.A OG1 GLY 85.A H 2.827 2.021 SER 86.A OG GLY 85.A O SER 86.A HG 2.638 1.914 PHE 87.A N ASN 102.A OD1 PHE 87.A H 2.878 2.042 ARG 89.A NH1 MET 93.A O ARG 89.A HH11 3.060 2.238 GLU 94.A N ASP 97.A OD2 GLU 94.A H 2.943 2.103 ASP 97.A N GLU 94.A O ASP 97.A H 3.124 2.340 LEU 99.A N ALA 96.A O LEU 99.A H 3.164 2.369 ASN 102.A N LEU 98.A O ASN 102.A H 2.804 2.102 ASN 102.A ND2 PHE 87.A O ASN 102.A HD22 3.051 2.208 ASN 102.A ND2 ASN 128.A O ASN 102.A HD21 2.727 1.887 ALA 103.A N LEU 99.A O ALA 103.A H 2.806 1.988 ILE 105.A N ASN 102.A O ILE 105.A H 3.078 2.443 PHE 106.A N ALA 103.A O PHE 106.A H 3.076 2.399 LYS 107.A N ALA 103.A O LYS 107.A H 3.323 2.559 VAL 108.A N.A GLY 104.A O VAL 108.A H.A 3.232 2.409 VAL 108.A N.B GLY 104.A O VAL 108.A H.B 3.208 2.369 GLN 109.A N ILE 105.A O GLN 109.A H 2.903 2.105 GLY 110.A N PHE 106.A O GLY 110.A H 2.848 2.026 LYS 111.A N LYS 107.A O LYS 111.A H 3.337 2.530 LYS 111.A NZ GLU 115.A OE1 LYS 111.A HZ1 3.208 2.409 ALA 112.A N VAL 108.A O.A ALA 112.A H 3.013 2.230 ALA 112.A N VAL 108.A O.B ALA 112.A H 2.961 2.175 LEU 113.A N GLN 109.A O LEU 113.A H 2.823 1.986 SER 114.A N GLY 110.A O SER 114.A H 3.140 2.313 GLU 115.A N LYS 111.A O GLU 115.A H 3.035 2.260 TYR 116.A N ALA 112.A O TYR 116.A H 2.849 2.088 ALA 117.A N LEU 113.A O ALA 117.A H 3.041 2.287 LYS 118.A N VAL 78.A O LYS 118.A H 3.211 2.403 LYS 118.A NZ ASP 79.A OD1 LYS 118.A HZ3 3.066 2.277 VAL 121.A N LYS 118.A O VAL 121.A H 2.968 2.155 LYS 122.A N ASP 79.A O LYS 122.A H 3.038 2.212 LYS 122.A NZ GLY 293.A O LYS 122.A HZ2 3.392 2.715 VAL 123.A N ASN 148.A O VAL 123.A H 2.806 2.004 LEU 124.A N ALA 81.A O LEU 124.A H 2.855 2.031 VAL 125.A N SER 150.A O VAL 125.A H 2.889 2.045 VAL 126.A N LEU 83.A O VAL 126.A H 2.994 2.165 GLY 127.A N LEU 83.A O GLY 127.A H 3.028 2.175 ALA 130.A N ASN 128.A OD1 ALA 130.A H 3.142 2.427 ASN 131.A ND2 GLY 182.A O ASN 131.A HD22 3.093 2.462 ASN 131.A ND2 ILE 282.A O ASN 131.A HD21 2.853 1.996 ASN 133.A N PRO 129.A O ASN 133.A H 2.832 1.985 ASN 133.A ND2 GLY 127.A O ASN 133.A HD21 3.062 2.237 CYS 134.A N ALA 130.A O CYS 134.A H 2.913 2.127 LEU 135.A N ASN 131.A O LEU 135.A H 3.118 2.317 ILE 136.A N THR 132.A O ILE 136.A H 2.980 2.147 ALA 137.A N ASN 133.A O ALA 137.A H 3.007 2.175 MET 138.A N CYS 134.A O MET 138.A H 3.025 2.182 ALA 139.A N LEU 135.A O ALA 139.A H 2.953 2.180 ASN 140.A N ALA 137.A O ASN 140.A H 3.139 2.381 ASN 140.A ND2 ILE 136.A O ASN 140.A HD21 2.843 1.994 ALA 141.A N MET 138.A O ALA 141.A H 3.177 2.353 LYS 143.A N SER 114.A OG LYS 143.A H 3.018 2.210 LEU 144.A N ALA 141.A O LEU 144.A H 2.998 2.225 GLY 145.A N ASN 148.A OD1 GLY 145.A H 2.864 2.076 GLU 147.A N GLU 147.A OE1 GLU 147.A H 2.757 1.921 ASN 148.A N GLY 145.A O ASN 148.A H 2.949 2.108 ASN 148.A ND2 PRO 119.A O ASN 148.A HD22 2.925 2.215 ASN 148.A ND2 VAL 121.A O ASN 148.A HD21 2.875 2.030 PHE 149.A N PRO 146.A O PHE 149.A H 3.191 2.338 SER 150.A N VAL 123.A O SER 150.A H 2.973 2.197 SER 150.A OG HIS 249.A NE2 SER 150.A HG 2.835 2.156 ALA 151.A N GLY 266.A O ALA 151.A H 2.787 1.976 MET 152.A N VAL 125.A O MET 152.A H 3.025 2.239 ARG 154.A NE ASN 158.A OD1 ARG 154.A HE 3.075 2.293 ARG 154.A NH1 ASP 252.A OD2 ARG 154.A HH12 2.813 2.017 ARG 154.A NH2 ASP 252.A OD2 ARG 154.A HH22 3.030 2.309 HIS 157.A N THR 153.A O HIS 157.A H 2.939 2.128 HIS 157.A ND1 SER 264.A OG no hydrogen 2.773 N/A ASN 158.A N ARG 154.A O ASN 158.A H 2.827 1.994 ARG 159.A N LEU 155.A O ARG 159.A H 2.872 2.038 ALA 160.A N ASP 156.A O ALA 160.A H 2.913 2.098 ILE 161.A N.A HIS 157.A O ILE 161.A H.A 2.989 2.198 ILE 161.A N.B HIS 157.A O ILE 161.A H.B 2.965 2.156 GLY 162.A N ASN 158.A O GLY 162.A H 2.954 2.100 GLU 163.A N ARG 159.A O GLU 163.A H 2.892 2.097 ILE 164.A N ALA 160.A O ILE 164.A H 2.959 2.116 ALA 165.A N ILE 161.A O.A ALA 165.A H 2.861 2.029 ALA 165.A N ILE 161.A O.B ALA 165.A H 2.861 2.026 ALA 166.A N GLY 162.A O ALA 166.A H 3.120 2.289 LYS 167.A N GLU 163.A O LYS 167.A H 2.927 2.108 LEU 168.A N ILE 164.A O LEU 168.A H 2.836 2.001 GLY 169.A N ALA 165.A O GLY 169.A H 2.748 2.113 GLY 169.A N ALA 166.A O GLY 169.A H 3.172 2.535 VAL 170.A N ALA 165.A O VAL 170.A H 3.015 2.189 ASP 173.A N ASP 173.A OD1 ASP 173.A H 2.675 2.057 LYS 174.A N PRO 171.A O LYS 174.A H 2.976 2.144 VAL 175.A N VAL 172.A O VAL 175.A H 3.370 2.521 HIS 176.A N THR 196.A O HIS 176.A H 2.991 2.189 HIS 176.A NE2 ASP 198.A OD2 HIS 176.A HE2 2.851 2.101 ASN 177.A ND2 GLY 260.A O ASN 177.A HD22 2.997 2.268 VAL 179.A N ASP 191.A O VAL 179.A H 3.105 2.323 TRP 181.A N VAL 189.A O TRP 181.A H 2.984 2.178 TRP 181.A NE1 ASP 191.A OD2 TRP 181.A HE1 2.876 2.030 GLY 182.A N SER 284.A O GLY 182.A H 2.933 2.127 ASN 183.A N THR 314.A OG1 ASN 183.A H 2.926 2.126 ASN 183.A ND2 GLU 317.A OE1 ASN 183.A HD21 2.937 2.124 ASN 183.A ND2 GLU 321.A OE2 ASN 183.A HD22 2.986 2.241 HIS 184.A N ASN 131.A OD1 HIS 184.A H 3.021 2.168 HIS 184.A ND1 ASP 156.A OD2 HIS 184.A HD1 2.513 1.668 SER 185.A OG GLU 317.A OE1 SER 185.A HG 2.652 1.851 THR 187.A N SER 185.A OG THR 187.A H 3.077 2.228 THR 187.A OG1 SER 185.A OG THR 187.A HG1 3.100 2.279 GLN 188.A N SER 185.A O GLN 188.A H 3.148 2.297 GLN 188.A NE2 ASP 156.A OD1 GLN 188.A HE22 3.091 2.400 GLN 188.A NE2 SER 185.A O GLN 188.A HE21 3.025 2.200 VAL 189.A N TRP 181.A O VAL 189.A H 3.010 2.212 ASP 191.A N VAL 179.A O ASP 191.A H 2.698 1.848 SER 193.A N ASP 191.A OD1 SER 193.A H 2.934 2.088 SER 193.A OG ASP 191.A OD1 SER 193.A HG 2.712 1.975 SER 193.A OG ASP 191.A OD2 SER 193.A HG 3.543 2.836 HIS 194.A NE2 ASP 191.A OD2 HIS 194.A HE2 2.907 2.288 ALA 195.A N VAL 192.A O ALA 195.A H 3.120 2.308 THR 196.A N HIS 176.A O THR 196.A H 2.979 2.191 VAL 197.A N LYS 204.A O VAL 197.A H 2.759 1.947 ASP 198.A N LYS 174.A O ASP 198.A H 2.831 2.005 LYS 199.A N GLY 202.A O LYS 199.A H 2.897 2.048 GLY 202.A N LYS 199.A O GLY 202.A H 3.059 2.215 THR 203.A OG1 ASP 198.A OD1 THR 203.A HG1 2.614 1.836 LYS 204.A N VAL 197.A O LYS 204.A H 2.907 2.081 VAL 206.A N ALA 195.A O VAL 206.A H 2.999 2.147 ASP 208.A N LYS 205.A O ASP 208.A H 2.869 2.071 ALA 209.A N VAL 206.A O ALA 209.A H 2.971 2.161 LEU 210.A N VAL 206.A O LEU 210.A H 3.077 2.440 LYS 212.A NZ GLU 216.A OE2 LYS 212.A HZ3 2.527 1.732 TYR 214.A N PRO 211.A O TYR 214.A H 3.061 2.447 LEU 215.A N PRO 211.A O LEU 215.A H 3.109 2.280 GLU 216.A N LYS 212.A O GLU 216.A H 2.942 2.233 GLY 217.A N TYR 214.A O GLY 217.A H 3.261 2.449 PHE 219.A N TYR 214.A O PHE 219.A H 3.045 2.200 GLN 221.A N GLY 217.A O GLN 221.A H 3.032 2.189 LYS 222.A N GLU 218.A O LYS 222.A H 2.970 2.148 LYS 222.A NZ GLU 163.A OE1 LYS 222.A HZ1 3.254 2.571 LYS 222.A NZ GLU 163.A OE2 LYS 222.A HZ1 3.080 2.401 ILE 223.A N PHE 219.A O ILE 223.A H 3.124 2.292 ALA 224.A N VAL 220.A O ALA 224.A H 2.905 2.085 GLN 225.A N GLN 221.A O GLN 225.A H 2.979 2.283 ARG 226.A N ILE 223.A O ARG 226.A H 3.281 2.431 ALA 229.A N GLN 225.A O ALA 229.A H 2.952 2.164 VAL 230.A N ARG 226.A O VAL 230.A H 2.928 2.102 ILE 231.A N GLY 227.A O ILE 231.A H 3.155 2.315 GLU 232.A N GLY 228.A O GLU 232.A H 2.910 2.092 ALA 233.A N ALA 229.A O ALA 233.A H 3.073 2.294 ARG 234.A N VAL 230.A O ARG 234.A H 2.945 2.091 ARG 234.A NH2 SER 237.A O ARG 234.A HH21 2.651 1.825 GLY 235.A N ILE 231.A O GLY 235.A H 2.789 2.126 SER 237.A N GLN 13.A OE1 SER 237.A H 3.023 2.197 SER 241.A OG SER 238.A O SER 241.A HG 3.434 2.914 ALA 242.A N SER 238.A O ALA 242.A H 2.900 2.122 ALA 243.A N ALA 239.A O ALA 243.A H 2.884 2.055 ASN 244.A N ALA 240.A O ASN 244.A H 2.905 2.086 ALA 245.A N SER 241.A O ALA 245.A H 2.980 2.155 ALA 246.A N ALA 242.A O ALA 246.A H 2.855 2.053 LEU 247.A N.A ALA 243.A O LEU 247.A H.A 2.979 2.149 LEU 247.A N.B ALA 243.A O LEU 247.A H.B 2.971 2.152 CYS 248.A N.B ASN 244.A O no hydrogen 2.901 N/A CYS 248.A O.B LEU 247.A O.A no hydrogen 3.296 N/A CYS 248.A O.B LEU 247.A O.B no hydrogen 3.401 N/A CYS 248.A SG.B ASN 244.A O no hydrogen 3.357 N/A HIS 249.A N ALA 245.A O HIS 249.A H 2.852 2.012 MET 250.A N ALA 246.A O MET 250.A H 2.981 2.137 ARG 251.A N LEU 247.A O.A ARG 251.A H 2.787 1.944 ARG 251.A N LEU 247.A O.B ARG 251.A H 2.867 2.033 ARG 251.A NH2 ASP 26.A O ARG 251.A HH21 3.462 2.729 ASP 252.A N CYS 248.A O.B ASP 252.A H 3.034 2.181 TRP 253.A N HIS 249.A O TRP 253.A H 2.920 2.114 LEU 254.A N MET 250.A O LEU 254.A H 2.864 2.111 PHE 255.A N ARG 251.A O PHE 255.A H 2.904 2.104 GLY 256.A N ASP 252.A O GLY 256.A H 2.821 2.087 THR 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