Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4y3p_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.810 2.085 SER 1.A OG SER 151.A O SER 1.A HG 3.116 2.281 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 3.028 2.228 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.958 2.139 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.655 1.896 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.943 2.100 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.820 2.007 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.524 2.915 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.882 2.216 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.891 2.082 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.903 2.104 LEU 13.A N ASP 11.A OD1 LEU 13.A H 3.069 2.285 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.343 2.490 ASP 15.A N ASP 11.A OD1 ASP 15.A H 3.061 2.208 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.693 1.894 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.879 2.050 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.856 2.079 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.795 2.031 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.938 2.125 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.045 2.213 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.849 2.022 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.786 1.949 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.028 2.218 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.812 2.132 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.801 1.984 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.017 2.162 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.959 2.138 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.800 1.940 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.909 2.072 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.916 2.083 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.916 2.092 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.909 2.110 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.803 2.250 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.881 2.066 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.299 2.441 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.599 1.965 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.671 1.890 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.940 2.224 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.869 2.086 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.912 2.099 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.889 2.062 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.661 1.835 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.916 2.154 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 3.017 2.210 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.030 2.189 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.676 1.969 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 3.037 2.182 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.829 1.999 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.901 2.065 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.182 2.328 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.793 1.999 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.904 2.155 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.042 2.214 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.954 2.156 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.927 2.154 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.884 2.037 TYR 59.A OH ASP 92.A OD2 TYR 59.A HH 2.732 1.960 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.837 1.998 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.050 2.213 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.979 2.133 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 3.355 2.729 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 2.780 1.977 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.877 2.067 THR 65.A OG1 THR 25.A O THR 65.A HG1 3.410 2.578 THR 66.A N SER 64.A OG THR 66.A H 3.405 2.612 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD1 THR 66.A HG1 2.556 1.812 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.284 2.456 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 3.008 2.214 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.842 1.992 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.106 2.261 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.892 2.073 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.047 2.268 TRP 75.A NE1 ASP 88.A O TRP 75.A HE1 2.927 2.338 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.193 2.435 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.302 2.533 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.913 2.071 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.878 2.056 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.909 2.064 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.094 2.244 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.784 2.018 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.909 2.107 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.074 2.282 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.038 2.253 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.058 2.267 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.143 2.550 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.945 2.090 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.565 1.772 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.788 1.979 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.942 2.167 THR 93.A N ASP 92.A OD1 THR 93.A H 2.714 1.965 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.909 2.068 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.781 1.958 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.878 2.079 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.950 2.098 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.713 1.882 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.830 1.973 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.965 2.309 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.130 2.303 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.244 2.459 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.710 1.855 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.917 2.071 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.771 2.026 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 3.011 2.166 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.787 2.026 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.157 2.320 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 3.036 2.222 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.847 2.087 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.984 2.280 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.321 2.501 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.655 1.863 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.847 2.050 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.127 2.317 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.126 2.294 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.833 1.995 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.908 2.063 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.929 2.210 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.988 2.157 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.009 2.334 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.799 1.975 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.847 1.990 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.051 2.204 SER 131.A OG ASP 146.A OD2.B SER 131.A HG 2.835 2.188 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.025 2.166 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.962 2.109 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.971 2.115 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.076 2.316 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.022 2.258 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.736 1.912 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 3.008 2.175 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.852 2.017 GLN 140.A NE2.A THR 132.A O GLN 140.A HE22.A 3.131 2.356 GLN 140.A NE2.A ASN 134.A O GLN 140.A HE21.A 2.889 2.032 GLN 140.A NE2.B THR 132.A O GLN 140.A HE22.B 2.851 2.160 GLN 140.A NE2.B ASN 134.A O GLN 140.A HE21.B 2.942 2.087 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H.B 2.904 2.050 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.966 2.110 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.020 2.197 ASP 146.A N.A THR 143.A OG1 ASP 146.A H.A 2.966 2.114 ASP 146.A N.B THR 143.A OG1 ASP 146.A H.B 2.943 2.106 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H.A 2.936 2.096 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.838 2.003 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.978 2.222 LYS 149.A N ASP 146.A O.A LYS 149.A H 3.334 2.538 LYS 149.A NZ GLY 319.A O LYS 149.A HZ3 3.172 2.339 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.887 2.143 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.165 2.387 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.977 2.197 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.800 2.102 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.061 2.254 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.793 2.005 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.835 2.023 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.906 2.131 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.253 2.604 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.811 1.959 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.774 1.938 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.921 2.129 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.860 2.034 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.127 2.357 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.851 2.003 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.805 1.968 THR 177.A N ASP 175.A OD1 THR 177.A H 2.926 2.120 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 2.619 1.781 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.032 2.200 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.944 2.124 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.874 2.030 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.784 2.036 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.834 2.037 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.314 2.461 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE1 GLN 192.A HE21 3.109 2.495 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.056 2.278 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.844 2.020 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.899 2.053 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.833 2.000 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD1.A THR 198.A HG1 2.662 1.951 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.810 2.044 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.761 1.945 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.214 2.425 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.772 1.944 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.107 2.341 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.960 2.181 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.811 1.960 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.886 2.061 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.776 1.919 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.053 2.273 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.918 2.085 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H.A 2.938 2.134 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.023 2.268 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.955 2.125 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.044 2.189 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.876 2.060 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.738 2.173 GLY 221.A N ASP 219.A OD1 GLY 221.A H 2.844 2.071 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.236 2.387 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD2 THR 222.A HG1 2.698 2.052 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.607 2.047 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.020 2.160 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.899 2.054 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.978 2.178 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.066 2.236 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.860 2.021 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.093 2.277 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.063 2.300 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.712 1.878 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.041 2.204 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.859 2.039 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.979 2.181 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 2.986 2.151 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 2.999 2.167 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.128 2.276 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.003 2.196 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.847 1.990 SER 247.A OG SER 245.A OG SER 247.A HG 3.061 2.485 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.054 2.233 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.803 1.991 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.132 2.392 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.767 1.947 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.914 2.081 PHE 253.A N CYS 290.A O.A PHE 253.A H 2.891 2.132 PHE 253.A N CYS 290.A O.B PHE 253.A H 2.847 2.079 CYS 255.A N.B SER 288.A O CYS 255.A H.B 3.438 2.619 CYS 255.A SG.A ASP 279.A OD1 no hydrogen 3.391 N/A CYS 255.A SG.A ASP 279.A OD2 no hydrogen 3.537 N/A CYS 255.A SG.B SER 288.A O no hydrogen 2.943 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.798 1.955 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.942 2.137 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.915 2.066 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.944 2.162 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.840 2.070 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.913 2.081 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.782 2.004 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.066 2.363 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.906 2.133 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.948 2.096 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.790 1.939 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.959 2.189 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.972 2.129 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.306 2.452 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.986 2.175 GLY 281.A N ASP 279.A OD1 GLY 281.A H 2.897 2.063 ILE 283.A N SER 289.A O.A ILE 283.A H 2.855 2.085 ILE 283.A N SER 289.A O.B ILE 283.A H 2.827 2.051 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.979 2.137 SER 289.A N.A SER 287.A OG SER 289.A H.A 2.985 2.139 SER 289.A N.B SER 287.A OG SER 289.A H.B 2.994 2.149 CYS 290.A N.A PHE 253.A O CYS 290.A H.A 2.730 1.886 CYS 290.A N.B PHE 253.A O CYS 290.A H.B 2.779 1.922 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H.A 2.845 2.039 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.009 2.159 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.730 2.075 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.875 2.044 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.042 2.215 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.847 2.025 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.838 2.026 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.561 1.755 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.051 2.202 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.023 2.181 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.890 2.089 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O.A ASN 303.A HD22 2.755 1.917 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O.B ASN 303.A HD22 2.903 2.097 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.855 2.052 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.760 1.999 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.762 1.951 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.058 2.323 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.980 2.333 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.978 2.133 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.799 1.957 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3 2.761 1.926 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.138 2.340 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.938 2.107 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.854 2.027 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.036 2.217 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.781 1.950 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.819 1.977 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.967 2.150 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.908 2.055 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.745 1.998 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.093 2.307 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.095 2.347 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.078 2.232 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.869 2.050 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.917 2.100 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.945 2.134 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD1 LYS 330.A HZ2 2.703 1.882 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.818 2.085 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.184 2.587 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.820 1.978