Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4y5e_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.995 2.196 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.960 2.146 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.641 1.859 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.918 2.083 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.880 2.068 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.477 2.861 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.886 2.236 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.927 2.128 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H.B 2.894 2.096 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.048 2.284 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.298 2.445 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.056 2.201 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.679 1.870 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.885 2.057 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.893 2.111 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.828 2.056 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.947 2.122 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 2.999 2.169 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.829 2.006 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.820 1.979 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.055 2.257 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.765 2.108 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.814 2.001 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.023 2.169 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.945 2.133 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.818 1.959 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.951 2.112 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.907 2.073 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.901 2.073 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.930 2.123 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.776 2.231 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.964 2.146 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.312 2.463 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.610 1.972 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.674 1.891 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.990 2.272 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.893 2.113 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.955 2.132 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.895 2.090 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.677 1.860 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.941 2.193 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.960 2.158 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.061 2.218 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.716 2.008 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.980 2.123 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.855 2.023 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.860 2.032 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.166 2.315 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.774 1.956 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.846 2.070 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.029 2.204 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.993 2.215 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.918 2.156 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.933 2.085 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.720 1.938 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.847 2.012 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.033 2.205 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.998 2.150 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.757 1.952 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.330 2.700 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.844 2.036 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.641 1.922 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.287 2.449 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.968 2.188 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.830 1.978 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.107 2.259 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.913 2.093 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.061 2.279 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.228 2.467 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.311 2.538 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.906 2.072 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.888 2.044 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.912 2.068 SER 83.A N ASP 81.A OD2 SER 83.A H 2.999 2.149 SER 83.A OG ASP 81.A OD2 SER 83.A HG 2.731 1.947 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.137 2.351 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.016 2.226 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.034 2.237 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.110 2.465 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.957 2.099 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.654 1.843 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.813 2.017 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 3.017 2.247 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.741 2.010 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.929 2.089 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.828 2.007 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.861 2.069 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.950 2.095 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.745 1.913 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.848 1.994 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 3.009 2.344 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.167 2.339 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.230 2.451 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.730 1.887 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.878 2.028 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.813 2.064 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 3.012 2.163 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.804 2.061 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.147 2.305 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.946 2.134 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.885 2.105 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 3.007 2.355 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.267 2.443 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.694 1.892 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.884 2.099 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.117 2.317 THR 121.A N ASP 119.A OD2 THR 121.A H 3.100 2.285 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD2 THR 121.A HG1 2.776 1.944 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.911 2.064 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.920 2.201 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.988 2.162 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.007 2.324 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.859 2.044 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.894 2.038 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.041 2.190 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.049 2.191 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.992 2.139 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.997 2.143 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.050 2.302 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.046 2.286 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.739 1.915 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 3.006 2.172 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.860 2.027 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.936 2.256 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.941 2.094 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.920 2.067 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.936 2.084 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.045 2.217 ASP 146.A N.A THR 143.A OG1 ASP 146.A H.A 2.996 2.141 ASP 146.A N.B THR 143.A OG1 ASP 146.A H.B 2.964 2.117 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H.A 2.913 2.063 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.817 1.989 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.943 2.179 LYS 149.A N ASP 146.A O.A no hydrogen 3.348 N/A SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.930 2.165 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.164 2.405 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.971 2.197 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.117 2.513 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.795 2.111 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.048 2.247 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.830 2.039 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.890 2.087 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.918 2.170 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.245 2.594 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.808 1.957 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.787 1.961 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.906 2.120 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.869 2.051 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.153 2.378 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.800 1.952 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.831 2.007 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.941 2.128 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.446 2.871 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.692 1.855 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.028 2.191 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.949 2.127 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.914 2.074 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.794 2.038 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.830 2.049 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.250 2.395 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.038 2.356 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.924 2.098 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.932 2.088 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.879 2.051 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.822 2.063 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.740 1.925 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.241 2.452 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.755 1.924 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.055 2.297 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.960 2.185 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.803 1.953 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.900 2.074 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.764 1.912 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.018 2.241 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.926 2.099 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.880 2.059 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.014 2.256 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.972 2.146 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.012 2.160 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.901 2.082 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.783 2.214 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.896 2.156 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.236 2.379 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.679 2.054 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.654 1.946 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.069 2.209 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.912 2.070 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.988 2.193 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.059 2.226 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.930 2.099 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.112 2.292 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.061 2.279 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.732 1.901 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.052 2.205 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.887 2.059 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.966 2.180 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.013 2.173 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.010 2.170 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.068 2.213 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.027 2.220 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.879 2.020 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.043 2.215 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.838 2.021 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.095 2.366 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.786 1.968 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.908 2.072 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.885 2.113 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.894 2.058 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.929 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.908 2.053 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.949 2.146 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.892 2.044 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.928 2.136 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.894 2.100 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.959 2.126 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.823 2.057 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.079 2.379 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.921 2.145 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.920 2.071 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.762 1.910 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.B 2.969 2.216 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.941 2.099 ASP 279.A N ASP 276.A O.B ASP 279.A H 3.182 2.327 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 3.011 2.211 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.852 2.030 ILE 283.A N SER 289.A O.A ILE 283.A H 2.878 2.095 ILE 283.A N SER 289.A O.B ILE 283.A H 2.836 2.042 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.979 2.133 SER 289.A N.A SER 287.A OG SER 289.A H.A 3.024 2.170 SER 289.A N.B SER 287.A OG SER 289.A H.B 3.022 2.167 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H.B 2.795 1.939 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.831 2.028 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.013 2.165 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.760 2.126 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.915 2.087 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.019 2.192 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.857 2.038 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.827 2.009 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.625 1.822 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.046 2.199 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.054 2.204 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H.B 2.890 2.103 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.846 2.013 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.876 2.079 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.795 2.027 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.792 1.984 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.075 2.331 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.999 2.374 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.985 2.145 LYS 311.A N.A ASP 307.A O LYS 311.A H.A 2.875 2.032 LYS 311.A N.B ASP 307.A O LYS 311.A H.B 2.888 2.044 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.917 2.068 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.736 1.870 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H.A 3.150 2.369 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.970 2.142 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.856 2.041 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.051 2.222 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.799 1.971 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.799 1.954 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.957 2.148 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.906 2.062 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.788 2.046 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.121 2.327 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.079 2.338 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.084 2.237 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H.A 2.850 2.030 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.921 2.108 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.926 2.118 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.794 1.965 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.816 2.076 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.A LYS 330.A HZ1 3.102 2.501 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.B LYS 330.A HZ1 3.222 2.612 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.835 1.983