Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4y5k_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O.A SER 1.A H3 2.785 1.962 SER 1.A N SER 151.A O.B SER 1.A H3 2.875 2.082 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.808 2.099 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 3.008 2.206 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.967 2.153 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.647 1.857 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.956 2.112 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.874 2.060 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.523 2.928 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.864 2.186 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.938 2.148 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.946 2.141 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.074 2.297 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.327 2.473 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.064 2.214 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.724 1.922 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.880 2.053 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.894 2.103 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.779 1.993 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.953 2.130 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.027 2.200 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.853 2.028 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.813 1.973 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.061 2.257 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.749 2.094 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.798 1.982 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.030 2.177 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.929 2.109 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.825 1.965 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.955 2.119 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.903 2.066 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.909 2.078 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.929 2.129 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.754 2.187 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.900 2.091 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.296 2.443 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.563 1.964 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.677 1.891 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.977 2.251 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 2.796 2.127 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.900 2.120 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.941 2.128 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.871 2.066 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.738 1.924 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.925 2.175 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 3.045 2.255 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.086 2.245 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.716 2.017 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.993 2.140 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.853 2.020 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.163 2.310 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.733 1.913 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.044 2.219 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 3.004 2.207 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.902 2.116 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.962 2.114 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.736 1.957 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.859 2.025 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.048 2.223 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.976 2.132 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.776 1.975 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.350 2.712 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.899 2.085 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.611 1.868 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.282 2.454 LYS 68.A N.A THR 91.A O LYS 68.A H.A 3.027 2.229 LYS 68.A N.B THR 91.A O LYS 68.A H.B 3.026 2.228 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.881 2.026 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.100 2.253 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.877 2.055 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.076 2.291 TRP 75.A NE1 ASP 88.A O TRP 75.A HE1 2.926 2.331 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.303 2.539 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.912 2.074 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.860 2.011 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.892 2.049 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 2.939 2.086 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.763 1.981 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.123 2.341 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.019 2.234 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.067 2.279 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.105 2.472 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.944 2.088 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.632 1.815 THR 91.A N LYS 68.A O.A THR 91.A H 2.815 2.019 THR 91.A N LYS 68.A O.B THR 91.A H 2.812 2.018 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 3.006 2.240 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.723 1.977 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.925 2.085 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.810 1.990 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.855 2.064 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.991 2.137 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.703 1.869 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.831 1.976 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 3.054 2.418 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.136 2.305 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.251 2.466 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.756 1.908 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.884 2.041 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.790 2.029 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 3.019 2.168 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.783 2.031 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.124 2.287 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.970 2.157 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.892 2.131 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H.A 3.028 2.363 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.302 2.476 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.725 1.916 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.875 2.088 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.083 2.271 THR 121.A N ASP 119.A OD2 THR 121.A H 3.128 2.304 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD2 THR 121.A HG1 2.789 1.952 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.944 2.096 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.924 2.200 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 3.010 2.183 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.052 2.384 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.863 2.057 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.895 2.040 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.080 2.234 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.038 2.179 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.989 2.136 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.981 2.127 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.024 2.270 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.046 2.300 THR 135.A N ASP 40.A OD2 THR 135.A H 3.420 2.603 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.776 1.946 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.995 2.161 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.850 2.014 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.922 2.258 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.946 2.095 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.931 2.078 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.927 2.077 ASP 146.A N.A THR 143.A OG1 ASP 146.A H.A 2.983 2.136 ASP 146.A N.B THR 143.A OG1 ASP 146.A H.B 3.007 2.152 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H.B 2.948 2.108 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.768 1.941 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.940 2.185 LYS 149.A N ASP 146.A O.B LYS 149.A H 3.374 2.580 LYS 149.A NZ GLY 319.A O LYS 149.A HZ3 2.939 2.089 SER 151.A N.A ALA 148.A O SER 151.A H.A 2.912 2.154 SER 151.A N.B ALA 148.A O SER 151.A H.B 2.918 2.171 SER 151.A OG.B SER 1.A OG SER 151.A HG.B 3.182 2.460 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H.A 3.126 2.355 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.977 2.204 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.132 2.539 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.809 2.121 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.048 2.250 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.826 2.034 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.871 2.067 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.895 2.121 TYR 163.A OH ASP 276.A O.B TYR 163.A HH 3.277 2.695 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.281 2.609 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.818 1.972 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.829 1.993 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.908 2.125 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.872 2.056 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.140 2.367 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.833 1.985 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.788 1.955 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.882 2.075 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.390 2.816 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.660 1.825 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.088 2.253 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.939 2.121 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.914 2.075 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.780 2.019 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.848 2.065 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.260 2.407 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE1 GLN 192.A HE21 3.299 2.674 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.046 2.241 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.918 2.108 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.894 2.046 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.845 2.017 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.831 2.076 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.766 1.955 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.230 2.441 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.775 1.946 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.074 2.315 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.931 2.153 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.756 1.907 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.898 2.075 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.786 1.934 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.053 2.267 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.905 2.075 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.874 2.045 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.001 2.248 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.991 2.164 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.040 2.186 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.894 2.077 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.743 2.183 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.855 2.112 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.236 2.380 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.685 2.076 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.654 1.912 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.078 2.218 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.914 2.078 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.986 2.191 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.097 2.263 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.903 2.066 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.095 2.278 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.052 2.268 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.716 1.887 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.051 2.204 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.886 2.055 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.969 2.186 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.013 2.178 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.015 2.171 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.064 2.210 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.026 2.213 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.858 1.998 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.028 2.203 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.835 2.010 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.130 2.388 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.776 1.957 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.890 2.055 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.892 2.124 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.877 2.030 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.968 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.910 2.060 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.947 2.133 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.909 2.062 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.919 2.134 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.866 2.076 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.948 2.117 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.822 2.053 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.035 2.332 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.913 2.144 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.937 2.084 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.780 1.927 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 3.002 2.243 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.955 2.121 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.208 2.355 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.987 2.174 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.883 2.056 ILE 283.A N SER 289.A O.A ILE 283.A H 2.862 2.087 ILE 283.A N SER 289.A O.B ILE 283.A H 2.843 2.065 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.954 2.106 SER 289.A N.A SER 287.A OG SER 289.A H.A 3.010 2.158 SER 289.A N.B SER 287.A OG SER 289.A H.B 3.009 2.155 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H.A 2.840 1.990 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.814 2.010 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.040 2.188 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.720 2.074 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.904 2.075 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.045 2.214 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.854 2.033 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.794 1.974 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.630 1.834 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.020 2.169 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.019 2.172 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.907 2.132 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.883 2.052 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.848 2.036 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.792 2.043 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.777 1.964 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.061 2.317 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 3.001 2.372 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.964 2.119 LYS 311.A N.A ASP 307.A O LYS 311.A H.A 2.860 2.014 LYS 311.A N.B ASP 307.A O LYS 311.A H.B 2.883 2.037 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.880 2.015 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.713 1.881 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H.A 3.124 2.340 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.972 2.143 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.871 2.049 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.029 2.199 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.807 1.977 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.792 1.960 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.979 2.175 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.939 2.095 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.799 2.051 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.141 2.355 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.090 2.363 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.070 2.225 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.844 2.027 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.920 2.102 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.938 2.132 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.782 1.938 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.857 2.101 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.A LYS 330.A HZ1 3.092 2.507 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.B LYS 330.A HZ1 3.276 2.674 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.821 1.959