Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ya6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N VAL 217.A O MET 1.A H3 2.722 1.989 GLY 6.A N GLN 31.A O GLY 6.A H 3.126 2.288 LYS 7.A N LEU 4.A O LYS 7.A H 2.948 2.132 LYS 7.A NZ GLN 2.A O LYS 7.A HZ2 2.793 1.942 VAL 8.A N ASP 86.A OD2 VAL 8.A H 2.850 2.011 ALA 9.A N LYS 33.A O ALA 9.A H 2.831 2.006 PHE 10.A N LEU 87.A O PHE 10.A H 2.832 2.011 VAL 11.A N VAL 35.A O VAL 11.A H 2.877 2.030 THR 12.A N CYS 89.A O THR 12.A H 3.129 2.294 GLY 14.A N ALA 37.A O GLY 14.A H 3.211 2.468 GLY 15.A N ASP 38.A OD2 GLY 15.A H 3.042 2.253 SER 16.A N GLY 13.A O SER 16.A H 3.282 2.441 LEU 20.A N SER 16.A O LEU 20.A H 3.148 2.346 GLY 21.A N GLY 17.A O GLY 21.A H 3.151 2.332 GLN 22.A N VAL 18.A O GLN 22.A H 2.994 2.214 GLN 22.A NE2 THR 142.A OG1 GLN 22.A HE22 3.406 2.566 ALA 23.A N ALA 19.A O ALA 23.A H 2.897 2.073 LYS 24.A N LEU 20.A O LYS 24.A H 2.863 2.039 VAL 25.A N GLY 21.A O VAL 25.A H 3.232 2.400 LEU 26.A N GLN 22.A O LEU 26.A H 3.007 2.172 ALA 27.A N ALA 23.A O ALA 27.A H 2.967 2.189 GLU 28.A N LYS 24.A O GLU 28.A H 2.907 2.109 GLU 29.A N VAL 25.A O GLU 29.A H 3.089 2.461 ALA 30.A N VAL 25.A O ALA 30.A H 3.143 2.306 MET 32.A N LEU 26.A O MET 32.A H 2.748 1.896 LYS 33.A N LYS 7.A O LYS 33.A H 2.835 2.053 VAL 34.A N ALA 57.A O VAL 34.A H 2.888 2.066 VAL 35.A N ALA 9.A O VAL 35.A H 2.747 1.896 ILE 36.A N HIS 59.A O ILE 36.A H 3.092 2.351 ALA 37.A N VAL 11.A O ALA 37.A H 2.911 2.058 ASP 38.A N VAL 61.A O ASP 38.A H 3.257 2.469 ARG 40.A N ASP 38.A OD1 ARG 40.A H 3.087 2.241 ARG 40.A NE ASP 42.A OD1 ARG 40.A HE 3.058 2.357 ARG 40.A NH2 ASP 42.A OD1 ARG 40.A HH21 3.508 2.902 ARG 40.A NH2 ASP 42.A OD2 ARG 40.A HH21 2.555 1.708 LEU 44.A N ARG 40.A O LEU 44.A H 3.222 2.399 ASP 45.A N GLN 41.A O ASP 45.A H 2.839 2.016 GLU 46.A N ASP 42.A O GLU 46.A H 2.945 2.141 ALA 47.A N HIS 43.A O ALA 47.A H 3.054 2.206 MET 48.A N LEU 44.A O MET 48.A H 2.941 2.108 GLY 49.A N ASP 45.A O GLY 49.A H 2.841 2.119 TYR 50.A N GLU 46.A O TYR 50.A H 3.194 2.469 TYR 50.A N ALA 47.A O TYR 50.A H 2.980 2.375 TYR 50.A OH GLU 28.A OE2 TYR 50.A HH 2.597 1.761 PHE 51.A N ALA 47.A O PHE 51.A H 2.894 2.078 SER 52.A N MET 48.A O SER 52.A H 2.895 2.124 SER 52.A OG MET 48.A O SER 52.A HG 3.109 2.581 SER 52.A OG GLY 49.A O SER 52.A HG 2.909 2.209 GLN 53.A N TYR 50.A O GLN 53.A H 3.051 2.220 GLN 53.A NE2 SER 52.A OG GLN 53.A HE21 3.211 2.509 LYS 54.A N PHE 51.A O LYS 54.A H 3.025 2.190 HIS 59.A N VAL 34.A O HIS 59.A H 2.941 2.134 HIS 59.A NE2 GLU 77.A OE2 HIS 59.A HE2 2.594 1.752 VAL 61.A N ILE 36.A O VAL 61.A H 3.015 2.218 ARG 62.A NH1 ILE 39.A O ARG 62.A HH11 2.766 1.956 LEU 63.A N ASP 38.A O LEU 63.A H 2.829 2.018 THR 66.A N ASP 64.A OD1 THR 66.A H 3.126 2.294 THR 66.A OG1 ASP 64.A OD1 THR 66.A HG1 2.767 1.934 THR 66.A OG1 ASP 64.A OD2 THR 66.A HG1 3.379 2.805 ASP 67.A N ASP 64.A O ASP 67.A H 2.827 1.983 ARG 68.A NE ASN 121.A OD1 ARG 68.A HE 2.932 2.091 ALA 70.A N ASP 67.A OD1 ALA 70.A H 3.034 2.194 TYR 71.A N ASP 67.A O TYR 71.A H 2.893 2.103 ALA 72.A N ARG 68.A O ALA 72.A H 3.090 2.248 ALA 73.A N ALA 69.A O ALA 73.A H 3.068 2.273 ALA 74.A N ALA 70.A O ALA 74.A H 2.794 2.014 VAL 75.A N TYR 71.A O VAL 75.A H 2.996 2.201 ASP 76.A N ALA 72.A O ASP 76.A H 2.938 2.113 GLU 77.A N ALA 73.A O GLU 77.A H 2.872 2.061 ALA 78.A N ALA 74.A O ALA 78.A H 2.965 2.188 GLU 79.A N VAL 75.A O GLU 79.A H 3.008 2.236 GLN 80.A N ASP 76.A O GLN 80.A H 3.011 2.268 VAL 81.A N GLU 77.A O VAL 81.A H 2.945 2.145 PHE 82.A N ALA 78.A O PHE 82.A H 2.889 2.043 GLY 83.A N ALA 78.A O GLY 83.A H 3.084 2.252 ASP 86.A N VAL 8.A O ASP 86.A H 2.807 2.003 LEU 87.A N VAL 8.A O LEU 87.A H 2.990 2.172 LEU 88.A N HIS 138.A O LEU 88.A H 2.962 2.136 CYS 89.A N PHE 10.A O CYS 89.A H 2.816 1.958 ASN 90.A N LEU 140.A O ASN 90.A H 2.819 1.973 ASN 90.A ND2 LEU 140.A O ASN 90.A HD22 2.948 2.185 THR 91.A N THR 12.A OG1 THR 91.A H 2.968 2.206 THR 91.A OG1 GLN 22.A OE1 THR 91.A HG1 2.620 1.788 ALA 92.A N THR 12.A OG1 ALA 92.A H 3.003 2.148 VAL 94.A N ASN 115.A OD1 VAL 94.A H 2.875 2.039 GLN 96.A N GLN 111.A OE1 GLN 96.A H 3.337 2.536 GLY 98.A N THR 153.A O GLY 98.A H 2.876 2.084 GLU 101.A N GLU 101.A OE1 GLU 101.A H 2.726 1.913 LYS 102.A N PRO 99.A O LYS 102.A H 3.000 2.176 ALA 103.A N ILE 100.A O ALA 103.A H 3.153 2.323 THR 104.A N ASP 107.A OD2 THR 104.A H 3.043 2.192 ASP 107.A N THR 104.A OG1 ASP 107.A H 2.959 2.163 TRP 108.A N THR 104.A O TRP 108.A H 3.122 2.303 ASP 109.A N PHE 105.A O ASP 109.A H 2.843 1.995 TRP 110.A N ASP 106.A O TRP 110.A H 3.038 2.206 GLN 111.A N ASP 107.A O GLN 111.A H 3.348 2.490 GLN 111.A NE2 GLN 96.A O GLN 111.A HE22 3.240 2.497 MET 112.A N TRP 108.A O MET 112.A H 2.861 2.021 ASP 113.A N ASP 109.A O ASP 113.A H 2.905 2.112 VAL 114.A N TRP 110.A O VAL 114.A H 3.172 2.329 ASN 115.A N GLN 111.A O ASN 115.A H 2.911 2.072 ASN 115.A ND2 VAL 94.A O ASN 115.A HD21 2.901 2.059 ASN 115.A ND2 THR 160.A OG1 ASN 115.A HD22 3.083 2.239 VAL 116.A N MET 112.A O VAL 116.A H 2.961 2.163 ASN 117.A N MET 112.A O ASN 117.A H 3.097 2.285 ASN 117.A ND2 ASP 113.A OD1 ASN 117.A HD22 3.171 2.375 VAL 119.A N VAL 116.A O VAL 119.A H 3.096 2.507 ILE 120.A N VAL 116.A O ILE 120.A H 2.894 2.048 ASN 121.A N ASN 117.A O ASN 121.A H 2.676 1.835 ASN 121.A ND2 LEU 65.A O ASN 121.A HD22 2.908 2.052 GLY 122.A N GLY 118.A O GLY 122.A H 3.258 2.456 VAL 123.A N VAL 119.A O VAL 123.A H 2.980 2.122 MET 124.A N ILE 120.A O MET 124.A H 2.829 1.983 THR 125.A N ASN 121.A O THR 125.A H 2.961 2.287 THR 125.A N GLY 122.A O THR 125.A H 3.238 2.600 THR 125.A OG1 ASN 121.A O THR 125.A HG1 2.544 1.791 VAL 126.A N GLY 122.A O VAL 126.A H 2.958 2.179 MET 127.A N VAL 123.A O MET 127.A H 2.865 2.031 ARG 129.A N VAL 126.A O ARG 129.A H 2.956 2.352 ARG 129.A NE THR 125.A O ARG 129.A HE 3.115 2.475 ARG 129.A NH1 ASP 76.A OD1 ARG 129.A HH12 2.694 1.933 ARG 129.A NH1 GLU 79.A OE2 ARG 129.A HH11 2.859 2.027 ARG 129.A NH2 ALA 72.A O ARG 129.A HH22 3.389 2.709 ARG 129.A NH2 ASP 76.A OD1 ARG 129.A HH22 2.995 2.333 MET 130.A N VAL 126.A O MET 130.A H 2.978 2.177 ILE 131.A N MET 127.A O ILE 131.A H 3.023 2.193 GLU 132.A N PRO 128.A O GLU 132.A H 3.019 2.195 ARG 133.A N ARG 129.A O ARG 133.A H 2.962 2.178 ARG 133.A NH1 ASP 86.A OD1 ARG 133.A HH12 2.824 1.975 GLY 134.A N MET 130.A O GLY 134.A H 3.111 2.322 GLY 137.A N ASN 179.A O GLY 137.A H 3.263 2.525 HIS 138.A N ASP 86.A O HIS 138.A H 2.827 2.140 HIS 138.A NE2 SER 183.A OG HIS 138.A HE2 2.953 2.158 ILE 139.A N GLY 181.A O ILE 139.A H 2.854 2.055 LEU 140.A N LEU 88.A O LEU 140.A H 2.700 1.856 ILE 141.A N SER 183.A O ILE 141.A H 2.915 2.071 THR 142.A N ASN 90.A O THR 142.A H 2.932 2.072 ALA 143.A N LEU 185.A O ALA 143.A H 2.717 1.965 SER 144.A OG GLY 188.A O SER 144.A HG 2.698 1.944 SER 146.A N SER 144.A OG SER 146.A H 2.948 2.091 ALA 147.A N SER 144.A O ALA 147.A H 2.914 2.070 PHE 148.A N MET 145.A O PHE 148.A H 2.944 2.143 VAL 149.A N MET 145.A O VAL 149.A H 2.982 2.316 LEU 151.A N THR 154.A OG1 LEU 151.A H 3.307 2.593 THR 153.A OG1 PRO 152.A O THR 153.A HG1 2.376 1.594 THR 154.A N LEU 151.A O THR 154.A H 3.197 2.345 THR 154.A OG1 LEU 151.A O THR 154.A HG1 2.982 2.151 CYS 158.A N THR 154.A O CYS 158.A H 2.726 1.872 CYS 158.A SG SER 146.A O CYS 158.A HG 3.364 2.242 THR 159.A N GLY 155.A O THR 159.A H 3.083 2.269 THR 159.A OG1 GLY 155.A O THR 159.A HG1 2.799 1.982 THR 160.A N ILE 156.A O THR 160.A H 3.046 2.265 THR 160.A OG1 TYR 157.A O THR 160.A HG1 2.697 1.979 LYS 161.A N TYR 157.A O LYS 161.A H 3.016 2.256 TYR 162.A N CYS 158.A O TYR 162.A H 2.924 2.072 ALA 163.A N THR 159.A O ALA 163.A H 3.123 2.331 VAL 164.A N THR 160.A O VAL 164.A H 3.206 2.401 ARG 165.A N LYS 161.A O ARG 165.A H 3.043 2.275 ARG 165.A NE ALA 147.A O ARG 165.A HE 3.197 2.457 ARG 165.A NH1 GLU 169.A OE2 ARG 165.A HH11 3.062 2.224 ARG 165.A NH2 ALA 147.A O ARG 165.A HH21 2.941 2.136 GLY 166.A N TYR 162.A O GLY 166.A H 2.987 2.180 LEU 167.A N ALA 163.A O LEU 167.A H 3.035 2.229 ALA 168.A N VAL 164.A O ALA 168.A H 2.868 2.054 GLU 169.A N ARG 165.A O GLU 169.A H 2.923 2.097 SER 170.A N GLY 166.A O SER 170.A H 2.931 2.205 SER 170.A OG GLY 166.A O SER 170.A HG 2.864 2.101 LEU 171.A N LEU 167.A O LEU 171.A H 2.860 2.025 ARG 172.A N ALA 168.A O ARG 172.A H 2.948 2.175 VAL 173.A N SER 170.A O VAL 173.A H 3.174 2.427 GLU 174.A N LEU 171.A O GLU 174.A H 3.159 2.557 MET 175.A N LEU 171.A O MET 175.A H 2.907 2.116 LYS 177.A NZ GLU 174.A O LYS 177.A HZ3 2.675 1.827 TYR 178.A N MET 175.A O TYR 178.A H 2.841 2.033 ASN 179.A N PRO 176.A O ASN 179.A H 2.919 2.095 ILE 180.A N MET 175.A O ILE 180.A H 3.251 2.402 GLY 181.A N GLY 137.A O GLY 181.A H 2.914 2.110 SER 183.A N ILE 139.A O SER 183.A H 2.943 2.118 SER 183.A OG ARG 221.A O SER 183.A HG 2.555 1.718 LEU 184.A N PHE 222.A O LEU 184.A H 2.715 1.855 LEU 185.A N ILE 141.A O LEU 185.A H 2.918 2.107 CYS 186.A N VAL 224.A O CYS 186.A H 3.129 2.303 GLY 195.A N ALA 191.A O GLY 195.A H 3.090 2.276 LEU 196.A N VAL 192.A O LEU 196.A H 2.909 2.107 LYS 197.A N PHE 193.A O LYS 197.A H 2.836 2.022 ARG 198.A N ALA 194.A O ARG 198.A H 2.919 2.165 ILE 200.A N LEU 196.A O ILE 200.A H 3.307 2.507 GLU 201.A N LYS 197.A O GLU 201.A H 2.742 1.940 HIS 202.A N ARG 198.A O HIS 202.A H 2.993 2.279 GLY 203.A N VAL 199.A O GLY 203.A H 3.286 2.574 GLY 203.A N ILE 200.A O GLY 203.A H 3.242 2.591 ASP 208.A N ASP 205.A OD2 ASP 208.A H 2.747 1.956 LEU 209.A N ASP 205.A O LEU 209.A H 2.952 2.109 GLY 210.A N PRO 206.A O GLY 210.A H 2.880 2.190 ARG 211.A N VAL 207.A O ARG 211.A H 2.969 2.271 ARG 211.A N ASP 208.A O ARG 211.A H 3.121 2.493 ARG 211.A NE GLU 29.A OE2 ARG 211.A HE 2.527 1.700 ARG 211.A NH2 GLU 29.A OE2 ARG 211.A HH21 3.351 2.779 VAL 212.A N ASP 208.A O VAL 212.A H 3.168 2.410 VAL 213.A N LEU 209.A O VAL 213.A H 3.116 2.312 LEU 214.A N GLY 210.A O LEU 214.A H 2.985 2.156 ASP 215.A N ARG 211.A O ASP 215.A H 3.027 2.194 ALA 216.A N VAL 212.A O ALA 216.A H 3.013 2.233 VAL 217.A N VAL 213.A O VAL 217.A H 2.844 2.031 ARG 218.A N LEU 214.A O ARG 218.A H 2.993 2.147 ASN 219.A N ASP 215.A O ASN 219.A H 3.135 2.347 ASN 219.A ND2 ASP 215.A O ASN 219.A HD22 2.847 2.009 ASP 220.A N VAL 217.A O ASP 220.A H 3.183 2.387 ARG 221.A N ALA 216.A O ARG 221.A H 2.845 2.022 ARG 221.A NH1 ASP 215.A OD2 ARG 221.A HH12 2.366 1.762 VAL 224.A N LEU 184.A O VAL 224.A H 2.976 2.150 TYR 227.A N LEU 225.A O TYR 227.A H 2.666 1.924 GLU 229.A N GLU 229.A OE1 GLU 229.A H 2.816 1.974 PHE 230.A N TYR 227.A O PHE 230.A H 3.279 2.473 ALA 231.A N PRO 228.A O ALA 231.A H 3.106 2.265 GLN 234.A N PHE 230.A O GLN 234.A H 2.888 2.110 GLN 234.A NE2 ASP 238.A OD1 GLN 234.A HE21 2.964 2.157 LYS 235.A N ALA 231.A O LYS 235.A H 2.822 1.992 LYS 235.A NZ GLU 232.A OE2 LYS 235.A HZ2 3.308 2.686 ALA 236.A N GLU 232.A O ALA 236.A H 3.202 2.405 ARG 237.A N GLY 233.A O ARG 237.A H 3.159 2.357 ARG 237.A NE GLN 234.A OE1 ARG 237.A HE 2.914 2.158 ARG 237.A NH2 GLN 234.A OE1 ARG 237.A HH21 2.801 2.023 ASP 238.A N GLN 234.A O ASP 238.A H 2.739 1.909 GLN 239.A N LYS 235.A O GLN 239.A H 2.869 2.122 GLN 239.A NE2 ASP 243.A OD1 GLN 239.A HE21 2.870 2.042 GLU 240.A N ALA 236.A O GLU 240.A H 3.337 2.597 VAL 241.A N ASP 238.A O VAL 241.A H 3.149 2.542 ILE 242.A N ASP 238.A O ILE 242.A H 3.190 2.362 ASP 243.A N GLN 239.A O ASP 243.A H 2.828 1.979 ALA 244.A N GLU 240.A O ALA 244.A H 2.969 2.195 MET 245.A N VAL 241.A O MET 245.A H 2.952 2.127 MET 246.A N ILE 242.A O MET 246.A H 2.878 2.072 SER 247.A OG ALA 244.A O SER 247.A HG 2.583 1.782 TYR 248.A N MET 245.A O TYR 248.A H 3.450 2.596 ALA 249.A N MET 246.A O ALA 249.A H 3.073 2.226 HIS 251.A N ASP 250.A OD1 HIS 251.A H 2.738 2.065 ASP 253.A N HIS 251.A ND1 ASP 253.A H 3.228 2.516 TYR 254.A N HIS 251.A O TYR 254.A H 3.246 2.534 ARG 256.A N PRO 252.A O ARG 256.A H 2.935 2.158 ARG 257.A N ASP 253.A O ARG 257.A H 2.944 2.155 MET 258.A N TYR 254.A O MET 258.A H 2.885 2.098 LYS 259.A N ALA 255.A O LYS 259.A H 2.877 2.132 ILE 260.A N ARG 256.A O ILE 260.A H 3.158 2.389 ARG 261.A N ARG 257.A O ARG 261.A H 3.084 2.276 GLU 262.A N MET 258.A O GLU 262.A H 2.977 2.123 GLN 263.A N LYS 259.A O GLN 263.A H 3.225 2.442 MET 264.A N ILE 260.A O MET 264.A H 3.006 2.333 MET 264.A N ARG 261.A O MET 264.A H 3.039 2.402 LYS 265.A N ARG 261.A O LYS 265.A H 3.072 2.409 MET 268.A N ARG 266.A O MET 268.A H 2.668 1.944