Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yac_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N VAL 217.A O MET 1.A H3 2.665 1.976 MET 1.A N ARG 218.A O MET 1.A H3 3.555 3.025 GLY 6.A N GLN 31.A O GLY 6.A H 3.031 2.189 LYS 7.A N LEU 4.A O LYS 7.A H 2.979 2.148 LYS 7.A NZ GLN 2.A O LYS 7.A HZ2 2.917 2.143 VAL 8.A N ASP 86.A OD2 VAL 8.A H 2.893 2.052 ALA 9.A N LYS 33.A O ALA 9.A H 2.802 1.978 PHE 10.A N LEU 87.A O PHE 10.A H 2.840 2.030 VAL 11.A N VAL 35.A O VAL 11.A H 2.881 2.029 THR 12.A N CYS 89.A O THR 12.A H 3.047 2.193 GLY 13.A N ALA 37.A O GLY 13.A H 2.734 2.072 GLY 15.A N ASP 38.A OD2 GLY 15.A H 3.016 2.217 SER 16.A N GLY 13.A O SER 16.A H 3.304 2.469 LEU 20.A N SER 16.A O LEU 20.A H 3.133 2.298 GLY 21.A N GLY 17.A O GLY 21.A H 3.080 2.265 GLN 22.A N VAL 18.A O GLN 22.A H 3.003 2.238 GLN 22.A NE2 THR 142.A OG1 GLN 22.A HE22 3.419 2.561 ALA 23.A N ALA 19.A O ALA 23.A H 2.852 2.025 LYS 24.A N LEU 20.A O LYS 24.A H 2.864 2.041 VAL 25.A N GLY 21.A O VAL 25.A H 3.277 2.432 LEU 26.A N GLN 22.A O LEU 26.A H 2.978 2.149 ALA 27.A N ALA 23.A O ALA 27.A H 2.855 2.033 GLU 28.A N LYS 24.A O GLU 28.A H 2.858 2.061 GLU 29.A N VAL 25.A O GLU 29.A H 3.088 2.456 ALA 30.A N VAL 25.A O ALA 30.A H 3.168 2.329 MET 32.A N LEU 26.A O MET 32.A H 2.828 1.980 LYS 33.A N LYS 7.A O LYS 33.A H 2.834 2.075 VAL 34.A N ALA 57.A O VAL 34.A H 2.990 2.152 VAL 35.A N ALA 9.A O VAL 35.A H 2.780 1.929 ILE 36.A N HIS 59.A O ILE 36.A H 3.072 2.353 ALA 37.A N VAL 11.A O ALA 37.A H 2.927 2.073 ASP 38.A N VAL 61.A O ASP 38.A H 3.240 2.444 ARG 40.A N ASP 38.A OD1 ARG 40.A H 2.946 2.102 ARG 40.A NE ASP 42.A OD1 ARG 40.A HE 2.921 2.183 ARG 40.A NH2 ASP 42.A OD1 ARG 40.A HH21 3.346 2.705 ARG 40.A NH2 ASP 42.A OD2 ARG 40.A HH21 2.650 1.795 GLN 41.A NE2 GLN 41.A O GLN 41.A HE21 3.445 2.981 GLN 41.A NE2 ASP 45.A OD1 GLN 41.A HE21 2.944 2.123 LEU 44.A N ARG 40.A O LEU 44.A H 3.238 2.394 ASP 45.A N GLN 41.A O ASP 45.A H 2.921 2.104 GLU 46.A N ASP 42.A O GLU 46.A H 3.009 2.216 ALA 47.A N HIS 43.A O ALA 47.A H 2.933 2.094 MET 48.A N LEU 44.A O MET 48.A H 2.903 2.070 GLY 49.A N ASP 45.A O GLY 49.A H 2.997 2.304 GLY 49.A N GLU 46.A O GLY 49.A H 3.058 2.452 TYR 50.A N GLU 46.A O TYR 50.A H 3.273 2.507 TYR 50.A OH GLU 28.A OE1 TYR 50.A HH 3.351 2.796 TYR 50.A OH GLU 28.A OE2 TYR 50.A HH 2.609 1.770 PHE 51.A N ALA 47.A O PHE 51.A H 2.945 2.113 SER 52.A N MET 48.A O SER 52.A H 2.903 2.179 SER 52.A OG GLY 49.A O SER 52.A HG 2.897 2.116 GLN 53.A N TYR 50.A O GLN 53.A H 2.930 2.090 GLN 53.A NE2 SER 52.A OG GLN 53.A HE21 3.342 2.652 LYS 54.A N PHE 51.A O LYS 54.A H 3.131 2.312 VAL 56.A N LYS 54.A O VAL 56.A H 2.966 2.364 HIS 59.A N VAL 34.A O HIS 59.A H 2.931 2.120 HIS 59.A NE2 GLU 77.A OE2 HIS 59.A HE2 2.589 1.736 VAL 61.A N ILE 36.A O VAL 61.A H 2.985 2.184 ARG 62.A NH1 ILE 39.A O ARG 62.A HH11 2.938 2.122 LEU 63.A N ASP 38.A O LEU 63.A H 2.811 2.001 THR 66.A N ASP 64.A OD1 THR 66.A H 3.045 2.204 THR 66.A OG1 ASP 64.A OD1 THR 66.A HG1 2.788 1.958 THR 66.A OG1 ASP 64.A OD2 THR 66.A HG1 3.206 2.630 ASP 67.A N ASP 64.A O ASP 67.A H 2.922 2.076 ARG 68.A NE ASN 121.A OD1 ARG 68.A HE 2.968 2.119 ALA 70.A N ASP 67.A OD1 ALA 70.A H 3.050 2.203 TYR 71.A N ASP 67.A O TYR 71.A H 2.878 2.114 ALA 72.A N ARG 68.A O ALA 72.A H 3.094 2.267 ALA 73.A N ALA 69.A O ALA 73.A H 3.097 2.293 ALA 74.A N ALA 70.A O ALA 74.A H 2.827 2.055 VAL 75.A N TYR 71.A O VAL 75.A H 2.974 2.175 ASP 76.A N ALA 72.A O ASP 76.A H 2.954 2.116 GLU 77.A N ALA 73.A O GLU 77.A H 2.932 2.117 ALA 78.A N ALA 74.A O ALA 78.A H 3.001 2.205 GLU 79.A N VAL 75.A O GLU 79.A H 3.017 2.243 GLN 80.A N ASP 76.A O GLN 80.A H 2.972 2.209 VAL 81.A N GLU 77.A O VAL 81.A H 2.920 2.137 PHE 82.A N ALA 78.A O PHE 82.A H 2.902 2.051 GLY 83.A N ALA 78.A O GLY 83.A H 3.166 2.356 ASP 86.A N VAL 8.A O ASP 86.A H 2.806 1.995 LEU 87.A N VAL 8.A O LEU 87.A H 3.012 2.193 LEU 88.A N HIS 138.A O LEU 88.A H 2.979 2.147 CYS 89.A N PHE 10.A O CYS 89.A H 2.831 1.972 ASN 90.A N LEU 140.A O ASN 90.A H 2.802 1.959 ASN 90.A ND2 LEU 140.A O ASN 90.A HD22 2.991 2.247 THR 91.A N THR 12.A OG1 THR 91.A H 2.869 2.087 THR 91.A OG1 GLN 22.A OE1 THR 91.A HG1 2.630 1.794 ALA 92.A N THR 12.A OG1 ALA 92.A H 3.001 2.143 VAL 94.A N ASN 115.A OD1 VAL 94.A H 2.840 2.012 GLN 96.A N GLN 111.A OE1 GLN 96.A H 3.319 2.529 GLY 98.A N THR 153.A O GLY 98.A H 2.900 2.104 GLU 101.A N GLU 101.A OE1 GLU 101.A H 2.855 2.060 LYS 102.A N PRO 99.A O LYS 102.A H 3.001 2.179 ALA 103.A N ILE 100.A O ALA 103.A H 3.240 2.398 THR 104.A N ASP 107.A OD2 THR 104.A H 2.999 2.150 ASP 107.A N THR 104.A OG1 ASP 107.A H 2.943 2.147 TRP 108.A N THR 104.A O TRP 108.A H 3.121 2.301 ASP 109.A N PHE 105.A O ASP 109.A H 2.885 2.042 TRP 110.A N ASP 106.A O TRP 110.A H 3.049 2.199 GLN 111.A N ASP 107.A O GLN 111.A H 3.388 2.531 GLN 111.A NE2 GLN 96.A O GLN 111.A HE22 3.167 2.427 GLN 111.A NE2 ASP 107.A O GLN 111.A HE21 3.694 2.990 MET 112.A N TRP 108.A O MET 112.A H 2.836 1.989 ASP 113.A N ASP 109.A O ASP 113.A H 2.829 2.027 VAL 114.A N TRP 110.A O VAL 114.A H 3.164 2.319 ASN 115.A N GLN 111.A O ASN 115.A H 2.914 2.082 ASN 115.A ND2 VAL 94.A O ASN 115.A HD21 2.894 2.049 ASN 115.A ND2 THR 160.A OG1 ASN 115.A HD22 3.145 2.304 VAL 116.A N MET 112.A O VAL 116.A H 2.952 2.149 ASN 117.A N MET 112.A O ASN 117.A H 3.141 2.334 ASN 117.A ND2 ASP 113.A OD1 ASN 117.A HD22 3.161 2.364 GLY 118.A N ASP 113.A O GLY 118.A H 2.792 2.178 ILE 120.A N VAL 116.A O ILE 120.A H 2.906 2.055 ASN 121.A N ASN 117.A O ASN 121.A H 2.706 1.875 ASN 121.A ND2 LEU 65.A O ASN 121.A HD22 2.923 2.064 GLY 122.A N GLY 118.A O GLY 122.A H 3.202 2.401 VAL 123.A N VAL 119.A O VAL 123.A H 2.947 2.092 MET 124.A N ILE 120.A O MET 124.A H 2.844 2.012 THR 125.A N ASN 121.A O THR 125.A H 3.033 2.364 THR 125.A N GLY 122.A O THR 125.A H 3.178 2.520 THR 125.A OG1 ASN 121.A O THR 125.A HG1 2.673 1.924 VAL 126.A N GLY 122.A O VAL 126.A H 2.947 2.148 MET 127.A N VAL 123.A O MET 127.A H 2.923 2.099 ARG 129.A N VAL 126.A O ARG 129.A H 2.941 2.327 ARG 129.A NE THR 125.A O ARG 129.A HE 3.096 2.461 ARG 129.A NH1 ASP 76.A OD1 ARG 129.A HH12 2.840 2.061 ARG 129.A NH1 GLU 79.A OE2 ARG 129.A HH11 2.926 2.093 ARG 129.A NH2 ALA 72.A O ARG 129.A HH22 3.492 2.830 ARG 129.A NH2 ASP 76.A OD1 ARG 129.A HH22 3.069 2.363 MET 130.A N VAL 126.A O MET 130.A H 3.022 2.225 ILE 131.A N MET 127.A O ILE 131.A H 3.058 2.229 GLU 132.A N PRO 128.A O GLU 132.A H 3.077 2.250 ARG 133.A N ARG 129.A O ARG 133.A H 3.004 2.252 ARG 133.A NH1 ASP 86.A OD1 ARG 133.A HH12 2.873 2.064 GLY 134.A N MET 130.A O GLY 134.A H 3.084 2.270 GLY 137.A N ASN 179.A O GLY 137.A H 3.248 2.548 HIS 138.A N ASP 86.A O HIS 138.A H 2.842 2.151 HIS 138.A NE2 SER 183.A OG HIS 138.A HE2 2.907 2.094 ILE 139.A N GLY 181.A O ILE 139.A H 2.789 1.985 LEU 140.A N LEU 88.A O LEU 140.A H 2.742 1.885 ILE 141.A N SER 183.A O ILE 141.A H 2.930 2.091 THR 142.A N ASN 90.A O THR 142.A H 2.927 2.069 ALA 143.A N LEU 185.A O ALA 143.A H 2.755 1.991 MET 145.A N PRO 187.A O MET 145.A H 2.903 2.136 SER 146.A N SER 144.A OG SER 146.A H 2.925 2.067 ALA 147.A N SER 144.A O ALA 147.A H 2.946 2.103 PHE 148.A N MET 145.A O PHE 148.A H 2.915 2.101 VAL 149.A N MET 145.A O VAL 149.A H 3.032 2.405 LEU 151.A N THR 154.A OG1 LEU 151.A H 3.306 2.560 THR 153.A OG1 PRO 152.A O THR 153.A HG1 2.414 1.636 THR 154.A N LEU 151.A O THR 154.A H 3.275 2.419 THR 154.A OG1 LEU 151.A O THR 154.A HG1 3.069 2.245 CYS 158.A N THR 154.A O CYS 158.A H 2.749 1.900 THR 159.A N GLY 155.A O THR 159.A H 3.096 2.272 THR 159.A OG1 GLY 155.A O THR 159.A HG1 2.822 2.017 THR 160.A N ILE 156.A O THR 160.A H 3.070 2.268 THR 160.A OG1 TYR 157.A O THR 160.A HG1 2.709 1.973 LYS 161.A N TYR 157.A O LYS 161.A H 3.073 2.337 LYS 161.A N CYS 158.A O LYS 161.A H 3.181 2.583 TYR 162.A N CYS 158.A O TYR 162.A H 2.926 2.076 ALA 163.A N THR 159.A O ALA 163.A H 3.114 2.310 VAL 164.A N THR 160.A O VAL 164.A H 3.236 2.434 ARG 165.A N LYS 161.A O ARG 165.A H 3.034 2.237 ARG 165.A NE GLU 169.A OE2 ARG 165.A HE 2.859 2.081 ARG 165.A NH1 ALA 147.A O ARG 165.A HH11 3.011 2.211 ARG 165.A NH2 GLU 169.A OE2 ARG 165.A HH21 3.526 2.933 GLY 166.A N TYR 162.A O GLY 166.A H 2.983 2.170 LEU 167.A N ALA 163.A O LEU 167.A H 3.034 2.229 ALA 168.A N VAL 164.A O ALA 168.A H 2.821 2.009 GLU 169.A N ARG 165.A O GLU 169.A H 2.898 2.063 SER 170.A N GLY 166.A O SER 170.A H 2.925 2.181 SER 170.A OG GLY 166.A O SER 170.A HG 2.902 2.156 LEU 171.A N LEU 167.A O LEU 171.A H 2.869 2.035 ARG 172.A N ALA 168.A O ARG 172.A H 2.936 2.157 VAL 173.A N SER 170.A O VAL 173.A H 3.151 2.429 GLU 174.A N LEU 171.A O GLU 174.A H 3.121 2.480 MET 175.A N LEU 171.A O MET 175.A H 2.895 2.110 LYS 177.A NZ GLU 174.A O LYS 177.A HZ3 2.730 1.893 TYR 178.A N MET 175.A O TYR 178.A H 2.894 2.091 ASN 179.A N PRO 176.A O ASN 179.A H 2.926 2.094 ILE 180.A N MET 175.A O ILE 180.A H 3.160 2.310 GLY 181.A N GLY 137.A O GLY 181.A H 2.948 2.148 SER 183.A N ILE 139.A O SER 183.A H 2.897 2.078 SER 183.A OG ARG 221.A O SER 183.A HG 2.663 1.830 LEU 184.A N PHE 222.A O LEU 184.A H 2.737 1.880 LEU 185.A N ILE 141.A O LEU 185.A H 2.958 2.172 CYS 186.A N VAL 224.A O CYS 186.A H 3.140 2.321 LEU 196.A N VAL 192.A O LEU 196.A H 2.862 2.028 LYS 197.A N PHE 193.A O LYS 197.A H 2.779 1.951 ARG 198.A N ALA 194.A O ARG 198.A H 2.810 2.043 VAL 199.A N GLY 195.A O VAL 199.A H 3.341 2.572 ILE 200.A N LEU 196.A O ILE 200.A H 3.332 2.540 GLU 201.A N LYS 197.A O GLU 201.A H 2.879 2.031 HIS 202.A N ARG 198.A O HIS 202.A H 3.274 2.585 GLY 203.A N ILE 200.A O GLY 203.A H 2.875 2.155 PHE 204.A N ILE 200.A O PHE 204.A H 2.737 2.125 VAL 207.A N ASP 205.A OD1 VAL 207.A H 3.128 2.425 LEU 209.A N ASP 205.A O LEU 209.A H 2.845 2.013 GLY 210.A N PRO 206.A O GLY 210.A H 2.807 2.078 ARG 211.A N VAL 207.A O ARG 211.A H 2.987 2.280 ARG 211.A N ASP 208.A O ARG 211.A H 3.087 2.458 ARG 211.A NE GLU 29.A OE2 ARG 211.A HE 2.517 1.776 ARG 211.A NH2 GLU 29.A OE2 ARG 211.A HH21 2.881 2.271 VAL 212.A N ASP 208.A O VAL 212.A H 3.192 2.410 VAL 213.A N LEU 209.A O VAL 213.A H 3.076 2.281 LEU 214.A N GLY 210.A O LEU 214.A H 2.927 2.103 ASP 215.A N ARG 211.A O ASP 215.A H 3.014 2.192 ALA 216.A N VAL 212.A O ALA 216.A H 3.067 2.317 VAL 217.A N VAL 213.A O VAL 217.A H 2.904 2.084 ARG 218.A N LEU 214.A O ARG 218.A H 3.030 2.182 ASN 219.A N ASP 215.A O ASN 219.A H 3.197 2.407 ASN 219.A ND2 ASP 215.A O ASN 219.A HD22 2.835 1.990 ASP 220.A N VAL 217.A O ASP 220.A H 3.216 2.431 ARG 221.A N ALA 216.A O ARG 221.A H 2.846 2.021 ARG 221.A NH1 ASP 215.A OD2 ARG 221.A HH12 2.301 1.655 VAL 224.A N LEU 184.A O VAL 224.A H 2.946 2.114 TYR 227.A N LEU 225.A O TYR 227.A H 2.727 2.002 GLU 229.A N GLU 229.A OE1 GLU 229.A H 2.677 1.830 PHE 230.A N TYR 227.A O PHE 230.A H 3.219 2.429 ALA 231.A N PRO 228.A O ALA 231.A H 3.277 2.438 GLN 234.A N PHE 230.A O GLN 234.A H 2.749 1.975 GLN 234.A NE2 ASP 238.A OD1 GLN 234.A HE21 2.887 2.074 LYS 235.A N ALA 231.A O LYS 235.A H 2.751 1.954 LYS 235.A NZ GLU 232.A OE2 LYS 235.A HZ2 3.150 2.343 ALA 236.A N GLU 232.A O ALA 236.A H 3.251 2.490 ARG 237.A N GLY 233.A O ARG 237.A H 3.234 2.409 ARG 237.A NE GLN 234.A OE1 ARG 237.A HE 2.872 2.113 ARG 237.A NH2 GLN 234.A OE1 ARG 237.A HH21 2.788 2.016 ASP 238.A N GLN 234.A O ASP 238.A H 2.796 1.965 GLN 239.A N LYS 235.A O GLN 239.A H 2.858 2.067 GLN 239.A NE2 ASP 243.A OD1 GLN 239.A HE21 2.756 1.932 GLU 240.A N ALA 236.A O GLU 240.A H 3.145 2.357 ILE 242.A N ASP 238.A O ILE 242.A H 3.056 2.215 ASP 243.A N GLN 239.A O ASP 243.A H 2.748 1.902 ALA 244.A N GLU 240.A O ALA 244.A H 2.946 2.172 MET 245.A N VAL 241.A O MET 245.A H 2.953 2.112 MET 246.A N ILE 242.A O MET 246.A H 2.879 2.056 SER 247.A N ALA 244.A O SER 247.A H 3.228 2.482 SER 247.A OG ALA 244.A O SER 247.A HG 2.624 1.797 TYR 248.A N MET 245.A O TYR 248.A H 3.389 2.544 ALA 249.A N MET 246.A O ALA 249.A H 3.024 2.209 HIS 251.A N TYR 248.A O HIS 251.A H 3.360 2.601 TYR 254.A N HIS 251.A O TYR 254.A H 2.920 2.122 ARG 256.A N PRO 252.A O ARG 256.A H 3.048 2.294 ARG 257.A N ASP 253.A O ARG 257.A H 3.097 2.269 MET 258.A N TYR 254.A O MET 258.A H 2.825 2.003 LYS 259.A N ALA 255.A O LYS 259.A H 3.232 2.452 ILE 260.A N ARG 256.A O ILE 260.A H 3.196 2.444 ARG 261.A NE ARG 257.A O ARG 261.A HE 2.991 2.396 GLU 262.A N MET 258.A O GLU 262.A H 3.112 2.256 GLN 263.A N LYS 259.A O GLN 263.A H 3.208 2.424 MET 264.A N ILE 260.A O MET 264.A H 2.975 2.185 LYS 265.A N ARG 261.A O LYS 265.A H 2.493 1.841 ARG 266.A N GLU 262.A O ARG 266.A H 3.338 2.509 MET 268.A N ARG 266.A O MET 268.A H 2.414 1.657