Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yag_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N ILE 242.A O MET 1.A H3 2.644 1.853 MET 1.A N VAL 243.A O MET 1.A H2 3.429 2.569 GLY 5.A N GLY 29.A O GLY 5.A H 2.809 1.993 THR 6.A N ILE 3.A O THR 6.A H 3.154 2.303 THR 6.A OG1 ILE 3.A O THR 6.A HG1 2.781 1.994 THR 7.A N ASP 86.A OD1 THR 7.A H 2.934 2.122 THR 7.A OG1 MET 82.A O THR 7.A HG1 2.740 1.985 THR 7.A OG1 GLY 83.A O THR 7.A HG1 3.562 3.010 ALA 8.A N ARG 31.A O ALA 8.A H 2.850 2.019 PHE 9.A N ILE 87.A O PHE 9.A H 2.877 2.066 ILE 10.A N VAL 33.A O ILE 10.A H 2.833 1.999 THR 11.A N ILE 89.A O THR 11.A H 2.940 2.111 GLY 12.A N ALA 35.A O GLY 12.A H 2.797 2.166 PHE 19.A N SER 15.A O PHE 19.A H 3.074 2.258 GLY 20.A N GLY 16.A O GLY 20.A H 3.014 2.219 ILE 21.A N ILE 17.A O ILE 21.A H 2.843 2.005 ALA 22.A N GLY 18.A O ALA 22.A H 2.841 2.025 GLN 23.A N PHE 19.A O GLN 23.A H 2.977 2.148 ARG 24.A N GLY 20.A O ARG 24.A H 3.178 2.362 ARG 24.A NE ASP 236.A OD1 ARG 24.A HE 2.843 2.021 LEU 25.A N ILE 21.A O LEU 25.A H 2.807 1.956 LEU 26.A N ALA 22.A O LEU 26.A H 2.954 2.098 ALA 27.A N GLN 23.A O ALA 27.A H 3.013 2.191 ASN 28.A N ARG 24.A O ASN 28.A H 3.070 2.358 ASN 28.A N LEU 25.A O ASN 28.A H 3.061 2.445 ASN 28.A ND2 ARG 24.A O ASN 28.A HD21 2.793 1.933 GLY 29.A N LEU 26.A O GLY 29.A H 2.892 2.046 ALA 30.A N LEU 25.A O ALA 30.A H 3.031 2.179 ARG 31.A N THR 6.A O ARG 31.A H 2.830 2.004 ARG 31.A NE ASN 57.A OD1 ARG 31.A HE 2.894 2.148 ARG 31.A NH2 ARG 56.A O ARG 31.A HH21 2.959 2.166 LEU 32.A N ASN 57.A O LEU 32.A H 2.813 1.983 VAL 33.A N ALA 8.A O VAL 33.A H 2.822 1.980 LEU 34.A N HIS 59.A O LEU 34.A H 2.845 2.040 ALA 35.A N ILE 10.A O ALA 35.A H 2.958 2.102 ASP 36.A N ILE 61.A O ASP 36.A H 3.039 2.274 ARG 38.A N ASP 36.A OD1 ARG 38.A H 2.948 2.101 ARG 38.A NE ASP 40.A OD1 ARG 38.A HE 2.801 2.078 ARG 38.A NH1 GLU 197.A OE1 ARG 38.A HH12 2.937 2.227 ARG 38.A NH1 ASN 201.A OD1 ARG 38.A HH11 2.834 1.988 ARG 38.A NH2 ASP 40.A OD1 ARG 38.A HH21 3.408 2.834 ARG 38.A NH2 ASP 40.A OD2 ARG 38.A HH21 2.867 2.011 ARG 38.A NH2 GLU 197.A OE1 ARG 38.A HH22 3.197 2.560 GLN 39.A NE2 GLN 39.A O GLN 39.A HE21 3.316 2.805 GLN 39.A NE2 ASP 43.A OD1 GLN 39.A HE21 2.929 2.142 HIS 41.A NE2 GLU 197.A OE1 HIS 41.A HE2 2.928 2.215 LEU 42.A N ARG 38.A O LEU 42.A H 3.067 2.237 ASP 43.A N GLN 39.A O ASP 43.A H 2.884 2.075 GLU 44.A N ASP 40.A O GLU 44.A H 3.037 2.225 ALA 45.A N HIS 41.A O ALA 45.A H 2.941 2.117 ARG 46.A N LEU 42.A O ARG 46.A H 2.900 2.080 ARG 46.A NH1 ASP 43.A OD1 ARG 46.A HH12 2.500 1.835 ARG 46.A NH2 THR 60.A OG1 ARG 46.A HH21 2.105 1.435 GLN 47.A N ASP 43.A O GLN 47.A H 2.946 2.120 GLN 47.A NE2 GLU 51.A OE2 GLN 47.A HE21 3.072 2.322 PHE 48.A N GLU 44.A O PHE 48.A H 2.974 2.166 PHE 49.A N ALA 45.A O PHE 49.A H 3.059 2.232 GLU 50.A N ARG 46.A O GLU 50.A H 2.918 2.105 GLU 51.A N GLN 47.A O GLU 51.A H 2.908 2.089 ARG 52.A N PHE 49.A O ARG 52.A H 3.170 2.465 ARG 52.A NH1 PHE 48.A O ARG 52.A HH11 2.904 2.148 ARG 52.A NH1 GLU 51.A OE1 ARG 52.A HH12 3.531 2.754 GLN 53.A N GLU 50.A O GLN 53.A H 3.004 2.164 GLN 54.A N PHE 49.A O GLN 54.A H 2.860 2.013 ARG 56.A NH1 GLN 53.A O ARG 56.A HH12 2.867 2.071 ASN 57.A N GLN 54.A O ASN 57.A H 2.974 2.133 ASN 57.A ND2 GLN 54.A OE1 ASN 57.A HD21 2.962 2.114 VAL 58.A N GLY 55.A O VAL 58.A H 3.117 2.291 HIS 59.A N LEU 32.A O HIS 59.A H 2.859 2.023 HIS 59.A NE2 GLU 77.A OE2 HIS 59.A HE2 2.906 2.074 ILE 61.A N LEU 34.A O ILE 61.A H 2.842 2.017 LEU 63.A N ASP 36.A O LEU 63.A H 3.012 2.241 ASP 64.A N GLN 70.A OE1 ASP 64.A H 2.974 2.132 SER 66.A N ASP 64.A OD1 SER 66.A H 2.975 2.125 SER 66.A OG ASP 64.A OD2 SER 66.A HG 3.181 2.618 ASP 67.A N ASP 64.A O ASP 67.A H 2.942 2.100 ARG 68.A NE ASN 121.A OD1 ARG 68.A HE 2.990 2.153 GLN 70.A N ASP 67.A OD1 GLN 70.A H 2.998 2.176 MET 71.A N ASP 67.A O MET 71.A H 2.999 2.215 ALA 72.A N ARG 68.A O ALA 72.A H 2.943 2.136 GLU 73.A N ALA 69.A O GLU 73.A H 2.987 2.146 ALA 74.A N GLN 70.A O ALA 74.A H 2.808 2.030 ALA 75.A N MET 71.A O ALA 75.A H 2.981 2.224 ARG 76.A N ALA 72.A O ARG 76.A H 3.188 2.357 GLU 77.A N GLU 73.A O GLU 77.A H 2.821 2.007 CYS 78.A N ALA 74.A O CYS 78.A H 2.790 1.939 CYS 78.A SG GLY 83.A O CYS 78.A HG 3.753 2.617 GLU 79.A N ALA 75.A O GLU 79.A H 3.234 2.386 ALA 80.A N ARG 76.A O ALA 80.A H 2.993 2.161 VAL 81.A N GLU 77.A O VAL 81.A H 2.842 2.016 MET 82.A N CYS 78.A O MET 82.A H 2.884 2.046 GLY 83.A N GLU 79.A O GLY 83.A H 3.016 2.334 ASP 86.A N THR 7.A O ASP 86.A H 2.774 2.001 ILE 87.A N THR 7.A O ILE 87.A H 3.109 2.271 LEU 88.A N HIS 138.A O LEU 88.A H 2.828 1.988 ILE 89.A N PHE 9.A O ILE 89.A H 2.831 1.977 ASN 90.A N VAL 140.A O ASN 90.A H 2.793 2.031 ASN 90.A ND2 ASN 141.A OD1 ASN 90.A HD21 2.897 2.064 ASN 91.A N THR 11.A OG1 ASN 91.A H 2.816 2.062 ASN 91.A ND2 THR 11.A O ASN 91.A HD21 3.062 2.228 ALA 92.A N THR 11.A OG1 ALA 92.A H 2.967 2.110 ILE 94.A N ASN 115.A OD1 ILE 94.A H 3.018 2.238 ASP 95.A N SER 198.A OG ASP 95.A H 2.859 2.030 SER 97.A N ASP 95.A OD1 SER 97.A H 3.034 2.238 GLY 98.A N PHE 154.A O GLY 98.A H 3.002 2.205 ASP 102.A N PRO 99.A O ASP 102.A H 2.901 2.093 ALA 103.A N PHE 100.A O ALA 103.A H 3.209 2.449 THR 104.A N ASP 107.A OD2 THR 104.A H 2.985 2.147 THR 104.A OG1 GLY 209.A O THR 104.A HG1 2.852 2.044 GLN 106.A NE2 ARG 205.A O GLN 106.A HE22 2.875 2.039 GLN 106.A NE2 ALA 208.A O GLN 106.A HE21 2.782 1.936 TRP 108.A N THR 104.A O TRP 108.A H 3.105 2.288 ASP 109.A N TYR 105.A O ASP 109.A H 2.836 1.987 TYR 110.A N GLN 106.A O TYR 110.A H 2.885 2.047 GLY 111.A N ASP 107.A O GLY 111.A H 2.927 2.076 LEU 112.A N TRP 108.A O LEU 112.A H 2.940 2.093 ALA 113.A N ASP 109.A O ALA 113.A H 2.881 2.090 ILE 114.A N TYR 110.A O ILE 114.A H 3.080 2.251 ASN 115.A N GLY 111.A O ASN 115.A H 3.148 2.321 ASN 115.A ND2 ILE 94.A O ASN 115.A HD22 2.972 2.115 LEU 116.A N LEU 112.A O LEU 116.A H 3.020 2.229 MET 117.A N LEU 112.A O MET 117.A H 2.893 2.067 ILE 120.A N LEU 116.A O ILE 120.A H 3.295 2.448 ASN 121.A N MET 117.A O ASN 121.A H 2.743 1.902 ASN 121.A ND2 VAL 65.A O ASN 121.A HD21 2.946 2.099 GLY 122.A N GLY 118.A O GLY 122.A H 2.957 2.138 ILE 123.A N PRO 119.A O ILE 123.A H 2.949 2.115 MET 124.A N ILE 120.A O MET 124.A H 2.845 2.021 ALA 125.A N ASN 121.A O ALA 125.A H 2.846 2.022 PHE 126.A N GLY 122.A O PHE 126.A H 2.953 2.158 THR 127.A N ILE 123.A O THR 127.A H 3.032 2.194 THR 127.A OG1 ILE 123.A O THR 127.A HG1 2.680 1.877 MET 130.A N PHE 126.A O MET 130.A H 3.247 2.439 ARG 131.A N THR 127.A O ARG 131.A H 2.891 2.050 ARG 131.A NH1 SER 175.A O ARG 131.A HH12 2.998 2.168 ARG 131.A NH1 ASP 179.A OD2 ARG 131.A HH11 2.824 1.997 ARG 131.A NH2 SER 175.A OG ARG 131.A HH22 2.905 2.146 ALA 132.A N PRO 128.A O ALA 132.A H 2.918 2.096 ARG 133.A N GLY 129.A O ARG 133.A H 2.980 2.205 ARG 133.A NH2 PRO 85.A O ARG 133.A HH21 2.936 2.239 GLY 134.A N ARG 131.A O GLY 134.A H 3.166 2.499 ARG 135.A NE ASP 86.A OD2 ARG 135.A HE 2.719 1.939 ARG 135.A NH2 ASP 86.A OD2 ARG 135.A HH21 3.392 2.806 GLY 137.A N ASN 180.A O GLY 137.A H 3.114 2.402 HIS 138.A N ASP 86.A O HIS 138.A H 2.961 2.217 HIS 138.A NE2 THR 184.A OG1 HIS 138.A HE2 2.781 1.923 ILE 139.A N GLY 182.A O ILE 139.A H 2.847 2.055 VAL 140.A N LEU 88.A O VAL 140.A H 2.838 2.028 ASN 141.A N THR 184.A O ASN 141.A H 2.910 2.093 ASN 141.A ND2 THR 169.A OG1 ASN 141.A HD21 2.879 2.019 THR 142.A N ASN 90.A O THR 142.A H 3.000 2.173 ALA 143.A N LEU 186.A O ALA 143.A H 2.683 1.915 LEU 145.A N PRO 188.A O LEU 145.A H 3.086 2.227 ALA 146.A N SER 144.A OG ALA 146.A H 2.883 2.041 GLY 147.A N SER 144.A O GLY 147.A H 3.017 2.172 LEU 148.A N LEU 145.A O LEU 148.A H 2.956 2.125 THR 149.A N LEU 145.A O THR 149.A H 2.993 2.151 MET 155.A N PRO 152.A O MET 155.A H 2.902 2.072 ALA 156.A N SER 153.A O ALA 156.A H 3.047 2.236 ALA 159.A N MET 155.A O ALA 159.A H 2.882 2.023 THR 160.A N ALA 156.A O THR 160.A H 3.017 2.179 THR 160.A OG1 ALA 156.A O THR 160.A HG1 2.755 2.067 ALA 161.A N ILE 157.A O ALA 161.A H 3.245 2.400 LYS 162.A N TYR 158.A O LYS 162.A H 2.979 2.148 LYS 162.A NZ THR 142.A O LYS 162.A HZ2 2.991 2.332 LYS 162.A NZ ALA 143.A O LYS 162.A HZ2 3.256 2.524 ALA 163.A N ALA 159.A O ALA 163.A H 2.897 2.055 ALA 164.A N THR 160.A O ALA 164.A H 3.297 2.477 VAL 165.A N ALA 161.A O VAL 165.A H 3.051 2.291 ILE 166.A N LYS 162.A O ILE 166.A H 3.245 2.451 THR 167.A N ALA 163.A O THR 167.A H 3.201 2.363 LEU 168.A N ALA 164.A O LEU 168.A H 2.794 1.943 THR 169.A N VAL 165.A O THR 169.A H 3.035 2.226 THR 169.A OG1 VAL 165.A O THR 169.A HG1 2.770 1.972 GLU 170.A N ILE 166.A O GLU 170.A H 3.090 2.260 THR 171.A N THR 167.A O THR 171.A H 2.920 2.109 THR 171.A OG1 THR 167.A O THR 171.A HG1 3.340 2.667 THR 171.A OG1 LEU 168.A O THR 171.A HG1 2.974 2.318 ILE 172.A N LEU 168.A O ILE 172.A H 3.058 2.264 ARG 173.A N GLU 170.A O ARG 173.A H 3.378 2.547 MET 176.A N ILE 172.A O MET 176.A H 2.983 2.138 ALA 177.A N ARG 173.A O ALA 177.A H 2.916 2.102 GLU 178.A N SER 175.A O GLU 178.A H 3.158 2.446 ASP 179.A N MET 176.A O ASP 179.A H 2.995 2.176 ASN 180.A N ALA 177.A O ASN 180.A H 2.980 2.131 ILE 181.A N MET 176.A O ILE 181.A H 3.029 2.193 GLY 182.A N GLY 137.A O GLY 182.A H 3.026 2.261 THR 184.A N ILE 139.A O THR 184.A H 2.838 2.105 THR 184.A OG1 LYS 246.A O THR 184.A HG1 2.719 1.913 VAL 185.A N LEU 247.A O VAL 185.A H 2.793 1.972 LEU 186.A N ASN 141.A O LEU 186.A H 2.892 2.067 MET 187.A N VAL 249.A O MET 187.A H 2.764 1.938 GLY 189.A N THR 251.A OG1 GLY 189.A H 2.869 2.038 LYS 192.A N MET 229.A O LYS 192.A H 2.849 2.028 LYS 192.A NZ ASP 226.A O LYS 192.A HZ3 3.379 2.716 LYS 192.A NZ GLU 230.A OE2 LYS 192.A HZ1 2.862 2.020 ARG 194.A NE SER 15.A OG ARG 194.A HE 2.977 2.222 ARG 194.A NH1 GLU 44.A OE1 ARG 194.A HH12 2.732 1.915 ARG 194.A NH2 ALA 14.A O ARG 194.A HH21 3.383 2.829 ARG 194.A NH2 GLU 44.A OE1 ARG 194.A HH22 3.082 2.387 ILE 195.A N SER 193.A OG ILE 195.A H 3.208 2.380 GLU 197.A N ARG 194.A O GLU 197.A H 2.849 1.998 SER 198.A N ILE 195.A O SER 198.A H 3.006 2.285 GLN 200.A N GLU 197.A O GLN 200.A H 2.928 2.317 ASN 201.A N SER 198.A O ASN 201.A H 2.873 2.134 ARG 202.A NE GLU 216.A OE2 ARG 202.A HE 2.916 2.121 ARG 202.A NH1 ASP 107.A OD1 ARG 202.A HH12 2.980 2.258 ARG 202.A NH1 PHE 206.A O ARG 202.A HH11 2.942 2.168 ARG 202.A NH2 ASP 107.A OD1 ARG 202.A HH22 2.954 2.223 ARG 202.A NH2 GLU 216.A OE2 ARG 202.A HH21 2.990 2.237 ARG 205.A NH1 ASP 64.A OD2 ARG 205.A HH12 3.035 2.207 ARG 205.A NH2 SER 66.A OG ARG 205.A HH22 2.809 1.968 PHE 206.A N PRO 203.A O PHE 206.A H 3.011 2.181 ARG 207.A N GLU 204.A O ARG 207.A H 3.132 2.277 ARG 207.A NE ARG 202.A O ARG 207.A HE 3.104 2.337 ARG 207.A NH2 ARG 202.A O ARG 207.A HH21 2.982 2.189 SER 210.A N ARG 207.A O SER 210.A H 3.186 2.334 GLY 211.A N ASP 107.A OD2 GLY 211.A H 2.864 2.009 GLU 216.A N LEU 212.A O GLU 216.A H 2.943 2.119 GLN 217.A N ALA 213.A O GLN 217.A H 2.935 2.151 GLN 218.A N GLU 214.A O GLN 218.A H 3.087 2.308 LEU 219.A N THR 215.A O LEU 219.A H 2.878 2.050 ALA 220.A N GLU 216.A O ALA 220.A H 3.044 2.289 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 2.988 2.175 ARG 222.A N LEU 219.A O ARG 222.A H 2.937 2.086 TRP 228.A N ALA 225.A O TRP 228.A H 3.239 2.386 MET 229.A N PRO 190.A O MET 229.A H 3.090 2.243 GLU 233.A N GLU 230.A O GLU 233.A H 3.033 2.379 GLY 235.A N PRO 231.A O GLY 235.A H 2.858 2.062 ASP 236.A N THR 232.A O ASP 236.A H 2.996 2.238 MET 237.A N GLU 233.A O MET 237.A H 3.235 2.430 ILE 238.A N VAL 234.A O ILE 238.A H 2.993 2.200 VAL 239.A N GLY 235.A O VAL 239.A H 2.910 2.100 ASP 240.A N ASP 236.A O ASP 240.A H 3.061 2.235 ALA 241.A N MET 237.A O ALA 241.A H 2.993 2.239 ILE 242.A N ILE 238.A O ILE 242.A H 2.926 2.105 VAL 243.A N VAL 239.A O VAL 243.A H 2.952 2.099 HIS 244.A N ASP 240.A O HIS 244.A H 2.917 2.116 LYS 246.A N ALA 241.A O LYS 246.A H 2.965 2.173 VAL 249.A N VAL 185.A O VAL 249.A H 3.059 2.230 THR 251.A N MET 187.A O THR 251.A H 3.310 2.545 HIS 252.A ND1 THR 251.A OG1 HIS 252.A HD1 2.674 1.845 ARG 256.A N GLY 253.A O ARG 256.A H 3.098 2.263 THR 258.A OG1 TRP 255.A O THR 258.A HG1 3.177 2.706 CYS 259.A N TRP 255.A O CYS 259.A H 2.982 2.152 CYS 259.A SG TRP 255.A O CYS 259.A HG 3.262 2.478 GLU 260.A N ARG 256.A O GLU 260.A H 2.894 2.059 ALA 261.A N GLU 257.A O ALA 261.A H 3.007 2.212 ARG 262.A N THR 258.A O ARG 262.A H 3.166 2.337 ARG 262.A NH1 LEU 148.A O ARG 262.A HH11 2.896 2.215 PHE 263.A N CYS 259.A O PHE 263.A H 2.808 1.958 GLN 264.A N GLU 260.A O GLN 264.A H 2.822 1.979 ALA 265.A N ALA 261.A O ALA 265.A H 3.063 2.252 LEU 266.A N ARG 262.A O LEU 266.A H 2.922 2.096 LEU 267.A N PHE 263.A O LEU 267.A H 2.882 2.035 ASP 268.A N GLN 264.A O ASP 268.A H 2.763 1.931 SER 269.A N ALA 265.A O SER 269.A H 3.218 2.569 SER 269.A N LEU 266.A O SER 269.A H 3.186 2.453 SER 269.A OG LEU 266.A O SER 269.A HG 2.754 2.326 MET 270.A N LEU 267.A O MET 270.A H 2.956 2.113