Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yai_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N ILE 242.A O MET 1.A H3 2.899 2.107 MET 1.A N VAL 243.A O MET 1.A H2 3.318 2.638 ALA 4.A N ASP 2.A OD1 ALA 4.A H 3.277 2.457 GLY 5.A N GLY 29.A O GLY 5.A H 2.919 2.076 THR 6.A N ILE 3.A O THR 6.A H 3.123 2.273 THR 6.A OG1 ILE 3.A O THR 6.A HG1 2.748 1.946 THR 7.A N ASP 86.A OD1 THR 7.A H 2.960 2.142 THR 7.A OG1 MET 82.A O THR 7.A HG1 2.734 1.948 ALA 8.A N ARG 31.A O ALA 8.A H 2.856 2.021 PHE 9.A N ILE 87.A O PHE 9.A H 2.881 2.067 ILE 10.A N VAL 33.A O ILE 10.A H 2.854 2.020 THR 11.A N ILE 89.A O THR 11.A H 2.963 2.140 GLY 12.A N ALA 35.A O GLY 12.A H 2.719 2.096 PHE 19.A N SER 15.A O PHE 19.A H 3.096 2.296 GLY 20.A N GLY 16.A O GLY 20.A H 2.997 2.183 ILE 21.A N ILE 17.A O ILE 21.A H 2.864 2.030 ALA 22.A N GLY 18.A O ALA 22.A H 2.829 2.006 GLN 23.A N PHE 19.A O GLN 23.A H 2.957 2.129 ARG 24.A N GLY 20.A O ARG 24.A H 3.190 2.369 ARG 24.A NE ASP 236.A OD1 ARG 24.A HE 2.776 1.963 LEU 25.A N ILE 21.A O LEU 25.A H 2.863 2.018 LEU 26.A N ALA 22.A O LEU 26.A H 2.995 2.140 ALA 27.A N GLN 23.A O ALA 27.A H 3.010 2.211 ASN 28.A N ARG 24.A O ASN 28.A H 3.057 2.380 ASN 28.A N LEU 25.A O ASN 28.A H 3.050 2.390 ASN 28.A ND2 ARG 24.A O ASN 28.A HD21 2.778 1.918 GLY 29.A N LEU 26.A O GLY 29.A H 2.939 2.096 ALA 30.A N LEU 25.A O ALA 30.A H 3.029 2.174 ARG 31.A N THR 6.A O ARG 31.A H 2.798 1.973 ARG 31.A NE ASN 57.A OD1 ARG 31.A HE 2.975 2.224 ARG 31.A NH2 ARG 56.A O ARG 31.A HH21 2.990 2.196 LEU 32.A N ASN 57.A O LEU 32.A H 2.828 1.994 VAL 33.A N ALA 8.A O VAL 33.A H 2.830 1.985 LEU 34.A N HIS 59.A O LEU 34.A H 2.841 2.039 ALA 35.A N ILE 10.A O ALA 35.A H 2.937 2.086 ASP 36.A N ILE 61.A O ASP 36.A H 3.083 2.310 ARG 38.A N ASP 36.A OD1 ARG 38.A H 2.961 2.119 ARG 38.A NE ASP 40.A OD1 ARG 38.A HE 2.902 2.145 ARG 38.A NH1 GLU 197.A OE1 ARG 38.A HH12 2.911 2.202 ARG 38.A NH1 ASN 201.A OD1 ARG 38.A HH11 2.791 1.944 ARG 38.A NH2 ASP 40.A OD1 ARG 38.A HH21 3.476 2.872 ARG 38.A NH2 ASP 40.A OD2 ARG 38.A HH21 2.971 2.112 ARG 38.A NH2 GLU 197.A OE1 ARG 38.A HH22 3.136 2.492 GLN 39.A NE2 GLN 39.A O GLN 39.A HE21 3.387 2.894 GLN 39.A NE2 ASP 43.A OD1 GLN 39.A HE21 2.954 2.158 HIS 41.A NE2 GLU 197.A OE1 HIS 41.A HE2 2.922 2.225 LEU 42.A N ARG 38.A O LEU 42.A H 3.072 2.250 ASP 43.A N GLN 39.A O ASP 43.A H 2.912 2.098 GLU 44.A N ASP 40.A O GLU 44.A H 3.014 2.203 ALA 45.A N HIS 41.A O ALA 45.A H 2.936 2.095 ARG 46.A N LEU 42.A O ARG 46.A H 2.901 2.079 ARG 46.A NH1 ASP 43.A OD1 ARG 46.A HH12 2.497 1.665 ARG 46.A NH2 THR 60.A OG1 ARG 46.A HH21 2.610 1.800 GLN 47.A N ASP 43.A O GLN 47.A H 2.987 2.157 PHE 48.A N GLU 44.A O PHE 48.A H 2.971 2.162 PHE 49.A N ALA 45.A O PHE 49.A H 3.134 2.317 GLU 50.A N ARG 46.A O GLU 50.A H 2.864 2.058 GLU 51.A N GLN 47.A O GLU 51.A H 2.813 1.997 ARG 52.A N PHE 49.A O ARG 52.A H 3.268 2.561 ARG 52.A NH1 PHE 48.A O ARG 52.A HH11 2.862 2.084 GLN 53.A N GLU 50.A O GLN 53.A H 2.931 2.088 GLN 54.A N PHE 49.A O GLN 54.A H 2.856 2.005 ARG 56.A NH1 GLN 53.A O ARG 56.A HH12 2.951 2.185 ASN 57.A N GLN 54.A O ASN 57.A H 3.027 2.182 ASN 57.A ND2 GLN 54.A OE1 ASN 57.A HD21 3.024 2.171 VAL 58.A N GLY 55.A O VAL 58.A H 3.117 2.294 HIS 59.A N LEU 32.A O HIS 59.A H 2.875 2.035 ILE 61.A N LEU 34.A O ILE 61.A H 2.888 2.054 ARG 62.A NE ILE 37.A O ARG 62.A HE 3.289 2.634 LEU 63.A N ASP 36.A O LEU 63.A H 2.998 2.227 ASP 64.A N GLN 70.A OE1 ASP 64.A H 2.993 2.167 SER 66.A N ASP 64.A OD1 SER 66.A H 2.936 2.083 ASP 67.A N ASP 64.A O ASP 67.A H 2.938 2.103 ARG 68.A NE ASN 121.A OD1 ARG 68.A HE 2.996 2.167 GLN 70.A N ASP 67.A OD1 GLN 70.A H 3.040 2.218 MET 71.A N ASP 67.A O MET 71.A H 2.989 2.219 ALA 72.A N ARG 68.A O ALA 72.A H 2.921 2.108 GLU 73.A N ALA 69.A O GLU 73.A H 2.991 2.160 ALA 74.A N GLN 70.A O ALA 74.A H 2.848 2.049 ALA 75.A N MET 71.A O ALA 75.A H 2.938 2.162 ARG 76.A N ALA 72.A O ARG 76.A H 3.218 2.403 GLU 77.A N GLU 73.A O GLU 77.A H 2.805 1.974 CYS 78.A N ALA 74.A O CYS 78.A H 2.796 1.946 CYS 78.A SG GLY 83.A O CYS 78.A HG 3.787 2.653 GLU 79.A N ALA 75.A O GLU 79.A H 3.233 2.385 ALA 80.A N ARG 76.A O ALA 80.A H 2.977 2.158 VAL 81.A N GLU 77.A O VAL 81.A H 2.818 1.988 MET 82.A N CYS 78.A O MET 82.A H 2.872 2.032 GLY 83.A N GLU 79.A O GLY 83.A H 3.079 2.431 ASP 86.A N THR 7.A O ASP 86.A H 2.868 2.142 ILE 87.A N THR 7.A O ILE 87.A H 3.175 2.342 LEU 88.A N HIS 138.A O LEU 88.A H 2.827 1.988 ILE 89.A N PHE 9.A O ILE 89.A H 2.846 1.990 ASN 90.A N VAL 140.A O ASN 90.A H 2.783 2.052 ASN 90.A ND2 ASN 141.A OD1 ASN 90.A HD21 2.860 2.019 ASN 91.A N THR 11.A OG1 ASN 91.A H 2.817 2.060 ASN 91.A ND2 THR 11.A O ASN 91.A HD21 3.130 2.309 ALA 92.A N THR 11.A OG1 ALA 92.A H 2.951 2.095 ILE 94.A N ASN 115.A OD1 ILE 94.A H 3.001 2.230 ASP 95.A N SER 198.A OG ASP 95.A H 2.875 2.054 SER 97.A N ASP 95.A OD1 SER 97.A H 3.082 2.282 SER 97.A OG ASP 95.A OD1 SER 97.A HG 2.727 2.049 GLY 98.A N PHE 154.A O GLY 98.A H 3.011 2.194 ASP 102.A N PRO 99.A O ASP 102.A H 2.893 2.087 ALA 103.A N PHE 100.A O ALA 103.A H 3.243 2.503 THR 104.A N ASP 107.A OD2 THR 104.A H 3.020 2.194 THR 104.A OG1 GLY 209.A O THR 104.A HG1 2.872 2.046 GLN 106.A NE2 ARG 205.A O GLN 106.A HE22 2.856 2.010 GLN 106.A NE2 ALA 208.A O GLN 106.A HE21 2.772 1.921 ASP 107.A N THR 104.A O ASP 107.A H 2.960 2.342 TRP 108.A N THR 104.A O TRP 108.A H 3.091 2.275 ASP 109.A N TYR 105.A O ASP 109.A H 2.831 1.986 TYR 110.A N GLN 106.A O TYR 110.A H 2.917 2.079 GLY 111.A N ASP 107.A O GLY 111.A H 2.935 2.080 LEU 112.A N TRP 108.A O LEU 112.A H 2.970 2.123 ALA 113.A N ASP 109.A O ALA 113.A H 2.840 2.032 ILE 114.A N TYR 110.A O ILE 114.A H 3.081 2.245 ASN 115.A N GLY 111.A O ASN 115.A H 3.131 2.298 ASN 115.A ND2 ILE 94.A O ASN 115.A HD22 2.959 2.102 LEU 116.A N LEU 112.A O LEU 116.A H 3.008 2.209 MET 117.A N LEU 112.A O MET 117.A H 2.914 2.086 ILE 120.A N LEU 116.A O ILE 120.A H 3.302 2.453 ASN 121.A N MET 117.A O ASN 121.A H 2.726 1.881 ASN 121.A ND2 VAL 65.A O ASN 121.A HD21 2.995 2.146 GLY 122.A N GLY 118.A O GLY 122.A H 2.975 2.159 ILE 123.A N PRO 119.A O ILE 123.A H 2.933 2.107 MET 124.A N ILE 120.A O MET 124.A H 2.843 2.014 ALA 125.A N ASN 121.A O ALA 125.A H 2.831 2.015 PHE 126.A N GLY 122.A O PHE 126.A H 2.994 2.234 THR 127.A N ILE 123.A O THR 127.A H 3.009 2.163 THR 127.A OG1 ILE 123.A O THR 127.A HG1 2.678 1.857 MET 130.A N PHE 126.A O MET 130.A H 3.227 2.413 ARG 131.A N THR 127.A O ARG 131.A H 2.935 2.101 ARG 131.A NH1 SER 175.A O ARG 131.A HH12 2.951 2.119 ARG 131.A NH1 ASP 179.A OD2 ARG 131.A HH11 2.856 2.018 ARG 131.A NH2 SER 175.A OG ARG 131.A HH22 2.932 2.186 ALA 132.A N PRO 128.A O ALA 132.A H 2.949 2.146 ARG 133.A N GLY 129.A O ARG 133.A H 2.970 2.183 ARG 133.A NH2 PRO 85.A O ARG 133.A HH21 2.891 2.191 GLY 134.A N ARG 131.A O GLY 134.A H 3.082 2.427 ARG 135.A NE ASP 86.A OD2 ARG 135.A HE 2.638 1.865 ARG 135.A NH2 ASP 86.A OD2 ARG 135.A HH21 3.324 2.752 GLY 137.A N ASN 180.A O GLY 137.A H 3.157 2.444 HIS 138.A N ASP 86.A O HIS 138.A H 2.925 2.180 HIS 138.A NE2 THR 184.A OG1 HIS 138.A HE2 2.819 1.961 ILE 139.A N GLY 182.A O ILE 139.A H 2.830 2.032 VAL 140.A N LEU 88.A O VAL 140.A H 2.825 2.014 ASN 141.A N THR 184.A O ASN 141.A H 2.900 2.075 ASN 141.A ND2 THR 169.A OG1 ASN 141.A HD21 2.894 2.035 THR 142.A N ASN 90.A O THR 142.A H 2.988 2.153 ALA 143.A N LEU 186.A O ALA 143.A H 2.707 1.963 LEU 145.A N PRO 188.A O LEU 145.A H 3.081 2.221 ALA 146.A N SER 144.A OG ALA 146.A H 2.922 2.086 GLY 147.A N SER 144.A O GLY 147.A H 2.994 2.149 LEU 148.A N LEU 145.A O LEU 148.A H 2.992 2.164 THR 149.A N LEU 145.A O THR 149.A H 2.973 2.129 MET 155.A N PRO 152.A O MET 155.A H 2.939 2.103 ALA 156.A N SER 153.A O ALA 156.A H 3.106 2.302 ALA 159.A N MET 155.A O ALA 159.A H 2.876 2.019 THR 160.A N ALA 156.A O THR 160.A H 3.017 2.181 THR 160.A OG1 ALA 156.A O THR 160.A HG1 2.700 1.979 ALA 161.A N ILE 157.A O ALA 161.A H 3.224 2.381 LYS 162.A N TYR 158.A O LYS 162.A H 2.992 2.154 LYS 162.A NZ THR 142.A O LYS 162.A HZ1 2.952 2.311 LYS 162.A NZ ALA 143.A O LYS 162.A HZ1 3.249 2.501 ALA 163.A N ALA 159.A O ALA 163.A H 2.917 2.072 ALA 164.A N THR 160.A O ALA 164.A H 3.273 2.442 VAL 165.A N ALA 161.A O VAL 165.A H 3.057 2.319 ILE 166.A N LYS 162.A O ILE 166.A H 3.195 2.390 THR 167.A N ALA 163.A O THR 167.A H 3.216 2.377 LEU 168.A N ALA 164.A O LEU 168.A H 2.784 1.937 THR 169.A N VAL 165.A O THR 169.A H 3.036 2.227 THR 169.A OG1 VAL 165.A O THR 169.A HG1 2.786 1.967 GLU 170.A N ILE 166.A O GLU 170.A H 3.062 2.232 THR 171.A N THR 167.A O THR 171.A H 2.950 2.133 THR 171.A OG1 THR 167.A O THR 171.A HG1 3.344 2.637 THR 171.A OG1 LEU 168.A O THR 171.A HG1 2.951 2.295 ILE 172.A N LEU 168.A O ILE 172.A H 3.071 2.287 ARG 173.A N GLU 170.A O ARG 173.A H 3.359 2.532 ARG 173.A NH2 ASN 245.A O ARG 173.A HH21 3.446 2.908 MET 176.A N ILE 172.A O MET 176.A H 3.018 2.174 ALA 177.A N ARG 173.A O ALA 177.A H 2.928 2.137 GLU 178.A N SER 175.A O GLU 178.A H 3.173 2.423 ASP 179.A N MET 176.A O ASP 179.A H 3.012 2.203 ASN 180.A N ALA 177.A O ASN 180.A H 3.021 2.172 ILE 181.A N MET 176.A O ILE 181.A H 3.005 2.171 GLY 182.A N GLY 137.A O GLY 182.A H 3.031 2.256 THR 184.A N ILE 139.A O THR 184.A H 2.806 2.067 THR 184.A OG1 LYS 246.A O THR 184.A HG1 2.661 1.838 VAL 185.A N LEU 247.A O VAL 185.A H 2.829 2.013 LEU 186.A N ASN 141.A O LEU 186.A H 2.881 2.062 MET 187.A N VAL 249.A O MET 187.A H 2.746 1.907 GLY 189.A N THR 251.A OG1 GLY 189.A H 2.872 2.046 LYS 192.A N MET 229.A O LYS 192.A H 2.879 2.058 LYS 192.A NZ ASP 226.A O LYS 192.A HZ1 3.168 2.509 LYS 192.A NZ GLU 230.A OE2 LYS 192.A HZ2 2.783 1.927 ARG 194.A NE SER 15.A OG ARG 194.A HE 3.051 2.257 ARG 194.A NH1 GLU 44.A OE1 ARG 194.A HH12 2.720 1.905 ARG 194.A NH2 ALA 14.A O ARG 194.A HH21 3.496 2.949 ARG 194.A NH2 GLU 44.A OE1 ARG 194.A HH22 3.065 2.370 ILE 195.A N SER 193.A OG ILE 195.A H 3.241 2.412 GLU 197.A N ARG 194.A O GLU 197.A H 2.861 2.009 SER 198.A N ILE 195.A O SER 198.A H 3.002 2.317 SER 198.A OG ILE 195.A O SER 198.A HG 2.663 1.868 GLN 200.A N GLU 197.A O GLN 200.A H 2.834 2.194 ASN 201.A N SER 198.A O ASN 201.A H 2.893 2.165 ARG 202.A N SER 198.A O ARG 202.A H 3.072 2.480 ARG 202.A NE GLU 216.A OE2 ARG 202.A HE 2.856 2.077 ARG 202.A NH1 ASP 107.A OD1 ARG 202.A HH12 2.997 2.256 ARG 202.A NH1 PHE 206.A O ARG 202.A HH11 2.946 2.166 ARG 202.A NH2 ASP 107.A OD1 ARG 202.A HH22 3.022 2.290 ARG 202.A NH2 GLU 216.A OE2 ARG 202.A HH21 2.863 2.106 ARG 205.A NH1 ASP 64.A OD2 ARG 205.A HH12 3.041 2.233 ARG 205.A NH2 SER 66.A OG ARG 205.A HH22 2.832 1.976 PHE 206.A N PRO 203.A O PHE 206.A H 3.129 2.289 ARG 207.A N GLU 204.A O ARG 207.A H 3.099 2.247 ARG 207.A NE ARG 202.A O ARG 207.A HE 3.014 2.216 ARG 207.A NH2 ARG 202.A O ARG 207.A HH21 3.048 2.278 SER 210.A N ARG 207.A O SER 210.A H 3.209 2.359 SER 210.A OG ASP 107.A OD1 SER 210.A HG 2.679 1.879 GLY 211.A N ASP 107.A OD2 GLY 211.A H 2.958 2.103 LEU 212.A N SER 210.A OG LEU 212.A H 3.151 2.295 GLU 216.A N LEU 212.A O GLU 216.A H 2.963 2.144 GLN 217.A N ALA 213.A O GLN 217.A H 2.998 2.255 GLN 218.A N GLU 214.A O GLN 218.A H 3.112 2.341 LEU 219.A N THR 215.A O LEU 219.A H 2.879 2.050 ALA 220.A N GLU 216.A O ALA 220.A H 3.112 2.357 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 2.976 2.167 ARG 222.A N LEU 219.A O ARG 222.A H 2.946 2.092 TRP 228.A N ALA 225.A O TRP 228.A H 3.325 2.479 MET 229.A N PRO 190.A O MET 229.A H 3.143 2.304 GLU 233.A N GLU 230.A O GLU 233.A H 2.994 2.323 VAL 234.A N GLU 230.A O VAL 234.A H 3.429 2.627 GLY 235.A N PRO 231.A O GLY 235.A H 2.853 2.060 ASP 236.A N THR 232.A O ASP 236.A H 3.032 2.266 MET 237.A N GLU 233.A O MET 237.A H 3.210 2.402 ILE 238.A N VAL 234.A O ILE 238.A H 3.014 2.244 VAL 239.A N GLY 235.A O VAL 239.A H 2.883 2.073 ASP 240.A N ASP 236.A O ASP 240.A H 3.054 2.217 ALA 241.A N MET 237.A O ALA 241.A H 3.008 2.260 ILE 242.A N ILE 238.A O ILE 242.A H 2.934 2.131 VAL 243.A N VAL 239.A O VAL 243.A H 2.963 2.115 HIS 244.A N ASP 240.A O HIS 244.A H 2.935 2.138 LYS 246.A N ALA 241.A O LYS 246.A H 2.995 2.202 TYR 248.A OH GLU 170.A OE2 TYR 248.A HH 2.613 1.843 VAL 249.A N VAL 185.A O VAL 249.A H 3.094 2.256 THR 251.A N MET 187.A O THR 251.A H 3.358 2.585 HIS 252.A ND1 THR 251.A OG1 HIS 252.A HD1 2.724 1.891 ARG 256.A N GLY 253.A O ARG 256.A H 3.138 2.314 GLU 257.A N GLU 257.A OE1 GLU 257.A H 2.697 2.014 THR 258.A OG1 TRP 255.A O THR 258.A HG1 3.157 2.670 CYS 259.A N TRP 255.A O CYS 259.A H 2.972 2.145 CYS 259.A SG TRP 255.A O CYS 259.A HG 3.267 2.512 GLU 260.A N ARG 256.A O GLU 260.A H 2.886 2.064 ALA 261.A N GLU 257.A O ALA 261.A H 2.966 2.170 ARG 262.A N THR 258.A O ARG 262.A H 3.137 2.309 ARG 262.A NH1 LEU 148.A O ARG 262.A HH11 2.897 2.221 PHE 263.A N CYS 259.A O PHE 263.A H 2.825 1.971 GLN 264.A N GLU 260.A O GLN 264.A H 2.858 2.026 GLN 264.A NE2 ASP 268.A OD1 GLN 264.A HE21 2.779 2.007 ALA 265.A N ALA 261.A O ALA 265.A H 3.036 2.236 LEU 266.A N ARG 262.A O LEU 266.A H 2.946 2.115 LEU 267.A N PHE 263.A O LEU 267.A H 2.936 2.094 ASP 268.A N GLN 264.A O ASP 268.A H 2.821 2.028 SER 269.A N ALA 265.A O SER 269.A H 3.220 2.587 SER 269.A N LEU 266.A O SER 269.A H 3.178 2.443 SER 269.A OG LEU 266.A O SER 269.A HG 2.765 1.926 MET 270.A N LEU 267.A O MET 270.A H 2.999 2.160