Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yaj_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N ASP 4.A OD2 no hydrogen 3.280 N/A ARG 3.A N SER 1.A OG ARG 3.A H 3.007 2.173 ARG 3.A NH2 GLU 203.A OE1 ARG 3.A HH21 2.821 2.004 ASP 4.A N SER 1.A O ASP 4.A H 3.024 2.192 LEU 5.A N SER 2.A O LEU 5.A H 3.080 2.304 LEU 7.A N ARG 3.A O LEU 7.A H 2.919 2.087 LYS 8.A N ASP 4.A O LYS 8.A H 2.826 1.996 ALA 9.A N LEU 5.A O ALA 9.A H 3.020 2.190 LYS 10.A N LEU 6.A O LYS 10.A H 3.002 2.195 GLU 11.A N LEU 7.A O GLU 11.A H 2.892 2.099 ASN 12.A N LYS 8.A O ASN 12.A H 3.262 2.529 ASN 12.A ND2 LYS 8.A O ASN 12.A HD22 2.795 2.010 GLY 13.A N LYS 10.A O GLY 13.A H 2.897 2.076 ARG 14.A N ALA 9.A O ARG 14.A H 2.870 2.021 LEU 17.A N ILE 226.A O LEU 17.A H 3.183 2.376 LEU 18.A N GLU 21.A OE1 LEU 18.A H 3.122 2.301 ALA 22.A N LEU 18.A O ALA 22.A H 2.926 2.120 LYS 23.A N GLU 19.A O LYS 23.A H 3.244 2.432 LYS 23.A NZ THR 34.A O LYS 23.A HZ3 3.461 2.609 LYS 23.A NZ VAL 222.A O LYS 23.A HZ1 2.864 2.186 TYR 24.A N HIS 20.A O TYR 24.A H 2.956 2.121 PHE 25.A N GLU 21.A O PHE 25.A H 2.968 2.130 ILE 26.A N ALA 22.A O ILE 26.A H 2.929 2.096 SER 27.A N LYS 23.A O SER 27.A H 2.815 2.022 SER 28.A N TYR 24.A O SER 28.A H 3.021 2.280 SER 28.A OG PHE 25.A O SER 28.A HG 2.882 2.084 TYR 29.A N ILE 26.A O TYR 29.A H 3.305 2.535 TYR 29.A OH GLU 200.A OE1 TYR 29.A HH 3.021 2.207 GLY 30.A N SER 27.A O GLY 30.A H 2.922 2.089 ILE 31.A N ILE 26.A O ILE 31.A H 3.252 2.429 THR 34.A N VAL 221.A O THR 34.A H 3.043 2.236 ASN 35.A N GLU 111.A OE2 ASN 35.A H 2.882 2.040 ARG 37.A N VAL 109.A O ARG 37.A H 2.988 2.217 ARG 37.A NH1 ASN 35.A OD1 ARG 37.A HH12 2.810 2.020 ARG 37.A NH1 ILE 36.A O ARG 37.A HH11 2.896 2.078 ALA 39.A N ILE 107.A O ALA 39.A H 2.652 1.800 LYS 40.A N GLU 44.A OE2 LYS 40.A H 3.047 2.325 GLU 44.A N SER 41.A OG GLU 44.A H 2.906 2.115 ALA 45.A N SER 41.A O ALA 45.A H 2.878 2.077 VAL 46.A N GLU 42.A O VAL 46.A H 2.958 2.154 ASN 47.A N GLU 43.A O ASN 47.A H 2.932 2.083 PHE 48.A N GLU 44.A O PHE 48.A H 2.807 1.991 SER 49.A N ALA 45.A O SER 49.A H 2.989 2.235 SER 49.A OG ALA 45.A O SER 49.A HG 2.865 2.122 ARG 50.A N VAL 46.A O ARG 50.A H 3.088 2.278 ARG 50.A NH1 GLU 81.A OE1 ARG 50.A HH11 2.842 2.082 GLU 51.A N ASN 47.A O GLU 51.A H 2.989 2.235 ILE 52.A N PHE 48.A O ILE 52.A H 2.807 2.023 GLY 53.A N SER 49.A O GLY 53.A H 2.848 2.079 VAL 56.A N LEU 78.A O VAL 56.A H 2.949 2.150 VAL 57.A N GLN 110.A O VAL 57.A H 2.988 2.171 LEU 58.A N LYS 75.A O LEU 58.A H 2.886 2.034 LYS 59.A N LEU 108.A O LYS 59.A H 3.083 2.317 LYS 59.A NZ GLU 19.A OE2 LYS 59.A HZ2 3.096 2.313 ILE 60.A N GLY 73.A O ILE 60.A H 3.047 2.323 VAL 61.A N GLY 106.A O VAL 61.A H 2.966 2.221 GLN 64.A N GLN 64.A OE1 GLN 64.A H 2.555 1.801 VAL 65.A N SER 62.A O VAL 65.A H 3.180 2.559 VAL 71.A N HIS 67.A O VAL 71.A H 3.263 2.498 GLY 72.A N SER 69.A O GLY 72.A H 2.947 2.129 GLY 73.A N LYS 68.A O GLY 73.A H 2.751 1.910 LYS 75.A N LEU 58.A O LYS 75.A H 2.896 2.110 LEU 78.A N VAL 56.A O LEU 78.A H 2.995 2.151 ARG 79.A N GLU 83.A OE2 ARG 79.A H 3.231 2.460 GLU 83.A N SER 80.A OG GLU 83.A H 2.962 2.125 VAL 84.A N SER 80.A O VAL 84.A H 2.938 2.201 ARG 85.A N GLU 81.A O ARG 85.A H 3.011 2.195 ARG 85.A NH1 GLU 43.A OE1 ARG 85.A HH12 2.866 2.184 ARG 85.A NH1 GLU 43.A OE2 ARG 85.A HH12 3.228 2.387 ARG 85.A NH1 GLU 81.A OE2 ARG 85.A HH11 3.263 2.445 ARG 85.A NH2 GLU 42.A OE1 ARG 85.A HH21 2.831 2.006 ARG 85.A NH2 GLU 43.A OE1 ARG 85.A HH22 2.630 1.866 LYS 86.A N GLU 82.A O LYS 86.A H 3.108 2.306 ALA 87.A N GLU 83.A O ALA 87.A H 2.925 2.082 TYR 88.A N VAL 84.A O TYR 88.A H 2.895 2.066 ARG 89.A N ARG 85.A O ARG 89.A H 3.401 2.570 ARG 89.A NE ARG 85.A O ARG 89.A HE 3.126 2.421 GLU 90.A N LYS 86.A O GLU 90.A H 2.865 2.041 ILE 91.A N ALA 87.A O ILE 91.A H 2.919 2.126 ILE 92.A N TYR 88.A O ILE 92.A H 3.114 2.287 GLU 93.A N ARG 89.A O GLU 93.A H 2.991 2.147 ASN 94.A N GLU 90.A O ASN 94.A H 2.931 2.081 ASN 94.A ND2 GLY 72.A O ASN 94.A HD22 3.412 2.687 VAL 95.A N ILE 91.A O VAL 95.A H 3.022 2.163 LYS 96.A N ILE 92.A O LYS 96.A H 2.961 2.170 ARG 97.A N ASN 94.A O ARG 97.A H 3.322 2.510 ARG 97.A NH1 ASN 94.A OD1 ARG 97.A HH12 2.951 2.369 ARG 97.A NH2 ASN 94.A OD1 ARG 97.A HH22 3.215 2.690 ASN 98.A N VAL 95.A O ASN 98.A H 3.184 2.372 ASN 98.A ND2 VAL 71.A O ASN 98.A HD22 3.098 2.264 VAL 99.A N VAL 95.A O VAL 99.A H 2.830 1.988 ALA 102.A N PRO 100.A O ALA 102.A H 2.752 2.067 GLU 105.A N VAL 61.A O GLU 105.A H 2.848 2.001 ILE 107.A N ALA 39.A O ILE 107.A H 2.924 2.085 LEU 108.A N LYS 59.A O LEU 108.A H 2.792 1.960 VAL 109.A N ARG 37.A O VAL 109.A H 2.841 1.987 GLN 110.A N VAL 57.A O GLN 110.A H 2.848 2.026 GLU 111.A N ASN 35.A O GLU 111.A H 2.900 2.051 VAL 117.A N ALA 214.A O VAL 117.A H 3.359 2.574 LEU 119.A N VAL 212.A O LEU 119.A H 2.548 1.754 ILE 120.A N GLY 136.A O ILE 120.A H 2.719 1.863 ILE 121.A N LEU 209.A O ILE 121.A H 3.156 2.314 GLY 122.A N MET 134.A O GLY 122.A H 2.809 1.965 LEU 123.A N MET 207.A O LEU 123.A H 2.849 2.068 LEU 124.A N THR 132.A O LEU 124.A H 3.032 2.199 ARG 125.A NE ILE 204.A O ARG 125.A HE 2.714 1.896 ARG 125.A NH2 GLY 198.A O ARG 125.A HH22 2.847 2.194 ARG 125.A NH2 ASN 201.A O ARG 125.A HH21 2.901 2.346 ARG 125.A NH2 ILE 204.A O ARG 125.A HH21 3.176 2.520 ASP 126.A N GLY 130.A O ASP 126.A H 3.154 2.312 GLN 128.A N ASP 126.A OD2 GLN 128.A H 3.144 2.396 PHE 129.A N ASP 126.A OD2 PHE 129.A H 3.331 2.524 GLY 130.A N ASP 126.A O GLY 130.A H 2.836 2.083 THR 132.A N LEU 124.A O THR 132.A H 2.886 2.052 THR 132.A OG1 GLY 130.A O THR 132.A HG1 2.963 2.153 VAL 133.A N ARG 151.A O VAL 133.A H 2.831 1.987 MET 134.A N GLY 122.A O MET 134.A H 2.919 2.077 PHE 135.A N SER 149.A O PHE 135.A H 3.022 2.213 GLY 136.A N ILE 120.A O GLY 136.A H 3.053 2.346 GLY 138.A N GLU 118.A O GLY 138.A H 2.906 2.074 GLU 143.A N GLY 139.A O GLU 143.A H 3.191 2.363 LEU 144.A N VAL 140.A O LEU 144.A H 2.628 1.809 PHE 145.A N VAL 140.A O PHE 145.A H 2.950 2.158 ARG 146.A N VAL 142.A O ARG 146.A H 3.070 2.372 ASP 147.A N PHE 141.A O ASP 147.A H 2.850 2.008 SER 149.A N PHE 135.A O SER 149.A H 2.961 2.147 SER 149.A OG MET 163.A O SER 149.A HG 2.813 1.996 ARG 151.A N VAL 133.A O ARG 151.A H 3.036 2.232 ARG 151.A NH1 PHE 150.A O ARG 151.A HH11 2.847 2.017 ARG 151.A NH1 GLU 166.A OE1 ARG 151.A HH12 3.034 2.251 ARG 151.A NH2 SER 162.A OG ARG 151.A HH21 2.798 2.033 ARG 151.A NH2 GLU 166.A OE1 ARG 151.A HH22 3.082 2.314 ALA 153.A N PRO 131.A O ALA 153.A H 2.944 2.091 SER 156.A N ASP 159.A OD2 SER 156.A H 3.065 2.206 SER 156.A OG ASP 159.A OD2 SER 156.A HG 2.990 2.186 ASP 159.A N SER 156.A OG ASP 159.A H 2.908 2.115 ALA 160.A N SER 156.A O ALA 160.A H 3.050 2.224 GLU 161.A N GLU 157.A O GLU 161.A H 2.967 2.118 SER 162.A N GLN 158.A O SER 162.A H 3.156 2.310 SER 162.A OG GLN 158.A O SER 162.A HG 2.909 2.239 SER 162.A OG ASP 159.A O SER 162.A HG 3.129 2.502 MET 163.A N ASP 159.A O MET 163.A H 3.030 2.222 ILE 164.A N ALA 160.A O ILE 164.A H 3.103 2.315 LYS 165.A N GLU 161.A O LYS 165.A H 3.064 2.223 LYS 168.A N ASP 147.A OD1 LYS 168.A H 3.126 2.285 ALA 169.A N ASP 147.A OD2 ALA 169.A H 2.964 2.238 TYR 170.A N VAL 167.A O TYR 170.A H 3.111 2.396 LEU 172.A N ALA 169.A O LEU 172.A H 3.182 2.347 LEU 173.A N TYR 170.A O LEU 173.A H 2.851 2.015 THR 174.A N LYS 171.A O THR 174.A H 3.118 2.267 PHE 176.A N MET 179.A O PHE 176.A H 3.075 2.307 MET 179.A N PHE 176.A O MET 179.A H 2.870 2.149 VAL 182.A N LEU 173.A O VAL 182.A H 3.183 2.351 ASP 183.A N TYR 215.A O ASP 183.A H 2.855 2.097 ALA 186.A N ASP 183.A OD1 ALA 186.A H 3.175 2.386 ILE 187.A N ASP 183.A O ILE 187.A H 3.246 2.462 LYS 188.A N ILE 184.A O LYS 188.A H 2.927 2.098 LYS 188.A NZ GLU 157.A OE2 LYS 188.A HZ1 3.263 2.406 LYS 188.A NZ GLU 161.A OE1 LYS 188.A HZ2 2.983 2.122 LYS 188.A NZ GLU 185.A OE2 LYS 188.A HZ3 3.045 2.197 ASP 189.A N GLU 185.A O ASP 189.A H 2.950 2.118 ALA 190.A N ALA 186.A O ALA 190.A H 3.009 2.213 LEU 191.A N ILE 187.A O LEU 191.A H 2.959 2.138 ILE 192.A N LYS 188.A O ILE 192.A H 3.016 2.192 ARG 193.A N ASP 189.A O ARG 193.A H 3.110 2.309 ARG 193.A NE TYR 29.A O ARG 193.A HE 2.831 2.263 ALA 194.A N ALA 190.A O ALA 194.A H 2.870 2.072 GLY 195.A N LEU 191.A O GLY 195.A H 3.067 2.255 ARG 196.A N ILE 192.A O ARG 196.A H 3.127 2.359 ARG 196.A NE GLU 200.A OE2 ARG 196.A HE 2.564 1.710 ARG 196.A NH2 GLU 200.A OE2 ARG 196.A HH21 3.520 2.954 ILE 197.A N ARG 193.A O ILE 197.A H 2.971 2.151 GLY 198.A N ALA 194.A O GLY 198.A H 3.167 2.378 VAL 199.A N GLY 195.A O VAL 199.A H 2.968 2.218 GLU 200.A N ARG 196.A O GLU 200.A H 2.983 2.169 ASN 201.A N ILE 197.A O ASN 201.A H 3.127 2.339 ASN 201.A ND2 TYR 29.A OH ASN 201.A HD21 2.905 2.087 ASN 201.A ND2 ILE 197.A O ASN 201.A HD22 2.918 2.087 GLU 203.A N GLU 203.A OE2 GLU 203.A H 2.642 1.788 ILE 204.A N ASN 201.A O ILE 204.A H 3.098 2.259 ALA 205.A N ILE 227.A O ALA 205.A H 2.971 2.197 MET 207.A N LEU 123.A O MET 207.A H 2.944 2.113 ASP 208.A N ARG 225.A O ASP 208.A H 2.794 1.960 LEU 209.A N ILE 121.A O LEU 209.A H 2.889 2.055 ASN 210.A N ASP 223.A O ASN 210.A H 3.014 2.224 VAL 212.A N LEU 119.A O VAL 212.A H 2.961 2.148 ILE 213.A N LYS 220.A O ILE 213.A H 3.111 2.263 ALA 214.A N VAL 117.A O ALA 214.A H 2.850 1.993 TYR 215.A N GLY 218.A O TYR 215.A H 3.098 2.250 TYR 215.A OH PRO 114.A O TYR 215.A HH 2.820 1.991 GLY 218.A N ASP 183.A OD2 GLY 218.A H 2.963 2.143 LYS 220.A N ILE 213.A O LYS 220.A H 2.880 2.091 VAL 221.A N PRO 32.A O VAL 221.A H 3.068 2.211 VAL 222.A N PRO 211.A O VAL 222.A H 3.016 2.191 ARG 225.A N ASP 208.A O ARG 225.A H 2.854 2.039 ILE 227.A N GLU 206.A O ILE 227.A H 2.890 2.034 LEU 228.A N LYS 15.A O LEU 228.A H 2.854 1.999 ARG 229.A N GLU 203.A O ARG 229.A H 2.882 2.119 ARG 229.A NE GLU 202.A O ARG 229.A HE 2.905 2.143 ARG 229.A NH2 GLU 202.A O ARG 229.A HH21 2.972 2.252