Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yak_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N ASP 4.A OD2 no hydrogen 2.975 N/A SER 2.A OG SER 28.A OG SER 2.A HG 2.585 1.956 ARG 3.A N SER 1.A OG ARG 3.A H 3.163 2.382 ARG 3.A NE GLU 203.A OE2 ARG 3.A HE 3.216 2.415 ARG 3.A NH2 GLU 203.A OE2 ARG 3.A HH21 3.209 2.423 ASP 4.A N SER 1.A O ASP 4.A H 3.128 2.323 LEU 5.A N SER 2.A O LEU 5.A H 3.160 2.386 LEU 7.A N ARG 3.A O LEU 7.A H 2.902 2.160 LYS 8.A N ASP 4.A O LYS 8.A H 2.925 2.070 ALA 9.A N LEU 5.A O ALA 9.A H 3.369 2.595 LYS 10.A N LEU 6.A O LYS 10.A H 3.267 2.432 GLU 11.A N LEU 7.A O GLU 11.A H 2.937 2.157 ASN 12.A N LYS 8.A O ASN 12.A H 3.132 2.453 ASN 12.A N ALA 9.A O ASN 12.A H 3.064 2.410 GLY 13.A N LYS 10.A O GLY 13.A H 3.413 2.600 ARG 14.A N ALA 9.A O ARG 14.A H 3.109 2.417 ARG 14.A NH2 SER 16.A O ARG 14.A HH21 3.535 2.927 ARG 14.A NH2 GLU 21.A OE1 ARG 14.A HH22 2.811 2.160 LEU 17.A N ILE 226.A O LEU 17.A H 2.991 2.213 ALA 22.A N LEU 18.A O ALA 22.A H 2.912 2.122 LYS 23.A N GLU 19.A O LYS 23.A H 3.360 2.612 LYS 23.A NZ VAL 222.A O LYS 23.A HZ1 2.489 1.740 TYR 24.A N HIS 20.A O TYR 24.A H 2.977 2.129 PHE 25.A N GLU 21.A O PHE 25.A H 3.145 2.347 ILE 26.A N ALA 22.A O ILE 26.A H 3.170 2.336 SER 27.A N LYS 23.A O SER 27.A H 2.919 2.157 SER 28.A N TYR 24.A O SER 28.A H 3.090 2.394 SER 28.A N PHE 25.A O SER 28.A H 3.135 2.477 SER 28.A OG PHE 25.A O SER 28.A HG 2.574 1.741 TYR 29.A N ILE 26.A O TYR 29.A H 3.255 2.470 GLY 30.A N SER 27.A O GLY 30.A H 2.984 2.143 ILE 31.A N ILE 26.A O ILE 31.A H 3.226 2.400 THR 34.A N VAL 221.A O THR 34.A H 2.826 1.995 ASN 35.A N GLU 111.A OE1 ASN 35.A H 3.232 2.385 ARG 37.A N VAL 109.A O ARG 37.A H 3.271 2.550 ARG 37.A NE GLU 51.A OE2 ARG 37.A HE 3.213 2.556 ARG 37.A NH1 ASN 35.A OD1 ARG 37.A HH12 3.383 2.588 ARG 37.A NH1 ILE 36.A O ARG 37.A HH11 3.018 2.170 ARG 37.A NH2 GLU 51.A OE2 ARG 37.A HH21 2.809 2.051 ALA 39.A N ILE 107.A O ALA 39.A H 2.705 1.870 LYS 40.A N GLU 44.A OE1 LYS 40.A H 3.002 2.211 GLU 44.A N SER 41.A OG GLU 44.A H 3.139 2.282 VAL 46.A N GLU 42.A O VAL 46.A H 3.394 2.602 ASN 47.A N GLU 43.A O ASN 47.A H 3.354 2.536 PHE 48.A N GLU 44.A O PHE 48.A H 3.043 2.198 SER 49.A N ALA 45.A O SER 49.A H 3.118 2.289 SER 49.A OG ALA 45.A O SER 49.A HG 2.378 1.671 ARG 50.A N VAL 46.A O ARG 50.A H 2.989 2.161 GLU 51.A N ASN 47.A O GLU 51.A H 2.836 2.150 ILE 52.A N PHE 48.A O ILE 52.A H 2.534 1.780 GLY 53.A N SER 49.A O GLY 53.A H 2.773 1.997 VAL 56.A N LEU 78.A O VAL 56.A H 3.017 2.241 VAL 57.A N GLN 110.A O VAL 57.A H 2.967 2.155 LEU 58.A N LYS 75.A O LEU 58.A H 3.098 2.261 LYS 59.A N LEU 108.A O LYS 59.A H 3.059 2.313 LYS 59.A NZ GLU 19.A OE2 LYS 59.A HZ2 3.075 2.187 ILE 60.A N GLY 73.A O ILE 60.A H 3.159 2.494 VAL 61.A N GLY 106.A O VAL 61.A H 2.874 2.044 SER 62.A OG GLU 103.A O SER 62.A HG 2.559 1.789 GLN 64.A N GLN 64.A OE1 GLN 64.A H 2.509 1.821 HIS 67.A ND1 VAL 66.A O no hydrogen 3.158 N/A GLY 73.A N LYS 68.A O GLY 73.A H 3.071 2.227 LYS 75.A N LEU 58.A O LYS 75.A H 3.042 2.237 LEU 78.A N VAL 56.A O LEU 78.A H 3.005 2.152 ARG 79.A N GLU 83.A OE1 ARG 79.A H 3.016 2.201 GLU 81.A N GLU 81.A OE1 GLU 81.A H 2.474 1.751 GLU 83.A N SER 80.A OG GLU 83.A H 3.252 2.526 VAL 84.A N SER 80.A O VAL 84.A H 2.993 2.248 LYS 86.A N GLU 82.A O LYS 86.A H 3.390 2.562 ALA 87.A N GLU 83.A O ALA 87.A H 2.984 2.166 TYR 88.A N VAL 84.A O TYR 88.A H 2.443 1.693 ARG 89.A N ARG 85.A O ARG 89.A H 3.050 2.198 GLU 90.A N LYS 86.A O GLU 90.A H 3.127 2.294 ILE 91.A N ALA 87.A O ILE 91.A H 3.156 2.360 ILE 92.A N TYR 88.A O ILE 92.A H 3.162 2.318 GLU 93.A N ARG 89.A O GLU 93.A H 2.719 2.063 GLU 93.A N GLU 90.A O GLU 93.A H 3.227 2.613 ASN 94.A N GLU 90.A O ASN 94.A H 2.739 1.920 ASN 94.A ND2 GLY 72.A O ASN 94.A HD22 2.565 1.750 VAL 95.A N ILE 91.A O VAL 95.A H 2.860 2.059 ARG 97.A NE GLU 93.A O ARG 97.A HE 2.652 1.952 ASN 98.A N ASN 94.A O ASN 98.A H 3.074 2.240 VAL 99.A N VAL 95.A O VAL 99.A H 2.676 1.830 GLU 105.A N VAL 61.A O GLU 105.A H 2.939 2.212 ILE 107.A N ALA 39.A O ILE 107.A H 2.958 2.185 LEU 108.A N LYS 59.A O LEU 108.A H 2.612 1.818 VAL 109.A N ARG 37.A O VAL 109.A H 3.059 2.209 GLN 110.A N VAL 57.A O GLN 110.A H 2.702 1.851 GLN 110.A NE2 VAL 222.A O GLN 110.A HE22 3.425 2.790 GLU 111.A N ASN 35.A O GLU 111.A H 2.877 2.065 VAL 117.A N ALA 214.A O VAL 117.A H 3.385 2.582 LEU 119.A N VAL 212.A O LEU 119.A H 2.490 1.720 ILE 120.A N GLY 136.A O ILE 120.A H 2.784 1.975 ILE 121.A N LEU 209.A O ILE 121.A H 3.173 2.331 GLY 122.A N MET 134.A O GLY 122.A H 2.821 1.984 LEU 123.A N MET 207.A O LEU 123.A H 2.756 2.035 LEU 124.A N THR 132.A O LEU 124.A H 3.019 2.186 ARG 125.A NH1 GLY 198.A O ARG 125.A HH12 3.404 2.746 ARG 125.A NH1 ASN 201.A O ARG 125.A HH12 3.539 2.859 ARG 125.A NH1 ILE 204.A O ARG 125.A HH11 2.522 1.823 ARG 125.A NH2 GLY 198.A O ARG 125.A HH22 3.102 2.364 ASP 126.A N GLY 130.A O ASP 126.A H 3.000 2.192 GLN 128.A N ASP 126.A OD2 GLN 128.A H 3.075 2.433 PHE 129.A N ASP 126.A OD2 PHE 129.A H 3.047 2.248 GLY 130.A N ASP 126.A O GLY 130.A H 2.745 1.989 THR 132.A N LEU 124.A O THR 132.A H 2.749 1.921 THR 132.A OG1 GLY 130.A O THR 132.A HG1 3.120 2.284 VAL 133.A N ARG 151.A O VAL 133.A H 2.775 1.982 MET 134.A N GLY 122.A O MET 134.A H 2.833 1.997 PHE 135.A N SER 149.A O PHE 135.A H 3.002 2.199 GLY 136.A N ILE 120.A O GLY 136.A H 3.215 2.540 GLY 138.A N GLU 118.A O GLY 138.A H 2.887 2.028 GLY 139.A N GLU 118.A OE2 GLY 139.A H 3.279 2.582 GLU 143.A N GLY 139.A O GLU 143.A H 3.430 2.597 LEU 144.A N VAL 140.A O LEU 144.A H 2.920 2.144 PHE 145.A N VAL 140.A O PHE 145.A H 3.027 2.214 ARG 146.A N VAL 142.A O ARG 146.A H 3.251 2.608 ASP 147.A N PHE 141.A O ASP 147.A H 2.811 1.981 SER 149.A N PHE 135.A O SER 149.A H 2.834 2.038 SER 149.A OG MET 163.A O SER 149.A HG 2.725 1.900 ARG 151.A N VAL 133.A O ARG 151.A H 3.038 2.217 ARG 151.A NH1 PHE 150.A O ARG 151.A HH11 3.018 2.177 ARG 151.A NH1 GLU 166.A OE1 ARG 151.A HH12 2.786 1.996 ARG 151.A NH2 SER 162.A OG ARG 151.A HH21 2.603 1.931 ARG 151.A NH2 GLU 166.A OE1 ARG 151.A HH22 3.029 2.322 ALA 153.A N PRO 131.A O ALA 153.A H 2.998 2.172 SER 156.A N ASP 159.A OD2 SER 156.A H 3.276 2.422 ASP 159.A N SER 156.A OG ASP 159.A H 3.138 2.316 ALA 160.A N SER 156.A O ALA 160.A H 3.101 2.255 GLU 161.A N GLU 157.A O GLU 161.A H 3.024 2.178 SER 162.A N GLN 158.A O SER 162.A H 3.155 2.326 SER 162.A OG GLN 158.A O SER 162.A HG 3.210 2.563 SER 162.A OG ASP 159.A O SER 162.A HG 3.210 2.499 MET 163.A N ASP 159.A O MET 163.A H 3.037 2.216 ILE 164.A N ALA 160.A O ILE 164.A H 3.315 2.578 LYS 165.A N GLU 161.A O LYS 165.A H 3.313 2.537 LYS 165.A NZ GLU 161.A OE2 LYS 165.A HZ2 3.012 2.368 GLU 166.A N SER 162.A O GLU 166.A H 2.868 2.225 LYS 168.A N ASP 147.A OD1 LYS 168.A H 3.160 2.318 ALA 169.A N ASP 147.A OD2 ALA 169.A H 3.041 2.350 TYR 170.A N VAL 167.A O TYR 170.A H 3.305 2.499 LEU 172.A N ALA 169.A O LEU 172.A H 2.934 2.079 LEU 173.A N TYR 170.A O LEU 173.A H 2.803 2.000 PHE 176.A N MET 179.A O PHE 176.A H 2.937 2.135 MET 179.A N PHE 176.A O MET 179.A H 2.852 2.106 VAL 182.A N LEU 173.A O VAL 182.A H 3.079 2.263 ASP 183.A N TYR 215.A O ASP 183.A H 2.863 2.038 ALA 186.A N ASP 183.A OD1 ALA 186.A H 3.259 2.486 LYS 188.A N ILE 184.A O LYS 188.A H 2.953 2.111 LYS 188.A NZ GLU 157.A OE2 LYS 188.A HZ1 2.886 2.166 LYS 188.A NZ GLU 161.A OE1 LYS 188.A HZ2 2.768 1.925 LYS 188.A NZ GLU 185.A OE2 LYS 188.A HZ3 3.264 2.478 ASP 189.A N GLU 185.A O ASP 189.A H 2.952 2.136 ALA 190.A N ALA 186.A O ALA 190.A H 3.029 2.193 LEU 191.A N ILE 187.A O LEU 191.A H 2.920 2.090 ILE 192.A N LYS 188.A O ILE 192.A H 3.125 2.336 ILE 192.A N ASP 189.A O ILE 192.A H 3.118 2.525 ARG 193.A N ASP 189.A O ARG 193.A H 3.101 2.311 ARG 193.A NE TYR 29.A O ARG 193.A HE 2.512 1.695 ARG 193.A NH1 ASP 189.A OD1 ARG 193.A HH11 2.758 1.994 ARG 193.A NH1 ASP 189.A OD2 ARG 193.A HH11 3.274 2.655 ALA 194.A N ALA 190.A O ALA 194.A H 2.872 2.069 GLY 195.A N LEU 191.A O GLY 195.A H 3.198 2.371 ARG 196.A N ILE 192.A O ARG 196.A H 3.063 2.279 ARG 196.A NE GLU 200.A OE2 ARG 196.A HE 2.932 2.105 ILE 197.A N ARG 193.A O ILE 197.A H 2.996 2.202 GLY 198.A N ALA 194.A O GLY 198.A H 3.254 2.524 GLY 198.A N GLY 195.A O GLY 198.A H 3.111 2.513 VAL 199.A N GLY 195.A O VAL 199.A H 3.017 2.195 GLU 200.A N ARG 196.A O GLU 200.A H 3.008 2.204 ASN 201.A N ILE 197.A O ASN 201.A H 3.180 2.354 ILE 204.A N ASN 201.A O ILE 204.A H 3.171 2.320 ALA 205.A N ILE 227.A O ALA 205.A H 2.986 2.188 MET 207.A N LEU 123.A O MET 207.A H 2.867 2.075 ASP 208.A N ARG 225.A O ASP 208.A H 2.812 1.990 LEU 209.A N ILE 121.A O LEU 209.A H 2.744 1.902 ASN 210.A N ASP 223.A O ASN 210.A H 3.082 2.340 VAL 212.A N LEU 119.A O VAL 212.A H 2.956 2.120 ILE 213.A N LYS 220.A O ILE 213.A H 2.926 2.097 ALA 214.A N VAL 117.A O ALA 214.A H 2.844 2.056 TYR 215.A N GLY 218.A O TYR 215.A H 3.164 2.319 TYR 215.A OH PRO 114.A O TYR 215.A HH 2.564 1.796 GLY 218.A N ASP 183.A OD2 GLY 218.A H 3.012 2.178 LYS 220.A N ILE 213.A O LYS 220.A H 2.981 2.170 LYS 220.A NZ GLU 111.A OE1 LYS 220.A HZ3 3.543 2.724 VAL 221.A N PRO 32.A O VAL 221.A H 3.091 2.236 VAL 222.A N PRO 211.A O VAL 222.A H 2.988 2.139 ARG 225.A N ASP 208.A O ARG 225.A H 2.941 2.125 ARG 225.A NH2 ASP 208.A OD2 ARG 225.A HH21 3.171 2.362 ILE 227.A N GLU 206.A O ILE 227.A H 2.985 2.192 LEU 228.A N LYS 15.A O LEU 228.A H 2.960 2.105 ARG 229.A N GLU 203.A O ARG 229.A H 3.158 2.501 ARG 229.A NE GLU 202.A O ARG 229.A HE 2.895 2.084 ARG 229.A NH2 GLU 202.A O ARG 229.A HH21 3.125 2.404