Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yav_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 4.A N ARG 26.A O LEU 4.A H 2.933 2.133 ILE 6.A N LYS 27.A O ILE 6.A H 2.858 2.052 TYR 7.A N LEU 53.A O TYR 7.A H 2.876 2.033 TYR 7.A OH ASP 55.A OD2 TYR 7.A HH 2.758 1.918 HIS 8.A N VAL 29.A O HIS 8.A H 3.073 2.298 HIS 8.A ND1 ILE 9.A O HIS 8.A HD1 2.739 1.939 HIS 8.A NE2 ASP 28.A OD1 HIS 8.A HE2 2.521 1.752 ARG 16.A N PRO 12.A O ARG 16.A H 3.093 2.323 ARG 16.A NE ALA 152.A O ARG 16.A HE 2.884 2.087 ARG 16.A NH1 SER 65.A OG ARG 16.A HH11 3.016 2.218 ARG 16.A NH2 ALA 152.A O ARG 16.A HH21 3.156 2.451 GLU 18.A N SER 14.A O GLU 18.A H 2.885 2.073 ILE 19.A N GLU 15.A O ILE 19.A H 2.848 2.001 LEU 20.A N VAL 17.A O LEU 20.A H 2.858 2.032 GLU 21.A N GLU 18.A O GLU 21.A H 3.090 2.259 LEU 22.A N ILE 19.A O LEU 22.A H 2.912 2.086 LYS 23.A NZ GLU 72.A OE1 LYS 23.A HZ3 2.729 1.903 LYS 23.A NZ TYR 75.A O LYS 23.A HZ1 2.715 1.902 LYS 23.A NZ PRO 78.A O LYS 23.A HZ2 2.772 1.902 GLY 24.A N GLU 21.A O GLY 24.A H 2.986 2.160 LEU 25.A N LEU 20.A O LEU 25.A H 2.918 2.075 ARG 26.A N GLN 2.A O ARG 26.A H 2.775 1.928 LYS 27.A N LEU 4.A O LYS 27.A H 2.872 2.052 VAL 29.A N ILE 6.A O VAL 29.A H 2.900 2.039 ILE 31.A N HIS 8.A O ILE 31.A H 2.826 1.997 SER 34.A N ASP 32.A OD1 SER 34.A H 2.887 2.070 LYS 35.A N ASP 32.A O LYS 35.A H 3.093 2.255 LYS 35.A NZ ASP 32.A OD2 LYS 35.A HZ3 2.580 1.746 LYS 35.A NZ ASP 226.A OD1 LYS 35.A HZ2 3.159 2.314 LYS 35.A NZ ASP 226.A OD2 LYS 35.A HZ2 3.128 2.373 LEU 41.A N PRO 38.A O LEU 41.A H 2.974 2.280 LEU 42.A N PRO 38.A O LEU 42.A H 3.133 2.328 ALA 43.A N ASP 39.A O ALA 43.A H 3.127 2.385 LYS 44.A N LEU 41.A O LYS 44.A H 3.241 2.424 THR 49.A OG1 LEU 51.A O no hydrogen 3.522 N/A LEU 53.A N TYR 7.A O LEU 53.A H 3.045 2.235 LEU 54.A N LEU 62.A O LEU 54.A H 2.858 2.028 ASP 55.A N THR 5.A O ASP 55.A H 2.894 2.079 VAL 56.A N GLU 60.A O VAL 56.A H 2.936 2.120 SER 61.A OG ASP 55.A OD1 SER 61.A HG 2.761 2.005 LEU 62.A N LEU 54.A O LEU 62.A H 2.818 1.986 LYS 63.A NZ THR 49.A O LYS 63.A HZ1 2.533 1.908 ILE 67.A N GLU 64.A O ILE 67.A H 2.858 2.025 LEU 68.A N SER 65.A O LEU 68.A H 2.884 2.084 TYR 70.A N VAL 66.A O TYR 70.A H 2.908 2.066 LEU 71.A N ILE 67.A O LEU 71.A H 2.895 2.055 GLU 72.A N LEU 68.A O GLU 72.A H 2.922 2.110 GLN 73.A N ARG 69.A O GLN 73.A H 3.000 2.198 ARG 74.A N TYR 70.A O ARG 74.A H 2.770 1.937 ARG 74.A NE GLU 57.A OE1 ARG 74.A HE 3.196 2.525 ARG 74.A NE GLU 57.A OE2 ARG 74.A HE 2.959 2.113 ARG 74.A NH1 ARG 74.A O ARG 74.A HH11 2.919 2.073 ARG 74.A NH2 GLU 57.A OE1 ARG 74.A HH21 2.747 1.954 TYR 75.A N LEU 71.A O TYR 75.A H 2.880 2.074 TYR 75.A OH GLN 2.A OE1 TYR 75.A HH 3.071 2.336 VAL 80.A N GLU 72.A OE2 VAL 80.A H 3.000 2.168 ALA 81.A N GLU 72.A OE2 ALA 81.A H 2.980 2.176 HIS 82.A N GLU 90.A OE1 HIS 82.A H 2.801 1.941 HIS 87.A N ASP 84.A O HIS 87.A H 2.861 2.018 HIS 87.A ND1 GLU 90.A OE1 HIS 87.A HD1 2.771 1.912 ALA 88.A N PRO 85.A O ALA 88.A H 2.983 2.191 VAL 89.A N PHE 86.A O VAL 89.A H 2.967 2.174 GLY 91.A N HIS 87.A O GLY 91.A H 2.817 2.010 LEU 92.A N VAL 89.A O LEU 92.A H 2.998 2.155 ALA 93.A N GLU 90.A O ALA 93.A H 2.886 2.049 GLU 94.A N GLY 91.A O GLU 94.A H 3.019 2.233 LEU 95.A N LEU 92.A O LEU 95.A H 2.965 2.274 ALA 96.A N ALA 93.A O ALA 96.A H 3.018 2.177 GLY 97.A N GLU 94.A O GLY 97.A H 3.419 2.626 PHE 99.A N LEU 95.A O PHE 99.A H 3.176 2.339 SER 100.A N ALA 96.A O SER 100.A H 2.938 2.089 SER 100.A OG ALA 96.A O SER 100.A HG 3.047 2.386 SER 100.A OG GLY 97.A O SER 100.A HG 3.000 2.316 GLY 101.A N GLY 97.A O GLY 101.A H 2.892 2.069 ALA 102.A N PRO 98.A O ALA 102.A H 3.029 2.199 GLY 103.A N PHE 99.A O GLY 103.A H 3.267 2.439 TYR 104.A N SER 100.A O TYR 104.A H 2.887 2.039 ARG 105.A N GLY 101.A O ARG 105.A H 2.884 2.042 ILE 106.A N GLY 103.A O ILE 106.A H 2.945 2.105 LEU 107.A N TYR 104.A O LEU 107.A H 2.955 2.113 ASN 108.A N ARG 105.A O ASN 108.A H 3.045 2.338 ASN 108.A ND2 GLU 110.A O ASN 108.A HD22 2.926 2.107 ARG 109.A NH1 THR 206.A O ARG 109.A HH11 2.785 2.079 ARG 109.A NH1 LYS 238.A O ARG 109.A HH12 3.014 2.174 GLU 110.A N ASN 108.A OD1 GLU 110.A H 2.999 2.165 LYS 113.A N GLU 110.A O LYS 113.A H 3.023 2.214 LYS 113.A NZ GLU 110.A OE1 LYS 113.A HZ1 3.274 2.400 LYS 113.A NZ GLU 110.A OE2 LYS 113.A HZ1 2.795 2.115 ARG 114.A N ILE 111.A O ARG 114.A H 3.092 2.237 ARG 117.A N ARG 114.A O ARG 117.A H 3.051 2.232 ALA 118.A N GLU 115.A O ALA 118.A H 2.940 2.104 ALA 119.A N GLU 116.A O ALA 119.A H 3.058 2.264 ASP 121.A N ARG 117.A O ASP 121.A H 2.831 1.983 ALA 122.A N ALA 118.A O ALA 122.A H 2.997 2.196 GLU 123.A N ALA 119.A O GLU 123.A H 3.171 2.423 PHE 124.A N VAL 120.A O PHE 124.A H 3.034 2.191 GLY 125.A N ASP 121.A O GLY 125.A H 2.867 2.053 LYS 126.A N ALA 122.A O LYS 126.A H 2.928 2.144 LYS 126.A NZ GLU 123.A OE2 LYS 126.A HZ2 2.803 1.936 VAL 127.A N GLU 123.A O VAL 127.A H 3.076 2.237 ASP 128.A N PHE 124.A O ASP 128.A H 2.863 2.017 ALA 129.A N GLY 125.A O ALA 129.A H 2.874 2.045 PHE 130.A N LYS 126.A O PHE 130.A H 2.940 2.115 LEU 131.A N VAL 127.A O LEU 131.A H 2.928 2.081 LYS 132.A N ASP 128.A O LYS 132.A H 2.929 2.098 LYS 132.A NZ ASP 128.A OD2 LYS 132.A HZ2 2.770 1.952 LYS 132.A NZ ASP 175.A OD1 LYS 132.A HZ1 2.862 2.013 ARG 133.A N ALA 129.A O ARG 133.A H 2.966 2.197 ARG 133.A NH1 ARG 133.A O ARG 133.A HH11 2.942 2.111 TYR 134.A N PHE 130.A O TYR 134.A H 2.950 2.218 ALA 135.A N LEU 131.A O ALA 135.A H 2.798 1.950 THR 136.A N LEU 141.A O THR 136.A H 2.846 2.158 GLY 137.A N LEU 141.A O GLY 137.A H 3.078 2.222 LEU 141.A N GLU 150.A OE2 LEU 141.A H 2.979 2.129 ASP 143.A N THR 136.A OG1 ASP 143.A H 3.257 2.472 ARG 145.A N PHE 142.A O ARG 145.A H 2.988 2.133 GLY 147.A N GLU 150.A OE1 GLY 147.A H 2.762 1.956 TRP 148.A N GLU 90.A OE2 TRP 148.A H 3.154 2.396 VAL 151.A N GLY 147.A O VAL 151.A H 2.985 2.172 ALA 152.A N TRP 148.A O ALA 152.A H 3.071 2.236 PHE 153.A N ALA 149.A O PHE 153.A H 2.854 2.072 THR 154.A N GLU 150.A O THR 154.A H 2.949 2.147 THR 154.A OG1 GLU 150.A O THR 154.A HG1 2.702 1.962 PHE 156.A N PHE 153.A O PHE 156.A H 3.082 2.267 LYS 157.A N THR 154.A O LYS 157.A H 3.080 2.277 LYS 157.A NZ GLU 15.A OE2 LYS 157.A HZ2 2.643 1.759 LYS 157.A NZ ALA 190.A O LYS 157.A HZ1 2.842 2.006 LYS 157.A NZ ARG 193.A O LYS 157.A HZ3 2.733 1.888 ARG 158.A N PRO 155.A O ARG 158.A H 2.929 2.125 ARG 158.A NE GLY 11.A O ARG 158.A HE 2.700 1.909 ARG 158.A NH1 GLU 15.A OE1 ARG 158.A HH12 2.768 1.989 ARG 158.A NH2 GLY 11.A O ARG 158.A HH21 2.970 2.262 ARG 158.A NH2 GLU 15.A OE1 ARG 158.A HH22 2.842 2.097 TRP 160.A N LYS 157.A O TRP 160.A H 3.203 2.431 PHE 161.A N ARG 158.A O PHE 161.A H 2.968 2.109 LEU 162.A N LEU 159.A O LEU 162.A H 2.855 2.048 TYR 164.A N TRP 160.A O TYR 164.A H 3.029 2.215 TYR 164.A OH PRO 234.A O TYR 164.A HH 2.985 2.154 TYR 165.A N PHE 161.A O TYR 165.A H 2.921 2.086 TYR 165.A OH LEU 199.A O TYR 165.A HH 2.680 1.896 GLU 166.A N LEU 162.A O GLU 166.A H 2.908 2.131 TYR 168.A N LEU 162.A O TYR 168.A H 3.076 2.221 PHE 174.A N PRO 171.A O PHE 174.A H 2.957 2.111 ARG 176.A N ASP 128.A OD1 ARG 176.A H 2.835 2.217 ARG 176.A NH1 ASP 139.A O ARG 176.A HH12 2.870 2.097 ARG 176.A NH1 ARG 176.A O ARG 176.A HH11 3.062 2.259 ARG 176.A NH2 GLY 137.A O ARG 176.A HH21 2.834 2.129 ARG 176.A NH2 ASP 139.A O ARG 176.A HH22 3.226 2.564 ARG 176.A NH2 PHE 140.A O ARG 176.A HH22 2.869 2.205 VAL 177.A N ASP 128.A OD1 VAL 177.A H 2.921 2.118 LEU 178.A N PHE 174.A O LEU 178.A H 3.193 2.373 ARG 179.A N ASP 175.A O ARG 179.A H 3.042 2.225 ARG 179.A NE SER 138.A O ARG 179.A HE 3.088 2.348 ARG 179.A NH2 ASP 139.A OD2 ARG 179.A HH21 3.169 2.350 TRP 180.A N ARG 176.A O TRP 180.A H 2.943 2.137 TRP 180.A NE1 GLU 150.A OE2 TRP 180.A HE1 2.806 1.972 ARG 181.A N VAL 177.A O ARG 181.A H 2.821 1.966 ARG 181.A NH1 ASP 163.A OD2 ARG 181.A HH12 3.364 2.652 ALA 182.A N LEU 178.A O ALA 182.A H 3.013 2.169 ALA 183.A N ARG 179.A O ALA 183.A H 3.026 2.207 CYS 184.A N TRP 180.A O CYS 184.A H 2.891 2.041 CYS 184.A SG TRP 180.A O CYS 184.A HG 3.352 2.480 THR 185.A N ARG 181.A O THR 185.A H 2.970 2.147 THR 185.A OG1 ARG 181.A O THR 185.A HG1 3.122 2.325 ALA 186.A N ALA 182.A O ALA 186.A H 3.167 2.516 HIS 187.A N CYS 184.A O HIS 187.A H 3.275 2.428 ALA 190.A N HIS 187.A O ALA 190.A H 2.985 2.136 GLN 191.A NE2 THR 185.A O GLN 191.A HE22 2.925 2.114 GLN 191.A NE2 HIS 187.A O GLN 191.A HE21 2.903 2.046 TYR 192.A OH ASP 28.A OD2 TYR 192.A HH 3.287 2.452 ARG 193.A NE GLU 18.A OE1 ARG 193.A HE 2.868 2.121 ARG 193.A NH2 GLU 18.A OE1 ARG 193.A HH21 3.386 2.795 ARG 193.A NH2 GLU 18.A OE2 ARG 193.A HH21 3.051 2.192 ARG 193.A NH2 ASP 28.A OD2 ARG 193.A HH22 2.728 1.948 GLU 197.A N SER 194.A OG GLU 197.A H 3.086 2.241 LEU 198.A N SER 194.A O LEU 198.A H 3.047 2.205 LEU 199.A N LYS 195.A O LEU 199.A H 2.872 2.017 LYS 200.A N GLU 196.A O LYS 200.A H 3.063 2.235 LYS 200.A NZ GLU 196.A OE2 LYS 200.A HZ1 2.705 1.924 LYS 200.A NZ TRP 229.A O LYS 200.A HZ2 2.913 2.171 LEU 201.A N GLU 197.A O LEU 201.A H 2.908 2.065 TYR 202.A N LEU 198.A O TYR 202.A H 2.912 2.111 TYR 202.A OH GLY 11.A O TYR 202.A HH 3.008 2.168 TYR 203.A N LYS 200.A O TYR 203.A H 3.407 2.556 ASP 204.A N SER 222.A OG ASP 204.A H 2.950 2.140 TYR 205.A N TYR 202.A O TYR 205.A H 2.938 2.192 THR 206.A N TYR 203.A O THR 206.A H 2.864 2.027 THR 206.A OG1 TYR 203.A O THR 206.A HG1 2.766 1.943 GLN 207.A N ASP 204.A O GLN 207.A H 3.076 2.227 GLN 207.A NE2 THR 206.A OG1 GLN 207.A HE21 2.999 2.224 GLN 207.A NE2 LYS 238.A O GLN 207.A HE22 3.110 2.271 GLY 209.A N ASP 204.A O GLY 209.A H 2.914 2.158 ARG 213.A N GLY 210.A O ARG 213.A H 3.218 2.408 ARG 218.A N PRO 215.A O ARG 218.A H 3.173 2.379 ARG 218.A NE ASP 245.A OD1 ARG 218.A HE 2.798 2.001 ARG 218.A NH1 ASP 204.A OD1 ARG 218.A HH12 2.908 2.178 ARG 218.A NH2 ASP 204.A OD1 ARG 218.A HH22 2.851 2.114 ARG 218.A NH2 ASP 204.A OD2 ARG 218.A HH22 3.510 2.930 ARG 218.A NH2 ILE 220.A O ARG 218.A HH21 2.857 2.157 SER 219.A N ASP 245.A OD1 SER 219.A H 3.418 2.624 SER 219.A N ASP 245.A OD2 SER 219.A H 2.790 2.003 ILE 220.A N ASP 245.A OD1 ILE 220.A H 3.382 2.599 SER 222.A N ASP 204.A OD2 SER 222.A H 2.869 2.032 SER 222.A OG LEU 201.A O SER 222.A HG 2.650 1.935 PHE 223.A N SER 221.A OG PHE 223.A H 2.966 2.156 SER 224.A N SER 221.A O SER 224.A H 2.980 2.145 ASP 226.A N SER 224.A OG ASP 226.A H 3.025 2.221 VAL 227.A N SER 224.A O VAL 227.A H 3.431 2.592 ARG 230.A N ASP 228.A OD1 ARG 230.A H 2.989 2.138 ARG 230.A NH1 ASP 228.A OD1 ARG 230.A HH11 2.966 2.167 THR 231.A N ASP 228.A O THR 231.A H 3.391 2.612 THR 231.A OG1 ASP 228.A O THR 231.A HG1 3.568 3.097 ARG 232.A N TRP 229.A O ARG 232.A H 3.120 2.299 ARG 232.A NE VAL 227.A O ARG 232.A HE 3.081 2.402 ARG 232.A NH1 SER 222.A O ARG 232.A HH12 2.747 1.917 ARG 232.A NH2 SER 222.A O ARG 232.A HH22 3.183 2.500 ARG 232.A NH2 VAL 227.A O ARG 232.A HH21 2.882 2.105 ARG 236.A NE TYR 164.A O ARG 236.A HE 2.767 1.915 ARG 236.A NH2 ASP 163.A O ARG 236.A HH21 2.992 2.248 LYS 238.A NZ ILE 106.A O LYS 238.A HZ2 2.784 2.099 LYS 238.A NZ ASN 108.A O LYS 238.A HZ1 2.801 1.947 LYS 238.A NZ GLU 166.A OE2 LYS 238.A HZ3 2.640 1.896 TRP 239.A NE1 GLU 166.A OE1 TRP 239.A HE1 2.867 2.015 GLY 240.A N ASP 237.A O GLY 240.A H 3.367 2.593 GLY 240.A N ASP 237.A OD1 GLY 240.A H 2.921 2.296 ALA 243.A N TYR 203.A OH ALA 243.A H 2.899 2.041 THR 244.A N GLU 247.A OE1 THR 244.A H 3.124 2.321 GLU 247.A N THR 244.A OG1 GLU 247.A H 3.005 2.168 LEU 248.A N THR 244.A O LEU 248.A H 3.014 2.243 GLY 249.A N ALA 246.A O GLY 249.A H 2.983 2.153 LEU 250.A N ASP 245.A O LEU 250.A H 2.818 2.009