Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yck_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A OG.A SER 151.A O SER 1.A HG.A 2.979 2.140 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.996 2.201 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.968 2.153 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.654 1.870 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.920 2.083 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.898 2.079 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.487 2.877 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.880 2.226 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.910 2.116 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H.A 2.913 2.124 LEU 13.A N ASP 11.A OD1 LEU 13.A H 3.054 2.281 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.286 2.432 ASP 15.A N ASP 11.A OD1 ASP 15.A H 3.060 2.208 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.702 1.894 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.876 2.049 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.895 2.117 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.831 2.063 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.928 2.104 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.002 2.181 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.838 2.016 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.817 1.976 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.044 2.247 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.793 2.139 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.813 1.989 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.019 2.165 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.946 2.137 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.814 1.955 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.948 2.117 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.889 2.054 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.885 2.057 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.923 2.117 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.799 2.233 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.902 2.094 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.305 2.448 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.581 1.947 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.678 1.903 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.969 2.247 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 2.861 2.174 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.899 2.122 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.964 2.147 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.892 2.084 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.701 1.887 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.936 2.181 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.959 2.164 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.057 2.214 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.727 2.027 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.942 2.086 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.815 1.984 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.842 2.015 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.155 2.303 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.766 1.951 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.055 2.241 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.978 2.188 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.899 2.132 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.929 2.081 TYR 59.A OH ASP 92.A OD2 TYR 59.A HH 2.735 1.946 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.845 2.012 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.033 2.205 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.977 2.129 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 3.341 2.702 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 2.749 1.948 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.843 2.033 THR 65.A OG1 THR 25.A O THR 65.A HG1 3.398 2.566 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD1 THR 66.A HG1 2.616 1.878 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.295 2.459 LYS 68.A N.A THR 91.A O LYS 68.A H.A 2.961 2.177 LYS 68.A N.B THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.982 2.196 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.841 1.989 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.122 2.270 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.916 2.095 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.038 2.252 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.231 2.476 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.300 2.534 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.908 2.067 TYR 79.A N SER 83.A O.A TYR 79.A H 2.856 2.013 TYR 79.A N SER 83.A O.B TYR 79.A H 2.816 1.966 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.951 2.105 SER 83.A N.A ASP 81.A OD1 SER 83.A H.A 3.024 2.177 SER 83.A N.B ASP 81.A OD1 SER 83.A H.B 3.036 2.185 SER 83.A OG.A ASP 81.A OD2 SER 83.A HG.A 2.628 2.017 SER 83.A OG.B ASP 81.A OD1 SER 83.A HG.B 2.506 1.702 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H.A 2.986 2.175 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.144 2.358 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.018 2.229 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.036 2.236 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.124 2.482 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.956 2.099 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.639 1.829 THR 91.A N LYS 68.A O.A THR 91.A H 2.799 2.016 THR 91.A N LYS 68.A O.B THR 91.A H 2.832 2.027 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 3.014 2.249 THR 93.A N ASP 92.A OD1 THR 93.A H 2.745 2.009 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.916 2.076 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.807 1.986 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.876 2.082 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.970 2.115 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.717 1.884 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.826 1.972 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 3.006 2.357 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.124 2.293 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.210 2.423 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.743 1.894 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.875 2.028 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.820 2.088 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.998 2.145 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.781 2.020 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.179 2.339 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.943 2.129 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.894 2.104 SER 113.A OG SER 115.A OG SER 113.A HG 3.124 2.457 SER 115.A OG SER 83.A OG.A SER 115.A HG 2.620 1.794 PHE 116.A N SER 113.A O no hydrogen 2.981 N/A THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.260 2.432 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.692 1.881 GLU 118.A N SER 114.A O.A GLU 118.A H 2.856 2.060 GLU 118.A N SER 114.A O.B GLU 118.A H 2.879 2.087 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.074 2.256 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.011 2.187 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.723 1.887 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.908 2.064 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.931 2.227 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 3.000 2.177 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.030 2.371 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.854 2.043 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.894 2.040 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.027 2.182 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.042 2.182 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.966 2.116 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.975 2.120 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.054 2.301 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.058 2.309 THR 135.A N ASP 40.A OD2 THR 135.A H 3.431 2.617 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.729 1.901 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.996 2.166 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.854 2.021 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.950 2.269 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.910 2.064 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.923 2.069 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.923 2.073 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.037 2.212 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H.B 2.991 2.137 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.917 2.073 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.824 1.998 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.929 2.166 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H.A 2.910 2.146 SER 151.A OG.B ALA 148.A O SER 151.A HG.B 2.837 2.006 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.106 2.323 ASP 153.A N SER 1.A O.A ASP 153.A H 2.973 2.199 ASP 153.A N SER 1.A O.B ASP 153.A H 2.957 2.170 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.815 2.129 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.053 2.247 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.822 2.032 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.867 2.064 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.905 2.155 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.257 2.609 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.821 1.971 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.809 1.977 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.887 2.104 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.885 2.067 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.158 2.388 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.808 1.962 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.814 1.986 THR 177.A N ASP 175.A OD1 THR 177.A H 2.948 2.134 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 2.666 1.828 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 3.401 2.834 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.024 2.185 THR 180.A N SER 329.A O.A THR 180.A H 2.904 2.074 THR 180.A N SER 329.A O.B THR 180.A H 3.027 2.206 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.914 2.072 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.786 2.039 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.821 2.037 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.259 2.405 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE1 GLN 192.A HE21 3.178 2.576 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.045 2.271 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.905 2.081 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.922 2.077 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.868 2.037 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.842 2.090 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.762 1.948 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.229 2.444 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.756 1.925 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.061 2.303 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.945 2.171 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.790 1.940 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.904 2.075 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.772 1.918 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H.A 3.029 2.232 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.925 2.098 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.886 2.064 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.003 2.247 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.961 2.134 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 2.995 2.139 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.880 2.060 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.788 2.209 GLY 221.A N ASP 219.A OD1 GLY 221.A H 2.881 2.132 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.274 2.418 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.661 1.952 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.064 2.205 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.919 2.081 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.987 2.193 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.055 2.222 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.912 2.074 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.102 2.280 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.041 2.247 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.731 1.896 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.033 2.185 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.874 2.045 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.943 2.158 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 2.999 2.161 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.011 2.171 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.087 2.233 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.019 2.213 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.876 2.017 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.004 2.175 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.854 2.035 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.098 2.365 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.772 1.957 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.898 2.061 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.879 2.107 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.903 2.057 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.853 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.904 2.051 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.944 2.133 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.907 2.057 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.925 2.137 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.879 2.090 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.961 2.128 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H.A 2.807 2.028 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.075 2.370 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.896 2.119 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.928 2.078 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.755 1.902 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.971 2.212 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.944 2.104 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.175 2.320 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.996 2.192 GLY 281.A N ASP 279.A OD1 GLY 281.A H 2.856 2.035 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.859 2.074 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.977 2.126 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.A 2.981 2.127 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.791 1.939 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.819 2.016 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.029 2.181 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.749 2.103 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.891 2.065 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.035 2.206 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.846 2.033 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.811 1.992 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.633 1.828 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.043 2.191 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.036 2.186 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.881 2.112 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.833 1.997 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.885 2.083 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.775 1.997 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.782 1.971 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.087 2.347 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.979 2.339 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.979 2.139 LYS 311.A N.A ASP 307.A O LYS 311.A H.A 2.841 1.998 LYS 311.A N.B ASP 307.A O LYS 311.A H.B 2.863 2.019 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.875 2.027 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.651 1.819 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H.A 3.144 2.359 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.974 2.149 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.833 2.015 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.040 2.212 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.785 1.956 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.800 1.957 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.941 2.132 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.907 2.063 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.760 2.031 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.131 2.336 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H.A 3.062 2.318 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.067 2.221 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.849 2.029 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.904 2.086 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.932 2.134 SER 329.A OG.B THR 180.A OG1 SER 329.A HG.B 2.549 1.797 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD1 LYS 330.A HZ2 2.791 1.957 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.830 2.087 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.A LYS 330.A HZ1 3.098 2.504 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.B LYS 330.A HZ1 3.249 2.645 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.806 1.951