Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yct_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A OG.A SER 149.A O SER 1.A HG.A 3.075 2.241 GLY 3.A N PHE 169.A O GLY 3.A H 2.982 2.187 SER 4.A N GLY 95.A O SER 4.A H 2.972 2.156 SER 4.A OG ASN 168.A OD1 SER 4.A HG 2.644 1.872 ALA 5.A N TYR 167.A O ALA 5.A H 2.933 2.095 THR 7.A N GLY 165.A O THR 7.A H 2.872 2.056 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.474 2.869 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.885 2.222 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.908 2.115 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H.B 2.915 2.129 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.067 2.289 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.269 2.415 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.058 2.201 TYR 17.A OH GLY 160.A O TYR 17.A HH 2.703 1.898 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.849 2.023 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.896 2.107 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.824 2.055 GLN 22.A N SER 93.A O GLN 22.A H 2.919 2.097 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.015 2.187 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.837 2.021 GLY 24.A N THR 91.A O GLY 24.A H 2.817 1.979 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.022 2.224 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.748 2.090 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.809 2.002 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.008 2.156 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.925 2.110 ASN 31.A N ASP 121.A OD2 ASN 31.A H 2.785 1.925 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.948 2.111 ASP 33.A N GLY 122.A O ASP 33.A H 2.894 2.058 ASP 35.A N LEU 124.A O ASP 35.A H 2.904 2.071 THR 36.A N THR 218.A OG1 THR 36.A H 2.921 2.113 THR 36.A OG1 ALA 216.A O THR 36.A HG1 2.801 2.250 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.901 2.092 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.291 2.433 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.632 1.995 SER 39.A OG PHE 128.A O SER 39.A HG 2.680 1.898 TRP 42.A N LEU 123.A O TRP 42.A H 2.955 2.259 VAL 43.A N GLU 105.A O VAL 43.A H 2.871 2.091 PHE 44.A N ASP 121.A O PHE 44.A H 2.966 2.138 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.877 2.061 SER 45.A OG SER 106.A OG SER 45.A HG 2.712 1.898 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.923 2.168 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.963 2.167 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.053 2.205 THR 48.A OG1 ALA 107.A O THR 48.A HG1 2.723 2.020 THR 49.A N LYS 108.A O THR 49.A H 2.971 2.116 THR 49.A OG1 LYS 108.A O THR 49.A HG1 2.827 1.996 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.847 2.019 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.152 2.301 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.740 1.938 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.864 2.096 GLN 56.A NE2 THR 115.A O GLN 56.A HE22 2.983 2.157 GLN 56.A NE2 ASP 117.A O GLN 56.A HE21 2.989 2.205 THR 57.A N ASP 121.A OD1 THR 57.A H 2.901 2.119 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.925 2.074 TYR 59.A OH ASP 90.A OD1 TYR 59.A HH 2.728 1.947 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.843 2.008 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.031 2.202 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.967 2.123 SER 64.A OG ASP 90.A OD1 SER 64.A HG 2.770 1.968 SER 64.A OG ASP 90.A OD2 SER 64.A HG 3.326 2.678 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.858 2.046 THR 66.A N SER 64.A OG THR 66.A H 3.401 2.614 THR 66.A OG1 ASP 90.A OD2 THR 66.A HG1 2.617 1.891 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.321 2.482 LYS 68.A N THR 89.A O LYS 68.A H 2.981 2.201 LEU 70.A N VAL 87.A O LEU 70.A H 2.824 1.979 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.134 2.286 THR 74.A N SER 135.A O THR 74.A H 2.887 2.065 TRP 75.A N GLY 85.A O TRP 75.A H 3.037 2.265 TRP 75.A NE1 SER 106.A O TRP 75.A HE1 3.187 2.428 SER 76.A N THR 133.A OG1 SER 76.A H 3.339 2.549 ILE 77.A N SER 83.A O ILE 77.A H 2.944 2.121 TYR 79.A N SER 81.A O TYR 79.A H 2.869 2.062 SER 82.A N SER 111.A OG SER 82.A H 2.892 2.081 SER 83.A N ILE 77.A O SER 83.A H 3.069 2.288 SER 84.A N LYS 109.A O SER 84.A H 2.985 2.193 GLY 85.A N TRP 75.A O GLY 85.A H 3.037 2.244 ASP 86.A N SER 106.A O ASP 86.A H 3.102 2.469 TYR 88.A N VAL 104.A O TYR 88.A H 2.922 2.064 TYR 88.A OH GLU 47.A OE2 TYR 88.A HH 2.653 1.841 THR 89.A N LYS 68.A O THR 89.A H 2.831 2.032 ASP 90.A N GLN 102.A O ASP 90.A H 3.008 2.243 THR 91.A N ASP 90.A OD2 THR 91.A H 2.739 1.996 VAL 92.A N VAL 99.A O VAL 92.A H 2.914 2.075 SER 93.A N GLN 22.A O SER 93.A H 2.811 1.993 VAL 94.A N LEU 97.A O VAL 94.A H 2.852 2.061 LEU 97.A N VAL 94.A O LEU 97.A H 2.960 2.106 THR 98.A OG1 SER 93.A OG THR 98.A HG1 2.709 1.878 VAL 99.A N VAL 92.A O VAL 99.A H 2.823 1.970 GLN 102.A N ASP 90.A O GLN 102.A H 2.979 2.318 GLN 102.A NE2 ALA 103.A O GLN 102.A HE21 3.147 2.319 GLN 102.A NE2 LYS 140.A O GLN 102.A HE22 3.217 2.437 VAL 104.A N TYR 88.A O VAL 104.A H 2.724 1.876 GLU 105.A N LEU 41.A O GLU 105.A H 2.870 2.024 SER 106.A N ASP 86.A O SER 106.A H 2.801 2.066 ALA 107.A N VAL 43.A O ALA 107.A H 2.997 2.150 LYS 108.A N SER 84.A O LYS 108.A H 2.816 2.059 LYS 109.A N SER 84.A O LYS 109.A H 3.161 2.320 VAL 110.A N GLU 52.A OE1 VAL 110.A H 2.951 2.141 SER 111.A N SER 82.A O SER 111.A H 2.874 2.104 PHE 114.A N SER 111.A O PHE 114.A H 2.992 2.304 THR 115.A N SER 111.A O THR 115.A H 3.252 2.422 THR 115.A OG1 GLU 52.A O THR 115.A HG1 2.675 1.869 GLU 116.A N SER 112.A O GLU 116.A H 2.817 2.012 ASP 117.A N PHE 114.A O ASP 117.A H 3.072 2.295 THR 119.A N ASP 117.A OD1 THR 119.A H 3.121 2.300 THR 119.A OG1 ASP 117.A OD1 THR 119.A HG1 2.743 1.913 ASP 121.A N ASN 31.A O ASP 121.A H 2.920 2.078 LEU 123.A N TRP 42.A O LEU 123.A H 2.886 2.139 LEU 124.A N ASP 33.A O LEU 124.A H 2.981 2.146 GLY 125.A N ASP 40.A O GLY 125.A H 2.994 2.325 LEU 126.A N ASP 35.A O LEU 126.A H 2.861 2.045 ALA 127.A N SER 38.A O ALA 127.A H 2.865 2.009 PHE 128.A N GLY 191.A O PHE 128.A H 3.029 2.180 LEU 131.A N PHE 128.A O LEU 131.A H 3.023 2.164 ASN 132.A N SER 129.A O ASN 132.A H 2.962 2.110 ASN 132.A ND2 SER 39.A O ASN 132.A HD22 2.962 2.109 ASN 132.A ND2 GLU 105.A OE1 ASN 132.A HD21 3.056 2.304 THR 133.A N ASP 40.A OD1 THR 133.A H 3.032 2.283 THR 133.A N ASP 40.A OD2 THR 133.A H 3.435 2.617 THR 133.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 133.A HG1 2.760 1.934 VAL 134.A N ASN 132.A OD1 VAL 134.A H 2.995 2.168 SER 135.A N THR 74.A O SER 135.A H 2.867 2.034 GLN 138.A NE2 THR 130.A O GLN 138.A HE22 2.944 2.279 GLN 138.A NE2 ASN 132.A O GLN 138.A HE21 2.975 2.129 GLN 139.A N ASN 132.A OD1 GLN 139.A H 2.917 2.063 GLN 139.A NE2 THR 137.A O GLN 139.A HE21 2.966 2.113 THR 141.A N SER 129.A OG THR 141.A H 3.035 2.210 ASP 144.A N THR 141.A OG1 ASP 144.A H.A 2.974 2.120 ASN 145.A N THR 141.A O ASN 145.A H 2.911 2.068 ASN 145.A ND2 GLN 102.A OE1 ASN 145.A HD22 2.832 2.007 ALA 146.A N PHE 142.A O ALA 146.A H 2.970 2.210 LYS 147.A N.A PHE 143.A O LYS 147.A H.A 2.898 2.348 SER 149.A N ALA 146.A O SER 149.A H 2.923 2.165 LEU 150.A N LYS 147.A O.B LEU 150.A H 3.029 2.270 ASP 151.A N SER 1.A O.A ASP 151.A H 2.960 2.186 ASP 151.A N SER 1.A O.B ASP 151.A H 2.972 2.194 VAL 154.A N SER 152.A O VAL 154.A H 2.800 2.117 PHE 155.A N PHE 315.A O PHE 155.A H 3.045 2.238 THR 156.A N ASN 168.A O THR 156.A H 2.830 2.037 ALA 157.A N VAL 313.A O ALA 157.A H 2.868 2.071 ASP 158.A N THR 166.A O ASP 158.A H 2.904 2.151 HIS 162.A N ASP 14.A OD1 HIS 162.A H 3.215 2.556 HIS 162.A N ASP 14.A OD2 HIS 162.A H 2.816 1.968 GLY 165.A N THR 7.A O GLY 165.A H 2.799 1.975 THR 166.A N ASP 158.A O THR 166.A H 2.891 2.107 TYR 167.A N ALA 5.A O TYR 167.A H 2.865 2.052 ASN 168.A N THR 156.A O ASN 168.A H 3.159 2.400 PHE 169.A N GLY 3.A O PHE 169.A H 2.792 1.947 GLY 170.A N VAL 154.A O GLY 170.A H 2.831 2.003 THR 175.A N ASP 173.A OD2 THR 175.A H 2.941 2.127 THR 175.A OG1 ASP 173.A OD1 THR 175.A HG1 3.412 2.845 THR 175.A OG1 ASP 173.A OD2 THR 175.A HG1 2.661 1.823 ALA 176.A N ASP 173.A O ALA 176.A H 3.052 2.210 THR 178.A N SER 327.A O THR 178.A H 2.931 2.103 THR 182.A N PHE 325.A O THR 182.A H 2.922 2.081 THR 184.A N LEU 323.A O THR 184.A H 2.779 2.030 SER 187.A N GLU 194.A O SER 187.A H 2.846 2.067 LYS 189.A N SER 187.A OG LYS 189.A H 3.315 2.461 GLN 190.A NE2 GLU 194.A OE1 GLN 190.A HE21 3.247 2.621 GLN 190.A NE2 GLU 194.A OE2 GLN 190.A HE21 3.121 2.347 GLY 191.A N THR 188.A O GLY 191.A H 2.929 2.104 TRP 193.A NE1 LEU 126.A O TRP 193.A HE1 2.905 2.059 TRP 195.A N GLY 214.A O TRP 195.A H 2.828 1.995 THR 196.A OG1 ASP 213.A OD1.B THR 196.A HG1 2.572 1.853 SER 197.A N ILE 212.A O SER 197.A H 2.837 2.068 SER 197.A OG GLY 263.A O SER 197.A HG 2.752 1.936 THR 198.A N GLY 263.A O THR 198.A H 3.227 2.447 THR 198.A OG1 GLY 265.A O THR 198.A HG1 2.765 1.934 TYR 200.A N LYS 208.A O TYR 200.A H 3.069 2.308 ALA 201.A N THR 261.A O ALA 201.A H 2.940 2.169 GLY 203.A N SER 259.A O GLY 203.A H 2.809 1.962 GLY 205.A N VAL 202.A O GLY 205.A H 2.912 2.087 LYS 208.A N TYR 200.A O LYS 208.A H 2.765 1.912 THR 210.A N THR 198.A O THR 210.A H 3.046 2.253 ILE 212.A N SER 197.A O ILE 212.A H 2.933 2.108 GLY 214.A N TRP 195.A O GLY 214.A H 2.878 2.058 ILE 215.A N ASN 301.A O ILE 215.A H 3.016 2.260 ALA 216.A N TRP 193.A O ALA 216.A H 2.933 2.102 ASP 217.A N PHE 303.A O ASP 217.A H 2.993 2.140 THR 218.A N THR 36.A OG1 THR 218.A H 2.893 2.073 THR 218.A OG1 PHE 34.A O THR 218.A HG1 2.764 2.209 GLY 219.A N ASP 217.A OD2 GLY 219.A H 2.849 2.105 THR 220.A N ASP 217.A O THR 220.A H 3.329 2.471 THR 220.A OG1 ASP 217.A OD1 THR 220.A HG1 2.648 2.057 THR 221.A OG1 ASP 15.A O THR 221.A HG1 2.641 1.922 LEU 223.A N GLY 291.A O LEU 223.A H 3.063 2.204 TYR 224.A N ILE 302.A O TYR 224.A H 2.913 2.073 LEU 225.A N GLN 293.A O LEU 225.A H 2.990 2.199 VAL 230.A N PRO 226.A O VAL 230.A H 3.053 2.220 SER 231.A N ALA 227.A O SER 231.A H 2.918 2.084 ALA 232.A N THR 228.A O ALA 232.A H 3.087 2.259 TYR 233.A N VAL 229.A O TYR 233.A H 3.036 2.247 TYR 233.A OH PRO 258.A O TYR 233.A HH 2.733 1.902 TRP 234.A N VAL 230.A O TRP 234.A H 3.036 2.195 TRP 234.A NE1 ILE 292.A O TRP 234.A HE1 2.860 2.032 ALA 235.A N SER 231.A O ALA 235.A H 2.968 2.178 GLN 236.A N TYR 233.A O GLN 236.A H 3.008 2.170 VAL 237.A N TRP 234.A O VAL 237.A H 2.976 2.134 ALA 240.A N VAL 237.A O ALA 240.A H 3.068 2.214 LYS 241.A N VAL 250.A O LYS 241.A H 3.022 2.215 SER 243.A N GLY 248.A O SER 243.A H 2.878 2.020 SER 245.A OG SER 243.A OG SER 245.A HG 3.020 2.427 VAL 246.A N SER 243.A OG VAL 246.A H 3.044 2.205 GLY 247.A N SER 243.A O GLY 247.A H 2.843 2.029 GLY 248.A N SER 243.A O GLY 248.A H 3.077 2.343 TYR 249.A N GLN 293.A OE1 TYR 249.A H 2.773 1.962 VAL 250.A N LYS 241.A O VAL 250.A H 2.896 2.061 PHE 251.A N CYS 288.A O PHE 251.A H 2.878 2.101 CYS 253.A N SER 286.A O CYS 253.A H 2.899 2.053 CYS 253.A SG SER 285.A O no hydrogen 3.931 N/A ALA 255.A N PRO 252.A O ALA 255.A H 2.892 2.044 PHE 260.A N ILE 271.A O PHE 260.A H 2.938 2.135 THR 261.A N ALA 201.A O THR 261.A H 2.915 2.064 PHE 262.A N ILE 269.A O PHE 262.A H 2.924 2.141 GLY 263.A N GLY 199.A O GLY 263.A H 2.890 2.102 VAL 264.A N ALA 267.A O VAL 264.A H 2.928 2.099 ALA 267.A N VAL 264.A O ALA 267.A H 2.786 2.026 ARG 268.A NH1 GLY 265.A O ARG 268.A HH12 3.071 2.354 ARG 268.A NH1 ALA 267.A O ARG 268.A HH11 2.897 2.129 ILE 269.A N PHE 262.A O ILE 269.A H 2.928 2.077 ILE 271.A N PHE 260.A O ILE 271.A H 2.758 1.906 TYR 275.A N PRO 272.A O TYR 275.A H.A 2.963 2.208 ILE 276.A N GLY 273.A O ILE 276.A H 2.931 2.092 ASP 277.A N ASP 274.A O.A ASP 277.A H 3.167 2.312 ASP 277.A N ASP 274.A O.B ASP 277.A H 3.450 2.597 PHE 278.A N PHE 289.A O PHE 278.A H 2.961 2.163 GLY 279.A N ASP 277.A OD2 GLY 279.A H 2.843 2.016 ILE 281.A N SER 287.A O.A ILE 281.A H 2.851 2.070 ILE 281.A N SER 287.A O.B ILE 281.A H 2.841 2.059 SER 285.A N SER 282.A O SER 285.A H 2.987 2.138 SER 287.A N.A SER 285.A OG SER 287.A H.A 2.960 2.106 SER 287.A N.B SER 285.A OG SER 287.A H.B 2.960 2.106 CYS 288.A N PHE 251.A O CYS 288.A H.A 2.776 1.927 CYS 288.A SG ASP 277.A OD2 no hydrogen 3.902 N/A PHE 289.A N GLY 279.A O PHE 289.A H 2.796 1.991 GLY 290.A N TYR 249.A O GLY 290.A H 3.013 2.165 GLY 291.A N ILE 276.A O GLY 291.A H 2.752 2.117 GLN 293.A N LEU 223.A O GLN 293.A H 2.896 2.069 GLN 293.A NE2 TYR 249.A O GLN 293.A HE22 3.008 2.178 GLN 293.A NE2 GLY 290.A O GLN 293.A HE21 2.842 2.030 SER 295.A N LEU 225.A O SER 295.A H 2.803 1.982 SER 295.A OG ASN 301.A OD1 SER 295.A HG 2.608 1.813 ALA 296.A N.A SER 294.A OG ALA 296.A H.A 3.023 2.169 ALA 296.A N.B SER 294.A OG ALA 296.A H.B 3.011 2.165 ILE 298.A N SER 295.A O ILE 298.A H.A 2.931 2.136 ASN 301.A ND2 ASP 213.A O ASN 301.A HD22 2.811 1.980 ILE 302.A N TYR 224.A O ILE 302.A H 2.870 2.056 PHE 303.A N ILE 215.A O PHE 303.A H 2.776 1.993 ASP 305.A N THR 220.A O ASP 305.A H 2.775 1.961 VAL 306.A N THR 221.A O VAL 306.A H 3.093 2.347 ALA 307.A N GLY 304.A O ALA 307.A H 2.976 2.340 LEU 308.A N GLY 304.A O LEU 308.A H 2.956 2.113 LYS 309.A N.A ASP 305.A O LYS 309.A H.A 2.839 1.999 LYS 309.A N.B ASP 305.A O LYS 309.A H.B 2.854 2.013 LYS 309.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 309.A HZ3.A 2.877 2.020 LYS 309.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 309.A HZ2.B 2.777 1.924 ALA 310.A N ALA 307.A O ALA 310.A H.A 3.122 2.336 ALA 311.A N LEU 308.A O ALA 311.A H 2.949 2.121 PHE 312.A N ALA 326.A O PHE 312.A H 2.845 2.025 VAL 313.A N ALA 157.A O VAL 313.A H 3.049 2.225 VAL 314.A N GLY 324.A O VAL 314.A H 2.783 1.952 PHE 315.A N PHE 155.A O PHE 315.A H 2.791 1.946 ASN 316.A N THR 322.A O ASN 316.A H 2.962 2.153 ASN 316.A ND2 THR 322.A OG1 ASN 316.A HD22 2.892 2.043 GLY 317.A N PRO 153.A O GLY 317.A H 2.769 2.026 ALA 318.A N ASN 316.A OD1 ALA 318.A H 3.071 2.262 THR 322.A N ASN 316.A O THR 322.A H.A 3.067 2.318 LEU 323.A N THR 184.A O LEU 323.A H 3.060 2.213 GLY 324.A N VAL 314.A O GLY 324.A H 2.848 2.029 PHE 325.A N THR 182.A O PHE 325.A H 2.899 2.088 ALA 326.A N PHE 312.A O ALA 326.A H 2.916 2.107 LYS 328.A NZ ASP 158.A OD2 LYS 328.A HZ2 2.741 1.901 LYS 328.A NZ LEU 159.A O LYS 328.A HZ1 2.849 2.100 LYS 328.A NZ LYS 309.A O.A LYS 328.A HZ1 3.106 2.519 LYS 328.A NZ LYS 309.A O.B LYS 328.A HZ1 3.263 2.661 LYS 328.A NZ ALA 311.A O LYS 328.A HZ3 2.814 1.962