Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yd3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A OG.A SER 151.A O.A SER 1.A HG.A 3.055 2.220 SER 1.A OG.A SER 151.A O.B SER 1.A HG.A 2.948 2.113 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.987 2.191 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.995 2.180 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.655 1.876 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.933 2.097 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.868 2.054 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.497 2.887 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.891 2.225 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.919 2.129 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.882 2.086 LEU 13.A N ASP 11.A OD1 LEU 13.A H 3.034 2.270 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.289 2.434 ASP 15.A N ASP 11.A OD1 ASP 15.A H 3.097 2.241 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.690 1.883 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.886 2.059 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.894 2.117 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.816 2.042 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.929 2.102 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.026 2.197 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.837 2.017 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.827 1.987 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.040 2.238 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.771 2.106 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.813 1.989 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.018 2.167 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.955 2.138 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.840 1.982 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.925 2.096 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.896 2.066 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.882 2.051 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.907 2.095 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.800 2.237 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.941 2.125 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.322 2.471 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.601 1.972 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.686 1.904 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.953 2.212 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.899 2.123 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.954 2.128 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.873 2.069 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.692 1.881 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.937 2.197 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.962 2.162 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.061 2.214 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.714 2.003 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.951 2.095 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.817 1.986 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.864 2.033 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.179 2.326 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.749 1.948 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.857 2.083 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 2.980 2.150 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O.A GLN 56.A HE21 3.185 2.392 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O.B GLN 56.A HE21 2.843 2.067 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.895 2.142 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.929 2.081 TYR 59.A OH ASP 92.A OD2 TYR 59.A HH 2.724 1.943 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.839 2.003 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.017 2.194 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.970 2.121 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 3.339 2.702 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 2.735 1.930 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.861 2.052 THR 65.A OG1 THR 25.A O THR 65.A HG1 3.411 2.579 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD1 THR 66.A HG1 2.626 1.885 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.310 2.475 LYS 68.A N.A THR 91.A O LYS 68.A H.A 2.961 2.173 LYS 68.A N.B THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.981 2.196 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.833 1.979 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.138 2.287 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.905 2.086 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.040 2.258 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.224 2.468 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.320 2.557 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.951 2.120 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H.B 2.869 2.037 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.923 2.076 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 2.999 2.148 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.730 1.956 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H.A 2.955 2.142 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.167 2.382 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.001 2.215 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.038 2.240 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.131 2.484 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.943 2.085 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.630 1.823 THR 91.A N LYS 68.A O.A THR 91.A H 2.789 1.998 THR 91.A N LYS 68.A O.B THR 91.A H 2.824 2.011 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.995 2.225 THR 93.A N ASP 92.A OD1 THR 93.A H 2.742 2.009 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.923 2.084 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.803 1.980 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.867 2.071 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.958 2.103 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.707 1.872 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.815 1.960 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.995 2.335 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.149 2.320 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.224 2.448 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.737 1.895 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.867 2.020 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.808 2.061 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 3.009 2.159 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.792 2.030 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.155 2.311 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.975 2.161 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.909 2.136 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.984 2.260 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.197 2.371 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.681 1.870 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.882 2.060 ASP 119.A N.A PHE 116.A O ASP 119.A H.A 2.976 2.178 ASP 119.A N.B PHE 116.A O ASP 119.A H.B 3.006 2.227 SER 120.A OG.B ASP 54.A O SER 120.A HG.B 2.547 1.786 THR 121.A N ASP 119.A OD1.B THR 121.A H.A 3.159 2.359 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1.B THR 121.A HG1 2.703 1.882 ILE 122.A N ASP 119.A O.A ILE 122.A H 3.198 2.345 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.922 2.080 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.972 2.286 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.991 2.163 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.003 2.335 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.839 2.023 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.893 2.037 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.035 2.189 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.028 2.170 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.952 2.101 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.963 2.111 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.057 2.300 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.018 2.259 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.734 1.907 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.997 2.168 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.863 2.028 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.914 2.247 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.906 2.057 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.913 2.057 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.939 2.088 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.055 2.228 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H.B 2.981 2.128 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.917 2.084 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.806 1.974 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.933 2.182 LYS 149.A N.B PHE 145.A O LYS 149.A H.B 2.941 2.410 LYS 149.A NZ.A GLY 319.A O LYS 149.A HZ3.A 2.904 2.042 LYS 149.A NZ.B GLY 319.A O LYS 149.A HZ3.B 2.856 2.033 SER 151.A N.A ALA 148.A O SER 151.A H.A 2.926 2.167 SER 151.A N.B ALA 148.A O SER 151.A H.B 2.919 2.164 SER 151.A OG.B ALA 148.A O SER 151.A HG.B 2.801 1.970 LEU 152.A N LYS 149.A O.A LEU 152.A H 3.033 2.250 LEU 152.A N LYS 149.A O.B LEU 152.A H 3.340 2.579 ASP 153.A N SER 1.A O.A ASP 153.A H 2.958 2.174 ASP 153.A N SER 1.A O.B ASP 153.A H 2.991 2.210 SER 154.A N.B GLY 172.A O SER 154.A H.B 3.101 2.478 VAL 156.A N SER 154.A O.A VAL 156.A H 2.808 2.134 VAL 156.A N SER 154.A O.B VAL 156.A H 2.822 2.148 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.056 2.248 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.827 2.038 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.883 2.078 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.919 2.152 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.224 2.566 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.813 1.967 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.802 1.974 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.903 2.116 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.874 2.052 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.159 2.393 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.803 1.958 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.823 1.989 THR 177.A N ASP 175.A OD1 THR 177.A H 2.919 2.103 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 2.689 1.852 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 3.430 2.845 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.039 2.205 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.932 2.110 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.908 2.064 THR 186.A N LEU 325.A O.A THR 186.A H 2.768 2.020 THR 186.A N LEU 325.A O.B THR 186.A H 2.819 2.100 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.844 2.056 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.294 2.444 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.887 2.064 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.888 2.041 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.871 2.040 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD1.B THR 198.A HG1 2.559 1.845 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.835 2.071 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.753 1.936 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.234 2.448 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.756 1.924 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.056 2.299 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.954 2.181 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.802 1.955 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H.A 2.895 2.070 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.774 1.926 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H.A 3.034 2.256 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.938 2.114 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.878 2.056 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.982 2.219 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.942 2.115 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 2.982 2.127 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.880 2.057 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.759 2.211 GLY 221.A N ASP 219.A OD1 GLY 221.A H 2.869 2.089 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.335 2.483 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD2 THR 222.A HG1 2.925 2.332 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.744 1.965 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.065 2.205 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.908 2.072 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.972 2.179 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.049 2.213 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.917 2.081 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.097 2.273 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.041 2.254 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.733 1.900 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.033 2.190 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.869 2.040 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.962 2.179 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 2.998 2.161 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.008 2.163 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.094 2.242 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.023 2.215 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.852 1.991 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.017 2.201 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.831 2.008 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.079 2.326 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.776 1.962 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.902 2.071 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.882 2.107 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.906 2.067 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.870 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.892 2.042 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.939 2.133 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.913 2.062 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.950 2.164 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.889 2.093 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.961 2.126 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H.A 2.797 2.026 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.077 2.380 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.935 2.164 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.922 2.073 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.757 1.905 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.961 2.206 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.942 2.104 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.160 2.307 ASP 279.A N ASP 276.A O.B ASP 279.A H 3.462 2.613 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 3.003 2.206 GLY 281.A N ASP 279.A OD1 GLY 281.A H 2.891 2.061 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.846 2.052 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.975 2.124 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.A 2.976 2.122 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.807 1.953 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.814 2.016 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.047 2.197 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.742 2.102 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.908 2.083 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.022 2.193 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.860 2.035 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.803 1.985 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.619 1.824 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.027 2.173 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.824 1.984 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O.A ASN 303.A HD22 2.870 2.046 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O.B ASN 303.A HD22 2.768 1.931 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.892 2.086 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.781 1.995 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.797 1.982 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.040 2.298 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.998 2.355 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.977 2.135 LYS 311.A N.A ASP 307.A O LYS 311.A H.A 2.873 2.027 LYS 311.A N.B ASP 307.A O LYS 311.A H.B 2.852 2.010 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.A 2.702 1.877 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.B 2.942 2.087 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H.A 3.151 2.353 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.978 2.156 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.840 2.020 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.059 2.235 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.792 1.963 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.807 1.968 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.961 2.154 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.860 2.007 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.779 2.040 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.107 2.301 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.096 2.360 LEU 325.A N.A THR 186.A O LEU 325.A H.A 3.059 2.213 LEU 325.A N.B THR 186.A O LEU 325.A H.B 3.057 2.222 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.846 2.024 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.923 2.108 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.926 2.117 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD1 LYS 330.A HZ2 2.761 1.925 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.841 2.095 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.A LYS 330.A HZ1 3.226 2.629 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.B LYS 330.A HZ1 3.113 2.523 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.806 1.952