Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yd6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.806 1.970 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.792 1.993 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.993 2.194 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.961 2.143 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.644 1.870 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.940 2.101 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.879 2.061 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.430 2.814 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.878 2.229 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.898 2.108 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.924 2.132 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.056 2.291 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.280 2.426 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.072 2.218 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.695 1.885 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.868 2.040 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.880 2.092 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.824 2.047 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.910 2.091 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 2.981 2.158 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.841 2.025 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.824 1.990 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.061 2.264 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.718 2.053 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.797 1.981 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.030 2.178 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.942 2.130 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.817 1.958 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.951 2.113 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.917 2.085 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.884 2.062 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.910 2.103 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.764 2.205 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.875 2.058 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.301 2.446 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.620 1.998 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.679 1.907 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.959 2.228 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.890 2.124 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.924 2.110 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.898 2.091 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.693 1.886 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.923 2.168 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.955 2.150 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.055 2.217 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.761 2.065 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.957 2.102 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.804 1.973 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.844 2.014 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.163 2.311 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.725 1.923 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 2.977 2.154 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.982 2.200 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.921 2.156 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.917 2.068 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.711 1.921 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.871 2.039 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.009 2.185 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.974 2.127 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.745 1.939 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.314 2.683 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.868 2.059 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.655 1.925 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.259 2.423 LYS 68.A N.A THR 91.A O LYS 68.A H.A 2.982 2.185 LYS 68.A N.B THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.997 2.213 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.829 1.979 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.111 2.264 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.903 2.082 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.025 2.251 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.217 2.462 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.299 2.535 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.921 2.093 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.860 2.012 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.994 2.160 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.027 2.183 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.677 1.892 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.956 2.168 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.123 2.336 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.007 2.226 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.012 2.219 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.090 2.420 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.931 2.074 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.747 1.930 THR 91.A N LYS 68.A O.A THR 91.A H 2.803 2.019 THR 91.A N LYS 68.A O.B THR 91.A H 2.832 2.028 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.985 2.223 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.720 1.979 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.922 2.080 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.805 1.983 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.854 2.053 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.975 2.119 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.743 1.908 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.813 1.960 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 3.022 2.374 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.121 2.294 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.231 2.449 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.753 1.910 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.859 2.011 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.798 2.034 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.992 2.147 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.779 2.023 LYS 110.A NZ ASP 88.A OD2 LYS 110.A HZ2 3.388 2.648 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.122 2.278 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.948 2.137 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.902 2.125 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 3.012 2.332 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.280 2.455 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.689 1.893 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.862 2.064 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.135 2.339 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.140 2.308 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.782 1.945 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.900 2.056 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.930 2.229 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.982 2.159 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.030 2.369 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.866 2.056 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.920 2.066 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.041 2.190 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.031 2.172 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.951 2.100 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.956 2.100 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.039 2.287 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.023 2.261 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.734 1.907 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.952 2.126 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.865 2.030 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.906 2.240 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.920 2.076 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.908 2.055 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.932 2.079 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.010 2.185 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H.B 2.974 2.120 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.917 2.081 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.823 1.998 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.940 2.185 LYS 149.A N.B PHE 145.A O LYS 149.A H.B 2.908 2.363 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.918 2.155 LEU 152.A N LYS 149.A O.A LEU 152.A H 3.034 2.284 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.965 2.184 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.830 2.161 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.047 2.243 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.824 2.028 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.877 2.077 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.899 2.141 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.263 2.590 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.830 1.987 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.818 2.002 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.899 2.116 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.890 2.080 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.160 2.407 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.797 1.951 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.805 1.968 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.937 2.121 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.372 2.801 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.651 1.812 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.042 2.201 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.923 2.120 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.900 2.060 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.759 2.000 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.847 2.061 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.277 2.423 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE1 GLN 192.A HE21 3.164 2.577 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 2.986 2.274 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.894 2.070 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.866 2.021 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.842 2.012 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.842 2.088 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.755 1.939 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.237 2.457 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.763 1.937 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.047 2.288 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.957 2.184 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.778 1.929 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.891 2.070 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.747 1.899 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.016 2.241 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.907 2.079 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.868 2.044 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.974 2.222 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.955 2.130 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 2.982 2.127 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.898 2.080 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.754 2.192 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.832 2.069 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.314 2.461 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.773 2.140 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.653 1.910 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.061 2.202 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.893 2.054 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.997 2.205 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.029 2.193 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.909 2.072 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.097 2.264 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.025 2.235 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.739 1.909 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.015 2.171 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.889 2.065 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.960 2.189 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.000 2.160 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.016 2.175 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.065 2.212 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.008 2.200 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.867 2.009 SER 247.A OG SER 245.A OG SER 247.A HG 3.082 2.518 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.017 2.185 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.868 2.053 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.090 2.342 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.776 1.970 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.870 2.033 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.876 2.104 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.885 2.039 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.971 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.876 2.027 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.951 2.148 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.883 2.032 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.918 2.130 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.871 2.068 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.974 2.147 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.790 2.034 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.063 2.366 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.899 2.125 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.932 2.080 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.763 1.910 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.977 2.225 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.917 2.075 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.140 2.287 ASP 279.A N ASP 276.A O.B ASP 279.A H 3.385 2.534 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.987 2.190 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.861 2.036 ILE 283.A N SER 289.A O.A ILE 283.A H 2.829 2.050 ILE 283.A N SER 289.A O.B ILE 283.A H 2.817 2.038 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.965 2.118 SER 289.A N.A SER 287.A OG SER 289.A H.A 2.974 2.121 SER 289.A N.B SER 287.A OG SER 289.A H.B 2.974 2.120 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H.A 2.770 1.917 CYS 290.A SG ASP 279.A OD2 no hydrogen 3.879 N/A PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.812 2.016 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.025 2.182 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.744 2.084 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.896 2.072 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.030 2.201 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.838 2.016 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.823 2.008 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.615 1.815 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.017 2.172 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.021 2.167 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H.B 2.879 2.089 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.820 1.986 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.860 2.055 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.782 2.011 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.785 1.968 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.062 2.331 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.979 2.331 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.975 2.129 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.858 2.014 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2 2.783 1.928 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.128 2.336 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.954 2.134 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.839 2.022 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.040 2.217 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.798 1.969 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.795 1.953 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.937 2.135 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.920 2.079 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.754 2.014 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.072 2.269 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.064 2.323 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.090 2.242 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.842 2.026 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.899 2.092 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.899 2.091 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.775 1.925 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.820 2.052 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.153 2.569 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.800 1.934