Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yd7_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.833 1.975 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.776 1.926 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.972 2.178 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.945 2.130 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.618 1.849 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.935 2.094 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.858 2.046 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.523 2.916 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.884 2.226 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.903 2.110 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.913 2.116 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.032 2.255 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.270 2.415 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.077 2.224 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.680 1.870 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.869 2.044 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.893 2.098 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.803 2.038 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.905 2.087 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 2.990 2.162 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.838 2.021 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.814 1.975 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.063 2.273 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.752 2.089 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.772 1.946 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.010 2.160 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.913 2.097 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.830 1.972 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.956 2.120 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.898 2.062 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.895 2.069 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.896 2.083 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.765 2.223 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.859 2.050 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.318 2.469 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.615 1.993 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.679 1.896 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.938 2.236 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.878 2.104 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.942 2.125 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.905 2.101 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.705 1.901 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.917 2.180 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.954 2.161 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.078 2.237 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.704 2.003 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.978 2.121 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.834 2.002 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.857 2.028 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.166 2.315 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.743 1.918 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.851 2.069 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 2.992 2.166 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.967 2.178 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.900 2.131 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.936 2.088 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.706 1.922 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.838 2.005 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.030 2.206 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.942 2.100 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.744 1.949 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.325 2.693 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.883 2.069 THR 65.A OG1 THR 25.A O THR 65.A HG1 3.362 2.527 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.673 1.940 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.251 2.417 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.996 2.208 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.862 2.008 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.114 2.263 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.911 2.088 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.048 2.282 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.215 2.452 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.249 2.460 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.953 2.126 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H.B 2.859 2.067 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.890 2.062 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.006 2.160 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.660 1.880 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.964 2.153 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.114 2.330 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.015 2.223 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.044 2.256 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.097 2.447 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.918 2.061 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.718 1.901 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.835 2.040 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 3.003 2.248 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.702 1.973 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.921 2.078 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.784 1.961 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.870 2.073 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.969 2.116 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.734 1.899 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.843 1.987 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 3.004 2.362 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.104 2.280 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.222 2.439 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.733 1.898 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.871 2.022 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.795 2.032 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.981 2.126 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.804 2.057 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.138 2.293 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.918 2.101 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.877 2.114 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H.A 2.985 2.300 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.264 2.434 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.691 1.885 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.898 2.118 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.089 2.293 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.144 2.318 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.851 2.014 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.885 2.035 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.882 2.153 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.996 2.165 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.056 2.371 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.846 2.035 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.901 2.045 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.033 2.188 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.012 2.155 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.934 2.081 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.995 2.140 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.082 2.324 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.015 2.255 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.755 1.927 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 3.007 2.180 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.863 2.029 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.930 2.270 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.899 2.054 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.897 2.044 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.950 2.101 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.023 2.192 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H.A 2.969 2.126 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.908 2.071 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.820 1.988 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.978 2.232 LYS 149.A N.B PHE 145.A O LYS 149.A H.B 2.906 2.377 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H.A 2.914 2.167 SER 151.A OG.B ALA 148.A O SER 151.A HG.B 2.820 1.992 LEU 152.A N ALA 148.A O LEU 152.A H 3.233 2.619 LEU 152.A N LYS 149.A O.A LEU 152.A H 3.016 2.263 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.966 2.186 SER 154.A N.A GLY 172.A O SER 154.A H.A 3.139 2.522 SER 154.A N.B GLY 172.A O SER 154.A H.B 3.121 2.478 VAL 156.A N SER 154.A O.A VAL 156.A H 2.759 2.067 VAL 156.A N SER 154.A O.B VAL 156.A H 2.792 2.101 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.028 2.225 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.809 2.016 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.859 2.052 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.897 2.139 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.255 2.576 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.845 2.000 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.797 1.964 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.896 2.111 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.879 2.065 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.139 2.368 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.809 1.963 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.804 1.979 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.918 2.112 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.628 1.794 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.037 2.196 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.940 2.123 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.923 2.085 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.781 2.014 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.841 2.068 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.242 2.390 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.000 2.358 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.838 2.012 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.868 2.023 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.818 1.985 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD1.B THR 198.A HG1 2.580 1.861 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.839 2.068 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.785 1.972 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.245 2.466 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.771 1.942 GLY 201.A N SER 199.A OG GLY 201.A H 3.427 2.576 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.069 2.307 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.937 2.160 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.789 1.936 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.929 2.105 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.758 1.904 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.023 2.250 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.903 2.081 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.870 2.049 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.985 2.228 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.966 2.139 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.005 2.149 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.889 2.071 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.728 2.194 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.887 2.136 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.284 2.428 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.643 1.919 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.046 2.186 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.896 2.055 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.994 2.203 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.058 2.222 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.922 2.085 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.075 2.252 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.026 2.243 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.709 1.880 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.018 2.174 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.880 2.051 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.952 2.173 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.015 2.175 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.003 2.164 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.071 2.217 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.020 2.213 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.843 1.985 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.033 2.212 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.821 2.009 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.056 2.289 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.788 1.972 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.912 2.074 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.864 2.085 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.858 2.012 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.936 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.900 2.047 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.938 2.134 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.878 2.031 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.935 2.150 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.861 2.064 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.922 2.089 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.813 2.050 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.035 2.328 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.881 2.110 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.904 2.056 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.762 1.910 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.B 2.997 2.203 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.951 2.113 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.126 2.271 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.983 2.183 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.858 2.036 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.837 2.062 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.972 2.121 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.B 2.986 2.131 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.781 1.931 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.795 1.993 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.018 2.167 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.734 2.080 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.912 2.089 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 2.994 2.168 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.842 2.017 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.800 1.980 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.616 1.818 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 2.998 2.151 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 2.997 2.144 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.867 2.115 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.861 2.035 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.889 2.090 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.782 2.028 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.772 1.960 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.048 2.317 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.983 2.335 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.954 2.111 LYS 311.A N.A ASP 307.A O LYS 311.A H.A 2.841 1.999 LYS 311.A N.B ASP 307.A O LYS 311.A H.B 2.857 2.013 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.922 2.073 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.691 1.835 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H.B 3.149 2.350 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.959 2.132 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.819 2.000 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.049 2.219 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.778 1.950 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.804 1.962 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.986 2.182 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.853 2.010 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.770 2.039 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.091 2.286 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.098 2.357 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.064 2.217 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.820 2.010 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.912 2.097 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.901 2.092 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.757 1.912 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.828 2.073 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.A LYS 330.A HZ1 3.069 2.485 LYS 330.A NZ LYS 311.A O.B LYS 330.A HZ1 3.205 2.609 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.813 1.949