Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ydd_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 5.A N GLU 154.A O ARG 5.A H 2.837 2.063 ARG 6.A NE ASP 223.A OD1 ARG 6.A HE 3.381 2.704 ARG 6.A NE ASP 223.A OD2 ARG 6.A HE 2.941 2.107 ARG 6.A NH2 ASP 223.A OD1 ARG 6.A HH21 2.835 2.007 GLN 7.A NE2 LEU 8.A O GLN 7.A HE21 2.873 2.016 GLN 7.A NE2 GLY 157.A O GLN 7.A HE22 3.387 2.598 LEU 8.A N ASP 156.A O LEU 8.A H 2.863 2.007 THR 9.A N GLY 220.A O THR 9.A H 2.824 2.092 THR 9.A OG1 GLN 7.A O THR 9.A HG1 2.825 2.010 TYR 10.A N ASN 251.A O TYR 10.A H 3.155 2.325 VAL 11.A N HIS 218.A O VAL 11.A H 2.960 2.151 THR 12.A N PHE 253.A O THR 12.A H 2.733 1.949 ASP 13.A N ALA 216.A O ASP 13.A H 2.807 1.959 LEU 14.A N VAL 255.A O LEU 14.A H 2.997 2.198 ASN 15.A N ASP 13.A OD1 ASN 15.A H 2.954 2.161 ASN 15.A ND2 ASP 13.A OD1 ASN 15.A HD22 2.853 2.027 ASN 15.A ND2 PRO 256.A O ASN 15.A HD21 2.960 2.304 LYS 16.A N ASP 13.A O LYS 16.A H 2.998 2.158 LYS 16.A NZ ARG 215.A O LYS 16.A HZ3 2.680 1.922 LYS 16.A NZ LEU 315.A O LYS 16.A HZ2 3.048 2.289 LYS 16.A NZ ILE 316.A O LYS 16.A HZ2 2.980 2.410 CYS 17.A N ASP 13.A O CYS 17.A H 3.252 2.591 CYS 20.A SG THR 22.A OG1 no hydrogen 3.103 N/A GLN 21.A NE2 VAL 45.A O GLN 21.A HE22 3.077 2.229 THR 24.A OG1 GLN 21.A OE1 THR 24.A HG1 2.832 2.065 VAL 25.A N GLN 21.A O VAL 25.A H 3.032 2.223 ALA 26.A N THR 22.A O ALA 26.A H 2.786 1.969 CYS 27.A N CYS 23.A O CYS 27.A H 3.077 2.221 LYS 28.A N THR 24.A O LYS 28.A H 3.219 2.391 LYS 28.A NZ THR 32.A O LYS 28.A HZ3 3.063 2.493 LYS 28.A NZ THR 32.A OG1 LYS 28.A HZ3 2.867 2.091 LYS 28.A NZ GLN 37.A O LYS 28.A HZ1 2.949 2.341 LYS 28.A NZ MET 40.A O LYS 28.A HZ1 2.874 2.224 LYS 29.A N VAL 25.A O LYS 29.A H 2.869 2.049 LEU 30.A N ALA 26.A O LEU 30.A H 3.118 2.516 LEU 30.A N CYS 27.A O LEU 30.A H 3.225 2.487 TRP 31.A N CYS 27.A O TRP 31.A H 2.851 2.011 THR 32.A N LYS 28.A O THR 32.A H 3.280 2.504 GLY 34.A N GLN 37.A OE1 GLY 34.A H 3.040 2.235 GLN 37.A N GLY 34.A O GLN 37.A H 3.183 2.336 GLN 37.A NE2 ASN 191.A OD1 GLN 37.A HE21 2.824 1.988 MET 40.A N GLN 37.A O MET 40.A H 3.022 2.174 TYR 41.A N TYR 53.A OH TYR 41.A H 2.974 2.244 ASN 44.A N ARG 131.A O ASN 44.A H 2.868 2.041 ASN 44.A ND2 GLU 46.A OE2 ASN 44.A HD21 2.988 2.141 GLU 46.A N LEU 129.A O GLU 46.A H 3.093 2.245 ALA 48.A N PHE 127.A O ALA 48.A H 2.775 1.922 LEU 51.A N ASP 113.A OD2 LEU 51.A H 2.827 2.001 TYR 53.A N GLU 46.A OE2 TYR 53.A H 2.886 2.066 TYR 53.A OH PHE 39.A O TYR 53.A HH 2.558 1.889 ARG 55.A N ASP 79.A O ARG 55.A H 2.890 2.082 ARG 55.A NE ASP 79.A OD1 ARG 55.A HE 2.918 2.138 ARG 55.A NH2 ASP 79.A OD1 ARG 55.A HH21 3.053 2.316 ASN 56.A N LEU 51.A O ASN 56.A H 2.849 2.117 TRP 57.A N PRO 54.A O TRP 57.A H 3.062 2.433 TRP 57.A NE1 GLU 46.A OE1 TRP 57.A HE1 2.912 2.081 GLN 58.A NE2 HIS 243.A NE2 GLN 58.A HE21 2.818 1.971 THR 59.A N ASN 56.A O THR 59.A H 3.226 2.380 THR 59.A OG1 ASN 56.A O THR 59.A HG1 3.417 2.785 LYS 60.A N TRP 57.A O LYS 60.A H 3.086 2.247 LYS 60.A NZ GLY 61.A O LYS 60.A HZ2 2.833 2.202 LYS 60.A NZ VAL 173.A O LYS 60.A HZ1 2.999 2.308 LYS 60.A NZ GLN 174.A O LYS 60.A HZ1 2.889 2.299 LYS 60.A NZ CYS 176.A O LYS 60.A HZ2 2.900 2.341 GLY 63.A N SER 175.A O GLY 63.A H 2.701 1.882 TYR 64.A N PHE 246.A O TYR 64.A H 2.923 2.077 TYR 64.A OH GLU 143.A OE1 TYR 64.A HH 2.756 1.927 LYS 65.A N GLU 68.A O LYS 65.A H 2.988 2.167 GLU 68.A N LYS 65.A O GLU 68.A H 2.836 1.986 GLN 70.A N GLY 63.A O GLN 70.A H 2.741 1.910 GLN 70.A NE2 GLU 68.A O GLN 70.A HE21 2.921 2.062 LYS 71.A NZ GLN 174.A OE1 LYS 71.A HZ3 3.283 2.607 GLY 72.A N GLN 174.A O GLY 72.A H 2.791 2.065 LYS 73.A N LYS 60.A O LYS 73.A H 2.928 2.078 LYS 73.A NZ THR 59.A O LYS 73.A HZ1 3.506 2.869 ASP 79.A N PRO 76.A O ASP 79.A H 2.985 2.208 TYR 80.A N MET 77.A O TYR 80.A H 3.066 2.407 GLY 81.A N MET 77.A O GLY 81.A H 3.088 2.390 GLU 85.A N SER 103.A O GLU 85.A H 2.889 2.072 GLY 90.A N ASP 87.A OD1 GLY 90.A H 3.227 2.388 ARG 91.A NH1 ARG 91.A O ARG 91.A HH11 2.957 2.197 LEU 92.A N TYR 88.A O LEU 92.A H 2.960 2.123 PHE 93.A N ALA 89.A O PHE 93.A H 2.908 2.076 GLU 94.A N GLY 90.A O GLU 94.A H 3.198 2.450 LYS 96.A N GLY 90.A O LYS 96.A H 2.873 2.025 LYS 96.A NZ ASP 87.A OD2 LYS 96.A HZ2 3.372 2.581 SER 103.A N GLU 85.A O SER 103.A H 2.918 2.113 SER 108.A OG ILE 78.A O SER 108.A HG 2.604 1.829 ASN 111.A ND2 GLU 114.A OE2 ASN 111.A HD21 2.924 2.140 TRP 112.A N ALA 109.A O TRP 112.A H 3.294 2.488 GLU 114.A N ASN 111.A O GLU 114.A H 3.134 2.324 ASP 115.A N THR 47.A OG1 ASP 115.A H 3.090 2.261 GLN 116.A N ASP 113.A O GLN 116.A H 3.150 2.327 ALA 118.A N SER 125.A O ALA 118.A H 3.048 2.223 ASN 123.A N GLU 120.A O ASN 123.A H 2.767 1.937 ASN 123.A ND2 GLU 264.A O ASN 123.A HD21 2.963 2.104 ASN 124.A ND2 GLN 116.A O ASN 124.A HD21 3.053 2.205 ASN 124.A ND2 GLY 119.A O ASN 124.A HD22 3.234 2.405 SER 125.A N ALA 118.A O SER 125.A H 2.793 2.002 PHE 127.A N ALA 48.A O PHE 127.A H 2.853 2.058 TYR 128.A OH ASP 115.A OD1 TYR 128.A HH 2.591 1.790 TYR 128.A OH ASP 115.A OD2 TYR 128.A HH 3.248 2.636 LEU 129.A N GLU 46.A O LEU 129.A H 2.816 2.032 ARG 131.A N ASN 44.A O ARG 131.A H 2.610 1.812 ARG 131.A NE GLU 46.A OE2 ARG 131.A HE 3.096 2.247 ARG 131.A NH1 TYR 178.A O ARG 131.A HH12 2.867 2.042 ARG 131.A NH2 TYR 53.A O ARG 131.A HH21 2.748 2.101 ARG 131.A NH2 TYR 178.A O ARG 131.A HH22 3.279 2.588 CYS 136.A SG THR 248.A OG1 no hydrogen 3.108 N/A THR 137.A N GLU 249.A O THR 137.A H 2.874 2.020 LYS 138.A N THR 248.A O LYS 138.A H 2.837 2.009 LYS 138.A NZ GLU 249.A OE2 LYS 138.A HZ3 2.815 1.983 GLU 143.A N PRO 139.A O GLU 143.A H 3.275 2.444 ALA 144.A N ALA 140.A O ALA 144.A H 3.079 2.291 CYS 145.A N CYS 141.A O CYS 145.A H 3.258 2.580 GLU 148.A N CYS 145.A O GLU 148.A H 3.400 2.559 TYR 151.A N VAL 160.A O TYR 151.A H 2.992 2.172 LYS 152.A NZ GLN 7.A OE1 LYS 152.A HZ1 2.890 2.093 LYS 152.A NZ CYS 136.A O LYS 152.A HZ3 3.011 2.211 LYS 152.A NZ GLY 157.A O LYS 152.A HZ2 2.795 1.948 ARG 153.A N ILE 158.A O ARG 153.A H 2.714 1.856 ARG 153.A NE ASP 156.A OD1 ARG 153.A HE 2.912 2.088 ARG 153.A NH1 GLU 201.A OE2 ARG 153.A HH12 3.132 2.406 ARG 153.A NH2 ASP 156.A OD2 ARG 153.A HH21 2.839 1.991 ARG 153.A NH2 GLU 201.A OE2 ARG 153.A HH22 2.906 2.103 GLN 155.A N GLN 155.A OE1 GLN 155.A H 2.744 1.910 GLY 157.A N ARG 153.A O GLY 157.A H 2.711 1.959 ILE 158.A N ASP 156.A OD1 ILE 158.A H 3.290 2.439 VAL 159.A N HIS 135.A ND1 VAL 159.A H 3.038 2.218 VAL 160.A N TYR 151.A O VAL 160.A H 2.832 2.006 HIS 162.A N ALA 149.A O HIS 162.A H 2.740 1.897 GLN 163.A NE2 ALA 190.A O GLN 163.A HE22 3.565 2.911 LYS 165.A N HIS 162.A O LYS 165.A H 3.163 2.574 LYS 165.A NZ GLU 148.A O LYS 165.A HZ2 3.533 2.736 CYS 166.A N HIS 162.A O CYS 166.A H 3.030 2.332 GLN 174.A N GLN 170.A O GLN 174.A H 3.106 2.332 SER 175.A N ALA 171.A O SER 175.A H 2.913 2.192 SER 175.A N CYS 172.A O SER 175.A H 3.165 2.543 SER 175.A OG GLN 70.A O SER 175.A HG 2.953 2.116 CYS 176.A N CYS 172.A O CYS 176.A H 2.845 2.035 TYR 178.A OH LEU 242.A O TYR 178.A HH 2.690 1.859 ALA 179.A N CYS 176.A O ALA 179.A H 3.350 2.506 LYS 180.A NZ TYR 41.A O LYS 180.A HZ3 3.129 2.521 LYS 180.A NZ TRP 42.A O LYS 180.A HZ2 2.784 1.982 LYS 180.A NZ ASN 44.A OD1 LYS 180.A HZ1 2.812 1.927 LYS 180.A NZ TYR 182.A OH LYS 180.A HZ3 2.965 2.164 TYR 182.A N ASN 191.A O TYR 182.A H 2.949 2.096 ASN 184.A N LYS 189.A O ASN 184.A H 2.674 1.823 ASN 184.A ND2 PRO 35.A O ASN 184.A HD21 2.790 1.942 ASN 184.A ND2 ASN 191.A OD1 ASN 184.A HD22 3.218 2.376 LEU 186.A N ASN 184.A OD1 LEU 186.A H 2.874 2.150 THR 187.A N ASN 184.A OD1 THR 187.A H 3.224 2.433 ASN 188.A N ASN 184.A O ASN 188.A H 2.844 2.152 ASN 191.A N TYR 182.A O ASN 191.A H 2.802 1.968 LYS 192.A NZ VAL 159.A O LYS 192.A HZ1 2.865 2.138 LYS 192.A NZ CYS 193.A O LYS 192.A HZ2 2.832 2.018 PHE 197.A N ILE 194.A O PHE 197.A H 3.004 2.212 ARG 199.A N CYS 196.A O ARG 199.A H 2.733 2.085 ARG 199.A NE ALA 205.A O ARG 199.A HE 2.773 1.953 ARG 199.A NH2 ALA 205.A O ARG 199.A HH21 3.100 2.409 ILE 200.A N CYS 196.A O ILE 200.A H 2.997 2.170 GLU 201.A N PHE 197.A O GLU 201.A H 2.823 1.987 GLN 202.A N ARG 199.A O GLN 202.A H 3.029 2.349 GLY 203.A N ILE 200.A O GLY 203.A H 2.938 2.093 VAL 204.A N ARG 199.A O VAL 204.A H 2.804 1.954 ALA 205.A N SER 326.A O ALA 205.A H 2.910 2.126 VAL 209.A N PRO 206.A O VAL 209.A H 2.997 2.280 ALA 210.A N PRO 206.A O ALA 210.A H 2.756 1.906 GLN 211.A N ALA 207.A O GLN 211.A H 2.991 2.173 CYS 212.A N VAL 209.A O CYS 212.A H 3.073 2.221 ARG 215.A N CYS 212.A O ARG 215.A H 3.405 2.600 ARG 215.A NH1 ILE 316.A O ARG 215.A HH12 3.465 2.851 ARG 215.A NH1 GLY 317.A O ARG 215.A HH12 2.888 2.108 ARG 215.A NH2 GLY 317.A O ARG 215.A HH22 2.989 2.246 ARG 215.A NH2 SER 320.A OG ARG 215.A HH21 2.955 2.255 HIS 218.A N VAL 11.A O HIS 218.A H 2.812 2.023 VAL 219.A N MET 323.A O VAL 219.A H 3.035 2.310 GLY 220.A N THR 9.A O GLY 220.A H 3.046 2.274 ASP 224.A N PHE 221.A O ASP 224.A H 2.888 2.050 ASN 226.A N ASP 224.A OD1 ASN 226.A H 3.065 2.281 SER 227.A N ASP 224.A O SER 227.A H 2.953 2.098 SER 227.A OG ASP 224.A O SER 227.A HG 2.771 1.987 SER 228.A OG HIS 218.A ND1 SER 228.A HG 2.813 2.225 SER 228.A OG MET 323.A O SER 228.A HG 3.133 2.662 TYR 230.A N SER 227.A OG TYR 230.A H 3.060 2.207 LYS 231.A N SER 227.A O LYS 231.A H 2.980 2.138 LEU 232.A N SER 228.A O LEU 232.A H 2.853 2.044 ILE 233.A N VAL 229.A O ILE 233.A H 2.938 2.112 LYS 234.A N TYR 230.A O LYS 234.A H 2.812 1.985 GLN 235.A N TYR 230.A O GLN 235.A H 3.225 2.441 TYR 236.A N LYS 231.A O TYR 236.A H 2.791 1.941 VAL 238.A N LEU 232.A O VAL 238.A H 2.916 2.121 LEU 240.A N TYR 254.A O LEU 240.A H 2.812 1.975 HIS 243.A N LEU 284.A O HIS 243.A H 2.741 1.891 HIS 243.A ND1 GLU 245.A OE2 HIS 243.A HD1 2.972 2.155 GLU 245.A N GLU 245.A OE1 GLU 245.A H 2.741 1.942 PHE 246.A N HIS 243.A O PHE 246.A H 3.067 2.217 GLY 247.A N PRO 244.A O GLY 247.A H 2.923 2.087 ASN 251.A N ASN 134.A O ASN 251.A H 2.849 2.010 ASN 251.A ND2 HIS 135.A O ASN 251.A HD22 2.919 2.085 ASN 251.A ND2 THR 137.A OG1 ASN 251.A HD21 2.871 2.030 PHE 253.A N TYR 10.A O PHE 253.A H 2.839 2.027 TYR 254.A N LEU 240.A O TYR 254.A H 2.679 1.913 TYR 254.A OH PRO 130.A O TYR 254.A HH 2.682 1.850 VAL 255.A N THR 12.A O VAL 255.A H 2.923 2.145 VAL 258.A N ASN 15.A OD1 VAL 258.A H 2.605 1.815 LEU 259.A N ASN 15.A OD1 LEU 259.A H 3.008 2.182 ARG 262.A NH1 THR 272.A O ARG 262.A HH11 2.959 2.134 ARG 262.A NH2 GLY 260.A O ARG 262.A HH21 3.047 2.197 ILE 263.A N ASP 273.A O ILE 263.A H 2.755 1.936 GLU 264.A N ASN 123.A OD1 GLU 264.A H 2.739 1.898 MET 265.A N GLU 269.A O MET 265.A H 2.783 1.929 GLY 268.A N MET 265.A O GLY 268.A H 2.801 1.978 GLU 269.A N ASN 267.A OD1 GLU 269.A H 3.005 2.170 SER 271.A N ILE 263.A O SER 271.A H 2.865 2.026 ASP 273.A N SER 271.A OG ASP 273.A H 2.875 2.017 LYS 275.A N PRO 261.A O LYS 275.A H 2.991 2.157 LYS 275.A NZ PRO 122.A O LYS 275.A HZ2 2.766 2.046 LYS 275.A NZ ASN 123.A OD1 LYS 275.A HZ2 3.063 2.386 LYS 275.A NZ ARG 262.A O LYS 275.A HZ3 2.824 2.036 GLN 280.A N PRO 277.A O GLN 280.A H 3.043 2.402 LEU 281.A N PRO 277.A O LEU 281.A H 3.395 2.584 GLU 282.A N LEU 278.A O GLU 282.A H 2.829 1.992 GLY 283.A N ALA 279.A O GLY 283.A H 2.997 2.216 LEU 284.A N GLN 280.A O LEU 284.A H 3.165 2.450 LEU 284.A N LEU 281.A O LEU 284.A H 3.068 2.460 PHE 285.A N LEU 281.A O PHE 285.A H 2.840 2.094 GLY 286.A N GLU 282.A O GLY 286.A H 2.861 2.054 VAL 289.A N GLY 286.A O VAL 289.A H 3.351 2.520 VAL 292.A N GLN 288.A O VAL 292.A H 3.206 2.380 LEU 293.A N VAL 289.A O LEU 293.A H 2.899 2.054 ALA 294.A N ARG 290.A O ALA 294.A H 3.040 2.233 ILE 295.A N ASP 291.A O ILE 295.A H 3.095 2.256 LEU 296.A N VAL 292.A O LEU 296.A H 2.870 2.025 GLN 297.A N LEU 293.A O GLN 297.A H 2.705 1.870 GLN 297.A NE2 GLU 301.A OE2 GLN 297.A HE21 2.635 1.854 SER 298.A N ALA 294.A O SER 298.A H 2.848 2.000 GLU 299.A N ILE 295.A O GLU 299.A H 2.915 2.095 ARG 300.A N LEU 296.A O ARG 300.A H 2.846 2.003 GLU 301.A N GLN 297.A O GLU 301.A H 2.901 2.098 LYS 302.A N SER 298.A O LYS 302.A H 3.158 2.346 LYS 303.A N GLU 299.A O LYS 303.A H 3.325 2.497 LYS 303.A NZ ASP 313.A OD1 LYS 303.A HZ1 2.687 1.851 MET 304.A N ARG 300.A O MET 304.A H 2.934 2.192 LYS 305.A N GLU 301.A O LYS 305.A H 3.108 2.373 LYS 305.A N LYS 302.A O LYS 305.A H 3.016 2.375 GLY 306.A N LYS 303.A O GLY 306.A H 3.043 2.212 LEU 307.A N LYS 302.A O LEU 307.A H 2.964 2.141 SER 309.A OG GLU 299.A OE1 SER 309.A HG 2.762 1.965 MET 312.A N SER 309.A OG MET 312.A H 3.173 2.315 ASP 313.A N SER 309.A O ASP 313.A H 3.047 2.218 VAL 314.A N ASP 310.A O VAL 314.A H 2.964 2.226 LEU 315.A N LEU 311.A O LEU 315.A H 3.153 2.349 ILE 316.A N MET 312.A O ILE 316.A H 2.823 1.994 GLY 317.A N ASP 313.A O GLY 317.A H 3.135 2.314 ARG 318.A NH1 ASP 313.A OD1 ARG 318.A HH12 2.896 2.172 ARG 319.A NH1 ARG 318.A O ARG 319.A HH11 2.862 2.107 ASP 322.A N ARG 319.A O ASP 322.A H 2.856 2.057 MET 323.A N SER 320.A O MET 323.A H 2.720 1.890 LEU 328.A N SER 326.A OG LEU 328.A H 3.224 2.372