Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ydj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 3.A N SER 25.A O GLN 3.A H 2.745 1.964 GLN 3.A NE2 GLN 1.A OE1 GLN 3.A HE21 2.736 1.907 VAL 5.A N ARG 23.A O VAL 5.A H 2.583 1.736 GLN 6.A NE2 TYR 99.A O GLN 6.A HE22 2.510 1.712 ALA 10.A N PHE 130.A O ALA 10.A H 3.250 2.470 LYS 12.A N ARG 132.A O LYS 12.A H 2.804 1.968 GLY 15.A N LEU 91C.A O GLY 15.A H 2.858 2.008 SER 16.A N SER 13.A O SER 16.A H 3.198 2.355 LEU 18.A N LEU 88.A O LEU 18.A H 3.138 2.317 ILE 20.A N LEU 86.A O ILE 20.A H 2.890 2.137 CYS 22.A N LEU 84.A O CYS 22.A H 2.620 1.916 ARG 23.A N VAL 5.A O ARG 23.A H 3.007 2.251 SER 25.A N GLN 3.A O SER 25.A H 2.967 2.186 LEU 29.A N ASP 27.A OD1 LEU 29.A H 3.298 2.479 GLY 30.A N ASP 27.A OD1 GLY 30.A H 2.746 2.095 SER 31.A N ASP 27.A OD1 SER 31.A H 3.077 2.274 SER 31.A OG ASP 27.A OD1 SER 31.A HG 3.318 2.480 SER 31.A OG ASP 27.A OD2 SER 31.A HG 3.297 2.732 PHE 32.A N ASP 27.A OD2 PHE 32.A H 3.011 2.175 HIS 33.A N GLY 30.A O HIS 33.A H 3.439 2.628 GLY 35.A N PHE 32.A O GLY 35.A H 2.753 1.927 TRP 41.A N GLY 54.A O TRP 41.A H 3.039 2.232 VAL 42.A N PHE 100.A O VAL 42.A H 2.643 1.814 ARG 43.A N GLU 51.A O ARG 43.A H 2.911 2.109 ARG 43.A NE GLU 51.A OE1 ARG 43.A HE 3.082 2.415 ARG 43.A NH1 ASP 94.A O ARG 43.A HH12 3.388 2.632 GLN 44.A N THR 98.A O GLN 44.A H 2.817 2.051 GLN 44.A NE2 GLN 48.A O GLN 44.A HE21 3.157 2.374 GLN 48.A N ALA 45.A O GLN 48.A H 2.996 2.254 GLU 51.A N ARG 43.A O GLU 51.A H 2.822 2.145 MET 53.A N TRP 41.A O MET 53.A H 3.097 2.252 GLY 55.A N THR 64.A O GLY 55.A H 2.707 1.902 ILE 56.A N MET 39D.A O ILE 56.A H 2.794 2.012 SER 59.A N GLY 35.A O SER 59.A H 2.939 2.244 THR 60.A N LEU 57.A O THR 60.A H 2.577 1.849 THR 60.A OG1 LEU 57.A O THR 60.A HG1 2.827 2.212 THR 62.A N THR 60.A O THR 62.A H 2.441 1.719 THR 64.A N GLY 55.A O THR 64.A H 2.615 1.842 ALA 66.A N MET 53.A O ALA 66.A H 2.852 2.038 LYS 68.A NZ GLU 51.A OE2 LYS 68.A HZ1 2.649 1.917 PHE 69.A N ALA 66.A O PHE 69.A H 3.237 2.506 ARG 70.A NH1 TYR 65.A O ARG 70.A HH11 3.389 2.533 ARG 72.A N PHE 69.A O ARG 72.A H 3.257 2.444 SER 74.A N ALA 87.A O SER 74.A H 3.397 2.559 ILE 75.A N TYR 65.A OH ILE 75.A H 2.766 1.922 SER 76.A N SER 85.A O SER 76.A H 3.147 2.340 VAL 83.A N PRO 78.A O VAL 83.A H 2.742 1.914 SER 85.A N SER 76.A O SER 85.A H 2.805 1.963 LEU 86.A N ILE 20.A O LEU 86.A H 2.758 1.950 ALA 87.A N SER 74.A O ALA 87.A H 2.993 2.135 LEU 88.A N LEU 18.A O LEU 88.A H 2.745 1.894 THR 92.A N ASP 95.A OD2 THR 92.A H 2.729 1.882 ASP 95.A N THR 92.A O ASP 95.A H 3.078 2.286 THR 96.A N TYR 93.A O THR 96.A H 3.135 2.296 THR 96.A OG1 TYR 93.A O THR 96.A HG1 2.770 2.091 ALA 97.A N VAL 131.A O ALA 97.A H 3.305 2.585 THR 98.A N GLN 44.A O THR 98.A H 2.907 2.061 TYR 99.A N THR 129.A O TYR 99.A H 2.948 2.119 TYR 99.A OH ASP 95.A O TYR 99.A HH 2.885 2.096 PHE 100.A N VAL 42.A O PHE 100.A H 2.650 1.879 CYS 101.A N GLN 6.A OE1 CYS 101.A H 3.371 2.562 ALA 102.A N ILE 40E.A O ALA 102.A H 3.261 2.478 ARG 103.A N LEU 124.A O ARG 103.A H 2.988 2.187 ARG 103.A NH2 ASP 123.A OD1 ARG 103.A HH21 3.560 2.759 ARG 103.A NH2 ASP 123.A OD2 ARG 103.A HH21 2.564 1.803 GLU 104.A N PHE 38C.A O GLU 104.A H 2.754 1.912 ARG 105.A N PHE 121L.A O ARG 105.A H 2.876 2.045 ARG 105.A NH1 ARG 105.A O ARG 105.A HH11 3.061 2.288 GLY 106.A N GLY 119J.A O GLY 106.A H 2.679 1.852 ARG 107.A NH1 HIS 108.A O ARG 107.A HH12 3.288 2.685 ARG 107.A NH1 LEU 117H.A O ARG 107.A HH11 2.852 2.139 HIS 108.A N LEU 117H.A O HIS 108.A H 3.308 2.502 HIS 108.A ND1 GLY 106.A O HIS 108.A HD1 2.840 1.998 ASP 123.A N ASP 123.A OD1 ASP 123.A H 2.591 1.896 TRP 125.A NE1 PHE 122M.A O TRP 125.A HE1 2.840 2.076 GLY 126.A N CYS 101.A O GLY 126.A H 2.719 1.877 GLY 128.A N GLN 6.A OE1 GLY 128.A H 2.979 2.245 THR 129.A N TYR 99.A O THR 129.A H 3.152 2.307 PHE 130.A N GLY 8.A O PHE 130.A H 2.891 2.128 VAL 131.A N ALA 97.A O VAL 131.A H 3.015 2.244 ARG 132.A N ALA 10.A O ARG 132.A H 2.871 2.091 VAL 133.A N THR 96.A OG1 VAL 133.A H 3.057 2.211 LYS 139.A N PHE 168.A O LYS 139.A H 2.760 2.017 LYS 139.A NZ ASP 166.A O LYS 139.A HZ2 3.048 2.233 SER 142.A N LYS 165.A O SER 142.A H 2.970 2.141 PHE 144.A N LEU 163.A O PHE 144.A H 2.867 2.047 LEU 146.A N GLY 161.A O LEU 146.A H 2.691 1.839 SER 149.A N ALA 159.A O SER 149.A H 2.946 2.219 SER 150.A OG THR 157.A O SER 150.A HG 2.676 1.871 THR 153.A OG1 THR 157.A O THR 153.A HG1 3.028 2.485 THR 157.A N SER 154.A O THR 157.A H 3.218 2.503 THR 157.A OG1 SER 154.A O THR 157.A HG1 2.653 1.889 ALA 158.A N VAL 206.A O ALA 158.A H 2.774 2.012 ALA 159.A N SER 149.A O ALA 159.A H 2.792 1.945 LEU 160.A N VAL 204.A O LEU 160.A H 3.071 2.243 GLY 161.A N LEU 146.A O GLY 161.A H 2.890 2.082 CYS 162.A N SER 202.A O CYS 162.A H 2.743 1.965 LEU 163.A N PHE 144.A O LEU 163.A H 2.682 1.868 VAL 164.A N LEU 200.A O VAL 164.A H 2.867 2.046 LYS 165.A N SER 142.A O LYS 165.A H 2.851 2.000 ASP 166.A N SER 199.A OG ASP 166.A H 2.989 2.141 TYR 167.A N TYR 198.A O TYR 167.A H 2.878 2.087 TYR 167.A OH GLU 170.A OE2 TYR 167.A HH 2.880 2.041 PHE 168.A N LYS 139.A O PHE 168.A H 3.021 2.223 THR 173.A N ASN 221.A O THR 173.A H 3.171 2.401 SER 175.A N ASN 219.A O SER 175.A H 3.120 2.313 ASN 177.A N ILE 217.A O ASN 177.A H 2.851 2.007 ASN 177.A ND2 THR 215.A O ASN 177.A HD22 3.312 2.651 SER 178.A N ASN 219.A OD1 SER 178.A H 2.841 2.036 GLY 179.A N TRP 176.A O GLY 179.A H 3.007 2.338 ALA 180.A N ASN 177.A O ALA 180.A H 3.137 2.294 LEU 181.A N TRP 176.A O LEU 181.A H 3.179 2.336 VAL 185.A N THR 182.A O VAL 185.A H 3.351 2.529 HIS 186.A N VAL 203.A O HIS 186.A H 2.806 1.964 PHE 188.A N SER 201.A O PHE 188.A H 2.939 2.118 VAL 191.A N SER 199.A O VAL 191.A H 2.789 1.991 GLN 193.A N LEU 197.A O GLN 193.A H 3.003 2.160 GLN 193.A NE2 ASP 166.A OD1 GLN 193.A HE22 3.437 2.800 GLY 196.A N GLN 193.A O GLY 196.A H 2.971 2.133 TYR 198.A N TYR 167.A O TYR 198.A H 2.760 1.901 SER 199.A N VAL 191.A O SER 199.A H 3.175 2.398 SER 199.A OG GLN 193.A OE1 SER 199.A HG 2.826 2.147 LEU 200.A N VAL 164.A O LEU 200.A H 2.986 2.196 SER 202.A N CYS 162.A O SER 202.A H 3.018 2.192 VAL 203.A N HIS 186.A O VAL 203.A H 2.992 2.134 VAL 204.A N LEU 160.A O VAL 204.A H 2.714 1.879 THR 205.A N GLY 184.A O THR 205.A H 2.955 2.138 VAL 206.A N ALA 158.A O VAL 206.A H 2.814 1.973 SER 208.A N GLY 156.A O SER 208.A H 3.166 2.345 SER 210.A N PRO 207.A O SER 210.A H 3.110 2.274 THR 213.A N SER 210.A O THR 213.A H 3.054 2.289 GLN 214.A N SER 210.A O GLN 214.A H 2.760 1.938 GLN 214.A NE2 THR 215.A O GLN 214.A HE21 2.752 1.893 ILE 217.A N ASN 177.A OD1 ILE 217.A H 2.959 2.111 CYS 218.A N LYS 231.A O CYS 218.A H 3.057 2.264 CYS 218.A SG LYS 231.A O no hydrogen 3.787 N/A ASN 219.A N SER 175.A O ASN 219.A H 2.798 1.970 ASN 219.A ND2 ASP 230.A OD1 ASN 219.A HD21 3.327 2.474 VAL 220.A N VAL 229.A O VAL 220.A H 2.747 1.907 ASN 221.A N THR 173.A O ASN 221.A H 3.117 2.277 HIS 222.A N THR 227.A O HIS 222.A H 2.748 1.888 HIS 222.A NE2 PRO 169.A O HIS 222.A HE2 2.730 1.885 SER 225.A N HIS 222.A O SER 225.A H 3.245 2.508 SER 225.A OG HIS 222.A O SER 225.A HG 3.415 2.757 ASN 226.A N LYS 223.A O ASN 226.A H 2.932 2.106 THR 227.A N HIS 222.A O THR 227.A H 3.090 2.238 THR 227.A OG1 SER 225.A O THR 227.A HG1 3.236 2.493 VAL 229.A N VAL 220.A O VAL 229.A H 2.778 1.952 LYS 231.A N CYS 218.A O LYS 231.A H 3.000 2.189 LYS 232.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 232.A HZ3 3.235 2.549 VAL 233.A N TYR 216.A O VAL 233.A H 2.856 2.000 GLU 110A.A N ASP 115F.A O GLU 110A.A H 2.825 1.994 LEU 91C.A N SER 16.A O LEU 91C.A H 2.922 2.079 MET 39D.A N ILE 56.A O MET 39D.A H 2.908 2.060 ASN 113D.A N GLU 110A.A OE1 ASN 113D.A H 2.667 1.841 ILE 40E.A N ALA 102.A O ILE 40E.A H 2.892 2.053 ASP 115F.A N GLU 110A.A O ASP 115F.A H 3.098 2.342 LEU 117H.A N HIS 108.A O LEU 117H.A H 2.911 2.108