Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ydj_G.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 3.A N GLN 297.A O LYS 3.A H 3.172 2.399 LEU 9.A N GLN 60.A OE1 LEU 9.A H 2.723 1.892 PHE 10.A N CYS 79.A O PHE 10.A H 3.279 2.481 CYS 11.A SG ALA 30.A O no hydrogen 3.333 N/A ALA 12.A N HIS 77.A O ALA 12.A H 2.648 1.965 SER 13.A N VAL 32.A O SER 13.A H 2.781 2.017 GLU 19.A N GLU 19.A OE1 GLU 19.A H 2.632 1.832 HIS 23.A ND1 HIS 23.A O HIS 23.A HD1 3.099 2.406 ASN 24.A N GLU 21.A O ASN 24.A H 3.400 2.573 ASN 24.A ND2 GLU 19.A OE2 ASN 24.A HD21 2.609 1.757 ALA 27.A N ASN 24.A O ALA 27.A H 3.235 2.473 THR 28.A N VAL 25.A O THR 28.A H 2.732 1.964 ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 3.322 2.533 ASN 37.A N ASP 35.A OD1 ASN 37.A H 2.726 1.907 ILE 41.A N SER 105.A O ILE 41.A H 2.971 2.339 LEU 43.A N VAL 103.A O LEU 43.A H 2.986 2.136 PHE 50.A N GLY 98.A O PHE 50.A H 2.923 2.303 MET 52.A N GLY 96.A O MET 52.A H 3.372 2.580 LYS 54.A N ASN 51.A O LYS 54.A H 3.270 2.432 ASN 55.A ND2 LEU 290.A O ASN 55.A HD21 3.467 2.901 MET 57.A N ASN 55.A OD1 MET 57.A H 3.401 2.541 VAL 58.A N ASN 55.A O VAL 58.A H 3.324 2.494 GLU 59.A N ASN 56.A O GLU 59.A H 3.128 2.486 GLN 60.A N ASN 56.A O GLN 60.A H 3.268 2.446 GLN 60.A NE2 THR 7.A O GLN 60.A HE22 2.567 1.727 GLN 60.A NE2 ASN 56.A OD1 GLN 60.A HE21 3.417 2.575 MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 3.068 2.262 GLN 62.A N VAL 58.A O GLN 62.A H 3.153 2.302 GLU 63.A N GLU 59.A O GLU 63.A H 3.132 2.273 ASP 64.A N GLN 60.A O ASP 64.A H 3.162 2.378 VAL 65.A N MET 61.A O VAL 65.A H 2.743 1.989 ILE 66.A N GLN 62.A O ILE 66.A H 2.737 1.960 TRP 69.A N VAL 65.A O TRP 69.A H 3.041 2.327 ASP 70.A N SER 67.A O ASP 70.A H 3.082 2.337 ILE 76.A N ILE 112.A O ILE 76.A H 2.816 2.096 HIS 77.A N ALA 12.A O HIS 77.A H 2.599 1.753 HIS 77.A ND1 THR 109.A O HIS 77.A HD1 2.591 1.789 TYR 78.A N THR 109.A OG1 TYR 78.A H 2.949 2.090 CYS 79.A N PHE 10.A O CYS 79.A H 3.052 2.192 THR 80.A OG1 TYR 84.A O THR 80.A HG1 2.936 2.341 TYR 84.A N PRO 81.A O TYR 84.A H 3.314 2.472 VAL 85.A N VAL 296.A O VAL 85.A H 3.136 2.334 LEU 87.A N LYS 294.A O LEU 87.A H 2.771 1.941 LYS 88.A N SER 104.A O LYS 88.A H 2.959 2.335 CYS 89.A N LYS 292.A O CYS 89.A H 3.023 2.235 ASN 90.A N ASN 102.A O ASN 90.A H 3.084 2.457 ASN 90.A ND2 ASN 102.A OD1 ASN 90.A HD21 3.610 2.791 ASN 90.A ND2 SER 104.A OG ASN 90.A HD22 3.076 2.376 ASN 93.A N ASP 91.A O ASN 93.A H 2.445 1.792 THR 97.A N ASN 95.A OD1 THR 97.A H 2.859 2.047 GLY 98.A N PHE 50.A O GLY 98.A H 3.226 2.411 CYS 100.A N GLU 48.A O CYS 100.A H 2.824 2.163 CYS 100.A SG ASP 91.A OD1 no hydrogen 3.445 N/A LYS 101.A N ASP 91.A OD2 LYS 101.A H 2.917 2.098 ASN 102.A N ASP 91.A OD1 ASN 102.A H 2.822 1.975 SER 104.A N LYS 88.A O SER 104.A H 2.964 2.214 SER 105.A N ILE 41.A O SER 105.A H 2.635 1.804 VAL 106.A N ILE 86.A O VAL 106.A H 2.968 2.175 THR 109.A N TYR 78.A O THR 109.A H 3.062 2.287 HIS 110.A N TYR 293.A OH HIS 110.A H 3.156 2.418 HIS 110.A ND1 TYR 293.A OH HIS 110.A HD1 2.856 2.007 ILE 112.A N ILE 76.A O ILE 112.A H 3.239 2.379 VAL 115.A N LYS 113.A O VAL 115.A H 2.505 1.784 THR 118.A N HIS 208.A O THR 118.A H 3.079 2.319 GLN 119.A NE2 ILE 204.A O GLN 119.A HE21 2.952 2.100 LEU 120.A N THR 118.A O LEU 120.A H 2.465 1.761 LEU 121.A N GLY 258.A O LEU 121.A H 2.923 2.104 ASN 123.A N ASN 255.A O ASN 123.A H 2.799 2.006 SER 125.A N GLU 289.A OE2 SER 125.A H 2.614 1.791 ALA 127.A N LEU 149.A O ALA 127.A H 2.770 1.950 GLU 130.A N ASN 93.A OD1 GLU 130.A H 3.313 2.517 ILE 132.A N HIS 148.A O ILE 132.A H 3.232 2.401 ARG 134.A N ILE 146.A O ARG 134.A H 3.042 2.341 ASN 137.A N SER 135.A OG ASN 137.A H 3.123 2.323 ASN 140.A N ASN 137.A O ASN 140.A H 2.986 2.306 ASN 141.A ND2 ARG 263.A O ASN 141.A HD21 3.392 2.582 LYS 143.A N ASN 140.A O LYS 143.A H 3.109 2.259 ILE 145.A N LEU 261.A O ILE 145.A H 3.162 2.383 ILE 146.A N ARG 134.A O ILE 146.A H 2.950 2.154 VAL 147.A N ILE 259.A O VAL 147.A H 2.762 1.908 HIS 148.A N ILE 132.A O HIS 148.A H 2.981 2.127 HIS 148.A NE2 SER 125.A O HIS 148.A HE2 2.571 1.738 LEU 149.A N THR 257.A O LEU 149.A H 3.217 2.424 ASN 150.A ND2 GLU 129.A O ASN 150.A HD21 2.864 2.019 SER 152.A OG ASN 255.A OD1 SER 152.A HG 3.434 2.890 VAL 153.A N ILE 256.A O VAL 153.A H 3.288 2.507 ILE 155.A N SER 254.A O ILE 155.A H 2.967 2.145 ASN 156.A N GLU 166.A O ASN 156.A H 2.741 1.884 CYS 157.A N CYS 252.A O CYS 157.A H 3.013 2.175 THR 158.A N TYR 164.A O THR 158.A H 2.810 1.954 ARG 159.A N ILE 250.A O ARG 159.A H 3.124 2.370 ARG 159.A NH2 GLU 214.A OE2 ARG 159.A HH22 2.713 2.104 TYR 164.A N THR 158.A O TYR 164.A H 3.063 2.218 CYS 165.A N LEU 240.A O CYS 165.A H 2.758 1.943 GLU 166.A N ASN 156.A O GLU 166.A H 2.651 1.822 ILE 167.A N ILE 238.A O ILE 167.A H 3.029 2.215 GLY 169.A N GLY 236.A O GLY 169.A H 2.670 1.861 THR 170.A N ASN 168.A OD1 THR 170.A H 2.969 2.363 LYS 171.A N ASN 168.A OD1 LYS 171.A H 3.283 2.499 TRP 172.A N ASN 168.A O TRP 172.A H 3.181 2.344 TRP 172.A NE1 LEU 223.A O TRP 172.A HE1 2.802 1.962 ASN 173.A N GLY 169.A O ASN 173.A H 3.156 2.354 LYS 174.A N THR 170.A O LYS 174.A H 3.408 2.616 VAL 175.A N LYS 171.A O VAL 175.A H 3.176 2.356 LEU 176.A N TRP 172.A O LEU 176.A H 2.997 2.142 LYS 177.A N ASN 173.A O LYS 177.A H 2.981 2.213 GLN 178.A N LYS 174.A O GLN 178.A H 3.384 2.573 VAL 179.A N VAL 175.A O VAL 179.A H 2.996 2.265 THR 180.A N LEU 176.A O THR 180.A H 2.954 2.115 THR 180.A OG1 LEU 176.A O THR 180.A HG1 3.367 2.612 THR 180.A OG1 LYS 177.A O THR 180.A HG1 2.418 1.879 GLU 181.A N LYS 177.A O GLU 181.A H 2.967 2.153 LYS 182.A N GLN 178.A O LYS 182.A H 3.034 2.245 LEU 183.A N VAL 179.A O LEU 183.A H 2.922 2.104 LYS 184.A N THR 180.A O LYS 184.A H 2.776 1.988 GLU 185.A N LYS 182.A O GLU 185.A H 3.336 2.538 HIS 186.A N LEU 183.A O HIS 186.A H 3.048 2.310 HIS 186.A ND1 LYS 182.A O HIS 186.A HD1 3.182 2.362 ASN 189.A N LYS 184.A O ASN 189.A H 3.090 2.349 THR 191.A N SER 271.A O THR 191.A H 3.177 2.416 ILE 193.A N GLU 273.A O ILE 193.A H 2.846 2.012 PHE 194.A N ASN 226.A OD1 PHE 194.A H 3.390 2.538 GLN 195.A N PHE 275.A O GLN 195.A H 2.949 2.164 GLN 195.A NE2 PHE 194.A O GLN 195.A HE21 3.042 2.211 GLU 203.A N GLU 203.A OE2 GLU 203.A H 2.434 1.768 ILE 204.A N ASP 201.A O ILE 204.A H 2.984 2.282 THR 205.A N ASP 201.A O THR 205.A H 3.078 2.368 THR 205.A OG1 ASP 201.A O THR 205.A HG1 3.226 2.465 HIS 207.A N CYS 218.A O HIS 207.A H 3.061 2.379 HIS 207.A ND1 THR 118.A O HIS 207.A HD1 3.090 2.258 HIS 208.A N THR 118.A OG1 HIS 208.A H 2.879 2.061 HIS 208.A ND1 PHE 216.A O HIS 208.A HD1 2.606 1.756 GLU 214.A N CYS 211.A O GLU 214.A H 3.036 2.338 PHE 216.A N PHE 209.A O PHE 216.A H 3.116 2.310 TYR 217.A N LYS 243.A O TYR 217.A H 3.127 2.480 CYS 218.A N HIS 207.A O CYS 218.A H 2.900 2.076 ASN 219.A N PRO 241.A O ASN 219.A H 2.927 2.088 THR 220.A OG1 GLN 119.A OE1 THR 220.A HG1 2.680 2.029 THR 221.A N ASN 219.A OD1 THR 221.A H 2.960 2.202 THR 221.A OG1 ASN 219.A OD1 THR 221.A HG1 2.450 1.682 GLN 222.A NE2 THR 239.A O GLN 222.A HE22 3.315 2.658 PHE 224.A N THR 221.A O PHE 224.A H 3.294 2.530 ASN 226.A ND2 PHE 194.A O ASN 226.A HD22 2.345 1.763 THR 227.A OG1 ASN 225.A OD1 THR 227.A HG1 2.371 1.747 ILE 238.A N ILE 167.A O ILE 238.A H 2.820 2.017 LEU 240.A N CYS 165.A O LEU 240.A H 2.708 1.892 CYS 242.A N ALA 163.A O CYS 242.A H 2.888 2.074 CYS 242.A SG LEU 240.A O no hydrogen 3.485 N/A ASN 251.A ND2 ASN 156.A OD1 ASN 251.A HD22 2.568 1.783 CYS 252.A N CYS 157.A O CYS 252.A H 3.078 2.251 CYS 252.A SG ASN 251.A O no hydrogen 3.083 N/A SER 254.A N ILE 155.A O SER 254.A H 3.099 2.360 ASN 255.A N ASN 123.A OD1 ASN 255.A H 3.045 2.188 ILE 256.A N VAL 153.A O ILE 256.A H 2.992 2.150 THR 257.A N LEU 121.A O THR 257.A H 3.059 2.224 ILE 259.A N VAL 147.A O ILE 259.A H 3.003 2.224 LEU 260.A N GLN 119.A O LEU 260.A H 2.783 1.926 LEU 261.A N ILE 145.A O LEU 261.A H 2.809 1.979 THR 262.A N ARG 276.A O THR 262.A H 2.821 2.025 THR 262.A OG1 GLY 278.A O THR 262.A HG1 2.896 2.203 ARG 263.A NH1 GLU 273.A OE2 ARG 263.A HH11 2.489 1.821 ARG 263.A NH2 LEU 138.A O ARG 263.A HH21 2.872 2.107 ARG 263.A NH2 THR 139.A O ARG 263.A HH22 2.955 2.384 ASP 264.A N THR 274.A O ASP 264.A H 2.989 2.169 ASN 268.A N GLY 266.A O ASN 268.A H 2.571 1.872 THR 270.A OG1 ASN 272.A OD1 THR 270.A HG1 3.453 2.990 GLU 273.A N THR 191.A O GLU 273.A H 2.636 1.928 PHE 275.A N ILE 193.A O PHE 275.A H 2.792 2.035 ARG 276.A N THR 262.A O ARG 276.A H 2.954 2.190 ARG 276.A NE ASP 264.A OD1 ARG 276.A HE 3.352 2.656 ARG 276.A NE ASP 264.A OD2 ARG 276.A HE 2.929 2.100 ARG 276.A NH1 PRO 196.A O ARG 276.A HH11 2.540 1.917 ARG 276.A NH2 ASP 264.A OD2 ARG 276.A HH21 3.256 2.545 GLY 278.A N LEU 260.A O GLY 278.A H 2.816 2.143 ASN 281.A N ASP 284.A OD2 ASN 281.A H 3.285 2.511 LYS 283.A N ASN 281.A OD1 LYS 283.A H 3.079 2.372 LYS 283.A NZ GLU 59.A OE1 LYS 283.A HZ3 3.118 2.390 ASP 284.A N ASN 281.A O ASP 284.A H 3.117 2.321 ASN 285.A N ILE 282.A O ASN 285.A H 2.960 2.217 ASN 285.A ND2 SER 117.A O ASN 285.A HD22 2.929 2.229 TRP 286.A NE1 GLN 62.A OE1 TRP 286.A HE1 2.880 2.030 ARG 287.A N LYS 283.A O ARG 287.A H 3.022 2.238 ARG 287.A NE MET 52.A O ARG 287.A HE 2.701 1.952 SER 288.A OG ASN 285.A O SER 288.A HG 2.728 1.927 GLU 289.A N TRP 286.A O GLU 289.A H 3.032 2.195 LEU 290.A N TRP 286.A O LEU 290.A H 2.949 2.138 LYS 294.A N LEU 87.A O LYS 294.A H 3.083 2.397 LYS 294.A NZ ASP 4.A OD2 LYS 294.A HZ2 3.178 2.359 LYS 294.A NZ ASN 49.A O LYS 294.A HZ3 3.148 2.287 VAL 296.A N VAL 85.A O VAL 296.A H 3.066 2.255 GLN 297.A N LYS 3.A O GLN 297.A H 2.858 2.099 ILE 298.A N GLY 83.A O ILE 298.A H 2.885 2.035