Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ydk_G.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 2.A NE1 GLU 48.A OE2 TRP 2.A HE1 2.796 2.128 LYS 3.A N GLN 340.A O LYS 3.A H 3.257 2.527 ALA 5.A N VAL 338.A O ALA 5.A H 3.286 2.474 LEU 9.A N GLN 60.A OE1 LEU 9.A H 2.998 2.176 PHE 10.A N CYS 102.A O PHE 10.A H 2.957 2.147 ALA 12.A N HIS 100.A O ALA 12.A H 2.835 2.031 SER 13.A N VAL 32.A O SER 13.A H 2.907 2.113 ALA 15.A N SER 13.A OG ALA 15.A H 3.356 2.528 LYS 16.A N ASN 24.A OD1 LYS 16.A H 2.913 2.102 LYS 16.A NZ ASP 14.A O LYS 16.A HZ2 3.138 2.358 GLU 19.A N LYS 16.A O GLU 19.A H 3.223 2.394 GLU 21.A N GLU 19.A OE2 GLU 21.A H 3.088 2.250 VAL 22.A N SER 93.A O VAL 22.A H 3.059 2.248 HIS 23.A N GLU 21.A OE2 HIS 23.A H 3.188 2.338 HIS 23.A ND1 GLU 21.A OE2 HIS 23.A HD1 2.662 1.835 ASN 24.A N GLU 21.A OE1 ASN 24.A H 2.762 1.963 ASN 24.A ND2 GLU 21.A OE1 ASN 24.A HD22 2.778 1.962 VAL 25.A N GLU 21.A O VAL 25.A H 3.045 2.268 TRP 26.A N VAL 22.A O TRP 26.A H 2.985 2.148 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 2.911 2.070 THR 28.A N ASN 24.A O THR 28.A H 2.849 2.079 HIS 29.A N TRP 26.A O HIS 29.A H 3.232 2.528 ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 2.867 2.114 CYS 31.A N ALA 27.A O CYS 31.A H 2.795 1.966 VAL 32.A N CYS 11.A O VAL 32.A H 2.938 2.128 ASN 37.A N ASP 35.A OD2 ASN 37.A H 2.940 2.135 ILE 41.A N SER 128.A O ILE 41.A H 3.317 2.527 LEU 43.A N VAL 126.A O LEU 43.A H 2.862 2.008 GLU 48.A N CYS 123.A O GLU 48.A H 3.236 2.458 PHE 50.A N GLY 121.A O PHE 50.A H 2.964 2.110 MET 52.A N GLY 119.A O MET 52.A H 2.988 2.166 TRP 53.A N ASN 51.A OD1 TRP 53.A H 3.250 2.509 LYS 54.A N ASN 51.A O LYS 54.A H 3.063 2.264 ASN 55.A ND2 LEU 333.A O ASN 55.A HD22 3.258 2.746 MET 57.A N ASN 55.A OD1 MET 57.A H 3.314 2.469 VAL 58.A N ASN 55.A O VAL 58.A H 2.920 2.105 GLN 60.A N ASN 56.A O GLN 60.A H 3.241 2.446 GLN 60.A NE2 LEU 9.A O GLN 60.A HE21 2.894 2.198 MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 3.226 2.405 GLN 62.A N VAL 58.A O GLN 62.A H 3.029 2.192 GLU 63.A N GLU 59.A O GLU 63.A H 3.112 2.300 ASP 64.A N GLN 60.A O ASP 64.A H 3.048 2.295 VAL 65.A N MET 61.A O VAL 65.A H 2.936 2.106 ILE 66.A N GLN 62.A O ILE 66.A H 2.995 2.147 SER 67.A N GLU 63.A O SER 67.A H 2.996 2.175 LEU 68.A N ASP 64.A O LEU 68.A H 2.756 1.954 TRP 69.A N VAL 65.A O TRP 69.A H 2.861 2.042 ASP 70.A N ILE 66.A O ASP 70.A H 2.882 2.090 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 3.273 2.549 GLN 71.A N LEU 68.A O GLN 71.A H 3.235 2.567 SER 72.A N TRP 69.A O SER 72.A H 3.328 2.568 LEU 73.A N TRP 69.A O LEU 73.A H 2.939 2.129 VAL 77.A N MET 285.A O VAL 77.A H 3.311 2.511 LYS 78.A N ILE 85.A O LYS 78.A H 2.681 1.840 LEU 79.A N GLN 283.A O LEU 79.A H 2.858 1.999 SER 83.A N THR 80.A O SER 83.A H 3.349 2.583 ILE 85.A N LYS 78.A O ILE 85.A H 2.806 1.955 GLN 87.A N CYS 76.A O GLN 87.A H 3.120 2.316 LYS 91.A NZ GLU 242.A OE1 LYS 91.A HZ2 3.434 2.770 LYS 91.A NZ GLU 242.A OE2 LYS 91.A HZ2 2.794 1.907 LYS 91.A NZ ALA 287.A O LYS 91.A HZ1 3.131 2.365 LYS 91.A NZ PRO 288.A O LYS 91.A HZ1 2.984 2.328 ASP 95.A N GLU 21.A OE2 ASP 95.A H 2.730 1.886 ILE 99.A N ILE 135.A O ILE 99.A H 2.809 1.965 HIS 100.A N ALA 12.A O HIS 100.A H 2.864 2.016 HIS 100.A ND1 THR 132.A O HIS 100.A HD1 2.867 2.068 TYR 101.A N THR 132.A OG1 TYR 101.A H 2.995 2.146 TYR 101.A OH ASP 64.A OD2 TYR 101.A HH 2.635 1.801 CYS 102.A N PHE 10.A O CYS 102.A H 2.736 1.939 TYR 107.A N PRO 104.A O TYR 107.A H 3.135 2.370 VAL 108.A N VAL 339.A O VAL 108.A H 3.280 2.494 ILE 109.A N VAL 129.A O ILE 109.A H 3.219 2.393 LEU 110.A N LYS 337.A O LEU 110.A H 2.921 2.102 LYS 111.A N SER 127.A O LYS 111.A H 2.692 1.836 LYS 111.A NZ TYR 336.A OH LYS 111.A HZ2 3.484 2.823 CYS 112.A N LYS 335.A O CYS 112.A H 2.747 1.907 ASN 113.A N ASN 125.A O ASN 113.A H 3.028 2.268 ASN 113.A ND2 ASN 125.A O ASN 113.A HD21 3.220 2.503 ASN 113.A ND2 SER 127.A OG ASN 113.A HD22 3.215 2.362 PHE 117.A N ASP 114.A O PHE 117.A H 3.191 2.341 THR 120.A N ASN 118.A OD1 THR 120.A H 3.022 2.162 THR 120.A OG1 ASN 118.A OD1 THR 120.A HG1 3.464 2.782 GLY 121.A N PHE 50.A O GLY 121.A H 3.035 2.340 CYS 123.A N GLU 48.A O CYS 123.A H 2.795 2.006 CYS 123.A SG ASN 125.A O no hydrogen 3.789 N/A LYS 124.A N ASP 114.A OD2 LYS 124.A H 2.957 2.145 ASN 125.A N ASP 114.A OD1 ASN 125.A H 3.057 2.214 SER 127.A N LYS 111.A O SER 127.A H 3.051 2.210 SER 128.A N ILE 41.A O SER 128.A H 3.107 2.299 VAL 129.A N ILE 109.A O VAL 129.A H 2.758 1.919 THR 132.A N TYR 101.A O THR 132.A H 2.935 2.136 HIS 133.A N TYR 336.A OH HIS 133.A H 3.224 2.402 HIS 133.A ND1 TYR 336.A OH HIS 133.A HD1 2.596 1.758 HIS 133.A NE2 GLU 332.A OE1 HIS 133.A HE2 2.796 1.979 ILE 135.A N ILE 99.A O ILE 135.A H 3.074 2.224 VAL 138.A N LYS 136.A O VAL 138.A H 2.739 2.028 THR 141.A N HIS 236.A O THR 141.A H 3.036 2.282 THR 141.A OG1 GLU 231.A O THR 141.A HG1 2.649 1.841 GLN 142.A N GLY 321.A O GLN 142.A H 2.747 2.049 GLN 142.A NE2 ILE 232.A O GLN 142.A HE21 2.969 2.121 LEU 143.A N THR 141.A O LEU 143.A H 2.582 1.881 LEU 144.A N GLY 302.A O LEU 144.A H 2.977 2.137 ASN 146.A N ASN 299.A O ASN 146.A H 2.766 1.953 GLY 147.A N THR 301.A OG1 GLY 147.A H 3.160 2.446 SER 148.A N GLU 332.A OE2 SER 148.A H 2.649 1.818 ALA 150.A N LEU 172.A O ALA 150.A H 2.854 2.057 GLU 153.A N ASN 116.A OD1 GLU 153.A H 3.404 2.557 ILE 155.A N HIS 171.A O ILE 155.A H 3.003 2.183 ARG 157.A N ILE 169.A O ARG 157.A H 2.890 2.065 ARG 157.A NH1 PHE 117.A O ARG 157.A HH12 2.922 2.116 ASN 160.A N SER 158.A OG ASN 160.A H 3.203 2.472 THR 162.A N ASN 160.A OD1 THR 162.A H 3.249 2.534 THR 162.A OG1 ASN 160.A OD1 THR 162.A HG1 2.621 1.899 ASN 163.A N ASN 160.A O ASN 163.A H 2.882 2.171 ASN 164.A ND2 ARG 307.A O ASN 164.A HD22 3.104 2.264 ALA 165.A N ASN 163.A OD1 ALA 165.A H 3.109 2.268 LYS 166.A N ASN 163.A O LYS 166.A H 3.114 2.274 LYS 166.A NZ GLU 159.A OE1 LYS 166.A HZ3 3.139 2.359 ILE 168.A N LEU 305.A O ILE 168.A H 2.863 2.034 ILE 169.A N ARG 157.A O ILE 169.A H 2.965 2.143 VAL 170.A N ILE 303.A O VAL 170.A H 2.715 1.866 HIS 171.A N ILE 155.A O HIS 171.A H 2.780 1.925 HIS 171.A NE2 SER 148.A O HIS 171.A HE2 2.764 1.965 LEU 172.A N THR 301.A O LEU 172.A H 3.103 2.273 ASN 173.A ND2 GLU 152.A O ASN 173.A HD21 2.706 1.851 VAL 176.A N ILE 300.A O VAL 176.A H 3.269 2.486 ILE 178.A N SER 298.A O ILE 178.A H 2.852 2.024 ASN 179.A N GLU 194.A O ASN 179.A H 2.846 1.999 CYS 180.A N CYS 296.A O CYS 180.A H 3.018 2.179 THR 181.A N TYR 192.A O THR 181.A H 2.756 1.961 ARG 182.A N ILE 294.A O ARG 182.A H 2.845 2.018 ARG 182.A NE ARG 182.A O ARG 182.A HE 3.037 2.309 ARG 182.A NH1 ILE 188.A O ARG 182.A HH11 2.696 1.884 ARG 182.A NH2 ILE 290.A O ARG 182.A HH22 2.788 2.085 ARG 182.A NH2 GLY 292.A O ARG 182.A HH21 2.734 1.879 ARG 189.A N ASP 187.A OD1 ARG 189.A H 2.915 2.061 LYS 190.A N ASP 187.A O LYS 190.A H 3.153 2.337 ALA 191.A N CYS 269.A O ALA 191.A H 3.019 2.165 TYR 192.A N THR 181.A O TYR 192.A H 2.976 2.208 CYS 193.A N LEU 267.A O CYS 193.A H 2.891 2.085 GLU 194.A N ASN 179.A O GLU 194.A H 2.787 1.959 ILE 195.A N ILE 265.A O ILE 195.A H 2.886 2.075 GLY 197.A N GLY 263.A O GLY 197.A H 2.974 2.307 THR 198.A N ASN 196.A OD1 THR 198.A H 2.945 2.222 LYS 199.A N ASN 196.A OD1 LYS 199.A H 3.367 2.568 TRP 200.A N ASN 196.A O TRP 200.A H 2.950 2.104 TRP 200.A NE1 LEU 251.A O TRP 200.A HE1 2.650 1.797 ASN 201.A N GLY 197.A O ASN 201.A H 3.080 2.235 LYS 202.A N THR 198.A O LYS 202.A H 3.310 2.478 VAL 203.A N LYS 199.A O VAL 203.A H 3.173 2.362 LEU 204.A N TRP 200.A O LEU 204.A H 2.746 1.931 LYS 205.A N ASN 201.A O LYS 205.A H 2.832 2.071 GLN 206.A N LYS 202.A O GLN 206.A H 3.063 2.286 VAL 207.A N VAL 203.A O VAL 207.A H 2.825 2.018 THR 208.A N LEU 204.A O THR 208.A H 2.947 2.140 GLU 209.A N LYS 205.A O GLU 209.A H 2.957 2.123 LYS 210.A N GLN 206.A O LYS 210.A H 2.962 2.178 LYS 210.A NZ GLU 153.A OE1 LYS 210.A HZ3 3.006 2.201 LYS 210.A NZ ILE 154.A O LYS 210.A HZ1 2.580 1.878 LEU 211.A N VAL 207.A O LEU 211.A H 2.899 2.119 LYS 212.A N THR 208.A O LYS 212.A H 2.987 2.279 GLU 213.A N LYS 210.A O GLU 213.A H 3.243 2.568 HIS 214.A N LEU 211.A O HIS 214.A H 3.194 2.529 PHE 215.A N LEU 211.A O PHE 215.A H 3.050 2.414 ASN 217.A N LYS 212.A O ASN 217.A H 2.968 2.114 LYS 218.A N PHE 215.A O LYS 218.A H 2.973 2.121 LYS 218.A NZ THR 313.A O LYS 218.A HZ2 2.692 2.100 LYS 218.A NZ ASN 315.A O LYS 218.A HZ3 3.521 2.969 LYS 218.A NZ GLU 316.A OE2 LYS 218.A HZ3 3.504 2.677 ILE 221.A N GLU 316.A O ILE 221.A H 2.922 2.069 PHE 222.A N ASN 254.A OD1 PHE 222.A H 2.666 1.811 GLN 223.A N PHE 318.A O GLN 223.A H 2.930 2.112 GLN 223.A NE2 PHE 222.A O GLN 223.A HE21 2.575 1.945 GLU 231.A N GLU 231.A OE1 GLU 231.A H 2.812 2.074 ILE 232.A N ASP 229.A O ILE 232.A H 3.108 2.269 THR 233.A N ASP 229.A O THR 233.A H 3.058 2.245 MET 234.A N LEU 230.A O MET 234.A H 2.926 2.150 HIS 235.A N CYS 246.A O HIS 235.A H 2.683 1.864 HIS 235.A ND1 THR 141.A O HIS 235.A HD1 2.858 2.049 HIS 236.A N THR 141.A OG1 HIS 236.A H 2.950 2.109 HIS 236.A ND1 PHE 244.A O HIS 236.A HD1 3.054 2.273 PHE 237.A N PHE 244.A O PHE 237.A H 3.238 2.422 CYS 239.A N GLU 242.A O CYS 239.A H 2.792 1.990 ARG 240.A NE ASN 295.A O ARG 240.A HE 3.128 2.299 ARG 240.A NH2 ASN 295.A O ARG 240.A HH21 3.362 2.617 GLY 241.A N ASN 238.A OD1 GLY 241.A H 2.874 2.225 GLU 242.A N CYS 239.A O GLU 242.A H 3.010 2.184 PHE 244.A N PHE 237.A O PHE 244.A H 2.731 1.905 TYR 245.A N LYS 270.A O TYR 245.A H 2.870 2.142 TYR 245.A OH GLU 231.A OE2 TYR 245.A HH 2.624 1.815 CYS 246.A N HIS 235.A O CYS 246.A H 2.972 2.139 ASN 247.A N PRO 268.A O ASN 247.A H 3.006 2.152 THR 249.A N ASN 247.A OD1 THR 249.A H 2.929 2.108 THR 249.A OG1 ASN 247.A OD1 THR 249.A HG1 2.746 2.029 GLN 250.A NE2 THR 266.A O GLN 250.A HE21 2.961 2.169 LEU 251.A N THR 248.A O LEU 251.A H 3.124 2.404 ASN 254.A ND2 PHE 222.A O no hydrogen 2.768 N/A THR 255.A OG1 ASN 253.A OD1 no hydrogen 2.586 N/A CYS 256.A N ASN 253.A O no hydrogen 3.094 N/A ILE 257.A N ASN 254.A O no hydrogen 3.066 N/A LYS 259.A NZ GLY 260.A O no hydrogen 3.009 N/A CYS 261.A N LYS 259.A O CYS 261.A H 2.802 2.171 CYS 261.A SG LYS 259.A O no hydrogen 3.619 N/A ILE 265.A N ILE 195.A O ILE 265.A H 2.870 2.080 LEU 267.A N CYS 193.A O LEU 267.A H 2.731 1.935 CYS 269.A N ALA 191.A O CYS 269.A H 2.833 2.012 CYS 269.A SG LEU 267.A O no hydrogen 3.831 N/A LYS 270.A N TYR 245.A O LYS 270.A H 2.907 2.150 ILE 271.A N ARG 189.A O ILE 271.A H 2.894 2.071 LYS 272.A N PHE 243.A O LYS 272.A H 3.162 2.376 GLN 273.A NE2 TYR 286.A O GLN 273.A HE21 2.880 2.038 ILE 275.A N ALA 284.A O ILE 275.A H 2.889 2.071 ASN 276.A N GLU 231.A OE2 ASN 276.A H 2.866 2.007 ASN 276.A ND2 GLU 231.A OE1 ASN 276.A HD22 2.913 2.081 MET 277.A N GLY 282.A O MET 277.A H 3.070 2.212 GLN 279.A N GLN 279.A OE1 GLN 279.A H 2.706 1.919 GLY 280.A N MET 277.A O GLY 280.A H 2.879 2.038 GLN 283.A N LEU 79.A O GLN 283.A H 3.010 2.223 ALA 284.A N ILE 275.A O ALA 284.A H 2.819 2.000 MET 285.A N VAL 77.A O MET 285.A H 2.799 2.013 TYR 286.A N GLN 273.A O TYR 286.A H 2.727 1.930 ILE 290.A N GLU 242.A OE2 ILE 290.A H 3.411 2.623 ILE 294.A N ARG 182.A O ILE 294.A H 3.102 2.268 ASN 295.A ND2 ASN 179.A OD1 ASN 295.A HD22 2.872 2.092 ASN 295.A ND2 THR 181.A OG1 ASN 295.A HD21 2.908 2.193 CYS 296.A N CYS 180.A O CYS 296.A H 3.085 2.269 SER 298.A N ILE 178.A O SER 298.A H 3.042 2.214 ASN 299.A N ASN 146.A OD1 ASN 299.A H 3.141 2.325 ILE 300.A N VAL 176.A O ILE 300.A H 2.834 1.990 THR 301.A N LEU 144.A O THR 301.A H 2.906 2.064 GLY 302.A N LEU 144.A O GLY 302.A H 3.275 2.555 ILE 303.A N VAL 170.A O ILE 303.A H 2.881 2.112 LEU 304.A N GLN 142.A O LEU 304.A H 2.914 2.055 LEU 305.A N ILE 168.A O LEU 305.A H 2.814 1.981 THR 306.A N ARG 319.A O THR 306.A H 2.853 2.029 ARG 307.A NH1 GLU 316.A OE1 ARG 307.A HH11 3.166 2.321 ARG 307.A NH2 LEU 161.A O ARG 307.A HH21 3.080 2.437 ARG 307.A NH2 THR 162.A O ARG 307.A HH22 3.086 2.535 ASP 308.A N THR 317.A O ASP 308.A H 2.965 2.126 ASN 315.A N THR 313.A OG1 ASN 315.A H 3.247 2.409 GLU 316.A N THR 219.A O GLU 316.A H 2.857 2.025 PHE 318.A N ILE 221.A O PHE 318.A H 2.836 2.019 ARG 319.A N THR 306.A O ARG 319.A H 2.939 2.130 ARG 319.A NE ASP 308.A OD1 ARG 319.A HE 3.262 2.622 ARG 319.A NE ASP 308.A OD2 ARG 319.A HE 2.766 1.926 ARG 319.A NH1 PRO 224.A O ARG 319.A HH11 2.948 2.151 ARG 319.A NH2 ASP 308.A OD1 ARG 319.A HH21 2.670 1.870 GLY 321.A N LEU 304.A O GLY 321.A H 2.723 1.911 LYS 326.A N ASN 324.A OD1 LYS 326.A H 3.173 2.387 LYS 326.A NZ GLU 59.A OE1 LYS 326.A HZ2 3.243 2.389 ASP 327.A N ASN 324.A O ASP 327.A H 2.992 2.189 ASN 328.A N ILE 325.A O ASN 328.A H 2.986 2.323 ASN 328.A ND2 VAL 138.A O ASN 328.A HD21 3.529 2.773 ASN 328.A ND2 SER 140.A O ASN 328.A HD22 3.009 2.191 TRP 329.A NE1 GLN 62.A OE1 TRP 329.A HE1 2.819 2.108 ARG 330.A N LYS 326.A O ARG 330.A H 2.977 2.225 ARG 330.A NH1 ASP 327.A OD1 ARG 330.A HH11 2.727 2.120 SER 331.A N ASP 327.A O SER 331.A H 3.114 2.407 GLU 332.A N TRP 329.A O GLU 332.A H 3.153 2.322 LEU 333.A N TRP 329.A O LEU 333.A H 2.903 2.112 TYR 336.A N LEU 333.A O TYR 336.A H 3.198 2.345 LYS 337.A N LEU 110.A O LYS 337.A H 3.133 2.411 LYS 337.A NZ ASP 4.A OD1 LYS 337.A HZ3 2.992 2.115 LYS 337.A NZ GLU 48.A OE1 LYS 337.A HZ2 2.923 2.076 LYS 337.A NZ ASN 49.A O LYS 337.A HZ1 2.619 1.752 VAL 339.A N VAL 108.A O VAL 339.A H 3.132 2.299 GLN 340.A N LYS 3.A O GLN 340.A H 2.902 2.092 ILE 341.A N GLY 106.A O ILE 341.A H 3.192 2.341