Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yhd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 6.A N THR 18.A O GLY 6.A H 2.929 2.143 THR 8.A N VAL 16.A O THR 8.A H 3.218 2.419 ILE 10.A N THR 14.A O ILE 10.A H 3.015 2.250 THR 14.A OG1 GLY 11.A O THR 14.A HG1 3.332 2.775 THR 14.A OG1 SER 12.A O THR 14.A HG1 3.264 2.487 THR 15.A N ASP 40.A O THR 15.A H 3.081 2.251 VAL 16.A N THR 8.A O VAL 16.A H 2.902 2.079 LYS 17.A N PHE 38.A O LYS 17.A H 3.002 2.205 LYS 17.A NZ LYS 275.A O LYS 17.A HZ2 2.955 2.402 LYS 17.A NZ GLU 276.A O LYS 17.A HZ2 3.182 2.350 THR 18.A N GLY 6.A O THR 18.A H 2.675 1.838 GLY 19.A N TYR 36.A O GLY 19.A H 2.950 2.148 LEU 21.A N VAL 34.A O LEU 21.A H 2.794 2.078 THR 23.A N LYS 32.A O THR 23.A H 3.266 2.479 ASP 25.A N MET 30.A O ASP 25.A H 2.620 1.767 ASN 28.A N ASP 25.A O ASN 28.A H 3.242 2.589 ASN 28.A N ASP 25.A OD1 ASN 28.A H 3.053 2.300 ASN 28.A ND2 ASP 25.A OD2 ASN 28.A HD22 3.069 2.259 ASN 28.A ND2 ARG 264.A O ASN 28.A HD21 3.621 3.149 MET 30.A N ASP 25.A O MET 30.A H 2.886 2.036 ALA 31.A N THR 56.A O ALA 31.A H 2.986 2.237 LYS 32.A N THR 23.A O LYS 32.A H 2.961 2.128 LYS 32.A NZ SER 265.A OG LYS 32.A HZ2 2.758 2.027 LYS 32.A NZ GLU 267.A OE2 LYS 32.A HZ3 3.557 2.698 LYS 33.A N LYS 54.A O LYS 33.A H 3.198 2.493 VAL 34.A N LEU 21.A O VAL 34.A H 2.897 2.061 PHE 35.A N ARG 52.A O PHE 35.A H 2.838 2.023 TYR 36.A N GLY 19.A O TYR 36.A H 2.887 2.079 SER 37.A N VAL 50.A O SER 37.A H 2.802 2.064 SER 37.A OG THR 18.A OG1 SER 37.A HG 2.876 2.069 PHE 38.A N LYS 17.A O PHE 38.A H 2.697 1.874 ILE 39.A N LEU 48.A O ILE 39.A H 2.685 1.952 ASP 40.A N THR 15.A O ASP 40.A H 2.904 2.087 LYS 42.A N ASN 13.A O LYS 42.A H 3.110 2.273 LYS 42.A NZ ASP 40.A OD2 LYS 42.A HZ1 3.099 2.418 ASN 43.A N ASP 41.A OD1 ASN 43.A H 2.703 1.886 HIS 44.A N ASP 41.A O HIS 44.A H 2.912 2.057 HIS 44.A ND1 LYS 46.A O HIS 44.A HD1 3.127 2.282 LYS 47.A N MET 221.A O LYS 47.A H 2.950 2.185 LYS 47.A NZ TRP 273.A O LYS 47.A HZ2 2.648 2.025 LYS 47.A NZ GLU 276.A OE1 LYS 47.A HZ3 2.674 1.895 LEU 48.A N ILE 39.A O LEU 48.A H 2.957 2.120 LEU 49.A N ILE 219.A O LEU 49.A H 2.934 2.190 VAL 50.A N SER 37.A O VAL 50.A H 2.816 1.979 ILE 51.A N THR 217.A O ILE 51.A H 2.786 1.935 ARG 52.A N PHE 35.A O ARG 52.A H 2.641 1.844 ARG 52.A NE ASP 214.A OD1 ARG 52.A HE 2.755 1.985 ARG 52.A NH2 ASP 214.A OD1 ARG 52.A HH21 3.508 2.941 ARG 52.A NH2 ASP 214.A OD2 ARG 52.A HH21 2.531 1.691 THR 53.A N PHE 215.A O THR 53.A H 2.735 1.918 LYS 54.A N LYS 33.A O LYS 54.A H 2.715 1.899 THR 56.A N ALA 31.A O THR 56.A H 2.737 1.942 ILE 57.A N PHE 211.A O ILE 57.A H 2.794 1.938 ALA 58.A N GLY 29.A O ALA 58.A H 3.093 2.242 GLY 59.A N SER 209.A O GLY 59.A H 2.906 2.057 TYR 61.A OH LEU 198.A O TYR 61.A HH 3.007 2.348 ARG 62.A N ALA 75.A O ARG 62.A H 3.116 2.310 TYR 64.A OH ASP 242.A OD1 TYR 64.A HH 2.583 1.799 GLU 67.A N LYS 71.A O GLU 67.A H 2.961 2.122 SER 72.A N LEU 245.A O SER 72.A H 3.147 2.365 SER 72.A OG SER 65.A O SER 72.A HG 2.613 1.833 ALA 75.A N ARG 62.A O ALA 75.A H 3.005 2.182 TRP 76.A N ASP 241.A O TRP 76.A H 3.265 2.454 TRP 76.A NE1 ASN 256.A OD1 TRP 76.A HE1 3.000 2.193 SER 78.A N VAL 239.A O SER 78.A H 2.738 1.970 SER 78.A OG ASP 241.A OD1 SER 78.A HG 2.650 2.009 ALA 79.A N VAL 239.A O ALA 79.A H 3.194 2.450 PHE 80.A N VAL 156.A O PHE 80.A H 2.920 2.101 LYS 81.A N GLU 237.A O LYS 81.A H 2.832 1.983 VAL 82.A N TRP 154.A O VAL 82.A H 3.108 2.368 GLN 83.A N ILE 235.A O GLN 83.A H 2.821 2.034 LEU 84.A N VAL 152.A O LEU 84.A H 2.902 2.064 GLN 85.A N ASP 233.A O GLN 85.A H 2.887 2.107 LEU 86.A N LYS 150.A O LEU 86.A H 2.645 1.791 GLU 90.A N PRO 87.A O GLU 90.A H 3.372 2.525 GLN 93.A N THR 220.A O GLN 93.A H 3.120 2.292 ILE 94.A N ASP 149.A O ILE 94.A H 2.733 1.909 SER 95.A N VAL 218.A O SER 95.A H 2.967 2.253 TYR 97.A N ASP 96.A OD1 TYR 97.A H 2.669 2.055 TYR 98.A N ALA 216.A O TYR 98.A H 2.817 2.000 ILE 103.A N THR 142.A O ILE 103.A H 3.201 2.422 TYR 108.A N TYR 135.A O TYR 108.A H 2.913 2.068 SER 110.A N LEU 133.A O SER 110.A H 2.970 2.176 THR 111.A N ASP 123.A O THR 111.A H 3.005 2.147 THR 111.A OG1 THR 132.A OG1 THR 111.A HG1 3.357 2.540 LEU 112.A N HIS 131.A O LEU 112.A H 3.054 2.220 THR 113.A N THR 121.A O THR 113.A H 3.074 2.278 TYR 114.A N VAL 127.A O TYR 114.A H 2.829 1.988 TYR 114.A OH ASP 41.A OD2 TYR 114.A HH 2.714 1.907 GLY 115.A N ASN 119.A O GLY 115.A H 3.187 2.341 GLY 118.A N TYR 114.A OH GLY 118.A H 3.222 2.582 THR 121.A N THR 113.A O THR 121.A H 3.053 2.257 ASP 123.A N THR 111.A O ASP 123.A H 3.199 2.365 ILE 129.A N LEU 112.A O ILE 129.A H 3.206 2.428 HIS 131.A N ILE 129.A O HIS 131.A H 2.838 2.174 HIS 131.A NE2 SER 37.A OG HIS 131.A HE2 2.528 1.675 LEU 133.A N SER 110.A O LEU 133.A H 2.601 1.912 LYS 134.A N ASP 214.A OD2 LYS 134.A H 3.414 2.589 TYR 135.A N TYR 108.A O TYR 135.A H 3.110 2.323 TYR 135.A OH THR 142.A OG1 TYR 135.A HH 2.462 1.719 GLN 137.A N LYS 106.A O GLN 137.A H 2.707 1.908 GLN 137.A NE2 ILE 103.A O GLN 137.A HE22 2.796 2.017 GLN 137.A NE2 THR 105.A O GLN 137.A HE21 2.649 1.796 PHE 140.A N GLN 137.A O PHE 140.A H 2.973 2.186 LYS 141.A N ILE 157.A O LYS 141.A H 2.804 1.985 THR 142.A N ILE 103.A O THR 142.A H 3.032 2.196 THR 142.A OG1 GLN 137.A OE1 THR 142.A HG1 2.401 1.817 ILE 143.A N LYS 155.A O ILE 143.A H 2.873 2.171 GLU 145.A N GLY 153.A O GLU 145.A H 2.964 2.276 THR 148.A N LYS 151.A O THR 148.A H 2.956 2.109 ASP 149.A N ASP 149.A OD1 ASP 149.A H 2.585 1.894 LYS 150.A N THR 148.A OG1 LYS 150.A H 3.182 2.335 LYS 150.A NZ ALA 92.A O LYS 150.A HZ1 3.161 2.335 LYS 151.A N THR 148.A OG1 LYS 151.A H 3.189 2.509 VAL 152.A N LEU 84.A O VAL 152.A H 3.064 2.281 TRP 154.A N VAL 82.A O TRP 154.A H 2.826 2.025 TRP 154.A NE1 PRO 99.A O TRP 154.A HE1 3.117 2.265 LYS 155.A N ILE 143.A O LYS 155.A H 2.873 2.171 VAL 156.A N PHE 80.A O VAL 156.A H 2.728 1.873 ILE 157.A N LYS 141.A O ILE 157.A H 2.791 2.105 PHE 158.A N SER 78.A O PHE 158.A H 2.985 2.148 ASN 159.A N ASP 139.A O ASN 159.A H 2.946 2.089 MET 161.A N TYR 169.A O MET 161.A H 3.024 2.404 ASN 163.A ND2 MET 184.A O ASN 163.A HD21 2.910 2.055 GLN 164.A NE2 MET 184.A O GLN 164.A HE21 3.557 3.061 GLN 164.A NE2 LYS 185.A O GLN 164.A HE22 2.251 1.599 TRP 166.A N ASN 163.A O TRP 166.A H 2.828 1.984 TYR 169.A N MET 161.A O TYR 169.A H 2.802 1.996 ASP 170.A N SER 173.A OG ASP 170.A H 2.826 2.022 ARG 171.A NH1 ASP 241.A OD2 ARG 171.A HH11 2.531 1.820 ARG 171.A NH1 ASP 259.A OD1 ARG 171.A HH12 3.002 2.151 ASP 172.A N ASP 170.A OD1 ASP 172.A H 3.004 2.236 SER 173.A N ASP 170.A O SER 173.A H 3.353 2.493 VAL 177.A N ASN 175.A OD1 VAL 177.A H 2.652 1.843 TYR 178.A N ASN 175.A OD1 TYR 178.A H 2.839 2.029 GLY 179.A N ASN 175.A O GLY 179.A H 2.712 1.931 ASN 180.A N GLY 254.A O ASN 180.A H 3.091 2.274 ASN 180.A ND2 ASP 170.A O ASN 180.A HD21 3.198 2.385 LEU 182.A N ASN 180.A OD1 LEU 182.A H 3.050 2.276 MET 184.A N GLN 181.A O MET 184.A H 3.311 2.542 LYS 185.A N ASN 196.A O LYS 185.A H 2.978 2.134 LYS 185.A NZ GLU 195.A O LYS 185.A HZ1 2.063 1.264 THR 186.A N ASN 196.A OD1 THR 186.A H 2.867 2.114 THR 186.A OG1 ASN 196.A OD1 THR 186.A HG1 2.579 1.758 ARG 187.A NE GLN 181.A OE1 ARG 187.A HE 3.087 2.426 ARG 187.A NH2 GLN 181.A OE1 ARG 187.A HH21 2.774 2.041 GLY 189.A N THR 186.A OG1 GLY 189.A H 3.198 2.514 ALA 193.A N ALA 69.A O ALA 193.A H 3.054 2.323 GLU 195.A N LYS 192.A O GLU 195.A H 2.750 1.933 ASN 196.A N ALA 193.A O ASN 196.A H 2.931 2.080 ASN 196.A ND2 THR 186.A O ASN 196.A HD21 3.111 2.286 LEU 198.A N PHE 183.A O LEU 198.A H 2.719 1.893 ASN 201.A N ASP 199.A OD1 ASN 201.A H 2.779 1.927 LYS 202.A N ASP 199.A O LYS 202.A H 2.946 2.125 ALA 203.A N PRO 200.A O ALA 203.A H 3.219 2.540 LEU 206.A N SER 204.A OG LEU 206.A H 3.250 2.404 LEU 207.A N SER 204.A O LEU 207.A H 2.983 2.251 SER 208.A N SER 204.A O SER 208.A H 3.262 2.435 SER 209.A N SER 205.A O SER 209.A H 3.075 2.444 GLY 210.A N SER 205.A O GLY 210.A H 2.798 2.071 PHE 211.A N ILE 57.A O PHE 211.A H 2.874 2.088 PHE 215.A N THR 53.A O PHE 215.A H 3.140 2.327 ALA 216.A N TYR 98.A O ALA 216.A H 3.005 2.193 THR 217.A N ILE 51.A O THR 217.A H 3.111 2.305 VAL 218.A N ASP 96.A O VAL 218.A H 2.752 1.897 ILE 219.A N LEU 49.A O ILE 219.A H 2.769 1.962 THR 220.A N GLN 93.A O THR 220.A H 2.811 2.007 MET 221.A N LYS 47.A O MET 221.A H 3.052 2.289 ARG 223.A N ASN 45.A O ARG 223.A H 3.342 2.534 ARG 223.A NH1 ASP 41.A O ARG 223.A HH12 2.848 2.248 ARG 223.A NH1 HIS 44.A O ARG 223.A HH11 2.476 1.888 GLN 228.A NE2 ASP 222.A O GLN 228.A HE22 3.428 2.617 THR 230.A N ILE 271.A O THR 230.A H 2.791 2.004 ASN 231.A N GLU 90.A OE2 ASN 231.A H 3.181 2.323 ILE 232.A N TYR 269.A O ILE 232.A H 3.056 2.301 ASP 233.A N GLN 85.A O ASP 233.A H 2.955 2.108 VAL 234.A N GLU 267.A O VAL 234.A H 2.977 2.128 ILE 235.A N GLN 83.A O ILE 235.A H 2.740 1.896 TYR 236.A N SER 265.A O TYR 236.A H 2.974 2.279 TYR 236.A OH LYS 54.A O TYR 236.A HH 2.512 1.733 GLU 237.A N LYS 81.A O GLU 237.A H 2.845 2.238 ARG 238.A N ASP 263.A O ARG 238.A H 3.009 2.174 ARG 238.A NE ASP 263.A OD2 ARG 238.A HE 3.126 2.280 ARG 238.A NH1 ALA 58.A O ARG 238.A HH11 2.470 1.749 ARG 238.A NH2 ASN 28.A O ARG 238.A HH22 2.404 1.731 ARG 238.A NH2 ASP 263.A OD2 ARG 238.A HH21 3.507 2.783 VAL 239.A N ALA 79.A O VAL 239.A H 2.884 2.033 ARG 240.A N TRP 261.A O ARG 240.A H 2.796 1.940 ARG 240.A NE ASP 263.A OD2 ARG 240.A HE 3.155 2.545 ARG 240.A NH2 ASP 263.A OD1 ARG 240.A HH21 3.242 2.565 ASP 241.A N TRP 76.A O ASP 241.A H 2.905 2.175 ASP 242.A N THR 257.A O ASP 242.A H 3.118 2.284 TYR 243.A N LEU 74.A O TYR 243.A H 2.709 1.870 TYR 243.A OH ASN 180.A O TYR 243.A HH 2.654 1.854 GLN 244.A N THR 255.A O GLN 244.A H 2.848 2.094 GLN 244.A NE2 ASP 242.A OD2 GLN 244.A HE21 2.654 1.914 LEU 245.A N SER 72.A O LEU 245.A H 2.950 2.201 HIS 246.A N LYS 253.A O HIS 246.A H 2.934 2.085 TRP 247.A N ASN 70.A O TRP 247.A H 2.743 1.912 THR 248.A N ASN 251.A O THR 248.A H 2.842 2.142 THR 248.A OG1 ASN 251.A O THR 248.A HG1 2.462 1.798 THR 250.A OG1 ASN 251.A OD1 THR 250.A HG1 2.582 1.916 ASN 251.A N THR 248.A OG1 ASN 251.A H 3.112 2.296 ASN 251.A ND2 VAL 177.A O ASN 251.A HD21 3.250 2.418 ASN 251.A ND2 TRP 252.A O ASN 251.A HD22 2.813 2.077 TRP 252.A N ARG 187.A O TRP 252.A H 2.935 2.079 TRP 252.A NE1 GLY 189.A O TRP 252.A HE1 3.163 2.411 LYS 253.A N HIS 246.A O LYS 253.A H 3.073 2.357 GLY 254.A N TYR 178.A O GLY 254.A H 2.940 2.095 THR 255.A N GLN 244.A O THR 255.A H 2.898 2.120 ASN 256.A ND2 ASP 241.A OD2 ASN 256.A HD21 3.474 2.663 THR 257.A N ASP 242.A O THR 257.A H 3.089 2.296 THR 257.A OG1 ASP 242.A O THR 257.A HG1 3.299 2.603 LYS 258.A NZ ASP 172.A OD1 LYS 258.A HZ1 3.544 2.710 LYS 258.A NZ ASP 172.A OD2 LYS 258.A HZ1 2.712 1.947 ASP 259.A N ASP 241.A OD1 ASP 259.A H 2.783 1.930 TRP 261.A N ARG 240.A O TRP 261.A H 3.124 2.272 ASP 263.A N ARG 238.A O ASP 263.A H 2.900 2.121 SER 265.A N TYR 236.A O SER 265.A H 2.829 1.980 SER 265.A OG ASP 25.A OD2 SER 265.A HG 2.561 1.915 GLU 267.A N VAL 234.A O GLU 267.A H 3.146 2.319 TYR 269.A N ILE 232.A O TYR 269.A H 2.986 2.179 LYS 270.A N THR 279.A O LYS 270.A H 2.949 2.209 ILE 271.A N THR 230.A O ILE 271.A H 2.582 1.728 ASP 272.A N GLU 277.A O ASP 272.A H 3.025 2.175 TRP 273.A N GLN 228.A O TRP 273.A H 3.283 2.433 GLU 274.A N ASP 272.A OD1 GLU 274.A H 3.074 2.417 LYS 275.A N ASP 272.A OD1 LYS 275.A H 3.093 2.244 GLU 277.A N ASP 272.A O GLU 277.A H 2.985 2.218 THR 279.A N LYS 270.A O THR 279.A H 3.232 2.440 ASN 280.A ND2 GLU 267.A OE1 ASN 280.A HD22 2.928 2.117 LEU 281.A N ARG 268.A O LEU 281.A H 3.157 2.363