Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yhf_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 5.A NE1 ASN 61.A OD1 TRP 5.A HE1 2.680 1.842 GLU 6.A N GLY 3.A O GLU 6.A H 3.006 2.186 ILE 7.A N VAL 73.A O ILE 7.A H 2.803 1.966 LYS 10.A N ASP 8.A OD1 LYS 10.A H 3.059 2.217 ASP 11.A N ASP 8.A O ASP 11.A H 2.711 1.889 LEU 12.A N PRO 9.A O LEU 12.A H 3.081 2.257 THR 13.A N LYS 30.A O THR 13.A H 3.058 2.281 LEU 15.A N TYR 28.A O LEU 15.A H 2.942 2.086 LYS 16.A N TYR 28.A O LYS 16.A H 3.270 2.454 LEU 18.A N VAL 26.A O LEU 18.A H 2.999 2.248 VAL 25.A N MET 41.A O VAL 25.A H 3.135 2.528 VAL 26.A N GLY 19.A O VAL 26.A H 2.844 2.042 LYS 27.A N ILE 39.A O LYS 27.A H 2.827 2.015 TYR 28.A N LYS 16.A O TYR 28.A H 2.760 1.945 GLY 29.A N VAL 37.A O GLY 29.A H 2.868 2.091 LYS 30.A N THR 13.A O LYS 30.A H 3.272 2.593 LYS 30.A N THR 13.A OG1 LYS 30.A H 3.129 2.343 LYS 30.A NZ ASP 36.A OD1 LYS 30.A HZ2 2.531 1.646 TRP 31.A N TYR 35.A O TRP 31.A H 2.837 2.037 ARG 32.A N ASP 11.A O ARG 32.A H 2.921 2.075 TYR 35.A N TRP 31.A O TYR 35.A H 3.219 2.397 VAL 37.A N GLY 29.A O VAL 37.A H 2.842 2.009 ALA 38.A N THR 84.A O ALA 38.A H 2.993 2.202 ILE 39.A N LYS 27.A O ILE 39.A H 2.654 1.825 LYS 40.A N ILE 82.A O LYS 40.A H 2.839 1.993 LYS 40.A NZ GLN 22.A O LYS 40.A HZ1 2.811 2.021 LYS 40.A NZ ASP 149.A OD1 LYS 40.A HZ3 2.845 2.068 MET 41.A N VAL 25.A O MET 41.A H 2.579 1.734 ILE 42.A N ILE 80.A O ILE 42.A H 3.075 2.279 LYS 43.A N PHE 23.A O LYS 43.A H 3.277 2.494 SER 48.A N TYR 155.A O SER 48.A H 3.190 2.485 PHE 52.A N SER 48.A O PHE 52.A H 2.600 1.769 ILE 53.A N GLU 49.A O ILE 53.A H 2.985 2.198 GLU 54.A N ASP 50.A O GLU 54.A H 3.180 2.455 GLU 55.A N GLU 51.A O GLU 55.A H 2.990 2.139 MET 60.A N ALA 56.A O MET 60.A H 2.863 2.044 ASN 61.A N LYS 57.A O ASN 61.A H 3.110 2.341 LEU 62.A N MET 59.A O LEU 62.A H 3.170 2.348 SER 63.A N TYR 121.A OH SER 63.A H 2.947 2.090 LYS 66.A NZ ASP 114.A OD1 LYS 66.A HZ3 2.811 1.968 LYS 66.A NZ GLU 117.A OE2 LYS 66.A HZ2 2.737 1.902 LEU 67.A N HIS 64.A O LEU 67.A H 3.160 2.312 VAL 68.A N VAL 147.A O VAL 68.A H 3.017 2.164 GLN 69.A N GLU 85.A OE1 GLN 69.A H 2.953 2.123 TYR 71.A N ILE 83.A O TYR 71.A H 2.776 1.955 GLY 72.A N ILE 83.A O GLY 72.A H 3.350 2.549 VAL 73.A N TRP 5.A O VAL 73.A H 2.910 2.116 CYS 74.A N PHE 81.A O CYS 74.A H 3.180 2.376 THR 75.A N GLU 6.A OE1 THR 75.A H 3.324 2.484 GLN 77.A NE2 PRO 79.A O GLN 77.A HE21 3.211 2.370 ARG 78.A NE GLU 49.A OE1 ARG 78.A HE 3.073 2.290 ARG 78.A NH1 THR 75.A O ARG 78.A HH12 2.614 1.911 ARG 78.A NH1 GLN 77.A O ARG 78.A HH11 2.776 1.954 PHE 81.A N CYS 74.A O PHE 81.A H 3.172 2.372 ILE 82.A N LYS 40.A O ILE 82.A H 2.965 2.188 ILE 83.A N GLY 72.A O ILE 83.A H 2.954 2.096 THR 84.A N ALA 38.A O THR 84.A H 2.978 2.138 THR 84.A OG1 GLU 85.A O THR 84.A HG1 3.142 2.389 GLU 85.A N GLN 69.A O GLU 85.A H 2.949 2.169 ASN 89.A N VAL 139.A O ASN 89.A H 2.872 2.118 ASN 89.A ND2 ASN 140.A O ASN 89.A HD21 2.849 2.038 GLY 90.A N MET 87.A O GLY 90.A H 3.129 2.276 LEU 92.A N CYS 137.A O LEU 92.A H 2.926 2.126 LEU 93.A N ALA 134.A O LEU 93.A H 3.222 2.572 TYR 95.A N CYS 91.A O TYR 95.A H 3.117 2.289 LEU 96.A N LEU 92.A O LEU 96.A H 2.770 1.992 ARG 97.A N LEU 93.A O ARG 97.A H 3.103 2.356 ARG 97.A NE GLY 204.A O ARG 97.A HE 2.811 2.030 ARG 97.A NH2 GLY 204.A O ARG 97.A HH21 3.041 2.351 GLU 98.A N ASN 94.A O GLU 98.A H 3.058 2.321 ARG 100.A N GLU 98.A OE2 ARG 100.A H 2.885 2.042 ARG 100.A NE GLU 98.A OE2 ARG 100.A HE 2.835 1.983 ARG 100.A NH1 GLU 98.A OE1 ARG 100.A HH11 3.153 2.318 HIS 101.A N GLU 98.A O HIS 101.A H 3.374 2.521 HIS 101.A ND1 TYR 95.A O HIS 101.A HD1 3.016 2.270 GLN 104.A N GLN 107.A OE1 GLN 104.A H 2.783 1.931 GLN 107.A N GLN 104.A O GLN 107.A H 2.870 2.164 LEU 108.A N GLN 104.A O LEU 108.A H 3.270 2.481 LEU 109.A N THR 105.A O LEU 109.A H 2.952 2.127 GLU 110.A N GLN 106.A O GLU 110.A H 3.243 2.477 MET 111.A N GLN 107.A O MET 111.A H 3.054 2.268 CYS 112.A N LEU 108.A O CYS 112.A H 3.149 2.369 LYS 113.A N LEU 109.A O LYS 113.A H 2.973 2.238 LYS 113.A NZ GLU 110.A OE1 LYS 113.A HZ3 3.057 2.302 ASP 114.A N GLU 110.A O ASP 114.A H 2.924 2.088 VAL 115.A N MET 111.A O VAL 115.A H 3.183 2.342 CYS 116.A N CYS 112.A O CYS 116.A H 3.015 2.203 GLU 117.A N LYS 113.A O GLU 117.A H 2.907 2.087 ALA 118.A N ASP 114.A O ALA 118.A H 3.289 2.473 MET 119.A N VAL 115.A O MET 119.A H 2.887 2.072 GLU 120.A N CYS 116.A O GLU 120.A H 2.800 1.992 TYR 121.A N GLU 117.A O TYR 121.A H 3.134 2.322 LEU 122.A N ALA 118.A O LEU 122.A H 3.043 2.222 GLU 123.A N MET 119.A O GLU 123.A H 2.893 2.095 SER 124.A N GLU 120.A O SER 124.A H 3.046 2.307 SER 124.A N TYR 121.A O SER 124.A H 3.095 2.502 SER 124.A OG TYR 121.A O SER 124.A HG 2.623 1.831 LYS 125.A N LEU 122.A O LYS 125.A H 3.110 2.363 GLN 126.A N GLU 123.A O GLN 126.A H 3.177 2.342 PHE 127.A N LEU 122.A O PHE 127.A H 2.893 2.033 HIS 129.A N ASP 189.A OD2 HIS 129.A H 2.877 2.061 HIS 129.A NE2 SER 148.A O HIS 129.A HE2 2.968 2.350 ARG 130.A N ASP 189.A OD1 ARG 130.A H 3.086 2.264 ALA 134.A N GLU 199.A OE2 ALA 134.A H 3.072 2.243 ARG 135.A NH2 ASP 131.A OD1 ARG 135.A HH21 2.849 2.251 ASN 136.A N ALA 133.A O ASN 136.A H 3.243 2.438 ASN 136.A ND2 ASP 131.A O ASN 136.A HD22 2.747 1.934 CYS 137.A N ALA 134.A O CYS 137.A H 3.288 2.463 CYS 137.A SG ALA 133.A O CYS 137.A HG 3.514 2.404 LEU 138.A N LYS 146.A O LEU 138.A H 2.841 1.998 VAL 139.A N GLY 90.A O VAL 139.A H 2.881 2.126 ASN 140.A N VAL 144.A O ASN 140.A H 3.085 2.274 GLN 142.A N ASN 140.A OD1 GLN 142.A H 2.843 2.171 GLY 143.A N ASN 140.A O GLY 143.A H 3.038 2.195 VAL 144.A N ASN 140.A OD1 VAL 144.A H 3.020 2.212 VAL 145.A N ASP 114.A OD2 VAL 145.A H 3.187 2.362 LYS 146.A N LEU 138.A O LYS 146.A H 2.749 1.920 LYS 146.A NZ GLU 85.A OE1 LYS 146.A HZ2 2.702 1.867 VAL 147.A N LYS 66.A O VAL 147.A H 2.883 2.074 GLY 151.A N HIS 129.A O GLY 151.A H 3.143 2.328 ARG 154.A N GLY 151.A O ARG 154.A H 3.334 2.502 ARG 154.A NE TYR 155.A OH no hydrogen 3.153 N/A ARG 154.A NH2 TYR 155.A OH no hydrogen 2.734 N/A TYR 155.A N LEU 152.A O TYR 155.A H 3.266 2.423 VAL 156.A N SER 153.A O VAL 156.A H 3.233 2.386 LEU 157.A N SER 46.A O LEU 157.A H 3.360 2.569 GLU 160.A N ASP 158.A OD1 GLU 160.A H 2.806 1.955 TYR 161.A N ASP 158.A O TYR 161.A H 3.086 2.263 THR 162.A N ASP 158.A O THR 162.A H 3.043 2.353 SER 163.A N ASP 159.A O SER 163.A H 2.982 2.139 GLY 166.A N SER 163.A O GLY 166.A H 2.672 1.852 LYS 168.A N GLU 160.A O LYS 168.A H 2.575 1.800 VAL 171.A N PHE 169.A O VAL 171.A H 2.816 2.114 ARG 172.A NE ASN 213.A OD1 ARG 172.A HE 3.328 2.633 ARG 172.A NH1 PHE 211.A O ARG 172.A HH12 2.852 2.096 ARG 172.A NH2 PRO 207.A O ARG 172.A HH21 2.722 1.923 ARG 172.A NH2 TYR 208.A O ARG 172.A HH22 2.788 2.113 ARG 172.A NH2 PHE 211.A O ARG 172.A HH22 3.271 2.636 TRP 173.A N PRO 170.A O TRP 173.A H 3.225 2.418 TRP 173.A NE1 GLU 199.A OE2 TRP 173.A HE1 2.742 1.910 SER 174.A N VAL 171.A O SER 174.A H 2.930 2.097 SER 174.A OG PRO 170.A O SER 174.A HG 2.913 2.157 GLU 177.A N GLU 177.A OE1 GLU 177.A H 2.863 2.065 VAL 178.A N PRO 175.A O VAL 178.A H 3.143 2.401 LEU 179.A N PRO 175.A O LEU 179.A H 3.187 2.353 MET 180.A N PRO 176.A O MET 180.A H 2.894 2.083 TYR 181.A N GLU 177.A O TYR 181.A H 3.046 2.311 SER 182.A N VAL 178.A O SER 182.A H 2.940 2.227 LYS 183.A N GLU 177.A O LYS 183.A H 2.995 2.135 LYS 187.A N SER 185.A OG LYS 187.A H 3.120 2.372 LYS 187.A NZ ARG 251.A O LYS 187.A HZ2 3.029 2.186 LYS 187.A NZ PRO 252.A O LYS 187.A HZ2 3.256 2.650 SER 188.A N SER 185.A O SER 188.A H 3.180 2.428 ILE 190.A N SER 186.A O ILE 190.A H 3.129 2.366 TRP 191.A N LYS 187.A O TRP 191.A H 3.134 2.312 ALA 192.A N SER 188.A O ALA 192.A H 3.052 2.233 PHE 193.A N ASP 189.A O PHE 193.A H 2.932 2.119 GLY 194.A N ILE 190.A O GLY 194.A H 3.149 2.398 GLY 194.A N TRP 191.A O GLY 194.A H 3.037 2.427 VAL 195.A N TRP 191.A O VAL 195.A H 3.231 2.452 LEU 196.A N ALA 192.A O LEU 196.A H 2.897 2.103 MET 197.A N PHE 193.A O MET 197.A H 2.943 2.134 TRP 198.A N GLY 194.A O TRP 198.A H 3.139 2.362 TRP 198.A NE1 TYR 227.A O TRP 198.A HE1 2.951 2.292 GLU 199.A N VAL 195.A O GLU 199.A H 2.823 2.046 ILE 200.A N LEU 196.A O ILE 200.A H 2.853 2.059 TYR 201.A N MET 197.A O TYR 201.A H 2.939 2.091 SER 202.A N TRP 198.A O SER 202.A H 2.961 2.329 LEU 203.A N ILE 200.A O LEU 203.A H 2.979 2.149 GLY 204.A N GLU 199.A O GLY 204.A H 2.837 2.012 PHE 211.A N TYR 208.A O PHE 211.A H 2.992 2.158 THR 212.A N GLU 215.A OE1 THR 212.A H 3.055 2.223 THR 216.A N THR 212.A O THR 216.A H 2.868 2.033 ALA 217.A N ASN 213.A O ALA 217.A H 3.116 2.285 GLU 218.A N SER 214.A O GLU 218.A H 3.139 2.348 HIS 219.A N GLU 215.A O HIS 219.A H 2.919 2.279 HIS 219.A N THR 216.A O HIS 219.A H 3.042 2.358 ILE 220.A N THR 216.A O ILE 220.A H 2.830 2.014 GLY 223.A N ILE 220.A O GLY 223.A H 2.698 1.866 LEU 224.A N HIS 219.A O LEU 224.A H 2.917 2.069 ARG 225.A NE TRP 244.A O ARG 225.A HE 3.010 2.390 ARG 225.A NH1 LEU 224.A O ARG 225.A HH11 2.950 2.146 ARG 225.A NH2 TRP 244.A O ARG 225.A HH21 3.266 2.714 ARG 225.A NH2 GLU 246.A OE1 ARG 225.A HH22 2.797 2.038 ARG 228.A NE ALA 232.A O ARG 228.A HE 2.994 2.325 ALA 232.A N PRO 229.A O ALA 232.A H 3.092 2.265 VAL 236.A N SER 233.A OG VAL 236.A H 3.273 2.426 TYR 237.A N SER 233.A O TYR 237.A H 2.947 2.119 TYR 237.A OH LEU 226.A O TYR 237.A HH 2.675 1.856 THR 238.A N GLU 234.A O THR 238.A H 2.907 2.133 ILE 239.A N LYS 235.A O ILE 239.A H 3.207 2.444 MET 240.A N VAL 236.A O MET 240.A H 3.186 2.361 TYR 241.A N TYR 237.A O TYR 241.A H 2.864 2.050 SER 242.A N THR 238.A O SER 242.A H 3.042 2.297 CYS 243.A N MET 240.A O CYS 243.A H 3.103 2.303 TRP 244.A N TYR 241.A O TRP 244.A H 2.986 2.142 GLU 250.A N LYS 247.A O GLU 250.A H 3.028 2.184 ARG 251.A N ALA 248.A O ARG 251.A H 3.093 2.240 ARG 251.A NE HIS 245.A O ARG 251.A HE 2.701 1.889 ARG 251.A NH1 GLU 177.A OE2 ARG 251.A HH12 2.894 2.084 ARG 251.A NH1 LYS 187.A O ARG 251.A HH11 3.002 2.265 ARG 251.A NH2 GLU 177.A OE1 ARG 251.A HH22 3.020 2.194 ARG 251.A NH2 HIS 245.A O ARG 251.A HH21 2.943 2.233 PHE 254.A N GLU 123.A OE1 PHE 254.A H 3.222 2.393 PHE 254.A N GLU 123.A OE2 PHE 254.A H 3.209 2.486 ILE 256.A N THR 253.A OG1 ILE 256.A H 3.299 2.458 LEU 257.A N THR 253.A O LEU 257.A H 3.015 2.173 LEU 258.A N PHE 254.A O LEU 258.A H 2.975 2.145 SER 259.A N LYS 255.A O SER 259.A H.A 3.111 2.318 ASN 260.A N ILE 256.A O ASN 260.A H 2.921 2.102 ILE 261.A N LEU 257.A O ILE 261.A H 2.907 2.061 LEU 262.A N LEU 258.A O LEU 262.A H 2.940 2.158 ASP 263.A N SER 259.A O ASP 263.A H 3.040 2.275 VAL 264.A N ASN 260.A O VAL 264.A H 3.124 2.285 MET 265.A N ILE 261.A O MET 265.A H 3.047 2.248 ASP 266.A N LEU 262.A O ASP 266.A H 3.038 2.284 GLU 267.A N VAL 264.A O GLU 267.A H 2.966 2.220 GLU 268.A N MET 265.A O GLU 268.A H 3.237 2.457