Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yjr_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 2.A N ILE 70.A O LEU 2.A H 2.891 1.919 ASP 3.A N TYR 22.A OH ASP 3.A H 2.967 1.982 ARG 4.A NE GLU 74.A OE1 ARG 4.A HE 2.884 1.935 ARG 4.A NE GLU 74.A OE2 ARG 4.A HE 3.552 2.744 ARG 4.A NH1 ARG 4.A O ARG 4.A HH11 3.228 2.265 ARG 4.A NH2 GLU 74.A OE2 ARG 4.A HH21 2.965 1.966 LYS 5.A N ASP 3.A OD1 LYS 5.A H 3.057 2.116 LEU 6.A N ASP 3.A O LEU 6.A H 2.944 2.011 LEU 7.A N ARG 4.A O LEU 7.A H 3.179 2.181 THR 8.A N TYR 21.A O THR 8.A H 3.013 2.027 GLU 10.A N LYS 19.A O GLU 10.A H 2.864 1.871 LEU 14.A N VAL 17.A O LEU 14.A H 2.690 1.684 LYS 18.A N VAL 33.A O LYS 18.A H 2.957 2.019 GLY 20.A N VAL 31.A O GLY 20.A H 2.849 1.917 TYR 21.A N THR 8.A O TYR 21.A H 2.872 1.959 TYR 21.A OH GLU 10.A OE2 TYR 21.A HH 2.608 1.814 TYR 22.A N LYS 29.A O TYR 22.A H 2.861 1.864 GLN 23.A N LEU 6.A O GLN 23.A H 2.996 2.044 MET 24.A N VAL 27.A O MET 24.A H 2.865 1.925 LYS 29.A N TYR 22.A O LYS 29.A H 2.814 1.819 LYS 29.A NZ GLU 81.A OE2.B LYS 29.A HZ1 2.718 1.723 VAL 31.A N GLY 20.A O VAL 31.A H 2.897 1.897 ALA 32.A N MET 80.A O ALA 32.A H 2.900 1.966 VAL 33.A N LYS 18.A O VAL 33.A H 2.813 1.923 LYS 34.A N LEU 78.A O LYS 34.A H 2.953 2.019 ILE 35.A N THR 16.A O ILE 35.A H 2.866 1.880 LEU 36.A N TRP 76.A O LEU 36.A H 2.800 1.806 ASN 38.A ND2 ALA 73.A O ASN 38.A HD21 2.941 1.938 ASN 41.A N GLU 39.A O ASN 41.A H 2.783 1.958 ASN 41.A ND2 LYS 37.A O ASN 41.A HD22 2.949 2.001 ALA 44.A N ASP 42.A OD1 ALA 44.A H 2.904 2.089 LEU 45.A N ASP 42.A OD1 LEU 45.A H 3.368 2.446 LYS 46.A N ASP 42.A O LYS 46.A H 3.078 2.080 ASP 47.A N PRO 43.A O ASP 47.A H 2.905 1.964 GLU 48.A N ALA 44.A O GLU 48.A H 3.009 2.091 LEU 49.A N LEU 45.A O LEU 49.A H 3.096 2.189 LEU 50.A N LYS 46.A O LEU 50.A H 2.908 1.934 ALA 51.A N ASP 47.A O ALA 51.A H 2.910 1.959 GLU 52.A N GLU 48.A O GLU 52.A H 2.894 1.952 ALA 53.A N LEU 49.A O ALA 53.A H 2.962 1.961 ASN 54.A N LEU 50.A O ASN 54.A H 2.919 1.971 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.071 2.119 MET 56.A N GLU 52.A O MET 56.A H 2.836 1.829 GLN 57.A N ALA 53.A O GLN 57.A H 2.953 2.008 GLN 58.A N VAL 55.A O GLN 58.A H 2.912 1.953 GLN 58.A NE2 ASN 54.A O GLN 58.A HE22 2.933 1.927 LEU 59.A N MET 56.A O LEU 59.A H 3.121 2.114 ASP 60.A N TYR 116.A OH ASP 60.A H 2.963 2.003 TYR 63.A N ASN 61.A OD1 TYR 63.A H 2.874 1.883 ILE 64.A N ASN 61.A O ILE 64.A H 3.247 2.288 VAL 65.A N ILE 142.A O VAL 65.A H 2.975 1.976 ARG 66.A NH1 ASP 60.A OD1 ARG 66.A HH12 2.594 1.701 ILE 68.A N VAL 79.A O ILE 68.A H 2.806 1.872 GLY 69.A N VAL 79.A O GLY 69.A H 3.184 2.223 CYS 71.A N MET 77.A O CYS 71.A H 2.804 1.861 ALA 73.A N SER 75.A O ALA 73.A H 3.020 2.019 GLU 74.A N GLU 74.A OE1 GLU 74.A H 2.828 1.930 TRP 76.A N LEU 36.A O TRP 76.A H 2.919 1.944 MET 77.A N CYS 71.A O MET 77.A H 2.836 1.961 LEU 78.A N LYS 34.A O LEU 78.A H 2.906 1.942 VAL 79.A N GLY 69.A O VAL 79.A H 2.822 1.830 MET 80.A N ALA 32.A O MET 80.A H.A 2.901 1.896 GLU 81.A N.A ARG 66.A O GLU 81.A H.A 2.938 1.949 GLU 81.A N.B ARG 66.A O GLU 81.A H.B 2.933 1.929 MET 82.A N THR 30.A O MET 82.A H.A 3.091 2.095 LEU 85.A N LEU 134.A O LEU 85.A H 2.915 2.106 GLY 86.A N ALA 83.A O GLY 86.A H 3.257 2.354 LEU 88.A N VAL 132.A O LEU 88.A H 2.817 1.947 TYR 91.A N PRO 87.A O TYR 91.A H 3.003 2.038 TYR 91.A OH GLN 137.A OE1 TYR 91.A HH 2.533 1.763 LEU 92.A N LEU 88.A O LEU 92.A H 2.968 1.993 GLN 93.A N ASN 89.A O GLN 93.A H 3.032 2.087 GLN 93.A NE2 GLY 199.A O GLN 93.A HE22 2.817 1.825 GLN 94.A N LYS 90.A O GLN 94.A H 3.123 2.219 ASN 95.A N TYR 91.A O ASN 95.A H 2.845 2.107 ASN 95.A ND2 TYR 91.A O ASN 95.A HD22 2.944 1.963 ARG 96.A NE GLN 93.A O ARG 96.A HE 3.012 2.034 ARG 96.A NH2 GLN 93.A O ARG 96.A HH21 3.482 2.695 ASN 102.A ND2 GLN 137.A O ASN 102.A HD21 2.901 1.902 ILE 103.A N LYS 99.A O ILE 103.A H 3.014 2.099 ILE 104.A N ASP 100.A O ILE 104.A H 2.874 1.892 GLU 105.A N LYS 101.A O GLU 105.A H 2.942 2.010 LEU 106.A N ASN 102.A O LEU 106.A H 3.079 2.131 VAL 107.A N ILE 103.A O VAL 107.A H 2.939 1.941 HIS 108.A N ILE 104.A O HIS 108.A H 2.759 1.790 HIS 108.A NE2 GLU 253.A OE2 HIS 108.A HE2 2.686 1.688 GLN 109.A N GLU 105.A O GLN 109.A H 2.991 2.067 GLN 109.A NE2 HIS 138.A O GLN 109.A HE21 2.972 1.963 VAL 110.A N LEU 106.A O VAL 110.A H 3.074 2.107 SER 111.A N VAL 107.A O SER 111.A H 2.913 1.991 SER 111.A OG HIS 108.A O SER 111.A HG 2.687 1.697 MET 112.A N HIS 108.A O MET 112.A H 2.875 1.989 GLY 113.A N GLN 109.A O GLY 113.A H 2.988 2.005 MET 114.A N VAL 110.A O MET 114.A H 2.868 1.913 LYS 115.A N SER 111.A O LYS 115.A H 2.840 1.906 LYS 115.A NZ GLU 253.A OE1 LYS 115.A HZ2 3.452 2.676 TYR 116.A N MET 112.A O TYR 116.A H 3.098 2.110 LEU 117.A N GLY 113.A O LEU 117.A H 2.903 1.943 GLU 118.A N MET 114.A O GLU 118.A H 2.839 1.865 GLU 119.A N LYS 115.A O GLU 119.A H 2.952 1.974 SER 120.A N TYR 116.A O SER 120.A H 2.907 1.990 SER 120.A OG TYR 116.A O SER 120.A HG 2.809 2.170 ASN 121.A N GLU 118.A O ASN 121.A H 2.944 1.995 PHE 122.A N LEU 117.A O PHE 122.A H 3.148 2.139 VAL 123.A N LYS 149.A O VAL 123.A H 2.928 1.953 HIS 124.A N ASP 184.A OD2 HIS 124.A H 2.826 1.833 HIS 124.A NE2 SER 143.A O HIS 124.A HE2 2.856 1.907 ARG 125.A N ASP 184.A OD1 ARG 125.A H 3.044 2.035 ARG 125.A NH1 LEU 147.A O ARG 125.A HH11 2.857 1.925 ASP 126.A N HIS 124.A ND1 ASP 126.A H 2.925 1.976 ALA 129.A N GLU 194.A OE1 ALA 129.A H 2.928 1.919 ARG 130.A NH2 ASP 126.A OD1 ARG 130.A HH21 2.831 1.987 ASN 131.A N ALA 128.A O ASN 131.A H 2.880 1.934 ASN 131.A ND2 ASP 126.A O ASN 131.A HD22 2.868 1.859 VAL 132.A N ALA 129.A O VAL 132.A H 3.106 2.103 LEU 133.A N LYS 141.A O LEU 133.A H 2.831 1.871 LEU 134.A N GLY 86.A O LEU 134.A H 2.866 1.904 VAL 135.A N TYR 139.A O VAL 135.A H 2.787 1.813 THR 136.A N TYR 139.A O THR 136.A H 3.472 2.519 GLN 137.A NE2 ASN 102.A OD1 GLN 137.A HE22 2.974 2.173 HIS 138.A N THR 136.A OG1 HIS 138.A H 2.956 2.019 HIS 138.A ND1 GLU 105.A OE1 HIS 138.A HD1 2.658 1.655 TYR 139.A N THR 136.A O TYR 139.A H 3.210 2.235 TYR 139.A OH PRO 62.A O TYR 139.A HH 2.721 1.749 ALA 140.A N GLN 109.A OE1 ALA 140.A H 2.875 1.924 LYS 141.A N LEU 133.A O LYS 141.A H 2.900 1.977 LYS 141.A NZ PRO 62.A O LYS 141.A HZ3 2.969 2.051 LYS 141.A NZ ILE 64.A O LYS 141.A HZ2 3.334 2.655 ILE 142.A N TYR 63.A O ILE 142.A H 2.845 1.872 SER 143.A N ASN 131.A O SER 143.A H 2.883 2.046 SER 143.A OG ASN 131.A O SER 143.A HG 2.631 1.688 PHE 145.A N GLU 52.A OE2 PHE 145.A H 2.835 1.884 GLY 146.A N ASP 144.A OD1 GLY 146.A H 3.273 2.267 SER 148.A N.A PHE 145.A O SER 148.A H.A 3.085 2.081 SER 148.A N.B PHE 145.A O SER 148.A H.B 3.100 2.118 SER 148.A N.C PHE 145.A O SER 148.A H.C 3.087 2.096 SER 148.A OG.A HIS 124.A O SER 148.A HG.A 2.887 1.979 SER 148.A OG.B PHE 145.A O SER 148.A HG.B 2.796 1.898 SER 148.A OG.C VAL 123.A O SER 148.A HG.C 2.830 1.863 LYS 149.A N VAL 123.A O LYS 149.A H.C 2.987 2.058 LEU 151.A N ASN 121.A O LEU 151.A H 2.905 1.896 ARG 152.A NE ASP 154.A OD1 ARG 152.A HE 2.862 1.928 ARG 152.A NH2 ASP 154.A OD1 ARG 152.A HH21 3.447 2.727 ARG 152.A NH2 ASP 154.A OD2 ARG 152.A HH21 3.100 2.087 GLU 155.A N ARG 152.A O GLU 155.A H 3.368 2.357 LYS 157.A NZ ALA 158.A O LYS 157.A HZ3 2.678 1.721 ALA 158.A N TYR 177.A O ALA 158.A H 2.903 1.929 VAL 166.A N TRP 164.A O VAL 166.A H 2.839 2.087 LYS 167.A NZ MET 206.A O LYS 167.A HZ1 2.749 1.949 TRP 168.A N PRO 165.A O TRP 168.A H 2.872 1.888 TRP 168.A NE1 GLU 194.A OE1 TRP 168.A HE1 2.870 1.866 TYR 169.A N VAL 166.A O TYR 169.A H 3.024 2.019 TYR 169.A OH ARG 125.A O TYR 169.A HH 2.684 1.741 GLU 172.A N GLU 172.A OE1 GLU 172.A H 2.847 1.911 CYS 173.A N ALA 170.A O CYS 173.A H 2.969 2.186 CYS 173.A SG LYS 178.A O CYS 173.A HG 3.523 2.214 ILE 174.A N ALA 170.A O ILE 174.A H 3.276 2.334 ASN 175.A N PRO 171.A O ASN 175.A H 2.776 1.797 ASN 175.A ND2 TYR 241.A OH ASN 175.A HD21 3.426 2.531 TYR 176.A N GLU 172.A O TYR 176.A H 2.894 1.952 TYR 177.A N CYS 173.A O TYR 177.A H 2.973 2.145 LYS 178.A N GLU 172.A O LYS 178.A H 3.353 2.342 SER 180.A N SER 183.A OG SER 180.A H 2.988 1.986 LYS 182.A NZ ARG 246.A O LYS 182.A HZ3 2.787 1.959 SER 183.A N SER 180.A OG SER 183.A H 3.263 2.348 SER 183.A OG GLU 172.A OE2 SER 183.A HG 2.808 1.874 ASP 184.A N SER 180.A O ASP 184.A H 3.187 2.265 VAL 185.A N SER 181.A O VAL 185.A H 2.979 2.124 TRP 186.A N LYS 182.A O TRP 186.A H 3.186 2.278 SER 187.A N SER 183.A O SER 187.A H 3.178 2.202 SER 187.A OG TRP 168.A O SER 187.A HG 2.657 1.747 PHE 188.A N ASP 184.A O PHE 188.A H 2.827 1.874 GLY 189.A N VAL 185.A O GLY 189.A H 3.007 2.103 VAL 190.A N TRP 186.A O VAL 190.A H 3.236 2.307 LEU 191.A N SER 187.A O LEU 191.A H 2.889 1.912 MET 192.A N PHE 188.A O MET 192.A H 2.834 1.863 TRP 193.A N GLY 189.A O TRP 193.A H 3.033 2.057 TRP 193.A NE1 GLY 222.A O TRP 193.A HE1 3.205 2.333 GLU 194.A N VAL 190.A O GLU 194.A H 2.891 1.937 ALA 195.A N LEU 191.A O ALA 195.A H 2.881 1.912 PHE 196.A N MET 192.A O PHE 196.A H 2.992 2.078 SER 197.A N GLU 194.A O SER 197.A H 3.142 2.175 SER 197.A OG TRP 193.A O SER 197.A HG 2.728 1.808 TYR 198.A OH.A VAL 98.A O TYR 198.A HH.A 2.711 1.778 GLY 199.A N GLU 194.A O GLY 199.A H.A 2.995 2.002 GLN 200.A N SER 197.A O GLN 200.A H 3.096 2.191 MET 206.A N TYR 203.A O MET 206.A H 3.162 2.193 LYS 207.A N GLU 210.A OE1 LYS 207.A H 2.867 1.860 VAL 211.A N LYS 207.A O VAL 211.A H 3.010 2.093 THR 212.A N GLY 208.A O THR 212.A H 2.982 2.001 THR 212.A OG1 GLY 208.A O THR 212.A HG1 3.345 2.683 ALA 213.A N SER 209.A O ALA 213.A H 3.130 2.175 MET 214.A N GLU 210.A O MET 214.A H 2.933 1.958 LEU 215.A N VAL 211.A O LEU 215.A H 2.959 1.976 GLU 216.A N THR 212.A O GLU 216.A H 3.060 2.106 LYS 217.A N ALA 213.A O LYS 217.A H 3.210 2.272 GLY 218.A N LEU 215.A O GLY 218.A H 2.949 1.956 GLU 219.A N MET 214.A O GLU 219.A H 3.129 2.162 ARG 220.A NE TRP 239.A O ARG 220.A HE 3.109 2.237 ARG 220.A NH1 LEU 215.A O ARG 220.A HH12 3.057 2.118 ARG 220.A NH1 GLU 219.A O ARG 220.A HH11 2.920 1.925 ARG 220.A NH2 TRP 239.A O ARG 220.A HH21 2.958 2.049 CYS 227.A N PRO 224.A O CYS 227.A H 2.947 1.942 MET 231.A N PRO 228.A O MET 231.A H 2.990 2.196 TYR 232.A N PRO 228.A O TYR 232.A H 3.171 2.223 TYR 232.A OH MET 221.A O TYR 232.A HH 2.615 1.785 ASP 233.A N ARG 229.A O ASP 233.A H 2.875 1.909 LEU 234.A N GLU 230.A O LEU 234.A H 3.067 2.148 MET 235.A N MET 231.A O MET 235.A H 3.002 2.055 ASN 236.A N TYR 232.A O ASN 236.A H 3.051 2.103 LEU 237.A N ASP 233.A O LEU 237.A H 3.107 2.187 CYS 238.A N LEU 234.A O CYS 238.A H 2.943 1.976 CYS 238.A SG LEU 234.A O CYS 238.A HG 3.455 2.343 TRP 239.A N MET 235.A O TRP 239.A H 2.970 2.101 THR 240.A N LEU 237.A O THR 240.A H 3.232 2.500 THR 240.A OG1 LEU 237.A O THR 240.A HG1 2.688 2.086 GLU 244.A N ASP 242.A OD1 GLU 244.A H 3.048 2.131 ASN 245.A N ASP 242.A O ASN 245.A H 3.104 2.261 ARG 246.A N VAL 243.A O ARG 246.A H 3.287 2.381 ARG 246.A NE THR 240.A O ARG 246.A HE 2.843 1.901 ARG 246.A NH1 GLU 172.A OE1 ARG 246.A HH12 3.540 2.776 ARG 246.A NH1 GLU 172.A OE2 ARG 246.A HH12 2.794 1.801 ARG 246.A NH1 LYS 182.A O ARG 246.A HH11 2.964 1.975 ARG 246.A NH2 GLU 172.A OE1 ARG 246.A HH22 2.887 1.891 ARG 246.A NH2 THR 240.A O ARG 246.A HH21 3.020 2.166 ARG 246.A NH2 TYR 241.A O ARG 246.A HH21 3.076 2.388 PHE 249.A N GLU 118.A OE2 PHE 249.A H 2.871 1.878 ALA 250.A N GLU 118.A OE1 ALA 250.A H 3.267 2.450 VAL 252.A N GLY 248.A O VAL 252.A H 3.096 2.145 GLU 253.A N PHE 249.A O GLU 253.A H 2.830 1.820 LEU 254.A N ALA 250.A O LEU 254.A H 3.362 2.405 ARG 255.A N ALA 251.A O ARG 255.A H 3.500 2.584 LEU 256.A N GLU 253.A O LEU 256.A H 3.142 2.155 ARG 257.A N LEU 254.A O ARG 257.A H 3.208 2.203 ARG 257.A NE GLU 253.A OE1 ARG 257.A HE 3.368 2.618 ARG 257.A NE GLU 253.A OE2 ARG 257.A HE 2.938 1.940 ARG 257.A NH2 GLU 253.A OE1 ARG 257.A HH21 2.907 2.027