Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yki_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N GLY 46.A O GLY 3.A H 3.055 2.204 ARG 4.A N LEU 1.A O ARG 4.A H 3.056 2.232 HIS 5.A ND1 THR 48.A OG1 no hydrogen 2.773 N/A HIS 5.A NE2 GLU 50.A OE2 no hydrogen 2.833 N/A LEU 6.A N THR 48.A O LEU 6.A H 2.843 2.014 ARG 7.A N ASP 82.A OD2 ARG 7.A H 2.850 1.991 ARG 7.A NE ASP 82.A OD2 ARG 7.A HE 3.012 2.154 ARG 7.A NH1 ASP 79.A O ARG 7.A HH12 2.829 2.099 ARG 7.A NH2 ASP 79.A O ARG 7.A HH22 3.309 2.718 ARG 7.A NH2 ASP 79.A OD1 ARG 7.A HH22 3.019 2.240 ARG 7.A NH2 ASP 82.A OD1 ARG 7.A HH21 2.911 2.053 LEU 8.A N GLU 50.A O LEU 8.A H 2.825 1.990 GLY 9.A N MET 83.A O GLY 9.A H 2.823 2.049 SER 10.A N ILE 52.A O SER 10.A H 3.272 2.505 SER 10.A OG ALA 85.A O SER 10.A HG 2.822 2.196 GLU 13.A N MET 17.A O GLU 13.A H 2.885 2.122 GLN 14.A NE2 GLU 12.A OE2 GLN 14.A HE21 3.455 2.617 PHE 16.A N GLU 13.A O PHE 16.A H 2.873 2.273 MET 17.A N GLU 13.A O MET 17.A H 2.989 2.156 PHE 18.A N SER 31.A O PHE 18.A H 2.717 1.890 PHE 19.A N GLU 12.A OE2 PHE 19.A H 2.929 2.101 ALA 20.A N CYS 29.A O ALA 20.A H 2.859 2.013 CYS 24.A SG ALA 20.A O no hydrogen 3.452 N/A CYS 24.A SG GLU 22.A O no hydrogen 3.655 N/A ASN 27.A ND2 TYR 49.A O ASN 27.A HD21 2.946 2.102 ASP 28.A N GLU 25.A O ASP 28.A H 3.187 2.473 CYS 29.A N GLY 26.A O CYS 29.A H 3.093 2.241 TRP 30.A N ASN 27.A O TRP 30.A H 3.078 2.233 SER 31.A N PHE 18.A O SER 31.A H 3.078 2.315 MET 33.A N PRO 15.A O MET 33.A H 3.148 2.299 VAL 34.A N PHE 16.A O VAL 34.A H 2.848 2.062 ASP 36.A N GLY 32.A O ASP 36.A H 2.934 2.103 MET 37.A N MET 33.A O MET 37.A H 3.104 2.293 VAL 38.A N VAL 34.A O VAL 38.A H 2.906 2.082 VAL 39.A N ASN 35.A O VAL 39.A H 2.872 2.026 LYS 40.A N ASP 36.A O LYS 40.A H 3.169 2.340 LYS 40.A NZ ASP 44.A OD2 LYS 40.A HZ3 3.265 2.479 LEU 41.A N MET 37.A O LEU 41.A H 2.915 2.070 SER 42.A N.A VAL 38.A O SER 42.A H.A 2.795 1.967 SER 42.A N.B VAL 38.A O SER 42.A H.B 2.807 1.997 SER 42.A OG.A PHE 47.A O SER 42.A HG.A 2.653 1.839 SER 42.A OG.B VAL 39.A O SER 42.A HG.B 2.720 1.931 GLU 43.A N VAL 39.A O GLU 43.A H.A 2.946 2.132 ASP 44.A N LYS 40.A O ASP 44.A H 2.923 2.120 LEU 45.A N LEU 41.A O LEU 45.A H 2.846 2.069 GLY 46.A N SER 42.A O.A GLY 46.A H 2.769 1.990 GLY 46.A N SER 42.A O.B GLY 46.A H 2.919 2.165 THR 48.A N ARG 4.A O THR 48.A H 2.899 2.120 GLU 50.A N LEU 6.A O GLU 50.A H 3.138 2.373 TYR 51.A OH ASN 35.A OD1 TYR 51.A HH 2.796 2.079 ILE 52.A N LEU 8.A O ILE 52.A H 2.826 2.003 ARG 57.A N PRO 54.A O ARG 57.A H 2.946 2.114 ARG 57.A NH1 PRO 54.A O ARG 57.A HH11 2.828 2.069 LYS 58.A N ASP 56.A OD1 LYS 58.A H 2.959 2.110 GLY 60.A N SER 139.A O GLY 60.A H 2.938 2.082 ALA 61.A N ASN 70.A OD1 ALA 61.A H 2.961 2.149 ASN 63.A N GLU 68.A O ASN 63.A H 2.942 2.083 LYS 64.A NZ.A LEU 62.A O LYS 64.A HZ2.A 2.946 2.149 THR 65.A N ASN 63.A OD1 THR 65.A H.B 2.851 2.213 THR 66.A N ASN 63.A OD1 THR 66.A H 3.013 2.252 ASN 67.A N ASN 63.A O ASN 67.A H 2.707 2.033 GLU 68.A N THR 66.A OG1 GLU 68.A H 3.210 2.512 ASN 70.A ND2 SER 139.A OG ASN 70.A HD21 2.856 2.004 GLY 71.A N ASP 56.A OD2 GLY 71.A H 2.855 2.014 MET 72.A N LYS 58.A O MET 72.A H 3.064 2.353 ILE 73.A N PHE 59.A O ILE 73.A H 3.388 2.603 ARG 74.A N ASN 70.A O ARG 74.A H 3.067 2.236 ARG 74.A NE ASP 78.A OD1 ARG 74.A HE 3.106 2.305 ARG 74.A NE ASP 78.A OD2 ARG 74.A HE 3.145 2.533 ARG 74.A NH1 GLU 68.A OE1 ARG 74.A HH12 3.186 2.390 ARG 74.A NH1 TRP 69.A O ARG 74.A HH11 2.965 2.153 ASP 75.A N GLY 71.A O ASP 75.A H 3.126 2.306 LEU 76.A N MET 72.A O LEU 76.A H 3.043 2.230 LEU 77.A N ILE 73.A O LEU 77.A H 3.009 2.171 ASP 78.A N ARG 74.A O ASP 78.A H 2.858 2.101 ASP 79.A N LEU 76.A O ASP 79.A H 2.965 2.129 LYS 80.A N ASP 75.A O LYS 80.A H 2.950 2.124 ASP 82.A N ARG 7.A O ASP 82.A H 2.731 1.886 ILE 84.A N GLY 213.A O ILE 84.A H 2.786 1.960 ALA 85.A N GLY 9.A O ALA 85.A H 2.837 2.058 LEU 88.A N ALA 211.A O LEU 88.A H 3.231 2.464 SER 89.A OG GLU 184.A OE2 SER 89.A HG 2.732 1.946 THR 90.A N GLU 209.A O THR 90.A H 2.869 2.123 ASN 91.A N TYR 100.A OH ASN 91.A H 3.169 2.393 ASN 91.A ND2 HIS 141.A ND1 ASN 91.A HD22 3.012 2.161 ARG 94.A N ASN 91.A OD1 ARG 94.A H 2.880 2.033 ARG 94.A NH1 SER 89.A O ARG 94.A HH11 3.018 2.248 ARG 94.A NH2 GLY 60.A O ARG 94.A HH21 2.987 2.137 LYS 95.A N.A ASN 91.A O LYS 95.A H.A 3.061 2.252 LYS 95.A N.B ASN 91.A O LYS 95.A H.B 3.046 2.245 LYS 95.A NZ.A LYS 95.A O.A LYS 95.A HZ3.A 2.786 1.911 LYS 95.A NZ.A ASP 99.A OD1 LYS 95.A HZ1.A 3.096 2.320 SER 96.A N.A SER 92.A O.A SER 96.A H.A 3.067 2.350 SER 96.A N.A SER 92.A O.B SER 96.A H.A 3.204 2.495 SER 96.A N.A ALA 93.A O SER 96.A H.A 3.244 2.558 SER 96.A N.B SER 92.A O.A SER 96.A H.B 3.094 2.383 SER 96.A N.B SER 92.A O.B SER 96.A H.B 3.237 2.536 SER 96.A N.B ALA 93.A O SER 96.A H.B 3.315 2.609 SER 96.A OG.A ALA 93.A O SER 96.A HG.A 2.631 1.802 SER 96.A OG.B SER 92.A O.A SER 96.A HG.B 3.471 2.690 SER 96.A OG.B SER 92.A O.B SER 96.A HG.B 3.338 2.551 ALA 97.A N ARG 94.A O ALA 97.A H.A 2.871 2.041 ILE 98.A N ARG 94.A O ILE 98.A H 2.836 2.032 ASP 99.A N LEU 214.A O ASP 99.A H 2.805 2.000 TYR 100.A OH SER 89.A O TYR 100.A HH 2.741 2.125 SER 101.A N PHE 212.A O SER 101.A H 2.887 2.060 SER 101.A OG PHE 102.A O SER 101.A HG 2.843 2.027 PHE 102.A N ASP 225.A OD1 PHE 102.A H 2.802 2.027 PHE 104.A N TYR 210.A O PHE 104.A H 2.896 2.061 ALA 107.A N PHE 208.A O ALA 107.A H 2.875 2.053 ILE 109.A N PHE 205.A O ILE 109.A H 2.807 2.002 LYS 110.A N.A ASP 183.A O LYS 110.A H.A 2.878 2.051 LYS 110.A N.B ASP 183.A O LYS 110.A H.B 2.877 2.049 VAL 112.A N PHE 181.A O VAL 112.A H 2.924 2.117 VAL 113.A N PHE 199.A O VAL 113.A H 2.849 2.095 LYS 114.A NZ ARG 175.A O LYS 114.A HZ2 2.612 2.009 GLY 115.A N ASP 197.A O GLY 115.A H 2.723 1.896 THR 118.A OG1 TYR 132.A OH THR 118.A HG1 3.075 2.270 LEU 120.A N THR 118.A OG1 LEU 120.A H 3.314 2.463 ASN 121.A N GLU 125.A OE1 ASN 121.A H 2.731 1.875 GLN 122.A NE2 TYR 154.A OH GLN 122.A HE22 3.086 2.358 LEU 124.A N GLN 122.A OE1 LEU 124.A H 2.764 1.948 GLU 125.A N GLN 122.A O GLU 125.A H 2.999 2.209 LEU 126.A N VAL 123.A O LEU 126.A H 2.940 2.107 LEU 127.A N LEU 124.A O LEU 127.A H 3.117 2.280 ASP 128.A N GLU 125.A O ASP 128.A H 3.029 2.183 GLN 129.A NE2 LEU 126.A O GLN 129.A HE21 3.056 2.199 GLN 129.A NE2 TYR 132.A O GLN 129.A HE22 3.008 2.153 TYR 132.A N GLN 129.A OE1 TYR 132.A H 2.855 2.004 LYS 133.A N LEU 178.A O LYS 133.A H 2.999 2.208 TRP 134.A NE1 LEU 157.A O TRP 134.A HE1 2.742 1.924 GLY 135.A N VAL 180.A O GLY 135.A H 3.047 2.317 GLY 138.A N LEU 164.A O GLY 138.A H 2.987 2.161 SER 139.A N GLU 143.A OE2 SER 139.A H 2.819 2.028 ARG 140.A NE ASP 183.A OD1 ARG 140.A HE 2.754 1.986 ARG 140.A NH1 GLU 13.A OE1 ARG 140.A HH12 2.841 2.051 ARG 140.A NH1 GLU 13.A OE2 ARG 140.A HH12 3.430 2.779 ARG 140.A NH2 GLU 13.A OE1 ARG 140.A HH22 3.340 2.701 ARG 140.A NH2 GLU 13.A OE2 ARG 140.A HH22 2.962 2.176 ARG 140.A NH2 ASP 183.A OD2 ARG 140.A HH21 2.978 2.162 THR 144.A N ARG 140.A O THR 144.A H 3.269 2.441 LEU 145.A N HIS 141.A O LEU 145.A H 2.884 2.054 LEU 146.A N PRO 142.A O LEU 146.A H 2.916 2.080 LYS 147.A N GLU 143.A O LYS 147.A H 2.889 2.071 LYS 147.A NZ ASP 159.A OD1 LYS 147.A HZ3 2.988 2.110 LYS 147.A NZ ASP 159.A OD2 LYS 147.A HZ3 3.404 2.699 THR 148.A N THR 144.A O THR 148.A H 2.983 2.301 THR 148.A OG1 THR 144.A O THR 148.A HG1 2.907 2.114 ASP 151.A N HIS 149.A ND1 ASP 151.A H 3.014 2.185 ARG 153.A N ASP 151.A OD1 ARG 153.A H.A 3.045 2.211 ARG 153.A NE ASP 151.A OD1 ARG 153.A HE 3.065 2.213 ARG 153.A NE ASP 151.A OD2 ARG 153.A HE 3.135 2.485 ARG 153.A NH2 ASP 151.A OD2 ARG 153.A HH21 2.636 1.847 TYR 154.A N ASP 151.A O TYR 154.A H 2.947 2.107 ARG 156.A N SER 152.A O.A ARG 156.A H 3.051 2.274 ARG 156.A N SER 152.A O.B ARG 156.A H 3.092 2.318 ARG 156.A NE GLU 160.A OE2 ARG 156.A HE 2.774 1.914 ARG 156.A NH2 GLU 160.A OE1 ARG 156.A HH21 2.897 2.076 ARG 156.A NH2 GLU 160.A OE2 ARG 156.A HH21 3.541 2.909 LEU 157.A N ARG 153.A O LEU 157.A H 3.059 2.286 VAL 158.A N TYR 154.A O VAL 158.A H 3.235 2.437 ASP 159.A N SER 155.A O ASP 159.A H 2.860 2.014 GLU 160.A N ARG 156.A O GLU 160.A H 2.799 1.998 GLY 161.A N VAL 158.A O GLY 161.A H 3.318 2.539 VAL 162.A N TRP 134.A O VAL 162.A H 2.844 1.995 LEU 164.A N VAL 136.A O LEU 164.A H 2.984 2.126 LYS 165.A N HIS 169.A ND1 LYS 165.A H 3.000 2.151 LYS 165.A NZ ASP 166.A OD2 LYS 165.A HZ2 2.957 2.213 HIS 169.A N ASP 166.A OD1 HIS 169.A H 2.829 1.981 ALA 170.A N ASP 166.A O ALA 170.A H 2.979 2.159 ILE 171.A N LEU 167.A O ILE 171.A H 2.945 2.109 GLU 172.A N ASN 168.A O GLU 172.A H 2.931 2.082 THR 173.A N HIS 169.A O THR 173.A H 2.966 2.140 THR 173.A OG1 HIS 169.A O THR 173.A HG1 2.862 2.066 LEU 174.A N ALA 170.A O LEU 174.A H 2.901 2.054 ARG 175.A N ILE 171.A O ARG 175.A H 2.891 2.058 ARG 175.A NE ASP 195.A OD2 ARG 175.A HE 2.778 1.959 ARG 175.A NH2 ASP 195.A OD1 ARG 175.A HH21 2.934 2.074 ARG 175.A NH2 ASP 195.A OD2 ARG 175.A HH21 3.530 2.926 GLY 176.A N THR 173.A O GLY 176.A H 3.073 2.345 GLY 177.A N LEU 174.A O GLY 177.A H 3.092 2.241 VAL 180.A N LYS 133.A O VAL 180.A H 2.884 2.070 PHE 181.A N VAL 112.A O PHE 181.A H 2.897 2.139 ILE 182.A N GLY 135.A O ILE 182.A H 3.184 2.337 ASP 183.A N LYS 110.A O.A ASP 183.A H 2.860 2.025 ASP 183.A N LYS 110.A O.B ASP 183.A H 2.896 2.052 GLY 185.A N GLY 108.A O GLY 185.A H 2.913 2.078 LEU 188.A N GLU 184.A O LEU 188.A H 2.979 2.136 ALA 189.A N GLY 185.A O ALA 189.A H 2.818 1.987 HIS 190.A N PRO 186.A O HIS 190.A H 3.131 2.294 ASN 191.A N VAL 187.A O ASN 191.A H 3.079 2.243 ASN 191.A ND2 GLN 14.A O ASN 191.A HD21 2.874 2.080 ASN 191.A ND2 VAL 187.A O ASN 191.A HD22 2.840 2.028 LEU 192.A N LEU 188.A O LEU 192.A H 2.990 2.261 ASP 195.A N LEU 192.A O ASP 195.A H 3.001 2.197 ASP 197.A N ASP 197.A OD1 ASP 197.A H 2.649 2.020 VAL 198.A N ASP 195.A O VAL 198.A H 3.066 2.215 PHE 199.A N VAL 113.A O PHE 199.A H 2.778 1.941 VAL 201.A N ALA 111.A O VAL 201.A H.B 2.825 2.003 PHE 205.A N ILE 109.A O PHE 205.A H 2.980 2.193 PHE 208.A N ALA 107.A O PHE 208.A H 3.015 2.182 GLU 209.A N THR 90.A OG1 GLU 209.A H 2.981 2.150 TYR 210.A N MET 105.A O TYR 210.A H 2.824 2.007 TYR 210.A OH GLU 184.A OE1 TYR 210.A HH 2.755 1.950 ALA 211.A N LEU 88.A O ALA 211.A H 2.993 2.190 PHE 212.A N SER 101.A OG PHE 212.A H 2.928 2.090 GLY 213.A N ILE 84.A O GLY 213.A H 2.972 2.192 LEU 214.A N ASP 99.A O LEU 214.A H 2.897 2.046 LYS 216.A NZ SER 96.A O.A LYS 216.A HZ1 3.282 2.741 LYS 216.A NZ SER 96.A O.B LYS 216.A HZ1 2.821 2.260 SER 218.A N PRO 215.A O SER 218.A H 3.080 2.292 TYR 220.A N SER 218.A OG TYR 220.A H 3.015 2.168 LYS 221.A NZ TYR 100.A O LYS 221.A HZ3 2.798 1.941 LYS 221.A NZ ASP 225.A OD1 LYS 221.A HZ2 3.494 2.703 LYS 221.A NZ ASP 225.A OD2 LYS 221.A HZ2 2.695 1.897 ILE 224.A N TYR 220.A O ILE 224.A H 3.036 2.183 ASP 225.A N LYS 221.A O ASP 225.A H 2.822 1.965 SER 226.A N SER 222.A O.A SER 226.A H.B 2.909 2.071 SER 226.A N SER 222.A O.B SER 226.A H.B 3.042 2.209 HIS 227.A N LEU 223.A O HIS 227.A H 3.011 2.183 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 2.885 2.042 LEU 229.A N.A ASP 225.A O LEU 229.A H.A 3.020 2.184 LEU 229.A N.B ASP 225.A O LEU 229.A H.B 2.995 2.164 LYS 230.A N SER 226.A O LYS 230.A H.A 3.040 2.208 PHE 231.A N HIS 227.A O PHE 231.A H 2.912 2.093 ARG 232.A N LEU 228.A O ARG 232.A H 3.088 2.281 ARG 232.A NH1 PRO 103.A O ARG 232.A HH11 3.446 2.785 GLU 233.A N LEU 229.A O.A GLU 233.A H 2.865 2.022 GLU 233.A N LEU 229.A O.B GLU 233.A H 2.943 2.104 GLU 234.A N LYS 230.A O GLU 234.A H 2.873 2.078 GLY 235.A N ARG 232.A O GLY 235.A H 3.114 2.303 PHE 236.A N PHE 231.A O PHE 236.A H 2.883 2.196 ILE 239.A N GLY 235.A O ILE 239.A H 2.996 2.170 LEU 240.A N PHE 236.A O LEU 240.A H 2.898 2.075 TRP 241.A N ILE 237.A O TRP 241.A H 3.032 2.218 GLU 242.A N.A ASP 238.A O GLU 242.A H.A 3.035 2.192 GLU 242.A N.B ASP 238.A O GLU 242.A H.B 3.030 2.197 LYS 243.A N ILE 239.A O LYS 243.A H.A 2.981 2.180 LYS 243.A NZ ASP 36.A OD2 LYS 243.A HZ3 2.779 1.889 TRP 244.A N LEU 240.A O TRP 244.A H 2.954 2.175 TRP 244.A NE1 ASP 36.A OD2 TRP 244.A HE1 2.837 2.007 SER 245.A N.A TRP 241.A O SER 245.A H.A 2.890 2.050 SER 245.A N.B TRP 241.A O SER 245.A H.B 2.881 2.047 SER 245.A OG.A TRP 241.A O SER 245.A HG.A 2.748 1.985 SER 246.A N HIS 190.A ND1 SER 246.A H.A 3.224 2.488