Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ykj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N GLY 46.A O GLY 3.A H 2.986 2.138 ARG 4.A N LEU 1.A O ARG 4.A H 2.976 2.138 HIS 5.A ND1 THR 48.A OG1 no hydrogen 2.817 N/A HIS 5.A NE2 GLU 50.A OE2 HIS 5.A HE2 2.785 1.936 LEU 6.A N THR 48.A O LEU 6.A H 2.832 2.007 ARG 7.A N ASP 82.A OD2 ARG 7.A H 2.824 1.965 ARG 7.A NE ASP 82.A OD2 ARG 7.A HE 3.013 2.158 ARG 7.A NH1 ASP 79.A O ARG 7.A HH12 2.885 2.145 ARG 7.A NH2 ASP 79.A O ARG 7.A HH22 3.307 2.695 ARG 7.A NH2 ASP 79.A OD1 ARG 7.A HH22 3.057 2.285 ARG 7.A NH2 ASP 82.A OD1 ARG 7.A HH21 2.913 2.059 LEU 8.A N GLU 50.A O LEU 8.A H 2.814 1.974 GLY 9.A N MET 83.A O GLY 9.A H 2.807 2.010 SER 10.A N ILE 52.A O SER 10.A H 3.300 2.538 SER 10.A OG ALA 85.A O SER 10.A HG 2.809 2.181 GLU 13.A N MET 17.A O GLU 13.A H 2.877 2.071 MET 17.A N GLU 13.A O MET 17.A H 2.916 2.084 PHE 18.A N SER 31.A O PHE 18.A H 2.734 1.920 PHE 19.A N GLU 12.A OE2 PHE 19.A H 2.841 2.014 ALA 20.A N CYS 29.A O ALA 20.A H 2.841 1.993 CYS 24.A SG ALA 20.A O no hydrogen 3.483 N/A CYS 24.A SG GLU 22.A O no hydrogen 3.694 N/A ASN 27.A ND2 TYR 49.A O ASN 27.A HD21 2.934 2.093 ASP 28.A N GLU 25.A O ASP 28.A H 3.191 2.463 CYS 29.A N GLY 26.A O CYS 29.A H 3.146 2.294 CYS 29.A SG GLY 26.A O no hydrogen 3.643 N/A TRP 30.A N ASN 27.A O TRP 30.A H 3.036 2.197 SER 31.A N PHE 18.A O SER 31.A H 3.080 2.324 MET 33.A N PRO 15.A O MET 33.A H 3.149 2.298 VAL 34.A N PHE 16.A O VAL 34.A H 2.856 2.047 ASP 36.A N GLY 32.A O ASP 36.A H 2.952 2.139 MET 37.A N MET 33.A O MET 37.A H 3.067 2.263 VAL 38.A N VAL 34.A O VAL 38.A H 2.895 2.076 VAL 39.A N ASN 35.A O VAL 39.A H 2.854 2.013 LYS 40.A N ASP 36.A O LYS 40.A H 3.105 2.279 LYS 40.A NZ ASP 44.A OD2 LYS 40.A HZ3 3.189 2.375 LEU 41.A N MET 37.A O LEU 41.A H 2.876 2.025 SER 42.A N.A VAL 38.A O SER 42.A H.A 2.780 1.949 SER 42.A N.B VAL 38.A O SER 42.A H.B 2.798 1.982 SER 42.A OG.A PHE 47.A O SER 42.A HG.A 2.610 1.799 SER 42.A OG.B VAL 38.A O SER 42.A HG.B 3.553 3.002 SER 42.A OG.B VAL 39.A O SER 42.A HG.B 2.782 1.999 GLU 43.A N VAL 39.A O GLU 43.A H.B 3.014 2.215 ASP 44.A N LYS 40.A O ASP 44.A H 2.962 2.156 LEU 45.A N LEU 41.A O LEU 45.A H 2.812 2.008 GLY 46.A N SER 42.A O.A GLY 46.A H 2.800 2.036 GLY 46.A N SER 42.A O.B GLY 46.A H 2.896 2.147 THR 48.A N ARG 4.A O THR 48.A H 2.911 2.128 GLU 50.A N LEU 6.A O GLU 50.A H 3.122 2.357 TYR 51.A OH ASN 35.A OD1 TYR 51.A HH 2.813 2.065 ILE 52.A N LEU 8.A O ILE 52.A H 2.778 1.964 ARG 57.A N.A PRO 54.A O ARG 57.A H.A 2.951 2.154 ARG 57.A N.B PRO 54.A O ARG 57.A H.B 3.008 2.186 ARG 57.A NH1.A PRO 54.A O ARG 57.A HH11.A 2.814 2.091 LYS 58.A N ASP 56.A OD1 LYS 58.A H.A 2.944 2.087 GLY 60.A N SER 139.A O GLY 60.A H 2.875 2.018 ALA 61.A N ASN 70.A OD1 ALA 61.A H 2.917 2.104 ASN 63.A N GLU 68.A O ASN 63.A H 2.966 2.108 LYS 64.A NZ.A LEU 62.A O LYS 64.A HZ1.A 2.720 1.971 THR 65.A N ASN 63.A OD1 THR 65.A H.B 2.912 2.214 THR 66.A N ASN 63.A OD1 THR 66.A H 3.056 2.263 ASN 67.A N ASN 63.A O ASN 67.A H 2.661 2.021 GLU 68.A N THR 66.A OG1 GLU 68.A H 3.171 2.459 ASN 70.A N ALA 61.A O ASN 70.A H 3.342 2.628 ASN 70.A ND2 SER 139.A OG ASN 70.A HD21 2.932 2.081 GLY 71.A N ASP 56.A OD2 GLY 71.A H 2.837 1.991 MET 72.A N LYS 58.A O MET 72.A H 3.064 2.371 ILE 73.A N PHE 59.A O ILE 73.A H 3.317 2.537 ARG 74.A N ASN 70.A O ARG 74.A H 3.093 2.269 ARG 74.A NE ASP 78.A OD1 ARG 74.A HE 3.125 2.330 ARG 74.A NE ASP 78.A OD2 ARG 74.A HE 3.154 2.561 ARG 74.A NH1 GLU 68.A OE1 ARG 74.A HH12 3.071 2.270 ARG 74.A NH1 TRP 69.A O ARG 74.A HH11 2.948 2.143 ASP 75.A N GLY 71.A O ASP 75.A H 3.118 2.297 LEU 76.A N MET 72.A O LEU 76.A H 3.018 2.197 LEU 77.A N ILE 73.A O LEU 77.A H 2.978 2.154 ASP 78.A N ARG 74.A O ASP 78.A H 2.840 2.069 ASP 79.A N LEU 76.A O ASP 79.A H 2.961 2.131 LYS 80.A N ASP 75.A O LYS 80.A H 2.884 2.061 ASP 82.A N ARG 7.A O ASP 82.A H 2.735 1.896 ILE 84.A N GLY 213.A O ILE 84.A H 2.835 2.014 ALA 85.A N GLY 9.A O ALA 85.A H 2.847 2.065 LEU 88.A N ALA 211.A O LEU 88.A H 3.229 2.452 SER 89.A OG GLU 184.A OE2 SER 89.A HG 2.726 1.964 THR 90.A N GLU 209.A O THR 90.A H 2.950 2.183 ASN 91.A N TYR 100.A OH ASN 91.A H 3.209 2.445 ASN 91.A ND2 HIS 141.A ND1 ASN 91.A HD22 3.016 2.161 ARG 94.A N ASN 91.A OD1 ARG 94.A H 2.829 1.976 ARG 94.A NE GLY 60.A O ARG 94.A HE 3.396 2.661 ARG 94.A NH1 SER 89.A O ARG 94.A HH11 3.043 2.289 ARG 94.A NH2 GLY 60.A O ARG 94.A HH21 3.037 2.206 LYS 95.A N.A ASN 91.A O LYS 95.A H.A 3.008 2.191 LYS 95.A N.B ASN 91.A O LYS 95.A H.B 3.001 2.195 LYS 95.A NZ.A LYS 95.A O.A LYS 95.A HZ2.A 2.935 2.079 LYS 95.A NZ.A ASP 99.A OD1 LYS 95.A HZ3.A 3.011 2.251 SER 96.A N.A SER 92.A O.A SER 96.A H.A 3.073 2.352 SER 96.A N.A SER 92.A O.B SER 96.A H.A 3.122 2.406 SER 96.A N.A ALA 93.A O SER 96.A H.A 3.210 2.536 SER 96.A N.B SER 92.A O.A SER 96.A H.B 3.116 2.424 SER 96.A N.B SER 92.A O.B SER 96.A H.B 3.165 2.478 SER 96.A N.B ALA 93.A O SER 96.A H.B 3.284 2.566 SER 96.A OG.A ALA 93.A O SER 96.A HG.A 2.811 2.006 SER 96.A OG.B ALA 93.A O SER 96.A HG.B 2.501 1.749 ALA 97.A N ARG 94.A O ALA 97.A H.B 2.849 2.052 ILE 98.A N ARG 94.A O ILE 98.A H 2.816 2.021 ASP 99.A N LEU 214.A O ASP 99.A H 2.812 2.019 TYR 100.A OH SER 89.A O TYR 100.A HH 2.755 2.129 SER 101.A N PHE 212.A O SER 101.A H 2.849 2.020 SER 101.A OG PHE 102.A O SER 101.A HG 2.822 1.997 PHE 102.A N ASP 225.A OD1 PHE 102.A H 2.832 2.071 PHE 104.A N TYR 210.A O PHE 104.A H 2.853 2.060 ALA 107.A N PHE 208.A O ALA 107.A H 2.996 2.172 ILE 109.A N PHE 205.A O ILE 109.A H 2.973 2.154 LYS 110.A N ASP 183.A O LYS 110.A H 2.890 2.061 VAL 112.A N PHE 181.A O VAL 112.A H 2.963 2.147 VAL 113.A N PHE 199.A O VAL 113.A H 2.885 2.130 LYS 114.A NZ ARG 175.A O LYS 114.A HZ3 2.768 2.034 GLY 115.A N ASP 197.A O GLY 115.A H 2.763 1.921 THR 118.A OG1 TYR 132.A OH THR 118.A HG1 3.226 2.403 LEU 120.A N THR 118.A OG1 LEU 120.A H 3.308 2.454 ASN 121.A N GLU 125.A OE1 ASN 121.A H 2.785 1.926 GLN 122.A NE2 TYR 154.A OH GLN 122.A HE22 2.921 2.219 LEU 124.A N GLN 122.A OE1 LEU 124.A H 2.815 1.988 GLU 125.A N GLN 122.A O GLU 125.A H 2.962 2.150 LEU 126.A N VAL 123.A O LEU 126.A H 2.967 2.129 LEU 127.A N LEU 124.A O LEU 127.A H 3.119 2.294 ASP 128.A N GLU 125.A O ASP 128.A H 3.096 2.258 GLN 129.A NE2 LEU 126.A O GLN 129.A HE21 2.942 2.086 GLN 129.A NE2 TYR 132.A O GLN 129.A HE22 3.019 2.161 TYR 132.A N GLN 129.A OE1 TYR 132.A H 2.818 1.967 LYS 133.A N LEU 178.A O LYS 133.A H 3.035 2.221 TRP 134.A NE1 LEU 157.A O TRP 134.A HE1 2.784 1.955 GLY 135.A N VAL 180.A O GLY 135.A H 3.018 2.294 GLY 138.A N LEU 164.A O GLY 138.A H 3.061 2.255 SER 139.A N GLU 143.A OE2 SER 139.A H 2.814 1.996 ARG 140.A NE ASP 183.A OD1 ARG 140.A HE 2.688 1.941 ARG 140.A NH1 GLU 13.A OE1 ARG 140.A HH12 2.797 1.952 ARG 140.A NH2 GLU 13.A OE1 ARG 140.A HH22 3.376 2.718 ARG 140.A NH2 GLU 13.A OE2 ARG 140.A HH22 2.938 2.245 ARG 140.A NH2 ASP 183.A OD2 ARG 140.A HH21 2.993 2.172 THR 144.A N ARG 140.A O THR 144.A H 3.426 2.621 LEU 145.A N HIS 141.A O LEU 145.A H 2.877 2.063 LEU 146.A N PRO 142.A O LEU 146.A H 2.948 2.110 LYS 147.A N GLU 143.A O LYS 147.A H 3.001 2.178 LYS 147.A NZ ASP 159.A OD1 LYS 147.A HZ3 2.867 1.979 LYS 147.A NZ ASP 159.A OD2 LYS 147.A HZ3 3.470 2.835 THR 148.A N THR 144.A O THR 148.A H 3.022 2.373 THR 148.A N LEU 145.A O THR 148.A H 3.327 2.612 THR 148.A OG1 THR 144.A O THR 148.A HG1 2.885 2.080 THR 148.A OG1 LEU 145.A O THR 148.A HG1 3.474 3.000 ASP 151.A N HIS 149.A ND1 ASP 151.A H 3.007 2.156 ARG 153.A N ASP 151.A OD1 ARG 153.A H 3.011 2.174 ARG 153.A NE ASP 151.A OD1 ARG 153.A HE 3.119 2.271 ARG 153.A NE ASP 151.A OD2 ARG 153.A HE 3.280 2.649 ARG 153.A NH2 ASP 151.A OD2 ARG 153.A HH21 2.736 1.940 TYR 154.A N ASP 151.A O TYR 154.A H 3.025 2.186 SER 155.A N.A SER 152.A O SER 155.A H.A 3.012 2.449 ARG 156.A N SER 152.A O ARG 156.A H.B 3.044 2.242 ARG 156.A NE GLU 160.A OE2 ARG 156.A HE 2.814 1.956 ARG 156.A NH2 GLU 160.A OE1 ARG 156.A HH21 2.936 2.105 LEU 157.A N ARG 153.A O LEU 157.A H 3.062 2.288 VAL 158.A N TYR 154.A O VAL 158.A H 3.159 2.344 ASP 159.A N SER 155.A O.A ASP 159.A H 2.930 2.081 ASP 159.A N SER 155.A O.B ASP 159.A H 2.839 1.987 GLU 160.A N ARG 156.A O GLU 160.A H 2.859 2.093 GLY 161.A N VAL 158.A O GLY 161.A H 3.267 2.460 VAL 162.A N TRP 134.A O VAL 162.A H 2.816 1.970 LEU 164.A N VAL 136.A O LEU 164.A H 3.133 2.275 LYS 165.A N HIS 169.A ND1 LYS 165.A H 2.992 2.144 LYS 165.A NZ ASP 166.A OD2 LYS 165.A HZ1 2.974 2.259 HIS 169.A N ASP 166.A OD1 HIS 169.A H 2.884 2.052 ALA 170.A N ASP 166.A O ALA 170.A H 2.975 2.161 ILE 171.A N LEU 167.A O ILE 171.A H 2.936 2.097 GLU 172.A N ASN 168.A O GLU 172.A H 2.995 2.154 THR 173.A N HIS 169.A O THR 173.A H 2.975 2.171 THR 173.A OG1 HIS 169.A O THR 173.A HG1 2.814 2.007 LEU 174.A N ALA 170.A O LEU 174.A H 2.855 2.020 ARG 175.A N ILE 171.A O ARG 175.A H 2.880 2.048 ARG 175.A NE ASP 195.A OD2 ARG 175.A HE 2.802 1.995 ARG 175.A NH2 ASP 195.A OD1 ARG 175.A HH21 2.813 1.953 ARG 175.A NH2 ASP 195.A OD2 ARG 175.A HH21 3.510 2.902 GLY 176.A N GLU 172.A O GLY 176.A H 3.034 2.391 GLY 176.A N THR 173.A O GLY 176.A H 3.122 2.456 GLY 177.A N LEU 174.A O GLY 177.A H 2.997 2.178 VAL 180.A N LYS 133.A O VAL 180.A H 2.909 2.094 PHE 181.A N VAL 112.A O PHE 181.A H 2.946 2.190 ILE 182.A N GLY 135.A O ILE 182.A H 3.128 2.285 ASP 183.A N LYS 110.A O ASP 183.A H 2.861 2.015 GLY 185.A N GLY 108.A O GLY 185.A H 2.894 2.061 LEU 188.A N GLU 184.A O LEU 188.A H 3.010 2.161 ALA 189.A N GLY 185.A O ALA 189.A H 2.758 1.943 HIS 190.A N PRO 186.A O HIS 190.A H 3.165 2.337 ASN 191.A N VAL 187.A O ASN 191.A H 3.038 2.199 ASN 191.A ND2 GLN 14.A O ASN 191.A HD21 2.938 2.139 ASN 191.A ND2 VAL 187.A O ASN 191.A HD22 2.864 2.041 LEU 192.A N LEU 188.A O LEU 192.A H 2.965 2.197 ASP 195.A N LEU 192.A O ASP 195.A H 3.001 2.208 ASP 197.A N ASP 197.A OD1 ASP 197.A H 2.628 1.998 VAL 198.A N ASP 195.A O VAL 198.A H 3.224 2.396 PHE 199.A N VAL 113.A O PHE 199.A H 2.820 1.990 SER 200.A OG.A GLY 202.A O SER 200.A HG.A 2.810 2.231 VAL 201.A N ALA 111.A O VAL 201.A H.B 2.814 1.983 PHE 205.A N ILE 109.A O PHE 205.A H 3.056 2.284 PHE 208.A N ALA 107.A O PHE 208.A H 3.037 2.182 GLU 209.A N THR 90.A OG1 GLU 209.A H 2.996 2.162 TYR 210.A N MET 105.A O TYR 210.A H 2.854 2.016 TYR 210.A OH GLU 184.A OE1 TYR 210.A HH 2.726 1.969 ALA 211.A N LEU 88.A O ALA 211.A H 2.940 2.145 PHE 212.A N SER 101.A OG PHE 212.A H 2.918 2.081 GLY 213.A N ILE 84.A O GLY 213.A H 3.016 2.240 LEU 214.A N ASP 99.A O LEU 214.A H 2.863 2.010 SER 218.A N PRO 215.A O SER 218.A H 3.110 2.374 TYR 220.A N SER 218.A OG TYR 220.A H 3.038 2.192 LYS 221.A NZ TYR 100.A O LYS 221.A HZ2 2.711 1.860 LYS 221.A NZ ASP 225.A OD2 LYS 221.A HZ1 2.721 1.934 ILE 224.A N TYR 220.A O ILE 224.A H 3.043 2.185 ASP 225.A N LYS 221.A O ASP 225.A H 2.815 1.964 SER 226.A N.A SER 222.A O.A SER 226.A H.A 2.988 2.169 SER 226.A N.A SER 222.A O.B SER 226.A H.A 3.142 2.327 SER 226.A N.B SER 222.A O.A SER 226.A H.B 2.962 2.123 SER 226.A N.B SER 222.A O.B SER 226.A H.B 3.117 2.285 SER 226.A OG.A SER 222.A O.A SER 226.A HG.A 3.314 2.583 SER 226.A OG.A SER 222.A O.B SER 226.A HG.A 3.241 2.535 SER 226.A OG.A LEU 223.A O SER 226.A HG.A 3.193 2.612 HIS 227.A N LEU 223.A O HIS 227.A H.B 3.067 2.242 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 2.874 2.035 LEU 229.A N.A ASP 225.A O LEU 229.A H.A 2.924 2.076 LEU 229.A N.B ASP 225.A O LEU 229.A H.B 2.917 2.077 LYS 230.A N.A SER 226.A O.A LYS 230.A H.A 3.168 2.336 LYS 230.A N.A SER 226.A O.B LYS 230.A H.A 3.045 2.210 LYS 230.A N.B SER 226.A O.A LYS 230.A H.B 3.121 2.299 LYS 230.A N.B SER 226.A O.B LYS 230.A H.B 3.001 2.176 PHE 231.A N HIS 227.A O PHE 231.A H.A 2.940 2.116 ARG 232.A N.A LEU 228.A O ARG 232.A H.A 3.091 2.306 ARG 232.A N.B LEU 228.A O ARG 232.A H.B 3.075 2.276 ARG 232.A N.B LEU 229.A O.A ARG 232.A H.B 3.027 2.523 ARG 232.A NH1.A PRO 103.A O ARG 232.A HH11.A 3.340 2.702 ARG 232.A NH2.A ASP 106.A OD2 ARG 232.A HH22.A 3.109 2.479 GLU 233.A N LEU 229.A O.A GLU 233.A H.A 2.836 1.994 GLU 233.A N LEU 229.A O.B GLU 233.A H.A 2.898 2.052 GLU 234.A N LYS 230.A O.A GLU 234.A H 2.861 2.051 GLU 234.A N LYS 230.A O.B GLU 234.A H 2.855 2.046 GLY 235.A N ARG 232.A O.A GLY 235.A H 3.119 2.309 GLY 235.A N ARG 232.A O.B GLY 235.A H 3.156 2.345 PHE 236.A N PHE 231.A O PHE 236.A H 2.897 2.207 ILE 239.A N GLY 235.A O ILE 239.A H 3.044 2.215 LEU 240.A N PHE 236.A O LEU 240.A H 2.938 2.109 TRP 241.A N ILE 237.A O TRP 241.A H 2.920 2.105 GLU 242.A N.A ASP 238.A O GLU 242.A H.A 2.995 2.166 GLU 242.A N.B ASP 238.A O GLU 242.A H.B 3.003 2.178 LYS 243.A N ILE 239.A O LYS 243.A H.A 2.948 2.145 LYS 243.A NZ ASP 36.A OD2 LYS 243.A HZ3 2.792 1.907 TRP 244.A N LEU 240.A O TRP 244.A H 2.961 2.182 TRP 244.A NE1 ASP 36.A OD2 TRP 244.A HE1 2.763 1.926 SER 245.A N TRP 241.A O SER 245.A H 2.866 2.026 SER 245.A OG TRP 241.A O SER 245.A HG 2.764 1.982 SER 246.A N HIS 190.A ND1 SER 246.A H 3.208 2.435