Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ykk_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 47.A O GLY 4.A H 2.961 2.112 ARG 5.A N LEU 2.A O ARG 5.A H 3.001 2.172 HIS 6.A ND1 THR 49.A OG1 no hydrogen 2.823 N/A HIS 6.A NE2 GLU 51.A OE2 HIS 6.A HE2 2.786 1.934 LEU 7.A N THR 49.A O LEU 7.A H 2.833 2.009 ARG 8.A N ASP 83.A OD2 ARG 8.A H 2.835 1.976 ARG 8.A NE ASP 83.A OD2 ARG 8.A HE 3.016 2.158 ARG 8.A NH1 ASP 80.A O ARG 8.A HH12 2.857 2.121 ARG 8.A NH2 ASP 80.A O ARG 8.A HH22 3.282 2.672 ARG 8.A NH2 ASP 80.A OD1 ARG 8.A HH22 3.067 2.300 ARG 8.A NH2 ASP 83.A OD1 ARG 8.A HH21 2.936 2.082 LEU 9.A N GLU 51.A O LEU 9.A H 2.802 1.961 GLY 10.A N MET 84.A O GLY 10.A H 2.807 2.013 SER 11.A N ILE 53.A O SER 11.A H 3.260 2.501 SER 11.A OG ALA 86.A O SER 11.A HG 2.803 2.164 GLU 14.A N MET 18.A O GLU 14.A H 2.867 2.074 PHE 17.A N GLU 14.A O PHE 17.A H 2.835 2.221 MET 18.A N GLU 14.A O MET 18.A H 2.971 2.141 PHE 19.A N SER 32.A O PHE 19.A H 2.740 1.918 PHE 20.A N GLU 13.A OE2 PHE 20.A H 2.905 2.076 ALA 21.A N CYS 30.A O ALA 21.A H 2.871 2.022 CYS 25.A SG ALA 21.A O no hydrogen 3.486 N/A CYS 25.A SG GLU 23.A O no hydrogen 3.680 N/A ASN 28.A ND2 TYR 50.A O ASN 28.A HD21 2.958 2.115 ASP 29.A N GLU 26.A O ASP 29.A H 3.156 2.432 CYS 30.A N GLY 27.A O CYS 30.A H 3.077 2.226 TRP 31.A N ASN 28.A O TRP 31.A H 3.006 2.161 SER 32.A N PHE 19.A O SER 32.A H 3.062 2.291 MET 34.A N PRO 16.A O MET 34.A H 3.121 2.269 VAL 35.A N PHE 17.A O VAL 35.A H 2.870 2.071 ASN 36.A ND2 TYR 52.A OH ASN 36.A HD22 2.795 2.007 ASP 37.A N GLY 33.A O ASP 37.A H 2.945 2.125 MET 38.A N MET 34.A O MET 38.A H 3.070 2.262 VAL 39.A N VAL 35.A O VAL 39.A H 2.878 2.059 VAL 40.A N ASN 36.A O VAL 40.A H 2.882 2.039 LYS 41.A N ASP 37.A O LYS 41.A H 3.102 2.268 LYS 41.A NZ ASP 45.A OD2 LYS 41.A HZ3 3.085 2.306 LEU 42.A N MET 38.A O LEU 42.A H 2.874 2.020 SER 43.A N.A VAL 39.A O SER 43.A H.A 2.784 1.958 SER 43.A N.B VAL 39.A O SER 43.A H.B 2.797 1.989 SER 43.A OG.A PHE 48.A O SER 43.A HG.A 2.603 1.810 SER 43.A OG.B VAL 40.A O SER 43.A HG.B 2.749 1.946 GLU 44.A N VAL 40.A O GLU 44.A H.B 3.001 2.214 ASP 45.A N LYS 41.A O ASP 45.A H 2.981 2.167 LEU 46.A N LEU 42.A O LEU 46.A H 2.831 2.043 GLY 47.A N SER 43.A O.A GLY 47.A H 2.779 2.010 GLY 47.A N SER 43.A O.B GLY 47.A H 2.911 2.163 THR 49.A N ARG 5.A O THR 49.A H 2.928 2.159 GLU 51.A N LEU 7.A O GLU 51.A H 3.119 2.349 ILE 53.A N LEU 9.A O ILE 53.A H 2.788 1.968 ARG 58.A N PRO 55.A O ARG 58.A H 2.959 2.145 ARG 58.A NH1 PRO 55.A O ARG 58.A HH11 2.833 2.096 LYS 59.A N ASP 57.A OD1 LYS 59.A H 2.969 2.120 GLY 61.A N SER 140.A O GLY 61.A H 2.867 2.007 ALA 62.A N ASN 71.A OD1 ALA 62.A H 2.905 2.096 ASN 64.A N GLU 69.A O ASN 64.A H 2.973 2.120 THR 66.A N ASN 64.A OD1 THR 66.A H 2.819 2.119 THR 67.A N ASN 64.A OD1 THR 67.A H 3.025 2.262 ASN 68.A N ASN 64.A O ASN 68.A H 2.726 2.089 GLU 69.A N THR 67.A OG1 GLU 69.A H 3.223 2.488 ASN 71.A ND2 SER 140.A OG ASN 71.A HD21 2.930 2.076 GLY 72.A N ASP 57.A OD2 GLY 72.A H 2.853 2.006 MET 73.A N LYS 59.A O MET 73.A H 3.095 2.415 ILE 74.A N PHE 60.A O ILE 74.A H 3.326 2.551 ARG 75.A N ASN 71.A O ARG 75.A H 3.064 2.241 ARG 75.A NE ASP 79.A OD1 ARG 75.A HE 3.079 2.270 ARG 75.A NH1 GLU 69.A OE1 ARG 75.A HH12 3.097 2.446 ARG 75.A NH1 TRP 70.A O ARG 75.A HH11 2.924 2.111 ARG 75.A NH2 GLU 69.A OE1 ARG 75.A HH22 3.288 2.684 ASP 76.A N GLY 72.A O ASP 76.A H 3.114 2.298 LEU 77.A N MET 73.A O LEU 77.A H 3.024 2.197 LEU 78.A N ILE 74.A O LEU 78.A H 2.977 2.151 ASP 79.A N ARG 75.A O ASP 79.A H 2.872 2.107 ASP 80.A N LEU 77.A O ASP 80.A H 2.954 2.124 LYS 81.A N ASP 76.A O LYS 81.A H 2.880 2.056 ASP 83.A N ARG 8.A O ASP 83.A H 2.747 1.914 ILE 85.A N GLY 214.A O ILE 85.A H 2.822 1.997 ALA 86.A N GLY 10.A O ALA 86.A H 2.840 2.049 LEU 89.A N ALA 212.A O LEU 89.A H 3.206 2.433 SER 90.A OG GLU 185.A OE2 SER 90.A HG 2.744 1.965 THR 91.A N GLU 210.A O THR 91.A H 2.935 2.175 ASN 92.A N TYR 101.A OH ASN 92.A H 3.166 2.391 ASN 92.A ND2 HIS 142.A ND1 ASN 92.A HD22 3.016 2.161 ARG 95.A N ASN 92.A OD1 ARG 95.A H 2.847 1.993 ARG 95.A NE GLY 61.A O ARG 95.A HE 3.410 2.679 ARG 95.A NH1 SER 90.A O ARG 95.A HH11 3.042 2.288 ARG 95.A NH2 GLY 61.A O ARG 95.A HH21 3.033 2.203 LYS 96.A N.A ASN 92.A O LYS 96.A H.A 3.015 2.197 LYS 96.A N.B ASN 92.A O LYS 96.A H.B 3.020 2.214 LYS 96.A NZ.A LYS 96.A O.A LYS 96.A HZ2.A 2.864 2.013 LYS 96.A NZ.A ASP 100.A OD1 LYS 96.A HZ3.A 3.001 2.246 SER 97.A N.A SER 93.A O.A SER 97.A H.A 3.091 2.416 SER 97.A N.A SER 93.A O.B SER 97.A H.A 3.139 2.471 SER 97.A N.A ALA 94.A O SER 97.A H.A 3.191 2.467 SER 97.A N.B SER 93.A O.A SER 97.A H.B 3.153 2.446 SER 97.A N.B SER 93.A O.B SER 97.A H.B 3.201 2.500 SER 97.A N.B ALA 94.A O SER 97.A H.B 3.312 2.597 SER 97.A OG.A ALA 94.A O SER 97.A HG.A 2.616 1.784 SER 97.A OG.B SER 93.A O.A SER 97.A HG.B 3.400 2.604 SER 97.A OG.B SER 93.A O.B SER 97.A HG.B 3.355 2.557 ALA 98.A N ARG 95.A O ALA 98.A H.A 2.866 2.041 ILE 99.A N ARG 95.A O ILE 99.A H 2.828 2.036 ASP 100.A N LEU 215.A O ASP 100.A H 2.794 1.984 TYR 101.A OH SER 90.A O TYR 101.A HH 2.747 2.130 SER 102.A N PHE 213.A O SER 102.A H 2.871 2.041 SER 102.A OG PHE 103.A O SER 102.A HG 2.805 1.985 PHE 103.A N ASP 226.A OD1 PHE 103.A H 2.847 2.088 PHE 105.A N TYR 211.A O PHE 105.A H 2.842 2.029 ASP 107.A N.B ASP 107.A OD1.B ASP 107.A H.B 2.650 2.022 ALA 108.A N PHE 209.A O ALA 108.A H.A 2.962 2.159 ILE 110.A N PHE 206.A O ILE 110.A H 2.954 2.149 LYS 111.A N ASP 184.A O LYS 111.A H 2.869 2.035 VAL 113.A N PHE 182.A O VAL 113.A H 2.918 2.098 VAL 114.A N PHE 200.A O VAL 114.A H 2.828 2.077 LYS 115.A NZ ARG 176.A O LYS 115.A HZ3 2.706 2.002 GLY 116.A N ASP 198.A O GLY 116.A H 2.747 1.901 THR 119.A OG1 TYR 133.A OH THR 119.A HG1 3.247 2.427 LEU 121.A N THR 119.A OG1 LEU 121.A H 3.255 2.404 ASN 122.A N GLU 126.A OE1 ASN 122.A H 2.810 1.955 GLN 123.A NE2 TYR 155.A OH GLN 123.A HE22 3.074 2.394 LEU 125.A N GLN 123.A OE1 LEU 125.A H 2.760 1.929 GLU 126.A N GLN 123.A O GLU 126.A H 2.989 2.185 LEU 127.A N VAL 124.A O LEU 127.A H 2.941 2.101 LEU 128.A N LEU 125.A O LEU 128.A H 3.139 2.298 ASP 129.A N GLU 126.A O ASP 129.A H 3.077 2.236 GLN 130.A NE2 LEU 127.A O GLN 130.A HE21 3.046 2.190 GLN 130.A NE2 TYR 133.A O GLN 130.A HE22 3.042 2.193 LYS 132.A N GLN 130.A OE1 LYS 132.A H 2.980 2.390 TYR 133.A N GLN 130.A OE1 TYR 133.A H 2.889 2.047 LYS 134.A N LEU 179.A O LYS 134.A H 3.011 2.203 TRP 135.A NE1 LEU 158.A O TRP 135.A HE1 2.756 1.925 GLY 136.A N VAL 181.A O GLY 136.A H 3.016 2.286 GLY 139.A N LEU 165.A O GLY 139.A H 3.177 2.378 SER 140.A N GLU 144.A OE2 SER 140.A H 2.850 2.026 ARG 141.A NE ASP 184.A OD1 ARG 141.A HE 2.751 2.024 ARG 141.A NH1 GLU 14.A OE1 ARG 141.A HH12 2.728 1.900 ARG 141.A NH1 GLU 14.A OE2 ARG 141.A HH12 3.472 2.849 ARG 141.A NH2 GLU 14.A OE1 ARG 141.A HH22 3.330 2.699 ARG 141.A NH2 GLU 14.A OE2 ARG 141.A HH22 3.016 2.266 ARG 141.A NH2 ASP 184.A OD2 ARG 141.A HH21 2.930 2.117 LEU 146.A N HIS 142.A O LEU 146.A H 2.857 2.030 LEU 147.A N PRO 143.A O LEU 147.A H 2.947 2.105 LYS 148.A N GLU 144.A O LYS 148.A H 2.965 2.150 LYS 148.A NZ ASP 160.A OD1 LYS 148.A HZ2 2.779 1.891 LYS 148.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 148.A HZ2 3.385 2.788 THR 149.A N THR 145.A O THR 149.A H 3.010 2.343 THR 149.A N LEU 146.A O THR 149.A H 3.333 2.629 THR 149.A OG1 THR 145.A O THR 149.A HG1 2.839 2.018 HIS 150.A N LEU 147.A O HIS 150.A H 3.395 2.611 ASP 152.A N HIS 150.A ND1 ASP 152.A H 3.019 2.170 ARG 154.A N ASP 152.A OD1 ARG 154.A H 3.024 2.193 ARG 154.A NE ASP 152.A OD1 ARG 154.A HE 3.099 2.251 ARG 154.A NE ASP 152.A OD2 ARG 154.A HE 3.240 2.564 ARG 154.A NH2 ASP 152.A OD2 ARG 154.A HH21 2.819 2.003 TYR 155.A N ASP 152.A O TYR 155.A H 2.974 2.135 SER 156.A N.A SER 153.A O SER 156.A H.A 3.044 2.486 ARG 157.A N SER 153.A O ARG 157.A H.B 3.080 2.280 ARG 157.A NE GLU 161.A OE2 ARG 157.A HE 2.776 1.920 ARG 157.A NH2 GLU 161.A OE1 ARG 157.A HH21 2.886 2.049 ARG 157.A NH2 GLU 161.A OE2 ARG 157.A HH21 3.562 2.938 LEU 158.A N ARG 154.A O LEU 158.A H 3.063 2.283 VAL 159.A N TYR 155.A O VAL 159.A H 3.176 2.359 ASP 160.A N SER 156.A O.A ASP 160.A H 2.891 2.043 ASP 160.A N SER 156.A O.B ASP 160.A H 2.806 1.954 GLU 161.A N ARG 157.A O GLU 161.A H 2.832 2.059 GLY 162.A N VAL 159.A O GLY 162.A H 3.224 2.407 VAL 163.A N TRP 135.A O VAL 163.A H 2.823 1.974 LYS 166.A N HIS 170.A ND1 LYS 166.A H 3.012 2.172 LYS 166.A NZ ASP 167.A OD2 LYS 166.A HZ1 2.918 2.286 HIS 170.A N ASP 167.A OD1 HIS 170.A H 2.924 2.080 ALA 171.A N ASP 167.A O ALA 171.A H 2.998 2.193 ILE 172.A N LEU 168.A O ILE 172.A H 2.969 2.152 GLU 173.A N ASN 169.A O GLU 173.A H 3.001 2.156 THR 174.A N HIS 170.A O THR 174.A H 2.985 2.164 THR 174.A OG1 HIS 170.A O THR 174.A HG1 2.837 2.015 LEU 175.A N ALA 171.A O LEU 175.A H 2.870 2.015 ARG 176.A N ILE 172.A O ARG 176.A H 2.839 2.010 ARG 176.A NE ASP 196.A OD2 ARG 176.A HE 2.706 1.917 ARG 176.A NH2 ASP 196.A OD1 ARG 176.A HH21 2.689 1.830 ARG 176.A NH2 ASP 196.A OD2 ARG 176.A HH21 3.405 2.818 GLY 177.A N THR 174.A O GLY 177.A H 3.032 2.309 GLY 178.A N LEU 175.A O GLY 178.A H 3.026 2.183 VAL 181.A N LYS 134.A O VAL 181.A H 2.906 2.088 PHE 182.A N VAL 113.A O PHE 182.A H 2.941 2.165 ILE 183.A N GLY 136.A O ILE 183.A H 3.125 2.279 ASP 184.A N LYS 111.A O ASP 184.A H 2.894 2.058 GLY 186.A N GLY 109.A O GLY 186.A H 2.864 2.023 LEU 189.A N GLU 185.A O LEU 189.A H 2.991 2.146 ALA 190.A N GLY 186.A O ALA 190.A H 2.732 1.921 HIS 191.A N PRO 187.A O HIS 191.A H 3.196 2.337 ASN 192.A ND2 GLN 15.A O ASN 192.A HD21 2.870 2.087 ASN 192.A ND2 VAL 188.A O ASN 192.A HD22 2.789 1.963 LEU 193.A N LEU 189.A O LEU 193.A H 3.138 2.436 LEU 193.A N HIS 191.A O LEU 193.A H 2.635 1.958 ASP 196.A N LEU 193.A O ASP 196.A H 3.012 2.228 ASP 198.A N ASP 198.A OD1 ASP 198.A H 2.661 2.034 VAL 199.A N ASP 196.A O VAL 199.A H 3.212 2.377 PHE 200.A N VAL 114.A O PHE 200.A H 2.796 1.963 VAL 202.A N ALA 112.A O VAL 202.A H.B 2.806 1.979 PHE 206.A N ILE 110.A O PHE 206.A H 3.032 2.251 PHE 209.A N ALA 108.A O PHE 209.A H 2.985 2.131 GLU 210.A N THR 91.A OG1 GLU 210.A H 2.975 2.134 TYR 211.A N MET 106.A O TYR 211.A H 2.824 1.986 TYR 211.A OH GLU 185.A OE1 TYR 211.A HH 2.750 1.951 ALA 212.A N LEU 89.A O ALA 212.A H 2.958 2.150 PHE 213.A N SER 102.A OG PHE 213.A H 2.897 2.067 GLY 214.A N ILE 85.A O GLY 214.A H 3.011 2.226 LEU 215.A N ASP 100.A O LEU 215.A H 2.834 1.981 SER 219.A N PRO 216.A O SER 219.A H 3.092 2.326 TYR 221.A N SER 219.A OG TYR 221.A H 3.079 2.239 LYS 222.A NZ TYR 101.A O LYS 222.A HZ3 2.745 1.885 LYS 222.A NZ ASP 226.A OD1 LYS 222.A HZ2 3.530 2.704 LYS 222.A NZ ASP 226.A OD2 LYS 222.A HZ2 2.700 1.912 ILE 225.A N TYR 221.A O ILE 225.A H 3.012 2.157 ASP 226.A N LYS 222.A O ASP 226.A H 2.807 1.965 SER 227.A N.A SER 223.A O.A SER 227.A H.A 2.978 2.158 SER 227.A N.A SER 223.A O.B SER 227.A H.A 3.078 2.260 SER 227.A N.B SER 223.A O.A SER 227.A H.B 2.946 2.106 SER 227.A N.B SER 223.A O.B SER 227.A H.B 3.047 2.212 SER 227.A OG.A SER 223.A O.A SER 227.A HG.A 3.359 2.625 SER 227.A OG.A SER 223.A O.B SER 227.A HG.A 3.260 2.545 SER 227.A OG.A LEU 224.A O SER 227.A HG.A 3.234 2.646 HIS 228.A N LEU 224.A O HIS 228.A H.B 3.052 2.214 LEU 229.A N ILE 225.A O LEU 229.A H 2.881 2.052 LEU 230.A N ASP 226.A O LEU 230.A H 2.944 2.104 LYS 231.A N.A SER 227.A O.A LYS 231.A H.A 3.124 2.300 LYS 231.A N.A SER 227.A O.B LYS 231.A H.A 3.012 2.186 LYS 231.A N.B SER 227.A O.A LYS 231.A H.B 3.118 2.289 LYS 231.A N.B SER 227.A O.B LYS 231.A H.B 3.006 2.175 PHE 232.A N HIS 228.A O PHE 232.A H.A 2.926 2.117 ARG 233.A N LEU 229.A O ARG 233.A H 3.082 2.285 GLU 234.A N LEU 230.A O GLU 234.A H 2.878 2.038 GLU 235.A N LYS 231.A O.A GLU 235.A H 2.890 2.075 GLU 235.A N LYS 231.A O.B GLU 235.A H 2.866 2.049 GLY 236.A N ARG 233.A O GLY 236.A H 3.130 2.335 PHE 237.A N PHE 232.A O PHE 237.A H 2.905 2.231 ILE 240.A N GLY 236.A O ILE 240.A H 3.043 2.211 LEU 241.A N PHE 237.A O LEU 241.A H 2.931 2.110 TRP 242.A N ILE 238.A O TRP 242.A H 2.947 2.125 GLU 243.A N ASP 239.A O GLU 243.A H 2.997 2.161 LYS 244.A N ILE 240.A O LYS 244.A H 2.933 2.151 LYS 244.A NZ ASP 37.A OD2 LYS 244.A HZ3 2.802 1.912 TRP 245.A N LEU 241.A O TRP 245.A H 2.948 2.175 TRP 245.A NE1 ASP 37.A OD2 TRP 245.A HE1 2.804 1.969 SER 246.A N TRP 242.A O SER 246.A H 2.864 2.020 SER 246.A OG TRP 242.A O SER 246.A HG 2.661 1.861 SER 247.A N HIS 191.A ND1 SER 247.A H 3.147 2.361