Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ykp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N GLY 46.A O GLY 3.A H 3.083 2.255 ARG 4.A N LEU 1.A O ARG 4.A H 2.984 2.163 HIS 5.A ND1 THR 48.A OG1 no hydrogen 2.783 N/A HIS 5.A NE2 GLU 50.A OE2 HIS 5.A HE2 2.804 1.961 LEU 6.A N THR 48.A O LEU 6.A H 2.833 2.004 ARG 7.A N ASP 82.A OD2 ARG 7.A H 2.827 1.970 ARG 7.A NE ASP 82.A OD2 ARG 7.A HE 3.011 2.155 ARG 7.A NH1 ASP 79.A O ARG 7.A HH12 2.839 2.094 ARG 7.A NH2 ASP 79.A O ARG 7.A HH22 3.334 2.731 ARG 7.A NH2 ASP 79.A OD1 ARG 7.A HH22 3.035 2.264 ARG 7.A NH2 ASP 82.A OD1 ARG 7.A HH21 2.988 2.129 LEU 8.A N GLU 50.A O LEU 8.A H 2.819 1.983 GLY 9.A N MET 83.A O GLY 9.A H 2.811 2.021 SER 10.A N ILE 52.A O SER 10.A H 3.294 2.539 SER 10.A OG ALA 85.A O SER 10.A HG 2.812 2.161 GLU 13.A N MET 17.A O GLU 13.A H 2.914 2.147 GLN 14.A NE2 GLU 12.A OE2 GLN 14.A HE21 3.529 2.683 PHE 16.A N GLU 13.A O PHE 16.A H 2.846 2.244 MET 17.A N GLU 13.A O MET 17.A H 2.950 2.119 PHE 18.A N SER 31.A O PHE 18.A H 2.733 1.921 PHE 19.A N GLU 12.A OE2 PHE 19.A H 2.922 2.099 ALA 20.A N CYS 29.A O ALA 20.A H 2.878 2.029 CYS 24.A SG ALA 20.A O no hydrogen 3.488 N/A CYS 24.A SG GLU 22.A O no hydrogen 3.682 N/A ASN 27.A ND2 TYR 49.A O ASN 27.A HD21 2.925 2.080 ASP 28.A N GLU 25.A O ASP 28.A H 3.172 2.445 CYS 29.A N GLY 26.A O CYS 29.A H 3.052 2.210 TRP 30.A N ASN 27.A O TRP 30.A H 3.003 2.156 SER 31.A N PHE 18.A O SER 31.A H 3.064 2.295 MET 33.A N PRO 15.A O MET 33.A H 3.144 2.293 VAL 34.A N PHE 16.A O VAL 34.A H 2.844 2.051 ASP 36.A N GLY 32.A O ASP 36.A H 2.914 2.093 MET 37.A N MET 33.A O MET 37.A H 3.101 2.312 VAL 38.A N VAL 34.A O VAL 38.A H 2.868 2.038 VAL 39.A N ASN 35.A O VAL 39.A H 2.833 1.985 LYS 40.A N ASP 36.A O LYS 40.A H 3.104 2.272 LYS 40.A NZ ASP 44.A OD2 LYS 40.A HZ2 3.193 2.411 LEU 41.A N MET 37.A O LEU 41.A H 2.903 2.053 SER 42.A N.A VAL 38.A O SER 42.A H.A 2.781 1.947 SER 42.A N.B VAL 38.A O SER 42.A H.B 2.799 1.983 SER 42.A OG.A PHE 47.A O SER 42.A HG.A 2.675 1.879 SER 42.A OG.B VAL 39.A O SER 42.A HG.B 2.785 1.982 GLU 43.A N VAL 39.A O GLU 43.A H.A 2.994 2.188 ASP 44.A N LYS 40.A O ASP 44.A H 2.957 2.132 LEU 45.A N LEU 41.A O LEU 45.A H 2.825 2.016 GLY 46.A N SER 42.A O.A GLY 46.A H 2.824 2.056 GLY 46.A N SER 42.A O.B GLY 46.A H 2.901 2.146 THR 48.A N ARG 4.A O THR 48.A H 2.928 2.147 GLU 50.A N LEU 6.A O GLU 50.A H 3.141 2.373 TYR 51.A OH ASN 35.A OD1 TYR 51.A HH 2.801 2.073 ILE 52.A N LEU 8.A O ILE 52.A H 2.804 1.986 ARG 57.A N PRO 54.A O ARG 57.A H 2.942 2.127 ARG 57.A NH1 PRO 54.A O ARG 57.A HH11 2.844 2.081 LYS 58.A N ASP 56.A OD1 LYS 58.A H 2.962 2.114 GLY 60.A N SER 139.A O GLY 60.A H 2.923 2.067 ALA 61.A N ASN 70.A OD1 ALA 61.A H 2.915 2.109 ASN 63.A N GLU 68.A O ASN 63.A H 2.934 2.079 THR 65.A N ASN 63.A OD1 THR 65.A H 2.947 2.191 THR 66.A N ASN 63.A OD1 THR 66.A H 3.175 2.397 ASN 67.A N ASN 63.A O ASN 67.A H 2.685 2.052 GLU 68.A N THR 66.A OG1 GLU 68.A H 3.160 2.410 ASN 70.A ND2 SER 139.A OG ASN 70.A HD21 2.863 2.006 GLY 71.A N ASP 56.A OD2 GLY 71.A H 2.884 2.037 MET 72.A N LYS 58.A O MET 72.A H 3.053 2.357 ILE 73.A N PHE 59.A O ILE 73.A H 3.368 2.583 ARG 74.A N ASN 70.A O ARG 74.A H 3.091 2.258 ARG 74.A NE ASP 78.A OD1 ARG 74.A HE 3.017 2.223 ARG 74.A NE ASP 78.A OD2 ARG 74.A HE 3.021 2.387 ARG 74.A NH1 GLU 68.A OE1 ARG 74.A HH12 3.308 2.645 ARG 74.A NH1 TRP 69.A O ARG 74.A HH11 2.981 2.180 ARG 74.A NH2 GLU 68.A OE1 ARG 74.A HH22 3.383 2.737 ASP 75.A N GLY 71.A O ASP 75.A H 3.124 2.305 LEU 76.A N MET 72.A O LEU 76.A H 3.027 2.213 LEU 77.A N ILE 73.A O LEU 77.A H 2.970 2.133 ASP 78.A N ARG 74.A O ASP 78.A H 2.852 2.093 ASP 79.A N LEU 76.A O ASP 79.A H 2.928 2.098 LYS 80.A N ASP 75.A O LYS 80.A H 2.904 2.076 ASP 82.A N ARG 7.A O ASP 82.A H 2.725 1.883 ILE 84.A N GLY 213.A O ILE 84.A H 2.817 1.996 ALA 85.A N GLY 9.A O ALA 85.A H 2.854 2.080 LEU 88.A N ALA 211.A O LEU 88.A H 3.231 2.457 SER 89.A OG GLU 184.A OE2 SER 89.A HG 2.693 1.916 THR 90.A N GLU 209.A O THR 90.A H 2.901 2.160 ASN 91.A N TYR 100.A OH ASN 91.A H 3.178 2.402 ASN 91.A ND2 HIS 141.A ND1 ASN 91.A HD22 3.001 2.143 ARG 94.A N ASN 91.A OD1 ARG 94.A H 2.871 2.021 ARG 94.A NH1 SER 89.A O ARG 94.A HH11 3.042 2.280 ARG 94.A NH2 GLY 60.A O ARG 94.A HH21 2.992 2.149 LYS 95.A N.A ASN 91.A O LYS 95.A H.A 2.998 2.188 LYS 95.A N.B ASN 91.A O LYS 95.A H.B 3.017 2.221 LYS 95.A NZ.A LYS 95.A O.A LYS 95.A HZ2.A 2.801 1.948 LYS 95.A NZ.A ASP 99.A OD1 LYS 95.A HZ3.A 3.050 2.308 SER 96.A N.A SER 92.A O.A SER 96.A H.A 3.031 2.336 SER 96.A N.A SER 92.A O.B SER 96.A H.A 3.085 2.395 SER 96.A N.A ALA 93.A O SER 96.A H.A 3.178 2.475 SER 96.A N.B SER 92.A O.A SER 96.A H.B 3.118 2.390 SER 96.A N.B SER 92.A O.B SER 96.A H.B 3.173 2.449 SER 96.A N.B ALA 93.A O SER 96.A H.B 3.309 2.613 SER 96.A OG.A ALA 93.A O SER 96.A HG.A 2.548 1.718 SER 96.A OG.B SER 92.A O.A SER 96.A HG.B 3.393 2.587 SER 96.A OG.B SER 92.A O.B SER 96.A HG.B 3.331 2.521 ALA 97.A N ARG 94.A O ALA 97.A H.A 2.905 2.103 ILE 98.A N ARG 94.A O ILE 98.A H 2.839 2.036 ASP 99.A N LEU 214.A O ASP 99.A H 2.810 2.009 TYR 100.A OH SER 89.A O TYR 100.A HH 2.728 2.122 SER 101.A N PHE 212.A O SER 101.A H 2.857 2.026 SER 101.A OG PHE 102.A O SER 101.A HG 2.860 2.038 PHE 102.A N ASP 225.A OD1 PHE 102.A H 2.795 2.039 PHE 104.A N TYR 210.A O PHE 104.A H 2.889 2.064 ALA 107.A N PHE 208.A O ALA 107.A H 2.894 2.079 ILE 109.A N PHE 205.A O ILE 109.A H 2.873 2.080 LYS 110.A N ASP 183.A O LYS 110.A H 2.809 1.978 VAL 112.A N PHE 181.A O VAL 112.A H 2.949 2.138 VAL 113.A N PHE 199.A O VAL 113.A H 2.799 2.030 LYS 114.A NZ ARG 175.A O LYS 114.A HZ2 2.533 1.885 GLY 115.A N ASP 197.A O GLY 115.A H 2.747 1.942 THR 118.A OG1 TYR 132.A OH THR 118.A HG1 3.424 2.605 LEU 120.A N THR 118.A OG1 LEU 120.A H 3.347 2.488 ASN 121.A N GLU 125.A OE1 ASN 121.A H 2.856 1.998 GLN 122.A NE2 TYR 154.A OH GLN 122.A HE22 2.917 2.185 LEU 124.A N GLN 122.A OE1 LEU 124.A H 2.869 2.034 GLU 125.A N GLN 122.A O GLU 125.A H 3.059 2.253 LEU 126.A N VAL 123.A O LEU 126.A H 2.954 2.123 LEU 127.A N LEU 124.A O LEU 127.A H 3.115 2.279 ASP 128.A N GLU 125.A O ASP 128.A H 3.003 2.155 GLN 129.A NE2 LEU 126.A O GLN 129.A HE21 2.997 2.144 GLN 129.A NE2 TYR 132.A O GLN 129.A HE22 2.992 2.137 TYR 132.A N GLN 129.A OE1 TYR 132.A H 2.853 2.001 LYS 133.A N LEU 178.A O LYS 133.A H 2.986 2.192 TRP 134.A NE1 LEU 157.A O TRP 134.A HE1 2.726 1.909 GLY 135.A N VAL 180.A O GLY 135.A H 3.076 2.361 GLY 138.A N LEU 164.A O GLY 138.A H 3.013 2.200 SER 139.A N GLU 143.A OE2 SER 139.A H 2.817 2.021 ARG 140.A NE ASP 183.A OD1 ARG 140.A HE 2.753 2.010 ARG 140.A NH1 GLU 13.A OE1 ARG 140.A HH12 2.816 2.009 ARG 140.A NH1 GLU 13.A OE2 ARG 140.A HH12 3.455 2.821 ARG 140.A NH2 GLU 13.A OE1 ARG 140.A HH22 3.316 2.665 ARG 140.A NH2 GLU 13.A OE2 ARG 140.A HH22 3.014 2.262 ARG 140.A NH2 ASP 183.A OD2 ARG 140.A HH21 2.919 2.114 THR 144.A N ARG 140.A O THR 144.A H 3.292 2.482 LEU 145.A N HIS 141.A O LEU 145.A H 2.880 2.056 LEU 146.A N PRO 142.A O LEU 146.A H 2.965 2.118 LYS 147.A N GLU 143.A O LYS 147.A H 2.906 2.090 LYS 147.A NZ ASP 159.A OD1 LYS 147.A HZ3 2.949 2.062 LYS 147.A NZ ASP 159.A OD2 LYS 147.A HZ3 3.450 2.774 THR 148.A N THR 144.A O THR 148.A H 2.976 2.294 THR 148.A OG1 THR 144.A O THR 148.A HG1 2.833 2.028 ASP 151.A N HIS 149.A ND1 ASP 151.A H 3.014 2.172 ARG 153.A N ASP 151.A OD1 ARG 153.A H 2.999 2.174 ARG 153.A NE ASP 151.A OD1 ARG 153.A HE 2.995 2.148 ARG 153.A NE ASP 151.A OD2 ARG 153.A HE 3.140 2.522 ARG 153.A NH2 ASP 151.A OD2 ARG 153.A HH21 2.653 1.864 TYR 154.A N ASP 151.A O TYR 154.A H 2.958 2.113 SER 155.A N.A SER 152.A O SER 155.A H.A 3.088 2.523 ARG 156.A N SER 152.A O ARG 156.A H.B 3.106 2.308 ARG 156.A NE GLU 160.A OE2 ARG 156.A HE 2.803 1.945 ARG 156.A NH2 GLU 160.A OE1 ARG 156.A HH21 2.955 2.129 LEU 157.A N ARG 153.A O LEU 157.A H 3.104 2.352 VAL 158.A N TYR 154.A O VAL 158.A H 3.232 2.428 ASP 159.A N SER 155.A O.A ASP 159.A H 2.933 2.086 ASP 159.A N SER 155.A O.B ASP 159.A H 2.822 1.971 GLU 160.A N ARG 156.A O GLU 160.A H 2.846 2.069 GLY 161.A N VAL 158.A O GLY 161.A H 3.303 2.518 VAL 162.A N TRP 134.A O VAL 162.A H 2.862 2.015 LEU 164.A N VAL 136.A O LEU 164.A H 2.984 2.130 LYS 165.A N HIS 169.A ND1 LYS 165.A H 2.973 2.124 HIS 169.A N ASP 166.A OD1 HIS 169.A H 2.854 2.017 ALA 170.A N ASP 166.A O ALA 170.A H 2.989 2.170 ILE 171.A N LEU 167.A O ILE 171.A H 2.923 2.087 GLU 172.A N ASN 168.A O GLU 172.A H 2.960 2.125 THR 173.A N HIS 169.A O THR 173.A H 2.914 2.125 THR 173.A OG1 HIS 169.A O THR 173.A HG1 2.849 2.037 LEU 174.A N ALA 170.A O LEU 174.A H 2.859 2.008 ARG 175.A N ILE 171.A O ARG 175.A H 2.820 1.980 ARG 175.A NE ASP 195.A OD2 ARG 175.A HE 2.760 1.965 ARG 175.A NH2 ASP 195.A OD1 ARG 175.A HH21 2.849 2.005 GLY 176.A N GLU 172.A O GLY 176.A H 3.066 2.400 GLY 176.A N THR 173.A O GLY 176.A H 3.124 2.487 GLY 177.A N LEU 174.A O GLY 177.A H 3.000 2.166 VAL 180.A N LYS 133.A O VAL 180.A H 2.903 2.086 PHE 181.A N VAL 112.A O PHE 181.A H 2.949 2.172 ILE 182.A N GLY 135.A O ILE 182.A H 3.207 2.360 ASP 183.A N LYS 110.A O ASP 183.A H 2.859 2.012 GLY 185.A N GLY 108.A O GLY 185.A H 2.883 2.047 LEU 188.A N GLU 184.A O LEU 188.A H 3.044 2.215 ALA 189.A N GLY 185.A O ALA 189.A H 2.816 1.996 HIS 190.A N PRO 186.A O HIS 190.A H 3.226 2.385 ASN 191.A N VAL 187.A O ASN 191.A H 3.071 2.250 ASN 191.A ND2 GLN 14.A O ASN 191.A HD21 2.856 2.073 ASN 191.A ND2 VAL 187.A O ASN 191.A HD22 2.823 2.003 LEU 192.A N LEU 188.A O LEU 192.A H 3.042 2.315 ASP 195.A N LEU 192.A O ASP 195.A H 3.044 2.284 ASP 197.A N ASP 197.A OD1 ASP 197.A H 2.668 2.053 VAL 198.A N ASP 195.A O VAL 198.A H 3.105 2.256 PHE 199.A N VAL 113.A O PHE 199.A H 2.739 1.901 VAL 201.A N ALA 111.A O VAL 201.A H.B 2.763 1.932 PHE 205.A N ILE 109.A O PHE 205.A H 2.988 2.207 PHE 208.A N ALA 107.A O PHE 208.A H 3.052 2.213 GLU 209.A N THR 90.A OG1 GLU 209.A H 2.978 2.153 TYR 210.A N MET 105.A O TYR 210.A H 2.744 1.914 TYR 210.A OH GLU 184.A OE1 TYR 210.A HH 2.702 1.904 ALA 211.A N LEU 88.A O ALA 211.A H 2.974 2.174 PHE 212.A N SER 101.A OG PHE 212.A H 2.902 2.067 GLY 213.A N ILE 84.A O GLY 213.A H 2.984 2.201 LEU 214.A N ASP 99.A O LEU 214.A H 2.851 1.998 SER 218.A N PRO 215.A O SER 218.A H 3.087 2.329 TYR 220.A N SER 218.A OG TYR 220.A H 3.022 2.174 LYS 221.A NZ TYR 100.A O LYS 221.A HZ2 2.690 1.859 LYS 221.A NZ ASP 225.A OD1 LYS 221.A HZ1 3.470 2.652 LYS 221.A NZ ASP 225.A OD2 LYS 221.A HZ1 2.738 1.958 ILE 224.A N TYR 220.A O ILE 224.A H 3.030 2.174 ASP 225.A N LYS 221.A O ASP 225.A H 2.815 1.964 SER 226.A N.A SER 222.A O.A SER 226.A H.A 2.935 2.117 SER 226.A N.A SER 222.A O.B SER 226.A H.A 3.130 2.319 SER 226.A N.B SER 222.A O.A SER 226.A H.B 2.911 2.075 SER 226.A N.B SER 222.A O.B SER 226.A H.B 3.107 2.280 SER 226.A OG.A SER 222.A O.A SER 226.A HG.A 3.372 2.659 SER 226.A OG.A SER 222.A O.B SER 226.A HG.A 3.265 2.585 SER 226.A OG.A LEU 223.A O SER 226.A HG.A 3.129 2.522 HIS 227.A N LEU 223.A O HIS 227.A H.B 3.015 2.171 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 2.895 2.051 LEU 229.A N.A ASP 225.A O LEU 229.A H.A 2.933 2.099 LEU 229.A N.B ASP 225.A O LEU 229.A H.B 2.917 2.077 LYS 230.A N SER 226.A O.A LYS 230.A H.A 3.120 2.302 LYS 230.A N SER 226.A O.B LYS 230.A H.A 3.013 2.194 PHE 231.A N HIS 227.A O PHE 231.A H 2.936 2.117 ARG 232.A N LEU 228.A O ARG 232.A H 3.075 2.278 ARG 232.A NH1 PRO 103.A O ARG 232.A HH11 3.551 2.828 GLU 233.A N LEU 229.A O.A GLU 233.A H 2.896 2.060 GLU 233.A N LEU 229.A O.B GLU 233.A H 2.884 2.051 GLU 234.A N LYS 230.A O GLU 234.A H 2.878 2.076 GLY 235.A N ARG 232.A O GLY 235.A H 3.076 2.266 PHE 236.A N PHE 231.A O PHE 236.A H 2.908 2.237 ILE 239.A N GLY 235.A O ILE 239.A H 3.025 2.205 LEU 240.A N PHE 236.A O LEU 240.A H 2.924 2.098 TRP 241.A N ILE 237.A O TRP 241.A H 2.948 2.134 GLU 242.A N ASP 238.A O GLU 242.A H 2.989 2.153 LYS 243.A N ILE 239.A O LYS 243.A H 2.929 2.131 LYS 243.A NZ ASP 36.A OD2 LYS 243.A HZ2 2.861 1.979 TRP 244.A N LEU 240.A O TRP 244.A H 2.937 2.160 TRP 244.A NE1 ASP 36.A OD2 TRP 244.A HE1 2.813 1.982 SER 245.A N TRP 241.A O SER 245.A H 2.890 2.058 SER 245.A OG TRP 241.A O SER 245.A HG 2.719 1.932 SER 246.A N HIS 190.A ND1 SER 246.A H 3.256 2.473