Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ylu_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 2.A N ASN 217.A OD1 GLY 2.A H 2.921 2.167 VAL 4.A N GLN 299.A OE1 VAL 4.A H 2.935 2.101 LYS 5.A NZ THR 130.A O LYS 5.A HZ3 2.850 2.095 SER 7.A OG THR 130.A OG1 SER 7.A HG 2.590 1.775 HIS 8.A N SER 116.A OG HIS 8.A H 2.829 2.007 SER 10.A OG GLU 14.A OE2 SER 10.A HG 2.686 1.886 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 3.015 2.372 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.955 2.119 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.930 2.104 CYS 16.A SG ASP 12.A O CYS 16.A HG 3.692 2.558 MET 17.A N GLU 14.A O MET 17.A H 3.223 2.372 VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 2.994 2.163 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 2.888 2.044 GLN 19.A NE2 THR 26.A OG1 GLN 19.A HE22 2.838 2.141 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.862 2.045 THR 21.A N SER 67.A O THR 21.A H 2.825 2.007 CYS 22.A N MET 25.A O CYS 22.A H 2.891 2.060 MET 25.A N CYS 22.A O MET 25.A H 3.325 2.487 THR 26.A OG1 VAL 20.A O THR 26.A HG1 3.358 2.670 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 3.001 2.174 ASN 28.A N CYS 148.A O ASN 28.A H 3.060 2.215 ASN 28.A ND2 CYS 120.A O ASN 28.A HD21 2.969 2.332 ASN 28.A ND2 GLY 146.A O ASN 28.A HD21 3.054 2.443 ASN 28.A ND2 CYS 148.A O ASN 28.A HD22 2.912 2.102 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.897 2.106 LEU 30.A N TRP 37.A O LEU 30.A H 2.875 2.094 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.863 2.012 TRP 31.A NE1 VAL 96.A O TRP 31.A HE1 3.068 2.290 LEU 32.A N THR 35.A O LEU 32.A H 2.939 2.106 ASP 33.A N THR 101.A OG1 ASP 33.A H 2.842 2.001 THR 35.A N LEU 32.A O THR 35.A H 2.912 2.053 VAL 36.A N LEU 92.A O VAL 36.A H 2.714 1.907 TRP 37.A N LEU 30.A O TRP 37.A H 2.909 2.085 CYS 38.A N LEU 90.A O CYS 38.A H 3.142 2.359 ARG 40.A N THR 88.A O ARG 40.A H 3.116 2.263 ARG 40.A NE ASP 190.A OD2 ARG 40.A HE 2.758 1.898 ARG 40.A NH2 ASP 190.A OD1 ARG 40.A HH21 2.966 2.107 HIS 41.A NE2 GLN 167.A O HIS 41.A HE2 3.020 2.268 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.287 2.430 MET 43.A N ARG 40.A O MET 43.A H 3.031 2.180 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 3.134 2.282 CYS 44.A SG PRO 45.A O CYS 44.A HG 3.554 2.403 GLN 48.A N PRO 45.A O GLN 48.A H 2.637 1.778 LEU 49.A N ALA 46.A O LEU 49.A H 3.432 2.585 SER 50.A OG.A GLN 192.A O SER 50.A HG.A 3.229 2.429 ASP 51.A N GLN 48.A O ASP 51.A H 3.213 2.568 TYR 54.A OH ASP 190.A O TYR 54.A HH 2.884 2.050 ALA 56.A N ASN 53.A OD1 ALA 56.A H 3.126 2.267 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 2.988 2.225 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 2.990 2.217 ILE 59.A N ASP 55.A O ILE 59.A H 3.299 2.468 SER 60.A N LEU 57.A O SER 60.A H 3.162 2.495 SER 60.A OG LEU 57.A O SER 60.A HG 2.533 1.736 MET 61.A N LEU 58.A O MET 61.A H 2.871 2.035 HIS 64.A N THR 62.A OG1 HIS 64.A H.A 3.096 2.380 SER 65.A N THR 62.A O SER 65.A H 3.076 2.308 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.318 2.473 SER 67.A N THR 21.A O SER 67.A H 2.934 2.146 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 2.921 2.142 GLN 69.A NE2 GLN 19.A OE1 GLN 69.A HE22 2.990 2.246 LYS 70.A N ALA 76.A O LYS 70.A H 2.895 2.042 HIS 71.A NE2 GLN 19.A OE1 HIS 71.A HE2 2.776 1.936 ALA 76.A N LYS 70.A O ALA 76.A H 3.279 2.488 LEU 78.A N VAL 68.A O LEU 78.A H 2.987 2.153 ARG 79.A N ASP 95.A OD1 ARG 79.A H 3.100 2.384 VAL 81.A N THR 93.A O VAL 81.A H 2.853 2.022 HIS 83.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 83.A HD1 2.843 1.991 ALA 84.A N LYS 91.A O ALA 84.A H 2.984 2.339 GLN 86.A N LEU 89.A O GLN 86.A H 2.723 1.901 GLN 86.A NE2 ASP 181.A O GLN 86.A HE22 3.454 2.756 THR 88.A N GLY 182.A O THR 88.A H 2.838 1.989 THR 88.A OG1 GLY 182.A O THR 88.A HG1 2.728 1.890 LEU 89.A N GLN 86.A O LEU 89.A H 3.147 2.315 LEU 90.A N CYS 38.A O LEU 90.A H 2.864 2.044 LYS 91.A N ALA 84.A O LYS 91.A H 2.910 2.135 LEU 92.A N VAL 36.A O LEU 92.A H 2.803 1.952 THR 93.A N GLY 82.A O THR 93.A H 2.926 2.113 VAL 94.A N ASN 34.A O VAL 94.A H 3.001 2.173 ASP 95.A N ASP 95.A OD1 ASP 95.A H 2.752 2.143 ASN 98.A N ASP 33.A O ASN 98.A H 2.838 2.036 ASN 98.A ND2 ALA 15.A O ASN 98.A HD21 3.196 2.387 ASN 98.A ND2 TRP 31.A O ASN 98.A HD22 2.831 1.984 SER 100.A N ASN 98.A OD1 SER 100.A H 2.891 2.081 THR 101.A OG1 ASN 98.A O THR 101.A HG1 2.721 1.932 THR 105.A N ILE 160.A O THR 105.A H 2.807 2.028 THR 107.A N PHE 162.A O THR 107.A H 3.162 2.349 VAL 109.A N TYR 185.A OH VAL 109.A H 2.987 2.177 GLY 112.A N MET 133.A O GLY 112.A H 2.741 1.895 ALA 113.A N LYS 110.A O ALA 113.A H 3.039 2.205 PHE 115.A N VAL 131.A O PHE 115.A H 2.982 2.185 SER 116.A N TYR 153.A O SER 116.A H 2.808 2.027 VAL 117.A N PHE 129.A O VAL 117.A H 2.777 1.928 LEU 118.A N VAL 151.A O LEU 118.A H 3.010 2.189 ALA 119.A N GLY 127.A O ALA 119.A H 2.753 2.023 CYS 120.A N SER 150.A OG CYS 120.A H 2.898 2.103 CYS 120.A SG LEU 118.A O CYS 120.A HG 3.679 2.498 TYR 121.A N ARG 124.A O TYR 121.A H 2.965 2.162 GLY 123.A N ASN 28.A OD1 GLY 123.A H 2.802 2.002 ARG 124.A N TYR 121.A O ARG 124.A H 2.794 1.946 THR 126.A N ALA 119.A O THR 126.A H 2.820 1.960 GLY 127.A N ALA 119.A O GLY 127.A H 3.365 2.560 THR 128.A OG1 VAL 117.A O THR 128.A HG1 2.806 2.039 PHE 129.A N VAL 117.A O PHE 129.A H 3.105 2.334 THR 130.A OG1 MET 6.A O THR 130.A HG1 2.738 1.938 VAL 131.A N PHE 115.A O VAL 131.A H 2.979 2.150 MET 133.A N ALA 113.A O MET 133.A H 2.890 2.103 ARG 134.A N THR 138.A O ARG 134.A H 2.846 2.018 ARG 134.A NE ASP 200.A OD1 ARG 134.A HE 2.902 2.058 ARG 134.A NE ASP 200.A OD2 ARG 134.A HE 3.327 2.693 ARG 134.A NH1 ASP 289.A OD1 ARG 134.A HH12 3.116 2.282 ARG 134.A NH1 ASP 289.A OD2 ARG 134.A HH12 3.221 2.579 ARG 134.A NH1 GLU 290.A OE2 ARG 134.A HH11 2.951 2.225 ARG 134.A NH2 ASP 200.A OD1 ARG 134.A HH21 3.317 2.614 ARG 134.A NH2 LYS 201.A O ARG 134.A HH21 2.750 2.178 ARG 134.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 134.A HH22 2.677 1.859 ASN 136.A ND2 LEU 198.A O ASN 136.A HD22 3.079 2.252 TYR 137.A N ARG 134.A O TYR 137.A H 2.795 1.963 THR 138.A OG1 ASN 136.A OD1 THR 138.A HG1 2.779 1.981 ILE 139.A N HIS 175.A O ILE 139.A H 2.829 2.004 GLY 141.A N HIS 175.A ND1 GLY 141.A H 3.156 2.393 LEU 144.A N TYR 121.A OH LEU 144.A H 3.027 2.179 SER 147.A N LEU 144.A O SER 147.A H 2.975 2.219 SER 147.A OG LEU 144.A O SER 147.A HG 2.758 2.153 CYS 148.A SG GLN 167.A O CYS 148.A HG 3.330 2.584 GLY 149.A N HIS 166.A O GLY 149.A H 2.866 2.028 SER 150.A N SER 147.A O SER 150.A H 3.022 2.181 SER 150.A OG SER 147.A O SER 150.A HG 2.627 1.904 GLY 152.A N TYR 164.A O GLY 152.A H 2.764 1.937 TYR 153.A N SER 116.A O TYR 153.A H 2.749 1.975 THR 154.A N ASN 161.A O THR 154.A H 3.016 2.231 THR 154.A OG1 ASN 161.A OD1 THR 154.A HG1 2.739 2.030 GLU 156.A N VAL 159.A O GLU 156.A H 3.001 2.187 VAL 159.A N GLU 156.A O VAL 159.A H 2.860 2.030 ILE 160.A N ALA 103.A O ILE 160.A H 2.861 2.019 ASN 161.A N THR 154.A O ASN 161.A H 2.765 1.956 ASN 161.A ND2 THR 105.A OG1 ASN 161.A HD22 3.078 2.258 PHE 162.A N THR 105.A O PHE 162.A H 2.892 2.148 CYS 163.A N GLY 152.A O CYS 163.A H 2.995 2.153 TYR 164.A N GLY 152.A O TYR 164.A H 3.284 2.624 MET 165.A N SER 178.A O MET 165.A H 2.814 2.044 HIS 166.A N SER 150.A O HIS 166.A H 2.760 1.957 HIS 166.A ND1 TYR 164.A OH HIS 166.A HD1 2.967 2.139 GLN 167.A N THR 176.A O GLN 167.A H 3.131 2.306 GLN 167.A NE2 THR 88.A O GLN 167.A HE21 2.942 2.117 GLN 167.A NE2 SER 178.A OG GLN 167.A HE22 3.346 2.491 MET 168.A N THR 176.A O MET 168.A H 3.102 2.279 LEU 170.A N THR 174.A O LEU 170.A H 2.799 2.003 THR 174.A N ALA 171.A O THR 174.A H 2.943 2.131 THR 174.A OG1 ASN 172.A O THR 174.A HG1 2.950 2.112 HIS 175.A N ILE 139.A O HIS 175.A H 2.886 2.127 HIS 175.A NE2 GLU 169.A OE1 HIS 175.A HE2 3.108 2.413 THR 176.A N MET 168.A O THR 176.A H 3.078 2.260 SER 178.A N MET 165.A O SER 178.A H 3.009 2.257 ALA 179.A N THR 183.A O ALA 179.A H 2.918 2.162 GLY 182.A N ALA 179.A O GLY 182.A H 2.881 2.071 THR 183.A N ASP 181.A OD1 THR 183.A H.A 3.032 2.177 THR 183.A OG1.B ASP 181.A OD1 no hydrogen 3.098 N/A TYR 185.A N GLY 177.A O TYR 185.A H 2.884 2.069 TYR 185.A OH CYS 163.A O TYR 185.A HH 2.647 1.810 ALA 187.A N MET 184.A O ALA 187.A H 3.111 2.313 MET 189.A N GLN 195.A OE1 MET 189.A H 2.693 1.845 ASP 190.A N ASP 190.A OD1 ASP 190.A H 2.716 2.069 LYS 191.A N MET 189.A O LYS 191.A H 2.981 2.363 GLN 192.A N LEU 49.A O GLN 192.A H 2.843 1.985 VAL 193.A N LYS 191.A O VAL 193.A H 2.951 2.276 GLN 195.A NE2 MET 189.A O GLN 195.A HE21 3.107 2.332 GLN 195.A NE2 VAL 193.A O GLN 195.A HE22 3.628 2.935 THR 199.A OG1 ASP 200.A O THR 199.A HG1 3.056 2.240 LYS 201.A N ASP 200.A OD1 LYS 201.A H 3.014 2.376 TYR 202.A N GLN 241.A O TYR 202.A H 3.037 2.238 CYS 203.A N ASP 289.A OD2 CYS 203.A H 3.048 2.235 SER 204.A N THR 243.A OG1 SER 204.A H 2.724 1.902 SER 204.A OG THR 243.A O SER 204.A HG 2.758 2.207 ASN 206.A N CYS 203.A O ASN 206.A H 2.983 2.390 ASN 206.A ND2 GLY 112.A O ASN 206.A HD21 3.053 2.195 ASN 206.A ND2 ASP 289.A O ASN 206.A HD22 2.886 2.108 VAL 207.A N CYS 203.A O VAL 207.A H 3.014 2.231 VAL 208.A N SER 204.A O VAL 208.A H 2.882 2.054 ALA 209.A N VAL 205.A O ALA 209.A H 3.066 2.296 TRP 210.A N ASN 206.A O TRP 210.A H 2.915 2.153 LEU 211.A N VAL 207.A O LEU 211.A H 3.056 2.283 TYR 212.A N VAL 208.A O TYR 212.A H 3.157 2.328 TYR 212.A OH VAL 260.A O TYR 212.A HH 2.867 2.034 ALA 213.A N ALA 209.A O ALA 213.A H 2.979 2.190 ALA 214.A N TRP 210.A O ALA 214.A H 2.923 2.084 ILE 215.A N LEU 211.A O ILE 215.A H 2.996 2.167 LEU 216.A N TYR 212.A O LEU 216.A H 2.953 2.146 ASN 217.A N ALA 214.A O ASN 217.A H 2.949 2.234 ASN 217.A ND2 ALA 213.A O ASN 217.A HD22 3.179 2.348 GLY 218.A N ILE 215.A O GLY 218.A H 3.186 2.370 CYS 219.A N ALA 214.A O CYS 219.A H 2.747 1.946 TRP 221.A NE1 GLN 280.A O TRP 221.A HE1 3.141 2.304 VAL 223.A N ALA 220.A O VAL 223.A H 3.073 2.224 LYS 224.A NZ TRP 221.A O LYS 224.A HZ3 3.115 2.372 THR 228.A N GLU 263.A O THR 228.A H 3.104 2.420 SER 232.A N SER 229.A OG SER 232.A H 3.199 2.381 PHE 233.A N SER 229.A O PHE 233.A H 2.861 2.068 ASN 234.A N VAL 230.A O ASN 234.A H 2.621 1.823 ASN 234.A ND2 PHE 245.A O ASN 234.A HD21 3.209 2.370 GLU 235.A N VAL 231.A O GLU 235.A H 2.994 2.159 TRP 236.A N SER 232.A O TRP 236.A H 3.145 2.319 ALA 237.A N PHE 233.A O ALA 237.A H 2.826 2.179 ALA 237.A N ASN 234.A O ALA 237.A H 3.104 2.481 LEU 238.A N ASN 234.A O LEU 238.A H 3.188 2.352 ALA 239.A N TRP 236.A O ALA 239.A H 3.088 2.360 ASN 240.A N ALA 237.A O ASN 240.A H 2.912 2.132 ASN 240.A ND2 TRP 236.A O ASN 240.A HD22 2.939 2.089 PHE 242.A N ALA 237.A O PHE 242.A H 3.299 2.439 THR 243.A N TYR 202.A O THR 243.A H 2.903 2.071 PHE 245.A N ASN 234.A OD1 PHE 245.A H 2.730 1.914 ASP 252.A N THR 248.A O ASP 252.A H 3.000 2.247 MET 253.A N GLN 249.A O MET 253.A H 2.961 2.125 LEU 254.A N VAL 251.A O LEU 254.A H 3.060 2.428 ALA 255.A N VAL 251.A O ALA 255.A H 3.062 2.243 VAL 256.A N ASP 252.A O VAL 256.A H 3.014 2.177 LYS 257.A N MET 253.A O LYS 257.A H 3.002 2.162 THR 258.A N LEU 254.A O THR 258.A H 3.009 2.296 THR 258.A N ALA 255.A O THR 258.A H 3.251 2.574 THR 258.A OG1 LEU 254.A O THR 258.A HG1 2.823 2.043 THR 258.A OG1 ALA 255.A O THR 258.A HG1 3.130 2.625 GLY 259.A N ALA 255.A O GLY 259.A H 2.681 1.968 VAL 260.A N THR 258.A OG1 VAL 260.A H 3.238 2.485 ALA 261.A N GLN 264.A OE1 ALA 261.A H 2.876 2.023 GLU 263.A N GLU 263.A OE1 GLU 263.A H 2.845 2.105 GLN 264.A N ALA 261.A O GLN 264.A H 2.831 2.186 GLN 264.A NE2 LYS 224.A O GLN 264.A HE22 2.624 1.780 LEU 265.A N ALA 261.A O LEU 265.A H 3.335 2.573 LEU 265.A N ILE 262.A O LEU 265.A H 2.914 2.320 LEU 266.A N ILE 262.A O LEU 266.A H 2.808 1.975 TYR 267.A N GLU 263.A O TYR 267.A H 3.124 2.329 ALA 268.A N GLN 264.A O ALA 268.A H 3.015 2.216 ILE 269.A N LEU 265.A O ILE 269.A H 2.903 2.116 GLN 270.A N LEU 266.A O GLN 270.A H 3.462 2.620 GLN 271.A N ALA 268.A O GLN 271.A H 2.882 2.195 GLN 271.A NE2 TYR 267.A O GLN 271.A HE22 3.648 2.939 LEU 272.A N ALA 268.A O LEU 272.A H 2.776 1.983 TYR 273.A N ILE 269.A O TYR 273.A H 3.011 2.262 GLY 275.A N LEU 272.A O GLY 275.A H 2.818 2.019 LYS 279.A N PHE 276.A O LYS 279.A H 3.053 2.200 ILE 281.A N SER 284.A O ILE 281.A H 2.838 1.996 SER 284.A N ILE 281.A O SER 284.A H.A 2.906 2.088 SER 284.A OG.A GLU 288.A OE2 SER 284.A HG.A 3.023 2.344 SER 284.A OG.B GLU 288.A OE2 no hydrogen 3.372 N/A MET 286.A N SER 284.A OG.A MET 286.A H 3.221 2.365 ASP 295.A N THR 292.A OG1 ASP 295.A H 2.994 2.151 VAL 296.A N THR 292.A O VAL 296.A H 2.935 2.091 ASN 297.A N PRO 293.A O ASN 297.A H 2.960 2.111 ASN 297.A ND2 SER 250.A O ASN 297.A HD21 3.089 2.289 ASN 297.A ND2 PRO 293.A O ASN 297.A HD22 3.028 2.304 MET 298.A N GLU 294.A O MET 298.A H 2.984 2.174 GLN 299.A N ASP 295.A O GLN 299.A H 2.887 2.041 GLN 299.A NE2 VAL 4.A O GLN 299.A HE21 2.666 1.896 GLN 299.A NE2 ASP 295.A OD1 GLN 299.A HE22 3.127 2.267 ILE 300.A N VAL 296.A O ILE 300.A H 3.005 2.269 MET 301.A N ASN 297.A O MET 301.A H 2.994 2.223 VAL 303.A N ASN 297.A O VAL 303.A H 3.339 2.550