Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ymb_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 1.A NH1 ASP 80.A OD1 ARG 1.A HH12 3.426 2.859 ARG 1.A NH1 ASP 80.A OD2 ARG 1.A HH12 3.240 2.390 ARG 1.A NH2 ASP 80.A OD1 ARG 1.A HH22 2.502 1.645 LEU 3.A N LEU 47.A O LEU 3.A H 2.957 2.147 ILE 4.A N ASP 80.A OD2 ILE 4.A H.B 2.731 1.888 VAL 5.A N ASP 49.A O VAL 5.A H 2.924 2.073 THR 6.A N LEU 81.A O THR 6.A H 2.781 2.003 THR 7.A N LYS 51.A O THR 7.A H 3.295 2.536 THR 7.A OG1 VAL 83.A O THR 7.A HG1 2.932 2.369 GLU 10.A N VAL 14.A O GLU 10.A H 2.891 2.051 TYR 13.A N GLU 10.A O TYR 13.A H 2.738 2.120 VAL 14.A N GLU 10.A O VAL 14.A H 2.871 2.031 MET 15.A N GLU 30.A O MET 15.A H.A 2.809 2.055 ARG 17.A N ARG 28.A O ARG 17.A H 2.680 1.828 ARG 17.A NE ASP 27.A O ARG 17.A HE 3.012 2.244 ARG 17.A NH2 ASP 27.A OD2 ARG 17.A HH21 3.405 2.631 LYS 21.A N SER 19.A OG LYS 21.A H 3.096 2.241 ASN 26.A ND2 TYR 48.A O ASN 26.A HD21 2.942 2.083 ARG 28.A N GLY 25.A O ARG 28.A H 3.160 2.306 ARG 28.A NE GLY 25.A O ARG 28.A HE 2.759 2.021 PHE 29.A N ASN 26.A O PHE 29.A H 3.115 2.255 GLU 30.A N MET 15.A O GLU 30.A H 2.824 2.044 TYR 32.A N PRO 12.A O TYR 32.A H 2.975 2.164 CYS 33.A N TYR 13.A O CYS 33.A H 2.851 2.068 ASP 35.A N GLY 31.A O ASP 35.A H 3.007 2.167 LEU 36.A N TYR 32.A O LEU 36.A H 2.818 2.012 LEU 37.A N CYS 33.A O LEU 37.A H 2.838 2.024 LYS 38.A N LEU 34.A O LYS 38.A H 2.945 2.094 GLU 39.A N ASP 35.A O GLU 39.A H 3.073 2.228 LEU 40.A N LEU 36.A O LEU 40.A H 2.832 1.993 SER 41.A N LEU 37.A O SER 41.A H.B 2.826 1.985 SER 41.A OG.A LEU 37.A O SER 41.A HG.A 3.334 2.730 SER 41.A OG.A LYS 38.A O SER 41.A HG.A 2.686 1.958 SER 41.A OG.B PHE 46.A O SER 41.A HG.B 2.591 1.852 ASN 42.A N LYS 38.A O ASN 42.A H 2.903 2.100 ILE 43.A N GLU 39.A O ILE 43.A H 3.071 2.307 ILE 43.A N LEU 40.A O ILE 43.A H 3.131 2.539 LEU 44.A N LEU 40.A O LEU 44.A H 2.868 2.036 GLY 45.A N SER 41.A O GLY 45.A H 2.684 1.947 ASP 49.A N LEU 3.A O ASP 49.A H.A 2.840 2.028 VAL 50.A N ASN 26.A OD1 VAL 50.A H 3.128 2.294 LYS 51.A N VAL 5.A O LYS 51.A H 2.821 1.987 VAL 53.A N THR 7.A O VAL 53.A H 2.856 2.029 GLY 56.A N VAL 53.A O GLY 56.A H 3.011 2.183 LYS 57.A N ASP 55.A OD1 LYS 57.A H 3.021 2.292 TYR 58.A OH GLU 10.A OE1 TYR 58.A HH 2.523 1.729 ALA 60.A N ASN 68.A OD1 ALA 60.A H 2.807 1.994 GLN 61.A NE2 GLY 65.A O GLN 61.A HE21 3.084 2.242 ASN 62.A N GLU 66.A O ASN 62.A H 2.932 2.129 ASN 62.A ND2 GLU 66.A OE1 ASN 62.A HD21 2.918 2.110 LYS 64.A N ASN 62.A OD1 LYS 64.A H 2.889 2.250 GLY 65.A N ASN 62.A O GLY 65.A H 3.132 2.296 GLU 66.A N ASN 62.A OD1 GLU 66.A H 2.847 2.046 ASN 68.A N ALA 60.A O ASN 68.A H 3.023 2.297 GLY 69.A N ASP 55.A OD2 GLY 69.A H 2.892 2.048 MET 70.A N LYS 57.A O MET 70.A H 3.253 2.542 VAL 71.A N TYR 58.A O VAL 71.A H 3.266 2.445 LYS 72.A N ASN 68.A O LYS 72.A H 3.092 2.301 LYS 72.A NZ ASP 76.A OD1 LYS 72.A HZ1 3.073 2.248 GLU 73.A N GLY 69.A O GLU 73.A H 3.123 2.332 LEU 74.A N MET 70.A O LEU 74.A H 3.080 2.332 LEU 74.A N VAL 71.A O LEU 74.A H 3.091 2.478 ILE 75.A N VAL 71.A O ILE 75.A H 2.945 2.104 ASP 76.A N LYS 72.A O ASP 76.A H 2.879 2.056 HIS 77.A N LEU 74.A O HIS 77.A H 2.949 2.120 ARG 78.A N GLU 73.A O ARG 78.A H 2.823 2.071 ARG 78.A NE GLU 73.A OE1 ARG 78.A HE 2.899 2.085 ARG 78.A NE GLU 73.A OE2 ARG 78.A HE 3.280 2.540 ARG 78.A NH1 ASP 76.A OD2 ARG 78.A HH12 2.874 2.283 ARG 78.A NH2 GLU 73.A OE2 ARG 78.A HH21 2.966 2.143 ASP 80.A N ILE 4.A O ASP 80.A H 2.845 2.134 LEU 81.A N ILE 4.A O LEU 81.A H 3.233 2.449 ALA 82.A N GLY 216.A O ALA 82.A H 2.784 1.964 VAL 83.A N THR 6.A O VAL 83.A H 3.210 2.438 LEU 86.A N ALA 84.A O LEU 86.A H 2.770 2.065 THR 87.A OG1 GLU 187.A OE2 THR 87.A HG1 2.699 1.962 ILE 88.A N GLY 212.A O ILE 88.A H 2.780 1.927 ARG 92.A N THR 89.A OG1 ARG 92.A H 3.279 2.455 ARG 92.A NE GLY 59.A O ARG 92.A HE 2.992 2.200 ARG 92.A NH1 THR 87.A O ARG 92.A HH11 2.984 2.214 ARG 92.A NH2 GLY 59.A O ARG 92.A HH21 3.166 2.447 GLU 93.A N THR 89.A O GLU 93.A H 2.952 2.125 VAL 95.A N ARG 92.A O VAL 95.A H 2.950 2.118 ILE 96.A N ARG 92.A O ILE 96.A H 3.056 2.285 ASP 97.A N THR 217.A O ASP 97.A H 2.852 2.078 PHE 98.A N GLU 93.A OE2 PHE 98.A H 3.143 2.302 SER 99.A N VAL 215.A O SER 99.A H 2.822 1.991 SER 99.A OG LYS 100.A O SER 99.A HG 2.810 1.992 LYS 100.A N THR 228.A OG1 LYS 100.A H 2.891 2.100 PHE 102.A N TYR 213.A O PHE 102.A H 2.953 2.231 LEU 105.A N LYS 211.A O LEU 105.A H 2.840 2.016 GLY 106.A N SER 188.A OG GLY 106.A H 3.033 2.209 ILE 107.A N ASP 209.A OD1 ILE 107.A H 2.773 1.931 SER 108.A N MET 186.A O SER 108.A H 2.885 2.044 SER 108.A OG GLY 206.A O SER 108.A HG 2.748 1.954 LEU 110.A N LEU 184.A O LEU 110.A H 2.675 1.818 TYR 111.A N THR 202.A O TYR 111.A H 3.061 2.226 TYR 111.A OH ASP 181.A OD1 TYR 111.A HH 2.691 1.860 ARG 112.A NH1 ASP 181.A OD1 ARG 112.A HH12 2.693 1.838 ARG 112.A NH2 ASP 181.A OD1 ARG 112.A HH22 3.398 2.769 LYS 113.A N ASN 200.A O LYS 113.A H 3.255 2.453 LYS 113.A NZ CYS 199.A O LYS 113.A HZ3 3.151 2.413 ILE 117.A N THR 115.A OG1 ILE 117.A H 3.201 2.412 ASP 118.A N ASP 122.A OD2 ASP 118.A H 2.943 2.191 ASP 122.A N SER 119.A O ASP 122.A H 2.961 2.341 ASP 122.A N SER 119.A OG ASP 122.A H 3.361 2.588 LEU 123.A N SER 119.A O LEU 123.A H 3.353 2.598 ALA 124.A N ALA 120.A O ALA 124.A H 2.888 2.093 LYS 125.A N ASP 121.A O LYS 125.A H 3.157 2.457 GLN 126.A N LEU 123.A O GLN 126.A H 3.117 2.291 GLN 126.A NE2 LEU 123.A O GLN 126.A HE21 3.023 2.179 GLN 126.A NE2 ILE 129.A O GLN 126.A HE22 2.975 2.115 ILE 129.A N GLN 126.A OE1 ILE 129.A H 2.632 1.798 GLY 132.A N ALA 183.A O GLY 132.A H 3.093 2.325 ARG 135.A N VAL 167.A O ARG 135.A H 2.846 2.015 ARG 135.A NE GLN 163.A OE1 ARG 135.A HE 2.767 1.987 GLY 137.A N VAL 134.A O GLY 137.A H 3.399 2.543 SER 138.A OG GLU 187.A OE2 SER 138.A HG 2.790 2.007 THR 141.A N GLY 137.A O THR 141.A H 3.157 2.387 THR 141.A OG1 GLY 137.A O THR 141.A HG1 3.237 2.450 PHE 142.A N SER 138.A O PHE 142.A H 3.292 2.489 PHE 143.A N THR 139.A O PHE 143.A H 3.349 2.536 LYS 144.A N MET 140.A O LYS 144.A H 2.836 1.985 SER 146.A N PHE 142.A O SER 146.A H 2.969 2.343 SER 146.A N PHE 143.A O SER 146.A H 3.233 2.527 ILE 148.A N SER 146.A OG ILE 148.A H 3.118 2.379 THR 150.A OG1 ASP 121.A OD2 THR 150.A HG1 3.021 2.413 TYR 151.A N ILE 148.A O TYR 151.A H 3.045 2.441 GLU 152.A N ILE 148.A O GLU 152.A H 2.802 1.972 LYS 153.A N SER 149.A O LYS 153.A H 3.029 2.233 MET 154.A N THR 150.A O MET 154.A H 3.235 2.452 TRP 155.A N TYR 151.A O TRP 155.A H 2.921 2.129 ALA 156.A N GLU 152.A O ALA 156.A H 3.145 2.377 PHE 157.A N LYS 153.A O PHE 157.A H 3.072 2.293 MET 158.A N MET 154.A O MET 158.A H.A 2.893 2.051 SER 159.A N TRP 155.A O SER 159.A H 2.929 2.174 SER 159.A OG TRP 155.A O SER 159.A HG 2.587 1.766 SER 160.A N PHE 157.A O SER 160.A H 3.113 2.320 SER 160.A OG PHE 157.A O SER 160.A HG 2.712 1.880 ARG 161.A NE SER 160.A OG ARG 161.A HE 3.406 2.711 ARG 161.A NH1 GLU 130.A OE1 ARG 161.A HH12 3.370 2.762 ARG 161.A NH1 GLU 130.A OE2 ARG 161.A HH12 2.856 2.000 ARG 161.A NH2 GLU 130.A OE1 ARG 161.A HH22 2.661 1.832 SER 164.A N ARG 161.A O SER 164.A H 3.247 2.586 LEU 166.A N GLN 163.A O LEU 166.A H 3.134 2.342 VAL 167.A N ALA 133.A O VAL 167.A H 3.041 2.239 GLU 172.A N ASN 169.A OD1 GLU 172.A H 2.920 2.064 GLY 173.A N ASN 169.A O GLY 173.A H 3.003 2.190 ILE 174.A N SER 170.A O ILE 174.A H 2.858 2.056 GLN 175.A N ASP 171.A O GLN 175.A H.A 3.065 2.254 GLN 175.A NE2.A ASP 171.A OD2 GLN 175.A HE21.A 3.042 2.379 ARG 176.A N GLU 172.A O ARG 176.A H 2.933 2.174 ARG 176.A NH1 SER 164.A O ARG 176.A HH12 3.068 2.300 ARG 176.A NH1 LEU 166.A O ARG 176.A HH12 3.319 2.761 ARG 176.A NH2 SER 164.A O ARG 176.A HH22 3.066 2.297 VAL 177.A N GLY 173.A O VAL 177.A H 3.054 2.252 LEU 178.A N ILE 174.A O LEU 178.A H 3.157 2.376 THR 179.A N GLN 175.A O THR 179.A H 3.167 2.493 THR 180.A N ARG 176.A O THR 180.A H 2.989 2.174 THR 180.A OG1 ARG 176.A O THR 180.A HG1 2.830 2.015 TYR 182.A OH ALA 165.A O TYR 182.A HH 2.837 2.019 ALA 183.A N GLU 130.A O ALA 183.A H 2.926 2.115 LEU 184.A N LEU 110.A O LEU 184.A H 2.897 2.080 LEU 185.A N GLY 132.A O LEU 185.A H 2.817 1.969 MET 186.A N SER 108.A O MET 186.A H 2.940 2.132 SER 188.A N GLY 106.A O SER 188.A H 2.720 1.992 THR 189.A OG1 TYR 213.A OH THR 189.A HG1 2.670 1.925 SER 190.A N GLU 187.A O SER 190.A H 3.119 2.525 ILE 191.A N GLU 187.A O ILE 191.A H 3.378 2.577 GLU 192.A N SER 188.A O GLU 192.A H 2.791 1.963 TYR 193.A N THR 189.A O TYR 193.A H 3.020 2.241 TYR 193.A OH GLU 11.A OE1 TYR 193.A HH 2.484 1.660 VAL 194.A N SER 190.A O VAL 194.A H 3.080 2.237 THR 195.A N ILE 191.A O THR 195.A H 2.974 2.127 THR 195.A OG1 ILE 191.A O THR 195.A HG1 3.049 2.277 THR 195.A OG1 GLU 192.A O THR 195.A HG1 3.382 2.850 GLN 196.A N GLU 192.A O GLN 196.A H 3.277 2.545 ARG 197.A N VAL 194.A O ARG 197.A H 2.900 2.069 ARG 197.A NH1 TYR 193.A O ARG 197.A HH11 3.179 2.422 ARG 197.A NH1 TRP 248.A O ARG 197.A HH12 2.820 2.021 ARG 197.A NH2 TRP 248.A O ARG 197.A HH22 3.405 2.778 ASN 200.A N ASN 198.A OD1 ASN 200.A H 3.306 2.501 ASN 200.A ND2 ASN 198.A OD1 ASN 200.A HD22 2.905 2.074 LEU 201.A N ASN 198.A O LEU 201.A H 3.081 2.227 THR 202.A N TYR 111.A O THR 202.A H 2.847 2.042 THR 202.A OG1 GLN 203.A O THR 202.A HG1 3.395 2.588 GLN 203.A NE2 GLY 205.A O GLN 203.A HE21 3.386 2.641 ILE 204.A N ILE 109.A O ILE 204.A H 2.870 2.066 ILE 208.A N ILE 107.A O ILE 208.A H 2.974 2.175 LYS 211.A N LEU 105.A O LYS 211.A H 2.933 2.114 LYS 211.A NZ ASP 209.A OD2 LYS 211.A HZ2 2.820 2.088 TYR 213.A N MET 103.A O TYR 213.A H 3.027 2.219 TYR 213.A OH GLU 187.A OE1 TYR 213.A HH 2.711 1.879 GLY 214.A N LEU 86.A O GLY 214.A H 3.123 2.309 VAL 215.A N SER 99.A OG VAL 215.A H 2.844 2.068 GLY 216.A N ALA 82.A O GLY 216.A H 2.891 2.112 THR 217.A N ASP 97.A O THR 217.A H 2.854 2.081 THR 217.A OG1 ASP 97.A O THR 217.A HG1 3.060 2.258 GLY 220.A N ASP 97.A OD2 GLY 220.A H 3.011 2.168 SER 221.A N PRO 218.A O SER 221.A H 3.076 2.309 TYR 223.A N SER 221.A OG TYR 223.A H 2.922 2.134 ARG 224.A NH1 PHE 98.A O ARG 224.A HH11 2.996 2.158 ILE 227.A N TYR 223.A O ILE 227.A H.B 2.787 1.951 THR 228.A N ARG 224.A O THR 228.A H 2.877 2.065 THR 228.A OG1 ARG 224.A O THR 228.A HG1 3.443 2.785 ILE 229.A N ASP 225.A O ILE 229.A H 2.941 2.158 ALA 230.A N LYS 226.A O ALA 230.A H 3.012 2.224 ILE 231.A N ILE 227.A O ILE 231.A H 2.905 2.090 LEU 232.A N THR 228.A O LEU 232.A H 3.031 2.243 GLN 233.A N ILE 229.A O GLN 233.A H 3.076 2.286 GLN 233.A NE2 GLU 237.A OE2 GLN 233.A HE21 3.193 2.347 LEU 234.A N ALA 230.A O LEU 234.A H 2.943 2.126 GLN 235.A N ILE 231.A O GLN 235.A H 2.820 2.000 GLU 236.A N LEU 232.A O GLU 236.A H 2.907 2.114 GLU 237.A N GLN 233.A O GLU 237.A H 2.883 2.128 GLY 238.A N GLN 235.A O GLY 238.A H 3.087 2.302 LYS 239.A N LEU 234.A O LYS 239.A H 2.887 2.125 MET 242.A N GLY 238.A O MET 242.A H 3.187 2.387 MET 243.A N LYS 239.A O MET 243.A H 2.905 2.080 LYS 244.A N LEU 240.A O LYS 244.A H 2.929 2.084 LYS 244.A NZ GLU 192.A OE1 LYS 244.A HZ2 2.998 2.144 GLU 245.A N HIS 241.A O GLU 245.A H 3.019 2.192 LYS 246.A N MET 242.A O LYS 246.A H 2.971 2.148 LYS 246.A NZ ASP 35.A OD2 LYS 246.A HZ3 2.813 1.961 TRP 247.A N MET 243.A O TRP 247.A H 3.270 2.479 TRP 247.A NE1 ASP 35.A OD2 TRP 247.A HE1 2.782 1.959 TRP 248.A N LYS 244.A O TRP 248.A H 2.952 2.184 TRP 248.A NE1 THR 189.A O TRP 248.A HE1 3.075 2.216 ARG 249.A N GLU 245.A O ARG 249.A H 3.071 2.240 ARG 249.A NE GLU 245.A OE1 ARG 249.A HE 3.198 2.502 CYS 251.A SG THR 195.A O no hydrogen 3.508 N/A